FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0017, 550 aa
1>>>pF1KE0017 550 - 550 aa - 550 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6296+/-0.000946; mu= 12.2912+/- 0.057
mean_var=95.5951+/-18.882, 0's: 0 Z-trim(106.6): 51 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.131177
statistics sampled from 9020 (9066) to 9020 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.278), width: 16
Scan time: 3.460
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS75248.1 MIER3 gene_id:166968|Hs108|chr5 ( 550) 3664 704.0 1.1e-202
CCDS3973.2 MIER3 gene_id:166968|Hs108|chr5 ( 549) 3646 700.6 1.2e-201
CCDS78011.1 MIER3 gene_id:166968|Hs108|chr5 ( 555) 3644 700.3 1.6e-201
CCDS41347.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 ( 433) 1296 255.9 7.4e-68
CCDS41348.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 ( 512) 1296 255.9 8.5e-68
CCDS53327.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 ( 450) 1280 252.8 6.2e-67
CCDS53328.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 ( 470) 1280 252.8 6.5e-67
CCDS53329.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 ( 529) 1280 252.9 7.2e-67
CCDS53325.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 ( 486) 1279 252.7 7.6e-67
CCDS53326.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 ( 565) 1279 252.7 8.6e-67
CCDS32855.1 MIER2 gene_id:54531|Hs108|chr19 ( 545) 1019 203.5 5.4e-52
CCDS53330.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 ( 370) 1001 200.0 4.1e-51
>>CCDS75248.1 MIER3 gene_id:166968|Hs108|chr5 (550 aa)
initn: 3664 init1: 3664 opt: 3664 Z-score: 3752.1 bits: 704.0 E(32554): 1.1e-202
Smith-Waterman score: 3664; 100.0% identity (100.0% similar) in 550 aa overlap (1-550:1-550)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAEASFGSSSPVGSLSSEDHDFDPTAEMLVHDYDDERTLEEEEMMDEGKNFSSEIEDLEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MAEASFGSSSPVGSLSSEDHDFDPTAEMLVHDYDDERTLEEEEMMDEGKNFSSEIEDLEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 EGTMPLEDLLAFYGYEPTIPAVANSSANSSPSELADELPDMTLDKEEIAKDLLSGDDEET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EGTMPLEDLLAFYGYEPTIPAVANSSANSSPSELADELPDMTLDKEEIAKDLLSGDDEET
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QSSADDLTPSVTSHETSDFFPRPLRSNTACDGDKESEVEDVETDSGNSPEDLRKEIMIGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QSSADDLTPSVTSHETSDFFPRPLRSNTACDGDKESEVEDVETDSGNSPEDLRKEIMIGL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 QYQAEIPPYLGEYDGNEKVYENEDQLLWCPDVVLESKVKEYLVETSLRTGSEKIMDRISA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QYQAEIPPYLGEYDGNEKVYENEDQLLWCPDVVLESKVKEYLVETSLRTGSEKIMDRISA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GTHTRDNEQALYELLKCNHNIKEAIERYCCNGKASQEGMTAWTEEECRSFEHALMLFGKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GTHTRDNEQALYELLKCNHNIKEAIERYCCNGKASQEGMTAWTEEECRSFEHALMLFGKD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 FHLIQKNKVRTRTVAECVAFYYMWKKSERYDYFAQQTRFGKKRYNHHPGVTDYMDRLVDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FHLIQKNKVRTRTVAECVAFYYMWKKSERYDYFAQQTRFGKKRYNHHPGVTDYMDRLVDE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 TEALGGTVNASALTSNRPEPIPDQQLNILNSFTASDLTALTNSVATVCDPTDVNCLDDSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TEALGGTVNASALTSNRPEPIPDQQLNILNSFTASDLTALTNSVATVCDPTDVNCLDDSF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 PPLGNTPRGQVNHVPVVTEELLTLPSNGESDCFNLFETGFYHSELNPMNMCSEESERPAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PPLGNTPRGQVNHVPVVTEELLTLPSNGESDCFNLFETGFYHSELNPMNMCSEESERPAK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 RLKMGIAVPESFMNEVSVNNLGVDFENHTHHITSAKMAVSVADFGSLSANETNGFISAHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RLKMGIAVPESFMNEVSVNNLGVDFENHTHHITSAKMAVSVADFGSLSANETNGFISAHA
490 500 510 520 530 540
550
pF1KE0 LHQHAALHSE
::::::::::
CCDS75 LHQHAALHSE
550
>>CCDS3973.2 MIER3 gene_id:166968|Hs108|chr5 (549 aa)
initn: 1842 init1: 1842 opt: 3646 Z-score: 3733.7 bits: 700.6 E(32554): 1.2e-201
Smith-Waterman score: 3646; 99.8% identity (99.8% similar) in 550 aa overlap (1-550:1-549)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAEASFGSSSPVGSLSSEDHDFDPTAEMLVHDYDDERTLEEEEMMDEGKNFSSEIEDLEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 MAEASFGSSSPVGSLSSEDHDFDPTAEMLVHDYDDERTLEEEEMMDEGKNFSSEIEDLEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 EGTMPLEDLLAFYGYEPTIPAVANSSANSSPSELADELPDMTLDKEEIAKDLLSGDDEET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 EGTMPLEDLLAFYGYEPTIPAVANSSANSSPSELADELPDMTLDKEEIAKDLLSGDDEET
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QSSADDLTPSVTSHETSDFFPRPLRSNTACDGDKESEVEDVETDSGNSPEDLRKEIMIGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 QSSADDLTPSVTSHETSDFFPRPLRSNTACDGDKESEVEDVETDSGNSPEDLRKEIMIGL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 QYQAEIPPYLGEYDGNEKVYENEDQLLWCPDVVLESKVKEYLVETSLRTGSEKIMDRISA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 QYQAEIPPYLGEYDGNEKVYENEDQLLWCPDVVLESKVKEYLVETSLRTGSEKIMDRISA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GTHTRDNEQALYELLKCNHNIKEAIERYCCNGKASQEGMTAWTEEECRSFEHALMLFGKD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS39 GTHTRDNEQALYELLKCNHNIKEAIERYCCNGKASQ-GMTAWTEEECRSFEHALMLFGKD
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 FHLIQKNKVRTRTVAECVAFYYMWKKSERYDYFAQQTRFGKKRYNHHPGVTDYMDRLVDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 FHLIQKNKVRTRTVAECVAFYYMWKKSERYDYFAQQTRFGKKRYNHHPGVTDYMDRLVDE
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 TEALGGTVNASALTSNRPEPIPDQQLNILNSFTASDLTALTNSVATVCDPTDVNCLDDSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 TEALGGTVNASALTSNRPEPIPDQQLNILNSFTASDLTALTNSVATVCDPTDVNCLDDSF
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 PPLGNTPRGQVNHVPVVTEELLTLPSNGESDCFNLFETGFYHSELNPMNMCSEESERPAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 PPLGNTPRGQVNHVPVVTEELLTLPSNGESDCFNLFETGFYHSELNPMNMCSEESERPAK
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 RLKMGIAVPESFMNEVSVNNLGVDFENHTHHITSAKMAVSVADFGSLSANETNGFISAHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 RLKMGIAVPESFMNEVSVNNLGVDFENHTHHITSAKMAVSVADFGSLSANETNGFISAHA
480 490 500 510 520 530
550
pF1KE0 LHQHAALHSE
::::::::::
CCDS39 LHQHAALHSE
540
>>CCDS78011.1 MIER3 gene_id:166968|Hs108|chr5 (555 aa)
initn: 3605 init1: 3605 opt: 3644 Z-score: 3731.6 bits: 700.3 E(32554): 1.6e-201
Smith-Waterman score: 3644; 99.1% identity (99.1% similar) in 555 aa overlap (1-550:1-555)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAEASFGSSSPV-----GSLSSEDHDFDPTAEMLVHDYDDERTLEEEEMMDEGKNFSSEI
:::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MAEASFGSSSPVCFIPVGSLSSEDHDFDPTAEMLVHDYDDERTLEEEEMMDEGKNFSSEI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 EDLEKEGTMPLEDLLAFYGYEPTIPAVANSSANSSPSELADELPDMTLDKEEIAKDLLSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EDLEKEGTMPLEDLLAFYGYEPTIPAVANSSANSSPSELADELPDMTLDKEEIAKDLLSG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 DDEETQSSADDLTPSVTSHETSDFFPRPLRSNTACDGDKESEVEDVETDSGNSPEDLRKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DDEETQSSADDLTPSVTSHETSDFFPRPLRSNTACDGDKESEVEDVETDSGNSPEDLRKE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 IMIGLQYQAEIPPYLGEYDGNEKVYENEDQLLWCPDVVLESKVKEYLVETSLRTGSEKIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 IMIGLQYQAEIPPYLGEYDGNEKVYENEDQLLWCPDVVLESKVKEYLVETSLRTGSEKIM
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 DRISAGTHTRDNEQALYELLKCNHNIKEAIERYCCNGKASQEGMTAWTEEECRSFEHALM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DRISAGTHTRDNEQALYELLKCNHNIKEAIERYCCNGKASQEGMTAWTEEECRSFEHALM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 LFGKDFHLIQKNKVRTRTVAECVAFYYMWKKSERYDYFAQQTRFGKKRYNHHPGVTDYMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LFGKDFHLIQKNKVRTRTVAECVAFYYMWKKSERYDYFAQQTRFGKKRYNHHPGVTDYMD
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 RLVDETEALGGTVNASALTSNRPEPIPDQQLNILNSFTASDLTALTNSVATVCDPTDVNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 RLVDETEALGGTVNASALTSNRPEPIPDQQLNILNSFTASDLTALTNSVATVCDPTDVNC
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 LDDSFPPLGNTPRGQVNHVPVVTEELLTLPSNGESDCFNLFETGFYHSELNPMNMCSEES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LDDSFPPLGNTPRGQVNHVPVVTEELLTLPSNGESDCFNLFETGFYHSELNPMNMCSEES
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 ERPAKRLKMGIAVPESFMNEVSVNNLGVDFENHTHHITSAKMAVSVADFGSLSANETNGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ERPAKRLKMGIAVPESFMNEVSVNNLGVDFENHTHHITSAKMAVSVADFGSLSANETNGF
490 500 510 520 530 540
540 550
pF1KE0 ISAHALHQHAALHSE
:::::::::::::::
CCDS78 ISAHALHQHAALHSE
550
>>CCDS41347.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 (433 aa)
initn: 1300 init1: 860 opt: 1296 Z-score: 1331.8 bits: 255.9 E(32554): 7.4e-68
Smith-Waterman score: 1296; 54.8% identity (73.4% similar) in 394 aa overlap (1-382:1-380)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAEASFGSSSPVGSLSSEDHDFDPTAEMLVHDYDDERTLEEEEMMDEGKNFSSEIEDLEK
::: : :::: :: .:.::.:::.:.:::::.::::::::::::. ::::::::: .
CCDS41 MAEPSVESSSPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE0 EGTMPLEDLLAFYGYEPTIPAVANSSANSSPSELADELPDMTLD---------KEEIAKD
:: ::...::..::: :. .. . : ... : : ::: ::
CCDS41 EGDMPIHELLSLYGYGSTVRLPEEDEEEEEEEEEGEDDEDADNDDNSGCSGENKEENIKD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KE0 LLSGDDEETQSSADDLTPSVTSHETSDFFPRPLRSNTACDG-DKESEVED-VETDSGNSP
::...::::: :: . ::.:....... :: : : : .::::. : : :
CCDS41 S-SGQEDETQSSNDDPSQSVASQDAQEII-RPRR----CKYFDTNSEVEEESEEDEDYIP
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 -EDLRKEIMIGLQYQAEIPPYLGEYDGNEKVYENEDQLLWCPDVVLESKVKEYLVETSLR
:: .::::.: ..::::: . .: :::::::.::::: :. . :.:: .: ..: :
CCDS41 SEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIIFLKDASRR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 TGSEKIMDRISAGTHTRDNEQALYELLKCNHNIKEAIERYCCNGKASQEGMTAWTEEECR
::.:: .. : :.: .:::::::::.::: . .::..: : ::..: ...:::::::
CCDS41 TGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFNVKAAREELSVWTEEECR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 SFEHALMLFGKDFHLIQKNKVRTRTVAECVAFYYMWKKSERYDYFAQQTRFGKKRYNHHP
.::..: .:::::::: ::::::.:.::::::::::::::::.::::::::::.:: ::
CCDS41 NFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWKKSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 GVTDYMDRLVDETEALGGTVNASALTSNRPEPIPDQQLNILNSFTASDLTALTNSVATVC
:::::::::.::.: :: .: : : :
CCDS41 GVTDYMDRLLDESE--------SAASSRAPSPPPTASNSSNSQSEKEDGTVSTANQNGVS
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 DPTDVNCLDDSFPPLGNTPRGQVNHVPVVTEELLTLPSNGESDCFNLFETGFYHSELNPM
CCDS41 SNGPGILQMLLPVHFSAISSRANAFLK
410 420 430
>>CCDS41348.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 (512 aa)
initn: 1343 init1: 860 opt: 1296 Z-score: 1330.6 bits: 255.9 E(32554): 8.5e-68
Smith-Waterman score: 1333; 48.4% identity (68.0% similar) in 510 aa overlap (1-491:1-488)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAEASFGSSSPVGSLSSEDHDFDPTAEMLVHDYDDERTLEEEEMMDEGKNFSSEIEDLEK
::: : :::: :: .:.::.:::.:.:::::.::::::::::::. ::::::::: .
CCDS41 MAEPSVESSSPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE0 EGTMPLEDLLAFYGYEPTIPAVANSSANSSPSELADELPDMTLD---------KEEIAKD
:: ::...::..::: :. .. . : ... : : ::: ::
CCDS41 EGDMPIHELLSLYGYGSTVRLPEEDEEEEEEEEEGEDDEDADNDDNSGCSGENKEENIKD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KE0 LLSGDDEETQSSADDLTPSVTSHETSDFFPRPLRSNTACDG-DKESEVED-VETDSGNSP
::...::::: :: . ::.:....... :: : : : .::::. : : :
CCDS41 S-SGQEDETQSSNDDPSQSVASQDAQEII-RPRR----CKYFDTNSEVEEESEEDEDYIP
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 -EDLRKEIMIGLQYQAEIPPYLGEYDGNEKVYENEDQLLWCPDVVLESKVKEYLVETSLR
:: .::::.: ..::::: . .: :::::::.::::: :. . :.:: .: ..: :
CCDS41 SEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLPEDKVIIFLKDASRR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 TGSEKIMDRISAGTHTRDNEQALYELLKCNHNIKEAIERYCCNGKASQEGMTAWTEEECR
::.:: .. : :.: .:::::::::.::: . .::..: : ::..: ...:::::::
CCDS41 TGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFNVKAAREELSVWTEEECR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 SFEHALMLFGKDFHLIQKNKVRTRTVAECVAFYYMWKKSERYDYFAQQTRFGKKRYNHHP
.::..: .:::::::: ::::::.:.::::::::::::::::.::::::::::.:: ::
CCDS41 NFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWKKSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 GVTDYMDRLVDETEALGGTVNASALTSNRPEPIPDQQLNILNSFTASD----LTALTNSV
:::::::::.::.: :: .: : : : . : :: . .. :: :.:
CCDS41 GVTDYMDRLLDESE--------SAASSRAPSPPPTAS-NSSNSQSEKEDGTVSTANQNGV
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 ATVCDPTDV-NCLDDSFPPLG-NTPRGQVNHVPVVTEELLTLPSNG-ESDCFNLFETGFY
.. : .. : . . : : : : :. :. .. . .:: :.: .. . .
CCDS41 SS-NGPGEILNKEEVKVEGLHINGPTGG-NKKPLHAD----MDTNGYETDNLTT-DPKLA
410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 HSELNPMNMCSEESERPAKRLKMGIAVPESFMNEVSVNNLGVDFENHTHHITSAKMAVSV
: : .:.::::::: ... ::
CCDS41 HMTARNENDFDEKSERPAKRRRVNSNGKESPGSSEFFQEAVSHGKFEELENTDD
460 470 480 490 500 510
>>CCDS53327.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 (450 aa)
initn: 1284 init1: 860 opt: 1280 Z-score: 1315.1 bits: 252.8 E(32554): 6.2e-67
Smith-Waterman score: 1280; 53.7% identity (73.5% similar) in 389 aa overlap (3-382:20-397)
10 20 30 40
pF1KE0 MAEASFGSSSPVGSLSSEDHDFDPTAEMLVHDYDDERTLEEEE
. : :::: :: .:.::.:::.:.:::::.::::::::::
CCDS53 MFMFNWFTDCLWTLFLSNYQPSVESSSPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDERTLEEEE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 MMDEGKNFSSEIEDLEKEGTMPLEDLLAFYGYEPTIPAVANSSANSSPSELADELPDMTL
::. ::::::::: .:: ::...::..::: :. .. . : ... :
CCDS53 MMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYGSTVRLPEEDEEEEEEEEEGEDDEDADN
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110 120 130 140 150
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: ::: :: ::...::::: :: . ::.:....... :: : : ..
CCDS53 DDNSGCSGENKEENIKDS-SGQEDETQSSNDDPSQSVASQDAQEII-RP-RRCKYFDTNS
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 ESEVEDVETDSGNSPEDLRKEIMIGLQYQAEIPPYLGEYDGNEKVYENEDQLLWCPDVVL
: : :. : .. :: .::::.: ..::::: . .: :::::::.::::: :. .
CCDS53 EVEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLP
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220 230 240 250 260 270
pF1KE0 ESKVKEYLVETSLRTGSEKIMDRISAGTHTRDNEQALYELLKCNHNIKEAIERYCCNGKA
:.:: .: ..: :::.:: .. : :.: .:::::::::.::: . .::..: : ::
CCDS53 EDKVIIFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFNVKA
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280 290 300 310 320 330
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..: ...:::::::.::..: .:::::::: ::::::.:.::::::::::::::::.::
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340 350 360 370 380 390
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. : :::: :: .:.::.:::.:.:::::.::::::::::
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::. ::::::::: .:: ::...::..::: :. .. . : ... :
CCDS53 MMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYGSTVRLPEEDEEEEEEEEEGEDDEDADN
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pF1KE0 D---------KEEIAKDLLSGDDEETQSSADDLTPSVTSHETSDFFPRPLRSNTACDGDK
: ::: :: ::...::::: :: . ::.:....... :: : : ..
CCDS53 DDNSGCSGENKEENIKDS-SGQEDETQSSNDDPSQSVASQDAQEII-RP-RRCKYFDTNS
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160 170 180 190 200 210
pF1KE0 ESEVEDVETDSGNSPEDLRKEIMIGLQYQAEIPPYLGEYDGNEKVYENEDQLLWCPDVVL
: : :. : .. :: .::::.: ..::::: . .: :::::::.::::: :. .
CCDS53 EVEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPEYLP
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220 230 240 250 260 270
pF1KE0 ESKVKEYLVETSLRTGSEKIMDRISAGTHTRDNEQALYELLKCNHNIKEAIERYCCNGKA
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CCDS53 EDKVIIFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFNVKA
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 SQEGMTAWTEEECRSFEHALMLFGKDFHLIQKNKVRTRTVAECVAFYYMWKKSERYDYFA
..: ...:::::::.::..: .:::::::: ::::::.:.::::::::::::::::.::
CCDS53 AREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWKKSERYDFFA
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340 350 360 370 380 390
pF1KE0 QQTRFGKKRYNHHPGVTDYMDRLVDETEALGGTVNASALTSNRPEPIPDQQLNILNSFTA
::::::::.:: :::::::::::.::.: :: .: : : :
CCDS53 QQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESE--------SAASSRAPSPPPTASNSSNSQSEK
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pF1KE0 SDLTALTNSVATVCDPTDVNCLDDSFPPLGNTPRGQVNHVPVVTEELLTLPSNGESDCFN
CCDS53 EDGTVSTANQNGVSSNGPGEILNKEEVKVEGLHINGPTGILQMLLPVHFSAISSRANAFL
410 420 430 440 450 460
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. : :::: :: .:.::.:::.:.:::::.::::::::::
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50 60 70 80 90 100
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pF1KE0 D---------KEEIAKDLLSGDDEETQSSADDLTPSVTSHETSDFFPRPLRSNTACDG-D
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CCDS53 DDNSGCSGENKEENIKDS-SGQEDETQSSNDDPSQSVASQDAQEII-RPRR----CKYFD
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160 170 180 190 200 210
pF1KE0 KESEVED-VETDSGNSP-EDLRKEIMIGLQYQAEIPPYLGEYDGNEKVYENEDQLLWCPD
.::::. : : : :: .::::.: ..::::: . .: :::::::.::::: :.
CCDS53 TNSEVEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPE
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220 230 240 250 260 270
pF1KE0 VVLESKVKEYLVETSLRTGSEKIMDRISAGTHTRDNEQALYELLKCNHNIKEAIERYCCN
. :.:: .: ..: :::.:: .. : :.: .:::::::::.::: . .::..: :
CCDS53 YLPEDKVIIFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFN
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 GKASQEGMTAWTEEECRSFEHALMLFGKDFHLIQKNKVRTRTVAECVAFYYMWKKSERYD
::..: ...:::::::.::..: .:::::::: ::::::.:.::::::::::::::::
CCDS53 VKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWKKSERYD
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340 350 360 370 380 390
pF1KE0 YFAQQTRFGKKRYNHHPGVTDYMDRLVDETEALGGTVNASALTSNRPEPIPDQQLNILNS
.::::::::::.:: :::::::::::.::.: :: .: : : : . : ::
CCDS53 FFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESE--------SAASSRAPSPPPTAS-NSSNS
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. .. :: :.:.. : .. : . . : : : : :. :. .. .
CCDS53 QSEKEDGTVSTANQNGVSS-NGPGEILNKEEVKVEGLHINGPTGG-NKKPLHAD----MD
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.:: :.: .. . . : : .:.::::::: ... ::
CCDS53 TNGYETDNLTT-DPKLAHMTARNENDFDEKSERPAKRRRVNSNGKESPGSSEFFQEAVSH
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510 520 530 540 550
pF1KE0 FENHTHHITSAKMAVSVADFGSLSANETNGFISAHALHQHAALHSE
CCDS53 GKFEELENTDD
520
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:::::::::::. ::::::::: .:: ::...::..::: :. .. . :
CCDS53 DERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYGSTVRLPEEDEEEEEEEEE
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100 110 120 130 140
pF1KE0 ADELPDMTLD---------KEEIAKDLLSGDDEETQSSADDLTPSVTSHETSDFFPRPLR
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CCDS53 GEDDEDADNDDNSGCSGENKEENIKDS-SGQEDETQSSNDDPSQSVASQDAQEII-RPRR
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150 160 170 180 190 200
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: : .::::. : : : :: .::::.: ..::::: . .: :::::::
CCDS53 ----CKYFDTNSEVEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYEN
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210 220 230 240 250 260
pF1KE0 EDQLLWCPDVVLESKVKEYLVETSLRTGSEKIMDRISAGTHTRDNEQALYELLKCNHNIK
.::::: :. . :.:: .: ..: :::.:: .. : :.: .:::::::::.::: . .
CCDS53 DDQLLWDPEYLPEDKVIIFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTE
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270 280 290 300 310 320
pF1KE0 EAIERYCCNGKASQEGMTAWTEEECRSFEHALMLFGKDFHLIQKNKVRTRTVAECVAFYY
::..: : ::..: ...:::::::.::..: .:::::::: ::::::.:.:::::::
CCDS53 EALRRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYY
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330 340 350 360 370 380
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:::::::::.::::::::::.:: :::::::::::.::.: :: .: : : :
CCDS53 MWKKSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESE--------SAASSRAPSPPP
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390 400 410 420 430 440
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CCDS53 TASNSSNSQSEKEDGTVSTANQNGVSSNGPGILQMLLPVHFSAISSRANAFLK
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10 20 30
pF1KE0 MAEASFGSSSPVGSLSSEDHDFDPTAEMLVHDYD
: :::: :: .:.::.:::.:.:::::.:
CCDS53 RFSQCLAEFRTWLRTNWLRFNADKTDVMLPSVESSSPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFD
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40 50 60 70 80 90
pF1KE0 DERTLEEEEMMDEGKNFSSEIEDLEKEGTMPLEDLLAFYGYEPTIPAVANSSANSSPSEL
:::::::::::. ::::::::: .:: ::...::..::: :. .. . :
CCDS53 DERTLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYGSTVRLPEEDEEEEEEEEE
90 100 110 120 130 140
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pF1KE0 ADELPDMTLD---------KEEIAKDLLSGDDEETQSSADDLTPSVTSHETSDFFPRPLR
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CCDS53 GEDDEDADNDDNSGCSGENKEENIKDS-SGQEDETQSSNDDPSQSVASQDAQEII-RPRR
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150 160 170 180 190 200
pF1KE0 SNTACDG-DKESEVED-VETDSGNSP-EDLRKEIMIGLQYQAEIPPYLGEYDGNEKVYEN
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CCDS53 ----CKYFDTNSEVEEESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYEN
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 EDQLLWCPDVVLESKVKEYLVETSLRTGSEKIMDRISAGTHTRDNEQALYELLKCNHNIK
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CCDS53 DDQLLWDPEYLPEDKVIIFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTE
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 EAIERYCCNGKASQEGMTAWTEEECRSFEHALMLFGKDFHLIQKNKVRTRTVAECVAFYY
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CCDS53 EALRRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYY
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pF1KE0 MWKKSERYDYFAQQTRFGKKRYNHHPGVTDYMDRLVDETEALGGTVNASALTSNRPEPIP
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CCDS53 MWKKSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESE--------SAASSRAPSPPP
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390 400 410 420 430
pF1KE0 DQQLNILNSFTASD----LTALTNSVATVCDPTDV-NCLDDSFPPLG-NTPRGQVNHVPV
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CCDS53 TAS-NSSNSQSEKEDGTVSTANQNGVSS-NGPGEILNKEEVKVEGLHINGPTGG-NKKPL
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440 450 460 470 480 490
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CCDS53 HAD----MDTNGYETDNLTT-DPKLAHMTARNENDFDEKSERPAKRRRVNSNGKESPGSS
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pF1KE0 VSVNNLGVDFENHTHHITSAKMAVSVADFGSLSANETNGFISAHALHQHAALHSE
CCDS53 EFFQEAVSHGKFEELENTDD
550 560
550 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 08:20:48 2016 done: Fri Nov 4 08:20:49 2016
Total Scan time: 3.460 Total Display time: 0.120
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]