Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9949
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9949, 532 aa
1>>>pF1KB9949 532 - 532 aa - 532 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.3076+/-0.00196; mu= -11.8252+/- 0.108
mean_var=496.1303+/-119.560, 0's: 0 Z-trim(105.1): 173 B-trim: 288 in 1/47
Lambda= 0.057581
statistics sampled from 8130 (8223) to 8130 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.615), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16
Scan time: 2.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7378.1 BMPR1A gene_id:657|Hs108|chr10 ( 532) 3626 317.2 2.9e-86
CCDS58919.1 BMPR1B gene_id:658|Hs108|chr4 ( 532) 2538 226.8 4.7e-59
CCDS3642.1 BMPR1B gene_id:658|Hs108|chr4 ( 502) 2520 225.3 1.3e-58
CCDS78413.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 ( 507) 1665 154.3 3.1e-37
CCDS6738.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 ( 503) 1655 153.5 5.5e-37
CCDS2205.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 ( 493) 1585 147.6 3.1e-35
CCDS2206.1 ACVR1 gene_id:90|Hs108|chr2 ( 509) 1580 147.2 4.2e-35
CCDS8816.1 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12 ( 505) 1564 145.9 1e-34
CCDS44893.2 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12 ( 453) 1523 142.5 1e-33
CCDS46434.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 ( 443) 1522 142.4 1.1e-33
CCDS31804.1 ACVRL1 gene_id:94|Hs108|chr12 ( 503) 1454 136.8 5.9e-32
CCDS47998.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 ( 426) 1444 135.9 9.3e-32
CCDS46433.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 ( 413) 1370 129.7 6.5e-30
CCDS44894.2 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12 ( 546) 1024 101.1 3.5e-21
CCDS46432.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 ( 336) 993 98.3 1.5e-20
CCDS63030.1 ACVR2A gene_id:92|Hs108|chr2 ( 405) 789 81.4 2.2e-15
CCDS33301.1 ACVR2A gene_id:92|Hs108|chr2 ( 513) 789 81.5 2.5e-15
CCDS2679.1 ACVR2B gene_id:93|Hs108|chr3 ( 512) 717 75.6 1.6e-13
CCDS2648.1 TGFBR2 gene_id:7048|Hs108|chr3 ( 567) 715 75.4 1.9e-13
CCDS33727.1 TGFBR2 gene_id:7048|Hs108|chr3 ( 592) 715 75.5 2e-13
>>CCDS7378.1 BMPR1A gene_id:657|Hs108|chr10 (532 aa)
initn: 3626 init1: 3626 opt: 3626 Z-score: 1662.1 bits: 317.2 E(32554): 2.9e-86
Smith-Waterman score: 3626; 100.0% identity (100.0% similar) in 532 aa overlap (1-532:1-532)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MPQLYIYIRLLGAYLFIISRVQGQNLDSMLHGTGMKSDSDQKKSENGVTLAPEDTLPFLK
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CCDS73 MPQLYIYIRLLGAYLFIISRVQGQNLDSMLHGTGMKSDSDQKKSENGVTLAPEDTLPFLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 CYCSGHCPDDAINNTCITNGHCFAIIEEDDQGETTLASGCMKYEGSDFQCKDSPKAQLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 CYCSGHCPDDAINNTCITNGHCFAIIEEDDQGETTLASGCMKYEGSDFQCKDSPKAQLRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 TIECCRTNLCNQYLQPTLPPVVIGPFFDGSIRWLVLLISMAVCIIAMIIFSSCFCYKHYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TIECCRTNLCNQYLQPTLPPVVIGPFFDGSIRWLVLLISMAVCIIAMIIFSSCFCYKHYC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KSISSRRRYNRDLEQDEAFIPVGESLKDLIDQSQSSGSGSGLPLLVQRTIAKQIQMVRQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KSISSRRRYNRDLEQDEAFIPVGESLKDLIDQSQSSGSGSGLPLLVQRTIAKQIQMVRQV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 GKGRYGEVWMGKWRGEKVAVKVFFTTEEASWFRETEIYQTVLMRHENILGFIAADIKGTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GKGRYGEVWMGKWRGEKVAVKVFFTTEEASWFRETEIYQTVLMRHENILGFIAADIKGTG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 SWTQLYLITDYHENGSLYDFLKCATLDTRALLKLAYSAACGLCHLHTEIYGTQGKPAIAH
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CCDS73 SWTQLYLITDYHENGSLYDFLKCATLDTRALLKLAYSAACGLCHLHTEIYGTQGKPAIAH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 RDLKSKNILIKKNGSCCIADLGLAVKFNSDTNEVDVPLNTRVGTKRYMAPEVLDESLNKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RDLKSKNILIKKNGSCCIADLGLAVKFNSDTNEVDVPLNTRVGTKRYMAPEVLDESLNKN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 HFQPYIMADIYSFGLIIWEMARRCITGGIVEEYQLPYYNMVPSDPSYEDMREVVCVKRLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 HFQPYIMADIYSFGLIIWEMARRCITGGIVEEYQLPYYNMVPSDPSYEDMREVVCVKRLR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB9 PIVSNRWNSDECLRAVLKLMSECWAHNPASRLTALRIKKTLAKMVESQDVKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PIVSNRWNSDECLRAVLKLMSECWAHNPASRLTALRIKKTLAKMVESQDVKI
490 500 510 520 530
>>CCDS58919.1 BMPR1B gene_id:658|Hs108|chr4 (532 aa)
initn: 2406 init1: 2040 opt: 2538 Z-score: 1173.6 bits: 226.8 E(32554): 4.7e-59
Smith-Waterman score: 2538; 70.1% identity (85.9% similar) in 531 aa overlap (3-532:10-532)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MPQLYIYIRLLGAYLFIISRVQGQNLDSMLHGTGMKSDSDQKKSENGVTLAPE
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CCDS58 MGWLEELNWQLHIFLLIL---LSMHTRAN--FLDNMLLRSAGKLNVGTKK-EDGESTAPT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 DTLPFLKCYCSGHCPDDAINNTCITNGHCFAIIEEDDQGETTLASGCMKYEGSDFQCKDS
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CCDS58 PRPKVLRCKCHHHCPEDSVNNICSTDGYCFTMIEEDDSGLPVVTSGCLGLEGSDFQCRDT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 PKAQLRRTIECC-RTNLCNQYLQPTLPPVVIGPFFDGSIRWLVLLISMAVCIIAMIIFSS
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CCDS58 PIPHQRRSIECCTERNECNKDLHPTLPPLKNRDFVDGPIHHRALLISVTVCSL-LLVLII
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 CFCYKHYCKSISSRRRYNRDLEQDEAFIPVGESLKDLIDQSQSSGSGSGLPLLVQRTIAK
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CCDS58 LFCYFRY-KRQETRPRYSIGLEQDETYIPPGESLRDLIEQSQSSGSGSGLPLLVQRTIAK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 QIQMVRQVGKGRYGEVWMGKWRGEKVAVKVFFTTEEASWFRETEIYQTVLMRHENILGFI
:::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QIQMVKQIGKGRYGEVWMGKWRGEKVAVKVFFTTEEASWFRETEIYQTVLMRHENILGFI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 AADIKGTGSWTQLYLITDYHENGSLYDFLKCATLDTRALLKLAYSAACGLCHLHTEIYGT
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CCDS58 AADIKGTGSWTQLYLITDYHENGSLYDYLKSTTLDAKSMLKLAYSSVSGLCHLHTEIFST
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 QGKPAIAHRDLKSKNILIKKNGSCCIADLGLAVKFNSDTNEVDVPLNTRVGTKRYMAPEV
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CCDS58 QGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCIADLGLAVKFISDTNEVDIPPNTRVGTKRYMPPEV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 LDESLNKNHFQPYIMADIYSFGLIIWEMARRCITGGIVEEYQLPYYNMVPSDPSYEDMRE
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CCDS58 LDESLNRNHFQSYIMADMYSFGLILWEVARRCVSGGIVEEYQLPYHDLVPSDPSYEDMRE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 VVCVKRLRPIVSNRWNSDECLRAVLKLMSECWAHNPASRLTALRIKKTLAKMVESQDVKI
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CCDS58 IVCIKKLRPSFPNRWSSDECLRQMGKLMTECWAHNPASRLTALRVKKTLAKMSESQDIKL
480 490 500 510 520 530
>>CCDS3642.1 BMPR1B gene_id:658|Hs108|chr4 (502 aa)
initn: 2406 init1: 2040 opt: 2520 Z-score: 1165.8 bits: 225.3 E(32554): 1.3e-58
Smith-Waterman score: 2520; 73.3% identity (88.2% similar) in 491 aa overlap (43-532:14-502)
20 30 40 50 60 70
pF1KB9 AYLFIISRVQGQNLDSMLHGTGMKSDSDQKKSENGVTLAPEDTLPFLKCYCSGHCPDDAI
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CCDS36 MLLRSAGKLNVGTKKEDGESTAPTPRPKVLRCKCHHHCPEDSV
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KB9 NNTCITNGHCFAIIEEDDQGETTLASGCMKYEGSDFQCKDSPKAQLRRTIECC-RTNLCN
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CCDS36 NNICSTDGYCFTMIEEDDSGLPVVTSGCLGLEGSDFQCRDTPIPHQRRSIECCTERNECN
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KB9 QYLQPTLPPVVIGPFFDGSIRWLVLLISMAVCIIAMIIFSSCFCYKHYCKSISSRRRYNR
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CCDS36 KDLHPTLPPLKNRDFVDGPIHHRALLISVTVCSLLLVLII-LFCYFRY-KRQETRPRYSI
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KB9 DLEQDEAFIPVGESLKDLIDQSQSSGSGSGLPLLVQRTIAKQIQMVRQVGKGRYGEVWMG
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CCDS36 GLEQDETYIPPGESLRDLIEQSQSSGSGSGLPLLVQRTIAKQIQMVKQIGKGRYGEVWMG
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KB9 KWRGEKVAVKVFFTTEEASWFRETEIYQTVLMRHENILGFIAADIKGTGSWTQLYLITDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 KWRGEKVAVKVFFTTEEASWFRETEIYQTVLMRHENILGFIAADIKGTGSWTQLYLITDY
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KB9 HENGSLYDFLKCATLDTRALLKLAYSAACGLCHLHTEIYGTQGKPAIAHRDLKSKNILIK
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CCDS36 HENGSLYDYLKSTTLDAKSMLKLAYSSVSGLCHLHTEIFSTQGKPAIAHRDLKSKNILVK
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410 420 430
pF1KB9 KNGSCCIADLGLAVKFNSDTNEVDVPLNTRVGTKRYMAPEVLDESLNKNHFQPYIMADIY
:::.:::::::::::: :::::::.: :::::::::: :::::::::.:::: :::::.:
CCDS36 KNGTCCIADLGLAVKFISDTNEVDIPPNTRVGTKRYMPPEVLDESLNRNHFQSYIMADMY
350 360 370 380 390 400
440 450 460 470 480 490
pF1KB9 SFGLIIWEMARRCITGGIVEEYQLPYYNMVPSDPSYEDMREVVCVKRLRPIVSNRWNSDE
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CCDS36 SFGLILWEVARRCVSGGIVEEYQLPYHDLVPSDPSYEDMREIVCIKKLRPSFPNRWSSDE
410 420 430 440 450 460
500 510 520 530
pF1KB9 CLRAVLKLMSECWAHNPASRLTALRIKKTLAKMVESQDVKI
::: . :::.:::::::::::::::.::::::: ::::.:.
CCDS36 CLRQMGKLMTECWAHNPASRLTALRVKKTLAKMSESQDIKL
470 480 490 500
>>CCDS78413.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 (507 aa)
initn: 1616 init1: 1516 opt: 1665 Z-score: 781.9 bits: 154.3 E(32554): 3.1e-37
Smith-Waterman score: 1665; 53.0% identity (73.9% similar) in 483 aa overlap (59-532:34-507)
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 MLHGTGMKSDSDQKKSENGVTLAPEDTLPFLKCYCSGH-CPDDAINNTCITNGHCFAIIE
:.:.: : : : : ::.:.: ::. .
CCDS78 AVAAPRPRLLLLVLAAAAAAAAALLPGATALQCFC--HLCTKD--NFTCVTDGLCFVSVT
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 EDDQGETTLASGCMKY-----EGSDFQCKDSPKAQLRRTIECCRTNLCNQYLQPTLPPVV
: . .. : :. . : : : :. : :: . ::. :: :
CCDS78 ETTD-KVIHNSMCIAEIDLIPRDRPFVCAPSSKTGSVTTTYCCNQDHCNKIELPTTGPFS
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190
pF1KB9 I--GPFFDGSIRWLVLLISMAVCIIAM-IIFSSCFCYKHYCKSISSRRRYNRDLEQDEAF
. .: . : .. :. .:. ::.. . ... .: : : : ..: :. :
CCDS78 VKSSPGL-GPVE-LAAVIAGPVCFVCISLMLMVYIC--HNRTVIHHRVPNEEDPSLDRPF
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KB9 IPVGESLKDLIDQSQSSGSGSGLPLLVQRTIAKQIQMVRQVGKGRYGEVWMGKWRGEKVA
: : .::::: . .::::::::::::::::. : . ...::::.:::: ::::::.::
CCDS78 ISEGTTLKDLIYDMTTSGSGSGLPLLVQRTIARTIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVA
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KB9 VKVFFTTEEASWFRETEIYQTVLMRHENILGFIAADIKGTGSWTQLYLITDYHENGSLYD
::.: . :: :::::.::::::..:::::::::::: : .:.::::.:..::::.:::.:
CCDS78 VKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFD
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KB9 FLKCATLDTRALLKLAYSAACGLCHLHTEIYGTQGKPAIAHRDLKSKNILIKKNGSCCIA
.:. :. .....::: :.: :: ::: :: :::::::::::::::::::.::::.::::
CCDS78 YLNRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCIA
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410 420 430
pF1KB9 DLGLAVKFNSDTNEVDVPLNTRVGTKRYMAPEVLDESLNKNHFQPYIMADIYSFGLIIWE
::::::. .: :. .:. : ::::::::::::::.:.: .::. . ::::..::..::
CCDS78 DLGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWE
360 370 380 390 400 410
440 450 460 470 480 490
pF1KB9 MARRCITGGIVEEYQLPYYNMVPSDPSYEDMREVVCVKRLRPIVSNRWNSDECLRAVLKL
.:::: ::: :.::::::..:::::: :.::.::: ..::: . :::.: : ::.. :.
CCDS78 IARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKI
420 430 440 450 460 470
500 510 520 530
pF1KB9 MSECWAHNPASRLTALRIKKTLAKMVESQDVKI
: ::: : :.:::::::::::... ... .:.
CCDS78 MRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEGIKM
480 490 500
>>CCDS6738.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 (503 aa)
initn: 1608 init1: 1516 opt: 1655 Z-score: 777.5 bits: 153.5 E(32554): 5.5e-37
Smith-Waterman score: 1655; 53.2% identity (74.0% similar) in 481 aa overlap (59-532:34-503)
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 MLHGTGMKSDSDQKKSENGVTLAPEDTLPFLKCYCSGH-CPDDAINNTCITNGHCFAIIE
:.:.: : : : : ::.:.: ::. .
CCDS67 AVAAPRPRLLLLVLAAAAAAAAALLPGATALQCFC--HLCTKD--NFTCVTDGLCFVSVT
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 EDDQGETTLASGCMKY-----EGSDFQCKDSPKAQLRRTIECCRTNLCNQYLQPTLPPVV
: . .. : :. . : : : :. : :: . ::. :: :
CCDS67 ETTD-KVIHNSMCIAEIDLIPRDRPFVCAPSSKTGSVTTTYCCNQDHCNKIELPT--TVK
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 IGPFFDGSIRWLVLLISMAVCIIAM-IIFSSCFCYKHYCKSISSRRRYNRDLEQDEAFIP
.: . : .. :. .:. ::.. . ... .: : : : ..: :. ::
CCDS67 SSPGL-GPVE-LAAVIAGPVCFVCISLMLMVYIC--HNRTVIHHRVPNEEDPSLDRPFIS
120 130 140 150 160 170
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 VGESLKDLIDQSQSSGSGSGLPLLVQRTIAKQIQMVRQVGKGRYGEVWMGKWRGEKVAVK
: .::::: . .::::::::::::::::. : . ...::::.:::: ::::::.::::
CCDS67 EGTTLKDLIYDMTTSGSGSGLPLLVQRTIARTIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVAVK
180 190 200 210 220 230
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 VFFTTEEASWFRETEIYQTVLMRHENILGFIAADIKGTGSWTQLYLITDYHENGSLYDFL
.: . :: :::::.::::::..:::::::::::: : .:.::::.:..::::.:::.:.:
CCDS67 IFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYL
240 250 260 270 280 290
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 KCATLDTRALLKLAYSAACGLCHLHTEIYGTQGKPAIAHRDLKSKNILIKKNGSCCIADL
. :. .....::: :.: :: ::: :: :::::::::::::::::::.::::.::::::
CCDS67 NRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCIADL
300 310 320 330 340 350
390 400 410 420 430 440
pF1KB9 GLAVKFNSDTNEVDVPLNTRVGTKRYMAPEVLDESLNKNHFQPYIMADIYSFGLIIWEMA
::::. .: :. .:. : ::::::::::::::.:.: .::. . ::::..::..::.:
CCDS67 GLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEIA
360 370 380 390 400 410
450 460 470 480 490 500
pF1KB9 RRCITGGIVEEYQLPYYNMVPSDPSYEDMREVVCVKRLRPIVSNRWNSDECLRAVLKLMS
::: ::: :.::::::..:::::: :.::.::: ..::: . :::.: : ::.. :.:
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420 430 440 450 460 470
510 520 530
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::: : :.:::::::::::... ... .:.
CCDS67 ECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEGIKM
480 490 500
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30 40 50 60 70 80
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: . : ::: : : :. : :: :.:
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:.: . . :. . ..:.. . : :..: .. .: ::: :..::. :
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: : . .::. :...:.. ::.... . . . : . : : ...: : .
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.: .. .:..::::: . .::::::::::::::::. : . . :::::.:::: :.
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CCDS22 WCGEDVAVKIFSSRDERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSEYH
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CCDS22 VGLVYWEIARRCSVGGIVEEYQLPYYDMVPSDPSIEEMRKVVCDQKFRPSIPNQWQSCEA
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::.. ..: ::: : :.::::::::::.... ..: :
CCDS22 LRVMGRIMRECWYANGAARLTALRIKKTISQLCVKEDCKA
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: : : : .. . : . .::. . .
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: : . .::.. :: . . :: :. ...:::. . ::. . :: . : :
CCDS22 D-GFHVYQKGCFQVYEQGKMTCKTPPSPG--QAVECCQGDWCNRNITAQLP--TKGKSFP
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:. . ..: . .:::..: .. . .:. ...: : ::.: :..
CCDS22 GTQNFHLEVGLIILSVVFAVCLLACLLGVALRKFKRR-----NQERLNPRDVEYGTIEGL
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CCDS22 ITTNVGDSTLADLLDHSCTSGSGSGLPFLVQRTVARQITLLECVGKGRYGEVWRGSWQGE
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pF1KB9 KVAVKVFFTTEEASWFRETEIYQTVLMRHENILGFIAADIKGTGSWTQLYLITDYHENGS
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CCDS22 NVAVKIFSSRDEKSWFRETELYNTVMLRHENILGFIASDMTSRHSSTQLWLITHYHEMGS
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:::.:. .:::: . :... : : :: ::: ::.:::::::::::::::::::.::::.:
CCDS22 LYDYLQLTTLDTVSCLRIVLSIASGLAHLHIEIFGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGQC
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CCDS22 CIADLGLAVMHSQSTNQLDVGNNPRVGTKRYMAPEVLDETIQVDCFDSYKRVDIWAFGLV
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pF1KB9 IWEMARRCITGGIVEEYQLPYYNMVPSDPSYEDMREVVCVKRLRPIVSNRWNSDECLRAV
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CCDS22 LWEVARRMVSNGIVEDYKPPFYDVVPNDPSFEDMRKVVCVDQQRPNIPNRWFSDPTLTSL
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CCDS22 AKLMKECWYQNPSARLTALRIKKTLTKIDNSLDKLKTDC
480 490 500
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: . :: :: .:. : .. .::. . ... . .:.: . . .
CCDS88 PEHPSMWGPVE------LVGIIAGPVFLLFLIIIIVFLVINYHQRVYHNRQRLDMEDPSC
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pF1KB9 EAFIPVGESLKDLIDQSQSSGSGSGLPLLVQRTIAKQIQMVRQVGKGRYGEVWMGKWRGE
: . ..:.::. . ..:::::::::.::::.:. : . . .::::.:::: :.:::
CCDS88 EMCLSKDKTLQDLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRTVARTIVLQEIIGKGRFGEVWRGRWRGG
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::::.: . :: :::::.::::::..:::::::::::: : .:.::::.:..::::.::
CCDS88 DVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGS
230 240 250 260 270 280
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pF1KB9 LYDFLKCATLDTRALLKLAYSAACGLCHLHTEIYGTQGKPAIAHRDLKSKNILIKKNGSC
:.:.:. :. ....::: ::: :: ::: :: ::::::.::::::::::::.:::: :
CCDS88 LFDYLNRYTVTIEGMIKLALSAASGLAHLHMEIVGTQGKPGIAHRDLKSKNILVKKNGMC
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pF1KB9 CIADLGLAVKFNSDTNEVDVPLNTRVGTKRYMAPEVLDESLNKNHFQPYIMADIYSFGLI
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CCDS88 AIADLGLAVRHDAVTDTIDIAPNQRVGTKRYMAPEVLDETINMKHFDSFKCADIYALGLV
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CCDS88 YWEIARRCNSGGVHEEYQLPYYDLVPSDPSIEEMRKVVCDQKLRPNIPNWWQSYEALRVM
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pF1KB9 LKLMSECWAHNPASRLTALRIKKTLAKMVESQDVKI
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CCDS88 GKMMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSVQEDVKI
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CCDS44 MVSIFNLDGMEHHVRTCIPKVELVPAGKPFYCLSS--EDLRNT-HCCYTDYCNRID
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CCDS44 LRVPSGHLKEPEHPSMWGPVE------LVGIIAGPVFLLFLIIIIVFLVINYHQRVYHNR
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pF1KB9 RRYNRDLEQDEAFIPVGESLKDLIDQSQSSGSGSGLPLLVQRTIAKQIQMVRQVGKGRYG
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CCDS44 QRLDMEDPSCEMCLSKDKTLQDLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRTVARTIVLQEIIGKGRFG
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::: :.::: ::::.: . :: :::::.::::::..:::::::::::: : .:.::::.
CCDS44 EVWRGRWRGGDVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLW
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CCDS44 LVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTIEGMIKLALSAASGLAHLHMEIVGTQGKPGIAHRDLKSK
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:::.:::: : ::::::::. .. :. .:. : :::::::::::::::..: .::. .
CCDS44 NILVKKNGMCAIADLGLAVRHDAVTDTIDIAPNQRVGTKRYMAPEVLDETINMKHFDSFK
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CCDS44 CADIYALGLVYWEIARRCNSGGVHEEYQLPYYDLVPSDPSIEEMRKVVCDQKLRPNIPNW
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CCDS44 WQSYEALRVMGKMMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSVQEDVKI
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CCDS46 MLTNGKEQVIKSCVSLPELNAQVFCHSS--NNVT
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 RTIECCRTNLCNQYLQ--PTLPPVV--IGPFFDGSIRWLVLLISMAVCIIAMIIFSSCF-
.: ::: :..::. :: : . .::. :...:.. ::.... . . .
CCDS46 KT-ECCFTDFCNNITLHLPTASPNAPKLGPM------ELAIIITVPVCLLSIAAMLTVWA
40 50 60 70 80
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: . : : ...: : . .: .. .:..::::: . .::::::::::::::::.
CCDS46 CQGRQC-SYRKKKRPNVEEPLSECNLVNAGKTLKDLIYDVTASGSGSGLPLLVQRTIART
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CCDS46 IVLQEIVGKGRFGEVWHGRWCGEDVAVKIFSSRDERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIA
150 160 170 180 190 200
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pF1KB9 ADIKGTGSWTQLYLITDYHENGSLYDFLKCATLDTRALLKLAYSAACGLCHLHTEIYGTQ
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CCDS46 ADNKDNGTWTQLWLVSEYHEQGSLYDYLNRNIVTVAGMIKLALSIASGLAHLHMEIVGTQ
210 220 230 240 250 260
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:::::::::.::::::.:: .: ::::::::: .: : .:.: : .::::::::::.:
CCDS46 GKPAIAHRDIKSKNILVKKCETCAIADLGLAVKHDSILNTIDIPQNPKVGTKRYMAPEML
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CCDS46 DDTMNVNIFESFKRADIYSVGLVYWEIARRCSVGGIVEEYQLPYYDMVPSDPSIEEMRKV
330 340 350 360 370 380
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pF1KB9 VCVKRLRPIVSNRWNSDECLRAVLKLMSECWAHNPASRLTALRIKKTLAKMVESQDVKI
:: ...:: . :.:.: : ::.. ..: ::: : :.::::::::::.... ..: :
CCDS46 VCDQKFRPSIPNQWQSCEALRVMGRIMRECWYANGAARLTALRIKKTISQLCVKEDCKA
390 400 410 420 430 440
532 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 08:17:06 2016 done: Sat Nov 5 08:17:07 2016
Total Scan time: 2.050 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]