Result of FASTA (omim) for
pF1KE0016
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0016, 741 aa
1>>>pF1KE0016 741 - 741 aa - 741 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7698+/-0.00051; mu= 17.0574+/- 0.031
mean_var=86.6867+/-18.248, 0's: 0 Z-trim(108.6): 226 B-trim: 580 in 1/53
Lambda= 0.137752
statistics sampled from 16417 (16687) to 16417 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.526), E-opt: 0.2 (0.196), width: 16
Scan time: 11.610
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016875493 (OMIM: 615855) PREDICTED: transmembra ( 875) 1166 243.1 3.8e-63
NP_001180380 (OMIM: 615855) transmembrane and TPR ( 882) 1145 238.9 6.8e-62
NP_787057 (OMIM: 615855) transmembrane and TPR rep ( 774) 1059 221.8 8.6e-57
XP_016875496 (OMIM: 615855) PREDICTED: transmembra ( 618) 884 186.9 2.1e-46
XP_005253556 (OMIM: 615855) PREDICTED: transmembra ( 944) 884 187.0 3e-46
XP_016875495 (OMIM: 615855) PREDICTED: transmembra ( 668) 783 166.9 2.5e-40
XP_016875494 (OMIM: 615855) PREDICTED: transmembra ( 813) 776 165.5 7.6e-40
XP_016875492 (OMIM: 615855) PREDICTED: transmembra ( 888) 456 102.0 1.1e-20
NP_858059 (OMIM: 300255) UDP-N-acetylglucosamine-- (1036) 378 86.5 6e-16
NP_858058 (OMIM: 300255) UDP-N-acetylglucosamine-- (1046) 378 86.5 6e-16
NP_001307251 (OMIM: 615856) transmembrane and TPR ( 637) 307 72.3 7.2e-12
XP_016874373 (OMIM: 615856) PREDICTED: transmembra ( 719) 307 72.3 7.9e-12
NP_689801 (OMIM: 615856) transmembrane and TPR rep ( 836) 307 72.3 8.9e-12
NP_001307250 (OMIM: 615856) transmembrane and TPR ( 591) 267 64.3 1.7e-09
XP_016885397 (OMIM: 300255) PREDICTED: UDP-N-acety ( 665) 220 55.0 1.2e-06
XP_016885396 (OMIM: 300255) PREDICTED: UDP-N-acety ( 665) 220 55.0 1.2e-06
XP_016880977 (OMIM: 116946) PREDICTED: cell divisi ( 427) 195 49.9 2.6e-05
XP_011534737 (OMIM: 608132,613464,615985) PREDICTE ( 276) 192 49.2 2.8e-05
NP_001275712 (OMIM: 608132,613464,615985) tetratri ( 276) 192 49.2 2.8e-05
NP_001275711 (OMIM: 608132,613464,615985) tetratri ( 317) 192 49.2 3.1e-05
XP_016880975 (OMIM: 116946) PREDICTED: cell divisi ( 720) 195 50.0 4e-05
XP_016880974 (OMIM: 116946) PREDICTED: cell divisi ( 721) 195 50.0 4e-05
XP_011523852 (OMIM: 116946) PREDICTED: cell divisi ( 727) 195 50.0 4e-05
XP_016880973 (OMIM: 116946) PREDICTED: cell divisi ( 762) 195 50.0 4.1e-05
NP_001280020 (OMIM: 116946) cell division cycle pr ( 763) 195 50.0 4.1e-05
XP_011523850 (OMIM: 116946) PREDICTED: cell divisi ( 769) 195 50.1 4.2e-05
XP_011523851 (OMIM: 116946) PREDICTED: cell divisi ( 769) 195 50.1 4.2e-05
NP_938052 (OMIM: 608132,613464,615985) tetratricop ( 475) 192 49.3 4.3e-05
XP_006720100 (OMIM: 608132,613464,615985) PREDICTE ( 475) 192 49.3 4.3e-05
NP_001280018 (OMIM: 116946) cell division cycle pr ( 823) 195 50.1 4.4e-05
NP_001247 (OMIM: 116946) cell division cycle prote ( 824) 195 50.1 4.4e-05
XP_011523848 (OMIM: 116946) PREDICTED: cell divisi ( 829) 195 50.1 4.4e-05
NP_001107563 (OMIM: 116946) cell division cycle pr ( 830) 195 50.1 4.4e-05
XP_011534736 (OMIM: 608132,613464,615985) PREDICTE ( 501) 192 49.3 4.5e-05
NP_938051 (OMIM: 608132,613464,615985) tetratricop ( 505) 192 49.3 4.5e-05
XP_006720098 (OMIM: 608132,613464,615985) PREDICTE ( 505) 192 49.3 4.5e-05
NP_653197 (OMIM: 608132,613464,615985) tetratricop ( 515) 192 49.3 4.6e-05
NP_001275710 (OMIM: 608132,613464,615985) tetratri ( 531) 192 49.3 4.7e-05
XP_011534734 (OMIM: 608132,613464,615985) PREDICTE ( 531) 192 49.3 4.7e-05
XP_016880976 (OMIM: 116946) PREDICTED: cell divisi ( 708) 186 48.2 0.00013
XP_016880972 (OMIM: 116946) PREDICTED: cell divisi ( 768) 186 48.3 0.00014
XP_016880971 (OMIM: 116946) PREDICTED: cell divisi ( 769) 186 48.3 0.00014
XP_016880970 (OMIM: 116946) PREDICTED: cell divisi ( 774) 186 48.3 0.00014
XP_011523849 (OMIM: 116946) PREDICTED: cell divisi ( 775) 186 48.3 0.00014
NP_001307594 (OMIM: 209900,600374,615982) Bardet-B ( 496) 165 44.0 0.0018
XP_016877939 (OMIM: 209900,600374,615982) PREDICTE ( 504) 165 44.0 0.0019
NP_001275884 (OMIM: 243150,609332) tetratricopepti ( 504) 161 43.2 0.0032
XP_011531303 (OMIM: 243150,609332) PREDICTED: tetr ( 509) 161 43.2 0.0032
XP_011520153 (OMIM: 209900,600374,615982) PREDICTE ( 275) 157 42.2 0.0035
XP_011531302 (OMIM: 243150,609332) PREDICTED: tetr ( 598) 161 43.2 0.0037
>>XP_016875493 (OMIM: 615855) PREDICTED: transmembrane a (875 aa)
initn: 1205 init1: 492 opt: 1166 Z-score: 1254.8 bits: 243.1 E(85289): 3.8e-63
Smith-Waterman score: 1456; 38.5% identity (66.7% similar) in 712 aa overlap (17-718:24-708)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAVLDTDLDHILPSSVLPPFWAKLVVGSVAIVCFARSYDGDFVFDDSEAIVNN
: : : ...... .:..:: .:.:: :: :::::
XP_016 MVVTTSARGGGGDRTPSRRRGCGLAPAGAAALLAGASCLCYGRSLQGEFVHDDVWAIVNN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 KDLQAETPLG-DLWHHDFWGSRLSSNTSHKSYRPLTVLTFRINYYLSGGFHPVGFHVVNI
:.. .:: .. .::::. .. :::::::::: ::::..: .:.: ..: ::.:::
XP_016 PDVRPGAPLRWGIFTNDFWGKGMAENTSHKSYRPLCVLTFKLNIFLTG-MNPFYFHAVNI
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LLHSGIS-VLMVDVFSVLFGGLQYTSKGRRLHLAPRASLLAALLFAVHPVHTECVAGVVG
.:: .. ::: ...: :.: : ....::::::::.::: :::.::
XP_016 ILHCLVTLVLMYTCDKTVF-------KNRGL------AFVTALLFAVHPIHTEAVAGIVG
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KE0 RADLLCALFFLLSFLGYCKAFRESNKEGAHSST---FWVLLSIFLGAVAMLCKEQGITVL
:::.: :.:::.::.: ... .. :. :: :..:::.:::. ::: :: ::::.
XP_016 RADVLACLLFLLAFLSYNRSLDQGCVGGSFPSTVSPFFLLLSLFLGTCAMLVKETGITVF
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 GLNAVFDILVIGKFNVLEIVQKVLHKDKSLENLGMLRNGGLLFRMTLLTSGGAGMLYVRW
:. :.:. :.. . .: . .: .:. .: .: : :. : .:: :
XP_016 GVCLVYDL-----FSLSNKQDKSYLRASSNRNF-LLTMRPFLKRAILVLSYVLVILYFRL
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 RIMGTGPPAFTEVDNPASFADSMLVRAVNYNYYYSLNAWLLLCPWWLCFDWSMGCIPLIK
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XP_016 WIMGGSMPLFSEQDNPASFSPYILTRFLTYSYLLAFNVWLLLAPVTLCYDWQVGSIPLVE
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 SISDWRVIA--LAALWFCLIGLICQALCSEDGHKRRILTLGLGFLVIPFLPASNLFFRVG
.: : : .: . :. . :..: : : .. ::. . .:: :::.::.::::::::::
XP_016 TIWDMRNLATIFLAVVMALLSLHCLAAFKRLEHKE--VLVGLLFLVFPFIPASNLFFRVG
350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 FVVAERVLYLPSVGYCVLLTFGFGALSKHTKK---KKLIAAVVLGILFINTLRCVLRSGE
:::::::::.::.:::.:.. :.. : .. ::...:: .:.. . . : ..
XP_016 FVVAERVLYMPSMGYCILFVHGLSKLCTWLNRCGATTLIVSTVL-LLLLFSWKTVKQNEI
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 WRSEEQLFRSALSVCPLNAKVHYNIGKNLADKGNQTAAIRYYREAVRLNPKYVHAMNNLG
: :.:.::::.... : ::::::: .. : :.: . :: .:: :..: :... :.::::
XP_016 WLSRESLFRSGVQTLPHNAKVHYNYANFLKDQGRNKEAIYHYRTALKLYPRHASALNNLG
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 NILKERNELQEAEELLSLAVQIQPDFAAAWMNLGIVQNSLKRFEAAEQSYRTAIKHRRKY
.. .. : :. . :.:..:. : .::: . .: .. : : . .::. ..
XP_016 TLTRDTAE---AKMYYQRALQLHPQHNRALFNLGNLLKSQEKKEEAITLLKDSIKYGPEF
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KE0 PDCYYNLGRLYADLNRHVDALNAWRNATVLKPEHSLAWNNMIILLDNTGNLAQAEAVGRE
: : .:. : :. .: .: . .... :. : ::. ..: .:: .: : ..
XP_016 ADAYSSLASLLAEQERFKEAEEIYQTGIKNCPDSSDLHNNYGVFLVDTGLPEKAVAHYQQ
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KE0 ALELIPNDHSLMFSLANVLGKSQKYKESEALFLKAIKANPNAASYHGNLAVLYHRWGHLD
:..: :. : : .:. . . . . .: . .:... . : . :..::. :. .
XP_016 AIKLSPSHHVAMVNLGRLYRSLGENSMAEEWYKRALQVA-HKAEILSPLGALYYNTGRYE
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740
pF1KE0 LAKKHYEISLQLDPTASGTKENYGLLRRKLELMQKKAV
: . :. . :.:.
XP_016 EALQIYQEAAALQPSQRELRLALAQVLAVMGQTKEAEKMTNHIVSEETGCLECYRLLSAI
700 710 720 730 740 750
>>NP_001180380 (OMIM: 615855) transmembrane and TPR repe (882 aa)
initn: 1010 init1: 396 opt: 1145 Z-score: 1232.2 bits: 238.9 E(85289): 6.8e-62
Smith-Waterman score: 1318; 36.4% identity (63.8% similar) in 723 aa overlap (17-718:24-715)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAVLDTDLDHILPSSVLPPFWAKLVVGSVAIVCFARSYDGDFVFDDSEAIVNN
: : : ...... .:..:: .:.:: :: :::::
NP_001 MVVTTSARGGGGDRTPSRRRGCGLAPAGAAALLAGASCLCYGRSLQGEFVHDDVWAIVNN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 KDLQAETPLG-DLWHHDFWGSRLSSNTSHKSYRPLTVLTFRINYYLSGGFHPVGFHVVNI
:.. .:: .. .::::. .. :::::::::: ::::..: .:.: ..: ::.:::
NP_001 PDVRPGAPLRWGIFTNDFWGKGMAENTSHKSYRPLCVLTFKLNIFLTG-MNPFYFHAVNI
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LLHSGIS-VLMVDVFSVLFGGLQYTSKGRRLHLAPRASLLAALLFAVHPVHTECVAGVVG
.:: .. ::: ...: :.: : ....::::::::.::: :::.::
NP_001 ILHCLVTLVLMYTCDKTVF-------KNRGL------AFVTALLFAVHPIHTEAVAGIVG
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KE0 RADLLCALFFLLSFLGYCKAFRESNKEGAHSST---FWVLLSIFLGAVAMLCKEQGITVL
:::.: :.:::.::.: ... .. :. :: :..:::.:::. ::: :: ::::.
NP_001 RADVLACLLFLLAFLSYNRSLDQGCVGGSFPSTVSPFFLLLSLFLGTCAMLVKETGITVF
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KE0 GLNAVFDILVI---------GKFNVLEIVQKVLHKDKSLENLGMLRNGGLLFRMTLLTSG
:. :.:.. . : . : . .:: . .:: .. .
NP_001 GVCLVYDLFSLSNKQDKSSNGALCPRSPQQPGSPQPSSLPGHPHRENG----KQQRFPHK
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 GAGMLYVRWRIMGTG-PPAFTEVDNPAS-FADSMLVRAVNYNYYYSLNAWLLLCPWWLCF
:: : . :: :.: : ..: ..:.: ..:.:::: : ::.
NP_001 GA------WGGCHSPLPPEPKSSGFPVSPRAVWSMMRFLTYSYLLAFNVWLLLAPVTLCY
290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 DWSMGCIPLIKSISDWRVIA--LAALWFCLIGLICQALCSEDGHKRRILTLGLGFLVIPF
::..: :::...: : : .: . :. . :..: : : .. ::. . .:: :::.::
NP_001 DWQVGSIPLVETIWDMRNLATIFLAVVMALLSLHCLAAFKRLEHKE--VLVGLLFLVFPF
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 LPASNLFFRVGFVVAERVLYLPSVGYCVLLTFGFGALSKHTKK---KKLIAAVVLGILFI
.:::::::::::::::::::.::.:::.:.. :.. : .. ::...:: .:..
NP_001 IPASNLFFRVGFVVAERVLYMPSMGYCILFVHGLSKLCTWLNRCGATTLIVSTVL-LLLL
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 NTLRCVLRSGEWRSEEQLFRSALSVCPLNAKVHYNIGKNLADKGNQTAAIRYYREAVRLN
. . : .. : :.:.::::.... : ::::::: .. : :.: . :: .:: :..:
NP_001 FSWKTVKQNEIWLSRESLFRSGVQTLPHNAKVHYNYANFLKDQGRNKEAIYHYRTALKLY
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 PKYVHAMNNLGNILKERNELQEAEELLSLAVQIQPDFAAAWMNLGIVQNSLKRFEAAEQS
:... :.::::.. .. : :. . :.:..:. : .::: . .: .. : :
NP_001 PRHASALNNLGTLTRDTAE---AKMYYQRALQLHPQHNRALFNLGNLLKSQEKKEEAITL
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KE0 YRTAIKHRRKYPDCYYNLGRLYADLNRHVDALNAWRNATVLKPEHSLAWNNMIILLDNTG
. .::. .. : : .:. : :. .: .: . .... :. : ::. ..: .::
NP_001 LKDSIKYGPEFADAYSSLASLLAEQERFKEAEEIYQTGIKNCPDSSDLHNNYGVFLVDTG
580 590 600 610 620 630
640 650 660 670 680 690
pF1KE0 NLAQAEAVGREALELIPNDHSLMFSLANVLGKSQKYKESEALFLKAIKANPNAASYHGNL
.: : ..:..: :. : : .:. . . . . .: . .:... . : . :
NP_001 LPEKAVAHYQQAIKLSPSHHVAMVNLGRLYRSLGENSMAEEWYKRALQVA-HKAEILSPL
640 650 660 670 680
700 710 720 730 740
pF1KE0 AVLYHRWGHLDLAKKHYEISLQLDPTASGTKENYGLLRRKLELMQKKAV
..::. :. . : . :. . :.:.
NP_001 GALYYNTGRYEEALQIYQEAAALQPSQRELRLALAQVLAVMGQTKEAEKMTNHIVSEETG
690 700 710 720 730 740
>>NP_787057 (OMIM: 615855) transmembrane and TPR repeat- (774 aa)
initn: 967 init1: 396 opt: 1059 Z-score: 1140.6 bits: 221.8 E(85289): 8.6e-57
Smith-Waterman score: 1063; 35.1% identity (62.3% similar) in 636 aa overlap (103-718:2-607)
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 SRLSSNTSHKSYRPLTVLTFRINYYLSGGFHPVGFHVVNILLHSGIS-VLMVDVFSVLFG
.: ::.:::.:: .. ::: ...:
NP_787 MNPFYFHAVNIILHCLVTLVLMYTCDKTVF-
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 GLQYTSKGRRLHLAPRASLLAALLFAVHPVHTECVAGVVGRADLLCALFFLLSFLGYCKA
:.: : ....::::::::.::: :::.:::::.: :.:::.::.: ..
NP_787 ------KNRGL------AFVTALLFAVHPIHTEAVAGIVGRADVLACLLFLLAFLSYNRS
40 50 60 70
200 210 220 230
pF1KE0 FRESNKEGAHSST---FWVLLSIFLGAVAMLCKEQGITVLGLNAVFDILVI---------
. .. :. :: :..:::.:::. ::: :: ::::.:. :.:.. .
NP_787 LDQGCVGGSFPSTVSPFFLLLSLFLGTCAMLVKETGITVFGVCLVYDLFSLSNKQDKSSN
80 90 100 110 120 130
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GKFNVLEIVQKVLHKDKSLENLGMLRNGGLLFRMTLLTSGGAGMLYVRWRIMGTG-PPAF
: . : . .:: . .:: .. . :: : . ::
NP_787 GALCPRSPQQPGSPQPSSLPGHPHRENG----KQQRFPHKGA------WGGCHSPLPPEP
140 150 160 170 180
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 TEVDNPAS-FADSMLVRAVNYNYYYSLNAWLLLCPWWLCFDWSMGCIPLIKSISDWRVIA
:.: : ..: ..:.: ..:.:::: : ::.::..: :::...: : : .:
NP_787 KSSGFPVSPRAVWSMMRFLTYSYLLAFNVWLLLAPVTLCYDWQVGSIPLVETIWDMRNLA
190 200 210 220 230 240
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 --LAALWFCLIGLICQALCSEDGHKRRILTLGLGFLVIPFLPASNLFFRVGFVVAERVLY
. :. . :..: : : .. ::. . .:: :::.::.:::::::::::::::::::
NP_787 TIFLAVVMALLSLHCLAAFKRLEHKE--VLVGLLFLVFPFIPASNLFFRVGFVVAERVLY
250 260 270 280 290 300
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 LPSVGYCVLLTFGFGALSKHTKK---KKLIAAVVLGILFINTLRCVLRSGEWRSEEQLFR
.::.:::.:.. :.. : .. ::...:: .:.. . . : .. : :.:.:::
NP_787 MPSMGYCILFVHGLSKLCTWLNRCGATTLIVSTVL-LLLLFSWKTVKQNEIWLSRESLFR
310 320 330 340 350 360
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 SALSVCPLNAKVHYNIGKNLADKGNQTAAIRYYREAVRLNPKYVHAMNNLGNILKERNEL
:.... : ::::::: .. : :.: . :: .:: :..: :... :.::::.. .. :
NP_787 SGVQTLPHNAKVHYNYANFLKDQGRNKEAIYHYRTALKLYPRHASALNNLGTLTRDTAE-
370 380 390 400 410 420
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pF1KE0 QEAEELLSLAVQIQPDFAAAWMNLGIVQNSLKRFEAAEQSYRTAIKHRRKYPDCYYNLGR
:. . :.:..:. : .::: . .: .. : : . .::. .. : : .:.
NP_787 --AKMYYQRALQLHPQHNRALFNLGNLLKSQEKKEEAITLLKDSIKYGPEFADAYSSLAS
430 440 450 460 470 480
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pF1KE0 LYADLNRHVDALNAWRNATVLKPEHSLAWNNMIILLDNTGNLAQAEAVGREALELIPNDH
: :. .: .: . .... :. : ::. ..: .:: .: : ..:..: :. :
NP_787 LLAEQERFKEAEEIYQTGIKNCPDSSDLHNNYGVFLVDTGLPEKAVAHYQQAIKLSPSHH
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pF1KE0 SLMFSLANVLGKSQKYKESEALFLKAIKANPNAASYHGNLAVLYHRWGHLDLAKKHYEIS
: .:. . . . . .: . .:... . : . :..::. :. . : . :. .
NP_787 VAMVNLGRLYRSLGENSMAEEWYKRALQVA-HKAEILSPLGALYYNTGRYEEALQIYQEA
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pF1KE0 LQLDPTASGTKENYGLLRRKLELMQKKAV
:.:.
NP_787 AALQPSQRELRLALAQVLAVMGQTKEAEKMTNHIVSEETGCLECYRLLSAIYSKQENHDK
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.: : :. : .:: : ::: . : :
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300 310 320 330 340 350
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.: ::::::. .:.: ..:.: ..:.:::: : ::.::..: :::...: : : .:
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. :. . :..: : : .. ::. . .:: :::.::.:::::::::::::::::::.
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::.:::.:.. :.. : .. ::...:: .:.. . . : .. : :.:.::::
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.... : ::::::: .. : :.: . :: .:: :..: :... :.::::.. .. :
XP_016 GVQTLPHNAKVHYNYANFLKDQGRNKEAIYHYRTALKLYPRHASALNNLGTLTRDTAE--
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:. . :.:..:. : .::: . .: .. : : . .::. .. : : .:. :
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:. .: .: . .... :. : ::. ..: .:: .: : ..:..: :. :
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pF1KE0 LMFSLANVLGKSQKYKESEALFLKAIKANPNAASYHGNLAVLYHRWGHLDLAKKHYEISL
: .:. . . . . .: . .:... . : . :..::. :. . : . :. .
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pF1KE0 QLDPTASGTKENYGLLRRKLELMQKKAV
:.:.
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::::.: :.:::.::.: ... .. :. :: :..:::.:::. ::: :: ::::
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.:. :.:.. . : . : . .:: ::
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270 280
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.:.: : ..:. : :. : .:
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290 300 310 320 330 340
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: : ::: . : :.: ::::::. .:.: ..:.: ..:.:::: : ::.::..: :
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350 360 370 380 390 400
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::...: : : .: . :. . :..: : : .. ::. . .:: :::.::.::::::
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410 420 430 440 450
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:::::::::::::.::.:::.:.. :.. : .. ::...:: .:.. . . :
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.. : :.:.::::.... : ::::::: .. : :.: . :: .:: :..: :... :.
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::::.. .. ::. . :.:..:. : .::: . .: .. : : . .::.
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.. : : .:. : :. .: .: . .... :. : ::. ..: .:: .: :
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640 650 660 670 680 690
pF1KE0 VGREALELIPNDHSLMFSLANVLGKSQKYKESEALFLKAIKANPNAASYHGNLAVLYHRW
..:..: :. : : .:. . . . . .: . .:... . : . :..::.
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:. . : . :. . :.:.
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:.:: .. ::: ...: :.: : ....::::::::.::: :::.:
XP_016 IILHCLVTLVLMYTCDKTVF-------KNRGL------AFVTALLFAVHPIHTEAVAGIV
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::::.: :.:::.::.: ... .. :. :: :..:::.:::. ::: :: ::::
XP_016 GRADVLACLLFLLAFLSYNRSLDQGCVGGSFPSTVSPFFLLLSLFLGTCAMLVKETGITV
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pF1KE0 LGLNAVFDILVI---------GKFNVLEIVQKVLHKDKSL------EN------------
.:. :.:.. . : . : . .:: ::
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pF1KE0 -----------------------LGMLR------NGGLLFRMT-------LLTSGGAGML
.:.: : ..:. : :. : .:
XP_016 GGCHSPLPPEPKSSGFPVSPRAVWSMMRYLRASSNRNFLLTMRPFLKRAILVLSYVLVIL
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290 300 310 320 330 340
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: : ::: . : :.: ::::::. .:.: ..:.: ..:.:::: : ::.::..: :
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350 360 370 380 390 400
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410 420 430 440 450
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:::::::::::::.::.:::.:.. :.. : .. ::...:: .:.. . . :
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.. : :.:.::::.... : ::::::: .. : :.: . :: .:: :..: :... :.
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pF1KE0 NNLGNILKERNELQEAEELLSLAVQIQPDFAAAWMNLGIVQNSLKRFEAAEQSYRTAIKH
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XP_016 NNLGTLTRDTA---EAKMYYQRALQLHPQHNRALFNLGNLLKSQEKKEEAITLLKDSIKY
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pF1KE0 RRKYPDCYYNLGRLYADLNRHVDALNAWRNATVLKPEHSLAWNNMIILLDNTGNLAQAEA
.. : : .:. : :.
XP_016 GPEFADAYSSLASLLAEQAHFISTPLKML
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Smith-Waterman score: 1236; 35.3% identity (62.1% similar) in 712 aa overlap (17-718:24-646)
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: : : ...... .:..:: .:.:: :: :::::
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XP_016 PDVRPGAPLRWGIFTNDFWGKGMAENTSHKSYRPLCVLTFKLNIFLTG-MNPFYFHAVNI
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pF1KE0 LLHSGIS-VLMVDVFSVLFGGLQYTSKGRRLHLAPRASLLAALLFAVHPVHTECVAGVVG
.:: .. ::: ...: :.: : ....::::::::.::: :::.::
XP_016 ILHCLVTLVLMYTCDKTVF-------KNRGL------AFVTALLFAVHPIHTEAVAGIVG
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pF1KE0 RADLLCALFFLLSFLGYCKAFRESNKEGAHSST---FWVLLSIFLGAVAMLCKEQGITVL
:::.: :.:::.::.: ... .. :. :: :..:::.:::. ::: :: ::::.
XP_016 RADVLACLLFLLAFLSYNRSLDQGCVGGSFPSTVSPFFLLLSLFLGTCAMLVKETGITVF
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..:.: ..:.:::: : ::.::..: :::..
XP_016 ---------------------------LTYSYLLAFNVWLLLAPVTLCYDWQVGSIPLVE
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XP_016 TIWDMRNLATIFLAVVMALLSLHCLAAFKRLEHKE--VLVGLLFLVFPFIPASNLFFRVG
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pF1KE0 FVVAERVLYLPSVGYCVLLTFGFGALSKHTKK---KKLIAAVVLGILFINTLRCVLRSGE
:::::::::.::.:::.:.. :.. : .. ::...:: .:.. . . : ..
XP_016 FVVAERVLYMPSMGYCILFVHGLSKLCTWLNRCGATTLIVSTVL-LLLLFSWKTVKQNEI
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pF1KE0 NILKERNELQEAEELLSLAVQIQPDFAAAWMNLGIVQNSLKRFEAAEQSYRTAIKHRRKY
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XP_016 TLTRDTAE---AKMYYQRALQLHPQHNRALFNLGNLLKSQEKKEEAITLLKDSIKYGPEF
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XP_016 ADAYSSLASLLAEQERFKEAEEIYQTGIKNCPDSSDLHNNYGVFLVDTGLPEKAVAHYQQ
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:.:: .. ::: ...: :.: : ....::::::::.::: :::.:
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270 280
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.:.: : ..:. : :. : .:
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350 360 370 380 390 400
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::...: : : .: . :. . :..: : : .. ::. . .:: :::.::.::::::
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:::::::::::::.: : .: :. : . . : :.
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. :..: .. :.::.. : .:.. :.: : .. : ::..:..:.:.. .:.
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: . : : . .: . :. ...: :.: : .: :. : . :. ..::
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..::. . . .. :. . .. .:.:. .. .: .:. . :: . :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]