FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0026, 485 aa 1>>>pF1KE0026 485 - 485 aa - 485 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4600+/-0.0011; mu= 7.9695+/- 0.065 mean_var=170.6102+/-35.804, 0's: 0 Z-trim(109.3): 151 B-trim: 456 in 1/50 Lambda= 0.098191 statistics sampled from 10647 (10823) to 10647 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.708), E-opt: 0.2 (0.332), width: 16 Scan time: 3.350 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 ( 485) 3393 493.3 2.5e-139 CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 488) 1133 173.1 6e-43 CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 ( 471) 866 135.3 1.4e-31 CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 477) 847 132.6 9.3e-31 CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 ( 468) 844 132.1 1.2e-30 CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 ( 475) 830 130.2 4.9e-30 CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 481) 808 127.1 4.3e-29 CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 488) 802 126.2 7.8e-29 CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 516) 802 126.2 8.1e-29 CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 ( 465) 790 124.5 2.4e-28 CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11 ( 488) 762 120.5 4e-27 CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 ( 486) 757 119.8 6.5e-27 CCDS4676.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 395) 754 119.3 7.4e-27 CCDS31393.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 493) 751 119.0 1.2e-26 CCDS376.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1 ( 475) 743 117.8 2.5e-26 CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4 ( 468) 742 117.7 2.7e-26 CCDS41612.1 TRIM22 gene_id:10346|Hs108|chr11 ( 498) 724 115.2 1.7e-25 CCDS32220.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 500) 720 114.6 2.5e-25 CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 ( 503) 719 114.5 2.8e-25 CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 ( 474) 693 110.8 3.4e-24 CCDS4466.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5 ( 630) 653 105.2 2.1e-22 CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 ( 513) 647 104.3 3.3e-22 CCDS10498.1 MEFV gene_id:4210|Hs108|chr16 ( 781) 640 103.4 8.9e-22 CCDS475.1 ERMAP gene_id:114625|Hs108|chr1 ( 475) 621 100.6 4e-21 CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 518) 614 99.6 8.5e-21 CCDS4612.2 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 535) 609 98.9 1.4e-20 CCDS4611.1 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 584) 609 98.9 1.5e-20 CCDS31392.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 326) 604 98.0 1.6e-20 CCDS31394.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 347) 604 98.0 1.7e-20 CCDS31388.1 TRIM34 gene_id:445372|Hs108|chr11 ( 842) 609 99.1 2e-20 CCDS4678.1 TRIM26 gene_id:7726|Hs108|chr6 ( 539) 603 98.1 2.6e-20 CCDS4614.1 BTN1A1 gene_id:696|Hs108|chr6 ( 526) 587 95.8 1.2e-19 CCDS4465.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5 ( 518) 585 95.5 1.5e-19 CCDS4462.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 ( 511) 583 95.2 1.8e-19 CCDS47388.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 461) 577 94.3 2.9e-19 CCDS4608.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 513) 577 94.4 3.2e-19 CCDS6056.2 TRIM35 gene_id:23087|Hs108|chr8 ( 493) 568 93.1 7.5e-19 CCDS34654.1 TRIM50 gene_id:135892|Hs108|chr7 ( 487) 558 91.6 2e-18 CCDS56403.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 313) 543 89.4 6.3e-18 CCDS4607.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 407) 543 89.5 7.6e-18 CCDS4606.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 523) 543 89.6 9.1e-18 CCDS56405.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 ( 466) 512 85.1 1.8e-16 CCDS4613.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 ( 527) 512 85.2 1.9e-16 CCDS4460.2 BTNL9 gene_id:153579|Hs108|chr5 ( 535) 511 85.0 2.1e-16 CCDS44327.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 343) 507 84.3 2.3e-16 CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11 ( 449) 500 83.4 5.6e-16 CCDS4677.1 TRIM15 gene_id:89870|Hs108|chr6 ( 465) 500 83.4 5.7e-16 CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11 ( 449) 495 82.7 9.1e-16 CCDS5679.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 ( 500) 491 82.2 1.5e-15 CCDS73287.1 TRIM64C gene_id:646754|Hs108|chr11 ( 450) 482 80.9 3.3e-15 >>CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 (485 aa) initn: 3393 init1: 3393 opt: 3393 Z-score: 2614.8 bits: 493.3 E(32554): 2.5e-139 Smith-Waterman score: 3393; 100.0% identity (100.0% similar) in 485 aa overlap (1-485:1-485) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIPGESQNWGYTCPLC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIPGESQNWGYTCPLC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 RAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLKGDLCERHGEKLKMFCKEDVLIMCEAC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 RAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLKGDLCERHGEKLKMFCKEDVLIMCEAC 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 SQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQVETR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 SQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQVETR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 KQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSELIQQSQV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 KQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSELIQQSQV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 LWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCRVLGLREILKT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 LWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCRVLGLREILKT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 YAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLPDNPERFYRYNIVLGSQCISSGRHYW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 YAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLPDNPERFYRYNIVLGSQCISSGRHYW 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE0 EVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKGNEYRAGTDEYPILSLPVPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 EVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKGNEYRAGTDEYPILSLPVPP 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE0 RRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYFSPCYSIGTNNTAPLAICS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 RRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYFSPCYSIGTNNTAPLAICS 430 440 450 460 470 480 pF1KE0 LDGED ::::: CCDS31 LDGED >>CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 (488 aa) initn: 889 init1: 402 opt: 1133 Z-score: 884.5 bits: 173.1 E(32554): 6e-43 Smith-Waterman score: 1133; 38.1% identity (66.7% similar) in 480 aa overlap (5-478:18-481) 10 20 30 40 pF1KE0 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIP : .: . :..: .:. .:.::. :.:::.::..:.. : CCDS34 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWW--- 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE0 GESQNWGYTCPLCRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLKGDLCERHGEKLKM :. . . ::.:: . :.:::: ::...:: .. :. .:: .: : :.. CCDS34 -EDLERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSL 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE0 FCKEDVLIMCEACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGER :: :: .: :. : :.::.:::..:.. ::: .:.. :: :... .: . . .:. CCDS34 FCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEE 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE0 KRTATWKIQVETRKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKL :. . : ::.:.:.:. :::. ::.: : . :. :..: . .:.: CCDS34 KKPGELKRLVESRRQQILREFEEL----------HRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE0 ELNHSELIQQSQVLWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKT . : ..: .. . : .. ::.. . . ::.:.. .:.. .. . .. .:.::. CCDS34 RENAAHLGDKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEK 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE0 DC-----RVLGLREILKTYAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQK-LPDNPERF . . ..::.::: ::: :::.::. :..::::: :.. .: . :::.:.:: CCDS34 NFSNFPRQYFALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRF 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE0 YRYNIVLGSQCISSGRHYWEVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKG : ::... ..::::::::::::...:..:::...:.:: . :. :.: .:: .: CCDS34 TFYPCVLATEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNG 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE0 NEYRAGTDEYPILSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPY ..: : : . : . : :.:::::.:::: .::::::: :::.:: : .: : CCDS34 DKYAATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTD-RSHIYTFTD-TFTEKLWPL 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE0 FSPCYSIGTNNTAPLAICSLDGED : : : .:.:::.: CCDS34 FYPGIRAGRKNAAPLTIRPPTDWE 470 480 >>CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 (471 aa) initn: 845 init1: 402 opt: 866 Z-score: 680.3 bits: 135.3 E(32554): 1.4e-31 Smith-Waterman score: 872; 34.6% identity (62.7% similar) in 491 aa overlap (4-484:5-470) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIPGESQNWGYTCPL ::::. . :: .::::. .:..:..:.:::.::.:::: :. .. . ::. CCDS38 MEFVTALVN-LQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDLDDT----FPCPV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 CRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLK---GDLCERHGEKLKMFCKEDVLIM :: ...: : :: :..: .. :... . . . .::.:.. : .:: .:. :. CCDS38 CRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKDLEIL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 CEACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQ : :: : .:. : . :.. .: .. :. .:: :... :.. :. . . .... : . CCDS38 CTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVELKKK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 VETRKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSELIQ :: ... : :::. . .:...: : ..: : . . ::. : :: . CCDS38 VEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQE----------MILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSD 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 QSQVLWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCRVL---- ..: ... :.. .: . .: . . . . : .:. :: .:..: : CCDS38 YVSTLKHLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSM--HHKYQNLKCPELFSFRLTKYGFSLPPQY 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 -GLREILKTYAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLPDNPERFYRYNIVLGSQ :: .:.: . .:: :: .::. .:.:::::: :.: .... .:.::: ::::: CCDS38 SGLDRIIKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRYERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQ 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 CISSGRHYWEVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVI-RLRKGNEYRAGTDE .::::::::::::.. .: ::::.. . :. : :::.: : :.. .: CCDS38 RFSSGRHYWEVEVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKT 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE0 YPILSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYFSPCYSIGT .: . : : ..:::.::: :.::::..: : ..:: : . ::: :. :: CCDS38 TQLLPV-VKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMND-RSILYTFNDC-FTEAVWPYF---YT-GT 410 420 430 440 450 480 pF1KE0 NNTAPLAICSL-DGED . . :: :::. :.: CCDS38 D-SEPLKICSVSDSER 460 470 >>CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 (477 aa) initn: 978 init1: 270 opt: 847 Z-score: 665.7 bits: 132.6 E(32554): 9.3e-31 Smith-Waterman score: 1023; 36.6% identity (65.4% similar) in 494 aa overlap (1-481:1-471) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIP----GESQNWG-Y :. . :.. . ::..: ::. .. .:. :::.::..:.. :: :. . : . CCDS15 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 TCPLCRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLKGDLCERHGEKLKMFCKEDVLI :: :: ::: :: :..:.: . . :::. : :::..: : ::.::..: CCDS15 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAE---MAQQHPGLQ-KQDLCQEHHEPLKLFCQKDQSP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 MCEACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKI .: .: .: ::. : :.: :... :: .:.: .:.:... .. .:.. :.. : :. CCDS15 ICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 QVETRKQSIVWEFEKYQ-RLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSEL .:. :.. :: ::::.. :.:..: : : : :. : :: ..:. . . : CCDS15 KVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQ---RLLQA--------LETEEEETASRLRESVACL 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 IQQSQVLWRMIAELKERS-QRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPE--PISLELKTDCRV .:.. : .. .:.::: : :.. ::::..: :.:... :.: :: : . . .: ::: CCDS15 DRQGHSLELLLLQLEERSTQGPLQ-MLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPT-RPRTVCRV 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 LGLREILKTYAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLP-DNPERFYRYNIVLGS : :.:. . :: : .:: :.. :.:.: . :.. . . .:: : ..:. CCDS15 PGQIEVLRGFLEDVVPDATSAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQ 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 pF1KE0 QCISSGRHYWEVEV---GDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKGNEYRAG .::::::::: . :: . :.::::..::.::. : :. ::::..: ::..: . CCDS15 TAFSSGRHYWEVGMNITGD-ALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLST 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE0 TDEYPILSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYFSPCYS . . : :: ..:::.:.:: ..:::.:.: :::. :. . ::: : :.: : CCDS15 FSALTPVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSD-GSHLHTYSQATFPGPLQPFF--C-- 410 420 430 440 450 470 480 pF1KE0 IGTNNTAPLAICSLDGED .:. ... ..: .. CCDS15 LGAPKSGQMVISTVTMWVKG 460 470 >>CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 (468 aa) initn: 1173 init1: 572 opt: 844 Z-score: 663.5 bits: 132.1 E(32554): 1.2e-30 Smith-Waterman score: 1283; 42.7% identity (66.5% similar) in 483 aa overlap (1-483:1-459) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIPGESQNWGYTCPLC : : . ::..: ::. .. .:. ::::.::. :. : : . :.:: : CCDS31 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQP----EGPYACPEC 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 RAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLKGDLCERHGEKLKMFCKEDVLIMCEAC : :::::: ::...: .: :::: . .: : : : :: ... ..: :: CCDS31 RELSPQRNLRPNRPLAKMAEMAR--RLHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAAC 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 SQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQVETR .: :: :: : :..:.: . : .:...::::.:....: ... . . :. .::.. CCDS31 ERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQ 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 KQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSELIQQSQV .:... :::. .::: ... .:: : :..: :.. .:. . ..: ::: CCDS31 RQNVLGEFERLRRLLAEEE---QQL-------LQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAH 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 LWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCRVLGLREILKT : ..::::. : : :. .::::...: : .. .:: :: . .::.: ::: :: : :. CCDS31 LAELIAELEGRCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRR 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 YAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLPDNPERFYRYNIVLGSQCISSGRHYW . .:: :::::: .::.::::. :. :: : :::.:::: :::.. ..:::::: CCDS31 FRGDVTLDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYW 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KE0 EVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKGNEYRAGTDEYPILSLPVPP :::::::. :.::::..::.::: :: :::.. . :. : ...: . : :: CCDS31 EVEVGDRTSWALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFL-GSYY--NSSERALAPLRDPP 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 pF1KE0 RRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYFSPCYSIGTNNTAPLAICS ::::::.:::: .:::..:: :: .: ::. :: : : : ::: : . .:..:: CCDS31 RRVGIFLDYEAGHLSFYSATD-GSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSS----SPTPMTICR 410 420 430 440 450 pF1KE0 LDGED : CCDS31 PKGGSGDTLAPQ 460 >>CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 (475 aa) initn: 1300 init1: 777 opt: 830 Z-score: 652.7 bits: 130.2 E(32554): 4.9e-30 Smith-Waterman score: 1305; 42.9% identity (69.5% similar) in 482 aa overlap (1-482:1-466) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIPGESQNWGYTCPLC : .: . . :::.::::. . ::.::.::::::. :.: . ... : .::.: CCDS44 MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECISQV------GKGGGSVCPVC 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 RAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLKGDLCERHGEKLKMFCKEDVLIMCEAC : .::::: ::::.:.... . . : .:. : :::.:..::..: .: .: CCDS44 RQRFLLKNLRPNRQLANMVNNLKEISQEAREGTQGERCAVHGERLHLFCEKDGKALCWVC 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 SQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQVETR .:: .:. :..::.:..: ::. .:. :: .:...:: : :::: . : :: :::. CCDS44 AQSRKHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGELRRKQELAEKLEVEIAIKRADWKKTVETQ 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 KQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSELIQQSQV :. : :: . . .: ... .::: :... : .. : ....: ::::. CCDS44 KSRIHAEFVQQKNFLVEEE--QRQL--------QELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQA 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 LWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCRVLGLREILKT : ..:.:: .: . . .::.. ::.::.::.:.. . : ::.. :.: ::...:.: CCDS44 LQELISELDRRCHSSALELLQEVIIVLERSESWNLKDLDITSPELRSVCHVPGLKKMLRT 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 YAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLPDNPERFYRYNIVLGSQCISSGRHYW :. . :::::: ::.::::..:. :::.:..: : ::: : .:::.: . ::.::: CCDS44 CAVHITLDPDTANPWLILSEDRRQVRLGDTQQSIPGNEERFDSYPMVLGAQHFHSGKHYW 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KE0 EVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKGNEYRAGTDEYPILSLPVPP ::.: . : ::::...: :: :: . :::.: : . ..:.::: : : ::: CCDS44 EVDVTGKEAWDLGVCRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEAGTYPQTPLHLQVPP 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 pF1KE0 RRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYFSPCYSIGTNNTAPLAICS .::::.:::: .::::.:: :: :..: . : : : :.::: .. : .:::::..: CCDS44 CQVGIFLDYEAGMVSFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAPLTLCP 410 420 430 440 450 460 pF1KE0 LDGED :. CCDS44 LNIGSQGSTDY 470 >>CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 (481 aa) initn: 918 init1: 358 opt: 808 Z-score: 635.8 bits: 127.1 E(32554): 4.3e-29 Smith-Waterman score: 978; 34.2% identity (65.2% similar) in 485 aa overlap (1-462:1-468) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIPGESQNWGYTCPLC : .: : ....:: ::::. ::::..:::::.::..::. :::: . . . ::::: CCDS34 MASAASVTSLADEVNCPICQGTLREPVTIDCGHNFCRACLTRYCEIPGPDLEESPTCPLC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 RAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGL-KGDLCERHGEKLKMFCKEDVLIMCEA . : .: ..:::::::::::... :.: .:: . :.:..::::. .::..: . .: . CCDS34 KEPFRPGSFRPNWQLANVVENIERLQLVSTLGLGEEDVCQEHGEKIYFFCEDDEMQLCVV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 CSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQVET : .. :: .:.. .::.: :. ..:. :. :.::.:: ... : :: . :: : CCDS34 CREAGEHATHTMRFLEDAAAPYREQIHKCLKCLRKEREEIQEIQSRENKRMQVLLTQVST 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 RKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSELIQQSQ ..:... :: . ...::..: . ::.:. . .. ... .. .:. .. CCDS34 KRQQVISEFAHLRKFLEEQQ----------SILLAQLESQDGDILRQR--DEFDLLVAGE 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 V--LWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCR-----VL . . .: ::.:...::.: .: ::. .: : .. . ..: .: :: : .: CCDS34 ICRFSALIEELEEKNERPARELLTDIRSTLIRCETRKCRKPVAVSPELGQRIRDFPQQAL 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 pF1KE0 GLREILKTY-----------AADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLPDNPERF :.. .: . : . :::.:.. .:..:::..:.... :. ::::.:: CCDS34 PLQREMKMFLEKLCFELDYEPAHISLDPQTSHPKLLLSEDHQRAQFSYKWQNSPDNPQRF 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE0 YRYNIVLGSQCISSGRHYWEVEVGDRSEWG---LGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIRL : . ::. :..::: : : . : .. : .:: ...:.:: . : :. : :..:: CCDS34 DRATCVLAHTGITGGRHTWVVSI-DLAHGGSCTVGVVSEDVQRKGELRLRPEEGVWAVRL 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE0 RKGNEYRAGTDEYPI-LSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGR : . .. .: :.: ::.: . .:::. ..: :.. :.:: : . CCDS34 AWG--FVSALGSFPTRLTLKEQPRQVRVSLDYEVGWVTFTNAVT-REPIYTFTA-SFTRK 410 420 430 440 450 460 460 470 480 pF1KE0 LLPYFSPCYSIGTNNTAPLAICSLDGED ..:.: CCDS34 VIPFFGLWGRGSSFSLSS 470 480 >>CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 (488 aa) initn: 1112 init1: 582 opt: 802 Z-score: 631.1 bits: 126.2 E(32554): 7.8e-29 Smith-Waterman score: 1202; 38.8% identity (68.7% similar) in 492 aa overlap (1-468:1-478) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLS--GLWEIPGESQNWGYTCP : .::. : :::.::::. .: ::.:::::::::..:.. : . : :. .:: CCDS31 MTSPVLVD-IREEVTCPICLELLTEPLSIDCGHSFCQACITPNGRESVIG--QEGERSCP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 LCRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLKGDLCERHGEKLKMFCKEDVLIMCE .:.. :: ::::: .:::.:...: . : :: ::. :: :::::..::.:: ..: CCDS31 VCQTSYQPGNLRPNRHLANIVRRLREVVLGPGKQLKAVLCADHGEKLQLFCQEDGKVICW 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 ACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQVE : .: ::..: . .:.:: ::. ...:.:..::.:..:: :: . :.. ..:: :.: CCDS31 LCERSQEHRGHHTFLVEEVAQEYQEKFQESLKKLKNEEQEAEKLTAFIREKKTSWKNQME 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 TRKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSELIQQS .. : ::.. . .:.. . .:.: .:..: . .. .: ...:..:. CCDS31 PERCRIQTEFNQLRNILDRVE--QREL--------KKLEQEEKKGLRIIEEAENDLVHQT 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 QVLWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCRVLGLREIL : : ..:..:..: : . .:::...: .::. :.:..:: . .:.. :. :...: CCDS31 QSLRELISDLERRCQGSTMELLQDVSDVTERSEFWTLRKPEALPTKLRSMFRAPDLKRML 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 pF1KE0 K---------TYAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLPDNPERFYRYNIVLG . .: .:: :.: :: :.....:..:.. .. . :. :. : . ::: CCDS31 RVCRELTDVQSYWVDVTLNPHTANLNLVLAKNRRQVRFVGAKVSGPSCLEKHYDCS-VLG 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE0 SQCISSGRHYWEVEVGDRSEWGLGVCKQNV-----------DRKEVVYLSPHYGFWVIRL :: .:::.:::::.:. .. : ::::.... ... .:. :.::: : CCDS31 SQHFSSGKHYWEVDVAKKTAWILGVCSNSLGPTFSFNHFAQNHSAYSRYQPQSGYWVIGL 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE0 RKGNEYRAGTDEYP--ILSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPG ....:::: : : .::. :::::::.:.:::: .::::::. : :.:: .: :: CCDS31 QHNHEYRAYEDSSPSLLLSMTVPPRRVGVFLDYEAGTVSFYNVTNHGFPIYTFSKYYFPT 410 420 430 440 450 460 460 470 480 pF1KE0 RLLPYFSPCYSIGTNNTAPLAICSLDGED : :::.:: . CCDS31 TLCPYFNPCNCVIPMTLRRPSS 470 480 >>CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 (516 aa) initn: 1112 init1: 582 opt: 802 Z-score: 630.8 bits: 126.2 E(32554): 8.1e-29 Smith-Waterman score: 1202; 38.8% identity (68.7% similar) in 492 aa overlap (1-468:29-506) 10 20 30 pF1KE0 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCG : .::. : :::.::::. .: ::.::::: CCDS31 MCGSERILQAGNILEIRVGQAGARRVATMTSPVLVD-IREEVTCPICLELLTEPLSIDCG 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 90 pF1KE0 HSFCHSCLS--GLWEIPGESQNWGYTCPLCRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPG ::::..:.. : . : :. .::.:.. :: ::::: .:::.:...: . : :: CCDS31 HSFCQACITPNGRESVIG--QEGERSCPVCQTSYQPGNLRPNRHLANIVRRLREVVLGPG 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE0 MGLKGDLCERHGEKLKMFCKEDVLIMCEACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALE ::. :: :::::..::.:: ..: : .: ::..: . .:.:: ::. ...:.:. CCDS31 KQLKAVLCADHGEKLQLFCQEDGKVICWLCERSQEHRGHHTFLVEEVAQEYQEKFQESLK 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE0 HLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQVETRKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVA .::.:..:: :: . :.. ..:: :.: .. : ::.. . .:.. . .:.: CCDS31 KLKNEEQEAEKLTAFIREKKTSWKNQMEPERCRIQTEFNQLRNILDRVE--QREL----- 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE0 AALASLQREAAETMQKLELNHSELIQQSQVLWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRS .:..: . .. .: ...:..:.: : ..:..:..: : . .:::...: .:: CCDS31 ---KKLEQEEKKGLRIIEEAENDLVHQTQSLRELISDLERRCQGSTMELLQDVSDVTERS 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 pF1KE0 KSWSLQQPEPISLELKTDCRVLGLREILK---------TYAADVRLDPDTAYSRLIVSED . :.:..:: . .:.. :. :...:. .: .:: :.: :: :..... CCDS31 EFWTLRKPEALPTKLRSMFRAPDLKRMLRVCRELTDVQSYWVDVTLNPHTANLNLVLAKN 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 pF1KE0 RKRVHYGDTNQKLPDNPERFYRYNIVLGSQCISSGRHYWEVEVGDRSEWGLGVCKQNV-- :..:.. .. . :. :. : . ::::: .:::.:::::.:. .. : ::::.... CCDS31 RRQVRFVGAKVSGPSCLEKHYDCS-VLGSQHFSSGKHYWEVDVAKKTAWILGVCSNSLGP 350 360 370 380 390 400 380 390 400 410 420 pF1KE0 ---------DRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKGNEYRAGTDEYP--ILSLPVPPRRVGIFVD ... .:. :.::: :....:::: : : .::. :::::::.:.: CCDS31 TFSFNHFAQNHSAYSRYQPQSGYWVIGLQHNHEYRAYEDSSPSLLLSMTVPPRRVGVFLD 410 420 430 440 450 460 430 440 450 460 470 480 pF1KE0 YEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYFSPCYSIGTNNTAPLAICSLDGED ::: .::::::. : :.:: .: :: : :::.:: . CCDS31 YEAGTVSFYNVTNHGFPIYTFSKYYFPTTLCPYFNPCNCVIPMTLRRPSS 470 480 490 500 510 >>CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 (465 aa) initn: 1024 init1: 391 opt: 790 Z-score: 622.2 bits: 124.5 E(32554): 2.4e-28 Smith-Waterman score: 1023; 35.3% identity (67.3% similar) in 468 aa overlap (1-462:1-450) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIPGESQ--NWGYTCP : :. .. ..::..: ::.... .:.::.::::.:: :.. ... :...: . . :: CCDS45 MASTTSTKKMMEEATCSICLSLMTNPVSINCGHSYCHLCITDFFKNPSQKQLRQETFCCP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 LCRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLKGDLCERHGEKLKMFCKEDVLIMCE :::: . .:::: ::....: .. . :. ::.:::....::... ..: CCDS45 QCRAPFHMDSLRPNKQLGSLIEALK--ETDQEMS-----CEEHGEQFHLFCEDEGQLICW 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 ACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQVE : ..:.:..:... .::: :: .:..:. .::. ... . ... : . :: .:. CCDS45 RCERAPQHKGHTTALVEDVCQGYKEKLQKAVTKLKQLEDRCTEQKLSTAMRITKWKEKVQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 TRKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSELIQQS ..:.: .:.. : .:.... . : :..: .:...:. .. : .: CCDS45 IQRQKIRSDFKNLQCFLHEEEKSY----------LWRLEKEEQQTLSRLRDYEAGLGLKS 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 QVLWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCRV----LGL . : : ::.:. : .. .::.....:.:: . .:. : .::::.: : : . . CCDS45 NELKSHILELEEKCQGSAQKLLQNVNDTLSRSWAVKLETSEAVSLELHTMCNVSKLYFDV 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 REILKTYAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLPDNPERFYRYNIVLGSQCIS ...:... ..: ::::::. .::.::::..: : :... . .:: . ::: . .. CCDS45 KKMLRSHQVSVTLDPDTAHHELILSEDRRQVTRGYTQENQDTSSRRFTAFPCVLGCEGFT 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 SGRHYWEVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKGNEYRAGTDEYPIL :::.:.::.::. . : :::: .::.: . :. :::..:: : . : : :. : CCDS45 SGRRYFEVDVGEGTGWDLGVCMENVQRGTGMKQEPQSGFWTLRLCKKKGYVALTSPPTSL 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE0 SLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYFSPCYSIGTNNTA : : ::::.:::: .:::: . : ::::::. : : ::: CCDS45 HLHEQPLLVGIFLDYEAGVVSFYN-GNTGCHIFTFPKASFSDTLRPYFQVYQYSPLFLPP 410 420 430 440 450 460 480 pF1KE0 PLAICSLDGED CCDS45 PGD 485 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 07:59:13 2016 done: Fri Nov 4 07:59:14 2016 Total Scan time: 3.350 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]