FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0065, 1030 aa 1>>>pF1KE0065 1030 - 1030 aa - 1030 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5489+/-0.00123; mu= -3.2344+/- 0.071 mean_var=318.0551+/-72.315, 0's: 0 Z-trim(110.6): 625 B-trim: 477 in 2/52 Lambda= 0.071916 statistics sampled from 11019 (11754) to 11019 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.703), E-opt: 0.2 (0.361), width: 16 Scan time: 5.220 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030) 6907 731.7 1.9e-210 CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX ( 960) 6002 637.8 3.3e-182 CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 493) 1009 119.5 1.8e-26 CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 570) 1009 119.5 2e-26 CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 358) 976 116.0 1.5e-25 CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 ( 315) 947 112.9 1.1e-24 CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 276) 891 107.0 5.5e-23 CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 455) 876 105.7 2.4e-22 CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 592) 876 105.8 2.9e-22 CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 734 90.8 4.6e-18 CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 707 88.0 3.3e-17 CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 707 88.0 3.7e-17 CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 702 87.5 4.7e-17 CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 702 87.8 9.6e-17 CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 702 87.8 9.7e-17 CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 702 87.8 9.7e-17 CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 783) 702 87.8 9.7e-17 CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 699 87.5 1.2e-16 CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 699 87.5 1.2e-16 CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 699 87.5 1.2e-16 CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 682 85.4 2e-16 CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 679 85.3 4.3e-16 CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 665 83.9 1.1e-15 CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 665 83.9 1.2e-15 CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 665 83.9 1.2e-15 CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 658 83.0 1.2e-15 CCDS9971.1 MOK gene_id:5891|Hs108|chr14 ( 419) 624 79.5 1.7e-14 CCDS81854.1 MOK gene_id:5891|Hs108|chr14 ( 418) 621 79.2 2e-14 CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 622 79.3 2.2e-14 CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 622 79.3 2.2e-14 CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 622 79.4 2.4e-14 CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 620 79.2 2.6e-14 CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 620 79.2 2.6e-14 CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 620 79.2 2.7e-14 CCDS6879.1 CDK9 gene_id:1025|Hs108|chr9 ( 372) 614 78.4 3.1e-14 CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 360) 607 77.7 5e-14 CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 598 76.8 1.1e-13 CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 598 76.8 1.1e-13 CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 598 76.8 1.2e-13 CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7 ( 326) 593 76.2 1.3e-13 CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 581 75.0 3.2e-13 CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 582 75.1 3.5e-13 CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 577 74.6 4.5e-13 CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 474) 579 74.9 4.6e-13 CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 577 74.6 4.7e-13 CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 504) 579 74.9 4.8e-13 CCDS12599.1 GSK3A gene_id:2931|Hs108|chr19 ( 483) 573 74.2 7.2e-13 CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 563 73.1 1.2e-12 CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 563 73.1 1.2e-12 CCDS61552.1 MOK gene_id:5891|Hs108|chr14 ( 389) 552 72.0 2.8e-12 >>CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030 aa) initn: 6907 init1: 6907 opt: 6907 Z-score: 3891.6 bits: 731.7 E(32554): 1.9e-210 Smith-Waterman score: 6907; 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39.1% identity (71.9% similar) in 437 aa overlap (10-432:1-433) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVKETTLRE :.:.: ::.::::.::.:.:::.:.: .::::::: .:.... ::. ..:: CCDS35 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMRE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 LKMLRTLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLI .:.:. :..::.:.: :. ... . :::::.:....:. :: .:::. . :..:..:.: CCDS35 IKLLKQLRHENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQII 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 KAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSP ..: .::...:.::::::::.:.:.. :.:::::::::.:. ... ::.::::::::.: CCDS35 NGIGFCHSHNIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEV-YTDYVATRWYRAP 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE0 ELLLG-APYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLFY :::.: . :::.::.:..::.. :. :.:::::.:.::::. :. :: : ....:: CCDS35 ELLVGDVKYGKAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFN 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 SNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQT .:: : :.:.: ... . ::::: :. :..:: :. :..:: : . . :.: :: CCDS35 KNPVFAGVRLPEIKEREPLERRY-PKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQM 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 QRLLDRSPSRSAKRKPYHVESSTLSNRNQAGKSTALQSHHRSNSKDIQNLSVGLPRADEG . . .: .. . ... .::...: :. . . : .. ..: : :: CCDS35 DGFAERFSQELQLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKE--KEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPK 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 pF1KE0 LPANESF------LNGNLA-----GASLSPLH-TKTYQASSQPGSTSKDLTNNNIPHLLS . . : ..:. : ... : :: ..: . . :... :: .: .. : . CCDS35 IKDYKLFKIKGSKIDGEKAEKGNRASNASCLHDSRTSHNKIVPSTSLKDCSNVSVDHTRN 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE0 PKEAKSKTEFDFN-IDPKPSEGPGTKYLKSNSRSQQNRHSFMESSQSKAGTLQPNEKQSR :. : ... . :. . : ::. CCDS35 PSVAIPPLTHNLSAVAPSINSGMGTETIPIQGYRVDEKTKKCSIPFVKPNRHSPSGIYNI 410 420 430 440 450 460 >>CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 (570 aa) initn: 824 init1: 824 opt: 1009 Z-score: 588.0 bits: 119.5 E(32554): 2e-26 Smith-Waterman score: 1053; 34.4% identity (66.8% similar) in 561 aa overlap (10-546:1-552) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVKETTLRE :.:.: ::.::::.::.:.:::.:.: .::::::: .:.... ::. ..:: CCDS82 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMRE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 LKMLRTLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLI .:.:. :..::.:.: :. ... . :::::.:....:. :: .:::. . :..:..:.: CCDS82 IKLLKQLRHENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQII 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 KAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSP ..: .::...:.::::::::.:.:.. :.:::::::::.:. ... ::.::::::::.: CCDS82 NGIGFCHSHNIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEV-YTDYVATRWYRAP 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE0 ELLLG-APYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLFY :::.: . :::.::.:..::.. :. :.:::::.:.::::. :. :: : ....:: CCDS82 ELLVGDVKYGKAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFN 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 SNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQT .:: : :.:.: ... . ::::: :. :..:: :. :..:: : . . :.: :: CCDS82 KNPVFAGVRLPEIKEREPLERRY-PKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQM 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 QRLLDRSPSRSAKRKPYHVESSTLSNRNQAGKSTALQSHHRSNSKDIQNLSVGLPRADEG . . .: .. . ... .::...: :. . . : .. ..: : :: CCDS82 DGFAERFSQELQLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKE--KEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPK 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 pF1KE0 LPANESF------LNGNLA-----GASLSPLH-TKTYQASSQPGSTSKDLTNNNIPHLLS . . : ..:. : ... : :: ..: . . :... :: .: .. : . CCDS82 IKDYKLFKIKGSKIDGEKAEKGNRASNASCLHDSRTSHNKIVPSTSLKDCSNVSVDHTRN 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE0 PKEAKSKTEFDFN-IDPKPSEGPGTKYLKSNSRSQQNRHSFMESSQSKAGTLQPNEKQSR :. : ... . :. . : ::. . .. ... ... . ..::... CCDS82 PSVAIPPLTHNLSAVAPSINSGMGTETIPIQGYRVDEK-----TKKCSIPFVKPNRHSPS 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE0 HSY---IDTIPQSSRSPSYRTKAKSHGALSDSK----SVSNLSEARAQ--IAEPSTSRYF : . :. .: .. . .: . . . .: . . ..: : :: ::. : CCDS82 GIYNINVTTLVSSEKNLFWASKKRREYSRTDVRLPELNYNHLPELRALGGIARNSRLTKK 470 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KE0 PSSCLDLNS-PTSPTPTRHSDTRTLLSPSGRNNRNEGTLDSRRTTTRHSKTMEELKLPEH :. :. . :. . :. . :: . :: CCDS82 ESKILSESRIPSLAAIDLHTPSITLHQVSGPPLSDDSGADLPQMEHQH 530 540 550 560 570 >>CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 (358 aa) initn: 846 init1: 745 opt: 976 Z-score: 572.2 bits: 116.0 E(32554): 1.5e-25 Smith-Waterman score: 986; 43.0% identity (74.9% similar) in 358 aa overlap (9-354:1-356) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVKETTLRE .:.:.: .: .:::.::::.:::...: .::::::: .::.. .:. .::: CCDS96 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALRE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 LKMLRTLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLI ..::. ::. :.:.: :.:::. .:.::::: ....:. :... ::: . ::: .: . CCDS96 IRMLKQLKHPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTL 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 KAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSP .:...:::.. .:::.::::.::....:.::::::::: :. : . ::.:::::::::: CCDS96 QAVNFCHKHNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLT-GPSDYYTDYVATRWYRSP 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE0 ELLLG-APYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLFY :::.: . :: ::.:..::...:: .: ::.::.:..:::. :.:.:: : .....: CCDS96 ELLVGDTQYGPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 SNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQT .: : :...: . . :: .. .: . : :.:. :..::..: :: :.:: :.. CCDS96 TNQYFSGVKIPDPEDMEPLELKFPNI-SYPALGLLKGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFEN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE0 QRLLD------RSPSRSAKRKP--YH--VESSTLSNRNQAGKSTALQS-HHRSNSKDIQN : .. .:.:.. :: .: .:.: :. : :. : . ... : .. CCDS96 IREIEDLAKEHNKPTRKTLRKSRKHHCFTETSKLQYLPQLTGSSILPALDNKKYYCDTKK 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE0 LSVGLPRADEGLPANESFLNGNLAGASLSPLHTKTYQASSQPGSTSKDLTNNNIPHLLSP :. .: CCDS96 LNYRFPNI >>CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 (315 aa) initn: 863 init1: 522 opt: 947 Z-score: 556.7 bits: 112.9 E(32554): 1.1e-24 Smith-Waterman score: 947; 45.4% identity (77.1% similar) in 306 aa overlap (10-313:1-303) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVKETTLRE :.:.: :. .:::.::::.:::.: . ..::.::: .::.. ::. .::: CCDS33 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVAVKKFVESEDDPVVKKIALRE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 LKMLRTLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLI ..::. ::. :.:.: :.:::. :..::::: ....:. ::. :::: .:: ..: . CCDS33 IRMLKQLKHPNLVNLIEVFRRKRKMHLVFEYCDHTLLNELERNPNGVADGVIKSVLWQTL 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 KAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSP .:...:: .. .::::::::.::... ..:.::::::. : :. ::.::::::::.: CCDS33 QALNFCHIHNCIHRDIKPENILITKQGIIKICDFGFAQILIPGDA--YTDYVATRWYRAP 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 pF1KE0 ELLLG-APYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLFY :::.: . ::.:::.:..::...:: ::::.::.:..:::. : ..:: : .....: CCDS33 ELLVGDTQYGSSVDIWAIGCVFAELLTGQPLWPGKSDVDQLYLIIRTLGKLIPRHQSIFK 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 SNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQT :: :::. .: . ..::... . . : :..::. ::..: :: : :. :.. CCDS33 SNGFFHGISIPEPEDMETLEEKFSDV-HPVALNFMKGCLKMNPDDRLTCSQLLESSYFDS 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 -QRLLDRSPSRSAKRKPYHVESSTLSNRNQAGKSTALQSHHRSNSKDIQNLSVGLPRADE :. . .:. : CCDS33 FQEAQIKRKARNEGRNRRRQQVLPLKS 290 300 310 >>CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 (276 aa) initn: 846 init1: 745 opt: 891 Z-score: 526.1 bits: 107.0 E(32554): 5.5e-23 Smith-Waterman score: 891; 48.8% identity (81.8% similar) in 258 aa overlap (9-265:1-257) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVKETTLRE .:.:.: .: .:::.::::.:::...: .::::::: .::.. .:. .::: CCDS73 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALRE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 LKMLRTLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLI ..::. ::. :.:.: :.:::. .:.::::: ....:. :... ::: . ::: .: . CCDS73 IRMLKQLKHPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTL 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 KAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSP .:...:::.. .:::.::::.::....:.::::::::: :. : . ::.:::::::::: CCDS73 QAVNFCHKHNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLT-GPSDYYTDYVATRWYRSP 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE0 ELLLG-APYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLFY :::.: . :: ::.:..::...:: .: ::.::.:..:::. :.:.:: : .....: CCDS73 ELLVGDTQYGPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 SNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQT .: : :...: . . :: .. .: CCDS73 TNQYFSGVKIPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGRVPIASRTE 240 250 260 270 >>CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 (455 aa) initn: 700 init1: 560 opt: 876 Z-score: 514.7 bits: 105.7 E(32554): 2.4e-22 Smith-Waterman score: 876; 35.4% identity (70.3% similar) in 421 aa overlap (10-423:1-411) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVKETTLRE :. .: :: ::::.::.:.::.::.: .::::: : . : . :.. ..:: CCDS47 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPE-QSVNKIAMRE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 LKMLRTLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLI .:.:. ...::.:.: :.::.. :..::::......:. :... .:. .....:..:.. CCDS47 IKFLKQFHHENLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQIL 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 KAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSP .:: . :.:.:.::::::::.:.:.. . :::::::::.:. .. ::.::::::::.: CCDS47 RAIDYLHSNNIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDI-YTDYVATRWYRAP 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 pF1KE0 ELLL-GAPYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLFY ::.: . ::: ::.:..::.. :.. :.: .:. :..: : : .: : . ...: CCDS47 ELVLKDTSYGKPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFS 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 SNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQT ..: : :. .: :.::.. ...: ::..: :... :..::::: . . :.: : CCDS47 KSPIFAGVVLPQVQHPKNARKKY-PKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTR 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 QRLLDR-SPSRSAKRKPYHVESSTLSNRNQAGKSTALQSHHRSN--SKDIQNLSV-GLPR . .... : .:: ... ..: . ....: . :.. .:.. .. . . :: : CCDS47 DGFIEKFMPELKAKLLQ-EAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGKEI 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 ADEGLPANESFLNGNLAGA--SLSPLHTKTYQASSQPGSTSKDLTNNNIPHLLSPKEAKS : : . . .. :. ..: . : :. :. ... .:.:. : .:: CCDS47 EKEKKPKEIKVRVIKVKGGRGDISEPKKKEYE-----GGLGQQDANENV-HPMSPDTKLV 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE0 KTEFDFNIDPKPSEGPGTKYLKSNSRSQQNRHSFMESSQSKAGTLQPNEKQSRHSYIDTI : :.: CCDS47 TIEPPNPINPSTNCNGLKENPHCGGSVTMPPINLTNSNLMAANLSSNLFHPSVR 410 420 430 440 450 >>CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 (592 aa) initn: 729 init1: 560 opt: 876 Z-score: 513.2 bits: 105.8 E(32554): 2.9e-22 Smith-Waterman score: 880; 32.7% identity (66.5% similar) in 486 aa overlap (10-464:1-479) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVKETTLRE :. .: :: ::::.::.:.::.::.: .::::: : . : . :.. ..:: CCDS47 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPE-QSVNKIAMRE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 LKMLRTLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLI .:.:. ...::.:.: :.::.. :..::::......:. :... .:. .....:..:.. CCDS47 IKFLKQFHHENLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQIL 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 KAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSP .:: . :.:.:.::::::::.:.:.. . :::::::::.:. .. ::.::::::::.: CCDS47 RAIDYLHSNNIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDI-YTDYVATRWYRAP 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 pF1KE0 ELLL-GAPYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLFY ::.: . ::: ::.:..::.. :.. :.: .:. :..: : : .: : . ...: CCDS47 ELVLKDTSYGKPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFS 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 SNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQT ..: : :. .: :.::.. ...: ::..: :... :..::::: . . :.: : CCDS47 KSPIFAGVVLPQVQHPKNARKKY-PKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTR 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 pF1KE0 QRLLDR-------------------SPSRSAK----RKPYH--VESSTLSNRNQAGKSTA . .... .:..:.: :: . : ..:: . . :: CCDS47 DGFIEKFMPELKAKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGK--E 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KE0 LQSHHRSNSKDIQNLSVGLPRADEGLPANESFLNG---NLAGASLSPLHTKTYQASSQPG ...... . .. ..: :.: . : .. . .: . :. .. :. : .. .: CCDS47 IEKEKKPKEIKVRVIKVKGGRGDISEPKKKEYEGGLGQQDANENVHPMSPDTKLVTIEPP 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 pF1KE0 STSKDLTNNNIPHLLSPKEAKSKTEFDFNIDPKP--SEGPGTKYLKSNSRSQQNRHSFME . . :: : .:. . : : .:. . . . ... .. . : . .. CCDS47 NPINPSTNCN-GLKENPHCGGSVTMPPINLTNSNLMAANLSSNLFHPSVRLTERAKKRRT 410 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 500 pF1KE0 SSQSKAGTLQPNEKQSRHSYIDTIPQSSRSPSYRTKAKSHGALSDSKSVSNLSEARAQIA :::: : ..:: .: CCDS47 SSQS-IGQVMPNSRQEDPGPIQSQMEKGIFNERTGHSDQMANENKRKLNFSRSDRKEFHF 470 480 490 500 510 520 >>CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 (292 aa) initn: 719 init1: 505 opt: 734 Z-score: 437.7 bits: 90.8 E(32554): 4.6e-18 Smith-Waterman score: 734; 41.0% identity (72.1% similar) in 290 aa overlap (10-297:1-286) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVKETTLRE :.:.: : .:::.::.:.: ...:::::::.:. . ....: : ..::: CCDS47 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIVALKRVRLDDDDEGVPSSALRE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 LKMLRTLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLI . .:. ::..:::.:..... :: ::::. .... . .. . . :: :::...::. CCDS47 ICLLKELKHKNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCNGDLDPEIVKSFLFQLL 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 KAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSP :.. .::. ...:::.::.::::..: ::: :::.:: .. :. :.: ::: : CCDS47 KGLGFCHSRNVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARAFGIPVRC-YSAEVVTLWYRPP 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE0 ELLLGAP-YGKSVDMWSVGCILGELSD-GQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLF ..:.:: :. :.::::.:::..::.. :.:::::.. ::: : ..:: :: . CCDS47 DVLFGAKLYSTSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDDQLKRIFRLLGTPTEEQWPSM 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 YSNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQ . : .. .: :: . ::.. ::..:::: .:..: .:. :.:: : CCDS47 TKLPDYKP--YPMYPATTSLVN-VVPKLNATGRDLLQNLLKCNPVQRISAEEALQHPYFS 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 TQRLLDRSPSRSAKRKPYHVESSTLSNRNQAGKSTALQSHHRSNSKDIQNLSVGLPRADE CCDS47 DFCPP 290 1030 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 05:14:37 2016 done: Fri Nov 4 05:14:37 2016 Total Scan time: 5.220 Total Display time: 0.190 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]