Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0013
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0013, 723 aa
1>>>pF1KE0013 723 - 723 aa - 723 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2386+/-0.00123; mu= 20.1647+/- 0.074
mean_var=63.0153+/-13.205, 0's: 0 Z-trim(100.2): 29 B-trim: 297 in 1/46
Lambda= 0.161567
statistics sampled from 6021 (6029) to 6021 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.525), E-opt: 0.2 (0.185), width: 16
Scan time: 3.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34924.1 DPY19L4 gene_id:286148|Hs108|chr8 ( 723) 4772 1121.8 0
CCDS12422.1 DPY19L3 gene_id:147991|Hs108|chr19 ( 716) 2011 478.3 1.8e-134
CCDS43567.1 DPY19L1 gene_id:23333|Hs108|chr7 ( 675) 326 85.5 2.9e-16
CCDS31851.1 DPY19L2 gene_id:283417|Hs108|chr12 ( 758) 301 79.7 1.8e-14
>>CCDS34924.1 DPY19L4 gene_id:286148|Hs108|chr8 (723 aa)
initn: 4772 init1: 4772 opt: 4772 Z-score: 6005.7 bits: 1121.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4772; 99.9% identity (100.0% similar) in 723 aa overlap (1-723:1-723)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADEEGPPVELRQRKKPKSSENKESAKEEKISDIPIPERAPKHVLFQRFAKIFIGCLAAV
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CCDS34 MAEEEGPPVELRQRKKPKSSENKESAKEEKISDIPIPERAPKHVLFQRFAKIFIGCLAAV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 TSGMMYALYLSAYHERKFWFSNRQELEREITFQGDSAIYYSYYKDMLKAPSFERGVYELT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TSGMMYALYLSAYHERKFWFSNRQELEREITFQGDSAIYYSYYKDMLKAPSFERGVYELT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HNNKTVSLKTINAVQQMSLYPELIASILYQATGSNEIIEPVYFYIGIVFGLQGIYVTALF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HNNKTVSLKTINAVQQMSLYPELIASILYQATGSNEIIEPVYFYIGIVFGLQGIYVTALF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VTSWLMSGTWLAGMLTVAWFVINRVDTTRIEYSIPLRENWALPYFACQIAALTGYLKSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VTSWLMSGTWLAGMLTVAWFVINRVDTTRIEYSIPLRENWALPYFACQIAALTGYLKSNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NTYGERFCYLLMSASTYTFMMMWEYSHYLLFLQAISLFLLDTFSVEQSDKVYEVYKIYIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NTYGERFCYLLMSASTYTFMMMWEYSHYLLFLQAISLFLLDTFSVEQSDKVYEVYKIYIF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 SLFLGYLLQFENPALLVSPLLSLVAALMLAKCLQLNVKKGSFVAKIIKVINFYLVCTLTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SLFLGYLLQFENPALLVSPLLSLVAALMLAKCLQLNVKKGSFVAKIIKVINFYLVCTLTI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 TLNIIMKMFVPHKENGHMLKFLEVKFGLNMTKNFTMNWLLCQESLQAPSQDFFLRLTQSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TLNIIMKMFVPHKENGHMLKFLEVKFGLNMTKNFTMNWLLCQESLQAPSQDFFLRLTQSS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 LLPFYILVLIICFLSMLQVIFRRINGKSLKETVTLEDGRIGERPEIIYHVIHTILLGSLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLPFYILVLIICFLSMLQVIFRRINGKSLKETVTLEDGRIGERPEIIYHVIHTILLGSLA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 MVIEGLKYIWIPYVCMLAAFGVCSPELWMTLFKWLRLRTVHPILLALILSMAVPTIIGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MVIEGLKYIWIPYVCMLAAFGVCSPELWMTLFKWLRLRTVHPILLALILSMAVPTIIGLS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 LWKEFFPRLMTELMELQEFYDPDTVELMTWIKRQAPVAAVFAGSPQLMGAIKLCTGWMVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LWKEFFPRLMTELMELQEFYDPDTVELMTWIKRQAPVAAVFAGSPQLMGAIKLCTGWMVT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 SLPLYNDDDLLKRNENIYQIYSKRSAEDIYKILTSYKANYLIVEDAICNEVGPMRGCRVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SLPLYNDDDLLKRNENIYQIYSKRSAEDIYKILTSYKANYLIVEDAICNEVGPMRGCRVK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 DLLDIANGHMVCEEGDKLTYSKYGRFCHEVKINYSPYVNYFTRVYWNRSYFVYKINTVIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DLLDIANGHMVCEEGDKLTYSKYGRFCHEVKINYSPYVNYFTRVYWNRSYFVYKINTVIS
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 FQS
:::
CCDS34 FQS
>>CCDS12422.1 DPY19L3 gene_id:147991|Hs108|chr19 (716 aa)
initn: 1812 init1: 958 opt: 2011 Z-score: 2527.7 bits: 478.3 E(32554): 1.8e-134
Smith-Waterman score: 2011; 43.4% identity (73.9% similar) in 716 aa overlap (11-716:4-713)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MADEEGPPVELRQRKKPKSSENKES--AKEEKISDIPIPERAPKHVLFQRFAKIF---IG
.:::.. ...: .:. :.:: .. . .. :. .:. ::. ::
CCDS12 MMSIRQRREIRATEVSEDFPAQEE---NVKLENKLPSGCTSRRLWKILSLTIG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 CLAAVTSGMMYALYLSAYHERKFWFSNRQELEREITFQGDSAIYYSYYKDMLKAPSFERG
:. :.. ..::.. :: .:::: .:.::::.:. . ..::::::.::.::.. .:
CCDS12 GTIALCIGLLTSVYLATLHENDLWFSNIKEVEREISFRTECGLYYSYYKQMLQAPTLVQG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 VYELTHNNKTVSLKTINAVQQMSLYPELIASILYQATGSNEIIEPVYFYIGIVFGLQGIY
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CCDS12 FHGLIYDNKTESMKTINLLQRMNIYQEVFLSILYRVLPIQKYLEPVYFYIYTLFGLQAIY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VTALFVTSWLMSGTWLAGMLTVAWFVINRVDTTRIEYSIPLRENWALPYFACQIAALTGY
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CCDS12 VTALYITSWLLSGTWLSGLLAAFWYVTNRIDTTRVEFTIPLRENWALPFFAIQIAAITYF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LKSNLNTYGERFCYLLMSASTYTFMMMWEYSHYLLFLQAISLFLLDTFSVEQSDKVYEVY
:. ::. .::. : . ::. : . :.........::. :: ::.... . :. .:
CCDS12 LRPNLQPLSERLTLLAIFISTFLFSLTWQFNQFMMLMQALVLFTLDSLDMLPAVKATWLY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 KIYIFSLFLGYLLQFENPALLVSPLLSLVAALMLAKCLQLNVKKGSFVAKIIKVI-NFYL
: : ::.: .::: : .: : :.:. ....:. :: :.: :::. .. :.. ....
CCDS12 GIQITSLLLVCILQFFNSMILGSLLISFNLSVFIARKLQKNLKTGSFLNRLGKLLLHLFM
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 VCTLTITLNIIMKMFVPHKENGHMLKFLEVKFGLNMTKNFTMNWLLCQESLQAPSQDFFL
: ::. :: :.: .. : . :..:::..::::. :..: : ::.:.. . :
CCDS12 VLCLTLFLNNIIKKILNLKSDEHIFKFLKAKFGLGATRDFDANLYLCEEAFGLLPFNTFG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 RLTQSSLLPFYILVLIICFLSMLQVIFRRINGKSLKETV-TLEDGRIGERPEIIYHVIHT
::... :. ::.:: : . . : :. .. .. ...: .: : . .:: :..:::
CCDS12 RLSDTLLFYAYIFVLSITVIVAFVVAFHNLSDSTNQQSVGKMEKGTVDLKPETAYNLIHT
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 ILLGSLAMVIEGLKYIWIPYVCMLAAFGVCSPELWMTLFKWLRLRTVHPILLALILSMAV
::.: ::. .::.: ..:..:.::.::::.: :.: ..: . . : :. ..:
CCDS12 ILFGFLALSTMRMKYLWTSHMCVFASFGLCSPEIWELLLKSVHLYNPKRIC---IMRYSV
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 PTIIGLSLWKEFFPRLMTELMELQEFYDPDTVELMTWIKRQAPVAAVFAGSPQLMGAIKL
: .: : : .:.: .: :: ::.:::::::::::.::. ..: :::::: ::....::
CCDS12 PILILLYLCYKFWPGMMDELSELREFYDPDTVELMNWINSNTPRKAVFAGSMQLLAGVKL
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 CTGWMVTSLPLYNDDDLLKRNENIYQIYSKRSAEDIYKILTSYKANYLIVEDAICNEVGP
::: .:. : :.:..: .:.. .::::.::. :... .: :. ..:.:.::.:: :
CCDS12 CTGRTLTNHPHYEDSSLRERTRAVYQIYAKRAPEEVHALLRSFGTDYVILEDSICYERRH
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 MRGCRVKDLLDIANGHMVCEEGDK---LTYSKYGRFCHEVKINYSPYVNYFTRVYWNRSY
::::..::::::::::. :.. : . . :::.:.: : ::: :::::. :...
CCDS12 RRGCRLRDLLDIANGHMMDGPGENDPDLKPADHPRFCEEIKRNLPPYVAYFTRVFQNKTF
650 660 670 680 690 700
720
pF1KE0 FVYKINTVISFQS
:::..
CCDS12 HVYKLSRNK
710
>>CCDS43567.1 DPY19L1 gene_id:23333|Hs108|chr7 (675 aa)
initn: 555 init1: 199 opt: 326 Z-score: 405.4 bits: 85.5 E(32554): 2.9e-16
Smith-Waterman score: 742; 25.9% identity (57.5% similar) in 717 aa overlap (35-715:5-672)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 EGPPVELRQRKKPKSSENKESAKEEKISDIPIPE-RAPKHVLFQRFAKIFIGCLAAVTSG
: :: : : . : .. : :: ..
CCDS43 MEGRPPPEGRPPPR---PRTGRAPRGRRRAVFAA
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 MMYALYLSAYHERKFWFSNRQELEREITFQGDSAIYYSYYKDMLKAPSFERGVYELTHNN
... ... : ::. . ::::..:. . ..::::.: ...:::: ::. . ...
CCDS43 VLHWSHITHLFENDRHFSHLSTLEREMAFRTEMGLYYSYFKTIVEAPSFLNGVWMIMNDK
40 50 60 70 80 90
130 140 150
pF1KE0 KTVSLKTINAVQQMSLYPELIASILYQA-TGSNEII------------------------
: .::......::::.: . :. : ..:
CCDS43 LTEYPLVINTLKRFNLYPEVILASWYRIYTKIMDLIGIQTKICWTVTRGEGLSPIESCEG
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 --EPVYFYIGIVFGLQGIYVTALFVTSWLMSGTWLAGMLTVAWFVINRVDTTRIEYSIPL
.:. ::....: :.:.... .:. . .::. :.:..:: : .:. . ::. .. ::
CCDS43 LGDPACFYVAVIFILNGLMMALFFIYGTYLSGSRLGGLVTVLCFFFNHGECTRVMWTPPL
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 RENWALPYFACQIAALTGYLKSNLNTYGERFCYLLMSASTYTFMMMWEYSHYLLFLQAIS
::... :... :. .: :... . : : . . :. ::. :......:. : :
CCDS43 RESFSYPFLVLQMLLVTHILRAT-KLY--RGSLIALCISNVFFMLPWQFAQFVLLTQIAS
220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 LFLLDTFSVEQSDKVYEVYKIYIFSLFLGYLLQFENPALLVSPLLSLVAAL-----MLAK
:: . . . . :. .. :...:: : ..:.: : ::.: : .. . : .
CCDS43 LFAVYVVGYIDICKLRKIIYIHMISLALCFVLMFGNSMLLTSYYASSLVIIWGILAMKPH
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 CLQLNVKKGSFVAKIIKVINFYLVCTLTITLNIIMKMFVPHKENGHMLKFLEVKFGLNMT
:..::.. :. .:. :.: : . :. . . . ...:. ..: ::
CCDS43 FLKINVSELSLW--VIQGC-FWLFGT--VILKYLTSKIFGIADDAHIGNLLTSKFF--SY
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 KNFTMNWLLCQESLQAPSQDFFLRLTQSSLLPFYILVLIICFLSMLQVIFRRINGKSLKE
:.: : .. .. :: :.. ::: :... :..... :. . : :.
CCDS43 KDFDTLLYTCAAEFDFMEKETPLRYTKTLLLP----VVLVVFVAIVRKIISDMWGVLAKQ
390 400 410 420 430
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 TVTLEDGRIGERPEIIYHVIHTILLGSLAMVIEGLKYIWIPYVCMLAAFGVCSPELWMTL
. .. .. .. :..::... . .:...: :: . :..:..:.. .:: . :
CCDS43 QTHVRKHQF-DHGELVYHALQLLAYTALGILIMRLKLFLTPHMCVMASL-ICSRQ----L
440 450 460 470 480 490
520 530 540 550 560
pF1KE0 FKWLRLRTVHP--ILLALILSMAVPTIIGLSLWKEFFPRLMTELMELQEFYDPDTVELMT
: :: . ::: :..:.. .:.. : . :.:. . :: . ::.
CCDS43 FGWLFCK-VHPGAIVFAILAAMSIQ---GSA-------NLQTQWNIVGEFSNLPQEELIE
500 510 520 530 540
570 580 590 600 610 620
pF1KE0 WIKRQAPVAAVFAGSPQLMGAIKLCTGWMVTSLPLYNDDDLLKRNENIYQIYSKRSAEDI
::: .. :::::. :...:: . ... : :.: : :.. .:..::...::..
CCDS43 WIKYSTKPDAVFAGAMPTMASVKLSALRPIVNHPHYEDAGLRARTKIVYSMYSRKAAEEV
550 560 570 580 590 600
630 640 650 660 670 680
pF1KE0 YKILTSYKANYLIVEDAIC-NEVGPMRGCRVKDLLDIANGHMVCEEGDKLTYSKYGRFCH
. : . :.:: :.:.. : . : :: . .. :. : . .: .:.
CCDS43 KRELIKLKVNYYILEESWCVRRSKP--GCSMPEIWDVE---------DPANAGKTP-LCN
610 620 630 640
690 700 710 720
pF1KE0 EVKINYSPYVNYFTRVYWNRSYFVYKINTVISFQS
. . .: .:: :. : : : ..
CCDS43 LLVKDSKP---HFTTVFQNSVYKVLEVVKE
650 660 670
>>CCDS31851.1 DPY19L2 gene_id:283417|Hs108|chr12 (758 aa)
initn: 668 init1: 206 opt: 301 Z-score: 373.2 bits: 79.7 E(32554): 1.8e-14
Smith-Waterman score: 779; 26.5% identity (57.4% similar) in 697 aa overlap (59-716:113-758)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 EKISDIPIPERAPKHVLFQRFAKIFIGCLAAVTSGMMYALYLSAYHERKFWFSNRQELER
:: .... :.: . : ::. . :::
CCDS31 QFVRNSLAQLREKVQELQARRFSSRTTLGIAVFVAILHWLHLVTLFENDRHFSHLSSLER
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 EITFQGDSAIYYSYYKDMLKAPSFERGVYELTHNNKTVSLKTINAVQQMSLYPELIASIL
:.::. . ..::::.: ...:::: .:.. . .. : :::.... ::::.: .
CCDS31 EMTFRTEMGLYYSYFKTIIEAPSFLEGLWMIMNDRLTEYPLIINAIKRFHLYPEVIIASW
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180
pF1KE0 Y---------------------QATGSNEII------EPVYFYIGIVFGLQGIYVTALFV
: . ::. .:. ::.:..: :.:... .:.
CCDS31 YCTFMGIMNLFGLETKTCWNVTRIEPLNEVQSCEGLGDPACFYVGVIFILNGLMMGLFFM
210 220 230 240 250 260
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TSWLMSGTWLAGMLTVAWFVINRVDTTRIEYSIPLRENWALPYFACQIAALTGYLKSNLN
. .::: :.:..:: : .:. ..::. .. ::::... :... :. :: :... :
CCDS31 YGAYLSGTQLGGLITVLCFFFNHGEATRVMWTPPLRESFSYPFLVLQMCILTLILRTSSN
270 280 290 300 310 320
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TYGERFCYLLMSASTYTFMMMWEYSHYLLFLQAISLFLLDTFSVEQSDKVYEVYKIYIFS
.: .. . :. .::. :......:: : ::: . . . . .: .. . ..:
CCDS31 ---DRRPFIALCLSNVAFMLPWQFAQFILFTQIASLFPMYVVGYIEPSKFQKIIYMNMIS
330 340 350 360 370
310 320 330 340 350
pF1KE0 LFLGYLLQFENPALLVSPLLSLVAALMLAKCLQLNVKKGSFVAKI-IKVINFYLV-----
. :...:.: : : : : .:... . : : . . :. .. .::.:.
CCDS31 VTLSFILMFGNSMYLSSYYSS---SLLMTWAIIL---KRNEIQKLGVSKLNFWLIQGSAW
380 390 400 410 420 430
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 -CTLTITLNIIMKMFVPHKENGHMLKFLEVKFGLNMTKNFTMNWLLCQESLQAPSQDFF-
: :: :... . .. ... .. .. ... : .: .: : :: ::.
CCDS31 WCG-TIILKFLTSKILGVSDHIRLSDLIAARI-LRYT-DFDTLIYTC-----APEFDFME
440 450 460 470 480
420 430 440 450 460
pF1KE0 ----LRLTQSSLLPFYILVLIICFLSMLQVIFRRINGKSLKETVTLEDGRIGERPEIIYH
:: :.. ::: ....: :: ... : :. : .. :. .. :. :. .:
CCDS31 KATPLRYTKTLLLP--VVMVITCF--IFKKTVRDIS-YVLATNIYLRK-QLLEHSELAFH
490 500 510 520 530
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 VIHTILLGSLAMVIEGLKYIWIPYVCMLAAFGVCSPELWMTLFKWLRLRTVHPILLALIL
... ... .::..: ::.. :..:..:.. .:: .:. ::. .:.. : .....
CCDS31 TLQLLVFTALAILIMRLKMFLTPHMCVMASL-ICSRQLFGWLFRRVRFEKV---IFGILT
540 550 560 570 580 590
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 SMAVPTIIGLSLWKEFFPRLMTELMELQEFYDPDTVELMTWIKRQAPVAAVFAGSPQLMG
:.. . . : .. . :: . ::. ::: .. :::::. :.
CCDS31 VMSI----------QGYANLRNQWSIIGEFNNLPQEELLQWIKYSTTSDAVFAGAMPTMA
600 610 620 630 640
590 600 610 620 630 640
pF1KE0 AIKLCTGWMVTSLPLYNDDDLLKRNENIYQIYSKRSAEDIYKILTSYKANYLIVEDAICN
.::: : ... : :.: :: :.. .:. ::..::... : ..:: ..:.: :
CCDS31 SIKLSTLHPIVNHPHYEDADLRARTKIVYSTYSRKSAKEVRDKLLELHVNYYVLEEAWCV
650 660 670 680 690 700
650 660 670 680 690 700
pF1KE0 EVGPMRGCRVKDLLDIANGHMVCEEGDKLTYSKYGRFCHEVKINYSPYVNYFTRVYWNRS
: :: . .. :. . . . .: . . :: :: :. :
CCDS31 -VRTKPGCSMLEIWDVEDPSNAANPP----------LCSVLLEDARPY---FTTVFQNSV
710 720 730 740 750
710 720
pF1KE0 YFVYKINTVISFQS
: : :.:
CCDS31 YRVLKVN
723 residues in 1 query sequences
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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