Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9855
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9855, 390 aa
1>>>pF1KB9855 390 - 390 aa - 390 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6286+/-0.000931; mu= 14.3986+/- 0.056
mean_var=58.9843+/-12.163, 0's: 0 Z-trim(103.8): 27 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.166996
statistics sampled from 7563 (7587) to 7563 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16
Scan time: 2.670
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31436.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 ( 390) 2562 625.8 2e-179
CCDS53606.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 ( 303) 1978 485.1 3.6e-137
CCDS8692.1 KCNJ8 gene_id:3764|Hs108|chr12 ( 424) 1277 316.3 3.4e-86
CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs108|chr1 ( 393) 1198 297.2 1.7e-80
CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17 ( 433) 1164 289.0 5.4e-78
CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs108|chr21 ( 423) 1159 287.8 1.2e-77
CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17 ( 433) 1154 286.6 2.9e-77
CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs108|chr17 ( 427) 1135 282.0 6.8e-76
CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 ( 501) 1135 282.1 7.9e-76
CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs108|chr11 ( 419) 1124 279.4 4.2e-75
CCDS12721.1 KCNJ14 gene_id:3770|Hs108|chr19 ( 436) 1056 263.0 3.7e-70
CCDS8477.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 ( 372) 1015 253.1 3e-67
CCDS8476.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 ( 391) 1015 253.1 3.1e-67
CCDS11687.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 ( 418) 894 224.0 2e-58
CCDS74141.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 ( 453) 894 224.0 2.2e-58
CCDS13971.1 KCNJ4 gene_id:3761|Hs108|chr22 ( 445) 885 221.8 9.5e-58
CCDS1193.1 KCNJ10 gene_id:3766|Hs108|chr1 ( 379) 884 221.6 9.7e-58
CCDS13656.1 KCNJ15 gene_id:3772|Hs108|chr21 ( 375) 838 210.5 2.1e-54
CCDS58733.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 ( 235) 685 173.6 1.7e-43
CCDS2498.1 KCNJ13 gene_id:3769|Hs108|chr2 ( 360) 568 145.4 7.6e-35
>>CCDS31436.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 (390 aa)
initn: 2562 init1: 2562 opt: 2562 Z-score: 3334.8 bits: 625.8 E(32554): 2e-179
Smith-Waterman score: 2562; 99.5% identity (100.0% similar) in 390 aa overlap (1-390:1-390)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MLSRKGIIPEEYVLTRLAEDPAEPRYRARQRRARFVSKKGNCNVAHKNIREQGRFLQDVF
::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MLSRKGIIPEEYVLTRLAEDPAKPRYRARQRRARFVSKKGNCNVAHKNIREQGRFLQDVF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 TTLVDLKWPHTLLIFTMSFLCSWLLFAMAWWLIAFAHGDLAPSEGTAEPCVTSIHSFSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TTLVDLKWPHTLLIFTMSFLCSWLLFAMAWWLIAFAHGDLAPSEGTAEPCVTSIHSFSSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 FLFSIEVQVTIGFGGRMVTEECPLAILILIVQNIVGLMINAIMLGCIFMKTAQAHRRAET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FLFSIEVQVTIGFGGRMVTEECPLAILILIVQNIVGLMINAIMLGCIFMKTAQAHRRAET
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LIFSKHAVIALRHGRLCFMLRVGDLRKSMIISATIHMQVVRKTTSPEGEVVPLHQVDIPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LIFSKHAVIALRHGRLCFMLRVGDLRKSMIISATIHMQVVRKTTSPEGEVVPLHQVDIPM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 ENGVGGNSIFLVAPLIIYHVIDANSPLYDLAPSDLHHHQDLEIIVILEGVVETTGITTQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ENGVGGNSIFLVAPLIIYHVIDANSPLYDLAPSDLHHHQDLEIIVILEGVVETTGITTQA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 RTSYLADEILWGQRFVPIVAEEDGRYSVDYSKFGNTIKVPTPLCTARQLDEDHSLLEALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS31 RTSYLADEILWGQRFVPIVAEEDGRYSVDYSKFGNTVKVPTPLCTARQLDEDHSLLEALT
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB9 LASARGPLRKRSVPMAKAKPKFSISPDSLS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LASARGPLRKRSVPMAKAKPKFSISPDSLS
370 380 390
>>CCDS53606.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 (303 aa)
initn: 1978 init1: 1978 opt: 1978 Z-score: 2576.2 bits: 485.1 E(32554): 3.6e-137
Smith-Waterman score: 1978; 99.7% identity (100.0% similar) in 303 aa overlap (88-390:1-303)
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 DVFTTLVDLKWPHTLLIFTMSFLCSWLLFAMAWWLIAFAHGDLAPSEGTAEPCVTSIHSF
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MAWWLIAFAHGDLAPSEGTAEPCVTSIHSF
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 SSAFLFSIEVQVTIGFGGRMVTEECPLAILILIVQNIVGLMINAIMLGCIFMKTAQAHRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SSAFLFSIEVQVTIGFGGRMVTEECPLAILILIVQNIVGLMINAIMLGCIFMKTAQAHRR
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 AETLIFSKHAVIALRHGRLCFMLRVGDLRKSMIISATIHMQVVRKTTSPEGEVVPLHQVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AETLIFSKHAVIALRHGRLCFMLRVGDLRKSMIISATIHMQVVRKTTSPEGEVVPLHQVD
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 IPMENGVGGNSIFLVAPLIIYHVIDANSPLYDLAPSDLHHHQDLEIIVILEGVVETTGIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IPMENGVGGNSIFLVAPLIIYHVIDANSPLYDLAPSDLHHHQDLEIIVILEGVVETTGIT
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 TQARTSYLADEILWGQRFVPIVAEEDGRYSVDYSKFGNTIKVPTPLCTARQLDEDHSLLE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS53 TQARTSYLADEILWGQRFVPIVAEEDGRYSVDYSKFGNTVKVPTPLCTARQLDEDHSLLE
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390
pF1KB9 ALTLASARGPLRKRSVPMAKAKPKFSISPDSLS
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ALTLASARGPLRKRSVPMAKAKPKFSISPDSLS
280 290 300
>>CCDS8692.1 KCNJ8 gene_id:3764|Hs108|chr12 (424 aa)
initn: 1713 init1: 892 opt: 1277 Z-score: 1661.0 bits: 316.3 E(32554): 3.4e-86
Smith-Waterman score: 1768; 70.6% identity (87.8% similar) in 385 aa overlap (1-372:1-384)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MLSRKGIIPEEYVLTRLA-EDPAEPRYRARQRRARFVSKKGNCNVAHKNIREQGRFLQDV
::.::.::::::::.:.: :. .:: : : .:::..:.: ::.::::::::::::::.
CCDS86 MLARKSIIPEEYVLARIAAENLRKPRIRDRLPKARFIAKSGACNLAHKNIREQGRFLQDI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 FTTLVDLKWPHTLLIFTMSFLCSWLLFAMAWWLIAFAHGDL-APSEGTAEP--------C
::::::::: :::.::::::::::::::. :::.::::::. : : .. :
CCDS86 FTTLVDLKWRHTLVIFTMSFLCSWLLFAIMWWLVAFAHGDIYAYMEKSGMEKSGLESTVC
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 VTSIHSFSSAFLFSIEVQVTIGFGGRMVTEECPLAILILIVQNIVGLMINAIMLGCIFMK
::...::.:::::::::::::::::::.:::::::: .::.::::::.:::.::::::::
CCDS86 VTNVRSFTSAFLFSIEVQVTIGFGGRMMTEECPLAITVLILQNIVGLIINAVMLGCIFMK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 TAQAHRRAETLIFSKHAVIALRHGRLCFMLRVGDLRKSMIISATIHMQVVRKTTSPEGEV
::::::::::::::.:::::.:.:.::::.:::::::::::::....:::.:::.:::::
CCDS86 TAQAHRRAETLIFSRHAVIAVRNGKLCFMFRVGDLRKSMIISASVRIQVVKKTTTPEGEV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 VPLHQVDIPMENGVGGNSIFLVAPLIIYHVIDANSPLYDLAPSDLHHHQDLEIIVILEGV
::.::.:::..: . .:.::::::::: :::: :::::.. .:: . ::::.:::::::
CCDS86 VPIHQLDIPVDNPIESNNIFLVAPLIICHVIDKRSPLYDISATDLAN-QDLEVIVILEGV
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 VETTGITTQARTSYLADEILWGQRFVPIVAEEDGRYSVDYSKFGNTIKVPTPLCTARQLD
::::::::::::::.:.:: ::.::: ::.::.: :::::::::::.:: .: :.::.::
CCDS86 VETTGITTQARTSYIAEEIQWGHRFVSIVTEEEGVYSVDYSKFGNTVKVAAPRCSARELD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB9 EDHSLL-EALTLA--SARGPLRKRSVPMAKAKPKFSISPDSLS
: :.: ..: . : .. ::::.
CCDS86 EKPSILIQTLQKSELSHQNSLRKRNSMRRNNSMRRNNSIRRNNSSLMVPKVQFMTPEGNQ
360 370 380 390 400 410
>>CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs108|chr1 (393 aa)
initn: 1015 init1: 605 opt: 1198 Z-score: 1558.7 bits: 297.2 E(32554): 1.7e-80
Smith-Waterman score: 1198; 50.7% identity (80.4% similar) in 341 aa overlap (19-358:13-347)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MLSRKGIIPEEYVLTRLAEDPAEPRYRARQRRARFVSKKGNCNVAHKNIREQGRFLQDVF
:.: :: :.:: :.: : : ::: . :.:: :.: :.:
CCDS11 MAQENAAFSPGQEEP--PRRRGRQ---RYVEKDGRCNVQQGNVRETYRYLTDLF
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB9 TTLVDLKWPHTLLIFTMSFLCSWLLFAMAWWLIAFAHGDLAPSEGTA-EPCVTSIHSFSS
::::::.: .::.:.... .::.:. :::::...::: : :: :::.....: .
CCDS11 TTLVDLQWRLSLLFFVLAYALTWLFFGAIWWLIAYGRGDLEHLEDTAWTPCVNNLNGFVA
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 AFLFSIEVQVTIGFGGRMVTEECPLAILILIVQNIVGLMINAIMLGCIFMKTAQAHRRAE
:::::::...:::.: :..:..:: .:..:..: :.: :.::.:.::.:.: .: ..::
CCDS11 AFLFSIETETTIGYGHRVITDQCPEGIVLLLLQAILGSMVNAFMVGCMFVKISQPNKRAA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 TLIFSKHAVIALRHGRLCFMLRVGDLRKSMIISATIHMQVVRKTTSPEGEVVPLHQVDIP
::.::.:::..:: ::::.:.::::::.: :. :.:. ...:. . ::: .::::.:.
CCDS11 TLVFSSHAVVSLRDGRLCLMFRVGDLRSSHIVEASIRAKLIRSRQTLEGEFIPLHQTDLS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 MENGVGGNSIFLVAPLIIYHVIDANSPLYDLAPSDLHHHQDLEIIVILEGVVETTGITTQ
. .: . .:::.::.: : ::: ::... . :.. .:.::.:::::.::.::.: :
CCDS11 VGFDTGDDRLFLVSPLVISHEIDAASPFWEASRRALER-DDFEIVVILEGMVEATGMTCQ
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 ARTSYLADEILWGQRFVPIVAEEDGRYSVDYSKFGNTIKVPTPLCTARQLDEDHSLLEAL
::.:::.::.:::.::. ... ::: : :::..: .:..:::: :.::.: : . :.:
CCDS11 ARSSYLVDEVLWGHRFTSVLTLEDGFYEVDYASFHETFEVPTPSCSARELAEAAARLDAH
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390
pF1KB9 TLASARGPLRKRSVPMAKAKPKFSISPDSLS
CCDS11 LYWSIPSRLDEKVEEEGAGEGAGGEAGADKEQNGCLPPPESESKV
350 360 370 380 390
>>CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17 (433 aa)
initn: 928 init1: 583 opt: 1164 Z-score: 1513.7 bits: 289.0 E(32554): 5.4e-78
Smith-Waterman score: 1164; 51.2% identity (81.2% similar) in 336 aa overlap (25-356:35-369)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MLSRKGIIPEEYVLTRLAEDPAEPRYRARQR-RARFVSKKGNCNVAHKNIREQG
. ..:.: : :::.:.:.::. :. :..
CCDS11 SRANPYSIVSSEEDGLHLVTMSGANGFGNGKVHTRRRCRNRFVKKNGQCNIEFANMDEKS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 -RFLQDVFTTLVDLKWPHTLLIFTMSFLCSWLLFAMAWWLIAFAHGDLAPSEGTAE-PCV
:.: :.::: ::..: . ::::...:: :::::.. .:.:: ::::: :.:: .. :::
CCDS11 QRYLADMFTTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGIIFWVIAVAHGDLEPAEGRGRTPCV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 TSIHSFSSAFLFSIEVQVTIGFGGRMVTEECPLAILILIVQNIVGLMINAIMLGCIFMKT
..:.: .:::::::.:.:::.: : ::::::.:......:.::: .:...:.: :. :
CCDS11 MQVHGFMAAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECPVAVFMVVAQSIVGCIIDSFMIGAIMAKM
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 AQAHRRAETLIFSKHAVIALRHGRLCFMLRVGDLRKSMIISATIHMQVVRKTTSPEGEVV
:. ..::.::.::..::.::: :.::.: :::.:::: :. : .. :... .. ::: .
CCDS11 ARPKKRAQTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIKPRVTEEGEYI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 PLHQVDIPMENGVGGNSIFLVAPLIIYHVIDANSPLYDLAPSDLHHHQDLEIIVILEGVV
:: :.:: . : . ::::.:. : : :: :::. .. .::. .:.::.:::::.:
CCDS11 PLDQIDIDVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISRQDLET-DDFEIVVILEGMV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 ETTGITTQARTSYLADEILWGQRFVPIVAEEDGRYSVDYSKFGNTIKVP-TPLCTARQLD
:.:..:::::.::::.:::::.:: :.. :: ..:..:::.: .: .:: :: :.:..:
CCDS11 EATAMTTQARSSYLANEILWGHRFEPVLFEEKNQYKIDYSHFHKTYEVPSTPRCSAKDLV
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390
pF1KB9 EDHSLLEALTLASARGPLRKRSVPMAKAKPKFSISPDSLS
:.. ::
CCDS11 ENKFLLPSANSFCYENELAFLSRDEEDEADGDQDGRSRDGLSPQARHDFDRLQAGGGVLE
370 380 390 400 410 420
>>CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs108|chr21 (423 aa)
initn: 602 init1: 602 opt: 1159 Z-score: 1507.4 bits: 287.8 E(32554): 1.2e-77
Smith-Waterman score: 1159; 49.0% identity (79.3% similar) in 343 aa overlap (14-351:32-372)
10 20 30
pF1KB9 MLSRKGIIPEEYVLTRLAEDPAEPRY--RARQRRA--RFVSKK
: . :.: ::. : : .: :.: :
CCDS42 AKLTESMTNVLEGDSMDQDVESPVAIHQPKLPKQARDDL-PRHISRDRTKRKIQRYVRKD
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 GNCNVAHKNIREQGRFLQDVFTTLVDLKWPHTLLIFTMSFLCSWLLFAMAWWLIAFAHGD
:.::: : :.:: :.: :.::::::::: .::::.: . .::.:.: :::::. .::
CCDS42 GKCNVHHGNVRETYRYLTDIFTTLVDLKWRFNLLIFVMVYTVTWLFFGMIWWLIAYIRGD
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 LAPSEGTA-EPCVTSIHSFSSAFLFSIEVQVTIGFGGRMVTEECPLAILILIVQNIVGLM
. : . ::::....: ::::::::...:::.: :..:..:: .:..:..:...: .
CCDS42 MDHIEDPSWTPCVTNLNGFVSAFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIILLLIQSVLGSI
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 INAIMLGCIFMKTAQAHRRAETLIFSKHAVIALRHGRLCFMLRVGDLRKSMIISATIHMQ
.::.:.::.:.: .: ..:::::.:: ::::..: :.::.:.::::::.: :. :.:. .
CCDS42 VNAFMVGCMFVKISQPKKRAETLVFSTHAVISMRDGKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAK
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 VVRKTTSPEGEVVPLHQVDIPMENGVGGNSIFLVAPLIIYHVIDANSPLYDLAPSDLHHH
.... . ::: .::.:.:: . .: . .:::.:::: : :. .::..... ..: .
CCDS42 LIKSKQTSEGEFIPLNQTDINVGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFWEISKAQLPK-
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 QDLEIIVILEGVVETTGITTQARTSYLADEILWGQRFVPIVAEEDGRYSVDYSKFGNTIK
..:::.:::::.::.::.: :::.::...::::: ::.:... ::: : :::..: .: .
CCDS42 EELEIVVILEGMVEATGMTCQARSSYITSEILWGYRFTPVLTLEDGFYEVDYNSFHETYE
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 VPTPLCTARQLDEDHSLLEALTLASARGPLRKRSVPMAKAKPKFSISPDSLS
. :: .:..: :
CCDS42 TSTPSLSAKELAELASRAELPLSWSVSSKLNQHAELETEEEEKNLEEQTERNGDVANLEN
360 370 380 390 400 410
>>CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17 (433 aa)
initn: 927 init1: 569 opt: 1154 Z-score: 1500.7 bits: 286.6 E(32554): 2.9e-77
Smith-Waterman score: 1154; 51.2% identity (81.2% similar) in 336 aa overlap (25-356:35-369)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MLSRKGIIPEEYVLTRLAEDPAEPRYRARQR-RARFVSKKGNCNVAHKNIREQG
. ..:.: : :::.:.:.::.: :. :..
CCDS74 SRANPYSIVSLEEDGLHLVTMSGANGFGNGKVHTRRRCRNRFVKKNGQCNIAFANMDEKS
10 20 30 40 50 60
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]