Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9972
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9972, 704 aa
1>>>pF1KB9972 704 - 704 aa - 704 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1433+/-0.00112; mu= 16.0304+/- 0.068
mean_var=81.8651+/-16.391, 0's: 0 Z-trim(103.4): 19 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.141751
statistics sampled from 7408 (7416) to 7408 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.588), E-opt: 0.2 (0.228), width: 16
Scan time: 3.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10508.1 TRAP1 gene_id:10131|Hs108|chr16 ( 704) 4538 938.4 0
CCDS61824.1 TRAP1 gene_id:10131|Hs108|chr16 ( 651) 3993 826.9 0
CCDS4909.1 HSP90AB1 gene_id:3326|Hs108|chr6 ( 724) 628 138.8 2.7e-32
CCDS9967.1 HSP90AA1 gene_id:3320|Hs108|chr14 ( 732) 626 138.4 3.7e-32
CCDS32160.1 HSP90AA1 gene_id:3320|Hs108|chr14 ( 854) 626 138.4 4.2e-32
CCDS9094.1 HSP90B1 gene_id:7184|Hs108|chr12 ( 803) 561 125.1 4e-28
>>CCDS10508.1 TRAP1 gene_id:10131|Hs108|chr16 (704 aa)
initn: 4538 init1: 4538 opt: 4538 Z-score: 5014.8 bits: 938.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4538; 100.0% identity (100.0% similar) in 704 aa overlap (1-704:1-704)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MARELRALLLWGRRLRPLLRAPALAAVPGGKPILCPRRTTAQLGPRRNPAWSLQAGRLFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MARELRALLLWGRRLRPLLRAPALAAVPGGKPILCPRRTTAQLGPRRNPAWSLQAGRLFS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 TQTAEDKEEPLHSIISSTESVQGSTSKHEFQAETKKLLDIVARSLYSEKEVFIRELISNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TQTAEDKEEPLHSIISSTESVQGSTSKHEFQAETKKLLDIVARSLYSEKEVFIRELISNA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SDALEKLRHKLVSDGQALPEMEIHLQTNAEKGTITIQDTGIGMTQEELVSNLGTIARSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SDALEKLRHKLVSDGQALPEMEIHLQTNAEKGTITIQDTGIGMTQEELVSNLGTIARSGS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KAFLDALQNQAEASSKIIGQFGVGFYSAFMVADRVEVYSRSAAPGSLGYQWLSDGSGVFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KAFLDALQNQAEASSKIIGQFGVGFYSAFMVADRVEVYSRSAAPGSLGYQWLSDGSGVFE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 IAEASGVRTGTKIIIHLKSDCKEFSSEARVRDVVTKYSNFVSFPLYLNGRRMNTLQAIWM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IAEASGVRTGTKIIIHLKSDCKEFSSEARVRDVVTKYSNFVSFPLYLNGRRMNTLQAIWM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 MDPKDVREWQHEEFYRYVAQAHDKPRYTLHYKTDAPLNIRSIFYVPDMKPSMFDVSRELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MDPKDVREWQHEEFYRYVAQAHDKPRYTLHYKTDAPLNIRSIFYVPDMKPSMFDVSRELG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 SSVALYSRKVLIQTKATDILPKWLRFIRGVVDSEDIPLNLSRELLQESALIRKLRDVLQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SSVALYSRKVLIQTKATDILPKWLRFIRGVVDSEDIPLNLSRELLQESALIRKLRDVLQQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 RLIKFFIDQSKKDAEKYAKFFEDYGLFMREGIVTATEQEVKEDIAKLLRYESSALPSGQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RLIKFFIDQSKKDAEKYAKFFEDYGLFMREGIVTATEQEVKEDIAKLLRYESSALPSGQL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 TSLSEYASRMRAGTRNIYYLCAPNRHLAEHSPYYEAMKKKDTEVLFCFEQFDELTLLHLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TSLSEYASRMRAGTRNIYYLCAPNRHLAEHSPYYEAMKKKDTEVLFCFEQFDELTLLHLR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 EFDKKKLISVETDIVVDHYKEEKFEDRSPAAECLSEKETEELMAWMRNVLGSRVTNVKVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EFDKKKLISVETDIVVDHYKEEKFEDRSPAAECLSEKETEELMAWMRNVLGSRVTNVKVT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 LRLDTHPAMVTVLEMGAARHFLRMQQLAKTQEERAQLLQPTLEINPRHALIKKLNQLRAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LRLDTHPAMVTVLEMGAARHFLRMQQLAKTQEERAQLLQPTLEINPRHALIKKLNQLRAS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB9 EPGLAQLLVDQIYENAMIAAGLVDDPRAMVGRLNELLVKALERH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EPGLAQLLVDQIYENAMIAAGLVDDPRAMVGRLNELLVKALERH
670 680 690 700
>>CCDS61824.1 TRAP1 gene_id:10131|Hs108|chr16 (651 aa)
initn: 3993 init1: 3993 opt: 3993 Z-score: 4413.0 bits: 826.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4068; 92.5% identity (92.5% similar) in 704 aa overlap (1-704:1-651)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MARELRALLLWGRRLRPLLRAPALAAVPGGKPILCPRRTTAQLGPRRNPAWSLQAGRLFS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MARELRALLLWGRRLRPLLRAPALAAVPGG------------------------------
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 TQTAEDKEEPLHSIISSTESVQGSTSKHEFQAETKKLLDIVARSLYSEKEVFIRELISNA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 -----------------------STSKHEFQAETKKLLDIVARSLYSEKEVFIRELISNA
40 50 60
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SDALEKLRHKLVSDGQALPEMEIHLQTNAEKGTITIQDTGIGMTQEELVSNLGTIARSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 SDALEKLRHKLVSDGQALPEMEIHLQTNAEKGTITIQDTGIGMTQEELVSNLGTIARSGS
70 80 90 100 110 120
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KAFLDALQNQAEASSKIIGQFGVGFYSAFMVADRVEVYSRSAAPGSLGYQWLSDGSGVFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 KAFLDALQNQAEASSKIIGQFGVGFYSAFMVADRVEVYSRSAAPGSLGYQWLSDGSGVFE
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 IAEASGVRTGTKIIIHLKSDCKEFSSEARVRDVVTKYSNFVSFPLYLNGRRMNTLQAIWM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 IAEASGVRTGTKIIIHLKSDCKEFSSEARVRDVVTKYSNFVSFPLYLNGRRMNTLQAIWM
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 MDPKDVREWQHEEFYRYVAQAHDKPRYTLHYKTDAPLNIRSIFYVPDMKPSMFDVSRELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MDPKDVREWQHEEFYRYVAQAHDKPRYTLHYKTDAPLNIRSIFYVPDMKPSMFDVSRELG
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 SSVALYSRKVLIQTKATDILPKWLRFIRGVVDSEDIPLNLSRELLQESALIRKLRDVLQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 SSVALYSRKVLIQTKATDILPKWLRFIRGVVDSEDIPLNLSRELLQESALIRKLRDVLQQ
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 RLIKFFIDQSKKDAEKYAKFFEDYGLFMREGIVTATEQEVKEDIAKLLRYESSALPSGQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 RLIKFFIDQSKKDAEKYAKFFEDYGLFMREGIVTATEQEVKEDIAKLLRYESSALPSGQL
370 380 390 400 410 420
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 TSLSEYASRMRAGTRNIYYLCAPNRHLAEHSPYYEAMKKKDTEVLFCFEQFDELTLLHLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 TSLSEYASRMRAGTRNIYYLCAPNRHLAEHSPYYEAMKKKDTEVLFCFEQFDELTLLHLR
430 440 450 460 470 480
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 EFDKKKLISVETDIVVDHYKEEKFEDRSPAAECLSEKETEELMAWMRNVLGSRVTNVKVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 EFDKKKLISVETDIVVDHYKEEKFEDRSPAAECLSEKETEELMAWMRNVLGSRVTNVKVT
490 500 510 520 530 540
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 LRLDTHPAMVTVLEMGAARHFLRMQQLAKTQEERAQLLQPTLEINPRHALIKKLNQLRAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 LRLDTHPAMVTVLEMGAARHFLRMQQLAKTQEERAQLLQPTLEINPRHALIKKLNQLRAS
550 560 570 580 590 600
670 680 690 700
pF1KB9 EPGLAQLLVDQIYENAMIAAGLVDDPRAMVGRLNELLVKALERH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 EPGLAQLLVDQIYENAMIAAGLVDDPRAMVGRLNELLVKALERH
610 620 630 640 650
>>CCDS4909.1 HSP90AB1 gene_id:3326|Hs108|chr6 (724 aa)
initn: 895 init1: 289 opt: 628 Z-score: 693.2 bits: 138.8 E(32554): 2.7e-32
Smith-Waterman score: 1122; 31.4% identity (62.9% similar) in 684 aa overlap (90-697:17-684)
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 STQTAEDKEEPLHSIISSTESVQGSTSKHEFQAETKKLLDIVARSLYSEKEVFIRELISN
:::: .:.... ..::.::.:.::::::
CCDS49 MPEEVHHGEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISN
10 20 30 40
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 ASDALEKLRHKLVSDGQALP---EMEIHLQTNAEKGTITIQDTGIGMTQEELVSNLGTIA
:::::.:.:.. ..: . : :..: . : .. :.:. :::::::. .:..::::::
CCDS49 ASDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELKIDIIPNPQERTLTLVDTGIGMTKADLINNLGTIA
50 60 70 80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 RSGSKAFLDALQNQAEASSKIIGQFGVGFYSAFMVADRVEVYSRSAAPGSLGYQWLSDGS
.::.:::..::: :. : .:::::::::::..::..: : .. . : : :...
CCDS49 KSGTKAFMEALQAGADIS--MIGQFGVGFYSAYLVAEKVVVITKHNDDEQ--YAWESSAG
110 120 130 140 150 160
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 GVFEIAEASG--VRTGTKIIIHLKSDCKEFSSEARVRDVVTKYSNFVSFP--LYLNGRR-
: : . : . :::.:.::: : :. : ::..:: :.:.:...: :::. .:
CCDS49 GSFTVRADHGEPIGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRVKEVVKKHSQFIGYPITLYLEKERE
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 -----------------------------------------------------------M
.
CCDS49 KEISDDEAEEEKGEKEEEDKDDEEKPKIEDVGSDEEDDSGKDKKKKTKKIKEKYIDQEEL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 NTLQAIWMMDPKDVREWQHEEFYRYVAQAHDKPRYTLHYKTDAPLNIRSIFYVPDMKPSM
: . :: .: :. . .. :::. ... . . :..... :..:.....: :
CCDS49 NKTKPIWTRNPDDITQEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFIPRRAP--
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 FDV--SRELGSSVALYSRKVLIQTKATDILPKWLRFIRGVVDSEDIPLNLSRELLQESAL
::. ... ... :: :.:.:. . ...:..: ::::::::::.:::.:::.::.: .
CCDS49 FDLFENKKKKNNIKLYVRRVFIMDSCDELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKI
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 IRKLRDVLQQRLIKFFIDQSKKDAEKYAKFFEDYGLFMREGIVTATEQEVKEDIAKLLRY
.. .: . .. ...: . .. : :.: ::.: .. .. :: .. .. ...::::
CCDS49 LKVIRKNIVKKCLELFSELAE-DKENYKKFYEAFSKNLKLGI--HEDSTNRRRLSELLRY
410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KB9 ESSALPSG-QLTSLSEYASRMRAGTRNIYYLCAPNRHLAEHSPYYEAMKKKDTEVLFCFE
..: :: ..::::::.:::. ..:::. . ... . .: . : ..:. ::.. :
CCDS49 HTS--QSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRKRGFEVVYMTE
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 QFDELTLLHLREFDKKKLISVETDIVVDHYKEEKFEDRSPAAECLSEKETEELMAWMRNV
.:: . .:.::: :.:.:: . . . :.. :... : :. . :.: :...
CCDS49 PIDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGL--ELPEDE-EEKKKMEE--SKAKFENLCKLMKEI
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 LGSRVTNVKVTLRLDTHPAMVTVLEMG---AARHFLRMQQLAKTQEERAQLLQPTLEINP
: ..: .: .. :: . : ... .: ..... : : .. .. . :::::
CCDS49 LDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMMAKKHLEINP
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KB9 RHALIKKLNQLRASEPG--LAQLLVDQIYENAMIAAGL-VDDPRAMVGRLNELLVKALER
: ... : : .. . .. :: ..:.:....:. ..::.. .:. ...
CCDS49 DHPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIYRMIKLGLGI
640 650 660 670 680 690
pF1KB9 H
CCDS49 DEDEVAAEEPNAAVPDEIPPLEGDEDASRMEEVD
700 710 720
>>CCDS9967.1 HSP90AA1 gene_id:3320|Hs108|chr14 (732 aa)
initn: 993 init1: 306 opt: 626 Z-score: 690.9 bits: 138.4 E(32554): 3.7e-32
Smith-Waterman score: 1113; 31.3% identity (62.9% similar) in 690 aa overlap (90-697:22-692)
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 STQTAEDKEEPLHSIISSTESVQGSTSKHEFQAETKKLLDIVARSLYSEKEVFIRELISN
:::: .:.... ..::.::.:.::::::
CCDS99 MPEETQTQDQPMEEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISN
10 20 30 40 50
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 ASDALEKLRHKLVSDGQALP---EMEIHLQTNAEKGTITIQDTGIGMTQEELVSNLGTIA
.::::.:.:.. ..: . : :..:.: : . :.:: :::::::. .:..::::::
CCDS99 SSDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELHINLIPNKQDRTLTIVDTGIGMTKADLINNLGTIA
60 70 80 90 100 110
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 RSGSKAFLDALQNQAEASSKIIGQFGVGFYSAFMVADRVEVYSRSAAPGSLGYQWLSDGS
.::.:::..::: :. : .:::::::::::..::..: : .. . : : :...
CCDS99 KSGTKAFMEALQAGADIS--MIGQFGVGFYSAYLVAEKVTVITKHNDDEQ--YAWESSAG
120 130 140 150 160
240 250 260 270 280
pF1KB9 GVFEIAEASG--VRTGTKIIIHLKSDCKEFSSEARVRDVVTKYSNFVSFPL---------
: : . .: . :::.:.::: : :. : :....: :.:.:...:.
CCDS99 GSFTVRTDTGEPMGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRIKEIVKKHSQFIGYPITLFVEKERD
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 --------------------------------------------------------YLNG
:..
CCDS99 KEVSDDEAEEKEDKEEEKEKEEKESEDKPEIEDVGSDEEEEKKDGDKKKKKKIKEKYIDQ
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 RRMNTLQAIWMMDPKDVREWQHEEFYRYVAQAHDKPRYTLHYKTDAPLNIRSIFYVPDMK
...: . :: .: :. . .. :::. ... . . :..... :..:....::
CCDS99 EELNKTKPIWTRNPDDITNEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFVPRRA
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 PSMFDV--SRELGSSVALYSRKVLIQTKATDILPKWLRFIRGVVDSEDIPLNLSRELLQE
: ::. .:. ... :: :.:.:. . ...:..: ::::::::::.:::.:::.::.
CCDS99 P--FDLFENRKKKNNIKLYVRRVFIMDNCEELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQ
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 SALIRKLRDVLQQRLIKFFIDQSKKDAEKYAKFFEDYGLFMREGIVTATEQEVKEDIAKL
: ... .: : .. ...: . .. : :.: ::.:... .. :: ... .. ...:
CCDS99 SKILKVIRKNLVKKCLELFTELAE-DKENYKKFYEQFSKNIKLGI--HEDSQNRKKLSEL
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 LRYESSALPSG-QLTSLSEYASRMRAGTRNIYYLCAPNRHLAEHSPYYEAMKKKDTEVLF
::: .:: :: ...::..: .::. . ..:::. . .. . .: . : ..:. ::..
CCDS99 LRYYTSA--SGDEMVSLKDYCTRMKENQKHIYYITGETKDQVANSAFVERLRKHGLEVIY
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 CFEQFDELTLLHLREFDKKKLISVETD-IVVDHYKEEKFEDRSPAAECLSEKET--EELM
.: .:: . .:.::. : :.:: . . . . .::: ... ::.: :.:
CCDS99 MIEPIDEYCVQQLKEFEGKTLVSVTKEGLELPEDEEEKKKQE--------EKKTKFENLC
530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 AWMRNVLGSRVTNVKVTLRLDTHPAMVTVLEMG---AARHFLRMQQLAKTQEERAQLLQP
:...: ..: .: :. :: : : ... .: ..... : : .. . .
CCDS99 KIMKDILEKKVEKVVVSNRLVTSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMAAKK
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690
pF1KB9 TLEINPRHALIKKLNQLRASEPGLAQL--LVDQIYENAMIAAGL-VDDPRAMVGRLNELL
::::: :..:. : : .. . .. :: .::.:....:. ..::.. ..:. ...
CCDS99 HLEINPDHSIIETLRQKAEADKNDKSVKDLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANRIYRMI
640 650 660 670 680 690
700
pF1KB9 VKALERH
CCDS99 KLGLGIDEDDPTADDTSAAVTEEMPPLEGDDDTSRMEEVD
700 710 720 730
>>CCDS32160.1 HSP90AA1 gene_id:3320|Hs108|chr14 (854 aa)
initn: 993 init1: 306 opt: 626 Z-score: 689.9 bits: 138.4 E(32554): 4.2e-32
Smith-Waterman score: 1114; 30.5% identity (62.3% similar) in 722 aa overlap (57-697:120-814)
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 VPGGKPILCPRRTTAQLGPRRNPAWSLQAGRLFSTQTAEDKEEPLHSIISSTESVQGSTS
::. . .. ...:.. : :.
CCDS32 AFPVTASLAFRQSQGAGQHLYKDLQPFILLRLLMPEETQTQDQPMEE-----EEVE----
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130 140
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