FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9906, 589 aa
1>>>pF1KB9906 589 - 589 aa - 589 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8453+/-0.000959; mu= 4.1527+/- 0.058
mean_var=192.2929+/-38.515, 0's: 0 Z-trim(112.4): 25 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.092490
statistics sampled from 13133 (13148) to 13133 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.735), E-opt: 0.2 (0.404), width: 16
Scan time: 3.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6663.1 UBQLN1 gene_id:29979|Hs108|chr9 ( 589) 3824 522.7 5e-148
CCDS6664.1 UBQLN1 gene_id:29979|Hs108|chr9 ( 561) 2718 375.1 1.3e-103
CCDS14374.1 UBQLN2 gene_id:29978|Hs108|chrX ( 624) 2617 361.7 1.6e-99
CCDS1127.1 UBQLN4 gene_id:56893|Hs108|chr1 ( 601) 2029 283.2 6.4e-76
CCDS7758.1 UBQLN3 gene_id:50613|Hs108|chr11 ( 655) 1150 165.9 1.4e-40
CCDS31385.1 UBQLNL gene_id:143630|Hs108|chr11 ( 475) 641 97.9 3e-20
>>CCDS6663.1 UBQLN1 gene_id:29979|Hs108|chr9 (589 aa)
initn: 3824 init1: 3824 opt: 3824 Z-score: 2771.0 bits: 522.7 E(32554): 5e-148
Smith-Waterman score: 3824; 100.0% identity (100.0% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-589)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAESGESGGPPGSQDSAAGAEGAGAPAAAASAEPKIMKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MAESGESGGPPGSQDSAAGAEGAGAPAAAASAEPKIMKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 FKEEISKRFKSHTDQLVLIFAGKILKDQDTLSQHGIHDGLTVHLVIKTQNRPQDHSAQQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 FKEEISKRFKSHTDQLVLIFAGKILKDQDTLSQHGIHDGLTVHLVIKTQNRPQDHSAQQT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 NTAGSNVTTSSTPNSNSTSGSATSNPFGLGGLGGLAGLSSLGLNTTNFSELQSQMQRQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NTAGSNVTTSSTPNSNSTSGSATSNPFGLGGLGGLAGLSSLGLNTTNFSELQSQMQRQLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 SNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHMLNNPDIMRQTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHMLNNPDIMRQTLE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPFASLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPFASLV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 SNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQTSQSSSASSGTASTVGGTTGSTASGTSGQSTTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQTSQSSSASSGTASTVGGTTGSTASGTSGQSTTA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 PNLVPGVGASMFNTPGMQSLLQQITENPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PNLVPGVGASMFNTPGMQSLLQQITENPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 NPLFAGNPQLQEQMRQQLPTFLQQMQNPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NPLFAGNPQLQEQMRQQLPTFLQQMQNPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 IPGFTPGLGALGSTGGSSGTNGSNATPSENTSPTAGTTEPGHQQFIQQMLQALAGVNPQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 IPGFTPGLGALGSTGGSSGTNGSNATPSENTSPTAGTTEPGHQQFIQQMLQALAGVNPQL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KB9 QNPEVRFQQQLEQLSAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QNPEVRFQQQLEQLSAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS
550 560 570 580
>>CCDS6664.1 UBQLN1 gene_id:29979|Hs108|chr9 (561 aa)
initn: 2710 init1: 2710 opt: 2718 Z-score: 1973.8 bits: 375.1 E(32554): 1.3e-103
Smith-Waterman score: 3565; 95.2% identity (95.2% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-561)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAESGESGGPPGSQDSAAGAEGAGAPAAAASAEPKIMKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MAESGESGGPPGSQDSAAGAEGAGAPAAAASAEPKIMKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 FKEEISKRFKSHTDQLVLIFAGKILKDQDTLSQHGIHDGLTVHLVIKTQNRPQDHSAQQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 FKEEISKRFKSHTDQLVLIFAGKILKDQDTLSQHGIHDGLTVHLVIKTQNRPQDHSAQQT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 NTAGSNVTTSSTPNSNSTSGSATSNPFGLGGLGGLAGLSSLGLNTTNFSELQSQMQRQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NTAGSNVTTSSTPNSNSTSGSATSNPFGLGGLGGLAGLSSLGLNTTNFSELQSQMQRQLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 SNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHMLNNPDIMRQTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHMLNNPDIMRQTLE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPFASLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPFASLV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 SNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQTSQSSSASSGTASTVGGTTGSTASGTSGQSTTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQTSQSSSASSGTASTVGGTTGSTASGTSGQSTTA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 PNLVPGVGASMFNTPGMQSLLQQITENPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PNLVPGVGASMFNTPGMQSLLQQITENPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQM---
370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 NPLFAGNPQLQEQMRQQLPTFLQQMQNPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 -------------------------QNPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGL
420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 IPGFTPGLGALGSTGGSSGTNGSNATPSENTSPTAGTTEPGHQQFIQQMLQALAGVNPQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 IPGFTPGLGALGSTGGSSGTNGSNATPSENTSPTAGTTEPGHQQFIQQMLQALAGVNPQL
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580
pF1KB9 QNPEVRFQQQLEQLSAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QNPEVRFQQQLEQLSAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS
520 530 540 550 560
>>CCDS14374.1 UBQLN2 gene_id:29978|Hs108|chrX (624 aa)
initn: 3022 init1: 1826 opt: 2617 Z-score: 1900.2 bits: 361.7 E(32554): 1.6e-99
Smith-Waterman score: 2931; 74.5% identity (87.1% similar) in 628 aa overlap (1-582:1-617)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAESGESGGPPGSQDSAAGAEGAGAPAAAASAEPKIMKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQ
:::.:::.::: . . :.:.:. ::: :::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS14 MAENGESSGPPRPSRGPAAAQGS----AAAPAEPKIIKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 FKEEISKRFKSHTDQLVLIFAGKILKDQDTLSQHGIHDGLTVHLVIKTQNRPQDHSAQQT
::: :::::::.::::::::::::::::::: :::::::::::::::.::::: .:.: .
CCDS14 FKEAISKRFKSQTDQLVLIFAGKILKDQDTLIQHGIHDGLTVHLVIKSQNRPQGQSTQPS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 NTAGSNVTTSSTPNSNSTSGSATSNPFGLGGLGGLAGLSSLGLNTTNFSELQSQMQRQLL
:.::.:.:..::: :::: :..:::::::.::::::::::::..:::::::::::.::.
CCDS14 NAAGTNTTSASTPRSNSTPISTNSNPFGLGSLGGLAGLSSLGLSSTNFSELQSQMQQQLM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 SNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHMLNNPDIMRQTLE
..::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS14 ASPEMMIQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHLLNNPDIMRQTLE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPFASLV
.::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.
CCDS14 IARNPAMMQEMMRNQDLALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLNAAQEQFGGNPFASVG
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 SNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQTSQSSSASSGTASTVGGTTGSTASGTSGQSTTA
:..:::::.::::::::::::::::: . .:::...:....:. .:...:...:....:
CCDS14 SSSSSGEGTQPSRTENRDPLPNPWAPPPATQSSATTSTTTSTGSGSGNSSSNATGNTVAA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 PNLVPGVGASMFNTPGMQSLLQQITENPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLN
: : ::.:.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ANYV----ASIFSTPGMQSLLQQITENPQLIQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLN
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 NPLFAGNPQLQEQMRQQLPTFLQQMQNPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGL
.:::..::::::::: :::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS14 SPLFTANPQLQEQMRPQLPAFLQQMQNPDTLSAMSNPRAMQALMQIQQGLQTLATEAPGL
420 430 440 450 460 470
490 500
pF1KB9 IPGFTPGLGA---------------------------------LGSTG-----GSSGTNG
::.::::.:. .: :: ::.:..:
CCDS14 IPSFTPGVGVGVLGTAIGPVGPVTPIGPIGPIVPFTPIGPIGPIGPTGPAAPPGSTGSGG
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550
pF1KB9 ------SNATPSENTSPTAGTTEPG-HQQFIQQMLQALAGVN-PQLQNPEVRFQQQLEQL
:.:.:::.:::: .: : .:::::::.:::::.: ::: :::::::::::::
CCDS14 PTGPTVSSAAPSETTSPT---SESGPNQQFIQQMVQALAGANAPQLPNPEVRFQQQLEQL
540 550 560 570 580
560 570 580
pF1KB9 SAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS
.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS
590 600 610 620
>>CCDS1127.1 UBQLN4 gene_id:56893|Hs108|chr1 (601 aa)
initn: 1876 init1: 908 opt: 2029 Z-score: 1476.4 bits: 283.2 E(32554): 6.4e-76
Smith-Waterman score: 2337; 62.8% identity (83.2% similar) in 608 aa overlap (26-589:4-601)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAESGESGGPPGSQDSAAGAEGAGAPAAAASAEPKIMKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQ
:..: . : ..:::::::.:::... . .::..
CCDS11 MAEPSGAETRPP--IRVTVKTPKDKEEIVICDRASVKE
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 FKEEISKRFKSHTDQLVLIFAGKILKDQDTLSQHGIHDGLTVHLVIKTQNRPQDHSAQQT
::::::.:::.. :::::::::::::: :::.::::.::::::::::: .. :: .: .
CCDS11 FKEEISRRFKAQQDQLVLIFAGKILKDGDTLNQHGIKDGLTVHLVIKTPQKAQDPAAATA
40 50 60 70 80 90
130 140
pF1KB9 NT--------AGSNVTTS-STPNSNSTSGSATSN---------------------PFG--
.. : :.. .: .:: . ::::::.:. : .
CCDS11 SSPSTPDPASAPSTTPASPATPAQPSTSGSASSDAGSGSRRSSGGGPSPGAGEGSPSATA
100 110 120 130 140 150
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 --LGGLGGLAGLSSLGLNTTNFSELQSQMQRQLLSNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMR
:.:.::. ::.::::...:: :::.::::::.:::::. ::::::.::.:.:::::::
CCDS11 SILSGFGGILGLGSLGLGSANFMELQQQMQRQLMSNPEMLSQIMENPLVQDMMSNPDLMR
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 QLIMANPQMQQLIQRNPEISHMLNNPDIMRQTLELARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIP
..::::::::::..::::::::::::..::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HMIMANPQMQQLMERNPEISHMLNNPELMRQTMELARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIP
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 GGYNALRRMYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPFASLVSNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAP
:::::::::::::::::.:::.::::.:::.::..:..:. .::: :::::.::::::.:
CCDS11 GGYNALRRMYTDIQEPMFSAAREQFGNNPFSSLAGNSDSS-SSQPLRTENREPLPNPWSP
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 QTSQSSSASSGTASTVGGTTGSTASGTSGQSTTAPNLVPGVGASMFNTPGMQSLLQQITE
. :.. .:: .: ::. :.. . .. . : . ..:..:::.: ::.:::::.:
CCDS11 SPPTSQAPGSGGEGT-GGS-GTSQVHPTVSNPFGIN-AASLGSGMFNSPEMQALLQQISE
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KB9 NPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLNNPLFAGNPQLQEQMRQQLPTFLQQMQ
:::::::..::::::::::.:.::::.:::::.: ::::::::::::.: :::.::::::
CCDS11 NPQLMQNVISAPYMRSMMQTLAQNPDFAAQMMVNVPLFAGNPQLQEQLRLQLPVFLQQMQ
400 410 420 430 440 450
450 460 470 480 490
pF1KB9 NPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGLIPGF-------TPGLGALGSTGGSS-
::..:: ..:::::::::::::::::: ::::::.:.. ::. .: ::..::.
CCDS11 NPESLSILTNPRAMQALLQIQQGLQTLQTEAPGLVPSLGSFGISRTPAPSA-GSNAGSTP
460 470 480 490 500 510
500 510 520 530 540 550
pF1KB9 -GTNGSNATPSENTSPTAGTTEPGHQQFIQQMLQALAGV-NPQLQNPEVRFQQQLEQLSA
. ..: :::. ..:::.... ..::..:::.: ::: : :.:.::::::::::::..
CCDS11 EAPTSSPATPA-TSSPTGASS--AQQQLMQQMIQLLAGSGNSQVQTPEVRFQQQLEQLNS
520 530 540 550 560
560 570 580
pF1KB9 MGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS
:::.::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS11 MGFINREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQLS
570 580 590 600
>>CCDS7758.1 UBQLN3 gene_id:50613|Hs108|chr11 (655 aa)
initn: 1256 init1: 762 opt: 1150 Z-score: 842.0 bits: 165.9 E(32554): 1.4e-40
Smith-Waterman score: 1222; 41.4% identity (63.5% similar) in 567 aa overlap (17-496:2-557)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAESGESGGPPGSQDSAAGAEGAGAPAAAASAEPKIMKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQ
: :.:. . : .:...::::::::.::.:.: .. ..::
CCDS77 MAKGGEALPQGSPAPVQDPHLIKVTVKTPKDKEDFSVTDTCTIQQ
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 FKEEISKRFKSHTDQLVLIFAGKILKDQDTLSQHGIHDGLTVHLVIKTQNRPQDHSAQQT
.:::::.:::.: :::::::::::::: :.:.: :..:::::::::: :.: . . .
CCDS77 LKEEISQRFKAHPDQLVLIFAGKILKDPDSLAQCGVRDGLTVHLVIKRQHRAMGNECPAA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 NTAGSNVTTSSTPNSNSTSGSATSNPFGLGGLGGLAGLSSLGLNTTNFSELQSQMQRQLL
.. .. . .: :. .: . :.:: :.::: ::: .: . :...:: .
CCDS77 SVPTQGPSPGSLPQPSSIYPADGPPAFSLGL---LTGLSRLGLAYRGFPDQPSSLMRQHV
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 SNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHMLNNPDIMRQTLE
: ::...:....::. ..::: :.:::.. ::.::::::.::::.:.::::.:::::::
CCDS77 SVPEFVTQLIDDPFIPGLLSNTGLVRQLVLDNPHMQQLIQHNPEIGHILNNPEIMRQTLE
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPFASLV
. :::::::::.:.:::.::::::::::::.: :::::..:::.:.::::::::::. .
CCDS77 FLRNPAMMQEMIRSQDRVLSNLESIPGGYNVLCTMYTDIMDPMLNAVQEQFGGNPFATAT
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KB9 SNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQTSQSSSASSG-----------------------
..... ::::: :: :::::::. .: .:.. .:
CCDS77 TDNATTTTSQPSRMENCDPLPNPWT-STHGGSGSRQGRQDGDQDAPDIRNRFPNFLGIIR
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370
pF1KB9 ----------TASTVGGTTGSTASGTSGQSTTAPNLV------------PGVGASM----
. ...: .:::. : :: : : :: : .
CCDS77 LYDYLQQLHENPQSLGTYLQGTASALS-QSQEPPPSVNRVPPSSPSSQEPGSGQPLPEES
350 360 370 380 390 400
380 390 400
pF1KB9 FNTPGMQS---LLQQITEN----------------------PQLMQNMLSA----PYMRS
: .: .:. ::: :.:.... .. :.
CCDS77 VAIKGRSSCPAFLRYPTENSTGQGGDQDGAGKSSTGHSTNLPDLVSGLGDSANRVPFAPL
410 420 430 440 450 460
410 420 430 440 450
pF1KB9 MMQSLSQNPDLAAQMMLNNPLFAGN---------PQLQEQMRQQLPTFLQQMQNPDTLSA
.. . : . : .: . . ::::.... ::: .:...: .:
CCDS77 SFSPTAAIPGIPEPPWLPSPAYPRSLRPDGMNPAPQLQDEIQPQLP-LLMHLQ-----AA
470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 MSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGLIPGFTPGLGALGSTGGSSGTNGSNATPSENTSP
:.::::.::: ::.::::.:::::: :. : : :.. ::..:
CCDS77 MANPRALQALRQIEQGLQVLATEAPRLLLWFMPCLAGTGSVAGGIESREDPLMSEDPLPN
520 530 540 550 560 570
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 TAGTTEPGHQQFIQQMLQALAGVNPQLQNPEVRFQQQLEQLSAMGFLNREANLQALIATG
CCDS77 PPPEVFPALDSAELGFLSPPFLHMLQDLVSTNPQQLQPEAHFQVQLEQLRSMGFLNREAN
580 590 600 610 620 630
>>CCDS31385.1 UBQLNL gene_id:143630|Hs108|chr11 (475 aa)
initn: 646 init1: 239 opt: 641 Z-score: 477.0 bits: 97.9 E(32554): 3e-20
Smith-Waterman score: 762; 36.0% identity (62.5% similar) in 480 aa overlap (23-453:14-475)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MAESGESGGPPGSQDSAAGAEGAGAPA---AAASAEPKIMKVTVKTPKEKEEFAVPENSS
.: :. : . . .: ::: ....: : .. :
CCDS31 MWHAISRTSRMSQSGCPSGLLADKNISSSATRVIVKTAGNQKDFMVADDIS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 VQQFKEEISKRFKSHTDQLVLIFAGKILKDQDTLSQHGIHDGLTVHLVIKTQ--NRPQDH
:.:::: . .:. . :::::.: : .:::.:::::.:: :: :..::::.. .: :
CCDS31 VRQFKEMLLAHFQCQMDQLVLVFMGCLLKDHDTLSQRGIMDGHTIYLVIKSKQGSRSLAH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 SAQQTNTAGSNVTTSSTPNSNSTSGSATSNPFGLGG----LGGLAGLSSLGLNTTNFSEL
: .. : : :....: : . .: :.. :. ..: .. ..: :.
CCDS31 SFRDLPT---NDPCHRDRNTKGNS-SRVHQPTGMNQAPVELAHFVGSDAPKVHTQNLE--
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 QSQMQRQLLSNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHML-N
.:.:: .:..::: .: .::: ..: :.: . . :::.:.:::.:..: .
CCDS31 --------VSHPECKAQMLENPSIQRLLSNMEFMWQFISEHLDTQQLMQQNPEVSRLLLD
170 180 190 200 210
240 250 260 270
pF1KB9 NPDIMRQTLELARNPAMMQEMMRNQDRALS-----------NLESIPGGYNALRRMYTDI
: .:. :::::::: ::.::.:. :. . . .::..::: ::: . :.::
CCDS31 NSEILLQTLELARNLAMIQEIMQIQQPSQNLEYPLNPQPYLGLETMPGGNNALGQNYADI
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 QEPMLSAAQEQFGGNPFASLVSN-----TSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQTSQSSSA
.. ::.. :. ::::::..:... ..:. : :..: : . : .. .::.
CCDS31 NDQMLNSMQDPFGGNPFTALLAGQVLEQVQSSPPPPPPSQEQQDQLTQHPATRVIYNSSG
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370
pF1KB9 --SSGTAST-----VGGTTGSTAS--GTSGQS----TTAPNLVPGVGASMFN--------
::.:... :. :. .... .:.::: : : .:.. . ..
CCDS31 GFSSNTSANDTLNKVNHTSKANTAMISTKGQSHICATRQPAWIPALPSIELTQQLQEEYK
340 350 360 370 380 390
380 390 400 410 420 430
pF1KB9 --TPGMQSLLQQITENPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLNNPLFAGNPQLQ
: ...: : . . :: ... :. .::: : .:: ::::.:: :.. :::.
CCDS31 DATVSLSSSRQTLKGDLQLSDEQSSSQITGGMMQLLMNNPYLAAQIML----FTSMPQLS
400 410 420 430 440 450
440 450 460 470 480 490
pF1KB9 EQMRQQLPTFLQQMQNPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGLIPGFTPGLGAL
:: :::::::::: : : :::
CCDS31 EQWRQQLPTFLQQTQISDLLSA
460 470
589 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 09:54:58 2016 done: Fri Nov 4 09:54:58 2016
Total Scan time: 3.220 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]