FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0059, 475 aa 1>>>pF1KE0059 475 - 475 aa - 475 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4993+/-0.00219; mu= 8.4995+/- 0.128 mean_var=288.6666+/-56.919, 0's: 0 Z-trim(103.1): 998 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.075488 statistics sampled from 6167 (7255) to 6167 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.534), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16 Scan time: 2.500 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 3365 381.3 1.2e-105 CCDS33121.1 ZNF582 gene_id:147948|Hs108|chr19 ( 517) 1977 230.2 4.1e-60 CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19 ( 499) 1971 229.5 6.3e-60 CCDS12494.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 418) 1853 216.5 4.2e-56 CCDS46061.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 419) 1841 215.2 1e-55 CCDS12493.1 ZFP82 gene_id:284406|Hs108|chr19 ( 532) 1842 215.5 1.1e-55 CCDS42557.1 ZNF829 gene_id:374899|Hs108|chr19 ( 432) 1702 200.1 3.8e-51 CCDS59380.1 ZNF829 gene_id:374899|Hs108|chr19 ( 513) 1702 200.2 4.2e-51 CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1687 198.8 1.5e-50 CCDS12505.1 ZNF571 gene_id:51276|Hs108|chr19 ( 609) 1662 196.0 9.5e-50 CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 1650 194.6 2.3e-49 CCDS77346.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 492) 1639 193.3 4.8e-49 CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1637 193.1 5.5e-49 CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1631 192.6 9.9e-49 CCDS42533.1 ZNF682 gene_id:91120|Hs108|chr19 ( 498) 1618 191.1 2.4e-48 CCDS32978.1 ZNF430 gene_id:80264|Hs108|chr19 ( 570) 1618 191.1 2.5e-48 CCDS42538.1 ZNF100 gene_id:163227|Hs108|chr19 ( 542) 1615 190.8 3.1e-48 CCDS42532.1 ZNF253 gene_id:56242|Hs108|chr19 ( 499) 1613 190.5 3.4e-48 CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1595 188.7 1.5e-47 CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1595 188.7 1.5e-47 CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1586 187.7 3e-47 CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1586 187.8 3.1e-47 CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1586 187.8 3.1e-47 CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1586 187.8 3.1e-47 CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1585 187.9 4.3e-47 CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1585 188.0 4.4e-47 CCDS74387.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 540) 1579 186.9 4.7e-47 CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 1579 187.0 5.3e-47 CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1567 185.6 1.2e-46 CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1561 185.1 2.1e-46 CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1559 184.8 2.3e-46 CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1559 184.8 2.3e-46 CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1549 183.5 4.1e-46 CCDS75608.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 554) 1535 182.1 1.3e-45 CCDS46028.1 ZNF90 gene_id:7643|Hs108|chr19 ( 601) 1535 182.1 1.4e-45 CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 ( 569) 1532 181.8 1.7e-45 CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1529 181.4 2.1e-45 CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 626) 1528 181.4 2.4e-45 CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 ( 641) 1528 181.4 2.4e-45 CCDS46032.1 ZNF492 gene_id:57615|Hs108|chr19 ( 531) 1526 181.1 2.5e-45 CCDS75078.1 ZNF718 gene_id:255403|Hs108|chr4 ( 478) 1525 180.9 2.6e-45 CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1528 181.5 2.7e-45 CCDS33102.1 ZNF331 gene_id:55422|Hs108|chr19 ( 463) 1524 180.8 2.7e-45 CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1526 181.3 3.1e-45 CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1525 181.1 3.1e-45 CCDS33931.1 ZNF141 gene_id:7700|Hs108|chr4 ( 474) 1516 179.9 5e-45 CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 1510 179.1 6.8e-45 CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 1510 179.3 7.9e-45 CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 1510 179.3 8.2e-45 CCDS12496.1 ZNF790 gene_id:388536|Hs108|chr19 ( 636) 1509 179.3 1e-44 >>CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 (475 aa) initn: 3365 init1: 3365 opt: 3365 Z-score: 2010.1 bits: 381.3 E(32554): 1.2e-105 Smith-Waterman score: 3365; 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59.4% identity (80.1% similar) in 473 aa overlap (1-472:1-469) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MAEGSVMFSDVSIDFSQEEWDCLDPVQRDLYRDVMLENYGNLVSMGLYTPKPQVISLLEQ ::.: : : ::.:.:: ::: ::.:.::::::.: :::.:.:.:.:: ::.:.::::: CCDS12 MAQGLVTFRDVAIEFSLEEWKCLEPAQRDLYREVTLENFGHLASLGLSISKPDVVSLLEQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 GKEPWMVGRELTRGLCSDLESMCETKLLSLKKEVYEIELCQREIM-GLTKHGLEYSSFGD ::::::.. ..: : :::: :: :.: .:...:: . ::: .: :: :.: CCDS12 GKEPWMIANDVTGPWCPDLESRCE-KFL--QKDIFEIGAFNWEIMESLKCSDLEGSDFRA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 VLEYRSHLAKQLGYPNGHFSQEIFTPEYMPTFIQQTFLTLHQIINNEDRPYECKKCGKAF : .... .:.. . .:.: : .::.: ..: :..: .. .. .::..::::: CCDS12 DWECEGQFERQVN-EECYFKQVNVTYGHMPVFQHHTSHTVRQSRETGEKLMECHECGKAF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 SQNSQFIQHQRIHIGEKSYECKECGKFFSCGSHVTRHLKIHTGEKPFECKECGKAFSCSS :..:..::::.:: ::: . :::::: :: .::...: .:::::::..::.:::::. .: CCDS12 SRGSHLIQHQKIHTGEKPFGCKECGKAFSRASHLVQHQRIHTGEKPYDCKDCGKAFGRTS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 YLSQHQRIHTGKKPYECKECGKAFSYCSNLIDHQRIHTGEKPYECKVCGKAFTKSSQLFQ : :::.::: ::::::::::.: :.:: ::: ::::::: :: ::::: ..::: CCDS12 ELILHQRLHTGVKPYECKECGKTFRQHSQLILHQRTHTGEKPYVCKDCGKAFIRGSQLTV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 HARIHTGEKPYECKECGKAFTQSSKLVQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSALTNHQRI : ::::: .::::::::::: : :.:. ::::::::::::::::::.: .: .: :::: CCDS12 HRRIHTGARPYECKECGKAFRQHSQLTVHQRIHTGEKPYECKECGKGFIHSSEVTRHQRI 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 HTGEKPYDCKECGKAFTQSSQLRQHQRIHAGEKPFECLECGKAFTQNSQLFQHQRIHTDE :.:::::.:::::::: : .:: .:::.:.:..:.:: .:::::...: :.::::::: . 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CCDS12 HTGEKPYECKICGKAYSQSSQLISHHRIHTSEKPYEYRECGKNFNYDPQLIQHQNLYW 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE0 KPYECNECGKAFNKCSNLTRHLRIHTGEKPYNCKECGKAFSSGSDLIRHQGIHTNK >>CCDS46061.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 (419 aa) initn: 2554 init1: 1380 opt: 1841 Z-score: 1113.6 bits: 215.2 E(32554): 1e-55 Smith-Waterman score: 1841; 65.1% identity (81.1% similar) in 418 aa overlap (1-416:1-418) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MAEGSVMFSDVSIDFSQEEWDCLDPVQRDLYRDVMLENYGNLVSM-GLYTPKPQVISLLE ::. ::::::::.:::::::.::. :::::::::::::.::::: : ::.::: :: CCDS46 MAQESVMFSDVSVDFSQEEWECLNDDQRDLYRDVMLENYSNLVSMAGHSISKPNVISYLE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 QGKEPWMVGRELTRGLCSDLESMCETKLLSLKKEVYEIELCQREIM-GLTKHGLEYSSFG ::::::.. :::::: ::: :::: : ::::.:::: : ::: ::.. .. ::: CCDS46 QGKEPWLADRELTRGQWPVLESRCETKKLFLKKEIYEIESTQWEIMEKLTRRDFQCSSFR 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 DVLEYRSHLAKQLGYPNGHFSQEIFTPEYMPTFIQQTFLTLHQIINNEDRPYECKKCGKA : : .. :.:: .:::.: .:: : .::. .. .::.::::.. . :. :. CCDS46 DDWECNRQFKKELGSQGGHFNQLVFTHEDLPTLSHHPSFTLQQIINSKKKFCASKEYRKT 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 FSQNSQFIQHQRIHIGEKSYECKECGKFFSCGSHVTRHLKIHTGEKPFECKECGKAFSCS : ..::: :. :: :: :::::::: : :..:.: :::::.::::::::::.: :. CCDS46 FRHGSQFATHEIIHTIEKPYECKECGKSFRHPSRLTHHQKIHTGKKPFECKECGKTFICG 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 SYLSQHQRIHTGKKPYECKECGKAFSYCSNLIDHQRIHTGEKPYECKVCGKAFTKSSQLF : :..:.:::::.::::::::::::: ::. :::::::::::::: :::::...:.. CCDS46 SDLTRHHRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSNFTRHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSNFT 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 QHARIHTGEKPYECKECGKAFTQSSKLVQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSALTNHQR :: :::::::::::::::.::.:::.:..:::::::::::::::: ::: ::: :: ::: CCDS46 QHQRIHTGEKPYECKECGNAFSQSSQLIKHQRIHTGEKPYECKECEKAFRSGSDLTRHQR 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 IHTGEKPYDCKECGKAFTQSSQLRQHQRIHAGEKPFECLECGKAFTQNSQLFQHQRIHTD ::::::::.:: ::::..::::: .:.:::..:::.: :::: :. . ::.::: .. CCDS46 IHTGEKPYECKICGKAYSQSSQLISHHRIHTSEKPYEYRECGKNFNYDPQLIQHQNLYW 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE0 EKPYECNECGKAFNKCSNLTRHLRIHTGEKPYNCKECGKAFSSGSDLIRHQGIHTNK >>CCDS12493.1 ZFP82 gene_id:284406|Hs108|chr19 (532 aa) initn: 5859 init1: 1734 opt: 1842 Z-score: 1113.2 bits: 215.5 E(32554): 1.1e-55 Smith-Waterman score: 1842; 56.7% identity (75.8% similar) in 476 aa overlap (1-475:1-475) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MAEGSVMFSDVSIDFSQEEWDCLDPVQRDLYRDVMLENYGNLVSMGLYTPKPQVISLLEQ :: :::::::::::: :::. :: :.:::::::::::.::::.: . ::.::: ::: CCDS12 MALRSVMFSDVSIDFSPEEWEYLDLEQKDLYRDVMLENYSNLVSLGCFISKPDVISSLEQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 GKEPWMVGRELTRGLCSDLESMCETKLLSLKKEVYEIELCQREIMG-LTKHGLEYSSFGD ::::: : :. : :::. ::: :::....:::.: : .:: . .:::. . . CCDS12 GKEPWKVVRKGRRQY-PDLETKYETKKLSLENDIYEINLSQWKIMERIENHGLKGLILKN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 VLEYRSHLAKQLGYPNGHFSQEIFTPEYMPTFIQQTFLTLHQIINNEDRPYECKKCGKAF : ... : .:.::. . : . .. ..: .: :: .. :.:::::.::::: CCDS12 DWESTGKIEGQERPQEGYFSSVKMPSEKVSSYQKRTSVTPHQRLHFVDKPYECKECGKAF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 SQNSQFIQHQRIHIGEKSYECKECGKFFSCGSHVTRHLKIHTGEKPFECKECGKAFSCSS .:. :.::: ::: ::::::: : .:.::: ..:.::: .::::::.:: :.. CCDS12 RVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYECKECGEAFICGA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 YLSQHQRIHTGKKPYECKECGKAFSYCSNLIDHQRIHTGEKPYECKVCGKAFTKSSQLFQ : ::..: :.:::::::::::: ..: ::::::::::: :: ::::: . ..: . CCDS12 DLRVHQKMHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCKECGKAFRQYAHLTR 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 HARIHTGEKPYECKECGKAFTQSSKLVQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSALTNHQRI : ....... :::::::::: .: : :...:::::::::::::::: . :: :::: CCDS12 HQKLNSADRLYECKECGKAFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQRI 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 HTGEKPYDCKECGKAFTQSSQLRQHQRIHAGEKPFECLECGKAFTQNSQLFQHQRIHTDE :::::::.::::::.:... .: :.:::.::::.:: :: :::.. :::..:: :: CCDS12 HTGEKPYECKECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSRYSQLISHQSIHIGV 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE0 KPYECNECGKAFNKCSNLTRHLRIHTGEKPYNCKECGKAFSSGSDLIRHQGIHTNK :::.:.:::::: :.::.: :: :::::.:::::::: . : ::.:::.. CCDS12 KPYDCKECGKAFRLLSQLTQHQSIHIGEKPYKCKECGKAFRLRQKLTLHQSIHTGEKPFE 420 430 440 450 460 470 CCDS12 CKECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKIHNVKI 480 490 500 510 520 530 >>CCDS42557.1 ZNF829 gene_id:374899|Hs108|chr19 (432 aa) initn: 1699 init1: 1699 opt: 1702 Z-score: 1031.7 bits: 200.1 E(32554): 3.8e-51 Smith-Waterman score: 2112; 67.9% identity (77.0% similar) in 473 aa overlap (1-473:30-431) 10 20 30 pF1KE0 MAEGSVMFSDVSIDFSQEEWDCLDPVQRDLY ...: ::: :::::::::::.::: : .:: CCDS42 MPHSPLISIPHVWCHPEEEERMHDELLQAVSKGPVMFRDVSIDFSQEEWECLDADQMNLY 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE0 RDVMLENYGNLVSMGLYTPKPQVISLLEQGKEPWMVGRELTRGLCSDLESMCETKLLSLK ..:::::..::::.:: . :: :::::::::::::: ::::::::::::::::::.:::: CCDS42 KEVMLENFSNLVSVGLSNSKPAVISLLEQGKEPWMVDRELTRGLCSDLESMCETKILSLK 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE0 KEVYEIELCQREIMGLTKHGLEYSSFGDVLEYRSHLAKQLGYPNGHFSQEIFTPEYMPTF :. :::: :.: : : :: CCDS42 KR-------------------------------------------HFSQVIITREDMSTF 130 160 170 180 190 200 210 pF1KE0 IQQTFLTLHQIINNEDRPYECKKCGKAFSQNSQFIQHQRIHIGEKSYECKECGKFFSCGS :: ::: : .:..:.::: :::.:.::::::::::::.::: :: :: :: :: :: CCDS42 IQPTFLIPPQKTMSEEKPWECKICGKTFNQNSQFIQHQRIHFGEKHYESKEYGKSFSRGS 140 150 160 170 180 190 220 230 240 250 260 270 pF1KE0 HVTRHLKIHTGEKPFECKECGKAFSCSSYLSQHQRIHTGKKPYECKECGKAFSYCSNLID :::: .::::.::.::::::::::::::.:::::::::.::::::::::::.::::: : CCDS42 LVTRHQRIHTGKKPYECKECGKAFSCSSYFSQHQRIHTGEKPYECKECGKAFKYCSNLND 200 210 220 230 240 250 280 290 300 310 320 330 pF1KE0 HQRIHTGEKPYECKVCGKAFTKSSQLFQHARIHTGEKPYECKECGKAFTQSSKLVQHQRI ::::::::::::::::::::::::::: : :::::::::::::::::::: :.:.::::. CCDS42 HQRIHTGEKPYECKVCGKAFTKSSQLFLHLRIHTGEKPYECKECGKAFTQHSRLIQHQRM 260 270 280 290 300 310 340 350 360 370 380 390 pF1KE0 HTGEKPYECKECGKAFSSGSALTNHQRIHTGEKPYDCKECGKAFTQSSQLRQHQRIHAGE ::::::::::.:::::.:.:.::::.:::.::: :.:.:: ::: :::.: CCDS42 HTGEKPYECKQCGKAFNSASTLTNHHRIHAGEKLYECEECRKAFIQSSEL---------- 320 330 340 350 360 400 410 420 430 440 450 pF1KE0 KPFECLECGKAFTQNSQLFQHQRIHTDEKPYECNECGKAFNKCSNLTRHLRIHTGEKPYN .::::::::::::::::::::::: :::::: :::::::::. 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CCDS12 HTGEKPYKCEECGKAFIRSSQLTRHQKVHTGEKPYEC-KECGKAFTQNSQLTLHQRLHTG 220 230 240 250 260 270 100 110 120 130 pF1KE0 KKEVYEIELCQREIMGLTKHGL-----------EYSSFGDVLEYRSHLAKQLGYPNGHFS .: .:: . :.. . :.. : : . : .. :.:... ::. 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