FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0038, 702 aa 1>>>pF1KE0038 702 - 702 aa - 702 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7061+/-0.000534; mu= 23.9128+/- 0.033 mean_var=76.4644+/-15.539, 0's: 0 Z-trim(106.3): 96 B-trim: 77 in 1/52 Lambda= 0.146671 statistics sampled from 14297 (14393) to 14297 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.487), E-opt: 0.2 (0.169), width: 16 Scan time: 10.400 The best scores are: opt bits E(85289) NP_062818 (OMIM: 237450,605495) solute carrier org ( 702) 4628 990.0 0 NP_006437 (OMIM: 237450,604843) solute carrier org ( 691) 3735 801.0 0 NP_059131 (OMIM: 613389) solute carrier organic an ( 712) 2140 463.6 1.2e-129 XP_005253451 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 712) 2140 463.6 1.2e-129 XP_011519006 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 711) 2128 461.0 7.1e-129 NP_001139418 (OMIM: 613389) solute carrier organic ( 730) 2068 448.3 4.8e-125 XP_011519005 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 729) 2056 445.8 2.8e-124 XP_016874975 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 594) 1758 382.6 2.3e-105 XP_016874976 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 594) 1758 382.6 2.3e-105 XP_016874973 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 612) 1686 367.4 9.1e-101 XP_016874974 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 612) 1686 367.4 9.1e-101 XP_005253453 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 612) 1686 367.4 9.1e-101 NP_001139416 (OMIM: 613389) solute carrier organic ( 612) 1686 367.4 9.1e-101 XP_011519011 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 612) 1686 367.4 9.1e-101 XP_016874977 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 564) 1574 343.7 1.2e-93 XP_011519013 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 564) 1574 343.7 1.2e-93 XP_016874978 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 545) 1554 339.4 2.1e-92 XP_016874979 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 545) 1554 339.4 2.1e-92 NP_001139417 (OMIM: 613389) solute carrier organic ( 663) 1417 310.5 1.3e-83 XP_005253534 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 650) 1410 309.0 3.6e-83 XP_011519122 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 668) 1410 309.1 3.7e-83 NP_066580 (OMIM: 602883) solute carrier organic an ( 670) 1410 309.1 3.7e-83 XP_011519120 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 670) 1410 309.1 3.7e-83 XP_011519121 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 670) 1410 309.1 3.7e-83 NP_602307 (OMIM: 602883) solute carrier organic an ( 670) 1410 309.1 3.7e-83 XP_005253531 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 670) 1410 309.1 3.7e-83 NP_037404 (OMIM: 612435) solute carrier organic an ( 710) 1399 306.8 1.9e-82 NP_001138516 (OMIM: 612435) solute carrier organic ( 692) 1395 305.9 3.4e-82 XP_005254946 (OMIM: 612435) PREDICTED: solute carr ( 697) 1395 305.9 3.4e-82 XP_011519758 (OMIM: 612435) PREDICTED: solute carr ( 652) 1370 300.6 1.3e-80 XP_016875339 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 578) 1350 296.3 2.2e-79 XP_016875338 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 598) 1350 296.3 2.3e-79 XP_005254948 (OMIM: 612435) PREDICTED: solute carr ( 595) 1165 257.2 1.4e-67 XP_016869372 (OMIM: 613543) PREDICTED: solute carr ( 687) 959 213.6 2e-54 NP_001139480 (OMIM: 613543) solute carrier organic ( 687) 959 213.6 2e-54 NP_112220 (OMIM: 613543) solute carrier organic an ( 848) 959 213.7 2.3e-54 XP_011519123 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 362) 889 198.5 3.7e-50 XP_011541674 (OMIM: 609013) PREDICTED: solute carr ( 586) 708 160.5 1.7e-38 XP_011541672 (OMIM: 609013) PREDICTED: solute carr ( 636) 708 160.5 1.9e-38 NP_851322 (OMIM: 609013) solute carrier organic an ( 724) 708 160.6 2e-38 NP_001138683 (OMIM: 604988) solute carrier organic ( 687) 695 157.8 1.3e-37 NP_009187 (OMIM: 604988) solute carrier organic an ( 709) 695 157.8 1.3e-37 XP_016872646 (OMIM: 604988) PREDICTED: solute carr ( 711) 695 157.8 1.3e-37 NP_005621 (OMIM: 601460,614441) solute carrier org ( 643) 672 152.9 3.7e-36 XP_016862565 (OMIM: 601460,614441) PREDICTED: solu ( 597) 658 149.9 2.7e-35 XP_016862564 (OMIM: 601460,614441) PREDICTED: solu ( 653) 658 149.9 2.9e-35 XP_016869373 (OMIM: 613543) PREDICTED: solute carr ( 554) 634 144.8 8.7e-34 XP_016869374 (OMIM: 613543) PREDICTED: solute carr ( 544) 600 137.6 1.3e-31 XP_011541455 (OMIM: 613365) PREDICTED: solute carr ( 445) 563 129.7 2.5e-29 XP_011541452 (OMIM: 613365) PREDICTED: solute carr ( 476) 563 129.7 2.6e-29 >>NP_062818 (OMIM: 237450,605495) solute carrier organic (702 aa) initn: 4628 init1: 4628 opt: 4628 Z-score: 5293.8 bits: 990.0 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4628; 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XP_011 SGIVGRCQKDNGCPQMFLYFLVISVITSYTLSLGGIPGYILLLRCIKPQLKSFALGIYTL 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KE0 VIRTLGGILAPIYFGALIDKTCMKWSTNSCGAQGACRIYNSVFFGRVYLGLSIALRFPAL .::.:: : ::.:::.::: .:.::. . ::..:.::.:.: : XP_011 AIRVLG-IPAPVYFGVLIDTSCLKWGFKRCGSRGSCRLYDSNVFRYQIKSIPASHCYSIP 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 690 pF1KE0 VLYIVFIFAMKKKFQGKDTKASDNERKVMDEANLEFLNNGEHFVPSAGTDSKTCNLDMQD XP_011 DLHNATDTNKFSCHFTACKTYISGTNCDTGHSVNSPKHCSTFHFKEKLCFKTQKFYNQER 660 670 680 690 700 710 >>XP_016874975 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carrier (594 aa) initn: 1773 init1: 1081 opt: 1758 Z-score: 2012.6 bits: 382.6 E(85289): 2.3e-105 Smith-Waterman score: 1758; 43.7% identity (76.8% similar) in 570 aa overlap (104-666:1-565) 80 90 100 110 120 130 pF1KE0 EIGNLLVIVFVSYFGSKLHRPKLIGIGCLLMGTGSILTSLPHFFMGYYRYSKETHINPSE ::.:..: ..:.::: :.: . .:: XP_016 MGVGTLLIAMPQFFMEQYKYER---YSPSS 10 20 140 150 160 170 180 pF1KE0 NSTSSLSTCLINQT----LSFNGTSPEIVEKDCVKESGSHMWIYVFMGNMLRGIGETPIV ::: :.: ::.... .: : . ..: ...: ::::::.::.::::::::: XP_016 NSTLSISPCLLESSSQLPVSVMEKSKSKISNECEVDTSSSMWIYVFLGNLLRGIGETPIQ 30 40 50 60 70 80 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 PLGISYIDDFAKEGHSSLYLGSLNAIGMIGPVIGFALGSLFAKMYVDIGYVDLSTIRITP ::::.:.::::.: ....:.: ......:::..:: :::: ::.:::::.:.:. : ::: XP_016 PLGIAYLDDFASEDNAAFYIGCVQTVAIIGPIFGFLLGSLCAKLYVDIGFVNLDHITITP 90 100 110 120 130 140 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 KDSRWVGAWWLGFLVSGLFSIISSIPFFFLPKN-PNKPQKERKISLSLHVLKTNDDRNQT :: .::::::::.:..:..:.....::..:::. : . ..: . : : . :: .: XP_016 KDPQWVGAWWLGYLIAGIISLLAAVPFWYLPKSLPRSQSREDSNSSSEKSKFIIDD--HT 150 160 170 180 190 200 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 ANLTNQGKN--VTKNVTGFFQSLKSILTNPLYVIFLLLTLLQVSSFIGSFTYVFKYMEQQ : ::.: . . . :. :::... ::.: ..: . .: .:..: :: ::.::: XP_016 DYQTPQGENAKIMEMARDFLPSLKNLFGNPVYFLYLCTSTVQFNSLFGMVTYKPKYIEQQ 210 220 230 240 250 260 370 380 390 400 410 420 pF1KE0 YGQSASHANFLLGIITIPTVATGMFLGGFIIKKFKLSLVGIAKFSFLTSMISFLFQLLYF ::::.:.:::..:.:.::.:: :.: ::...:::..:. : ::. . .:....:. : : XP_016 YGQSSSRANFVIGLINIPAVALGIFSGGIVMKKFRISVCGAAKLYLGSSVFGYLLFLSLF 270 280 290 300 310 320 430 440 450 460 470 480 pF1KE0 PLICESKSVAGLTLTYDGNNSVASHVDVPLSYCNSECNCDESQWEPVCGNNGITYLSPCL : ::...:::::..:.:.. :. : . .: :::.:.:.:..:::.::.:::::.: :: XP_016 ALGCENSDVAGLTVSYQGTKPVSYHERALFSDCNSRCKCSETKWEPMCGENGITYVSACL 330 340 350 360 370 380 490 500 510 520 530 540 pF1KE0 AGCKSSSGIKKHTVFYNCSCVEVTGLQNRNYSAHLGECPRDNTCTRKFFIYVAIQVINSL :::..:. :. .::::.:: ... .. : :. .:.: .:: : . :. ...:.::.: XP_016 AGCQTSNRSGKNIIFYNCTCVGIAASKSGNSSGIVGRCQKDNGCPQMFLYFLVISVITSY 390 400 410 420 430 440 550 560 570 580 590 600 pF1KE0 FSATGGTTFILLTVKIVQPELKALAMGFQSMVIRTLGGILAPIYFGALIDKTCMKWSTNS . :: .: .. ..:.::..:.:. ...::.:.:: ::.:::.::: .:.::. . 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