FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9962, 692 aa 1>>>pF1KB9962 692 - 692 aa - 692 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6501+/-0.000971; mu= 12.9434+/- 0.058 mean_var=88.9621+/-17.437, 0's: 0 Z-trim(106.4): 14 B-trim: 134 in 2/47 Lambda= 0.135979 statistics sampled from 8951 (8959) to 8951 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.64), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16 Scan time: 2.820 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31149.1 DCLRE1C gene_id:64421|Hs108|chr10 ( 692) 4644 921.5 0 CCDS31150.1 DCLRE1C gene_id:64421|Hs108|chr10 ( 572) 3843 764.4 0 CCDS7105.1 DCLRE1C gene_id:64421|Hs108|chr10 ( 577) 3836 763.0 0 CCDS7584.1 DCLRE1A gene_id:9937|Hs108|chr10 (1040) 312 71.8 5.9e-12 CCDS866.1 DCLRE1B gene_id:64858|Hs108|chr1 ( 532) 293 67.9 4.2e-11 >>CCDS31149.1 DCLRE1C gene_id:64421|Hs108|chr10 (692 aa) initn: 4644 init1: 4644 opt: 4644 Z-score: 4923.9 bits: 921.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4644; 100.0% identity (100.0% similar) in 692 aa overlap (1-692:1-692) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MSSFEGQMAEYPTISIDRFDRENLRARAYFLSHCHKDHMKGLRAPTLKRRLECSLKVYLY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 MSSFEGQMAEYPTISIDRFDRENLRARAYFLSHCHKDHMKGLRAPTLKRRLECSLKVYLY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 CSPVTKELLLTSPKYRFWKKRIISIEIETPTQISLVDEASGEKEEIVVTLLPAGHCPGSV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 CSPVTKELLLTSPKYRFWKKRIISIEIETPTQISLVDEASGEKEEIVVTLLPAGHCPGSV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 MFLFQGNNGTVLYTGDFRLAQGEAARMELLHSGGRVKDIQSVYLDTTFCDPRFYQIPSRE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 MFLFQGNNGTVLYTGDFRLAQGEAARMELLHSGGRVKDIQSVYLDTTFCDPRFYQIPSRE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 ECLSGVLELVRSWITRSPYHVVWLNCKAAYGYEYLFTNLSEELGVQVHVNKLDMFRNMPE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 ECLSGVLELVRSWITRSPYHVVWLNCKAAYGYEYLFTNLSEELGVQVHVNKLDMFRNMPE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 ILHHLTTDRNTQIHACRHPKAEEYFQWSKLPCGITSRNRIPLHIISIKPSTMWFGERSRK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 ILHHLTTDRNTQIHACRHPKAEEYFQWSKLPCGITSRNRIPLHIISIKPSTMWFGERSRK 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB9 TNVIVRTGESSYRACFSFHSSYSEIKDFLSYLCPVNAYPNVIPVGTTMDKVVEILKPLCR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 TNVIVRTGESSYRACFSFHSSYSEIKDFLSYLCPVNAYPNVIPVGTTMDKVVEILKPLCR 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB9 SSQSTEPKYKPLGKLKRARTVHRDSEEEDDYLFDDPLPIPLRHKVPYPETFHPEVFSMTA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 SSQSTEPKYKPLGKLKRARTVHRDSEEEDDYLFDDPLPIPLRHKVPYPETFHPEVFSMTA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB9 VSEKQPEKLRQTPGCCRAECMQSSRFTNFVDCEESNSESEEEVGIPASLQGDLGSVLHLQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 VSEKQPEKLRQTPGCCRAECMQSSRFTNFVDCEESNSESEEEVGIPASLQGDLGSVLHLQ 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB9 KADGDVPQWEVFFKRNDEITDESLENFPSSTVAGGSQSPKLFSDSDGESTHISSQNSSQS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 KADGDVPQWEVFFKRNDEITDESLENFPSSTVAGGSQSPKLFSDSDGESTHISSQNSSQS 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB9 THITEQGSQGWDSQSDTVLLSSQERNSGDITSLDKADYRPTIKENIPASLMEQNVICPKD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 THITEQGSQGWDSQSDTVLLSSQERNSGDITSLDKADYRPTIKENIPASLMEQNVICPKD 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB9 TYSDLKSRDKDVTIVPSTGEPTTLSSETHIPEEKSLLNLSTNADSQSSSDFEVPSTPEAE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 TYSDLKSRDKDVTIVPSTGEPTTLSSETHIPEEKSLLNLSTNADSQSSSDFEVPSTPEAE 610 620 630 640 650 660 670 680 690 pF1KB9 LPKREHLQYLYEKLATGESIAVKKRKCSLLDT :::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 LPKREHLQYLYEKLATGESIAVKKRKCSLLDT 670 680 690 >>CCDS31150.1 DCLRE1C gene_id:64421|Hs108|chr10 (572 aa) initn: 3843 init1: 3843 opt: 3843 Z-score: 4076.0 bits: 764.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3843; 100.0% identity (100.0% similar) in 572 aa overlap (121-692:1-572) 100 110 120 130 140 150 pF1KB9 TQISLVDEASGEKEEIVVTLLPAGHCPGSVMFLFQGNNGTVLYTGDFRLAQGEAARMELL :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 MFLFQGNNGTVLYTGDFRLAQGEAARMELL 10 20 30 160 170 180 190 200 210 pF1KB9 HSGGRVKDIQSVYLDTTFCDPRFYQIPSREECLSGVLELVRSWITRSPYHVVWLNCKAAY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 HSGGRVKDIQSVYLDTTFCDPRFYQIPSREECLSGVLELVRSWITRSPYHVVWLNCKAAY 40 50 60 70 80 90 220 230 240 250 260 270 pF1KB9 GYEYLFTNLSEELGVQVHVNKLDMFRNMPEILHHLTTDRNTQIHACRHPKAEEYFQWSKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 GYEYLFTNLSEELGVQVHVNKLDMFRNMPEILHHLTTDRNTQIHACRHPKAEEYFQWSKL 100 110 120 130 140 150 280 290 300 310 320 330 pF1KB9 PCGITSRNRIPLHIISIKPSTMWFGERSRKTNVIVRTGESSYRACFSFHSSYSEIKDFLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 PCGITSRNRIPLHIISIKPSTMWFGERSRKTNVIVRTGESSYRACFSFHSSYSEIKDFLS 160 170 180 190 200 210 340 350 360 370 380 390 pF1KB9 YLCPVNAYPNVIPVGTTMDKVVEILKPLCRSSQSTEPKYKPLGKLKRARTVHRDSEEEDD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 YLCPVNAYPNVIPVGTTMDKVVEILKPLCRSSQSTEPKYKPLGKLKRARTVHRDSEEEDD 220 230 240 250 260 270 400 410 420 430 440 450 pF1KB9 YLFDDPLPIPLRHKVPYPETFHPEVFSMTAVSEKQPEKLRQTPGCCRAECMQSSRFTNFV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 YLFDDPLPIPLRHKVPYPETFHPEVFSMTAVSEKQPEKLRQTPGCCRAECMQSSRFTNFV 280 290 300 310 320 330 460 470 480 490 500 510 pF1KB9 DCEESNSESEEEVGIPASLQGDLGSVLHLQKADGDVPQWEVFFKRNDEITDESLENFPSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 DCEESNSESEEEVGIPASLQGDLGSVLHLQKADGDVPQWEVFFKRNDEITDESLENFPSS 340 350 360 370 380 390 520 530 540 550 560 570 pF1KB9 TVAGGSQSPKLFSDSDGESTHISSQNSSQSTHITEQGSQGWDSQSDTVLLSSQERNSGDI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 TVAGGSQSPKLFSDSDGESTHISSQNSSQSTHITEQGSQGWDSQSDTVLLSSQERNSGDI 400 410 420 430 440 450 580 590 600 610 620 630 pF1KB9 TSLDKADYRPTIKENIPASLMEQNVICPKDTYSDLKSRDKDVTIVPSTGEPTTLSSETHI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 TSLDKADYRPTIKENIPASLMEQNVICPKDTYSDLKSRDKDVTIVPSTGEPTTLSSETHI 460 470 480 490 500 510 640 650 660 670 680 690 pF1KB9 PEEKSLLNLSTNADSQSSSDFEVPSTPEAELPKREHLQYLYEKLATGESIAVKKRKCSLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 PEEKSLLNLSTNADSQSSSDFEVPSTPEAELPKREHLQYLYEKLATGESIAVKKRKCSLL 520 530 540 550 560 570 pF1KB9 DT :: CCDS31 DT >>CCDS7105.1 DCLRE1C gene_id:64421|Hs108|chr10 (577 aa) initn: 3836 init1: 3836 opt: 3836 Z-score: 4068.5 bits: 763.0 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3836; 100.0% identity (100.0% similar) in 571 aa overlap (122-692:7-577) 100 110 120 130 140 150 pF1KB9 QISLVDEASGEKEEIVVTLLPAGHCPGSVMFLFQGNNGTVLYTGDFRLAQGEAARMELLH :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS71 MKHQERFLFQGNNGTVLYTGDFRLAQGEAARMELLH 10 20 30 160 170 180 190 200 210 pF1KB9 SGGRVKDIQSVYLDTTFCDPRFYQIPSREECLSGVLELVRSWITRSPYHVVWLNCKAAYG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS71 SGGRVKDIQSVYLDTTFCDPRFYQIPSREECLSGVLELVRSWITRSPYHVVWLNCKAAYG 40 50 60 70 80 90 220 230 240 250 260 270 pF1KB9 YEYLFTNLSEELGVQVHVNKLDMFRNMPEILHHLTTDRNTQIHACRHPKAEEYFQWSKLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS71 YEYLFTNLSEELGVQVHVNKLDMFRNMPEILHHLTTDRNTQIHACRHPKAEEYFQWSKLP 100 110 120 130 140 150 280 290 300 310 320 330 pF1KB9 CGITSRNRIPLHIISIKPSTMWFGERSRKTNVIVRTGESSYRACFSFHSSYSEIKDFLSY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS71 CGITSRNRIPLHIISIKPSTMWFGERSRKTNVIVRTGESSYRACFSFHSSYSEIKDFLSY 160 170 180 190 200 210 340 350 360 370 380 390 pF1KB9 LCPVNAYPNVIPVGTTMDKVVEILKPLCRSSQSTEPKYKPLGKLKRARTVHRDSEEEDDY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS71 LCPVNAYPNVIPVGTTMDKVVEILKPLCRSSQSTEPKYKPLGKLKRARTVHRDSEEEDDY 220 230 240 250 260 270 400 410 420 430 440 450 pF1KB9 LFDDPLPIPLRHKVPYPETFHPEVFSMTAVSEKQPEKLRQTPGCCRAECMQSSRFTNFVD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS71 LFDDPLPIPLRHKVPYPETFHPEVFSMTAVSEKQPEKLRQTPGCCRAECMQSSRFTNFVD 280 290 300 310 320 330 460 470 480 490 500 510 pF1KB9 CEESNSESEEEVGIPASLQGDLGSVLHLQKADGDVPQWEVFFKRNDEITDESLENFPSST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS71 CEESNSESEEEVGIPASLQGDLGSVLHLQKADGDVPQWEVFFKRNDEITDESLENFPSST 340 350 360 370 380 390 520 530 540 550 560 570 pF1KB9 VAGGSQSPKLFSDSDGESTHISSQNSSQSTHITEQGSQGWDSQSDTVLLSSQERNSGDIT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS71 VAGGSQSPKLFSDSDGESTHISSQNSSQSTHITEQGSQGWDSQSDTVLLSSQERNSGDIT 400 410 420 430 440 450 580 590 600 610 620 630 pF1KB9 SLDKADYRPTIKENIPASLMEQNVICPKDTYSDLKSRDKDVTIVPSTGEPTTLSSETHIP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS71 SLDKADYRPTIKENIPASLMEQNVICPKDTYSDLKSRDKDVTIVPSTGEPTTLSSETHIP 460 470 480 490 500 510 640 650 660 670 680 690 pF1KB9 EEKSLLNLSTNADSQSSSDFEVPSTPEAELPKREHLQYLYEKLATGESIAVKKRKCSLLD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS71 EEKSLLNLSTNADSQSSSDFEVPSTPEAELPKREHLQYLYEKLATGESIAVKKRKCSLLD 520 530 540 550 560 570 pF1KB9 T : CCDS71 T >>CCDS7584.1 DCLRE1A gene_id:9937|Hs108|chr10 (1040 aa) initn: 191 init1: 101 opt: 312 Z-score: 328.1 bits: 71.8 E(32554): 5.9e-12 Smith-Waterman score: 366; 32.1% identity (56.9% similar) in 346 aa overlap (15-346:713-1020) 10 20 30 40 pF1KB9 MSSFEGQMAEYPTISIDRFDRENLRA-RAYFLSHCHKDHMKGLR ..: :. ... ::::.: :.::. :: CCDS75 GNKKIPESSNVGGSRKKTCPFYKKIPGTGFTVDAFQYGVVEGCTAYFLTHFHSDHYAGLS 690 700 710 720 730 740 50 60 70 80 90 100 pF1KB9 APTLKRRLECSLKVYLYCSPVTKELLLTSPKYRFWKKRIISIEIETPTQISLVDEASGEK . .::: .: .:: . : . .. : . ..: .. : : CCDS75 K---------HFTFPVYCSEITGNLL--KNKLHVQEQYIHPLPLDTECIVN------GVK 750 760 770 780 110 120 130 140 150 160 pF1KB9 EEIVVTLLPAGHCPGSVMFLFQGNNGTV-LYTGDFRLAQGEAARMELLHSGGRVKDIQSV :.:: :.::::.::.:: :::: :.::::: :. : :: . . .. . CCDS75 ----VVLLDANHCPGAVMILFYLPNGTVILHTGDFR-ADPSMER-SLLAD----QKVHML 790 800 810 820 830 170 180 190 200 210 220 pF1KB9 YLDTTFCDPRFYQIPSREECLSGVLELVRSWITRSPYHVVWLNCKAAYGYEYLFTNLSEE :::::.:.:. : .::..: . ... . .: .: :.. . . : : .: ... CCDS75 YLDTTYCSPE-YTFPSQQEVIRFAINTAFEAVTLNP-HALVVCGTYSIGKEKVFLAIADV 840 850 860 870 880 890 230 240 250 260 270 pF1KB9 LGVQVHVN----KLDMFRNMPEILHHLTTDR-NTQIHACRHPKAEEYFQ--WSKLP-CGI :: .: .. : . :.::: .::: .. .: : . :. :.: :: CCDS75 LGSKVGMSQEKYKTLQCLNIPEINSLITTDMCSSLVHLL--PMMQINFKGLQSHLKKCG- 900 910 920 930 940 950 280 290 300 310 320 330 pF1KB9 TSRNRIPLHIISIKPSTMWF--GERSRKTNVIVRT-GESS-YRACFSFHSSYSEIKDFLS . :. :....: : : .. .: ..:: .: :. : : .: :::: :.: :.. CCDS75 GKYNQ----ILAFRP-TGWTHSNKFTRIADVIPQTKGNISIYGIPYSEHSSYLEMKRFVQ 960 970 980 990 1000 340 350 360 370 380 390 pF1KB9 YLCPVNAYPNVIPVGTTMDKVVEILKPLCRSSQSTEPKYKPLGKLKRARTVHRDSEEEDD .: : . :.: ::: CCDS75 WLKPQKIIPTV-NVGTWKSRSTMEKYFREWKLEAGY 1010 1020 1030 1040 >>CCDS866.1 DCLRE1B gene_id:64858|Hs108|chr1 (532 aa) initn: 348 init1: 182 opt: 293 Z-score: 312.7 bits: 67.9 E(32554): 4.2e-11 Smith-Waterman score: 425; 28.3% identity (51.9% similar) in 520 aa overlap (6-489:3-476) 10 20 30 40 50 pF1KB9 MSSFEGQMAEYPTISIDRFD-RENLRARAYFLSHCHKDHMKGLRAPTLKRRLECSLKVYL : . . :..: .. :. :: .:::: :.:: :: . : : : CCDS86 MNGVLIPHTPIAVDFWSLRRAGTARLFFLSHMHSDHTVGLSS-TWARPL-------- 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 YCSPVTKELLLTSPKYRFWKKRIISIEIETPTQISLVDEASGEKEEIVVTLLPAGHCPGS ::::.: .:: . . :. : ..:. ... .:: . .: ..:::: :.::::: CCDS86 YCSPITAHLL--HRHLQVSKQWIQALEV-GESHVLPLDEIG--QETMTVTLLDANHCPGS 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 VMFLFQGNNGTVLYTGDFRLAQGEAARMELLHSGGRVKDIQSVYLDTTFCDPRFYQIPSR :::::.: ::.::::::: . . . : : :.:...:::.: :.: . .::: CCDS86 VMFLFEGYFGTILYTGDFRYTPS-MLKEPALTLG---KQIHTLYLDNTNCNPALV-LPSR 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KB9 EECLSGVLELVRSWITRSPYHVVWLNCKAAYGYEYLFTNLSEELGVQVHVN--KLDMFRN .: ...:.: . : : . .. . : : :. .:. :. . : .. .:.. . CCDS86 QEAAHQIVQLIR----KHPQHNIKIGLYS-LGKESLLEQLALEFQTWVVLSPRRLELVQL 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB9 MPEILHHLTTDRNTQIHACRHPKA--EEYFQWSKLPCGITSRNRIPLHIISIKPSTMWFG . . .. .::: : . ....:.. : :.: :. CCDS86 LGLADVFTVEEKAGRIHAVDHMEICHSNMLRWNQTH---------PT--IAILPT----- 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 pF1KB9 ERSRKTNVIVRTGESSYRACFSFHSSYSEIKDFLSYLCPVNAYPNVI--PVGTTMDKVV- ::: : . . . .: ::::::.. :.. : : .. : : : : .:.. CCDS86 --SRK---IHSSHPDIHVIPYSDHSSYSELRAFVAALKPCQVVPIVSRRPCGGFQDSLSP 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 pF1KB9 EILKPLC-------RSSQSTEPKYKPL--GKLKRART--VHRDSEEE--DDYLFDDPLPI .: :: ::.: .:. : .::: :: : .: :: :. : CCDS86 RISVPLIPDSVQQYMSSSSRKPSLLWLLERRLKRPRTQGVVFESPEESADQSQADRDSKK 320 330 340 350 360 370 400 410 420 430 440 450 pF1KB9 PLRHKV-PYPETFHPEVFSMTAVSEKQ--PEKLRQTPGCCRAECMQSSRFTNFV------ ..:. :.: .. . .:: :. . . : ...: : .. CCDS86 AKKEKLSPWPADLEKQPSHHPLRIKKQLFPDLYSKEWNKAVPFCESQKRVTMLTAPLGFS 380 390 400 410 420 430 460 470 480 490 500 pF1KB9 ------DCEESNSESEEEVGIPASLQGDLGSVLHLQKADGDVPQWEVFFKRNDEITDESL : : .....::.:. . : .:. .: :. : CCDS86 VHLRSTDEEFISQKTREEIGLGSPLV-PMGDDDGGPEATGNQSAWMGHGSPLSHSSKGTP 440 450 460 470 480 490 510 520 530 540 550 560 pF1KB9 ENFPSSTVAGGSQSPKLFSDSDGESTHISSQNSSQSTHITEQGSQGWDSQSDTVLLSSQE CCDS86 LLATEFRGLALKYLLTPVNFFQAGYSSRRFDQQVEKYHKPC 500 510 520 530 692 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 04:43:22 2016 done: Mon Nov 7 04:43:22 2016 Total Scan time: 2.820 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]