Result of FASTA (omim) for pF1KB9995
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9995, 585 aa
  1>>>pF1KB9995 585 - 585 aa - 585 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9623+/-0.000386; mu= 21.1451+/- 0.024
 mean_var=68.9793+/-14.296, 0's: 0 Z-trim(112.6): 73  B-trim: 133 in 1/51
 Lambda= 0.154424
 statistics sampled from 21511 (21584) to 21511 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.253), width:  16
 Scan time:  9.750

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_000809 (OMIM: 138275) glutamate decarboxylase 2 ( 585) 4006 901.9       0
NP_001127838 (OMIM: 138275) glutamate decarboxylas ( 585) 4006 901.9       0
XP_011509224 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glut ( 594) 2618 592.7 1.1e-168
XP_016859245 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glut ( 594) 2618 592.7 1.1e-168
NP_000808 (OMIM: 603513,605363) glutamate decarbox ( 594) 2618 592.7 1.1e-168
XP_011536748 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 520) 1789 408.0  4e-113
NP_057073 (OMIM: 616569) cysteine sulfinic acid de ( 520) 1789 408.0  4e-113
NP_001231634 (OMIM: 616569) cysteine sulfinic acid ( 493) 1785 407.1 7.1e-113
XP_016861786 (OMIM: 615601) PREDICTED: acidic amin ( 502) 1719 392.4 1.9e-108
NP_997242 (OMIM: 615601) acidic amino acid decarbo ( 521) 1719 392.4  2e-108
XP_016859246 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glut ( 395) 1538 352.0 2.2e-96
XP_011536753 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 275) 1131 261.2 3.3e-69
XP_016874907 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 275) 1131 261.2 3.3e-69
XP_016861787 (OMIM: 615601) PREDICTED: acidic amin ( 275) 1101 254.5 3.4e-67
NP_001231635 (OMIM: 616569) cysteine sulfinic acid ( 260) 1079 249.6 9.7e-66
XP_016874906 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 293) 1079 249.6 1.1e-65
XP_011536751 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 293) 1079 249.6 1.1e-65
XP_016874908 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 368) 1079 249.7 1.3e-65
XP_016874905 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 422) 1079 249.7 1.4e-65
XP_011536744 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine su ( 551) 1079 249.8 1.7e-65
XP_016859247 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glut ( 224)  565 135.0 2.6e-31
NP_038473 (OMIM: 603513,605363) glutamate decarbox ( 224)  565 135.0 2.6e-31
XP_005246501 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glut ( 224)  565 135.0 2.6e-31
NP_001076440 (OMIM: 107930,608643) aromatic-L-amin ( 480)  456 111.0 9.4e-24
NP_000781 (OMIM: 107930,608643) aromatic-L-amino-a ( 480)  456 111.0 9.4e-24
XP_005271802 (OMIM: 107930,608643) PREDICTED: arom ( 442)  442 107.8 7.7e-23
NP_001229815 (OMIM: 107930,608643) aromatic-L-amin ( 442)  442 107.8 7.7e-23
XP_011513463 (OMIM: 107930,608643) PREDICTED: arom ( 461)  442 107.8 7.9e-23
NP_001229817 (OMIM: 107930,608643) aromatic-L-amin ( 402)  438 106.9 1.3e-22
NP_002103 (OMIM: 137580,142704) histidine decarbox ( 662)  418 102.6 4.3e-21
NP_001229819 (OMIM: 107930,608643) aromatic-L-amin ( 338)  361 89.7 1.7e-17
NP_001229818 (OMIM: 107930,608643) aromatic-L-amin ( 387)  336 84.2 8.9e-16
NP_001293075 (OMIM: 137580,142704) histidine decar ( 629)  335 84.1 1.5e-15
NP_001229816 (OMIM: 107930,608643) aromatic-L-amin ( 432)  333 83.5 1.5e-15
XP_016877588 (OMIM: 137580,142704) PREDICTED: hist ( 437)  173 47.9 8.4e-05
XP_016877586 (OMIM: 137580,142704) PREDICTED: hist ( 618)  173 48.0 0.00011
XP_016877585 (OMIM: 137580,142704) PREDICTED: hist ( 621)  173 48.0 0.00011
XP_016877584 (OMIM: 137580,142704) PREDICTED: hist ( 664)  173 48.0 0.00012
XP_016877583 (OMIM: 137580,142704) PREDICTED: hist ( 697)  173 48.0 0.00012
NP_001272379 (OMIM: 614244) pyridoxal-dependent de ( 429)  159 44.8 0.00072
NP_001310950 (OMIM: 614244) pyridoxal-dependent de ( 471)  152 43.2  0.0023
XP_016878554 (OMIM: 614244) PREDICTED: pyridoxal-d ( 483)  152 43.2  0.0023
NP_001310949 (OMIM: 614244) pyridoxal-dependent de ( 497)  152 43.3  0.0024
NP_001272378 (OMIM: 614244) pyridoxal-dependent de ( 498)  152 43.3  0.0024
NP_001272377 (OMIM: 614244) pyridoxal-dependent de ( 697)  152 43.4  0.0031
XP_016878552 (OMIM: 614244) PREDICTED: pyridoxal-d ( 708)  152 43.4  0.0031
XP_006720928 (OMIM: 614244) PREDICTED: pyridoxal-d ( 746)  152 43.4  0.0032
XP_016878553 (OMIM: 614244) PREDICTED: pyridoxal-d ( 746)  152 43.4  0.0032
NP_001272374 (OMIM: 614244) pyridoxal-dependent de ( 760)  152 43.4  0.0033
NP_001272373 (OMIM: 614244) pyridoxal-dependent de ( 761)  152 43.4  0.0033


>>NP_000809 (OMIM: 138275) glutamate decarboxylase 2 [Ho  (585 aa)
 initn: 4006 init1: 4006 opt: 4006  Z-score: 4820.6  bits: 901.9 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4006; 100.0% identity (100.0% similar) in 585 aa overlap (1-585:1-585)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MASPGSGFWSFGSEDGSGDSENPGTARAWCQVAQKFTGGIGNKLCALLYGDAEKPAESGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MASPGSGFWSFGSEDGSGDSENPGTARAWCQVAQKFTGGIGNKLCALLYGDAEKPAESGG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 SQPPRAAARKAACACDQKPCSCSKVDVNYAFLHATDLLPACDGERPTLAFLQDVMNILLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SQPPRAAARKAACACDQKPCSCSKVDVNYAFLHATDLLPACDGERPTLAFLQDVMNILLQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 YVVKSFDRSTKVIDFHYPNELLQEYNWELADQPQNLEEILMHCQTTLKYAIKTGHPRYFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YVVKSFDRSTKVIDFHYPNELLQEYNWELADQPQNLEEILMHCQTTLKYAIKTGHPRYFN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 QLSTGLDMVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMREIIGWPGGSGDGIFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QLSTGLDMVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMREIIGWPGGSGDGIFS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 PGGAISNMYAMMIARFKMFPEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLKKGAAALGIGTDSVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PGGAISNMYAMMIARFKMFPEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLKKGAAALGIGTDSVI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 LIKCDERGKMIPSDLERRILEAKQKGFVPFLVSATAGTTVYGAFDPLLAVADICKKYKIW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LIKCDERGKMIPSDLERRILEAKQKGFVPFLVSATAGTTVYGAFDPLLAVADICKKYKIW
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 MHVDAAWGGGLLMSRKHKWKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCSALLVREEGLMQNCNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MHVDAAWGGGLLMSRKHKWKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCSALLVREEGLMQNCNQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 MHASYLFQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTTGFEAHVDKCLELAEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MHASYLFQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTTGFEAHVDKCLELAEY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 LYNIIKNREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSRLSKVAPVIKARMMEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LYNIIKNREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSRLSKVAPVIKARMMEY
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580     
pF1KB9 GTTMVSYQPLGDKVNFFRMVISNPAATHQDIDFLIEEIERLGQDL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GTTMVSYQPLGDKVNFFRMVISNPAATHQDIDFLIEEIERLGQDL
              550       560       570       580     

>>NP_001127838 (OMIM: 138275) glutamate decarboxylase 2   (585 aa)
 initn: 4006 init1: 4006 opt: 4006  Z-score: 4820.6  bits: 901.9 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4006; 100.0% identity (100.0% similar) in 585 aa overlap (1-585:1-585)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MASPGSGFWSFGSEDGSGDSENPGTARAWCQVAQKFTGGIGNKLCALLYGDAEKPAESGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MASPGSGFWSFGSEDGSGDSENPGTARAWCQVAQKFTGGIGNKLCALLYGDAEKPAESGG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 SQPPRAAARKAACACDQKPCSCSKVDVNYAFLHATDLLPACDGERPTLAFLQDVMNILLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQPPRAAARKAACACDQKPCSCSKVDVNYAFLHATDLLPACDGERPTLAFLQDVMNILLQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 YVVKSFDRSTKVIDFHYPNELLQEYNWELADQPQNLEEILMHCQTTLKYAIKTGHPRYFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YVVKSFDRSTKVIDFHYPNELLQEYNWELADQPQNLEEILMHCQTTLKYAIKTGHPRYFN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 QLSTGLDMVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMREIIGWPGGSGDGIFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLSTGLDMVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMREIIGWPGGSGDGIFS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 PGGAISNMYAMMIARFKMFPEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLKKGAAALGIGTDSVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGGAISNMYAMMIARFKMFPEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLKKGAAALGIGTDSVI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 LIKCDERGKMIPSDLERRILEAKQKGFVPFLVSATAGTTVYGAFDPLLAVADICKKYKIW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LIKCDERGKMIPSDLERRILEAKQKGFVPFLVSATAGTTVYGAFDPLLAVADICKKYKIW
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 MHVDAAWGGGLLMSRKHKWKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCSALLVREEGLMQNCNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MHVDAAWGGGLLMSRKHKWKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCSALLVREEGLMQNCNQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 MHASYLFQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTTGFEAHVDKCLELAEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MHASYLFQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTTGFEAHVDKCLELAEY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 LYNIIKNREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSRLSKVAPVIKARMMEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LYNIIKNREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSRLSKVAPVIKARMMEY
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580     
pF1KB9 GTTMVSYQPLGDKVNFFRMVISNPAATHQDIDFLIEEIERLGQDL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GTTMVSYQPLGDKVNFFRMVISNPAATHQDIDFLIEEIERLGQDL
              550       560       570       580     

>>XP_011509224 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glutamat  (594 aa)
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          ..:.:.  : ..  : .  .  : :  .:: ::.  :  .: :.:..:   .. :. 
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        ::: ::: :::::.::: :::.:::::::::::::..::::::::::::::::
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>>XP_016859245 (OMIM: 603513,605363) PREDICTED: glutamat  (594 aa)
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Smith-Waterman score: 2618; 64.1% identity (86.0% similar) in 591 aa overlap (2-585:4-594)

                 10         20        30        40          50     
pF1KB9   MASPGSGFWSFGS-EDGSGDSENPGTARAWCQVAQKFTGGIGNKLCALLY--GDAEKP
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       ..:::.:: :.:::::::.:::.:..::.    .: ::.:.:..::.::. :. ::::..
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pF1KB9 KTGHPRYFNQLSTGLDMVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMREIIGWP
       .:::::.:::::::::..:::..:::::::::::::::::::::.: .::::::::.:: 
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pF1KB9 DICKKYKIWMHVDAAWGGGLLMSRKHKWKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCSALLVRE
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XP_016 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
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pF1KB9 DKCLELAEYLYNIIKNREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSRLSKVAP
       .::::::::::  ::::: .::::.:.:.:::::::::: ::: . :. .:  .: ::::
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pF1KB9 VIKARMMEYGTTMVSYQPLGDKVNFFRMVISNPAATHQDIDFLIEEIERLGQDL
        ::: ::: :::::.::: :::.:::::::::::::..::::::::::::::::
XP_016 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
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>>NP_000808 (OMIM: 603513,605363) glutamate decarboxylas  (594 aa)
 initn: 2361 init1: 2361 opt: 2618  Z-score: 3149.3  bits: 592.7 E(85289): 1.1e-168
Smith-Waterman score: 2618; 64.1% identity (86.0% similar) in 591 aa overlap (2-585:4-594)

                 10         20        30        40          50     
pF1KB9   MASPGSGFWSFGS-EDGSGDSENPGTARAWCQVAQKFTGGIGNKLCALLY--GDAEKP
          ..:.:.  : ..  : .  .  : :  .:: ::.  :  .: :.:..:   .. :. 
NP_000 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGFLQRTNSLEEK
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pF1KB9 AESGGSQPPRAAARKA-ACACDQKPCSCSKVDVNYAFLHATDLLPACDGERPTLAFLQDV
       ..  ..   : ....  .:  ...     ....... : : ::::: .::. :. :: .:
NP_000 SRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFARDLLPAKNGEEQTVQFLLEV
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB9 MNILLQYVVKSFDRSTKVIDFHYPNELLQE---YNWELADQPQNLEEILMHCQTTLKYAI
       ..:::.:: :.:::::::.:::.:..::.    .: ::.:.:..::.::. :. ::::..
NP_000 VDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGV
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pF1KB9 KTGHPRYFNQLSTGLDMVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMREIIGWP
       .:::::.:::::::::..:::..:::::::::::::::::::::.: .::::::::.:: 
NP_000 RTGHPRFFNQLSTGLDIIGLAGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWS
              190       200       210       220       230       240

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pF1KB9 GGSGDGIFSPGGAISNMYAMMIARFKMFPEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLKKGAAA
       . .:::::::::::::::..: ::.:.::::: :::::.:.:. ::::.::.:.::..::
NP_000 SKDGDGIFSPGGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA
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pF1KB9 LGIGTDSVILIKCDERGKMIPSDLERRILEAKQKGFVPFLVSATAGTTVYGAFDPLLAVA
       ::.:::.::::::.::::.::.:.: .::::::::.::: :.:::::::::::::.  .:
NP_000 LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVYGAFDPIQEIA
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pF1KB9 DICKKYKIWMHVDAAWGGGLLMSRKHKWKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCSALLVRE
       :::.::..:.::::::::::::::::. ::.:.:::::::::::::::: :::::.::.:
NP_000 DICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVTWNPHKMMGVLLQCSAILVKE
              370       380       390       400       410       420

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pF1KB9 EGLMQNCNQMHASYLFQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTTGFEAHV
       .:..:.:::: :.:::: ::.::.::::::::.:::::::.::.::::.::::.::: ..
NP_000 KGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGDKAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQI
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             480       490       500       510       520       530 
pF1KB9 DKCLELAEYLYNIIKNREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSRLSKVAP
       .::::::::::  ::::: .::::.:.:.:::::::::: ::: . :. .:  .: ::::
NP_000 NKCLELAEYLYAKIKNREEFEMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAP
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pF1KB9 VIKARMMEYGTTMVSYQPLGDKVNFFRMVISNPAATHQDIDFLIEEIERLGQDL
        ::: ::: :::::.::: :::.:::::::::::::..::::::::::::::::
NP_000 KIKALMMESGTTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL
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>>XP_011536748 (OMIM: 616569) PREDICTED: cysteine sulfin  (520 aa)
 initn: 1456 init1: 782 opt: 1789  Z-score: 2151.9  bits: 408.0 E(85289): 4e-113
Smith-Waterman score: 1789; 50.4% identity (80.4% similar) in 510 aa overlap (80-585:15-520)

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pF1KB9 GDAEKPAESGGSQPPRAAARKAACACDQKPCSCSKVDVNYAFLHA-TDLLPACDGERPTL
                                     :.   . ..  .: : .. ::.  :.  ..
XP_011                 MSIPLKSSFLLSYLCTLPPALLSREILMADSEALPSLAGDPVAV
                               10        20        30        40    

       110       120        130       140       150       160      
pF1KB9 -AFLQDVMNILLQYVV-KSFDRSTKVIDFHYPNELLQEYNWELADQPQNLEEILMHCQTT
        :.:. :...... .. :. . : :: ... :.:: :  . :: .: .. ..:: .:...
XP_011 EALLRAVFGVVVDEAIQKGTSVSQKVCEWKEPEELKQLLDLELRSQGESQKQILERCRAV
           50        60        70        80        90       100    

        170       180       190       200       210       220      
pF1KB9 LKYAIKTGHPRYFNQLSTGLDMVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMRE
       ..:..::::::.:::: .:::  .::.  .: . ::...::::::::::.:  .:.:.: 
XP_011 IRYSVKTGHPRFFNQLFSGLDPHALAGRIITESLNTSQYTYEIAPVFVLMEEEVLRKLRA
          110       120       130       140       150       160    

        230       240       250       260       270       280      
pF1KB9 IIGWPGGSGDGIFSPGGAISNMYAMMIARFKMFPEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLK
       ..::  .:::::: :::.::::::. .::.. .:. :..:. .:: :  :::.. :.:..
XP_011 LVGW--SSGDGIFCPGGSISNMYAVNLARYQRYPDCKQRGLRTLPPLALFTSKECHYSIQ
            170       180       190       200       210       220  

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB9 KGAAALGIGTDSVILIKCDERGKMIPSDLERRILEAKQKGFVPFLVSATAGTTVYGAFDP
       :::: ::.::::: ..: ::::::.: ::::.:  :. .: ::::::::.:::: :::::
XP_011 KGAAFLGLGTDSVRVVKADERGKMVPEDLERQIGMAEAEGAVPFLVSATSGTTVLGAFDP
            230       240       250       260       270       280  

        350       360       370       380       390       400      
pF1KB9 LLAVADICKKYKIWMHVDAAWGGGLLMSRKHKWKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCSA
       : :.::.:... .:.::::::::..:.:. :.  :.:..::.::.:::::.... :::::
XP_011 LEAIADVCQRHGLWLHVDAAWGGSVLLSQTHRHLLDGIQRADSVAWNPHKLLAAGLQCSA
            290       300       310       320       330       340  

        410        420       430       440       450       460     
pF1KB9 LLVREEG-LMQNCNQMHASYLFQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTT
       ::... . :.. :.  .::::::::: ::.. :::::..::::.:: .::::::.:.:  
XP_011 LLLQDTSNLLKRCHGSQASYLFQQDKFYDVALDTGDKVVQCGRRVDCLKLWLMWKAQGDQ
            350       360       370       380       390       400  

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pF1KB9 GFEAHVDKCLELAEYLYNIIKNREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSR
       :.: ..:. . ::.:: . .:.:::.:.:..  :. .:::::..:::::  ... .   :
XP_011 GLERRIDQAFVLARYLVEEMKKREGFELVME--PEFVNVCFWFVPPSLRGKQESPDYHER
            410       420       430         440       450       460

         530       540       550       560       570       580     
pF1KB9 LSKVAPVIKARMMEYGTTMVSYQPLGDKVNFFRMVISNPAATHQDIDFLIEEIERLGQDL
       :::::::.: ::.. :. :..::: : . ::::.:..: : :  :.:::..:.:::::::
XP_011 LSKVAPVLKERMVKEGSMMIGYQPHGTRGNFFRVVVANSALTCADMDFLLNELERLGQDL
              470       480       490       500       510       520

>>NP_057073 (OMIM: 616569) cysteine sulfinic acid decarb  (520 aa)
 initn: 1456 init1: 782 opt: 1789  Z-score: 2151.9  bits: 408.0 E(85289): 4e-113
Smith-Waterman score: 1789; 50.4% identity (80.4% similar) in 510 aa overlap (80-585:15-520)

      50        60        70        80        90        100        
pF1KB9 GDAEKPAESGGSQPPRAAARKAACACDQKPCSCSKVDVNYAFLHA-TDLLPACDGERPTL
                                     :.   . ..  .: : .. ::.  :.  ..
NP_057                 MSIPLKSSFLLSYLCTLPPALLSREILMADSEALPSLAGDPVAV
                               10        20        30        40    

       110       120        130       140       150       160      
pF1KB9 -AFLQDVMNILLQYVV-KSFDRSTKVIDFHYPNELLQEYNWELADQPQNLEEILMHCQTT
        :.:. :...... .. :. . : :: ... :.:: :  . :: .: .. ..:: .:...
NP_057 EALLRAVFGVVVDEAIQKGTSVSQKVCEWKEPEELKQLLDLELRSQGESQKQILERCRAV
           50        60        70        80        90       100    

        170       180       190       200       210       220      
pF1KB9 LKYAIKTGHPRYFNQLSTGLDMVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMRE
       ..:..::::::.:::: .:::  .::.  .: . ::...::::::::::.:  .:.:.: 
NP_057 IRYSVKTGHPRFFNQLFSGLDPHALAGRIITESLNTSQYTYEIAPVFVLMEEEVLRKLRA
          110       120       130       140       150       160    

        230       240       250       260       270       280      
pF1KB9 IIGWPGGSGDGIFSPGGAISNMYAMMIARFKMFPEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLK
       ..::  .:::::: :::.::::::. .::.. .:. :..:. .:: :  :::.. :.:..
NP_057 LVGW--SSGDGIFCPGGSISNMYAVNLARYQRYPDCKQRGLRTLPPLALFTSKECHYSIQ
            170       180       190       200       210       220  

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB9 KGAAALGIGTDSVILIKCDERGKMIPSDLERRILEAKQKGFVPFLVSATAGTTVYGAFDP
       :::: ::.::::: ..: ::::::.: ::::.:  :. .: ::::::::.:::: :::::
NP_057 KGAAFLGLGTDSVRVVKADERGKMVPEDLERQIGMAEAEGAVPFLVSATSGTTVLGAFDP
            230       240       250       260       270       280  

        350       360       370       380       390       400      
pF1KB9 LLAVADICKKYKIWMHVDAAWGGGLLMSRKHKWKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCSA
       : :.::.:... .:.::::::::..:.:. :.  :.:..::.::.:::::.... :::::
NP_057 LEAIADVCQRHGLWLHVDAAWGGSVLLSQTHRHLLDGIQRADSVAWNPHKLLAAGLQCSA
            290       300       310       320       330       340  

        410        420       430       440       450       460     
pF1KB9 LLVREEG-LMQNCNQMHASYLFQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTT
       ::... . :.. :.  .::::::::: ::.. :::::..::::.:: .::::::.:.:  
NP_057 LLLQDTSNLLKRCHGSQASYLFQQDKFYDVALDTGDKVVQCGRRVDCLKLWLMWKAQGDQ
            350       360       370       380       390       400  

         470       480       490       500       510       520     
pF1KB9 GFEAHVDKCLELAEYLYNIIKNREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSR
       :.: ..:. . ::.:: . .:.:::.:.:..  :. .:::::..:::::  ... .   :
NP_057 GLERRIDQAFVLARYLVEEMKKREGFELVME--PEFVNVCFWFVPPSLRGKQESPDYHER
            410       420       430         440       450       460

         530       540       550       560       570       580     
pF1KB9 LSKVAPVIKARMMEYGTTMVSYQPLGDKVNFFRMVISNPAATHQDIDFLIEEIERLGQDL
       :::::::.: ::.. :. :..::: : . ::::.:..: : :  :.:::..:.:::::::
NP_057 LSKVAPVLKERMVKEGSMMIGYQPHGTRGNFFRVVVANSALTCADMDFLLNELERLGQDL
              470       480       490       500       510       520

>>NP_001231634 (OMIM: 616569) cysteine sulfinic acid dec  (493 aa)
 initn: 1456 init1: 782 opt: 1785  Z-score: 2147.4  bits: 407.1 E(85289): 7.1e-113
Smith-Waterman score: 1785; 51.4% identity (81.4% similar) in 494 aa overlap (95-585:4-493)

           70        80        90       100        110       120   
pF1KB9 RAAARKAACACDQKPCSCSKVDVNYAFLHATDLLPACDGERPTL-AFLQDVMNILLQYVV
                                     .. ::.  :.  .. :.:. :...... ..
NP_001                            MADSEALPSLAGDPVAVEALLRAVFGVVVDEAI
                                          10        20        30   

            130       140       150       160       170       180  
pF1KB9 -KSFDRSTKVIDFHYPNELLQEYNWELADQPQNLEEILMHCQTTLKYAIKTGHPRYFNQL
        :. . : :: ... :.:: :  . :: .: .. ..:: .:.....:..::::::.::::
NP_001 QKGTSVSQKVCEWKEPEELKQLLDLELRSQGESQKQILERCRAVIRYSVKTGHPRFFNQL
            40        50        60        70        80        90   

            190       200       210       220       230       240  
pF1KB9 STGLDMVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMREIIGWPGGSGDGIFSPG
        .:::  .::.  .: . ::...::::::::::.:  .:.:.: ..::  .:::::: ::
NP_001 FSGLDPHALAGRIITESLNTSQYTYEIAPVFVLMEEEVLRKLRALVGW--SSGDGIFCPG
           100       110       120       130       140         150 

            250       260       270       280       290       300  
pF1KB9 GAISNMYAMMIARFKMFPEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLKKGAAALGIGTDSVILI
       :.::::::. .::.. .:. :..:. .:: :  :::.. :.:..:::: ::.::::: ..
NP_001 GSISNMYAVNLARYQRYPDCKQRGLRTLPPLALFTSKECHYSIQKGAAFLGLGTDSVRVV
             160       170       180       190       200       210 

            310       320       330       340       350       360  
pF1KB9 KCDERGKMIPSDLERRILEAKQKGFVPFLVSATAGTTVYGAFDPLLAVADICKKYKIWMH
       : ::::::.: ::::.:  :. .: ::::::::.:::: :::::: :.::.:... .:.:
NP_001 KADERGKMVPEDLERQIGMAEAEGAVPFLVSATSGTTVLGAFDPLEAIADVCQRHGLWLH
             220       230       240       250       260       270 

            370       380       390       400       410        420 
pF1KB9 VDAAWGGGLLMSRKHKWKLSGVERANSVTWNPHKMMGVPLQCSALLVREEG-LMQNCNQM
       :::::::..:.:. :.  :.:..::.::.:::::.... :::::::... . :.. :.  
NP_001 VDAAWGGSVLLSQTHRHLLDGIQRADSVAWNPHKLLAAGLQCSALLLQDTSNLLKRCHGS
             280       290       300       310       320       330 

             430       440       450       460       470       480 
pF1KB9 HASYLFQQDKHYDLSYDTGDKALQCGRHVDVFKLWLMWRAKGTTGFEAHVDKCLELAEYL
       .::::::::: ::.. :::::..::::.:: .::::::.:.:  :.: ..:. . ::.::
NP_001 QASYLFQQDKFYDVALDTGDKVVQCGRRVDCLKLWLMWKAQGDQGLERRIDQAFVLARYL
             340       350       360       370       380       390 

             490       500       510       520       530       540 
pF1KB9 YNIIKNREGYEMVFDGKPQHTNVCFWYIPPSLRTLEDNEERMSRLSKVAPVIKARMMEYG
        . .:.:::.:.:..  :. .:::::..:::::  ... .   ::::::::.: ::.. :
NP_001 VEEMKKREGFELVME--PEFVNVCFWFVPPSLRGKQESPDYHERLSKVAPVLKERMVKEG
             400         410       420       430       440         

             550       560       570       580     
pF1KB9 TTMVSYQPLGDKVNFFRMVISNPAATHQDIDFLIEEIERLGQDL
       . :..::: : . ::::.:..: : :  :.:::..:.:::::::
NP_001 SMMIGYQPHGTRGNFFRVVVANSALTCADMDFLLNELERLGQDL
     450       460       470       480       490   

>>XP_016861786 (OMIM: 615601) PREDICTED: acidic amino ac  (502 aa)
 initn: 1371 init1: 770 opt: 1719  Z-score: 2067.8  bits: 392.4 E(85289): 1.9e-108
Smith-Waterman score: 1719; 49.1% identity (81.4% similar) in 489 aa overlap (99-585:19-502)

       70        80        90       100       110       120        
pF1KB9 RKAACACDQKPCSCSKVDVNYAFLHATDLLPACDGERPTLAFLQDVMNILLQYVV-KSFD
                                     :. :. .    :....  .... :: :. :
XP_016             MIPSKKNAVLVDGVVLNGPTTDA-KAGEKFVEEACRLIMEEVVLKATD
                           10        20         30        40       

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB9 RSTKVIDFHYPNELLQEYNWELADQPQNLEEILMHCQTTLKYAIKTGHPRYFNQLSTGLD
        . :: ... :..: :  . :. :. .  ...:  :. ...:..::.:::.:::: .:::
XP_016 VNEKVCEWRPPEQLKQLLDLEMRDSGEPPHKLLELCRDVIHYSVKTNHPRFFNQLYAGLD
        50        60        70        80        90       100       

       190       200       210       220       230       240       
pF1KB9 MVGLAADWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLLEYVTLKKMREIIGWPGGSGDGIFSPGGAISN
       . .:.: ..: . : ...:::..:::.:.: ..:::: :.:::    :::::.:::..::
XP_016 YYSLVARFMTEALNPSVYTYEVSPVFLLVEEAVLKKMIEFIGWK--EGDGIFNPGGSVSN
       110       120       130       140       150         160     

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB9 MYAMMIARFKMFPEVKEKGMAALPRLIAFTSEHSHFSLKKGAAALGIGTDSVILIKCDER
       :::: .::.:. :..::::... :::: ::: . :.:.::.:. :::::..: ... : :
XP_016 MYAMNLARYKYCPDIKEKGLSGSPRLILFTSAECHYSMKKAASFLGIGTENVCFVETDGR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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