FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0046, 639 aa 1>>>pF1KE0046 639 - 639 aa - 639 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0292+/-0.000368; mu= 9.0297+/- 0.023 mean_var=181.2110+/-36.033, 0's: 0 Z-trim(120.7): 18 B-trim: 650 in 2/52 Lambda= 0.095276 statistics sampled from 36326 (36345) to 36326 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.749), E-opt: 0.2 (0.426), width: 16 Scan time: 13.140 The best scores are: opt bits E(85289) XP_005259037 (OMIM: 616582) PREDICTED: lipolysis-s ( 648) 1013 151.6 8.3e-36 NP_991403 (OMIM: 616582) lipolysis-stimulated lipo ( 649) 1005 150.5 1.8e-35 NP_001247418 (OMIM: 616582) lipolysis-stimulated l ( 629) 792 121.2 1.1e-26 XP_011525328 (OMIM: 616582) PREDICTED: lipolysis-s ( 600) 564 89.8 3e-17 XP_005259039 (OMIM: 616582) PREDICTED: lipolysis-s ( 580) 512 82.7 4.1e-15 NP_991404 (OMIM: 616582) lipolysis-stimulated lipo ( 581) 512 82.7 4.1e-15 NP_057009 (OMIM: 616582) lipolysis-stimulated lipo ( 630) 453 74.6 1.2e-12 NP_001186728 (OMIM: 609646,609739) immunoglobulin- ( 546) 385 65.2 7e-10 XP_011511040 (OMIM: 609646,609739) PREDICTED: immu ( 525) 369 63.0 3.1e-09 NP_001247419 (OMIM: 616582) lipolysis-stimulated l ( 541) 365 62.4 4.7e-09 XP_011511041 (OMIM: 609646,609739) PREDICTED: immu ( 367) 319 56.0 2.8e-07 NP_787120 (OMIM: 609646,609739) immunoglobulin-lik ( 502) 319 56.1 3.5e-07 XP_005247446 (OMIM: 609646,609739) PREDICTED: immu ( 514) 319 56.1 3.6e-07 NP_001186729 (OMIM: 609646,609739) immunoglobulin- ( 457) 254 47.1 0.00016 >>XP_005259037 (OMIM: 616582) PREDICTED: lipolysis-stimu (648 aa) initn: 1096 init1: 789 opt: 1013 Z-score: 763.8 bits: 151.6 E(85289): 8.3e-36 Smith-Waterman score: 1240; 39.1% identity (62.7% similar) in 617 aa overlap (2-584:70-632) 10 20 30 pF1KE0 MDRVLLRWISL-FWLTAMVEGLQVTVPDKKK : :.. :. : : :: ....:::: . . 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XP_005 RARRAQTAAMALLAGGLSRGLGSHPAAAGRDAVVFVWLLLSTWCTAPARAIQVTVSNPYH 40 50 60 70 80 90 40 50 60 70 80 pF1KE0 VAMLFQPTVLRCHFSTSSH--QPAVVQWKFKSYCQDRMGESLGMSSTRAQ---SLSKRNL :..::::..: : .. .: :: :. ::.::.:.::...... .:. : .:. : XP_005 VVILFQPVTLPCTYQMTSTPTQPIVI-WKYKSFCRDRIADAFSPASVDNQLNAQLAAGNP 100 110 120 130 140 150 90 100 110 120 130 140 pF1KE0 EWDPYLDCLDSRRTVRVVASKQGSTVTLGDFYRGREITIVHDADLQIGKLMWGDSGLYYC ..::..: :: :::::::.:::..:::::.:.::.:::. .::: . . :::::.::: XP_005 GYNPYVECQDSVRTVRVVATKQGNAVTLGDYYQGRRITITGNADLTFDQTAWGDSGVYYC 160 170 180 190 200 210 150 160 170 180 190 200 pF1KE0 IITTPDDLEGKNEDSVELLVLGRTGLLADLLPSFAVEIMPEWVFVGLVLLGVFLFFVLVG ... .::.:.:: .::.:: .. : :. .: . . XP_005 SVVSAQDLQGNNEAYAELIVLVYAAGKA------ATSGVPS---------------IYAP 220 230 240 250 210 220 230 240 250 260 pF1KE0 ICWCQCCPHSCCCYVRCPCCPDSCCCPQALYEAGKAAKAGYPPSVSGVPGPYSIPSVPLG . . : .. : : : :. : : . ::: .: :: . : : XP_005 STYAHLSP------AKTP--P-----PPAMIPMGPAYN-GYP---GGYPGDVDRSSSA-G 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KE0 GAPSSGMLMDKPHPPPLAPSDSTGGSHSVRKGYRIQADKERDSMKVLYYVEKELAQFDPA : : . : : .::. . :::.::::::... :::.::::.:::::.:::. XP_005 GQGS--------YVPLLRDTDSSVA--SVRSGYRIQASQQDDSMRVLYYMEKELANFDPS 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KE0 RRM--RGRYNNTISELSSLHEEDSNFRQSFHQMRSKQFPVSGDLESNPDYWSGVMGGSSG : :: . ..::..::::.: : : :. . : : : :: : XP_005 RPGPPSGRVERAMSEVTSLHEDDWRSRPS----RGPALTPIRDEE-----W----GGHSP 350 360 370 380 390 390 400 410 420 430 440 pF1KE0 AS-RGPSAMEYNKEDRESFRHSQPRSKSEMLSRKNFATGVPAVSMDELA--AFADSYGQR : :: . .. ..: .::..: : : .:.:. . :.: :.: XP_005 RSPRGWDQEPAREQAGGGWRARRPRARS-----------VDA--LDDLTPPSTAES-GSR 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KE0 PRRADGNSHEARGGSRFERSESRAHSGFYQDDSLEEYYGQRSRSREPLTDADRGWAFSPA ..:. .: : ::... .:..:. ... :::.: : : . XP_005 SPTSNGGRSRAYMPPR-----SRSRDDLYDQDDSRDF----PRSRDPHYDDFR------S 450 460 470 480 510 520 530 540 550 pF1KE0 RRRPAEDAHLPRLVSRTP--GTAPKYDHSYLGSARERQARPEGASRGGSLETPSKRSAQL :.:: : . . .: : . . . : : : :. .: .:. . . : :. . XP_005 RERPPADPRSHHHRTRDPRDNGSRSGDLPYDGRLLEEAVRKKGSEE---RRRPHKEEEE- 490 500 510 520 530 540 560 570 580 590 600 610 pF1KE0 GPRSASYYAWSPPGTYKAGSSQDDQEDASDDALPPYSELELTRGPSYRGRDLPYHSNSEK .:: .:: :. .:: ..: XP_005 ----EAYYPPAPP-PYSETDSQASRERRLKKNLALSRESLVV 550 560 570 580 >>NP_991404 (OMIM: 616582) lipolysis-stimulated lipoprot (581 aa) initn: 681 init1: 330 opt: 512 Z-score: 392.3 bits: 82.7 E(85289): 4.1e-15 Smith-Waterman score: 736; 32.9% identity (56.2% similar) in 596 aa overlap (2-584:70-565) 10 20 30 pF1KE0 MDRVLLRWISL-FWLTAMVEGLQVTVPDKKK : :.. :. : : :: ....:::: . . 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NP_991 SVVSAQDLQGNNEAYAELIVLVYAAGKA------ATSGVPS---------------IYAP 220 230 240 250 210 220 230 240 250 260 pF1KE0 ICWCQCCPHSCCCYVRCPCCPDSCCCPQALYEAGKAAKAGYPPSVSGVPGPYSIPSVPLG . . : .. : : : :. : : . ::: .: :: . : : NP_991 STYAHLSP------AKTP--P-----PPAMIPMGPAYN-GYP---GGYPGDVDRSSSA-G 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KE0 GAPSSGMLMDKPHPPPLAPSDSTGGSHSVRKGYRIQADKERDSMKVLYYVEKELAQFDPA : : . : : .::. .:. ::.::::::... :::.::::.:::::.:::. NP_991 GQGS--------YVPLLRDTDSSVASE-VRSGYRIQASQQDDSMRVLYYMEKELANFDPS 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KE0 RRM--RGRYNNTISELSSLHEEDSNFRQSFHQMRSKQFPVSGDLESNPDYWSGVMGGSSG : :: . ..::..::::.: : : :. . : : : :: : NP_991 RPGPPSGRVERAMSEVTSLHEDDWRSRPS----RGPALTPIRDEE-----W----GGHSP 360 370 380 390 390 400 410 420 430 440 pF1KE0 AS-RGPSAMEYNKEDRESFRHSQPRSKSEMLSRKNFATGVPAVSMDELA--AFADSYGQR : :: . .. ..: .::..: : : .:.:. . :.: :.: NP_991 RSPRGWDQEPAREQAGGGWRARRPRARS-----------VDA--LDDLTPPSTAES-GSR 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KE0 PRRADGNSHEARGGSRFERSESRAHSGFYQDDSLEEYYGQRSRSREPLTDADRGWAFSPA ..:. .: : ::... .:..:. ... :::.: : : . NP_991 SPTSNGGRSRAYMPPR-----SRSRDDLYDQDDSRDF----PRSRDPHYDDFR------S 450 460 470 480 510 520 530 540 550 pF1KE0 RRRPAEDAHLPRLVSRTP--GTAPKYDHSYLGSARERQARPEGASRGGSLETPSKRSAQL :.:: : . . .: : . . . : : : :. .: .:. . . : :. . NP_991 RERPPADPRSHHHRTRDPRDNGSRSGDLPYDGRLLEEAVRKKGSEE---RRRPHKEEEE- 490 500 510 520 530 540 560 570 580 590 600 610 pF1KE0 GPRSASYYAWSPPGTYKAGSSQDDQEDASDDALPPYSELELTRGPSYRGRDLPYHSNSEK .:: .:: :. .:: ..: NP_991 ----EAYYPPAPP-PYSETDSQASRERRLKKNLALSRESLVV 550 560 570 580 >>NP_057009 (OMIM: 616582) lipolysis-stimulated lipoprot (630 aa) initn: 727 init1: 415 opt: 453 Z-score: 348.0 bits: 74.6 E(85289): 1.2e-12 Smith-Waterman score: 1148; 37.8% identity (60.6% similar) in 617 aa overlap (2-584:70-614) 10 20 30 pF1KE0 MDRVLLRWISL-FWLTAMVEGLQVTVPDKKK : :.. :. : : :: ....:::: . . NP_057 RARRAQTAAMALLAGGLSRGLGSHPAAAGRDAVVFVWLLLSTWCTAPARAIQVTVSNPYH 40 50 60 70 80 90 40 50 60 70 80 pF1KE0 VAMLFQPTVLRCHFSTSSH--QPAVVQWKFKSYCQDRMGESLGMSSTRAQ---SLSKRNL :..::::..: : .. .: :: :. ::.::.:.::...... .:. : .:. : NP_057 VVILFQPVTLPCTYQMTSTPTQPIVI-WKYKSFCRDRIADAFSPASVDNQLNAQLAAGNP 100 110 120 130 140 150 90 100 110 120 130 140 pF1KE0 EWDPYLDCLDSRRTVRVVASKQGSTVTLGDFYRGREITIVHDADLQIGKLMWGDSGLYYC ..::..: :: :::::::.:::..:::::.:.::.:::. .::: . . :::::.::: NP_057 GYNPYVECQDSVRTVRVVATKQGNAVTLGDYYQGRRITITGNADLTFDQTAWGDSGVYYC 160 170 180 190 200 210 150 160 170 180 190 200 pF1KE0 IITTPDDLEGKNEDSVELLVLGRTGLLADLLPSFAVEIMPEWVFVGLVLLGVFLFFVLVG ... .::.:.:: .::.:: .:.:: .: :..::.:.:.: NP_057 SVVSAQDLQGNNEAYAELIVL-------------------DWLFVVVVCLAAFLIFLLLG 220 230 240 250 210 220 230 240 250 pF1KE0 ICWCQCCPHSCCCYVRCPCCPDSCCCPQALYEAGKAAKAGYP----PSVSG-------VP :::::::::.::::::::::::.::::.::: ::::: .: : ::. . : NP_057 ICWCQCCPHTCCCYVRCPCCPDKCCCPEALYAAGKAATSGVPSIYAPSTYAHLSPAKTPP 260 270 280 290 300 310 260 270 280 290 300 pF1KE0 GPYSIPSVPL-----GGAP-----SSGMLMDKPHPPPLAPSDSTGGSHSVRKGYRIQADK : :: : :: : ::. . . : : .::. .:. ::.::::::.. NP_057 PPAMIPMGPAYNGYPGGYPGDVDRSSSAGGQGSYVPLLRDTDSSVASE-VRSGYRIQASQ 320 330 340 350 360 370 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 ERDSMKVLYYVEKELAQFDPARRM--RGRYNNTISELSSLHEEDSNFRQSFHQMRSKQFP . :::.::::.:::::.:::.: :: . ..::..::::.: : : :. . NP_057 QDDSMRVLYYMEKELANFDPSRPGPPSGRVERAMSEVTSLHEDDWRSRPS----RGPALT 380 390 400 410 420 430 370 380 390 400 410 420 pF1KE0 VSGDLESNPDYWSGVMGGSSGAS-RGPSAMEYNKEDRESFRHSQPRSKSEMLSRKNFATG : : : :: : : :: . .. ..: .::..: NP_057 PIRDEE-----W----GGHSPRSPRGWDQEPAREQAGGGWRARRPRARS----------- 440 450 460 470 430 440 450 460 470 pF1KE0 VPAVSMDELA--AFADSYGQRPRRADGNSHEARGGSRFERSESRAHSGFYQDDSLEEYYG : : .:.:. . :.: :.: ..:. .: : ::... .:..:. ... NP_057 VDA--LDDLTPPSTAES-GSRSPTSNGGRSRAYMPPR-----SRSRDDLYDQDDSRDF-- 480 490 500 510 520 480 490 500 510 520 530 pF1KE0 QRSRSREPLTDADRGWAFSPARRRPAEDAHLPRLVSRTP--GTAPKYDHSYLGSARERQA :::.: : : .:.:: : . . .: : . . . : : : :. . NP_057 --PRSRDPHYDDFR------SRERPPADPRSHHHRTRDPRDNGSRSGDLPYDGRLLEEAV 530 540 550 560 570 540 550 560 570 580 590 pF1KE0 RPEGASRGGSLETPSKRSAQLGPRSASYYAWSPPGTYKAGSSQDDQEDASDDALPPYSEL : .:. . . : :. . .:: .:: :. .:: ..: NP_057 RKKGSEE---RRRPHKEEEE-----EAYYPPAPP-PYSETDSQASRERRLKKNLALSRES 580 590 600 610 620 600 610 620 630 pF1KE0 ELTRGPSYRGRDLPYHSNSEKKRKKEPAKKTNDFPTRMSLVV NP_057 LVV 630 >>NP_001186728 (OMIM: 609646,609739) immunoglobulin-like (546 aa) initn: 463 init1: 315 opt: 385 Z-score: 298.4 bits: 65.2 E(85289): 7e-10 Smith-Waterman score: 734; 30.3% identity (53.5% similar) in 585 aa overlap (8-548:10-544) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MDRVLLRWISLF-WLTAMVEGLQVTVPDKKKVAMLFQPTVLRCHFSTSSH-QPAVVQW :. : :: : .: ::: .. . :: .:.: ..::.. : .:: : NP_001 MAWPKLPAPWLLLCTWLPAGCLSLLVTVQHTERYVTLFASIILKCDYTTSAQLQDVVVTW 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 KFKSYCQDRMGESLGMSSTRAQSLSKRNLEWDPYLDCLDSRRTVRVVASKQGSTV-TLGD .:::.:.: . . . : : ::.. :: :: :..: ::.::...:.. .:: NP_001 RFKSFCKDPIFDYYSASYQAALSLGQ-----DPSNDCNDNQREVRIVAQRRGQNEPVLGV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 FYRGREITIVHDADLQIGKLMWGDSGLYYCIITTPDDLEGKNEDSVELLVLGRTGLLADL :: :.::: . ::: :...:: : :.::: : .: : : . :.:.:: NP_001 DYRQRKITIQNRADLVINEVMWWDHGVYYCTIEAPGDTSGDPDKEVKLIVL--------- 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 LPSFAVEIMPEWVFVGLVLLGVFLFFVLVGICWCQCCPHSCCCYVRCPCCPDSCCCPQAL .:. : ...::..:...:.:.:::::::. ::::.:::::: ::::. 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NP_001 GPKSWALERRELDPSWSGRHRSSRLNGSPIHWSDRDSLSDVPSSSEARWRPSHPPFRSRC 390 400 410 420 430 440 440 450 460 470 480 490 pF1KE0 GQRPRRADGNSHEARGGSRFERSESRAHSGFYQD--DSLEEYYGQRSRSREPLT-DADRG .:::: . : : : : : .. ..: . ..... :.: . : : NP_001 QERPRRPSPRESTQRHGRR------RRHRSYSPPLPSGLSSWSSEEDKERQPQSWRAHRR 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 pF1KE0 WAFSPARRRPAEDAHLPRLVSRTPGTAPKYDHSYLGSARERQARPEGASRGGSLETPSKR . :: . : : : .. ::: . ::. ::... ... : :. NP_001 GSHSP--HWPEEKPPSYRSLDITPGKNSRKK----GSV-ERRSEKDSSHSGRSVVI 500 510 520 530 540 560 570 580 590 600 610 pF1KE0 SAQLGPRSASYYAWSPPGTYKAGSSQDDQEDASDDALPPYSELELTRGPSYRGRDLPYHS >>XP_011511040 (OMIM: 609646,609739) PREDICTED: immunogl (525 aa) initn: 463 init1: 315 opt: 369 Z-score: 286.7 bits: 63.0 E(85289): 3.1e-09 Smith-Waterman score: 728; 30.7% identity (53.6% similar) in 550 aa overlap (8-519:10-520) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MDRVLLRWISLF-WLTAMVEGLQVTVPDKKKVAMLFQPTVLRCHFSTSSH-QPAVVQW :. : :: : .: ::: .. . :: .:.: ..::.. : .:: : XP_011 MAWPKLPAPWLLLCTWLPAGCLSLLVTVQHTERYVTLFASIILKCDYTTSAQLQDVVVTW 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 KFKSYCQDRMGESLGMSSTRAQSLSKRNLEWDPYLDCLDSRRTVRVVASKQGSTV-TLGD .:::.:.: . . . : : ::.. :: :: :..: ::.::...:.. .:: XP_011 RFKSFCKDPIFDYYSASYQAALSLGQ-----DPSNDCNDNQREVRIVAQRRGQNEPVLGV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 FYRGREITIVHDADLQIGKLMWGDSGLYYCIITTPDDLEGKNEDSVELLVLGRTGLLADL :: :.::: . ::: :...:: : :.::: : .: : : . :.:.:: XP_011 DYRQRKITIQNRADLVINEVMWWDHGVYYCTIEAPGDTSGDPDKEVKLIVL--------- 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 LPSFAVEIMPEWVFVGLVLLGVFLFFVLVGICWCQCCPHSCCCYVRCPCCPDSCCCPQAL .:. : ...::..:...:.:.:::::::. ::::.:::::: ::::. 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