FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0047, 753 aa 1>>>pF1KE0047 753 - 753 aa - 753 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4903+/-0.000443; mu= 20.5663+/- 0.028 mean_var=96.5258+/-19.226, 0's: 0 Z-trim(112.8): 87 B-trim: 380 in 1/52 Lambda= 0.130543 statistics sampled from 21816 (21904) to 21816 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.257), width: 16 Scan time: 10.720 The best scores are: opt bits E(85289) NP_006230 (OMIM: 602256) serine/threonine-protein ( 753) 5054 963.0 0 XP_011530341 (OMIM: 602256) PREDICTED: serine/thre ( 753) 5054 963.0 0 NP_689412 (OMIM: 300109) serine/threonine-protein ( 591) 1106 219.4 3.5e-56 XP_005274610 (OMIM: 300109) PREDICTED: serine/thre ( 653) 1106 219.4 3.7e-56 NP_006231 (OMIM: 300109) serine/threonine-protein ( 653) 1106 219.4 3.7e-56 NP_689410 (OMIM: 300109) serine/threonine-protein ( 625) 1105 219.2 4.1e-56 XP_016885101 (OMIM: 300109) PREDICTED: serine/thre ( 563) 926 185.5 5.4e-46 NP_006238 (OMIM: 600658) serine/threonine-protein ( 499) 563 117.0 1.9e-25 XP_016882424 (OMIM: 600658) PREDICTED: serine/thre ( 551) 563 117.1 2e-25 NP_001191213 (OMIM: 600658) serine/threonine-prote ( 477) 478 101.0 1.2e-20 NP_001008709 (OMIM: 176875) serine/threonine-prote ( 341) 390 84.3 9.1e-16 NP_002701 (OMIM: 176914) serine/threonine-protein ( 323) 389 84.1 1e-15 XP_011536807 (OMIM: 176914) PREDICTED: serine/thre ( 330) 389 84.1 1e-15 NP_001231903 (OMIM: 176914) serine/threonine-prote ( 337) 389 84.1 1e-15 XP_011536806 (OMIM: 176914) PREDICTED: serine/thre ( 362) 389 84.1 1.1e-15 NP_002699 (OMIM: 176875) serine/threonine-protein ( 330) 388 83.9 1.2e-15 NP_002700 (OMIM: 600590) serine/threonine-protein ( 327) 385 83.4 1.7e-15 NP_996759 (OMIM: 600590) serine/threonine-protein ( 327) 385 83.4 1.7e-15 NP_001009552 (OMIM: 176916) serine/threonine-prote ( 309) 382 82.8 2.4e-15 NP_002711 (OMIM: 602035) serine/threonine-protein ( 307) 373 81.1 7.8e-15 NP_001290432 (OMIM: 602035) serine/threonine-prote ( 307) 373 81.1 7.8e-15 NP_996756 (OMIM: 176875) serine/threonine-protein ( 286) 370 80.5 1.1e-14 NP_002706 (OMIM: 176915) serine/threonine-protein ( 309) 367 79.9 1.7e-14 NP_002712 (OMIM: 612725) serine/threonine-protein ( 305) 358 78.2 5.5e-14 XP_011517149 (OMIM: 612725) PREDICTED: serine/thre ( 293) 354 77.5 9e-14 NP_001116827 (OMIM: 612725) serine/threonine-prote ( 342) 354 77.5 1e-13 NP_001124164 (OMIM: 114105) serine/threonine-prote ( 469) 338 74.6 1e-12 XP_016863854 (OMIM: 114105) PREDICTED: serine/thre ( 509) 338 74.7 1.1e-12 NP_001124163 (OMIM: 114105) serine/threonine-prote ( 511) 338 74.7 1.1e-12 NP_000935 (OMIM: 114105) serine/threonine-protein ( 521) 338 74.7 1.1e-12 XP_016869100 (OMIM: 114107) PREDICTED: serine/thre ( 418) 322 71.6 7.6e-12 XP_016869099 (OMIM: 114107) PREDICTED: serine/thre ( 439) 322 71.6 7.8e-12 NP_001230904 (OMIM: 114107) serine/threonine-prote ( 502) 322 71.7 8.6e-12 NP_005596 (OMIM: 114107) serine/threonine-protein ( 512) 322 71.7 8.8e-12 NP_001230903 (OMIM: 114107) serine/threonine-prote ( 521) 322 71.7 8.9e-12 NP_001276898 (OMIM: 114106) serine/threonine-prote ( 410) 315 70.3 1.9e-11 XP_016871868 (OMIM: 114106) PREDICTED: serine/thre ( 426) 315 70.3 1.9e-11 XP_005270001 (OMIM: 114106) PREDICTED: serine/thre ( 514) 315 70.4 2.2e-11 NP_001135826 (OMIM: 114106) serine/threonine-prote ( 515) 315 70.4 2.2e-11 NP_066955 (OMIM: 114106) serine/threonine-protein ( 524) 315 70.4 2.2e-11 NP_001135825 (OMIM: 114106) serine/threonine-prote ( 525) 315 70.4 2.2e-11 NP_001290435 (OMIM: 602035) serine/threonine-prote ( 228) 242 56.3 1.7e-07 XP_016878893 (OMIM: 602035) PREDICTED: serine/thre ( 228) 242 56.3 1.7e-07 NP_001290436 (OMIM: 602035) serine/threonine-prote ( 228) 242 56.3 1.7e-07 XP_016878892 (OMIM: 602035) PREDICTED: serine/thre ( 228) 242 56.3 1.7e-07 NP_001116841 (OMIM: 612725) serine/threonine-prote ( 283) 238 55.6 3.3e-07 NP_001290433 (OMIM: 602035) serine/threonine-prote ( 273) 184 45.4 0.00037 XP_006721124 (OMIM: 602035) PREDICTED: serine/thre ( 273) 184 45.4 0.00037 NP_001276897 (OMIM: 114106) serine/threonine-prote ( 514) 171 43.2 0.0032 >>NP_006230 (OMIM: 602256) serine/threonine-protein phos (753 aa) initn: 5054 init1: 5054 opt: 5054 Z-score: 5146.8 bits: 963.0 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5054; 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NP_689 MGCSSSSTKT---RRSDTSLRAALIIQNWYRGYKARLKARQHYALTIFQSIEYADEQGQM 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE0 KLHDFFSYLMDHFIPSSHNDRDFLTRIFTEDRFAQDSEMKKCSDY-ESIEVPDSYTGPRL .: :::...... .: .. : . .. . ....:. :: .::.:::::.:::: NP_689 QLSTFFSFMLENY---THIHKEELE--LRNQSLESEQDMRDRWDYVDSIDVPDSYNGPRL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 SFPLLPDHATALVEAFRLKQQLHARYVLNLLYETKKHLVQLPNINRVSTCYSEEITVCGD .::: :.:::. .: :::.:::..:.:::: : :.::.....: :.:.:.::: NP_689 QFPLTCTDIDLLLEAFKEQQILHAHYVLEVLFETKKVLKQMPNFTHIQTSPSKEVTICGD 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 LHGQLDDLIFIFYKNGLPSPERSYVFNGDFVDRGKDSVEILMILFAFMLVYPKEFHLNRG :::.::::..::::::::: . ::::::::::::.:.:::::: . .::::...::::: NP_689 LHGKLDDLFLIFYKNGLPSERNPYVFNGDFVDRGKNSIEILMILCVSFLVYPNDLHLNRG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 NHEDHMVNLRYGFTKEVMNKYKVHGKEILRTLQDVFCWLPLATLIDEKVLILHGGVSDIT :::: :.:::::::::...:::.:::.::. :.. . :::..:..:...:..:::.:. : NP_689 NHEDFMMNLRYGFTKEILHKYKLHGKRILQILEEFYAWLPIGTIVDNEILVIHGGISETT 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 DLELLDKIERSKIVSTMRCKTRQKSEKQMEEKRRANQKSSAQGPIPWFLPESRSLPSSPL ::.:: ..::.:. :.. :: NP_689 DLNLLHRVERNKMKSVL---------------------------IP-------------- 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 RLGSYKAQKTSRSSSIPCSGSLDGRELSRQVRSSVELELERCRQQAGLLVTGEKEEPSRS :... 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NP_689 AFYVVHRYEDLMKPDVTNLG 610 620 >>XP_016885101 (OMIM: 300109) PREDICTED: serine/threonin (563 aa) initn: 1972 init1: 920 opt: 926 Z-score: 946.8 bits: 185.5 E(85289): 5.4e-46 Smith-Waterman score: 1859; 47.4% identity (71.4% similar) in 629 aa overlap (99-726:1-550) 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 LMDHFIPSSHNDRDFLTRIFTEDRFAQDSEMKKCSDY-ESIEVPDSYTGPRLSFPLLPDH :. :: .::.:::::.::::.::: XP_016 MRDRWDYVDSIDVPDSYNGPRLQFPLTCTD 10 20 30 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 ATALVEAFRLKQQLHARYVLNLLYETKKHLVQLPNINRVSTCYSEEITVCGDLHGQLDDL :.:::. .: :::.:::..:.:::: : :.::.....: :.:.:.::::::.:::: XP_016 IDLLLEAFKEQQILHAHYVLEVLFETKKVLKQMPNFTHIQTSPSKEVTICGDLHGKLDDL 40 50 60 70 80 90 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 IFIFYKNGLPSPERSYVFNGDFVDRGKDSVEILMILFAFMLVYPKEFHLNRGNHEDHMVN ..::::::::: . ::::::::::::.:.:::::: . .::::...::::::::: :.: XP_016 FLIFYKNGLPSERNPYVFNGDFVDRGKNSIEILMILCVSFLVYPNDLHLNRGNHEDFMMN 100 110 120 130 140 150 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 LRYGFTKEVMNKYKVHGKEILRTLQDVFCWLPLATLIDEKVLILHGGVSDITDLELLDKI ::::::::...:::.:::.::. :.. . :::..:..:...:..:::.:. :::.:: .. 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