Result of FASTA (ccds) for pF1KB9898
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9898, 2002 aa
  1>>>pF1KB9898     2002 - 2002 aa - 2002 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4036+/-0.00121; mu= -3.6273+/- 0.073
 mean_var=282.7341+/-58.349, 0's: 0 Z-trim(110.9): 20  B-trim: 127 in 1/51
 Lambda= 0.076276
 statistics sampled from 11976 (11993) to 11976 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.682), E-opt: 0.2 (0.368), width:  16
 Scan time:  5.210

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS47120.1 TET2 gene_id:54790|Hs108|chr4          (2002) 13593 1510.9       0
CCDS3666.1 TET2 gene_id:54790|Hs108|chr4           (1165) 7703 862.6       0
CCDS46339.2 TET3 gene_id:200424|Hs108|chr2         (1795) 2045 240.1 6.2e-62
CCDS7281.1 TET1 gene_id:80312|Hs108|chr10          (2136) 1812 214.5 3.8e-54


>>CCDS47120.1 TET2 gene_id:54790|Hs108|chr4               (2002 aa)
 initn: 13593 init1: 13593 opt: 13593  Z-score: 8092.4  bits: 1510.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 13593; 100.0% identity (100.0% similar) in 2002 aa overlap (1-2002:1-2002)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MEQDRTNHVEGNRLSPFLIPSPPICQTEPLATKLQNGSPLPERAHPEVNGDTKWHSFKSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MEQDRTNHVEGNRLSPFLIPSPPICQTEPLATKLQNGSPLPERAHPEVNGDTKWHSFKSY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 YGIPCMKGSQNSRVSPDFTQESRGYSKCLQNGGIKRTVSEPSLSGLLQIKKLKQDQKANG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YGIPCMKGSQNSRVSPDFTQESRGYSKCLQNGGIKRTVSEPSLSGLLQIKKLKQDQKANG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 ERRNFGVSQERNPGESSQPNVSDLSDKKESVSSVAQENAVKDFTSFSTHNCSGPENPELQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ERRNFGVSQERNPGESSQPNVSDLSDKKESVSSVAQENAVKDFTSFSTHNCSGPENPELQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 ILNEQEGKSANYHDKNIVLLKNKAVLMPNGATVSASSVEHTHGELLEKTLSQYYPDCVSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ILNEQEGKSANYHDKNIVLLKNKAVLMPNGATVSASSVEHTHGELLEKTLSQYYPDCVSI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 AVQKTTSHINAINSQATNELSCEITHPSHTSGQINSAQTSNSELPPKPAAVVSEACDADD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AVQKTTSHINAINSQATNELSCEITHPSHTSGQINSAQTSNSELPPKPAAVVSEACDADD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 ADNASKLAAMLNTCSFQKPEQLQQQKSVFEICPSPAENNIQGTTKLASGEEFCSGSSSNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ADNASKLAAMLNTCSFQKPEQLQQQKSVFEICPSPAENNIQGTTKLASGEEFCSGSSSNL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 QAPGGSSERYLKQNEMNGAYFKQSSVFTKDSFSATTTPPPPSQLLLSPPPPLPQVPQLPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QAPGGSSERYLKQNEMNGAYFKQSSVFTKDSFSATTTPPPPSQLLLSPPPPLPQVPQLPS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 EGKSTLNGGVLEEHHHYPNQSNTTLLREVKIEGKPEAPPSQSPNPSTHVCSPSPMLSERP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EGKSTLNGGVLEEHHHYPNQSNTTLLREVKIEGKPEAPPSQSPNPSTHVCSPSPMLSERP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 QNNCVNRNDIQTAGTMTVPLCSEKTRPMSEHLKHNPPIFGSSGELQDNCQQLMRNKEQEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QNNCVNRNDIQTAGTMTVPLCSEKTRPMSEHLKHNPPIFGSSGELQDNCQQLMRNKEQEI
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 LKGRDKEQTRDLVPPTQHYLKPGWIELKAPRFHQAESHLKRNEASLPSILQYQPNLSNQM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LKGRDKEQTRDLVPPTQHYLKPGWIELKAPRFHQAESHLKRNEASLPSILQYQPNLSNQM
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB9 TSKQYTGNSNMPGGLPRQAYTQKTTQLEHKSQMYQVEMNQGQSQGTVDQHLQFQKPSHQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TSKQYTGNSNMPGGLPRQAYTQKTTQLEHKSQMYQVEMNQGQSQGTVDQHLQFQKPSHQV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB9 HFSKTDHLPKAHVQSLCGTRFHFQQRADSQTEKLMSPVLKQHLNQQASETEPFSNSHLLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HFSKTDHLPKAHVQSLCGTRFHFQQRADSQTEKLMSPVLKQHLNQQASETEPFSNSHLLQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB9 HKPHKQAAQTQPSQSSHLPQNQQQQQKLQIKNKEEILQTFPHPQSNNDQQREGSFFGQTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HKPHKQAAQTQPSQSSHLPQNQQQQQKLQIKNKEEILQTFPHPQSNNDQQREGSFFGQTK
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB9 VEECFHGENQYSKSSEFETHNVQMGLEEVQNINRRNSPYSQTMKSSACKIQVSCSNNTHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VEECFHGENQYSKSSEFETHNVQMGLEEVQNINRRNSPYSQTMKSSACKIQVSCSNNTHL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB9 VSENKEQTTHPELFAGNKTQNLHHMQYFPNNVIPKQDLLHRCFQEQEQKSQQASVLQGYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VSENKEQTTHPELFAGNKTQNLHHMQYFPNNVIPKQDLLHRCFQEQEQKSQQASVLQGYK
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB9 NRNQDMSGQQAAQLAQQRYLIHNHANVFPVPDQGGSHTQTPPQKDTQKHAALRWHLLQKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NRNQDMSGQQAAQLAQQRYLIHNHANVFPVPDQGGSHTQTPPQKDTQKHAALRWHLLQKQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB9 EQQQTQQPQTESCHSQMHRPIKVEPGCKPHACMHTAPPENKTWKKVTKQENPPASCDNVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EQQQTQQPQTESCHSQMHRPIKVEPGCKPHACMHTAPPENKTWKKVTKQENPPASCDNVQ
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB9 QKSIIETMEQHLKQFHAKSLFDHKALTLKSQKQVKVEMSGPVTVLTRQTTAAELDSHTPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QKSIIETMEQHLKQFHAKSLFDHKALTLKSQKQVKVEMSGPVTVLTRQTTAAELDSHTPA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB9 LEQQTTSSEKTPTKRTAASVLNNFIESPSKLLDTPIKNLLDTPVKTQYDFPSCRCVEQII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LEQQTTSSEKTPTKRTAASVLNNFIESPSKLLDTPIKNLLDTPVKTQYDFPSCRCVEQII
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB9 EKDEGPFYTHLGAGPNVAAIREIMEERFGQKGKAIRIERVIYTGKEGKSSQGCPIAKWVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EKDEGPFYTHLGAGPNVAAIREIMEERFGQKGKAIRIERVIYTGKEGKSSQGCPIAKWVV
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB9 RRSSSEEKLLCLVRERAGHTCEAAVIVILILVWEGIPLSLADKLYSELTETLRKYGTLTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RRSSSEEKLLCLVRERAGHTCEAAVIVILILVWEGIPLSLADKLYSELTETLRKYGTLTN
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB9 RRCALNEERTCACQGLDPETCGASFSFGCSWSMYYNGCKFARSKIPRKFKLLGDDPKEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RRCALNEERTCACQGLDPETCGASFSFGCSWSMYYNGCKFARSKIPRKFKLLGDDPKEEE
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KB9 KLESHLQNLSTLMAPTYKKLAPDAYNNQIEYEHRAPECRLGLKEGRPFSGVTACLDFCAH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KLESHLQNLSTLMAPTYKKLAPDAYNNQIEYEHRAPECRLGLKEGRPFSGVTACLDFCAH
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KB9 AHRDLHNMQNGSTLVCTLTREDNREFGGKPEDEQLHVLPLYKVSDVDEFGSVEAQEEKKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AHRDLHNMQNGSTLVCTLTREDNREFGGKPEDEQLHVLPLYKVSDVDEFGSVEAQEEKKR
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KB9 SGAIQVLSSFRRKVRMLAEPVKTCRQRKLEAKKAAAEKLSSLENSSNKNEKEKSAPSRTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SGAIQVLSSFRRKVRMLAEPVKTCRQRKLEAKKAAAEKLSSLENSSNKNEKEKSAPSRTK
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KB9 QTENASQAKQLAELLRLSGPVMQQSQQPQPLQKQPPQPQQQQRPQQQQPHHPQTESVNSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QTENASQAKQLAELLRLSGPVMQQSQQPQPLQKQPPQPQQQQRPQQQQPHHPQTESVNSY
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KB9 SASGSTNPYMRRPNPVSPYPNSSHTSDIYGSTSPMNFYSTSSQAAGSYLNSSNPMNPYPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SASGSTNPYMRRPNPVSPYPNSSHTSDIYGSTSPMNFYSTSSQAAGSYLNSSNPMNPYPG
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KB9 LLNQNTQYPSYQCNGNLSVDNCSPYLGSYSPQSQPMDLYRYPSQDPLSKLSLPPIHTLYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LLNQNTQYPSYQCNGNLSVDNCSPYLGSYSPQSQPMDLYRYPSQDPLSKLSLPPIHTLYQ
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KB9 PRFGNSQSFTSKYLGYGNQNMQGDGFSSCTIRPNVHHVGKLPPYPTHEMDGHFMGATSRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PRFGNSQSFTSKYLGYGNQNMQGDGFSSCTIRPNVHHVGKLPPYPTHEMDGHFMGATSRL
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KB9 PPNLSNPNMDYKNGEHHSPSHIIHNYSAAPGMFNSSLHALHLQNKENDMLSHTANGLSKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PPNLSNPNMDYKNGEHHSPSHIIHNYSAAPGMFNSSLHALHLQNKENDMLSHTANGLSKM
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KB9 LPALNHDRTACVQGGLHKLSDANGQEKQPLALVQGVASGAEDNDEVWSDSEQSFLDPDIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LPALNHDRTACVQGGLHKLSDANGQEKQPLALVQGVASGAEDNDEVWSDSEQSFLDPDIG
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KB9 GVAVAPTHGSILIECAKRELHATTPLKNPNRNHPTRISLVFYQHKSMNEPKHGLALWEAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GVAVAPTHGSILIECAKRELHATTPLKNPNRNHPTRISLVFYQHKSMNEPKHGLALWEAK
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

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CCDS47 DSTVTTSPYAFTRVTGPYNRYI
             1990      2000  

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       .  :    :: :. :..: .   :   :                                
CCDS36 KCTE----TH-GVYPELANLSSDMGFSFFF                              
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CCDS46 PIQIKKSRPREAQPLFPPVRQIVLEGLRSPASQEVQAHPPA---PLPASQGSAVPLPPEP
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       .          :.  . ....  : :.    .:. :  .  . .: .     : ..:  .
CCDS46 SLA--------LFAPSPSRDSLLPPTQ----EMRSPSPMT-ALQPGSTGPLPPADDKLEE
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        . . :   ..  ..     .  .. . .:    .   .. .. .: ::.:.: :: :::
CCDS46 LIRQFEAEFGDSFGLPGPPSVPIQDPENQQTCLPA--PESPFATRSPKQIKIESSGAVTV
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pF1KB9 LTRQTTAAELDSHTPALEQQTTSSEKTPTKRTA--ASVLNNFIESPSKLLDTPIKNLLDT
       :.           :  ....  ..: ::::     . .:..:.::: : :::: :.::::
CCDS46 LS-----------TTCFHSEEGGQEATPTKAENPLTPTLSGFLESPLKYLDTPTKSLLDT
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pF1KB9 PVK-TQYDFPSCRCVEQIIEKDEGPFYTHLGAGPNVAAIREIMEERFGQKGKAIRIERVI
       :.: .: .::.: :::::.::::::.:::::.::.::.:::.::::.:.::::::::.::
CCDS46 PAKRAQAEFPTCDCVEQIVEKDEGPYYTHLGSGPTVASIRELMEERYGEKGKAIRIEKVI
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pF1KB9 YTGKEGKSSQGCPIAKWVVRRSSSEEKLLCLVRERAGHTCEAAVIVILILVWEGIPLSLA
       :::::::::.::::::::.:: . :::::::::.:::: :. ::::::::.::::: ::.
CCDS46 YTGKEGKSSRGCPIAKWVIRRHTLEEKLLCLVRHRAGHHCQNAVIVILILAWEGIPRSLG
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pF1KB9 DKLYSELTETLRKYGTLTNRRCALNEERTCACQGLDPETCGASFSFGCSWSMYYNGCKFA
       : ::.:::.::::::. :.:::.::..::::::: ::.:::::::::::::::.::::.:
CCDS46 DTLYQELTDTLRKYGNPTSRRCGLNDDRTCACQGKDPNTCGASFSFGCSWSMYFNGCKYA
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pF1KB9 RSKIPRKFKLLGDDPKEEEKLESHLQNLSTLMAPTYKKLAPDAYNNQIEYEHRAPECRLG
       ::: ::::.: ::.::::: :.. .:.:.: .:: ::.:::.::.::.  :. : .::::
CCDS46 RSKTPRKFRLAGDNPKEEEVLRKSFQDLATEVAPLYKRLAPQAYQNQVTNEEIAIDCRLG
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pF1KB9 LKEGRPFSGVTACLDFCAHAHRDLHNMQNGSTLVCTLTREDNREFGGKPEDEQLHVLPLY
       :::::::.:::::.:::::::.: ::. :: :.:::::.::::  :  ::::::::::::
CCDS46 LKEGRPFAGVTACMDFCAHAHKDQHNLYNGCTVVCTLTKEDNRCVGKIPEDEQLHVLPLY
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pF1KB9 KVSDVDEFGSVEAQEEKKRSGAIQVLSSFRRKVRMLAEPVKTCRQRKLEAKKAAAEKLSS
       :....::::: : :. :  :::::::..: :.:: : ::.:.::::.:::.::::::   
CCDS46 KMANTDEFGSEENQNAKVGSGAIQVLTAFPREVRRLPEPAKSCRQRQLEARKAAAEK---
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pF1KB9 LENSSNKNEKEK-SAPSRTKQTENASQAKQLAELLRLSGPVMQQSQQP----QPLQK---
            .: .::: :.: . ::      .      : :.: . ::. .:    .: ..   
CCDS46 -----KKIQKEKLSTPEKIKQEALELAGITSDPGLSLKGGLSQQGLKPSLKVEPQNHFSS
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        .  .: .  : :::          ::.. .. ::   ... .  : :      .: .: 
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        .  ..   :     :.:  ::.   : :    :.:.    : ..:    : :.  :   
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        ::   . .. . : :::.:..   .:.:  : : ..     : : :..        :: 
CCDS46 GPSLTEKPWALGAGDFNSALKGSPGFQDKLWNPMKGEEGRIPAAGASQLDRAWQSFGLPL
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        . ..   .  . .:: :  . :. :         .   .: ... :...:.:::::..:
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       :: .::::::::.:::::::::.::::::::::.::: :::::::::::::..:.:.:::
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       :::::::   ::.:: ..::  .                                     
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CCDS72 SSLTKQKNPTQKKTKSTPSRDRRKKKPTVVSYQENDRQKWEKLSYMYGTICDIWIASKFQ
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        . ..:.: :....:.::.::.::::::::.:::.:::::.:.::::.::::: :.::::
CCDS72 KDSELPTCSCLDRVIQKDKGPYYTHLGAGPSVAAVREIMENRYGQKGNAIRIEIVVYTGK
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CCDS72 DTDEFGSKEGMEAKIKSGAIEVLAPRRKKRTCFTQPVPRSGKKRAAMMTEVLAHKIRAVE
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CCDS72 KKPIPRIKRKNNSTTT----NNSKPSSLPTL----G---SNTETVQPEVKSETEPHFILK
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                .......::   :.      :.::.    .   :   .:..:  . . .. 
CCDS72 ---------SSDNTKTYSLMPSA------PHPVKEASPGFSWSPKTASATPAPLKNDATA
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pF1KB9 AAGSYLNSSNPMNPYPGLLNQNTQYPSYQCNGNLSVDNCSPYLGSYSPQSQPMDLYRYPS
       . :    ::.:   .:              .: ::  : .   :              :.
CCDS72 SCGFSERSSTPHCTMP--------------SGRLSGANAAAADG--------------PG
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        . :....  :. ::  :                            ...: ..       
CCDS72 ISQLGEVA--PLPTLSAP----------------------------VMEPLINS------
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        :.        :.:  : :.  .::        :.:: .     ..:  . ::      :
CCDS72 EPS-------TGVTEPLTPH--QPN--------HQPSFL-----TSPQDLASSPMEEDEQ
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       ..: :             : :. :           :: :  .:: :              
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       :: :::::. ::: .:::::.::.:::.:::::.::::::::...::::::::.::::::
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