Result of FASTA (ccds) for pF1KE0016
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0016, 741 aa
  1>>>pF1KE0016 741 - 741 aa - 741 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1076+/-0.00121; mu= 15.1515+/- 0.072
 mean_var=76.0821+/-15.581, 0's: 0 Z-trim(101.9): 79  B-trim: 0 in 0/48
 Lambda= 0.147039
 statistics sampled from 6624 (6701) to 6624 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.552), E-opt: 0.2 (0.206), width:  16
 Scan time:  3.220

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS41904.1 TMTC4 gene_id:84899|Hs108|chr13        ( 741) 4938 1057.9       0
CCDS9497.2 TMTC4 gene_id:84899|Hs108|chr13         ( 760) 4938 1057.9       0
CCDS66575.1 TMTC4 gene_id:84899|Hs108|chr13        ( 630) 3824 821.6       0
CCDS53772.1 TMTC1 gene_id:83857|Hs108|chr12        ( 882) 1145 253.3 1.2e-66
CCDS8718.1 TMTC1 gene_id:83857|Hs108|chr12         ( 774) 1059 235.1 3.2e-61
CCDS9032.1 TMTC3 gene_id:160418|Hs108|chr12        ( 914)  928 207.3 8.7e-53
CCDS35502.1 OGT gene_id:8473|Hs108|chrX            (1036)  378 90.6 1.3e-17
CCDS14414.1 OGT gene_id:8473|Hs108|chrX            (1046)  378 90.6 1.3e-17
CCDS81717.1 TMTC2 gene_id:160335|Hs108|chr12       ( 637)  307 75.5 2.9e-13
CCDS9025.1 TMTC2 gene_id:160335|Hs108|chr12        ( 836)  307 75.5 3.7e-13


>>CCDS41904.1 TMTC4 gene_id:84899|Hs108|chr13             (741 aa)
 initn: 4938 init1: 4938 opt: 4938  Z-score: 5659.9  bits: 1057.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4938; 100.0% identity (100.0% similar) in 741 aa overlap (1-741:1-741)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAVLDTDLDHILPSSVLPPFWAKLVVGSVAIVCFARSYDGDFVFDDSEAIVNNKDLQAET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MAVLDTDLDHILPSSVLPPFWAKLVVGSVAIVCFARSYDGDFVFDDSEAIVNNKDLQAET
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 PLGDLWHHDFWGSRLSSNTSHKSYRPLTVLTFRINYYLSGGFHPVGFHVVNILLHSGISV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PLGDLWHHDFWGSRLSSNTSHKSYRPLTVLTFRINYYLSGGFHPVGFHVVNILLHSGISV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LMVDVFSVLFGGLQYTSKGRRLHLAPRASLLAALLFAVHPVHTECVAGVVGRADLLCALF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LMVDVFSVLFGGLQYTSKGRRLHLAPRASLLAALLFAVHPVHTECVAGVVGRADLLCALF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 FLLSFLGYCKAFRESNKEGAHSSTFWVLLSIFLGAVAMLCKEQGITVLGLNAVFDILVIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FLLSFLGYCKAFRESNKEGAHSSTFWVLLSIFLGAVAMLCKEQGITVLGLNAVFDILVIG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 KFNVLEIVQKVLHKDKSLENLGMLRNGGLLFRMTLLTSGGAGMLYVRWRIMGTGPPAFTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KFNVLEIVQKVLHKDKSLENLGMLRNGGLLFRMTLLTSGGAGMLYVRWRIMGTGPPAFTE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 VDNPASFADSMLVRAVNYNYYYSLNAWLLLCPWWLCFDWSMGCIPLIKSISDWRVIALAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VDNPASFADSMLVRAVNYNYYYSLNAWLLLCPWWLCFDWSMGCIPLIKSISDWRVIALAA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 LWFCLIGLICQALCSEDGHKRRILTLGLGFLVIPFLPASNLFFRVGFVVAERVLYLPSVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LWFCLIGLICQALCSEDGHKRRILTLGLGFLVIPFLPASNLFFRVGFVVAERVLYLPSVG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 YCVLLTFGFGALSKHTKKKKLIAAVVLGILFINTLRCVLRSGEWRSEEQLFRSALSVCPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YCVLLTFGFGALSKHTKKKKLIAAVVLGILFINTLRCVLRSGEWRSEEQLFRSALSVCPL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 NAKVHYNIGKNLADKGNQTAAIRYYREAVRLNPKYVHAMNNLGNILKERNELQEAEELLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NAKVHYNIGKNLADKGNQTAAIRYYREAVRLNPKYVHAMNNLGNILKERNELQEAEELLS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 LAVQIQPDFAAAWMNLGIVQNSLKRFEAAEQSYRTAIKHRRKYPDCYYNLGRLYADLNRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LAVQIQPDFAAAWMNLGIVQNSLKRFEAAEQSYRTAIKHRRKYPDCYYNLGRLYADLNRH
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE0 VDALNAWRNATVLKPEHSLAWNNMIILLDNTGNLAQAEAVGREALELIPNDHSLMFSLAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VDALNAWRNATVLKPEHSLAWNNMIILLDNTGNLAQAEAVGREALELIPNDHSLMFSLAN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE0 VLGKSQKYKESEALFLKAIKANPNAASYHGNLAVLYHRWGHLDLAKKHYEISLQLDPTAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VLGKSQKYKESEALFLKAIKANPNAASYHGNLAVLYHRWGHLDLAKKHYEISLQLDPTAS
              670       680       690       700       710       720

              730       740 
pF1KE0 GTKENYGLLRRKLELMQKKAV
       :::::::::::::::::::::
CCDS41 GTKENYGLLRRKLELMQKKAV
              730       740 

>>CCDS9497.2 TMTC4 gene_id:84899|Hs108|chr13              (760 aa)
 initn: 4938 init1: 4938 opt: 4938  Z-score: 5659.7  bits: 1057.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4938; 100.0% identity (100.0% similar) in 741 aa overlap (1-741:20-760)

                                  10        20        30        40 
pF1KE0                    MAVLDTDLDHILPSSVLPPFWAKLVVGSVAIVCFARSYDGD
                          :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MIPNQHNAGAGSHQPAVFRMAVLDTDLDHILPSSVLPPFWAKLVVGSVAIVCFARSYDGD
               10        20        30        40        50        60

              50        60        70        80        90       100 
pF1KE0 FVFDDSEAIVNNKDLQAETPLGDLWHHDFWGSRLSSNTSHKSYRPLTVLTFRINYYLSGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 FVFDDSEAIVNNKDLQAETPLGDLWHHDFWGSRLSSNTSHKSYRPLTVLTFRINYYLSGG
               70        80        90       100       110       120

             110       120       130       140       150       160 
pF1KE0 FHPVGFHVVNILLHSGISVLMVDVFSVLFGGLQYTSKGRRLHLAPRASLLAALLFAVHPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 FHPVGFHVVNILLHSGISVLMVDVFSVLFGGLQYTSKGRRLHLAPRASLLAALLFAVHPV
              130       140       150       160       170       180

             170       180       190       200       210       220 
pF1KE0 HTECVAGVVGRADLLCALFFLLSFLGYCKAFRESNKEGAHSSTFWVLLSIFLGAVAMLCK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 HTECVAGVVGRADLLCALFFLLSFLGYCKAFRESNKEGAHSSTFWVLLSIFLGAVAMLCK
              190       200       210       220       230       240

             230       240       250       260       270       280 
pF1KE0 EQGITVLGLNAVFDILVIGKFNVLEIVQKVLHKDKSLENLGMLRNGGLLFRMTLLTSGGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 EQGITVLGLNAVFDILVIGKFNVLEIVQKVLHKDKSLENLGMLRNGGLLFRMTLLTSGGA
              250       260       270       280       290       300

             290       300       310       320       330       340 
pF1KE0 GMLYVRWRIMGTGPPAFTEVDNPASFADSMLVRAVNYNYYYSLNAWLLLCPWWLCFDWSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 GMLYVRWRIMGTGPPAFTEVDNPASFADSMLVRAVNYNYYYSLNAWLLLCPWWLCFDWSM
              310       320       330       340       350       360

             350       360       370       380       390       400 
pF1KE0 GCIPLIKSISDWRVIALAALWFCLIGLICQALCSEDGHKRRILTLGLGFLVIPFLPASNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 GCIPLIKSISDWRVIALAALWFCLIGLICQALCSEDGHKRRILTLGLGFLVIPFLPASNL
              370       380       390       400       410       420

             410       420       430       440       450       460 
pF1KE0 FFRVGFVVAERVLYLPSVGYCVLLTFGFGALSKHTKKKKLIAAVVLGILFINTLRCVLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 FFRVGFVVAERVLYLPSVGYCVLLTFGFGALSKHTKKKKLIAAVVLGILFINTLRCVLRS
              430       440       450       460       470       480

             470       480       490       500       510       520 
pF1KE0 GEWRSEEQLFRSALSVCPLNAKVHYNIGKNLADKGNQTAAIRYYREAVRLNPKYVHAMNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 GEWRSEEQLFRSALSVCPLNAKVHYNIGKNLADKGNQTAAIRYYREAVRLNPKYVHAMNN
              490       500       510       520       530       540

             530       540       550       560       570       580 
pF1KE0 LGNILKERNELQEAEELLSLAVQIQPDFAAAWMNLGIVQNSLKRFEAAEQSYRTAIKHRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 LGNILKERNELQEAEELLSLAVQIQPDFAAAWMNLGIVQNSLKRFEAAEQSYRTAIKHRR
              550       560       570       580       590       600

             590       600       610       620       630       640 
pF1KE0 KYPDCYYNLGRLYADLNRHVDALNAWRNATVLKPEHSLAWNNMIILLDNTGNLAQAEAVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KYPDCYYNLGRLYADLNRHVDALNAWRNATVLKPEHSLAWNNMIILLDNTGNLAQAEAVG
              610       620       630       640       650       660

             650       660       670       680       690       700 
pF1KE0 REALELIPNDHSLMFSLANVLGKSQKYKESEALFLKAIKANPNAASYHGNLAVLYHRWGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 REALELIPNDHSLMFSLANVLGKSQKYKESEALFLKAIKANPNAASYHGNLAVLYHRWGH
              670       680       690       700       710       720

             710       720       730       740 
pF1KE0 LDLAKKHYEISLQLDPTASGTKENYGLLRRKLELMQKKAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 LDLAKKHYEISLQLDPTASGTKENYGLLRRKLELMQKKAV
              730       740       750       760

>>CCDS66575.1 TMTC4 gene_id:84899|Hs108|chr13             (630 aa)
 initn: 4171 init1: 3824 opt: 3824  Z-score: 4383.9  bits: 821.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3953; 85.0% identity (85.0% similar) in 741 aa overlap (1-741:1-630)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAVLDTDLDHILPSSVLPPFWAKLVVGSVAIVCFARSYDGDFVFDDSEAIVNNKDLQAET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::      
CCDS66 MAVLDTDLDHILPSSVLPPFWAKLVVGSVAIVCFARSYDGDFVFDDSEAIVNNK------
               10        20        30        40        50          

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 PLGDLWHHDFWGSRLSSNTSHKSYRPLTVLTFRINYYLSGGFHPVGFHVVNILLHSGISV
                                                                   
CCDS66 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LMVDVFSVLFGGLQYTSKGRRLHLAPRASLLAALLFAVHPVHTECVAGVVGRADLLCALF
                                                    :::::::::::::::
CCDS66 ---------------------------------------------VAGVVGRADLLCALF
                                                        60         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 FLLSFLGYCKAFRESNKEGAHSSTFWVLLSIFLGAVAMLCKEQGITVLGLNAVFDILVIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 FLLSFLGYCKAFRESNKEGAHSSTFWVLLSIFLGAVAMLCKEQGITVLGLNAVFDILVIG
      70        80        90       100       110       120         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 KFNVLEIVQKVLHKDKSLENLGMLRNGGLLFRMTLLTSGGAGMLYVRWRIMGTGPPAFTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KFNVLEIVQKVLHKDKSLENLGMLRNGGLLFRMTLLTSGGAGMLYVRWRIMGTGPPAFTE
     130       140       150       160       170       180         

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 VDNPASFADSMLVRAVNYNYYYSLNAWLLLCPWWLCFDWSMGCIPLIKSISDWRVIALAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VDNPASFADSMLVRAVNYNYYYSLNAWLLLCPWWLCFDWSMGCIPLIKSISDWRVIALAA
     190       200       210       220       230       240         

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 LWFCLIGLICQALCSEDGHKRRILTLGLGFLVIPFLPASNLFFRVGFVVAERVLYLPSVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LWFCLIGLICQALCSEDGHKRRILTLGLGFLVIPFLPASNLFFRVGFVVAERVLYLPSVG
     250       260       270       280       290       300         

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 YCVLLTFGFGALSKHTKKKKLIAAVVLGILFINTLRCVLRSGEWRSEEQLFRSALSVCPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 YCVLLTFGFGALSKHTKKKKLIAAVVLGILFINTLRCVLRSGEWRSEEQLFRSALSVCPL
     310       320       330       340       350       360         

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 NAKVHYNIGKNLADKGNQTAAIRYYREAVRLNPKYVHAMNNLGNILKERNELQEAEELLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NAKVHYNIGKNLADKGNQTAAIRYYREAVRLNPKYVHAMNNLGNILKERNELQEAEELLS
     370       380       390       400       410       420         

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 LAVQIQPDFAAAWMNLGIVQNSLKRFEAAEQSYRTAIKHRRKYPDCYYNLGRLYADLNRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LAVQIQPDFAAAWMNLGIVQNSLKRFEAAEQSYRTAIKHRRKYPDCYYNLGRLYADLNRH
     430       440       450       460       470       480         

              610       620       630       640       650       660
pF1KE0 VDALNAWRNATVLKPEHSLAWNNMIILLDNTGNLAQAEAVGREALELIPNDHSLMFSLAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VDALNAWRNATVLKPEHSLAWNNMIILLDNTGNLAQAEAVGREALELIPNDHSLMFSLAN
     490       500       510       520       530       540         

              670       680       690       700       710       720
pF1KE0 VLGKSQKYKESEALFLKAIKANPNAASYHGNLAVLYHRWGHLDLAKKHYEISLQLDPTAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VLGKSQKYKESEALFLKAIKANPNAASYHGNLAVLYHRWGHLDLAKKHYEISLQLDPTAS
     550       560       570       580       590       600         

              730       740 
pF1KE0 GTKENYGLLRRKLELMQKKAV
       :::::::::::::::::::::
CCDS66 GTKENYGLLRRKLELMQKKAV
     610       620       630

>>CCDS53772.1 TMTC1 gene_id:83857|Hs108|chr12             (882 aa)
 initn: 1010 init1: 396 opt: 1145  Z-score: 1310.2  bits: 253.3 E(32554): 1.2e-66
Smith-Waterman score: 1318; 36.4% identity (63.8% similar) in 723 aa overlap (17-718:24-715)

                      10        20        30        40        50   
pF1KE0        MAVLDTDLDHILPSSVLPPFWAKLVVGSVAIVCFARSYDGDFVFDDSEAIVNN
                              : :  :  ...... .:..:: .:.:: ::  :::::
CCDS53 MVVTTSARGGGGDRTPSRRRGCGLAPAGAAALLAGASCLCYGRSLQGEFVHDDVWAIVNN
               10        20        30        40        50        60

            60         70        80        90       100       110  
pF1KE0 KDLQAETPLG-DLWHHDFWGSRLSSNTSHKSYRPLTVLTFRINYYLSGGFHPVGFHVVNI
        :..  .::   .. .::::. .. :::::::::: ::::..: .:.: ..:  ::.:::
CCDS53 PDVRPGAPLRWGIFTNDFWGKGMAENTSHKSYRPLCVLTFKLNIFLTG-MNPFYFHAVNI
               70        80        90       100        110         

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE0 LLHSGIS-VLMVDVFSVLFGGLQYTSKGRRLHLAPRASLLAALLFAVHPVHTECVAGVVG
       .::  .. :::    ...:       :.: :      ....::::::::.::: :::.::
CCDS53 ILHCLVTLVLMYTCDKTVF-------KNRGL------AFVTALLFAVHPIHTEAVAGIVG
     120       130              140             150       160      

             180       190       200          210       220        
pF1KE0 RADLLCALFFLLSFLGYCKAFRESNKEGAHSST---FWVLLSIFLGAVAMLCKEQGITVL
       :::.:  :.:::.::.: ... ..   :.  ::   :..:::.:::. ::: :: ::::.
CCDS53 RADVLACLLFLLAFLSYNRSLDQGCVGGSFPSTVSPFFLLLSLFLGTCAMLVKETGITVF
        170       180       190       200       210       220      

      230                240       250       260       270         
pF1KE0 GLNAVFDILVI---------GKFNVLEIVQKVLHKDKSLENLGMLRNGGLLFRMTLLTSG
       :.  :.:.. .         : .      :    . .:: .    .::    ..  .   
CCDS53 GVCLVYDLFSLSNKQDKSSNGALCPRSPQQPGSPQPSSLPGHPHRENG----KQQRFPHK
        230       240       250       260       270           280  

     280       290        300        310       320       330       
pF1KE0 GAGMLYVRWRIMGTG-PPAFTEVDNPAS-FADSMLVRAVNYNYYYSLNAWLLLCPWWLCF
       ::      :    .  ::       :.:  :   ..: ..:.:  ..:.:::: :  ::.
CCDS53 GA------WGGCHSPLPPEPKSSGFPVSPRAVWSMMRFLTYSYLLAFNVWLLLAPVTLCY
                  290       300       310       320       330      

       340       350         360       370       380       390     
pF1KE0 DWSMGCIPLIKSISDWRVIA--LAALWFCLIGLICQALCSEDGHKRRILTLGLGFLVIPF
       ::..: :::...: : : .:  . :. . :..: : :  ..  ::.  . .:: :::.::
CCDS53 DWQVGSIPLVETIWDMRNLATIFLAVVMALLSLHCLAAFKRLEHKE--VLVGLLFLVFPF
        340       350       360       370       380         390    

         400       410       420       430          440       450  
pF1KE0 LPASNLFFRVGFVVAERVLYLPSVGYCVLLTFGFGALSKHTKK---KKLIAAVVLGILFI
       .:::::::::::::::::::.::.:::.:.. :.. :    ..     ::...:: .:..
CCDS53 IPASNLFFRVGFVVAERVLYMPSMGYCILFVHGLSKLCTWLNRCGATTLIVSTVL-LLLL
          400       410       420       430       440        450   

            460       470       480       490       500       510  
pF1KE0 NTLRCVLRSGEWRSEEQLFRSALSVCPLNAKVHYNIGKNLADKGNQTAAIRYYREAVRLN
        . . : ..  : :.:.::::.... : ::::::: .. : :.: .  :: .:: :..: 
CCDS53 FSWKTVKQNEIWLSRESLFRSGVQTLPHNAKVHYNYANFLKDQGRNKEAIYHYRTALKLY
           460       470       480       490       500       510   

            520       530       540       550       560       570  
pF1KE0 PKYVHAMNNLGNILKERNELQEAEELLSLAVQIQPDFAAAWMNLGIVQNSLKRFEAAEQS
       :... :.::::.. ..  :   :.   . :.:..:.   : .::: . .: .. : :   
CCDS53 PRHASALNNLGTLTRDTAE---AKMYYQRALQLHPQHNRALFNLGNLLKSQEKKEEAITL
           520       530          540       550       560       570

            580       590       600       610       620       630  
pF1KE0 YRTAIKHRRKYPDCYYNLGRLYADLNRHVDALNAWRNATVLKPEHSLAWNNMIILLDNTG
        . .::.  .. : : .:. : :. .:  .: . ....    :. :   ::. ..: .::
CCDS53 LKDSIKYGPEFADAYSSLASLLAEQERFKEAEEIYQTGIKNCPDSSDLHNNYGVFLVDTG
              580       590       600       610       620       630

            640       650       660       670       680       690  
pF1KE0 NLAQAEAVGREALELIPNDHSLMFSLANVLGKSQKYKESEALFLKAIKANPNAASYHGNL
          .: :  ..:..: :. :  : .:. .  .  . . .:  . .:...  . :   . :
CCDS53 LPEKAVAHYQQAIKLSPSHHVAMVNLGRLYRSLGENSMAEEWYKRALQVA-HKAEILSPL
              640       650       660       670       680          

            700       710       720       730       740            
pF1KE0 AVLYHRWGHLDLAKKHYEISLQLDPTASGTKENYGLLRRKLELMQKKAV           
       ..::.  :. . : . :. .  :.:.                                  
CCDS53 GALYYNTGRYEEALQIYQEAAALQPSQRELRLALAQVLAVMGQTKEAEKMTNHIVSEETG
     690       700       710       720       730       740         

>>CCDS8718.1 TMTC1 gene_id:83857|Hs108|chr12              (774 aa)
 initn: 967 init1: 396 opt: 1059  Z-score: 1212.5  bits: 235.1 E(32554): 3.2e-61
Smith-Waterman score: 1063; 35.1% identity (62.3% similar) in 636 aa overlap (103-718:2-607)

             80        90       100       110        120       130 
pF1KE0 SRLSSNTSHKSYRPLTVLTFRINYYLSGGFHPVGFHVVNILLHSGIS-VLMVDVFSVLFG
                                     .:  ::.:::.::  .. :::    ...: 
CCDS87                              MNPFYFHAVNIILHCLVTLVLMYTCDKTVF-
                                            10        20        30 

             140       150       160       170       180       190 
pF1KE0 GLQYTSKGRRLHLAPRASLLAALLFAVHPVHTECVAGVVGRADLLCALFFLLSFLGYCKA
             :.: :      ....::::::::.::: :::.:::::.:  :.:::.::.: ..
CCDS87 ------KNRGL------AFVTALLFAVHPIHTEAVAGIVGRADVLACLLFLLAFLSYNRS
                           40        50        60        70        

             200          210       220       230                  
pF1KE0 FRESNKEGAHSST---FWVLLSIFLGAVAMLCKEQGITVLGLNAVFDILVI---------
       . ..   :.  ::   :..:::.:::. ::: :: ::::.:.  :.:.. .         
CCDS87 LDQGCVGGSFPSTVSPFFLLLSLFLGTCAMLVKETGITVFGVCLVYDLFSLSNKQDKSSN
       80        90       100       110       120       130        

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE0 GKFNVLEIVQKVLHKDKSLENLGMLRNGGLLFRMTLLTSGGAGMLYVRWRIMGTG-PPAF
       : .      :    . .:: .    .::    ..  .   ::      :    .  ::  
CCDS87 GALCPRSPQQPGSPQPSSLPGHPHRENG----KQQRFPHKGA------WGGCHSPLPPEP
      140       150       160           170             180        

      300        310       320       330       340       350       
pF1KE0 TEVDNPAS-FADSMLVRAVNYNYYYSLNAWLLLCPWWLCFDWSMGCIPLIKSISDWRVIA
            :.:  :   ..: ..:.:  ..:.:::: :  ::.::..: :::...: : : .:
CCDS87 KSSGFPVSPRAVWSMMRFLTYSYLLAFNVWLLLAPVTLCYDWQVGSIPLVETIWDMRNLA
      190       200       210       220       230       240        

         360       370       380       390       400       410     
pF1KE0 --LAALWFCLIGLICQALCSEDGHKRRILTLGLGFLVIPFLPASNLFFRVGFVVAERVLY
         . :. . :..: : :  ..  ::.  . .:: :::.::.:::::::::::::::::::
CCDS87 TIFLAVVMALLSLHCLAAFKRLEHKE--VLVGLLFLVFPFIPASNLFFRVGFVVAERVLY
      250       260       270         280       290       300      

         420       430          440       450       460       470  
pF1KE0 LPSVGYCVLLTFGFGALSKHTKK---KKLIAAVVLGILFINTLRCVLRSGEWRSEEQLFR
       .::.:::.:.. :.. :    ..     ::...:: .:.. . . : ..  : :.:.:::
CCDS87 MPSMGYCILFVHGLSKLCTWLNRCGATTLIVSTVL-LLLLFSWKTVKQNEIWLSRESLFR
        310       320       330       340        350       360     

            480       490       500       510       520       530  
pF1KE0 SALSVCPLNAKVHYNIGKNLADKGNQTAAIRYYREAVRLNPKYVHAMNNLGNILKERNEL
       :.... : ::::::: .. : :.: .  :: .:: :..: :... :.::::.. ..  : 
CCDS87 SGVQTLPHNAKVHYNYANFLKDQGRNKEAIYHYRTALKLYPRHASALNNLGTLTRDTAE-
         370       380       390       400       410       420     

            540       550       560       570       580       590  
pF1KE0 QEAEELLSLAVQIQPDFAAAWMNLGIVQNSLKRFEAAEQSYRTAIKHRRKYPDCYYNLGR
         :.   . :.:..:.   : .::: . .: .. : :    . .::.  .. : : .:. 
CCDS87 --AKMYYQRALQLHPQHNRALFNLGNLLKSQEKKEEAITLLKDSIKYGPEFADAYSSLAS
            430       440       450       460       470       480  

            600       610       620       630       640       650  
pF1KE0 LYADLNRHVDALNAWRNATVLKPEHSLAWNNMIILLDNTGNLAQAEAVGREALELIPNDH
       : :. .:  .: . ....    :. :   ::. ..: .::   .: :  ..:..: :. :
CCDS87 LLAEQERFKEAEEIYQTGIKNCPDSSDLHNNYGVFLVDTGLPEKAVAHYQQAIKLSPSHH
            490       500       510       520       530       540  

            660       670       680       690       700       710  
pF1KE0 SLMFSLANVLGKSQKYKESEALFLKAIKANPNAASYHGNLAVLYHRWGHLDLAKKHYEIS
         : .:. .  .  . . .:  . .:...  . :   . :..::.  :. . : . :. .
CCDS87 VAMVNLGRLYRSLGENSMAEEWYKRALQVA-HKAEILSPLGALYYNTGRYEEALQIYQEA
            550       560       570        580       590       600 

            720       730       740                                
pF1KE0 LQLDPTASGTKENYGLLRRKLELMQKKAV                               
         :.:.                                                      
CCDS87 AALQPSQRELRLALAQVLAVMGQTKEAEKMTNHIVSEETGCLECYRLLSAIYSKQENHDK
             610       620       630       640       650       660 

>>CCDS9032.1 TMTC3 gene_id:160418|Hs108|chr12             (914 aa)
 initn: 1188 init1: 432 opt: 928  Z-score: 1061.1  bits: 207.3 E(32554): 8.7e-53
Smith-Waterman score: 1351; 35.9% identity (65.1% similar) in 694 aa overlap (24-695:11-677)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAVLDTDLDHILPSSVLPPFWAKLVVGSVAIVCFARSYDGDFVFDDSEAIVNNKDLQAET
                              :.:: :. .:.  :    :::::  ::..::::.  :
CCDS90              MANINLKEITLIVG-VVTACYWNSLFCGFVFDDVSAILDNKDLHPST
                            10         20        30        40      

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 PLGDLWHHDFWGSRLSSNTSHKSYRPLTVLTFRINYYLSGGFHPVGFHVVNILLHSGISV
       ::  :...::::. .: . ::::::::::::::.:: ::  ..:...:..:...:. .::
CCDS90 PLKTLFQNDFWGTPMSEERSHKSYRPLTVLTFRLNYLLSE-LKPMSYHLLNMIFHAVVSV
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pF1KE0 LMVDVFSVLFGGLQYTSKGRRLHLAPRASLLAALLFAVHPVHTECVAGVVGRADLLCALF
       ... :               .: :  ..:..:.:::::::.::: :.::::::.:: ..:
CCDS90 IFLKVC--------------KLFLDNKSSVIASLLFAVHPIHTEAVTGVVGRAELLSSIF
         110                     120       130       140       150 

              190       200         210       220       230        
pF1KE0 FLLSFLGYCKAFRESNKEGAHSSTFW--VLLSIFLGAVAMLCKEQGITVLGLNAVFDILV
       :: .::.: ..      .:  .: .:  . :..:: ::: :::::::::.:.  :.....
CCDS90 FLAAFLSYTRS------KGPDNSIIWTPIALTVFLVAVATLCKEQGITVVGICCVYEVFI
             160             170       180       190       200     

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pF1KE0 IGKFNV--LEIVQKVLHKDKSLENLGMLRNGGLLFRMTLLTSGGAGMLYVRWRIMGTGPP
          ...  :  .   . . :.   ..::..   : .. .:  .   .. .: ... .  :
CCDS90 AQGYTLPLLCTTAGQFLRGKGSIPFSMLQT---LVKLIVLMFSTLLLVVIRVQVIQSQLP
         210       220       230          240       250       260  

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pF1KE0 AFTEVDNPASFADSMLVRAVNYNYYYSLNAWLLLCPWWLCFDWSMGCIPLIKSISDWRVI
       .::. ::::. . .  .: ...::   .:::::: :  :: ::.:: ::::.:. : : .
CCDS90 VFTRFDNPAAVSPTP-TRQLTFNYLLPVNAWLLLNPSELCCDWTMGTIPLIESLLDIRNL
            270        280       290       300       310       320 

        360       370       380       390       400       410      
pF1KE0 ALAALWFCLIGLICQALCSEDGHKRRILTLGLGFLVIPFLPASNLFFRVGFVVAERVLYL
       : .  .::..:..       .: . . . ..: ....::.::::::: :::::::::::.
CCDS90 A-TFTFFCFLGMLGVFSIRYSGDSSKTVLMALCLMALPFIPASNLFFPVGFVVAERVLYV
              330       340       350       360       370       380

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pF1KE0 PSVGYCVLLTFGFGALSKHTKKKKLIAAVVLGILFINTLRCVLRSGEWRSEEQLFRSALS
       ::.:.:.:.. :.  .: ..  :::    .  ... ..:.   :. .:.::  :: :::.
CCDS90 PSMGFCILVAHGWQKISTKSVFKKLSWICLSMVILTHSLKTFHRNWDWESEYTLFMSALK
              390       400       410       420       430       440

        480       490       500       510       520       530      
pF1KE0 VCPLNAKVHYNIGKNLADKGNQTAAIRYYREAVRLNPKYVHAMNNLGNILKERNELQEAE
       :   :::.  :.:. : .. :   :..:. .:....:  . :  :.:   :. :. .:::
CCDS90 VNKNNAKLWNNVGHALENEKNFERALKYFLQATHVQPDDIGAHMNVGRTYKNLNRTKEAE
              450       460       470       480       490       500

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pF1KE0 ELLSLAVQIQPD------FAA--------AWMNLG-IVQNSLKRFEAAEQSYRTAIKHRR
       :   .: ...:.      .::        ...::. ... . .:.: :.: :: ::. : 
CCDS90 ESYMMAKSLMPQIIPGKKYAARIAPNHLNVYINLANLIRANESRLEEADQLYRQAISMRP
              510       520       530       540       550       560

             590       600       610       620       630       640 
pF1KE0 KYPDCYYNLGRLYADLNRHVDALNAWRNATVLKPEHSLAWNNMIILLDNTGNLAQAEAVG
        . . : . :.:   .:. . : .:. .:  :  ...  : :. :.  .  .  .:    
CCDS90 DFKQAYISRGELLLKMNKPLKAKEAYLKALELDRNNADLWYNLAIVHIELKEPNEALKNF
              570       580       590       600       610       620

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pF1KE0 REALELIPNDHSLMFSLANVLGKSQKYK---ESEALFLKAIKANPNAASYHGNLAVLYHR
        .:::: :. .  .:. : :. .: . :   :..  .:. :. .:  :. . ::..:   
CCDS90 NRALELNPKHKLALFNSAIVMQESGEVKLRPEARKRLLSYINEEPLDANGYFNLGMLAMD
              630       640       650       660       670       680

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pF1KE0 WGHLDLAKKHYEISLQLDPTASGTKENYGLLRRKLELMQKKAV                 
                                                                   
CCDS90 DKKDNEAEIWMKKAIKLQADFRSALFNLALLYSQTAKELKALPILEELLRYYPDHIKGLI
              690       700       710       720       730       740

>>CCDS35502.1 OGT gene_id:8473|Hs108|chrX                 (1036 aa)
 initn: 628 init1: 354 opt: 378  Z-score: 429.7  bits: 90.6 E(32554): 1.3e-17
Smith-Waterman score: 378; 32.9% identity (65.7% similar) in 213 aa overlap (508-717:71-280)

       480       490       500       510       520       530       
pF1KE0 CPLNAKVHYNIGKNLADKGNQTAAIRYYREAVRLNPKYVHAMNNLGNILKERNELQEAEE
                                     :.. ::  ..:..::::. :::..:::: :
CCDS35 EPDNTGVLLLLSSIHFQCRRLDRSAHFSTLAIKQNPLLAEAYSNLGNVYKERGQLQEAIE
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pF1KE0 LLSLAVQIQPDFAAAWMNLGIVQNSLKRFEAAEQSYRTAIKHRRKYPDCY---YNLGRLY
           :....:::  ...::. .  .   .:.: :.: .:...    :: :    .:: : 
CCDS35 HYRHALRLKPDFIDGYINLAAALVAAGDMEGAVQAYVSALQYN---PDLYCVRSDLGNLL
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pF1KE0 ADLNRHVDALNAWRNATVLKPEHSLAWNNMIILLDNTGNLAQAEAVGREALELIPNDHSL
         :.:  .:   . .:   .:. ..::.:.  ...  :..  :    ..:. : ::  . 
CCDS35 KALGRLEEAKACYLKAIETQPNFAVAWSNLGCVFNAQGEIWLAIHHFEKAVTLDPNFLDA
       160       170       180       190       200       210       

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pF1KE0 MFSLANVLGKSQKYKESEALFLKAIKANPNAASYHGNLAVLYHRWGHLDLAKKHYEISLQ
       ...:.::: ... . .. : .:.:.. .:: :  ::::: .:.. : .:::   :. ...
CCDS35 YINLGNVLKEARIFDRAVAAYLRALSLSPNHAVVHGNLACVYYEQGLIDLAIDTYRRAIE
       220       230       240       250       260       270       

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pF1KE0 LDPTASGTKENYGLLRRKLELMQKKAV                                 
       :.:                                                         
CCDS35 LQPHFPDAYCNLANALKEKGSVAEAEDCYNTALRLCPTHADSLNNLANIKREQGNIEEAV
       280       290       300       310       320       330       

>>CCDS14414.1 OGT gene_id:8473|Hs108|chrX                 (1046 aa)
 initn: 628 init1: 354 opt: 378  Z-score: 429.6  bits: 90.6 E(32554): 1.3e-17
Smith-Waterman score: 378; 32.9% identity (65.7% similar) in 213 aa overlap (508-717:81-290)

       480       490       500       510       520       530       
pF1KE0 CPLNAKVHYNIGKNLADKGNQTAAIRYYREAVRLNPKYVHAMNNLGNILKERNELQEAEE
                                     :.. ::  ..:..::::. :::..:::: :
CCDS14 EPDNTGVLLLLSSIHFQCRRLDRSAHFSTLAIKQNPLLAEAYSNLGNVYKERGQLQEAIE
               60        70        80        90       100       110

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pF1KE0 LLSLAVQIQPDFAAAWMNLGIVQNSLKRFEAAEQSYRTAIKHRRKYPDCY---YNLGRLY
           :....:::  ...::. .  .   .:.: :.: .:...    :: :    .:: : 
CCDS14 HYRHALRLKPDFIDGYINLAAALVAAGDMEGAVQAYVSALQYN---PDLYCVRSDLGNLL
              120       130       140       150          160       

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pF1KE0 ADLNRHVDALNAWRNATVLKPEHSLAWNNMIILLDNTGNLAQAEAVGREALELIPNDHSL
         :.:  .:   . .:   .:. ..::.:.  ...  :..  :    ..:. : ::  . 
CCDS14 KALGRLEEAKACYLKAIETQPNFAVAWSNLGCVFNAQGEIWLAIHHFEKAVTLDPNFLDA
       170       180       190       200       210       220       

          660       670       680       690       700       710    
pF1KE0 MFSLANVLGKSQKYKESEALFLKAIKANPNAASYHGNLAVLYHRWGHLDLAKKHYEISLQ
       ...:.::: ... . .. : .:.:.. .:: :  ::::: .:.. : .:::   :. ...
CCDS14 YINLGNVLKEARIFDRAVAAYLRALSLSPNHAVVHGNLACVYYEQGLIDLAIDTYRRAIE
       230       240       250       260       270       280       

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pF1KE0 LDPTASGTKENYGLLRRKLELMQKKAV                                 
       :.:                                                         
CCDS14 LQPHFPDAYCNLANALKEKGSVAEAEDCYNTALRLCPTHADSLNNLANIKREQGNIEEAV
       290       300       310       320       330       340       

>>CCDS81717.1 TMTC2 gene_id:160335|Hs108|chr12            (637 aa)
 initn: 1217 init1: 280 opt: 307  Z-score: 351.7  bits: 75.5 E(32554): 2.9e-13
Smith-Waterman score: 1199; 34.5% identity (63.8% similar) in 643 aa overlap (22-594:3-616)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAVLDTDLDHILPSSVLPPFWAKLVVGSVAIVCFARSYDGDFVFDDSEAIVNNKDLQAET
                            :.:: ...... .  . ..:: .:::.:: .:.::  ::
CCDS81                    MIAELVSSALGLALYLNTLSADFCYDDSRAIKTNQDLLPET
                                  10        20        30        40 

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 PLGDLWHHDFWGSRLSSNTSHKSYRPLTVLTFRINYYLSGGFHPVGFHVVNILLHSGISV
       :   ....::::. :. . :::::::: .:.::.:. . ::..: ..:.::.:::.... 
CCDS81 PWTHIFYNDFWGTLLTHSGSHKSYRPLCTLSFRLNHAI-GGLNPWSYHLVNVLLHAAVTG
              50        60        70         80        90       100

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pF1KE0 LMVDVFSVLFGGLQYTSKGRRLHLAPRASLLAALLFAVHPVHTECVAGVVGRADLLCALF
       :...  ..:.:   .:             ..:.:.:: ::.::: :::.:::::.  .::
CCDS81 LFTSFSKILLGDGYWT-------------FMAGLMFASHPIHTEAVAGIVGRADVGASLF
              110                    120       130       140       

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pF1KE0 FLLSFLGYCKAFRESNKEGAHSSTF-WVLLSIFLGAVAMLCKEQGITVLGLNAVFDILVI
       ::::.: : :   . . .:  . :. : : : . .. .:: ::::.:::...::.:..:.
CCDS81 FLLSLLCYIK---HCSTRGYSARTWGWFLGSGLCAGCSMLWKEQGVTVLAVSAVYDVFVF
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pF1KE0 GKFNVLEIVQKVLHKDKSLENLGMLRNGGLLFRMTLLTSGGAGMLYVRWRIMGTGPPAFT
        .... .:.  . .: :.:         .:.. ..::   :...: .:   ::. ::.:.
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pF1KE0 EVDNPASFADSMLVRAVNYNYYYSLNAWLLLCPWWLCFDWSMGCIPLIKSISDWRVIALA
       . ::::. .::.:.:.... :  . : ::::::  : :::::  .::.:.. ::: .  .
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       :..  :. :   .:        :.           .::.                     
CCDS81 AFYTGLLLLAYYGLKSPSVDRECNGKTVTNGKQNANGHSCLSDVEYQNSETKSSFASKVE
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pF1KE0 ----------------RRILTLGLGFLVIPFLPASNLFFRVGFVVAERVLYLPSVGYCVL
                       . :..:.:..:.:::.::.:::: ::::.::::::.::.:.:.:
CCDS81 NGIKNDVSQRTQLPSTENIVVLSLSLLIIPFVPATNLFFYVGFVIAERVLYIPSMGFCLL
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pF1KE0 LTFGFGALSKHTKK---KKLIAAVVLGILFINTLRCVLRSGEWRSEEQLFRSALSVCPLN
       .: :  ::  ...:   :.::  ..  .. .  :. ..:.:.:..::.:.::...: :  
CCDS81 ITVGARALYVKVQKRFLKSLIFYATATLIVFYGLKTAIRNGDWQNEEMLYRSGIKVNP--
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       ::.  :.:. : .... . :   ::.:.    ...  . ::: .:.: ... :: .  .:
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pF1KE0 AVQIQPDFAAAWMNLGIVQNSLKRFEAAEQSY-----------RTAIKHRRKYPDCYYNL
       :.  .: .:.:..: ::.  .  : : :....           .    :. .  .: :::
CCDS81 AIGSRPTLASAYLNTGIILMNQGRTEEARRTFLKCSEIPDENLKDPHAHKSSVTSCLYNL
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pF1KE0 GRLYADLNRHVDALNAWRNATVLKPEHSLAWNNMIILLDNTGNLAQAEAVGREALELIPN
       :.::                                                        
CCDS81 GKLYHEQGHYEVWPMPLCPFPSPLF                                   
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pF1KE0 LMVDVFSVLFGGLQYTSKGRRLHLAPRASLLAALLFAVHPVHTECVAGVVGRADLLCALF
       :...  ..:.:   .:             ..:.:.:: ::.::: :::.:::::.  .::
CCDS90 LFTSFSKILLGDGYWT-------------FMAGLMFASHPIHTEAVAGIVGRADVGASLF
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pF1KE0 FLLSFLGYCKAFRESNKEGAHSSTF-WVLLSIFLGAVAMLCKEQGITVLGLNAVFDILVI
       ::::.: : :   . . .:  . :. : : : . .. .:: ::::.:::...::.:..:.
CCDS90 FLLSLLCYIK---HCSTRGYSARTWGWFLGSGLCAGCSMLWKEQGVTVLAVSAVYDVFVF
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pF1KE0 GKFNVLEIVQKVLHKDKSLENLGMLRNGGLLFRMTLLTSGGAGMLYVRWRIMGTGPPAFT
        .... .:.  . .: :.:         .:.. ..::   :...: .:   ::. ::.:.
CCDS90 HRLKIKQILPTI-YKRKNL---------SLFLSISLLIFWGSSLLGARLYWMGNKPPSFS
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pF1KE0 EVDNPASFADSMLVRAVNYNYYYSLNAWLLLCPWWLCFDWSMGCIPLIKSISDWRVIALA
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CCDS90 NSDNPAADSDSLLTRTLTFFYLPTKNLWLLLCPDTLSFDWSMDAVPLLKTVCDWRNLHTV
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pF1KE0 ALWFCLIGLICQAL--------CS----------EDGHK---------------------
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CCDS90 ITVGARALYVKVQKRFLKSLIFYATATLIVFYGLKTAIRNGDWQNEEMLYRSGIKVNP--
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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