Result of FASTA (omim) for
pF1KB9832
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9832, 343 aa
1>>>pF1KB9832 343 - 343 aa - 343 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2723+/-0.000349; mu= 12.8447+/- 0.022
mean_var=97.5447+/-19.278, 0's: 0 Z-trim(116.5): 128 B-trim: 166 in 1/53
Lambda= 0.129859
statistics sampled from 27512 (27640) to 27512 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.324), width: 16
Scan time: 8.490
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002354 (OMIM: 300097) melanoma-associated antig ( 347) 1146 224.7 2.3e-58
NP_803134 (OMIM: 300097) melanoma-associated antig ( 347) 1146 224.7 2.3e-58
NP_796379 (OMIM: 300097) melanoma-associated antig ( 347) 1146 224.7 2.3e-58
NP_002358 (OMIM: 300153) melanoma-associated antig ( 346) 1120 219.9 6.6e-57
NP_872312 (OMIM: 300761) melanoma-associated antig ( 347) 1114 218.7 1.4e-56
XP_011543869 (OMIM: 300763) PREDICTED: melanoma-as ( 336) 1046 206.0 9.6e-53
NP_001264236 (OMIM: 300763) melanoma-associated an ( 336) 1046 206.0 9.6e-53
XP_011543815 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-as ( 346) 1022 201.5 2.2e-51
XP_011543816 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-as ( 346) 1022 201.5 2.2e-51
NP_002356 (OMIM: 300152) melanoma-associated antig ( 346) 1022 201.5 2.2e-51
NP_002355 (OMIM: 300098) melanoma-associated antig ( 319) 1020 201.1 2.7e-51
XP_011543814 (OMIM: 300098) PREDICTED: melanoma-as ( 319) 1020 201.1 2.7e-51
NP_001093391 (OMIM: 300762) melanoma-associated an ( 324) 1006 198.5 1.7e-50
XP_011543756 (OMIM: 300762) PREDICTED: melanoma-as ( 324) 1006 198.5 1.7e-50
XP_011543755 (OMIM: 300762) PREDICTED: melanoma-as ( 324) 1006 198.5 1.7e-50
NP_001238757 (OMIM: 300343) melanoma-associated an ( 369) 917 181.9 1.9e-45
NP_001011543 (OMIM: 300343) melanoma-associated an ( 369) 917 181.9 1.9e-45
NP_066386 (OMIM: 300343) melanoma-associated antig ( 369) 917 181.9 1.9e-45
XP_016885011 (OMIM: 300344) PREDICTED: melanoma-as ( 394) 889 176.6 7.8e-44
NP_001011544 (OMIM: 300344) melanoma-associated an ( 400) 889 176.6 7.9e-44
XP_011529466 (OMIM: 300344) PREDICTED: melanoma-as ( 421) 889 176.6 8.2e-44
XP_016885010 (OMIM: 300344) PREDICTED: melanoma-as ( 429) 889 176.6 8.4e-44
NP_005357 (OMIM: 300344) melanoma-associated antig ( 429) 889 176.6 8.4e-44
NP_001159873 (OMIM: 300341) melanoma-associated an ( 318) 815 162.7 9.8e-40
NP_001159872 (OMIM: 300341) melanoma-associated an ( 318) 815 162.7 9.8e-40
NP_005355 (OMIM: 300341) melanoma-associated antig ( 318) 815 162.7 9.8e-40
XP_016885009 (OMIM: 300341) PREDICTED: melanoma-as ( 318) 815 162.7 9.8e-40
NP_002353 (OMIM: 300175) melanoma-associated antig ( 317) 800 159.9 6.8e-39
XP_005274736 (OMIM: 300175) PREDICTED: melanoma-as ( 317) 800 159.9 6.8e-39
XP_005274735 (OMIM: 300175) PREDICTED: melanoma-as ( 317) 800 159.9 6.8e-39
NP_001011548 (OMIM: 300175) melanoma-associated an ( 317) 800 159.9 6.8e-39
NP_001011549 (OMIM: 300175) melanoma-associated an ( 317) 800 159.9 6.8e-39
NP_001011550 (OMIM: 300175) melanoma-associated an ( 317) 800 159.9 6.8e-39
XP_005274734 (OMIM: 300175) PREDICTED: melanoma-as ( 397) 800 160.0 8.2e-39
NP_057333 (OMIM: 300468) melanoma-associated antig ( 373) 786 157.3 4.8e-38
NP_004979 (OMIM: 300016) melanoma-associated antig ( 309) 784 156.9 5.3e-38
XP_005262391 (OMIM: 300342) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 764 153.1 7.3e-37
XP_005278250 (OMIM: 300764) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 764 153.1 7.3e-37
NP_001074259 (OMIM: 300764) melanoma-associated an ( 315) 764 153.1 7.3e-37
XP_005278249 (OMIM: 300764) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 764 153.1 7.3e-37
NP_005356 (OMIM: 300342) melanoma-associated antig ( 315) 764 153.1 7.3e-37
XP_005262392 (OMIM: 300342) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 764 153.1 7.3e-37
NP_775794 (OMIM: 300467) melanoma-associated antig ( 407) 747 150.0 8.2e-36
NP_001269430 (OMIM: 300173) melanoma-associated an ( 314) 743 149.2 1.1e-35
NP_001269433 (OMIM: 300173) melanoma-associated an ( 314) 743 149.2 1.1e-35
NP_001308332 (OMIM: 300549) melanoma-associated an ( 314) 743 149.2 1.1e-35
NP_001269431 (OMIM: 300173) melanoma-associated an ( 314) 743 149.2 1.1e-35
NP_005352 (OMIM: 300173) melanoma-associated antig ( 314) 743 149.2 1.1e-35
XP_016885008 (OMIM: 300173) PREDICTED: melanoma-as ( 314) 743 149.2 1.1e-35
XP_016884895 (OMIM: 300549) PREDICTED: melanoma-as ( 314) 743 149.2 1.1e-35
>>NP_002354 (OMIM: 300097) melanoma-associated antigen B (347 aa)
initn: 1156 init1: 864 opt: 1146 Z-score: 1169.0 bits: 224.7 E(85289): 2.3e-58
Smith-Waterman score: 1146; 54.2% identity (78.2% similar) in 349 aa overlap (1-341:1-345)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MPRGQKSKLRAREKRHQARCENQDLGATQATVAEGES-PSPAYLLFGDRPQNLPAAETPS
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NP_002 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSPVL-GDTPTSSPAAGIPQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 IPEALQGAPSTTNAIAPVSCS-SNEGASSQDEKSLGSSREA---EGWKEDPLNKKVVSLV
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NP_002 KP---QGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 HFLLQKYETKEPITKGDMIKFVIRKDKCHFNEILKRASEHMELALGVDLKEVDPIRHYYA
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NP_002 HFILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYT
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pF1KB9 FFSKLDLTYDETTSDEEKIPKTGLLMIALGVIFLNGNRAPEEAVWEIMNMMGVYADRKHF
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NP_002 LVSKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHL
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pF1KB9 LYGDPRKVMTKDLVQLKYLEYQQVPNSDPPRYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFVAKIHDTV
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NP_002 IYGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGAT
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pF1KB9 PSAFPSCYEEALRDEEQRTQARAAARAH---TAAMANARSRTTSSSFSHAK
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NP_002 PRDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
300 310 320 330 340
>>NP_803134 (OMIM: 300097) melanoma-associated antigen B (347 aa)
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Smith-Waterman score: 1146; 54.2% identity (78.2% similar) in 349 aa overlap (1-341:1-345)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MPRGQKSKLRAREKRHQARCENQDLGATQATVAEGES-PSPAYLLFGDRPQNLPAAETPS
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NP_803 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSPVL-GDTPTSSPAAGIPQ
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pF1KB9 IPEALQGAPSTTNAIAPVSCS-SNEGASSQDEKSLGSSREA---EGWKEDPLNKKVVSLV
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pF1KB9 HFLLQKYETKEPITKGDMIKFVIRKDKCHFNEILKRASEHMELALGVDLKEVDPIRHYYA
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NP_803 HFILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYT
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pF1KB9 FFSKLDLTYDETTSDEEKIPKTGLLMIALGVIFLNGNRAPEEAVWEIMNMMGVYADRKHF
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NP_803 LVSKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHL
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pF1KB9 LYGDPRKVMTKDLVQLKYLEYQQVPNSDPPRYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFVAKIHDTV
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NP_803 IYGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGAT
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pF1KB9 PSAFPSCYEEALRDEEQRTQARAAARAH---TAAMANARSRTTSSSFSHAK
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NP_803 PRDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
300 310 320 330 340
>>NP_796379 (OMIM: 300097) melanoma-associated antigen B (347 aa)
initn: 1156 init1: 864 opt: 1146 Z-score: 1169.0 bits: 224.7 E(85289): 2.3e-58
Smith-Waterman score: 1146; 54.2% identity (78.2% similar) in 349 aa overlap (1-341:1-345)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MPRGQKSKLRAREKRHQARCENQDLGATQATVAEGES-PSPAYLLFGDRPQNLPAAETPS
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NP_796 HFILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYT
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pF1KB9 LYGDPRKVMTKDLVQLKYLEYQQVPNSDPPRYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFVAKIHDTV
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NP_796 IYGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGAT
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pF1KB9 PSAFPSCYEEALRDEEQRTQARAAARAH---TAAMANARSRTTSSSFSHAK
: ::: :::::::::.:.:.:...::. ::. ::::. : ::
NP_796 PRDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
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>>NP_002358 (OMIM: 300153) melanoma-associated antigen B (346 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB9 MPRGQKSKLRAREKRHQARCENQDLGATQATVAEGE-SPSPAYLLFGDRPQNLPAAETPS
:::::::::::::::...: ..::: . : :.:: : ::: . .. : .. : .
NP_002 MPRGQKSKLRAREKRQRTRGQTQDLKVGQPTAAEKEESPSSSSSVLRDTASSSLAF---G
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pF1KB9 IPEALQGAPSTTNAIAPVSCS-SNEGASSQDEKSLGSSREAEGWK---EDPLNKKVVSLV
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NP_002 IPQEPQREPPTTSAAAAMSCTGSDKGDESQDEENASSSQASTSTERSLKDSLTRKTKMLV
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pF1KB9 HFLLQKYETKEPITKGDMIKFVIRKDKCHFNEILKRASEHMELALGVDLKEVDPIRHYYA
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NP_002 QFLLYKYKMKEPTTKAEMLKIISKKYKEHFPEIFRKVSQRTELVFGLALKEVNPTTHSYI
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pF1KB9 FFSKLDLTYDETTSDEEKIPKTGLLMIALGVIFLNGNRAPEEAVWEIMNMMGVYADRKHF
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NP_002 LVSMLG-PNDGNQSSAWTLPRNGLLMPLLSVIFLNGNCAREEEIWEFLNMLGIYDGKRHL
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pF1KB9 LYGDPRKVMTKDLVQLKYLEYQQVPNSDPPRYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFVAKIHDTV
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NP_002 IFGEPRKLITQDLVQEKYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTT
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pF1KB9 PSAFPSCYEEALRDEEQRTQAR--AAARAHTAAMANARSRTTSSSFSHAK
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NP_002 PNNFPLLYEEALRDEEERAGARPRVAARRGTTAMTSAYSRATSSSSSQPM
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>>NP_872312 (OMIM: 300761) melanoma-associated antigen B (347 aa)
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pF1KB9 MPRGQKSKLRAREKRHQARCENQDL-GATQATVAEGESPSPAYLLFGDRPQN-LPAAETP
:::::::::::::::.::: .:: : . : ::: : . : :. : .:
NP_872 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSASACLKDVFQSSLDGA--S
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pF1KB9 SIPEALQGAPST-TNAIAPVSCSSNEGASSQDEKSLGSSREAEG---WKEDPLNKKVVSL
. :..:. : :: :.: : ::...: :. ... :. . . :...::. :
NP_872 NNPHGLREAQSTSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIIL
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pF1KB9 VHFLLQKYETKEPITKGDMIKFVIRKDKCHFNEILKRASEHMELALGVDLKEVDPIRHYY
::.:: ::. ::::::.::.. : . .: .: ::.:::::.:: .:.:::::.: .: :
NP_872 VHYLLYKYQMKEPITKADMLRNVTQMSKSQFPVILSRASEHLELIFGLDLKEVEPNKHIY
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.. .:::: : ::: .::::::: .::.:: ::: . :: ::...: ::.: .:
NP_872 VLVNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEH
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pF1KB9 FLYGDPRKVMTKDLVQLKYLEYQQVPNSDPPRYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFVAKIHDT
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NP_872 FMFGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDT
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pF1KB9 VPSAFPSCYEEALRDEEQRTQARAAARAHTAAMANARSRTTSSSFSHAK
.:: : . : :::.:::.:..::.::.:...: :.:::.. ::. :.
NP_872 APSEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAGARSKVKSSKSSQLQ
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>>XP_011543869 (OMIM: 300763) PREDICTED: melanoma-associ (336 aa)
initn: 1098 init1: 840 opt: 1046 Z-score: 1067.9 bits: 206.0 E(85289): 9.6e-53
Smith-Waterman score: 1046; 53.0% identity (75.9% similar) in 336 aa overlap (1-329:1-331)
10 20 30 40 50
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::. : : .. . :: ::.:::..: .: .: : :. : .: :: :.
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60 70 80 90 100 110
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pF1KB9 LVHFLLQKYETKEPITKGDMIKFVIRKDKCHFNEILKRASEHMELALGVDLKEVDPIRHY
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>>NP_001264236 (OMIM: 300763) melanoma-associated antige (336 aa)
initn: 1098 init1: 840 opt: 1046 Z-score: 1067.9 bits: 206.0 E(85289): 9.6e-53
Smith-Waterman score: 1046; 53.0% identity (75.9% similar) in 336 aa overlap (1-329:1-331)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MPRGQKSKLRAREKRHQARCENQDLGATQATVAEGES-PSPAYLLFGDRPQNLPAAETPS
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::. : : .. . :: ::.:::..: .: .: : :. : .: :: :.
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NP_001 TVASTYKSRYEEALREEEEQARARAVARDSARARASRSFQP
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>>XP_011543815 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-associ (346 aa)
initn: 1013 init1: 874 opt: 1022 Z-score: 1043.4 bits: 201.5 E(85289): 2.2e-51
Smith-Waterman score: 1022; 50.1% identity (74.4% similar) in 347 aa overlap (1-342:1-346)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MPRGQKSKLRAREKRHQARCENQDLGATQATVAEGESPS-PAYLLFGDRPQNLPAAETPS
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pF1KB9 IPEALQGAPSTTNAIAPVSCSSNEGASSQDEK----SLGSSREAEGWKEDPLNKKVVSLV
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XP_011 ALKKPQRALSTTTSVDVSYKKSYKGANSKIEKKQSFSQGLSSTVQS-RTDPLIMKTNMLV
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pF1KB9 HFLLQKYETKEPITKGDMIKFVIRKDKCHFNEILKRASEHMELALGVDLKEVDPIRHYYA
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XP_011 QFLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKDSYV
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XP_011 LVSKMDLPNNGTVTRGRGFPKTGLLLNLLGVIFMKGNCATEEKIWEFLNKMRIYDGKKHF
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>>XP_011543816 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-associ (346 aa)
initn: 1013 init1: 874 opt: 1022 Z-score: 1043.4 bits: 201.5 E(85289): 2.2e-51
Smith-Waterman score: 1022; 50.1% identity (74.4% similar) in 347 aa overlap (1-342:1-346)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MPRGQKSKLRAREKRHQARCENQDLGATQATVAEGESPS-PAYLLFGDRPQNLPAAETPS
::::::: :.:::::.:.: ..:: ..: :... .. : . :..: :. :... :
XP_011 MPRGQKSTLHAREKRQQTRGQTQDHQGAQITATNKKKVSFSSPLILGATIQKKSAGRSRS
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60 70 80 90 100 110
pF1KB9 IPEALQGAPSTTNAIAPVSCSSNEGASSQDEK----SLGSSREAEGWKEDPLNKKVVSLV
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XP_011 ALKKPQRALSTTTSVDVSYKKSYKGANSKIEKKQSFSQGLSSTVQS-RTDPLIMKTNMLV
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pF1KB9 HFLLQKYETKEPITKGDMIKFVIRKDKCHFNEILKRASEHMELALGVDLKEVDPIRHYYA
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XP_011 QFLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKDSYV
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pF1KB9 FFSKLDLTYDETTSDEEKIPKTGLLMIALGVIFLNGNRAPEEAVWEIMNMMGVYADRKHF
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XP_011 LVSKMDLPNNGTVTRGRGFPKTGLLLNLLGVIFMKGNCATEEKIWEFLNKMRIYDGKKHF
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pF1KB9 LYGDPRKVMTKDLVQLKYLEYQQVPNSDPPRYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFVAKIHDTV
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XP_011 IFGEPRKLITQDLVKLKYLEYRQVPNSNPARYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFWAKVNKTV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB9 PSAFPSCYEEALRDEEQRTQARAAARAHTAAMANARSRTTSSSFSHAK
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XP_011 PSAFQFWYEEALRDEEERVQAAAMLNDGSSAMGRKCSKAKASSSSHA
300 310 320 330 340
>>NP_002356 (OMIM: 300152) melanoma-associated antigen B (346 aa)
initn: 1013 init1: 874 opt: 1022 Z-score: 1043.4 bits: 201.5 E(85289): 2.2e-51
Smith-Waterman score: 1022; 50.1% identity (74.4% similar) in 347 aa overlap (1-342:1-346)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MPRGQKSKLRAREKRHQARCENQDLGATQATVAEGESPS-PAYLLFGDRPQNLPAAETPS
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NP_002 MPRGQKSTLHAREKRQQTRGQTQDHQGAQITATNKKKVSFSSPLILGATIQKKSAGRSRS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 IPEALQGAPSTTNAIAPVSCSSNEGASSQDEK----SLGSSREAEGWKEDPLNKKVVSLV
. : : :::... .: .::.:. :: : : : ... . ::: :. ::
NP_002 ALKKPQRALSTTTSVDVSYKKSYKGANSKIEKKQSFSQGLSSTVQS-RTDPLIMKTNMLV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 HFLLQKYETKEPITKGDMIKFVIRKDKCHFNEILKRASEHMELALGVDLKEVDPIRHYYA
.::.. :. :.:: :.::.:.: .. : : ::::.:: .::...:::::.:: . :.
NP_002 QFLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKDSYV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 FFSKLDLTYDETTSDEEKIPKTGLLMIALGVIFLNGNRAPEEAVWEIMNMMGVYADRKHF
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NP_002 LVSKMDLPNNGTVTRGRGFPKTGLLLNLLGVIFMKGNCATEEKIWEFLNKMRIYDGKKHF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 LYGDPRKVMTKDLVQLKYLEYQQVPNSDPPRYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFVAKIHDTV
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NP_002 IFGEPRKLITQDLVKLKYLEYRQVPNSNPARYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFWAKVNKTV
240 250 260 270 280 290
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pF1KB9 PSAFPSCYEEALRDEEQRTQARAAARAHTAAMANARSRTTSSSFSHAK
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NP_002 PSAFQFWYEEALRDEEERVQAAAMLNDGSSAMGRKCSKAKASSSSHA
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343 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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start: Fri Nov 4 19:33:56 2016 done: Fri Nov 4 19:33:57 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]