Result of FASTA (omim) for
pF1KB9953
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9953, 536 aa
1>>>pF1KB9953 536 - 536 aa - 536 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4268+/-0.000518; mu= -5.1695+/- 0.032
mean_var=367.4399+/-78.164, 0's: 0 Z-trim(117.1): 104 B-trim: 52 in 1/57
Lambda= 0.066908
statistics sampled from 28651 (28754) to 28651 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.337), width: 16
Scan time: 11.070
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_434700 (OMIM: 212050,607212) caspase recruitmen ( 536) 3496 352.2 2.4e-96
NP_434701 (OMIM: 212050,607212) caspase recruitmen ( 492) 3130 316.8 9.6e-86
XP_011513889 (OMIM: 606445,607210,615206,616452) P (1153) 899 101.8 1.2e-20
NP_001311210 (OMIM: 606445,607210,615206,616452) c (1154) 899 101.8 1.2e-20
XP_011513888 (OMIM: 606445,607210,615206,616452) P (1154) 899 101.8 1.2e-20
NP_115791 (OMIM: 606445,607210,615206,616452) casp (1154) 899 101.8 1.2e-20
NP_055365 (OMIM: 607209) caspase recruitment domai (1032) 679 80.5 2.7e-14
XP_016880547 (OMIM: 173200,602723,607211) PREDICTE ( 544) 595 72.1 4.8e-12
NP_001244899 (OMIM: 173200,602723,607211) caspase ( 740) 595 72.3 5.9e-12
XP_016880546 (OMIM: 173200,602723,607211) PREDICTE (1003) 595 72.4 7.3e-12
NP_077015 (OMIM: 173200,602723,607211) caspase rec (1004) 595 72.4 7.3e-12
XP_011523519 (OMIM: 173200,602723,607211) PREDICTE (1004) 595 72.4 7.3e-12
XP_011523518 (OMIM: 173200,602723,607211) PREDICTE (1004) 595 72.4 7.3e-12
XP_011523517 (OMIM: 173200,602723,607211) PREDICTE (1004) 595 72.4 7.3e-12
XP_011523520 (OMIM: 173200,602723,607211) PREDICTE (1004) 595 72.4 7.3e-12
XP_011523515 (OMIM: 173200,602723,607211) PREDICTE (1004) 595 72.4 7.3e-12
XP_011523514 (OMIM: 173200,602723,607211) PREDICTE (1004) 595 72.4 7.3e-12
>>NP_434700 (OMIM: 212050,607212) caspase recruitment do (536 aa)
initn: 3496 init1: 3496 opt: 3496 Z-score: 1850.8 bits: 352.2 E(85289): 2.4e-96
Smith-Waterman score: 3496; 99.8% identity (100.0% similar) in 536 aa overlap (1-536:1-536)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSDYENDDECWNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSDPNLVIRKRK
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 MSDYENDDECWSVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSDPNLVIRKRK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 VGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASGESGLTQLLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 VGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASGESGLTQLLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 TEVMKLQKKVQDLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERVQRLKEECEAGSRELKRCKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 TEVMKLQKKVQDLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERVQRLKEECEAGSRELKRCKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 ENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAEDDCKVERKHTLKLRHAMEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 ENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAEDDCKVERKHTLKLRHAMEQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 RPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKLDRSSPYIQVLEEDWRQALRDHQEQANT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 RPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKLDRSSPYIQVLEEDWRQALRDHQEQANT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 IFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDRIEAILLQMEEVAIERDQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 IFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDRIEAILLQMEEVAIERDQA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 IATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQVFQCEAQLLAVEGRLRRQQLET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 IATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQVFQCEAQLLAVEGRLRRQQLET
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 LVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGGGSPKQPFAALHQEQVLRNPHDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 LVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGGGSPKQPFAALHQEQVLRNPHDA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB9 GLSSGEPPEKERRRLKESFENYRRKRALRKMQKGWRQGEEDRENTTGSDNTDTEGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 GLSSGEPPEKERRRLKESFENYRRKRALRKMQKGWRQGEEDRENTTGSDNTDTEGS
490 500 510 520 530
>>NP_434701 (OMIM: 212050,607212) caspase recruitment do (492 aa)
initn: 3127 init1: 3127 opt: 3130 Z-score: 1660.3 bits: 316.8 E(85289): 9.6e-86
Smith-Waterman score: 3130; 99.0% identity (99.4% similar) in 487 aa overlap (1-487:1-486)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSDYENDDECWNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSDPNLVIRKRK
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 MSDYENDDECWSVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSDPNLVIRKRK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 VGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASGESGLTQLLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 VGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASGESGLTQLLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 TEVMKLQKKVQDLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERVQRLKEECEAGSRELKRCKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 TEVMKLQKKVQDLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERVQRLKEECEAGSRELKRCKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 ENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAEDDCKVERKHTLKLRHAMEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 ENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAEDDCKVERKHTLKLRHAMEQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 RPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKLDRSSPYIQVLEEDWRQALRDHQEQANT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 RPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKLDRSSPYIQVLEEDWRQALRDHQEQANT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 IFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDRIEAILLQMEEVAIERDQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 IFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDRIEAILLQMEEVAIERDQA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 IATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQVFQCEAQLLAVEGRLRRQQLET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 IATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQVFQCEAQLLAVEGRLRRQQLET
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 LVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGGGSPKQPFAALHQEQVLRNPHDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_434 LVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGGGSPKQPFAALHQEQVLRNPHDA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB9 GLSSGEPPEKERRRLKESFENYRRKRALRKMQKGWRQGEEDRENTTGSDNTDTEGS
: .: :
NP_434 G-PAGLPGIGAVC
490
>>XP_011513889 (OMIM: 606445,607210,615206,616452) PREDI (1153 aa)
initn: 1228 init1: 414 opt: 899 Z-score: 491.8 bits: 101.8 E(85289): 1.2e-20
Smith-Waterman score: 1250; 39.9% identity (69.8% similar) in 547 aa overlap (1-531:8-538)
10 20 30 40
pF1KB9 MSDY-----ENDDECWNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQV
:.:: ...: :. .: : :. :.:...:::::::::.. .::..:
XP_011 MPGGGPEMDDYMETLKDEEDALWENVECNRHMLSRYINPAKLTPYLRQCKVIDEQDEDEV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 LSDPNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIID
:. : : . ..: :::::. :..:::.::::::.:::.::: ::::::.: :: :.
XP_011 LNAPMLPSKINRAGRLLDILHTKGQRGYVVFLESLEFYYPELYKLVTGKEPTRRFSTIVV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 ASGESGLTQLLMTEVMKLQKKVQ-------DLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERV
:. :::..::.::.:::.... .: : : . .: :.. . : :::
XP_011 EEGHEGLTHFLMNEVIKLQQQMKAKDLQRCELLARLRQLEDEKKQMTLTRVELLTFQERY
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 QRLKEECEAGSRELKRCKEENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAE
..::: .. . :: . :..::.:::: :. ::::. :.::.:::::::::::: : : :
XP_011 YKMKEERDSYNDELVKVKDDNYNLAMRYAQLSEEKNMAVMRSRDLQLEIDQLKHRLNKME
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KB9 DDCKVERKHTLKLRHAMEQRPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKL---DRSSP
..::.::...:::.. .:.::..: . ::..:. .:... :::.. .: :: : ..
XP_011 EECKLERNQSLKLKNDIENRPKKEQVLELERENEMLKTKNQELQSIIQAGKRSLPDSDKA
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 YIQVLEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKM
...::.: ..::.:.:: .: :..:... ::.: : . .:::: .::.: .: :: .:
XP_011 ILDILEHDRKEALEDRQELVNRIYNLQEEARQAEELRDKYLEEKEDLELKCSTLGKDCEM
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 YKDRIEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQ
:: :.....::.::: :::::. .:.: ..:... : ::: :::.::: :: ::....
XP_011 YKHRMNTVMLQLEEVERERDQAFHSRDEAQTQYSQCLIEKDKYRKQIRELEEKNDEMRIE
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 VFQCEAQLLAVEGRLRRQQLETLVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGG
. . :: .. .:..::: . . :..:... :: . ::. :.. .: :
XP_011 MVRREACIVNLESKLRRLSKD----SNNLDQSLPRNLPVTIISQDFGDASPRTNGQEADD
430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 GSPKQPFAALHQEQVLRNPHDAGLSSGEPPEKERRRLKE-SFENYRRKRALRKMQKGWRQ
.: .. ..:.:. : ..: :: ... . .:.. . .
XP_011 SSTSE-----------ESPEDSKYFLPYHPPQRRMNLKGIQLQRAKSPISLKRTSDFQAK
480 490 500 510 520
520 530
pF1KB9 GEEDRENTTGSDNTDTEGS
:.:. :.: .: ..
XP_011 GHEE-EGTDASPSSCGSLPITNSFTKMPPRSRSSIMSITAEPPGNDSIVRRYKEDAPHRS
530 540 550 560 570 580
>>NP_001311210 (OMIM: 606445,607210,615206,616452) caspa (1154 aa)
initn: 1228 init1: 414 opt: 899 Z-score: 491.8 bits: 101.8 E(85289): 1.2e-20
Smith-Waterman score: 1250; 39.9% identity (69.8% similar) in 547 aa overlap (1-531:8-538)
10 20 30 40
pF1KB9 MSDY-----ENDDECWNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQV
:.:: ...: :. .: : :. :.:...:::::::::.. .::..:
NP_001 MPGGGPEMDDYMETLKDEEDALWENVECNRHMLSRYINPAKLTPYLRQCKVIDEQDEDEV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 LSDPNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIID
:. : : . ..: :::::. :..:::.::::::.:::.::: ::::::.: :: :.
NP_001 LNAPMLPSKINRAGRLLDILHTKGQRGYVVFLESLEFYYPELYKLVTGKEPTRRFSTIVV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 ASGESGLTQLLMTEVMKLQKKVQ-------DLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERV
:. :::..::.::.:::.... .: : : . .: :.. . : :::
NP_001 EEGHEGLTHFLMNEVIKLQQQMKAKDLQRCELLARLRQLEDEKKQMTLTRVELLTFQERY
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 QRLKEECEAGSRELKRCKEENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAE
..::: .. . :: . :..::.:::: :. ::::. :.::.:::::::::::: : : :
NP_001 YKMKEERDSYNDELVKVKDDNYNLAMRYAQLSEEKNMAVMRSRDLQLEIDQLKHRLNKME
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KB9 DDCKVERKHTLKLRHAMEQRPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKL---DRSSP
..::.::...:::.. .:.::..: . ::..:. .:... :::.. .: :: : ..
NP_001 EECKLERNQSLKLKNDIENRPKKEQVLELERENEMLKTKNQELQSIIQAGKRSLPDSDKA
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 YIQVLEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKM
...::.: ..::.:.:: .: :..:... ::.: : . .:::: .::.: .: :: .:
NP_001 ILDILEHDRKEALEDRQELVNRIYNLQEEARQAEELRDKYLEEKEDLELKCSTLGKDCEM
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 YKDRIEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQ
:: :.....::.::: :::::. .:.: ..:... : ::: :::.::: :: ::....
NP_001 YKHRMNTVMLQLEEVERERDQAFHSRDEAQTQYSQCLIEKDKYRKQIRELEEKNDEMRIE
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 VFQCEAQLLAVEGRLRRQQLETLVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGG
. . :: .. .:..::: . . :..:... :: . ::. :.. .: :
NP_001 MVRREACIVNLESKLRRLSKD----SNNLDQSLPRNLPVTIISQDFGDASPRTNGQEADD
430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 GSPKQPFAALHQEQVLRNPHDAGLSSGEPPEKERRRLKE-SFENYRRKRALRKMQKGWRQ
.: .. ..:.:. : ..: :: ... . .:.. . .
NP_001 SSTSE-----------ESPEDSKYFLPYHPPQRRMNLKGIQLQRAKSPISLKRTSDFQAK
480 490 500 510 520
520 530
pF1KB9 GEEDRENTTGSDNTDTEGS
:.:. :.: .: ..
NP_001 GHEE-EGTDASPSSCGSLPITNSFTKMQPPRSRSSIMSITAEPPGNDSIVRRYKEDAPHR
530 540 550 560 570 580
>>XP_011513888 (OMIM: 606445,607210,615206,616452) PREDI (1154 aa)
initn: 1228 init1: 414 opt: 899 Z-score: 491.8 bits: 101.8 E(85289): 1.2e-20
Smith-Waterman score: 1250; 39.9% identity (69.8% similar) in 547 aa overlap (1-531:8-538)
10 20 30 40
pF1KB9 MSDY-----ENDDECWNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQV
:.:: ...: :. .: : :. :.:...:::::::::.. .::..:
XP_011 MPGGGPEMDDYMETLKDEEDALWENVECNRHMLSRYINPAKLTPYLRQCKVIDEQDEDEV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 LSDPNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIID
:. : : . ..: :::::. :..:::.::::::.:::.::: ::::::.: :: :.
XP_011 LNAPMLPSKINRAGRLLDILHTKGQRGYVVFLESLEFYYPELYKLVTGKEPTRRFSTIVV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 ASGESGLTQLLMTEVMKLQKKVQ-------DLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERV
:. :::..::.::.:::.... .: : : . .: :.. . : :::
XP_011 EEGHEGLTHFLMNEVIKLQQQMKAKDLQRCELLARLRQLEDEKKQMTLTRVELLTFQERY
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 QRLKEECEAGSRELKRCKEENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAE
..::: .. . :: . :..::.:::: :. ::::. :.::.:::::::::::: : : :
XP_011 YKMKEERDSYNDELVKVKDDNYNLAMRYAQLSEEKNMAVMRSRDLQLEIDQLKHRLNKME
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KB9 DDCKVERKHTLKLRHAMEQRPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKL---DRSSP
..::.::...:::.. .:.::..: . ::..:. .:... :::.. .: :: : ..
XP_011 EECKLERNQSLKLKNDIENRPKKEQVLELERENEMLKTKNQELQSIIQAGKRSLPDSDKA
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 YIQVLEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKM
...::.: ..::.:.:: .: :..:... ::.: : . .:::: .::.: .: :: .:
XP_011 ILDILEHDRKEALEDRQELVNRIYNLQEEARQAEELRDKYLEEKEDLELKCSTLGKDCEM
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340 350 360 370 380 390
pF1KB9 YKDRIEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQ
:: :.....::.::: :::::. .:.: ..:... : ::: :::.::: :: ::....
XP_011 YKHRMNTVMLQLEEVERERDQAFHSRDEAQTQYSQCLIEKDKYRKQIRELEEKNDEMRIE
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
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XP_011 MVRREACIVNLESKLRRLSKD----SNNLDQSLPRNLPVTIISQDFGDASPRTNGQEADD
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460 470 480 490 500 510
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.: .. ..:.:. : ..: :: ... . .:.. . .
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520 530
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:.:. :.: .: ..
XP_011 GHEE-EGTDASPSSCGSLPITNSFTKMQPPRSRSSIMSITAEPPGNDSIVRRYKEDAPHR
530 540 550 560 570 580
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10 20 30 40
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:.:: ...: :. .: : :. :.:...:::::::::.. .::..:
NP_115 MPGGGPEMDDYMETLKDEEDALWENVECNRHMLSRYINPAKLTPYLRQCKVIDEQDEDEV
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50 60 70 80 90 100
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NP_115 LNAPMLPSKINRAGRLLDILHTKGQRGYVVFLESLEFYYPELYKLVTGKEPTRRFSTIVV
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..::: .. . :: . :..::.:::: :. ::::. :.::.:::::::::::: : : :
NP_115 YKMKEERDSYNDELVKVKDDNYNLAMRYAQLSEEKNMAVMRSRDLQLEIDQLKHRLNKME
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230 240 250 260 270
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..::.::...:::.. .:.::..: . ::..:. .:... :::.. .: :: : ..
NP_115 EECKLERNQSLKLKNDIENRPKKEQVLELERENEMLKTKNQELQSIIQAGKRSLPDSDKA
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280 290 300 310 320 330
pF1KB9 YIQVLEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKM
...::.: ..::.:.:: .: :..:... ::.: : . .:::: .::.: .: :: .:
NP_115 ILDILEHDRKEALEDRQELVNRIYNLQEEARQAEELRDKYLEEKEDLELKCSTLGKDCEM
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340 350 360 370 380 390
pF1KB9 YKDRIEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQ
:: :.....::.::: :::::. .:.: ..:... : ::: :::.::: :: ::....
NP_115 YKHRMNTVMLQLEEVERERDQAFHSRDEAQTQYSQCLIEKDKYRKQIRELEEKNDEMRIE
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NP_115 MVRREACIVNLESKLRRLSKD----SNNLDQSLPRNLPVTIISQDFGDASPRTNGQEADD
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pF1KB9 GSPKQPFAALHQEQVLRNPHDAGLSSGEPPEKERRRLKE-SFENYRRKRALRKMQKGWRQ
.: .. ..:.:. : ..: :: ... . .:.. . .
NP_115 SSTSE-----------ESPEDSKYFLPYHPPQRRMNLKGIQLQRAKSPISLKRTSDFQAK
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520 530
pF1KB9 GEEDRENTTGSDNTDTEGS
:.:. :.: .: ..
NP_115 GHEE-EGTDASPSSCGSLPITNSFTKMQPPRSRSSIMSITAEPPGNDSIVRRYKEDAPHR
530 540 550 560 570 580
>>NP_055365 (OMIM: 607209) caspase recruitment domain-co (1032 aa)
initn: 685 init1: 402 opt: 679 Z-score: 377.7 bits: 80.5 E(85289): 2.7e-14
Smith-Waterman score: 950; 35.0% identity (63.5% similar) in 543 aa overlap (7-518:24-565)
10 20 30 40
pF1KB9 MSDYENDDECWNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPD
.: :. .:: : :. ...:...:::::::.:.. .
NP_055 MPGRAEAGEAEEEAGAGSGSEAEEDALWERIEGVRHRLARALNPAKLTPYLRQCRVIDEQ
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:::.: : ::::.::::: .:. .: : . :... ..: :. .. :: .:
NP_055 SMILDEEGPEGLTQFLMTEVRRLREARKSQLQREQQLQARGRVLEEERAGLEQRLRDQQQ
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:: :::.:. :::: :: : :.::: .:::::. ::::..:..:.::::: .:::: .
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pF1KB9 LMKAEDDCKVERK--------HTLKLRHAMEQRPSQ-ELLWELQQEKALLQARVQELEAS
. . :..: . :. . . .. :..:.. .:. ::. :. : : ..::. .
NP_055 VSRLEEECALLRRARGPPPGAEEKEKEKEKEKEPDNVDLVSELRAENQRLTASLRELQEG
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.:. ..: ...::.:::.: ..:: . . ... .:. .: : . ..:
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: ..:. .:.:: .:: :. ..: :.::. :::::: .:.... :....: ::: :
NP_055 EDLRLKHRTLQKDCDLYKHRMATVLAQLEEIEKERDQAIQSRDRIQLQYSQSLIEKDQYR
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:::: : . ::: . . :. .: .:.: : :.. . : .: .. .
NP_055 KQVRGLEAERDELLTTLTSLEGTKALLEVQLQRAQGGTCLKACASSHSLCSNLSSTWSLS
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.:. : . . .. . :: :.. : .:. .: : .:: . :..
NP_055 EFPSPLGGPEATGEAAVMGGPEPHNSEEATDSEKEINRLSILPFPPSAGSILRRQREEDP
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:.:: .. . . : : :
NP_055 APPKRSFSSMSDITGSVTL-KPWSPGLSSSSSSDSVWPLGKPEGLLARGCGLDFLNRSLA
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: ::. : . .::..... . :: ... ..: . .. . :: ... :.
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.:..: .. .:: : .:. ..: : .:..:. ... : :. : ..
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::.. .: ..:: .. : :::. .: .: . ::::. :: . ..:...
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.:. .: :.: :. .. . :: .. :: ... :: .. :. :::
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>>NP_001244899 (OMIM: 173200,602723,607211) caspase recr (740 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB9 MSDYENDDEC-WNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSD
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NP_001 TSKLTECLAGAIGSLQEELNQEKGQKEVLLRRCQQLQEHLGLAETRAEGLHQLEADHSRM
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.:..: .. .:: : .:. ..: : .:..:. ... : :. : ..
NP_001 SCELELQEQ-SLRTASDQESGDEELNRLKEENE----KLRSLTFSLAEK---------DI
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pF1KB9 LEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDR
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NP_001 VNALQAQVCELQKERDQAYSARDSAQREISQSLVEKDSLRRQVFELTDQVCELRTQLRQL
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NP_001 QAEPPGVLKQEARTREPCPREKQRLV---RMHAICPRDDSDCSLVSSTESQLLSDLSATS
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NP_001 SRELVDSFRSSSPAPPSQQSLYKRVAEDFGEEPWSFSSCLEIPEGDPGALPGAKAGDPHL
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>>XP_016880546 (OMIM: 173200,602723,607211) PREDICTED: c (1003 aa)
initn: 557 init1: 261 opt: 595 Z-score: 334.0 bits: 72.4 E(85289): 7.3e-12
Smith-Waterman score: 608; 31.9% identity (62.0% similar) in 461 aa overlap (7-451:15-458)
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pF1KB9 MSDYENDDEC-WNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSD
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XP_016 MGELCRRDSALTALDEETLWEMMESHRHRIVRCICPSRLTPYLRQAKVLCQLDEEEVLHS
10 20 30 40 50 60
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pF1KB9 PNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASG
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XP_016 PRLTNSAMRAGHLLDLLKTRGKNGAIAFLESLKFHNPDVYTLVTGLQPDVDFSNFSGLME
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pF1KB9 ESGLTQLLMTEVMKLQKKVQDLTA----LLSSKDDFIKELRVKDSLLRK-HQERVQ--RL
: ::. : . .::..... . :: ... ..: . .. . :: ... :.
XP_016 TSKLTECLAGAIGSLQEELNQEKGQKEVLLRRCQQLQEHLGLAETRAEGLHQLEADHSRM
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 KEECEAGSRELKRCKEENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAE--D
:.: : .:. : :.: .:... .. .:: : : :.:: :. ::. :..:. .
XP_016 KREVSAHFHEVLRLKDEMLSLSLHYSNALQEKELAASRCRSLQEELYLLKQELQRANMVS
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XP_016 SCELELQEQ-SLRTASDQESGDEELNRLKEENE----KLRSLTFSLAEK---------DI
250 260 270 280
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pF1KB9 LEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDR
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pF1KB9 IEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQVFQC
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XP_016 VNALQAQVCELQKERDQAYSARDSAQREISQSLVEKDSLRRQVFELTDQVCELRTQLRQL
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KB9 EAQ---LLAVEGRLRR---QQLETLVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLA
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XP_016 QAEPPGVLKQEARTREPCPREKQRLV---RMHAICPRDDSDCSLVSSTESQLLSDLSATS
410 420 430 440 450 460
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XP_016 SRELVDSFRSSSPAPPSQQSLYKRVAEDFGEEPWSFSCLEIPEGDPGALPGAKAGDPHLD
470 480 490 500 510 520
536 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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