FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0057, 1179 aa
1>>>pF1KE0057 1179 - 1179 aa - 1179 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.4781+/-0.000544; mu= -20.3405+/- 0.034
mean_var=626.8289+/-133.625, 0's: 0 Z-trim(121.2): 29 B-trim: 552 in 1/57
Lambda= 0.051227
statistics sampled from 37437 (37471) to 37437 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.748), E-opt: 0.2 (0.439), width: 16
Scan time: 18.200
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_056305 (OMIM: 610258) protein transport protein (1179) 8007 608.1 1e-172
NP_001070675 (OMIM: 610257) protein transport prot (1220) 3291 259.6 8.8e-68
NP_001305049 (OMIM: 610257) protein transport prot (1220) 3291 259.6 8.8e-68
NP_001305048 (OMIM: 610257) protein transport prot (1205) 3127 247.5 3.9e-64
NP_001070676 (OMIM: 610257) protein transport prot (1205) 3127 247.5 3.9e-64
NP_001070674 (OMIM: 610257) protein transport prot (1106) 3119 246.8 5.5e-64
NP_001177978 (OMIM: 610257) protein transport prot (1200) 2998 237.9 2.9e-61
NP_057295 (OMIM: 610257) protein transport protein (1181) 2651 212.3 1.5e-53
NP_001287674 (OMIM: 610257) protein transport prot (1166) 2223 180.6 4.9e-44
NP_001287673 (OMIM: 610257) protein transport prot (1067) 2187 178.0 2.9e-43
>>NP_056305 (OMIM: 610258) protein transport protein Sec (1179 aa)
initn: 8007 init1: 8007 opt: 8007 Z-score: 3221.8 bits: 608.1 E(85289): 1e-172
Smith-Waterman score: 8007; 100.0% identity (100.0% similar) in 1179 aa overlap (1-1179:1-1179)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKLKELERPAVQAWSPASQYPLYLATGTSAQQLDSSFSTNGTLEIFEVDFRDPSLDLKHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 MKLKELERPAVQAWSPASQYPLYLATGTSAQQLDSSFSTNGTLEIFEVDFRDPSLDLKHR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GVLSALSRFHKLVWGSFGSGLLESSGVIVGGGDNGMLILYNVTHILSSGKEPVIAQKQKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 GVLSALSRFHKLVWGSFGSGLLESSGVIVGGGDNGMLILYNVTHILSSGKEPVIAQKQKH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 TGAVRALDLNPFQGNLLASGASDSEIFIWDLNNLNVPMTLGSKSQQPPEDIKALSWNRQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 TGAVRALDLNPFQGNLLASGASDSEIFIWDLNNLNVPMTLGSKSQQPPEDIKALSWNRQA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 QHILSSAHPSGKAVVWDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDIATQLVLCSEDDRLPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 QHILSSAHPSGKAVVWDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDIATQLVLCSEDDRLPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 IQLWDLRFASSPLKVLESHSRGILSVSWSQADAELLLTSAKDSQILCRNLGSSEVVYKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 IQLWDLRFASSPLKVLESHSRGILSVSWSQADAELLLTSAKDSQILCRNLGSSEVVYKLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 TQSSWCFDVQWCPRDPSVFSAASFNGWISLYSVMGRSWEVQHMRQADKISSSFSKGQPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 TQSSWCFDVQWCPRDPSVFSAASFNGWISLYSVMGRSWEVQHMRQADKISSSFSKGQPLP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 PLQVPEQVAQAPLIPPLKKPPKWIRRPTGVSFAFGGKLVTFGLPSTPAHLVPQPCPRLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 PLQVPEQVAQAPLIPPLKKPPKWIRRPTGVSFAFGGKLVTFGLPSTPAHLVPQPCPRLVF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 ISQVTTESEFLMRSAELQEALGSGNLLNYCQNKSQQALLQSEKMLWQFLKVTLEQDSRMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 ISQVTTESEFLMRSAELQEALGSGNLLNYCQNKSQQALLQSEKMLWQFLKVTLEQDSRMK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 FLKLLGYSKDELQKKVATWLKSDVGLGESPQPKGNDLNSDRQQAFCSQASKHTTKEASAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 FLKLLGYSKDELQKKVATWLKSDVGLGESPQPKGNDLNSDRQQAFCSQASKHTTKEASAS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 SAFFDELVPQNMTPWEIPITKDIDGLLSQALLLGELGPAVELCLKEERFADAIILAQAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SAFFDELVPQNMTPWEIPITKDIDGLLSQALLLGELGPAVELCLKEERFADAIILAQAGG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 TDLLKQTQERYLAKKKTKISSLLACVVQKNWKDVVCTCSLKNWREALALLLTYSGTEKFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 TDLLKQTQERYLAKKKTKISSLLACVVQKNWKDVVCTCSLKNWREALALLLTYSGTEKFP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 ELCDMLGTRMEQEGSRALTSEARLCYVCSGSVERLVECWAKCHQALSPMALQDLMEKVMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 ELCDMLGTRMEQEGSRALTSEARLCYVCSGSVERLVECWAKCHQALSPMALQDLMEKVMV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 LNRSLEQLRGPHGVSPGPATTYRVTQYANLLAAQGSLATAMSFLPRDCAQPPVQQLRDRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LNRSLEQLRGPHGVSPGPATTYRVTQYANLLAAQGSLATAMSFLPRDCAQPPVQQLRDRL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 FHAQGSAVLGQQSPPFPFPRIVVGATLHSKETSSYRLGSQPSHQVPTPSPRPRVFTPQSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 FHAQGSAVLGQQSPPFPFPRIVVGATLHSKETSSYRLGSQPSHQVPTPSPRPRVFTPQSS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 PAMPLAPSHPSPYQGPRTQNISDYRAPGPQAIQPLPLSPGVRPASSQPQLLGGQRVQVPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 PAMPLAPSHPSPYQGPRTQNISDYRAPGPQAIQPLPLSPGVRPASSQPQLLGGQRVQVPN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE0 PVGFPGTWPLPGSPLPMACPGIMRPGSTSLPETPRLFPLLPLRPLGPGRMVSHTPAPPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 PVGFPGTWPLPGSPLPMACPGIMRPGSTSLPETPRLFPLLPLRPLGPGRMVSHTPAPPAS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE0 FPVPYLPGDPGAPCSSVLPTTGILTPHPGPQDSWKEAPAPRGNLQRNKLPETFMPPAPIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 FPVPYLPGDPGAPCSSVLPTTGILTPHPGPQDSWKEAPAPRGNLQRNKLPETFMPPAPIT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE0 APVMSLTPELQGILPSQPPVSSVSHAPPGVPGELSLQLQHLPPEKMERKELPPEHQSLKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 APVMSLTPELQGILPSQPPVSSVSHAPPGVPGELSLQLQHLPPEKMERKELPPEHQSLKS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE0 SFEALLQRCSLSATDLKTKRKLEEAAQRLEYLYEKLCEGTLSPHVVAGLHEVARCVDAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SFEALLQRCSLSATDLKTKRKLEEAAQRLEYLYEKLCEGTLSPHVVAGLHEVARCVDAGS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170
pF1KE0 FEQGLAVHAQVAGCSSFSEVSSFMPILKAVLIIAHKLLV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 FEQGLAVHAQVAGCSSFSEVSSFMPILKAVLIIAHKLLV
1150 1160 1170
>>NP_001070675 (OMIM: 610257) protein transport protein (1220 aa)
initn: 2122 init1: 1288 opt: 3291 Z-score: 1337.9 bits: 259.6 E(85289): 8.8e-68
Smith-Waterman score: 3629; 47.3% identity (72.1% similar) in 1238 aa overlap (1-1170:1-1211)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKLKELERPAVQAWSPASQYPLYLATGTSAQQLDSSFSTNGTLEIFEVDFRDPSLDLKHR
:::::..: :.::::::...:.::::::::::::..::::..:::::.:. :::::.:
NP_001 MKLKEVDRTAMQAWSPAQNHPIYLATGTSAQQLDATFSTNASLEIFELDLSDPSLDMKSC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE0 GVLSALSRFHKLVWGSFG-SGLLESSGVIVGGGDNGMLILYNVTHILSSGKEPVIAQKQK
...:. :.:::.:: . .. . :::...::.:: .:::. ..:... :: ::::..:
NP_001 ATFSSSHRYHKLIWGPYKMDSKGDVSGVLIAGGENGNIILYDPSKIIAGDKEVVIAQNDK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 HTGAVRALDLNPFQGNLLASGASDSEIFIWDLNNLNVPMTLGSKSQQPPEDIKALSWNRQ
::: :::::.: :: ::.::::..:::.::::::. .::: :.:.: :::::. ..::::
NP_001 HTGPVRALDVNIFQTNLVASGANESEIYIWDLNNFATPMTPGAKTQ-PPEDISCIAWNRQ
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 AQHILSSAHPSGKAVVWDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDIATQLVLCSEDDRLP
.::::.:: :::.:.::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:: :::::::
NP_001 VQHILASASPSGRATVWDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDVATQMVLASEDDRLP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 VIQLWDLRFASSPLKVLESHSRGILSVSWSQADAELLLTSAKDSQILCRNLGSSEVVYKL
:::.::::::::::.:::.:.::::...::.:: ::::. .::..::: : ...::.:.:
NP_001 VIQMWDLRFASSPLRVLENHARGILAIAWSMADPELLLSCGKDAKILCSNPNTGEVLYEL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 PTQSSWCFDVQWCPRDPSVFSAASFNGWISLYSVMGRSWEVQHMRQADKISSSFSK----
::...::::.:::::.:.:.:::::.: ::.::.:: : . ...:.::.::::..
NP_001 PTNTQWCFDIQWCPRNPAVLSAASFDGRISVYSIMGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 --GQPLPPLQVPEQVAQAPLIPPLKKPPKWIRRPTGVSFAFGGKLVTFGLPSTPAHL--V
::::::::.:.:.:: .. ::::::::::::.:.::.:::::::: :.:
NP_001 GTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWIRRPVGASFSFGGKLVTFENVRMPSHQGAE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 PQPCPRLVFISQVTTESEFLMRSAELQEALGSGNLLNYCQNKSQQALLQSEKMLWQFLKV
: . ::::::.::.::: :: .::.:. : ...::::.: . . . :: .:.::::
NP_001 QQQQQHHVFISQVVTEKEFLSRSDQLQQAVQSQGFINYCQKKIDASQTEFEKNVWSFLKV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KE0 TLEQDSRMKFLKLLGYSKDELQKKVATWLK----SDVGLGESPQPKGNDLNSDRQQAFCS
..:.::: :.:.:::: :..: ::.: :. ..:.: .: : .: . . : .
NP_001 NFEDDSRGKYLELLGYRKEDLGKKIALALNKVDGANVALKDSDQVAQSD-GEESPAAEEQ
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 QASKHTTKEASASSAFFDELVPQNMTPWEIPITKDIDGLLSQALLLGELGPAVELCLKEE
..: .: : :..:.. ..: .. :::::..:::: :.. ::.:::...
NP_001 LLGEHIKEEKEES-----EFLPSSGGTFNISVSGDIDGLITQALLTGNFESAVDLCLHDN
540 550 560 570 580 590
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pF1KE0 RFADAIILAQAGGTDLLKQTQERYLAKKKTKISSLLACVVQKNWKDVVCTCSLKNWREAL
:.::::::: ::: .:: .::..:.::...::. :.. ::.::::..: .:.::::::::
NP_001 RMADAIILAIAGGQELLARTQKKYFAKSQSKITRLITAVVMKNWKEIVESCDLKNWREAL
600 610 620 630 640 650
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pF1KE0 ALLLTYSGTEKFPELCDMLGTRMEQEGSRALTSEARLCYVCSGSVERLVECWAKCHQALS
: .:::. ..: :::.::::.:.::. : ..: :::.:.:.::.:: ::.: ...
NP_001 AAVLTYAKPDEFSALCDLLGTRLENEGDSLLQTQACLCYICAGNVEKLVACWTKAQDGSH
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE0 PMALQDLMEKVMVLNRSLEQLRGPHGVSPGPATTYRVTQYANLLAAQGSLATAMSFLPRD
:..::::.:::..: .... .. . : . ...:::::::::::.:.:..::: .
NP_001 PLSLQDLIEKVVILRKAVQLTQAMDTSTVGVLLAAKMSQYANLLAAQGSIAAALAFLPDN
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KE0 CAQPPVQQLRDRLFHAQGSAVLGQQSPPFPFPRIVVGATLHSKETSSYRLGSQPSHQVPT
:: ..:::::: .::: : :..:: .:. . .. . : : .:.
NP_001 TNQPNIMQLRDRLCRAQGEPVAGHESPKIPYEK---------QQLPKGRPGPVAGHH---
780 790 800 810 820
830 840 850 860 870 880
pF1KE0 PSPRPRVFTPQSSPAMPLAPSHPSPYQGPRTQNISDY--RAPGPQAIQ--PLPLSPGVRP
::: : : : : ..: . : . .:: . : : : .:
NP_001 --QMPRVQTQQYYPHGENPPPPGFIMHGNVNPNAAGQLPTSPGHMHTQVPPYPQPQPYQP
830 840 850 860 870
890 900 910 920 930
pF1KE0 ASSQPQLLGGQRVQVPN-PVGFPGTWPLPGSPLPMACPGIMRPGSTSL------PETPRL
:. : ::. . :. ::. : . :..: . . :...: .:
NP_001 AQPYPFGTGGSAMYRPQQPVAPPTSNAYPNTPYISSASSY--TGQSQLYAAQHQASSPTS
880 890 900 910 920 930
940 950 960 970 980 990
pF1KE0 FPLLPLRPL-GPGRMVSHT-P-APPASFPVPYLPGDPGA-PCSSVLPTTGILTPHPGPQD
: . : . : .: : :::.: :: :. : .: ::.. . :::.
NP_001 SPATSFPPPPSSGASFQHGGPGAPPSSSAYALPPGTTGTLPAASELPAS----QRTGPQN
940 950 960 970 980 990
1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE0 SWKEAPAPRGNLQRNKLPETFMPPAPITAPVMSLTPELQGIL----PSQP-PVSSVS---
.:.. :: ...:.::.::::.:::.:.:. . :. . :: : :.:: :
NP_001 GWNDPPALNRVPKKKKMPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPLSSQSSFP
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1050 1060 1070
pF1KE0 --HAP-----------------------------PGVP-GELSLQLQHLPPEKMERKELP
: : ::.: :. ..: :: .:. .: .:
NP_001 QPHLPGGQPFHGVQQPLGQTGMPPSFSKPNIEGAPGAPIGNTFQHVQSLPTKKITKKPIP
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE0 PEHQSLKSSFEALLQRCSLSATDLKTKRKLEEAAQRLEYLYEKLCEGTLSPHVVAGLHEV
:: ::..:: :.::: :::: .:::::..:..:::.::.:: : :::: ...:::..
NP_001 DEHLILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLREQTLSPTITSGLHNI
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1140 1150 1160 1170
pF1KE0 ARCVDAGSFEQGLAVHAQVAGCSSFSEVSSFMPILKAVLIIAHKLLV
:: ... .. .::..:..... :.:::.:.:::.::.:
NP_001 ARSIETRNYSEGLTMHTHIVSTSNFSETSAFMPVLKVVLTQANKLGV
1180 1190 1200 1210 1220
>>NP_001305049 (OMIM: 610257) protein transport protein (1220 aa)
initn: 2122 init1: 1288 opt: 3291 Z-score: 1337.9 bits: 259.6 E(85289): 8.8e-68
Smith-Waterman score: 3629; 47.3% identity (72.1% similar) in 1238 aa overlap (1-1170:1-1211)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKLKELERPAVQAWSPASQYPLYLATGTSAQQLDSSFSTNGTLEIFEVDFRDPSLDLKHR
:::::..: :.::::::...:.::::::::::::..::::..:::::.:. :::::.:
NP_001 MKLKEVDRTAMQAWSPAQNHPIYLATGTSAQQLDATFSTNASLEIFELDLSDPSLDMKSC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE0 GVLSALSRFHKLVWGSFG-SGLLESSGVIVGGGDNGMLILYNVTHILSSGKEPVIAQKQK
...:. :.:::.:: . .. . :::...::.:: .:::. ..:... :: ::::..:
NP_001 ATFSSSHRYHKLIWGPYKMDSKGDVSGVLIAGGENGNIILYDPSKIIAGDKEVVIAQNDK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 HTGAVRALDLNPFQGNLLASGASDSEIFIWDLNNLNVPMTLGSKSQQPPEDIKALSWNRQ
::: :::::.: :: ::.::::..:::.::::::. .::: :.:.: :::::. ..::::
NP_001 HTGPVRALDVNIFQTNLVASGANESEIYIWDLNNFATPMTPGAKTQ-PPEDISCIAWNRQ
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 AQHILSSAHPSGKAVVWDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDIATQLVLCSEDDRLP
.::::.:: :::.:.::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:: :::::::
NP_001 VQHILASASPSGRATVWDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDVATQMVLASEDDRLP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 VIQLWDLRFASSPLKVLESHSRGILSVSWSQADAELLLTSAKDSQILCRNLGSSEVVYKL
:::.::::::::::.:::.:.::::...::.:: ::::. .::..::: : ...::.:.:
NP_001 VIQMWDLRFASSPLRVLENHARGILAIAWSMADPELLLSCGKDAKILCSNPNTGEVLYEL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 PTQSSWCFDVQWCPRDPSVFSAASFNGWISLYSVMGRSWEVQHMRQADKISSSFSK----
::...::::.:::::.:.:.:::::.: ::.::.:: : . ...:.::.::::..
NP_001 PTNTQWCFDIQWCPRNPAVLSAASFDGRISVYSIMGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 --GQPLPPLQVPEQVAQAPLIPPLKKPPKWIRRPTGVSFAFGGKLVTFGLPSTPAHL--V
::::::::.:.:.:: .. ::::::::::::.:.::.:::::::: :.:
NP_001 GTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWIRRPVGASFSFGGKLVTFENVRMPSHQGAE
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420 430 440 450 460 470
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..:.::: :.:.:::: :..: ::.: :. ..:.: .: : .: . . : .
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..: .: : :..:.. ..: .. :::::..:::: :.. ::.:::...
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1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE0 MERKELPPEHQSLKSSFEALLQRCSLSATDLKTKRKLEEAAQRLEYLYEKLCEGTLSPHV
. .: .: :: ::..:: :.::: :::: .:::::..:..:::.::.:: : :::: .
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1130 1140 1150 1160 1170
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..:::..:: ... .. .::..:..... :.:::.:.:::.::.:: :.:: :
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:::::..: :.::::::...:.::::::::::::..::::..:::::.:. :::::.:
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...:. :.:::.:: . .. . :::...::.:: .:::. ..:... :: ::::..:
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:: ..:::::: .::: : :..:: .:. . .. . : : .:.
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: :.: . : : : : . . .: .: :.. :::
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: :: .:. .: .: :: ::..:: :.::: :::: .:::::..:..:::.::.:: :
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pF1KE0 V
:
NP_001 V
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NP_001 ITKKPIPDEHLILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLREQTLSPTI
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NP_001 TSGLHNIARSIETRNYSEGLTMHTHIVSTSNFSETSAFMPVLKVVLTQANKLGV
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pF1KE0 AQHILSSAHPSGKAVVWDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDIATQLVLCSEDDRLP
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NP_057 VQHILASASPSGRATVWDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDVATQMVLASEDDRLP
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pF1KE0 VIQLWDLRFASSPLKVLESHSRGILSVSWSQADAELLLTSAKDSQILCRNLGSSEVVYKL
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NP_057 NFEDDSRGKYLELLGYRKEDLGKK------------------------------------
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60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 05:47:42 2016 done: Fri Nov 4 05:47:45 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]