Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9842
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9842, 360 aa
1>>>pF1KB9842 360 - 360 aa - 360 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4823+/-0.00114; mu= 15.3725+/- 0.068
mean_var=119.4942+/-35.367, 0's: 0 Z-trim(104.4): 284 B-trim: 1081 in 2/45
Lambda= 0.117328
statistics sampled from 7376 (7875) to 7376 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.591), E-opt: 0.2 (0.242), width: 16
Scan time: 2.260
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 2357 410.8 9.4e-115
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 1767 310.9 1.1e-84
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 853 156.2 4.2e-38
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 827 151.8 8.7e-37
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 827 151.9 9.4e-37
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 811 149.1 5.6e-36
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 804 147.9 1.3e-35
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 758 140.1 2.9e-33
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 758 140.1 2.9e-33
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 746 138.1 1.2e-32
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 745 137.9 1.3e-32
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 739 136.9 2.6e-32
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 738 136.7 2.9e-32
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 738 136.7 2.9e-32
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 734 136.1 4.9e-32
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 717 133.2 3.5e-31
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 709 131.8 9.1e-31
CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 ( 350) 708 131.6 9.8e-31
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 701 130.4 2.2e-30
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 686 127.9 1.3e-29
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 677 126.4 3.7e-29
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 677 126.4 3.9e-29
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 387) 627 118.0 1.4e-26
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 355) 622 117.1 2.4e-26
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 618 116.4 3.8e-26
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 572 108.6 8.4e-24
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 572 108.7 8.9e-24
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 572 108.7 9e-24
CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 562 106.9 2.7e-23
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 560 106.6 3.5e-23
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3 ( 342) 556 105.9 5.3e-23
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 551 105.1 1e-22
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 548 104.6 1.5e-22
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 520 99.9 4e-21
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 520 99.9 4e-21
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 520 99.9 4e-21
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 520 99.9 4e-21
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 520 99.9 4.1e-21
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 520 99.9 4.1e-21
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 520 99.9 4.2e-21
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 520 99.9 4.2e-21
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 520 99.9 4.3e-21
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 520 100.0 4.6e-21
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 515 99.0 6.9e-21
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 504 97.1 2.5e-20
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 503 96.9 2.7e-20
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 498 96.1 5e-20
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 497 95.9 5.6e-20
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 492 95.1 1.1e-19
CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 ( 350) 487 94.2 1.8e-19
>>CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 (360 aa)
initn: 2357 init1: 2357 opt: 2357 Z-score: 2173.7 bits: 410.8 E(32554): 9.4e-115
Smith-Waterman score: 2357; 100.0% identity (100.0% similar) in 360 aa overlap (1-360:1-360)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MEDFNMESDSFEDFWKGEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCEPESLEINKYFVVIIYALVFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 MEDFNMESDSFEDFWKGEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCEPESLEINKYFVVIIYALVFL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGTFLCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 LSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGTFLCK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 VVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRYLVKFICLSIWGLSLLLALPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 VVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRYLVKFICLSIWGLSLLLALPV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LLFRRTVYSSNVSPACYEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIMLFCYGFTLRTLFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 LLFRRTVYSSNVSPACYEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIMLFCYGFTLRTLFK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 AHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCERRNHIDRALDATE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 AHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCERRNHIDRALDATE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 ILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKDSRPSFVGSSSGHTSTTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 ILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKDSRPSFVGSSSGHTSTTL
310 320 330 340 350 360
>>CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 (350 aa)
initn: 1757 init1: 1757 opt: 1767 Z-score: 1634.1 bits: 310.9 E(32554): 1.1e-84
Smith-Waterman score: 1767; 78.0% identity (90.5% similar) in 346 aa overlap (15-360:10-350)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MEDFNMESDSFEDFWKGEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCEPESLEINKYFVVIIYALVFL
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CCDS24 MSNITDPQMWDFDDL-NFT---GMPPADEDYSPCMLETETLNKYVVIIAYALVFL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGTFLCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 LSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGTFLCK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 VVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRYLVKFICLSIWGLSLLLALPV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::. ::::. :.::
CCDS24 VVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRHLVKFVCLGCWGLSMNLSLPF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LLFRRTVYSSNVSPACYEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIMLFCYGFTLRTLFK
.:::.. . .: ::.::: .::.::.:::.:::::..:::::::..::::::::::::::
CCDS24 FLFRQAYHPNNSSPVCYEVLGNDTAKWRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFCYGFTLRTLFK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 AHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCERRNHIDRALDATE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.: :::::::
CCDS24 AHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERRNNIGRALDATE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 ILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKDSRPSFVGSSSGHTSTTL
:::.:::::::.:::::::.::::.:::::.:::.::. : . :.. ::: ..:..:
CCDS24 ILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRHGFLKILAMHGLVSKEFLARHRVTSYT-SSSVNVSSNL
300 310 320 330 340 350
>>CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 (374 aa)
initn: 602 init1: 236 opt: 853 Z-score: 797.6 bits: 156.2 E(32554): 4.2e-38
Smith-Waterman score: 853; 41.2% identity (73.7% similar) in 335 aa overlap (3-329:7-331)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MEDFNMESDSFEDFWKGEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCE-PESLEINKYFVVIIY
.:. :: ::.. . . : :: .: . :: : : .... :: : :
CCDS52 MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVNTSYYSVDSEM---LL----CSLQEVRQFSRLFVPIAY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 ALVFLLSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNG-WIF
.:. ...:::: ::.... . . .::.:::::::.:.::.::.::::.::.:...: :.:
CCDS52 SLICVFGLLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVSHATGAWVF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 GTFLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRYLV---KFICLSIWG
.. ::... . .:: :.:::.:::.:::.:::.::... . . :.::: .::
CCDS52 SNATCKLLKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLPRSKIICLVVWG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB9 LSLLLALPVLLFRRTVYSSNVSPAC---YEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIML
::.... ...: . :... : .: :. . .. :..:. : :::..::..:.
CCDS52 LSVIISSSTFVFNQK-YNTQGSDVCEPKYQTV-SEPIRWKLLMLGLELLFGFFIPLMFMI
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 FCYGFTLRTLFKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCER
::: : ..:: .:. ...:.:.:::.::::.:: : .:.:.:::. : ....:.
CCDS52 FCYTFIVKTLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLV-TAANLGKMNRSCQS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 RNHIDRALDATEILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKDSRPSF
.. : . .::.:..:: ::::..:::::::::. .::::
CCDS52 EKLIGYTKTVTEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYKSSGFSCAG
300 310 320 330 340 350
350 360
pF1KB9 VGSSSGHTSTTL
CCDS52 RYSENISRQTSETADNDNASSFTM
360 370
>>CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (368 aa)
initn: 829 init1: 388 opt: 827 Z-score: 773.9 bits: 151.8 E(32554): 8.7e-37
Smith-Waterman score: 827; 40.9% identity (67.9% similar) in 340 aa overlap (21-357:25-361)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MEDFNMESDSFEDFWKGEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCEPE-SLEINKYFVVIIY
:.:.:. . . :: . ::.... :. .:
CCDS14 MVLEVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFSLNFDRAFLPALY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 ALVFLLSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFG
.:.:::.::::. : :.: :.. : ::..::.::.:: :..::::.::.. . :.::
CCDS14 SLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAVQWVFG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 TFLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQ-KRYLVKFICLSIWGLSL
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CCDS14 SGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTLTCLAVWGLCL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 LLALPVLLFRRTVYSSNVSPA-CYEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIMLFCYGF
:.::: ..: . .. .. . : : : ::.: ::..:::.: .::.
CCDS14 LFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQY---NFPQVGRTALRVLQLVAGFLLPLLVMAYCYAH
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 TLRTLFKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCERRNHID
: .:. .. .. ::::.. .::. : ::: ::.::.:.: :: .. ..: :....:
CCDS14 ILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNCGRESRVD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 RALDATEILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKDSRPSFVGSSS
: ..: :: .: :::::.:::.: :::. . .: : .. .: .. : ::
CCDS14 VAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSSSRRDSSW
300 310 320 330 340 350
360
pF1KB9 GHTSTTL
..::
CCDS14 SETSEASYSGL
360
>>CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (415 aa)
initn: 829 init1: 388 opt: 827 Z-score: 773.3 bits: 151.9 E(32554): 9.4e-37
Smith-Waterman score: 827; 40.9% identity (67.9% similar) in 340 aa overlap (21-357:72-408)
10 20 30 40
pF1KB9 MEDFNMESDSFEDFWKGEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCEPE-SLEINKY
:.:.:. . . :: . ::....
CCDS48 APSSPFPPSQVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFSLNFDRA
50 60 70 80 90 100
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 FVVIIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKV
:. .:.:.:::.::::. : :.: :.. : ::..::.::.:: :..::::.::.. .
CCDS48 FLPALYSLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAA
110 120 130 140 150 160
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 NGWIFGTFLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQ-KRYLVKFICLS
:.::. ::::.. : ..:::.: ::::::: :::: :::::. . : . ::.
CCDS48 VQWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTLTCLA
170 180 190 200 210 220
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 IWGLSLLLALPVLLFRRTVYSSNVSPA-CYEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIM
.::: ::.::: ..: . .. .. . : : : ::.: ::..:::.:
CCDS48 VWGLCLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQY---NFPQVGRTALRVLQLVAGFLLPLLVM
230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 LFCYGFTLRTLFKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCE
.::. : .:. .. .. ::::.. .::. : ::: ::.::.:.: :: .. ..:
CCDS48 AYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNCG
280 290 300 310 320 330
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 RRNHIDRALDATEILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKDSRPS
:....: : ..: :: .: :::::.:::.: :::. . .: : .. .: .. :
CCDS48 RESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSSS
340 350 360 370 380 390
350 360
pF1KB9 FVGSSSGHTSTTL
:: ..::
CCDS48 RRDSSWSETSEASYSGL
400 410
>>CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 (360 aa)
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10 20 30 40 50
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...:::::.:.::.. . ::.:::::::::..::::...::.:. .. :.:: ::
CCDS26 VFGLLGNSVVVLVLFKYKRLRSMTDVYLLNLAISDLLFVFSLPFWGYYAADQWVFGLGLC
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: .:: : :. : .. :...:..: . . .:...:: ::::::.. .:::
CCDS26 PGFLFS-TCYTERNHTYCKTKYSLNSTTWKVLSSLEINILGLVIPLGIMLFCYSMIIRTL
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CCDS26 QHCKNEKKNKAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLETLVELEVLQD-CTFERYLDYAIQA
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pF1KB9 TEILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKDSRPSFVGSSSGHTST
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CCDS26 TETLAFVHCCLNPIIYFFLGEKFRKYILQLFKTCRGLFVLCQYCGLLQIYSADTPSSSYT
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360
pF1KB9 TL
CCDS26 QSTMDHDLHDAL
350 360
>>CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 (372 aa)
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10 20 30 40 50
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CCDS84 LIFLLGVIGNVLVLVILERHRQTRSSTETFLFHLAVADLLLVFILPFAVAEGSVGWVLGT
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CCDS84 FLCKTVIALHKVNFYCSSLLLACIAVDRYLAIVHAVHAYRHRRLLSIHITCGTIWLVGFL
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CCDS84 LALPEILFAKVSQGHHNNSLPRCTFSQENQAETHAW-FTSRFLYHVAGFLLPMLVMGWCY
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pF1KB9 GFTLRTLFKAHM-GQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCERRN
... : .:. :...:.:: . :. ::.::: ::..:.. ::: : .....::. .
CCDS84 VGVVHRLRQAQRRPQRQKAVRVAILVTSIFFLCWSPYHIVIFLDTLARLKAVDNTCKLNG
240 250 260 270 280 290
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pF1KB9 HIDRALDATEILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSL----PKDSRP
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CCDS84 SLPVAITMCEFLGLAHCCLNPMLYTFAGVKFRSDLSRLLTKLGCTGPASLCQLFPSWRRS
300 310 320 330 340 350
350 360
pF1KB9 SFVGSSSGHTSTTL
:. : .. . ::.
CCDS84 SLSESENATSLTTF
360 370
>>CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 (372 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB9 MEDFNMESDSFEDFWKGEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCEPESLEINK-YFVVIIYA
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CCDS77 MKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWFLPIMYS
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pF1KB9 LVFLLSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGT
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CCDS77 IICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAKSWVFGV
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pF1KB9 FLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQK-RYLV--KFICLSIWGLS
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CCDS77 HFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWILA
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pF1KB9 LLLALPVLLFRRTVYSSNVSPACYEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIMLFCYGF
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CCDS77 TVLSIPELLYSDLQRSSS-EQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLAMSFCYLV
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pF1KB9 TLRTLFKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCERRNHID
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CCDS77 IIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTCELSKQLN
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pF1KB9 RALDATEILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKDSRPSFVGSSS
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CCDS77 IAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSSCRHIRRSS
300 310 320 330 340 350
360
pF1KB9 GHTSTTL
CCDS77 MSVEAETTTTFSP
360 370
>>CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 (378 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB9 MEDFNMESDSFEDFWKGEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCEPESLEINK-YF
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CCDS11 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWF
10 20 30 40 50 60
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pF1KB9 VVIIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVN
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CCDS11 LPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAK
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pF1KB9 GWIFGTFLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQK-RYLV--KFICL
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CCDS11 SWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 SIWGLSLLLALPVLLFRRTVYSSNVSPACYEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIM
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CCDS11 GIWILATVLSIPELLYSDLQRSSS-EQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLAM
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pF1KB9 LFCYGFTLRTLFKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCE
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CCDS11 SFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTCE
240 250 260 270 280 290
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pF1KB9 RRNHIDRALDATEILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKDSRPS
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CCDS11 LSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSSCR
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. ::
CCDS11 HIRRSSMSVEAETTTTFSP
360 370
>>CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 (369 aa)
initn: 666 init1: 367 opt: 746 Z-score: 699.8 bits: 138.1 E(32554): 1.2e-32
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10 20 30 40
pF1KB9 MEDFNMESDSFEDFWKGEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCEPESL-EI
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CCDS27 MTPTDFTSPIPNMADDYGSESTS-----SMEDYVNFNFTD----FY-----CEKNNVRQF
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50 60 70 80 90 100
pF1KB9 NKYFVVIIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAA
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CCDS27 ASHFLPPLYWLVFIVGALGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAI
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. .. : : ::.::::. . ..:::: .::. :::::::.::..: :. : .:: : :
CCDS27 AAADQWKFQTFMCKVVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSK
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pF1KB9 FICLSIWGLSLLLALPVLLFRRTVYSSNVSPACYEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVP
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CCDS27 MVCFTIWVLAAALCIPEILYSQIKEESGIAICTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGFFLP
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CCDS27 FVVMACCYTIIIHTLIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFI
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pF1KB9 ETCERRNHIDRALDATEILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKD
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CCDS27 SNCAVSTNIDICFQVTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSF
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pF1KB9 SRPSFVGSSSGHTSTTL
CCDS27 TRREGSLKLSSMLLETTSGALSL
350 360
360 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 19:40:14 2016 done: Fri Nov 4 19:40:15 2016
Total Scan time: 2.260 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]