Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9856
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9856, 390 aa
1>>>pF1KB9856 390 - 390 aa - 390 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9468+/-0.000788; mu= 20.3497+/- 0.049
mean_var=120.7268+/-38.074, 0's: 0 Z-trim(110.0): 273 B-trim: 1301 in 2/48
Lambda= 0.116727
statistics sampled from 10836 (11322) to 10836 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.348), width: 16
Scan time: 3.000
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 2572 444.3 8.8e-125
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 1561 274.0 1.5e-73
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 ( 366) 1139 202.9 3.8e-52
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 ( 365) 1061 189.8 3.4e-48
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 721 132.6 6.3e-31
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 685 126.7 4.5e-29
CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 367) 663 122.8 5.1e-28
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX ( 458) 574 107.9 1.9e-23
CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2 ( 481) 566 106.6 4.9e-23
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 540 102.2 1e-21
CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7 ( 357) 527 99.9 3.9e-21
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 432) 523 99.3 7e-21
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 445) 523 99.3 7.1e-21
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 523 99.4 7.4e-21
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 504 96.0 5.6e-20
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 504 96.1 6.4e-20
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 504 96.1 6.6e-20
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 504 96.2 6.7e-20
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 504 96.2 6.8e-20
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 497 95.0 1.5e-19
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 497 95.0 1.6e-19
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 490 93.8 3.4e-19
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 483 92.7 8.7e-19
CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1 ( 590) 479 92.1 1.4e-18
CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4 ( 477) 469 90.3 4e-18
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 ( 460) 465 89.6 6.3e-18
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 460 88.7 1.1e-17
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 ( 408) 459 88.5 1.2e-17
CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 443) 458 88.4 1.4e-17
CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 414) 454 87.7 2.1e-17
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 447 86.5 5.1e-17
CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11 ( 479) 446 86.4 5.9e-17
CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15 ( 532) 444 86.1 8e-17
CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7 ( 466) 443 85.9 8.3e-17
CCDS2978.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 400) 431 83.8 3.1e-16
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 427 83.0 4.6e-16
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 427 83.1 4.9e-16
CCDS2604.1 HRH1 gene_id:3269|Hs108|chr3 ( 487) 427 83.2 5.5e-16
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 400 78.5 1.1e-14
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 471) 388 76.6 5.1e-14
CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 ( 348) 386 76.1 5.4e-14
CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6 ( 342) 375 74.2 1.9e-13
CCDS344.1 HCRTR1 gene_id:3061|Hs108|chr1 ( 425) 360 71.9 1.3e-12
CCDS13493.1 HRH3 gene_id:11255|Hs108|chr20 ( 445) 355 71.0 2.3e-12
CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1 ( 440) 351 70.4 3.7e-12
CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 ( 339) 348 69.7 4.5e-12
CCDS7710.1 DRD4 gene_id:1815|Hs108|chr11 ( 419) 339 68.3 1.5e-11
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 334 67.4 2.5e-11
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 334 67.4 2.5e-11
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 334 67.4 2.5e-11
>>CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 (390 aa)
initn: 2572 init1: 2572 opt: 2572 Z-score: 2353.7 bits: 444.3 E(32554): 8.8e-125
Smith-Waterman score: 2572; 100.0% identity (100.0% similar) in 390 aa overlap (1-390:1-390)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MEEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 MEEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALIT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 VCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 VCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 SLPPFFWRQAKAEEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 SLPPFFWRQAKAEEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRIL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 KQTPNRTGKRLTRAQLITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSESGSPVYVNQVKVRVSDALLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 KQTPNRTGKRLTRAQLITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSESGSPVYVNQVKVRVSDALLE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFDFFTWLGYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 KKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFDFFTWLGYL
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB9 NSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 NSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
370 380 390
>>CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 (377 aa)
initn: 1535 init1: 931 opt: 1561 Z-score: 1433.7 bits: 274.0 E(32554): 1.5e-73
Smith-Waterman score: 1561; 62.4% identity (83.4% similar) in 380 aa overlap (12-390:3-377)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MEEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALIT
: : .:: .: : : . . .. :. :...:..::
CCDS23 MSPLNQSAEGLPQE--ASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVIT
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQV
:::.::::::..:. ::::::::::::.:::.::::::::::::: ::.: :..::.
CCDS23 LATVLSNAFVLTTILLTRKLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 VCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISI
.::.::::::::::::::::::::::::::::::.::: .:: .::.:::.::..:: :
CCDS23 LCDIWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 SLPPFFWRQAKAEEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRIL
:.::.:::::::.::.:.:.:::..: ::.::: ::::.:..::: :::::: ::.:::
CCDS23 SIPPLFWRQAKAQEEMSDCLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRIL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KB9 KQTPNRTGKRLTRAQLITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSES-GSPVYVNQVKVRVSDALL
. :. :::.: :.::: : :: :. :.:: . . :.: :::.. :.::....:. :
CCDS23 NP-PSLYGKRFTTAHLITGSAGS--SLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFNHVKIKLADSAL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 EKKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFDFFTWLGY
:.:.. ::::::::: :::::::::.::::::..:::.:::.:.::.: :.:::::::::
CCDS23 ERKRISAARERKATKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390
pF1KB9 LNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
:::::::::::. ::.:.:::.:.. :. .:
CCDS23 LNSLINPIIYTVFNEEFRQAFQKIVPFRKAS
350 360 370
>>CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 (366 aa)
initn: 1109 init1: 617 opt: 1139 Z-score: 1049.8 bits: 202.9 E(32554): 3.8e-52
Smith-Waterman score: 1139; 48.9% identity (75.4% similar) in 366 aa overlap (32-388:5-366)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 EEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSIS-LPWKVLLVMLLALIT
: : .. .. .. .: :.:. . :. ..
CCDS29 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLA
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQV
: :: :..:::.. ::::: :::::: ::::::.::..::::.: .: : : .:::
CCDS29 LMTTTINSLVIAAIIVTRKLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 VCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISI
:::.::: :::::: ::::: .:::::: ::::::::. :::::.:..::..::..:. :
CCDS29 VCDIWLSVDITCCTCSILHLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFI
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 SLPPFFWRQAKAEEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRIL
:.::.:::. . .. .::... :::. :.::: ::::.: :.. :: .:: :..
CCDS29 SMPPLFWRHQGTSRD-DECIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYH
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KB9 KQTPNRTGKRLTRAQLITDS-PGSTSSVTS---INSRVPDVPSESGSPVYVNQVKVRVSD
:. .: .:. . .:.. .: ::.::.. ... . : :: . . .. . :. :.
CCDS29 KRQASRIAKEEVNGQVLLESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSD-PSTDFDKIH-STVRSLRSE
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 ALLEK----KKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFD
:: .:. ..:::::. :::.:::::..::::::. ::. .: : : . . .
CCDS29 FKHEKSWRRQKISGTRERKAATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVC-DKCKISEEMSN
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390
pF1KB9 FFTWLGYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
:..:::::::::::.:::. :::::.::.::.: .:
CCDS29 FLAWLGYLNSLINPLIYTIFNEDFKKAFQKLVRCRC
340 350 360
>>CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 (365 aa)
initn: 1063 init1: 627 opt: 1061 Z-score: 978.8 bits: 189.8 E(32554): 3.4e-48
Smith-Waterman score: 1061; 47.8% identity (71.2% similar) in 364 aa overlap (32-387:5-362)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 EEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALITL
::... . .. :.:. : :..::
CCDS50 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITT
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 ATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQVV
::: : :: .. :.::: :::::: :::::::::..::::.: .: : :: :: .
CCDS50 LTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQPANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFL
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 CDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISIS
:. ::: :.:::: :::::::::::::::::.:.::. ::: ::::.:: ::..:: ::
CCDS50 CEVWLSVDMTCCTCSILHLCVIALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFIS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LPPFFWR-QAKAEEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRIL
.::.::: . . :.:... ::..::.:::.::::.: :.. :: ::: :.:
CCDS50 MPPLFWRSHRRLSPPPSQCTIQHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQ
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KB9 KQTPNR-TGKRLTRAQ--LITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSESGSPVYVNQVKVRVSDA
:. .: ..: : .: . . . .: :..... : . :. . .... :
CCDS50 KRGSSRHLSNRSTDSQNSFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEK----FHASIRIPPFDN
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 LL----EKKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFDF
: :.... ..:::::.. ::.::::::. :::::: :.. . . ..: ::
CCDS50 DLDHPGERQQISSTRERKAARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGLSIYTVSSEVA--DF
280 290 300 310 320
360 370 380 390
pF1KB9 FTWLGYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
.:::::.::::::..:: ::::: ::.:::: .
CCDS50 LTWLGYVNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIRCREHT
330 340 350 360
>>CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 (422 aa)
initn: 988 init1: 662 opt: 721 Z-score: 668.7 bits: 132.6 E(32554): 6.3e-31
Smith-Waterman score: 965; 39.7% identity (69.2% similar) in 403 aa overlap (24-377:11-408)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MEEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALIT
: .: :. .. . ..... ..:. .::. .
CCDS34 MDVLSPGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLI
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQV
. ..:.:: :.:.. :.:.. :::::.:::::::.::.::.:....: : ..::::::
CCDS34 FCAVLGNACVVAAIALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 VCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISI
.::.... :. :::.::::::.::::::::::: ..: ::::.:::..:.:.:.... :
CCDS34 TCDLFIALDVLCCTSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB9 SLPPFF-WRQAKAEEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRI
:.::.. :: . . . . :... :: ::.::: ::::.: ::...:::::. :: ::
CCDS34 SIPPMLGWRTPEDRSDPDACTISKDHG-YTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270
pF1KB9 LKQT-------------------PNRT-----GKRLTRAQLITDSPGSTSSVTSI-----
: . :... :.: : . . . :. . ..
CCDS34 RKTVKKVEKTGADTRHGASPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDD
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310
pF1KB9 -------------NSR--VPDVPSESG----SPVYVNQVKVRVSDALLEKKKLMAARERK
::. .: .:::.: .:. .. . : ..: :.:. :::::
CCDS34 GAALEVIEVHRVGNSKEHLP-LPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEA---KRKMALARERK
290 300 310 320 330 340
320 330 340 350 360 370
pF1KB9 ATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFDFFTWLGYLNSLINPIIYTM
..::::::.:.::.:::::::..::.:.:...: . . ...:::: :::.::.::..
CCDS34 TVKTLGIIMGTFILCWLPFFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAY
350 360 370 380 390 400
380 390
pF1KB9 SNEDFKQAFHKLIRFKCTS
:.::.
CCDS34 FNKDFQNAFKKIIKCKFCRQ
410 420
>>CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 (477 aa)
initn: 588 init1: 352 opt: 685 Z-score: 635.4 bits: 126.7 E(32554): 4.5e-29
Smith-Waterman score: 685; 34.4% identity (62.3% similar) in 390 aa overlap (3-384:12-391)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MEEPGA-QCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKV
::: . : : : :. : . . . ..: . . .: : .
CCDS75 MGAGVLVLGASEPGNLSSAAPLPDGAAT-AARLLVPASPPASLLPPASESPEPLSQQWTA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 LLVMLLALITLATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYT
. .:.:::.: . .:..::... .: .:.: .: .: ::: .::....::.:... .
CCDS75 GMGLLMALIVLLIVAGNVLVIVAIAKTPRLQTLTNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATIV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 VTGRWTLGQVVCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMI
: ::: :. :..: : :. : :::: ::::::::: :::. .:.. : :: ..
CCDS75 VWGRWEYGSFFCELWTSVDVLCVTASIETLCVIALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARGLV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB9 ALVWVFSISISLPPFFWRQAKAE-EEVSECVVNT---DHIL---YTVYSTVGAFYFPTLL
::..: .:. :.. . .:: .:. .: . : . :.. :.: .:: : .
CCDS75 CTVWAISALVSFLPILMHWWRAESDEARRCYNDPKCCDFVTNRAYAIASSVVSFYVPLCI
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 LIALYGRIYVEARSRILKQTPNRTGKRLTRAQLITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSESGS
. .: :.. ::.... : . .:. . :: : : : . . : : ...
CCDS75 MAFVYLRVFREAQKQVKK--IDSCERRFLGGPARPPSP-SPSPVPA-PAPPPGPPRPAAA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 PVYVNQVKVRVSDALLEKKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDA
. . .. :.. . ..:.: ::.:: ::::::.:.: .::::::. ..: . ..
CCDS75 AATAPLANGRAGKR--RPSRLVALREQKALKTLGIIMGVFTLCWLPFFLANVVKAFHREL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KB9 CWFHLAIFDFFTWLGYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
.: : ::.:::: :: .::::: : ::..::. :.
CCDS75 VPDRL--FVFFNWLGYANSAFNPIIYCRS-PDFRKAFQGLLCCARRAARRRHATHGDRPR
360 370 380 390 400 410
CCDS75 ASGCLARPGPPPSPGAASDDDDDDVVGATPPARLLEPWAGCNGGAAADSDSSLDEPCRPG
420 430 440 450 460 470
>>CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 (367 aa)
initn: 552 init1: 149 opt: 663 Z-score: 616.5 bits: 122.8 E(32554): 5.1e-28
Smith-Waterman score: 670; 36.0% identity (65.1% similar) in 381 aa overlap (23-384:5-365)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MEEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALIT
..::. . .:.:.. : . : . :::
CCDS33 MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGA-SQARPHAYYALSYCALI-
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB9 LATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGR-WTLGQ
:: ...:..: .: . : :.: .:::..::::.::::. :::: .. ::: :....
CCDS33 LAIVFGNGLVCMAVLKERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSR
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 VVCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEY---SAKRTPKRAAVMIALVWVF
. :: ... :. ::::::.::.:..::: :.. :.: ... . .:.:.::. :::.
CCDS33 ICCDVFVTLDVMMCTASILNLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 SISISLPPFFWRQAKAEEEVSECVV-NTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEA
....: : .: .. .. : : . : : ...::.: .::.: . . .:.::::
CCDS33 AFAVSCPLLFGFNTTGDPTV--CSISNPD---FVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYV--
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KB9 RSRILKQTPNRTGKR-LTR--AQLITDSPGSTSSVTSIN------SRVPDVPSES--GSP
.::: : :: ::: .: . :: ... : . .: .. ... :.:
CCDS33 ---VLKQ---RRRKRILTRQNSQCNSVRPGFPQQTLSPDPAHLELKRYYSICQDTALGGP
220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 VYVNQVKVRVSDALLEKK---KLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICK
. . : .. :.: .:: ::.:::. ..:.::::::::::::. .. :.
CCDS33 GF----QERGGELKREEKTRNSLMPLREKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQ
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390
pF1KB9 DACWFHLAIFDFFTWLGYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
.: ... :::::.:: .::.::: : .:..:: :..
CCDS33 -TCHVSPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC
330 340 350 360
>>CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX (458 aa)
initn: 515 init1: 224 opt: 574 Z-score: 534.5 bits: 107.9 E(32554): 1.9e-23
Smith-Waterman score: 599; 31.3% identity (62.6% similar) in 358 aa overlap (38-385:46-384)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 CAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALITLATTLSN
. . :... : .: .... ..:.. .:
CCDS14 IGLLVWQSDISVSPVAAIVTDIFNTSDGGRFKFPDGVQ-NWPALSIVIIIIMTIG---GN
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 AFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGR-WTLGQVVCDFWL
.:: .: .:::. .::.. :::..:.::..::::.: . . : : . .: :.
CCDS14 ILVIMAVSMEKKLHNATNYFLMSLAIADMLVGLLVMPLSLLAILYDYVWPLPRYLCPVWI
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISISLP-PF
: :. ::::.:::.:.:::: :: . .:.: . .: . ::.::..::..:.: :
CCDS14 SLDVLFSTASIMHLCAISLDRYVAIRNPIEHSRFNSRTKAIMKIAIVWAISIGVSVPIPV
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 FWRQAKAEEEV----SECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYG-RIYVEARSRIL
. . ::.: . ::.: : . . : : ::..: ... : ::: :. ..
CCDS14 I--GLRDEEKVFVNNTTCVLN-DPNFVLIGSFV-AFFIPLTIMVITYCLTIYVLRRQALM
200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 KQTPNRTGKRLTRAQLITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSESGSPVYVNQVKVRVSDALLE
: ... . :: . . . .: .:..: .... : .
CCDS14 ----------LLHGHT-EEPPGLSLDFLKCCKRNTAEEENSANPNQDQNARRRKKKERRP
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB9 KKKLMAAR-ERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLA--IFDFFTWL
. ..: ::::.:.:::.. .:.. : :::: ... .:. .: .: ... :.:.
CCDS14 RGTMQAINNERKASKVLGIVFFVFLIMWCPFFITNILSVLCEKSCNQKLMEKLLNVFVWI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB9 GYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
::. : :::..::. :. ...:: . .:
CCDS14 GYVCSGINPLVYTLFNKIYRRAFSNYLRCNYKVEKKPPVRQIPRVAATALSGRELNVNIY
360 370 380 390 400 410
>>CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2 (481 aa)
initn: 446 init1: 194 opt: 566 Z-score: 527.0 bits: 106.6 E(32554): 4.9e-23
Smith-Waterman score: 568; 29.3% identity (65.5% similar) in 362 aa overlap (36-384:44-395)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 AQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALITLATTL
:. . ... .: : .::.... . :..
CCDS24 IPEHILQSTFVHVISSNWSGLQTESIPEEMKQIVEEQGNKLHWAALLILMVIIPTIG---
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTV-TGRWTLGQVVCDF
.:..:: .: .::. .::.. ::::.::::...::::. . . . : : :.:
CCDS24 GNTLVILAVSLEKKLQYATNYFLMSLAVADLLVGLFVMPIALLTIMFEAMWPLPLVLCPA
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 WLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISISLP-
:: :. ::::.:::.:..::: :: .. . . : . :..::..::.:..:
CCDS24 WLFLDVLFSTASIMHLCAISVDRYIAIKKPIQANQYNSRATAFIKITVVWLISIGIAIPV
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 PFFWRQAKAEEEVS-ECVVNTDHIL-YTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRILK
:. .. ... . ::.. ... . ......::. : ..:. : . ..: ..
CCDS24 PIKGIETDVDNPNNITCVLTKERFGDFMLFGSLAAFFTPLAIMIVTY-FLTIHALQKKAY
200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB9 QTPNRTGKRLTRAQLIT-----DSPGSTSSVTSI--NSRVPDVPSESGSPVYVNQVKVRV
. :. .::: . : ..: :. ... .:: . .:: ... .:
CCDS24 LVKNKPPQRLTWLTVSTVFQRDETPCSSPEKVAMLDGSRKDKALPNSG-----DETLMRR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 SDALLEKKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDAC-WFHLAIF-D
.... .:. . :..:.:.:::.. :.. : :::: .... .: :.: : .. .
CCDS24 TSTIGKKSVQTISNEQRASKVLGIVFFLFLLMWCPFFITNITLVLC-DSCNQTTLQMLLE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390
pF1KB9 FFTWLGYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
.:.:.::..: .::..::. :. :..:: . :
CCDS24 IFVWIGYVSSGVNPLVYTLFNKTFRDAFGRYITCNYRATKSVKTLRKRSSKIYFRNPMAE
370 380 390 400 410 420
CCDS24 NSKFFKKHGIRNGINPAMYQSPMRLRSSTIQSSSIILLDTLLLTENEGDKTEEQVSYV
430 440 450 460 470 480
>>CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 (465 aa)
initn: 674 init1: 443 opt: 540 Z-score: 503.5 bits: 102.2 E(32554): 1e-21
Smith-Waterman score: 562; 34.3% identity (61.5% similar) in 327 aa overlap (2-310:5-319)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MEEPGAQ--CAP----PPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVL
:.: :. :: : ::. .: : . ::. . : : : ...:
CCDS75 MFRQEQPLAEGSFAPMGSLQPDAGNASW----NGTEAPGGGARATPYSLQVTLTL-----
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 LVMLLALITLATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTV
: : .:. : :...:..:: .:. .: :..: : ...::: .:.::. ::.:.: :
CCDS75 -VCLAGLLMLLTVFGNVLVIIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 TGRWTLGQVVCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIA
: : .:.. :...:. :. ::.::.:::.:.:::::.::.:.::. ::::.: ..:
CCDS75 MGYWYFGKAWCEIYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIII
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB9 LVWVFSISISLPPFFWRQAKA-----EEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIA
:::.: ::.::.. . :. . .: .: :. :.. : .:.:. : :..:
CCDS75 TVWVISAVISFPPLISIEKKGGGGGPQPAEPRCEIN-DQKWYVISSCIGSFFAPCLIMIL
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 LYGRIYVEARSRILKQTPNRTGKRLTRA-----QLITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSE-
.: ::: :. : . :.: : . : . .. : :. .... .:..
CCDS75 VYVRIYQIAKRRT-RVPPSRRGPDAVAAPPGGTERRPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQL
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KB9 SGSPVYVNQVKVRVSDAL-LEKKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPI
.:.: . : .::: ::... ::
CCDS75 NGAPGEPAPAGPRDTDALDLEESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKPGDSLP
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 CKDACWFHLAIFDFFTWLGYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
CCDS75 RRGPGATGIGTPAAGPGEERVGAAKASRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWFPFFFT
350 360 370 380 390 400
390 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 19:48:46 2016 done: Fri Nov 4 19:48:47 2016
Total Scan time: 3.000 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]