FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9867, 446 aa
1>>>pF1KB9867 446 - 446 aa - 446 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7214+/-0.00118; mu= 15.3919+/- 0.071
mean_var=152.3490+/-58.728, 0's: 0 Z-trim(103.7): 304 B-trim: 916 in 2/48
Lambda= 0.103909
statistics sampled from 7067 (7537) to 7067 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.232), width: 16
Scan time: 2.910
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 2952 455.5 4.8e-128
CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4 ( 477) 1045 169.7 5.7e-42
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 ( 408) 677 114.4 2.1e-25
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 651 110.6 3.2e-24
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 651 110.6 3.3e-24
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 651 110.6 3.4e-24
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 651 110.6 3.4e-24
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 640 109.1 1.2e-23
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CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 597 102.5 9.4e-22
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 590 101.4 1.8e-21
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 570 98.5 1.6e-20
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 567 97.8 1.7e-20
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 522 91.1 1.9e-18
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 522 91.2 2e-18
CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 360) 520 90.8 2.4e-18
CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 378) 520 90.9 2.4e-18
CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 387) 520 90.9 2.5e-18
CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 388) 520 90.9 2.5e-18
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CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 428) 520 90.9 2.6e-18
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 471) 507 89.0 1.1e-17
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 491 86.6 5.6e-17
CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1 ( 440) 471 83.6 4.3e-16
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX ( 458) 467 83.0 6.7e-16
CCDS4956.1 HCRTR2 gene_id:3062|Hs108|chr6 ( 444) 450 80.5 3.9e-15
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CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 443) 427 77.0 4.2e-14
CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 414) 423 76.4 6.1e-14
CCDS344.1 HCRTR1 gene_id:3061|Hs108|chr1 ( 425) 413 74.9 1.8e-13
CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1 ( 590) 414 75.2 1.9e-13
CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15 ( 532) 408 74.3 3.4e-13
CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 ( 339) 403 73.3 4.4e-13
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 ( 366) 403 73.3 4.6e-13
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 400 72.9 6.3e-13
CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7 ( 466) 393 71.9 1.5e-12
CCDS53867.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 387) 387 70.9 2.5e-12
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 ( 365) 383 70.3 3.6e-12
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 ( 460) 380 70.0 5.7e-12
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 378 69.5 5.9e-12
CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 367) 372 68.7 1.1e-11
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 373 68.9 1.2e-11
CCDS2978.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 400) 372 68.7 1.2e-11
CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11 ( 479) 369 68.4 1.8e-11
CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 ( 348) 364 67.4 2.5e-11
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 364 67.6 3e-11
>>CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 (446 aa)
initn: 2952 init1: 2952 opt: 2952 Z-score: 2412.3 bits: 455.5 E(32554): 4.8e-128
Smith-Waterman score: 2952; 100.0% identity (100.0% similar) in 446 aa overlap (1-446:1-446)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MRTLNTSAMDGTGLVVERDFSVRILTACFLSLLILSTLLGNTLVCAAVIRFRHLRSKVTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MRTLNTSAMDGTGLVVERDFSVRILTACFLSLLILSTLLGNTLVCAAVIRFRHLRSKVTN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 FFVISLAVSDLLVAVLVMPWKAVAEIAGFWPFGSFCNIWVAFDIMCSTASILNLCVISVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FFVISLAVSDLLVAVLVMPWKAVAEIAGFWPFGSFCNIWVAFDIMCSTASILNLCVISVD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 RYWAISSPFRYERKMTPKAAFILISVAWTLSVLISFIPVQLSWHKAKPTSPSDGNATSLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RYWAISSPFRYERKMTPKAAFILISVAWTLSVLISFIPVQLSWHKAKPTSPSDGNATSLA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 ETIDNCDSSLSRTYAISSSVISFYIPVAIMIVTYTRIYRIAQKQIRRIAALERAAVHAKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ETIDNCDSSLSRTYAISSSVISFYIPVAIMIVTYTRIYRIAQKQIRRIAALERAAVHAKN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 CQTTTGNGKPVECSQPESSFKMSFKRETKVLKTLSVIMGVFVCCWLPFFILNCILPFCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CQTTTGNGKPVECSQPESSFKMSFKRETKVLKTLSVIMGVFVCCWLPFFILNCILPFCGS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 GETQPFCIDSNTFDVFVWFGWANSSLNPIIYAFNADFRKAFSTLLGCYRLCPATNNAIET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GETQPFCIDSNTFDVFVWFGWANSSLNPIIYAFNADFRKAFSTLLGCYRLCPATNNAIET
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 VSINNNGAAMFSSHHEPRGSISKECNLVYLIPHAVGSSEDLKKEEAAGIARPLEKLSPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VSINNNGAAMFSSHHEPRGSISKECNLVYLIPHAVGSSEDLKKEEAAGIARPLEKLSPAL
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KB9 SVILDYDTDVSLEKIQPITQNGQHPT
::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SVILDYDTDVSLEKIQPITQNGQHPT
430 440
>>CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4 (477 aa)
initn: 1627 init1: 784 opt: 1045 Z-score: 867.0 bits: 169.7 E(32554): 5.7e-42
Smith-Waterman score: 1647; 58.2% identity (79.1% similar) in 450 aa overlap (23-444:40-477)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MRTLNTSAMDGTGLVVERDFSVRILTACFLSLLILSTLLGNTLVCAAVIRFR
...:::.:.:::. :::::.:::::..: :
CCDS34 AYPGQFALYQQLAQGNAVGGSAGAPPLGPSQVVTACLLTLLIIWTLLGNVLVCAAIVRSR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 HLRSKVTNFFVISLAVSDLLVAVLVMPWKAVAEIAGFWPFGSFCNIWVAFDIMCSTASIL
:::...:: :..:::::::.::.::::::::::.::.::::.::..::::::::::::::
CCDS34 HLRANMTNVFIVSLAVSDLFVALLVMPWKAVAEVAGYWPFGAFCDVWVAFDIMCSTASIL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 NLCVISVDRYWAISSPFRYERKMTPKAAFILISVAWTLSVLISFIPVQLSWHKAKPTS--
:::::::::::::: ::::.:::: . :......:::::.:::::::::.::. . .:
CCDS34 NLCVISVDRYWAISRPFRYKRKMTQRMALVMVGLAWTLSILISFIPVQLNWHRDQAASWG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210
pF1KB9 ----PSD-GNATSLAETI-------DNCDSSLSRTYAISSSVISFYIPVAIMIVTYTRIY
:.. .: : : . .::::::.::::::::.::::::::::::::::::
CCDS34 GLDLPNNLANWTPWEEDFWEPDVNAENCDSSLNRTYAISSSLISFYIPVAIMIVTYTRIY
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 RIAQKQIRRIAALERAAVHAKNCQTTTGNGKPVECSQPESSFKMSFKRETKVLKTLSVIM
:::: :::::..::::: ::..:..... :. :..:.. :.:.::::::::::::
CCDS34 RIAQVQIRRISSLERAAEHAQSCRSSAA------CA-PDTSLRASIKKETKVLKTLSVIM
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 GVFVCCWLPFFILNCILPFC-GSGETQP--F-CIDSNTFDVFVWFGWANSSLNPIIYAFN
:::::::::::::::..::: : : : : :.. .:::::::::::::::::.:::::
CCDS34 GVFVCCWLPFFILNCMVPFCSGHPEGPPAGFPCVSETTFDVFVWFGWANSSLNPVIYAFN
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 ADFRKAFSTLLGCYRLCPATNNAIETVSINNNGAAMFSSHHEPRGSISKECNLVYLIPHA
:::.:.:. :::: ..: : .:::.:.:. ..: ... ....:.:
CCDS34 ADFQKVFAQLLGCSHFCSRT--PVETVNISNE---LISYNQDIVFHKEIAAAYIHMMPNA
370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KB9 V--GSSEDLKKEEAAGIARPLE--KLSP-----ALSVI-LDYDTDVSLEKIQPITQNGQH
: :. : . :: . . : .. . :: : :: :: . ..::.:: :.: :: :
CCDS34 VTPGNREVDNDEEEGPFDRMFQIYQTSPDGDPVAESVWELDCEGEISLDKITPFTPNGFH
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 PT
>>CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 (408 aa)
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Smith-Waterman score: 677; 33.2% identity (62.9% similar) in 367 aa overlap (25-378:39-395)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MRTLNTSAMDGTGLVVERDFSVRILTACFLSLLILSTLLGNTLVCAAVIRFRHL
:.. .:.: .:.:. :: :: .:. .:
CCDS60 SSLAPWPDLPTLAPNTANTSGLPGVPWEAALAGALLALAVLATVGGNLLVIVAIAWTPRL
10 20 30 40 50 60
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pF1KB9 RSKVTNFFVISLAVSDLLVAVLVMPWKAVAEIAGFWPFGSF-CNIWVAFDIMCSTASILN
.. .:: :: :::..::....::.: :. ..: ::.:. :..:.. :..: :::: .
CCDS60 QT-MTNVFVTSLAAADLVMGLLVVPPAATLALTGHWPLGATGCELWTSVDVLCVTASIET
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 LCVISVDRYWAISSPFRYERKMTPKAAFILISVAWTLSVLISFIPVQLSWHKAKPTSPSD
::...:::: :...:.:: .: . : . ..:..:. .:: :.. .: .. .:
CCDS60 LCALAVDRYLAVTNPLRYGALVTKRCARTAVVLVWVVSAAVSFAPIMSQWWRVG----AD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 GNATSLAETIDNCDSSLSRTYAISSSVISFYIPVAIMIVTYTRIYRIAQKQIRRI-AALE
..: . : . . :.. :: .:::.:. .:. .:.:.. .: .:.: . . :
CCDS60 AEAQRCHSNPRCCAFASNMPYVLLSSSVSFYLPLLVMLFVYARVFVVATRQLRLLRGELG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KB9 R-AAVHAKNCQTTTGNGKPV-ECSQPES-------SFKMSFKRETKVLKTLSVIMGVFVC
: .. . . :: :. ::. .. :: ..: ::..:::.:.
CCDS60 RFPPEESPPAPSRSLAPAPVGTCAPPEGVPACGRRPARLLPLREHRALCTLGLIMGTFTL
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 CWLPFFILNCILPFCGSGETQPFCIDSNTFDVFVWFGWANSSLNPIIYAFNADFRKAFST
::::::. : . . : : . . .: .. :.:.:::..::.:: . :::.::
CCDS60 CWLPFFLANVLRALGG-----PSLVPGPAFLALNWLGYANSAFNPLIYCRSPDFRSAFRR
310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 LLG-CYRLCPATNNAIETVSINNNGA-AMFSSHHEPRGSISKECNLVYLIPHAVGSSEDL
:: : : : : .. .:. : :: .::
CCDS60 LLCRCGRRLPPEPCAAARPALFPSGVPAARSSPAQPRLCQRLDGASWGVS
360 370 380 390 400
410 420 430 440
pF1KB9 KKEEAAGIARPLEKLSPALSVILDYDTDVSLEKIQPITQNGQHPT
>>CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 (429 aa)
initn: 574 init1: 276 opt: 651 Z-score: 548.3 bits: 110.6 E(32554): 3.2e-24
Smith-Waterman score: 717; 36.9% identity (66.3% similar) in 347 aa overlap (19-351:22-347)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MRTLNTSAMDGTGLVVERDFSVRILTACFLSLLILSTLLGNTLVCAAVIRFRHLRSK
..: :: . .:. ::: .::: :: .: :::.:
CCDS60 MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILFGVLGNILVILSVACHRHLHS-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 VTNFFVISLAVSDLLVAVLVMPWKAVAEIAGFWPFGS-FCNIWVAFDIMCSTASILNLCV
::......:::.:::.. :.:..:. :. :.: :: :::::.: :..: ::::..::.
CCDS60 VTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFCNIWAAVDVLCCTASIMGLCI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 ISVDRYWAISSPFRYERKMTPKAAFILISVAWTLSVLISFIPVQLSWHKAKPTSPSDGNA
::.::: ..: :.:: .: . ... . .:.::..::. :. ..:.. : .: :
CCDS60 ISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALSLVISIGPL-FGWRQ--P-APED---
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 TSLAETIDNCDSSLSRTYAISSSVISFYIPVAIMIVTYTRIYRIAQKQIRRIAALERAA-
::: :. . :.. :.. :::.:.::..: : :.: .:... : . . ..
CCDS60 ----ETI--CQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGLKSGLKTDK
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KB9 ---------VHAKNCQTTTGNGKPVECSQPESSFKM-SFKRETKVLKTLSVIMGVFVCCW
.: :: . :.: .. . : .. .:.:: :. :::....: :: ::
CCDS60 SDSEQVTLRIHRKNAPAG-GSGMASAKTKTHFSVRLLKFSREKKAAKTLGIVVGCFVLCW
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 LPFFILNCILPFCGSGETQP-FCIDSNTFDVFVWFGWANSSLNPIIYAFNA-DFRKAFST
::::. ..:. : : : . ..: . :.:. :: .::::: .. .:.:::..
CCDS60 LPFFL---VMPI---GSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPCSSQEFKKAFQN
290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 LLGCYRLCPATNNAIETVSINNNGAAMFSSHHEPRGSISKECNLVYLIPHAVGSSEDLKK
.: ::
CCDS60 VLRIQCLCRKQSSKHALGYTLHPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYRISKTDGVCEWKF
340 350 360 370 380 390
>>CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 (455 aa)
initn: 574 init1: 276 opt: 651 Z-score: 548.0 bits: 110.6 E(32554): 3.3e-24
Smith-Waterman score: 717; 36.9% identity (66.3% similar) in 347 aa overlap (19-351:22-347)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MRTLNTSAMDGTGLVVERDFSVRILTACFLSLLILSTLLGNTLVCAAVIRFRHLRSK
..: :: . .:. ::: .::: :: .: :::.:
CCDS60 MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILFGVLGNILVILSVACHRHLHS-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 VTNFFVISLAVSDLLVAVLVMPWKAVAEIAGFWPFGS-FCNIWVAFDIMCSTASILNLCV
::......:::.:::.. :.:..:. :. :.: :: :::::.: :..: ::::..::.
CCDS60 VTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFCNIWAAVDVLCCTASIMGLCI
60 70 80 90 100 110
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pF1KB9 ISVDRYWAISSPFRYERKMTPKAAFILISVAWTLSVLISFIPVQLSWHKAKPTSPSDGNA
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pF1KB9 EPRGSISKECNLVYLIPHAVGSSEDLKKEEAAGIARPLEKLSPALSVILDYDTDVSLEKI
CCDS13 DCAPSSGDAPPGAPLALTALPDPDPEPPGTPEMQAPVASRRKPPSAFREWRLLGPFRRPT
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CCDS43 TSAPAHWGELKNANFTGPNQTSSNSTLPQLDITRAISVGLVLGAFILFAIVGNILVILSV
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CCDS43 ACNRHLRTP-TNYFIVNLAMADLLLSFTVLPFSAALEVLGYWVLGRIFCDIWAAVDVLCC
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CCDS43 TASILSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKAILALLSVWVLSTVISIGPL-LGW---K
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CCDS43 EPAPNDDK---------ECGVTEEPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRVYIVAKRTTKN
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pF1KB9 IAA--LERAA--------VHAKNCQTTTGNGKPVECSQPESSFKMS---FKRETKVLKTL
. : ... . .:.:: . : .. .. .:.::. .. :.:: :. :::
CCDS43 LEAGVMKEMSNSKELTLRIHSKNFHEDTLSSTKAKGHNPRSSIAVKLFKFSREKKAAKTL
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CCDS43 GIVVGMFILCWLPFFI---ALPL-GSLFSTLKP---PDAVFKVVFWLGYFNSCLNPIIYP
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pF1KB9 FNA-DFRKAFSTLLGCYRLCPATNNAIETVSINNNGAAMFSSHHEPRGSISKECNLVYLI
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CCDS43 CSSKEFKRAFVRILGCQCRGRGRRRRRRRRRLGGCAYTYRPWTRGGSLERSQSRKDSLDD
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pF1KB9 MRTLNTSAMDGTGLVVERDFSVRILTACFLSLLILSTLLG
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CCDS74 PVAGSWAPHLLSEVTASPAPTWDAPPDNASGCGEQINYGRVEKVVIGSILTLITLLTIAG
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pF1KB9 NTLVCAAVIRFRHLRSKVTNFFVISLAVSDLLVAVLVMPWKAVAE-IAGFWPFGSF-CNI
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CCDS74 NCLVVISVCFVKKLRQP-SNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNV
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CCDS74 FIAMDVMCCTASIMTLCVISIDRYLGITRPLTYPVRQNGKCMAKMILSVWLLSASITLPP
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. ..: . . .: .. : : . :.: :....::::...:. : .::
CCDS74 L-FGWAQ----NVNDDKV---------CLISQDFGYTIYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIY
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CCDS74 KAARKSAAKHKFPGFPR--VEPDSVIALNGIVKLQKEVEECANLSRLLKHERKNISIFKR
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270 280 290 300 310 320
pF1KB9 ETKVLKTLSVIMGVFVCCWLPFFILNCILPF-CGSGETQPFCIDSNTFDVFVWFGWANSS
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330 340 350 360 370 380
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CCDS74 INPFIYAFFNRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]