Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9832
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9832, 343 aa
1>>>pF1KB9832 343 - 343 aa - 343 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4492+/-0.000847; mu= 11.6134+/- 0.051
mean_var=96.9745+/-19.066, 0's: 0 Z-trim(109.3): 46 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.130240
statistics sampled from 10754 (10800) to 10754 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.698), E-opt: 0.2 (0.332), width: 16
Scan time: 2.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX ( 343) 2267 436.0 2.2e-122
CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX ( 347) 1146 225.3 5.7e-59
CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX ( 346) 1120 220.5 1.7e-57
CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX ( 347) 1114 219.3 3.7e-57
CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX ( 336) 1046 206.5 2.5e-53
CCDS14220.1 MAGEB3 gene_id:4114|Hs108|chrX ( 346) 1022 202.0 5.8e-52
CCDS14219.1 MAGEB2 gene_id:4113|Hs108|chrX ( 319) 1020 201.7 7.1e-52
CCDS43927.1 MAGEB16 gene_id:139604|Hs108|chrX ( 324) 1006 199.0 4.4e-51
CCDS14705.1 MAGEA10 gene_id:4109|Hs108|chrX ( 369) 916 182.1 6.1e-46
CCDS48180.1 MAGEA11 gene_id:4110|Hs108|chrX ( 429) 889 177.1 2.3e-44
CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX ( 318) 815 163.1 2.8e-40
CCDS14702.1 MAGEA4 gene_id:4103|Hs108|chrX ( 317) 800 160.3 2e-39
CCDS14678.1 MAGEC2 gene_id:51438|Hs108|chrX ( 373) 786 157.7 1.4e-38
CCDS76051.1 MAGEA1 gene_id:4100|Hs108|chrX ( 309) 784 157.3 1.5e-38
CCDS14691.1 MAGEA9 gene_id:4108|Hs108|chrX ( 315) 764 153.5 2.1e-37
CCDS35423.1 MAGEA9B gene_id:728269|Hs108|chrX ( 315) 764 153.5 2.1e-37
CCDS14217.1 MAGEB6 gene_id:158809|Hs108|chrX ( 407) 747 150.4 2.4e-36
CCDS76046.1 MAGEA2B gene_id:266740|Hs108|chrX ( 314) 743 149.6 3.2e-36
CCDS76049.1 MAGEA2 gene_id:4101|Hs108|chrX ( 314) 743 149.6 3.2e-36
CCDS76050.1 MAGEA6 gene_id:4105|Hs108|chrX ( 314) 741 149.2 4.2e-36
CCDS76045.1 MAGEA3 gene_id:4102|Hs108|chrX ( 314) 733 147.7 1.2e-35
CCDS65233.1 MAGEB5 gene_id:347541|Hs108|chrX ( 275) 730 147.1 1.6e-35
CCDS35417.1 MAGEC1 gene_id:9947|Hs108|chrX (1142) 734 148.2 3.1e-35
CCDS76048.1 MAGEA12 gene_id:4111|Hs108|chrX ( 314) 697 141.0 1.3e-33
CCDS14677.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 346) 680 137.8 1.3e-32
CCDS3269.1 MAGEF1 gene_id:64110|Hs108|chr3 ( 307) 669 135.7 4.9e-32
CCDS10023.1 NSMCE3 gene_id:56160|Hs108|chr15 ( 304) 650 132.1 5.7e-31
CCDS14433.1 MAGEE1 gene_id:57692|Hs108|chrX ( 957) 614 125.6 1.6e-28
CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX ( 606) 595 121.9 1.3e-27
CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1431) 587 120.6 7.7e-27
CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1034) 579 119.1 1.7e-26
CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 706) 576 118.4 1.8e-26
CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 309) 568 116.7 2.5e-26
CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 739) 570 117.3 4.1e-26
CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 739) 570 117.3 4.1e-26
CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 741) 570 117.3 4.1e-26
CCDS73700.1 MAGEL2 gene_id:54551|Hs108|chr15 (1249) 568 117.0 8.2e-26
CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 778) 560 115.4 1.6e-25
CCDS35279.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 834) 560 115.4 1.7e-25
CCDS59529.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 962) 505 105.1 2.4e-22
CCDS10014.1 NDN gene_id:4692|Hs108|chr15 ( 321) 489 101.9 7.7e-22
CCDS14431.1 MAGEE2 gene_id:139599|Hs108|chrX ( 523) 433 91.5 1.7e-18
CCDS14676.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 643) 395 84.4 2.9e-16
CCDS14369.1 MAGEH1 gene_id:28986|Hs108|chrX ( 219) 374 80.2 1.8e-15
>>CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX (343 aa)
initn: 2267 init1: 2267 opt: 2267 Z-score: 2310.7 bits: 436.0 E(32554): 2.2e-122
Smith-Waterman score: 2267; 100.0% identity (100.0% similar) in 343 aa overlap (1-343:1-343)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MPRGQKSKLRAREKRHQARCENQDLGATQATVAEGESPSPAYLLFGDRPQNLPAAETPSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MPRGQKSKLRAREKRHQARCENQDLGATQATVAEGESPSPAYLLFGDRPQNLPAAETPSI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 PEALQGAPSTTNAIAPVSCSSNEGASSQDEKSLGSSREAEGWKEDPLNKKVVSLVHFLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PEALQGAPSTTNAIAPVSCSSNEGASSQDEKSLGSSREAEGWKEDPLNKKVVSLVHFLLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 KYETKEPITKGDMIKFVIRKDKCHFNEILKRASEHMELALGVDLKEVDPIRHYYAFFSKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KYETKEPITKGDMIKFVIRKDKCHFNEILKRASEHMELALGVDLKEVDPIRHYYAFFSKL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 DLTYDETTSDEEKIPKTGLLMIALGVIFLNGNRAPEEAVWEIMNMMGVYADRKHFLYGDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DLTYDETTSDEEKIPKTGLLMIALGVIFLNGNRAPEEAVWEIMNMMGVYADRKHFLYGDP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 RKVMTKDLVQLKYLEYQQVPNSDPPRYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFVAKIHDTVPSAFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RKVMTKDLVQLKYLEYQQVPNSDPPRYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFVAKIHDTVPSAFP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB9 SCYEEALRDEEQRTQARAAARAHTAAMANARSRTTSSSFSHAK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SCYEEALRDEEQRTQARAAARAHTAAMANARSRTTSSSFSHAK
310 320 330 340
>>CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX (347 aa)
initn: 1156 init1: 864 opt: 1146 Z-score: 1172.2 bits: 225.3 E(32554): 5.7e-59
Smith-Waterman score: 1146; 54.2% identity (78.2% similar) in 349 aa overlap (1-341:1-345)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MPRGQKSKLRAREKRHQARCENQDLGATQATVAEGES-PSPAYLLFGDRPQNLPAAETPS
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CCDS14 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSPVL-GDTPTSSPAAGIPQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 IPEALQGAPSTTNAIAPVSCS-SNEGASSQDEKSLGSSREA---EGWKEDPLNKKVVSLV
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CCDS14 KP---QGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 HFLLQKYETKEPITKGDMIKFVIRKDKCHFNEILKRASEHMELALGVDLKEVDPIRHYYA
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CCDS14 HFILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 FFSKLDLTYDETTSDEEKIPKTGLLMIALGVIFLNGNRAPEEAVWEIMNMMGVYADRKHF
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CCDS14 LVSKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 LYGDPRKVMTKDLVQLKYLEYQQVPNSDPPRYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFVAKIHDTV
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CCDS14 IYGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGAT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB9 PSAFPSCYEEALRDEEQRTQARAAARAH---TAAMANARSRTTSSSFSHAK
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CCDS14 PRDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
300 310 320 330 340
>>CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX (346 aa)
initn: 1103 init1: 624 opt: 1120 Z-score: 1145.9 bits: 220.5 E(32554): 1.7e-57
Smith-Waterman score: 1120; 53.2% identity (77.0% similar) in 348 aa overlap (1-341:1-344)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MPRGQKSKLRAREKRHQARCENQDLGATQATVAEGE-SPSPAYLLFGDRPQNLPAAETPS
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CCDS14 MPRGQKSKLRAREKRQRTRGQTQDLKVGQPTAAEKEESPSSSSSVLRDTASSSLAF---G
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 IPEALQGAPSTTNAIAPVSCS-SNEGASSQDEKSLGSSREAEGWK---EDPLNKKVVSLV
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CCDS14 IPQEPQREPPTTSAAAAMSCTGSDKGDESQDEENASSSQASTSTERSLKDSLTRKTKMLV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 HFLLQKYETKEPITKGDMIKFVIRKDKCHFNEILKRASEHMELALGVDLKEVDPIRHYYA
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CCDS14 QFLLYKYKMKEPTTKAEMLKIISKKYKEHFPEIFRKVSQRTELVFGLALKEVNPTTHSYI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 FFSKLDLTYDETTSDEEKIPKTGLLMIALGVIFLNGNRAPEEAVWEIMNMMGVYADRKHF
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CCDS14 LVSMLG-PNDGNQSSAWTLPRNGLLMPLLSVIFLNGNCAREEEIWEFLNMLGIYDGKRHL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 LYGDPRKVMTKDLVQLKYLEYQQVPNSDPPRYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFVAKIHDTV
..:.:::..:.:::: ::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.::..::.
CCDS14 IFGEPRKLITQDLVQEKYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB9 PSAFPSCYEEALRDEEQRTQAR--AAARAHTAAMANARSRTTSSSFSHAK
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CCDS14 PNNFPLLYEEALRDEEERAGARPRVAARRGTTAMTSAYSRATSSSSSQPM
300 310 320 330 340
>>CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX (347 aa)
initn: 1097 init1: 955 opt: 1114 Z-score: 1139.7 bits: 219.3 E(32554): 3.7e-57
Smith-Waterman score: 1114; 53.3% identity (75.8% similar) in 347 aa overlap (1-341:1-345)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MPRGQKSKLRAREKRHQARCENQDL-GATQATVAEGESPSPAYLLFGDRPQN-LPAAETP
:::::::::::::::.::: .:: : . : ::: : . : :. : .:
CCDS35 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSASACLKDVFQSSLDGA--S
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 SIPEALQGAPST-TNAIAPVSCSSNEGASSQDEKSLGSSREAEG---WKEDPLNKKVVSL
. :..:. : :: :.: : ::...: :. ... :. . . :...::. :
CCDS35 NNPHGLREAQSTSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIIL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 VHFLLQKYETKEPITKGDMIKFVIRKDKCHFNEILKRASEHMELALGVDLKEVDPIRHYY
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CCDS35 VHYLLYKYQMKEPITKADMLRNVTQMSKSQFPVILSRASEHLELIFGLDLKEVEPNKHIY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 AFFSKLDLTYDETTSDEEKIPKTGLLMIALGVIFLNGNRAPEEAVWEIMNMMGVYADRKH
.. .:::: : ::: .::::::: .::.:: ::: . :: ::...: ::.: .:
CCDS35 VLVNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 FLYGDPRKVMTKDLVQLKYLEYQQVPNSDPPRYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFVAKIHDT
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CCDS35 FMFGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB9 VPSAFPSCYEEALRDEEQRTQARAAARAHTAAMANARSRTTSSSFSHAK
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CCDS35 APSEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAGARSKVKSSKSSQLQ
300 310 320 330 340
>>CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX (336 aa)
initn: 1098 init1: 840 opt: 1046 Z-score: 1070.9 bits: 206.5 E(32554): 2.5e-53
Smith-Waterman score: 1046; 53.0% identity (75.9% similar) in 336 aa overlap (1-329:1-331)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MPRGQKSKLRAREKRHQARCENQDLGATQATVAEGES-PSPAYLLFGDRPQNLPAAETPS
::::: :: ::::::.::: :.: ::..:::.:: :. :: . . ::..: : .
CCDS59 MPRGQASKRRAREKRRQARGEDQCLGGAQATAAEKEKLPSSSSPACQSPPQSFPNA---G
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 IPEALQGAPSTTNAIAPVS-CSSNEGASSQDEKSLGS-----SREAEGWKEDPLNKKVVS
::. : : .. . :: ::.:::..: .: .: : :. : .: :: :.
CCDS59 IPQESQRASYPSSPASAVSLTSSDEGAKGQKGESPNSFHGPSSSESTG--RDLLNTKTGE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 LVHFLLQKYETKEPITKGDMIKFVIRKDKCHFNEILKRASEHMELALGVDLKEVDPIRHY
::.:::.:: :::::. :.: . :: : :: :::.:..:..:...:. :::.:: :.
CCDS59 LVQFLLNKYIRKEPITREAMLKVINRKYKQHFPEILRRSTENVEVVFGLYLKEMDPSRQS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 YAFFSKLDLTYDETTSDEEKIPKTGLLMIALGVIFLNGNRAPEEAVWEIMNMMGVYADRK
:.. .:::. . . :: .: .::::. :..::..:::: :: .:: .: .:.: ::
CCDS59 YVLVGKLDFPNQGSLSDGGGFPLSGLLMVLLSTIFMHGNRATEEEMWECLNALGMYKGRK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 HFLYGDPRKVMTKDLVQLKYLEYQQVPNSDPPRYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFVAKIHD
::.::.:....:::::. ::::::::.::::::::::::::.::::::::::::::..:
CCDS59 HFIYGEPQELVTKDLVREGYLEYQQVPSSDPPRYEFLWGPRARAETSKMKVLEFVAKLND
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB9 TVPSAFPSCYEEALRDEEQRTQARAAARAHTAAMANARSRTTSSSFSHAK
:: :.. : ::::::.::....:::.:: . : :.
CCDS59 TVASTYKSRYEEALREEEEQARARAVARDSARARASRSFQP
300 310 320 330
>>CCDS14220.1 MAGEB3 gene_id:4114|Hs108|chrX (346 aa)
initn: 1013 init1: 874 opt: 1022 Z-score: 1046.3 bits: 202.0 E(32554): 5.8e-52
Smith-Waterman score: 1022; 50.1% identity (74.4% similar) in 347 aa overlap (1-342:1-346)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MPRGQKSKLRAREKRHQARCENQDLGATQATVAEGESPS-PAYLLFGDRPQNLPAAETPS
::::::: :.:::::.:.: ..:: ..: :... .. : . :..: :. :... :
CCDS14 MPRGQKSTLHAREKRQQTRGQTQDHQGAQITATNKKKVSFSSPLILGATIQKKSAGRSRS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 IPEALQGAPSTTNAIAPVSCSSNEGASSQDEK----SLGSSREAEGWKEDPLNKKVVSLV
. : : :::... .: .::.:. :: : : : ... . ::: :. ::
CCDS14 ALKKPQRALSTTTSVDVSYKKSYKGANSKIEKKQSFSQGLSSTVQS-RTDPLIMKTNMLV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
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CCDS14 QFLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKDSYV
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CCDS14 LVSKMDLPNNGTVTRGRGFPKTGLLLNLLGVIFMKGNCATEEKIWEFLNKMRIYDGKKHF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
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CCDS14 PSAFQFWYEEALRDEEERVQAAAMLNDGSSAMGRKCSKAKASSSSHA
300 310 320 330 340
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CCDS14 IPQEPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGS
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CCDS14 LVQFLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHT
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CCDS14 HSVFGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNG
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CCDS14 TTPCAFPTHYEEALKDEEKAGV
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CCDS43 PLEVPQSFCSSSIAVTTTSSSESDEASSNQEEEDSPSSSEDTSDPRNVPADALDQKVAFL
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pF1KB9 VHFLLQKYETKEPITKGDMIKFVIRKDKCHFNEILKRASEHMELALGVDLKEVDPIRHYY
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CCDS43 VNFMLHKCQMKKPITKADMLKIIIKDDESHFSEILLRASEHLEMIFGLDVVEVDPTTHCY
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CCDS43 GLFIKLGLTYDGMLSGEKGVPKTGLLIIVLGVIFMKGNRATEEEVWEVLNLTGVYSGKKH
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CCDS43 FIFGEPRMLITKDFVKEKYLEYQQVANSDPARYEFLWGPRAKAETSKMKVLEFVAKVHGS
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pF1KB9 VPSAFPSCYEEALRDEEQRTQARAAARAHTAAMANARSRTTSSSFSHAK
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CCDS43 YPHSFPSQYAEALKEEEERARARI
310 320
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CCDS14 MPRAPKRQRCMPEEDLQSQSETQGLEGAQAPLAVEEDASSSTSTSSSFPSSFPSSSSSSS
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pF1KB9 -------PSIPEALQGAPSTTNAI--APVSCSS------------NEGASSQDEKSLGSS
:: :: ... : : : ..::: .::.::: :.: ..
CCDS14 SSCYPLIPSTPEEVSADDETPNPPQSAQIACSSPSVVASLPLDQSDEGSSSQKEESPSTL
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CCDS14 QVLPDSESLPRSEIDEKVTDLVQFLLFKYQMKEPITKAEILESVIRNYEDHFPLLFSEAS
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CCDS14 ECMLLVFGIDVKEVDPTGHSFVLVTSLGLTYDGMLSDVQSMPKTGILILILSIVFIEGYC
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CCDS14 TPEEVIWEALNMMGLYDGMEHLIYGEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPGSDPARYEFLWGP
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CCDS14 ATGS-FSYPE
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CCDS48 QALQAEEQEAAFFSSTLNVGTLEELPAAESPSPPQSPQEESFSPTAMDAIFGSLSDEGSG
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