FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0075, 1447 aa 1>>>pF1KE0075 1447 - 1447 aa - 1447 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3381+/-0.00108; mu= 5.9438+/- 0.065 mean_var=233.6026+/-46.568, 0's: 0 Z-trim(111.6): 33 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.083914 statistics sampled from 12489 (12507) to 12489 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.702), E-opt: 0.2 (0.384), width: 16 Scan time: 4.270 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6714.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9 (1447) 9793 1199.8 0 CCDS47995.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9 (1446) 9327 1143.4 0 CCDS47996.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9 (1381) 9321 1142.7 0 CCDS43851.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9 (1296) 8768 1075.7 0 CCDS53312.1 PTCH2 gene_id:8643|Hs108|chr1 (1146) 2010 257.5 1.6e-67 CCDS516.1 PTCH2 gene_id:8643|Hs108|chr1 (1203) 2010 257.5 1.7e-67 >>CCDS6714.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9 (1447 aa) initn: 9793 init1: 9793 opt: 9793 Z-score: 6416.4 bits: 1199.8 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 9793; 100.0% identity (100.0% similar) in 1447 aa overlap (1-1447:1-1447) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MASAGNAAEPQDRGGGGSGCIGAPGRPAGGGRRRRTGGLRRAAAPDRDYLHRPSYCDAAF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 MASAGNAAEPQDRGGGGSGCIGAPGRPAGGGRRRRTGGLRRAAAPDRDYLHRPSYCDAAF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 ALEQISKGKATGRKAPLWLRAKFQRLLFKLGCYIQKNCGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAAN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 ALEQISKGKATGRKAPLWLRAKFQRLLFKLGCYIQKNCGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAAN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 LETNVEELWVEVGGRVSRELNYTRQKIGEEAMFNPQLMIQTPKEEGANVLTTEALLQHLD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 LETNVEELWVEVGGRVSRELNYTRQKIGEEAMFNPQLMIQTPKEEGANVLTTEALLQHLD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 SALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYMDQIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 SALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYMDQIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 LQSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVDSWEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 LQSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVDSWEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 DPDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMHWQEELIVGGTVKNSTGKLVSAHAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 DPDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMHWQEELIVGGTVKNSTGKLVSAHAL 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE0 QTMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAILEAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 QTMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAILEAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVL 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE0 SFTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLTMLRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 SFTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLTMLRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALS 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE0 VAAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVFLLAHAFSETGQNKRIPFEDRTGEC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 VAAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVFLLAHAFSETGQNKRIPFEDRTGEC 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE0 LKRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQAAVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 LKRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQAAVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDL 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE0 YRREDRRLDIFCCFTSPCVSRVIQVEPQAYTDTHDNTRYSPPPPYSSHSFAHETQITMQS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 YRREDRRLDIFCCFTSPCVSRVIQVEPQAYTDTHDNTRYSPPPPYSSHSFAHETQITMQS 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE0 TVQLRTEYDPHTHVYYTTAEPRSEISVQPVTVTQDTLSCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 TVQLRTEYDPHTHVYYTTAEPRSEISVQPVTVTQDTLSCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSL 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE0 HCLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFLFLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 HCLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFLFLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDI 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KE0 VPRETREYDFIAAQFKYFSFYNMYIVTQKADYPNIQHLLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 VPRETREYDFIAAQFKYFSFYNMYIVTQKADYPNIQHLLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQL 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KE0 PKMWLHYFRDWLQGLQDAFDSDWETGKIMPNNYKNGSDDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDIS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 PKMWLHYFRDWLQGLQDAFDSDWETGKIMPNNYKNGSDDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDIS 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KE0 QLTKQRLVDADGIINPSAFYIYLTAWVSNDPVAYAASQANIRPHRPEWVHDKADYMPETR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 QLTKQRLVDADGIINPSAFYIYLTAWVSNDPVAYAASQANIRPHRPEWVHDKADYMPETR 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE0 LRIPAAEPIEYAQFPFYLNGLRDTSDFVEAIEKVRTICSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 LRIPAAEPIEYAQFPFYLNGLRDTSDFVEAIEKVRTICSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQ 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE0 YIGLRHWLLLFISVVLACTFLVCAVFLLNPWTAGIIVMVLALMTVELFGMMGLIGIKLSA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 YIGLRHWLLLFISVVLACTFLVCAVFLLNPWTAGIIVMVLALMTVELFGMMGLIGIKLSA 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE0 VPVVILIASVGIGVEFTVHVALAFLTAIGDKNRRAVLALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLML :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 VPVVILIASVGIGVEFTVHVALAFLTAIGDKNRRAVLALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLML 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE0 AGSEFDFIVRYFFAVLAILTILGVLNGLVLLPVLLSFFGPYPEVSPANGLNRLPTPSPEP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 AGSEFDFIVRYFFAVLAILTILGVLNGLVLLPVLLSFFGPYPEVSPANGLNRLPTPSPEP 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KE0 PPSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSEELRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 PPSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSEELRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATE 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KE0 NPVFAHSTVVHPESRHHPPSNPRQQPHLDSGSLPPGRQGQQPRRDPPREGLWPPPYRPRR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 NPVFAHSTVVHPESRHHPPSNPRQQPHLDSGSLPPGRQGQQPRRDPPREGLWPPPYRPRR 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KE0 DAFEISTEGHSGPSNRARWGPRGARSHNPRNPASTAMGSSVPGYCQPITTVTASASVTVA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 DAFEISTEGHSGPSNRARWGPRGARSHNPRNPASTAMGSSVPGYCQPITTVTASASVTVA 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KE0 VHPPPVPGPGRNPRGGLCPGYPETDHGLFEDPHVPFHVRCERRDSKVEVIELQDVECEER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS67 VHPPPVPGPGRNPRGGLCPGYPETDHGLFEDPHVPFHVRCERRDSKVEVIELQDVECEER 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KE0 PRGSSSN ::::::: CCDS67 PRGSSSN >>CCDS47995.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9 (1446 aa) initn: 9327 init1: 9327 opt: 9327 Z-score: 6111.5 bits: 1143.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 9327; 100.0% identity (100.0% similar) in 1381 aa overlap (67-1447:66-1446) 40 50 60 70 80 90 pF1KE0 GGLRRAAAPDRDYLHRPSYCDAAFALEQISKGKATGRKAPLWLRAKFQRLLFKLGCYIQK :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 FCKDGGGGEEEEENGGEEKDDRGDKETRSDKGKATGRKAPLWLRAKFQRLLFKLGCYIQK 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 pF1KE0 NCGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAANLETNVEELWVEVGGRVSRELNYTRQKIGEEAMFNPQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 NCGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAANLETNVEELWVEVGGRVSRELNYTRQKIGEEAMFNPQ 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE0 LMIQTPKEEGANVLTTEALLQHLDSALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 LMIQTPKEEGANVLTTEALLQHLDSALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYM 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE0 DQIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAKLQSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 DQIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAKLQSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVD 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE0 SWEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPADPDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 SWEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPADPDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMH 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE0 WQEELIVGGTVKNSTGKLVSAHALQTMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 WQEELIVGGTVKNSTGKLVSAHALQTMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAIL 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE0 EAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVLSFTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 EAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVLSFTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLT 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE0 MLRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALSVAAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 MLRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALSVAAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVF 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KE0 LLAHAFSETGQNKRIPFEDRTGECLKRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 LLAHAFSETGQNKRIPFEDRTGECLKRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQ 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KE0 AAVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDLYRREDRRLDIFCCFTSPCVSRVIQVEPQAYTDTHDN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 AAVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDLYRREDRRLDIFCCFTSPCVSRVIQVEPQAYTDTHDN 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 pF1KE0 TRYSPPPPYSSHSFAHETQITMQSTVQLRTEYDPHTHVYYTTAEPRSEISVQPVTVTQDT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 TRYSPPPPYSSHSFAHETQITMQSTVQLRTEYDPHTHVYYTTAEPRSEISVQPVTVTQDT 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 pF1KE0 LSCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSLHCLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 LSCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSLHCLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFL 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 pF1KE0 FLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDIVPRETREYDFIAAQFKYFSFYNMYIVTQKADYPNIQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 FLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDIVPRETREYDFIAAQFKYFSFYNMYIVTQKADYPNIQ 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 pF1KE0 HLLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQLPKMWLHYFRDWLQGLQDAFDSDWETGKIMPNNYKNG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 HLLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQLPKMWLHYFRDWLQGLQDAFDSDWETGKIMPNNYKNG 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 pF1KE0 SDDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDISQLTKQRLVDADGIINPSAFYIYLTAWVSNDPVAYAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 SDDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDISQLTKQRLVDADGIINPSAFYIYLTAWVSNDPVAYAA 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 pF1KE0 SQANIRPHRPEWVHDKADYMPETRLRIPAAEPIEYAQFPFYLNGLRDTSDFVEAIEKVRT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 SQANIRPHRPEWVHDKADYMPETRLRIPAAEPIEYAQFPFYLNGLRDTSDFVEAIEKVRT 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE0 ICSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQYIGLRHWLLLFISVVLACTFLVCAVFLLNPWTAGII :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 ICSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQYIGLRHWLLLFISVVLACTFLVCAVFLLNPWTAGII 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE0 VMVLALMTVELFGMMGLIGIKLSAVPVVILIASVGIGVEFTVHVALAFLTAIGDKNRRAV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 VMVLALMTVELFGMMGLIGIKLSAVPVVILIASVGIGVEFTVHVALAFLTAIGDKNRRAV 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KE0 LALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLMLAGSEFDFIVRYFFAVLAILTILGVLNGLVLLPVLLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 LALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLMLAGSEFDFIVRYFFAVLAILTILGVLNGLVLLPVLLS 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KE0 FFGPYPEVSPANGLNRLPTPSPEPPPSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 FFGPYPEVSPANGLNRLPTPSPEPPPSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSE 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KE0 ELRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATENPVFAHSTVVHPESRHHPPSNPRQQPHLDSGSLPPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 ELRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATENPVFAHSTVVHPESRHHPPSNPRQQPHLDSGSLPPG 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KE0 RQGQQPRRDPPREGLWPPPYRPRRDAFEISTEGHSGPSNRARWGPRGARSHNPRNPASTA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 RQGQQPRRDPPREGLWPPPYRPRRDAFEISTEGHSGPSNRARWGPRGARSHNPRNPASTA 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KE0 MGSSVPGYCQPITTVTASASVTVAVHPPPVPGPGRNPRGGLCPGYPETDHGLFEDPHVPF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 MGSSVPGYCQPITTVTASASVTVAVHPPPVPGPGRNPRGGLCPGYPETDHGLFEDPHVPF 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KE0 HVRCERRDSKVEVIELQDVECEERPRGSSSN ::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 HVRCERRDSKVEVIELQDVECEERPRGSSSN 1420 1430 1440 >>CCDS47996.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9 (1381 aa) initn: 9321 init1: 9321 opt: 9321 Z-score: 6107.9 bits: 1142.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 9321; 100.0% identity (100.0% similar) in 1380 aa overlap (68-1447:2-1381) 40 50 60 70 80 90 pF1KE0 GLRRAAAPDRDYLHRPSYCDAAFALEQISKGKATGRKAPLWLRAKFQRLLFKLGCYIQKN :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 MGKATGRKAPLWLRAKFQRLLFKLGCYIQKN 10 20 30 100 110 120 130 140 150 pF1KE0 CGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAANLETNVEELWVEVGGRVSRELNYTRQKIGEEAMFNPQL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 CGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAANLETNVEELWVEVGGRVSRELNYTRQKIGEEAMFNPQL 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 pF1KE0 MIQTPKEEGANVLTTEALLQHLDSALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYMD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 MIQTPKEEGANVLTTEALLQHLDSALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYMD 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 pF1KE0 QIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAKLQSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVDS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 QIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAKLQSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVDS 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 pF1KE0 WEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPADPDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMHW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 WEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPADPDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMHW 220 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 390 pF1KE0 QEELIVGGTVKNSTGKLVSAHALQTMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAILE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 QEELIVGGTVKNSTGKLVSAHALQTMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAILE 280 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 450 pF1KE0 AWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVLSFTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLTM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 AWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVLSFTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLTM 340 350 360 370 380 390 460 470 480 490 500 510 pF1KE0 LRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALSVAAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 LRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALSVAAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVFL 400 410 420 430 440 450 520 530 540 550 560 570 pF1KE0 LAHAFSETGQNKRIPFEDRTGECLKRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 LAHAFSETGQNKRIPFEDRTGECLKRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQA 460 470 480 490 500 510 580 590 600 610 620 630 pF1KE0 AVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDLYRREDRRLDIFCCFTSPCVSRVIQVEPQAYTDTHDNT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 AVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDLYRREDRRLDIFCCFTSPCVSRVIQVEPQAYTDTHDNT 520 530 540 550 560 570 640 650 660 670 680 690 pF1KE0 RYSPPPPYSSHSFAHETQITMQSTVQLRTEYDPHTHVYYTTAEPRSEISVQPVTVTQDTL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 RYSPPPPYSSHSFAHETQITMQSTVQLRTEYDPHTHVYYTTAEPRSEISVQPVTVTQDTL 580 590 600 610 620 630 700 710 720 730 740 750 pF1KE0 SCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSLHCLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFLF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 SCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSLHCLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFLF 640 650 660 670 680 690 760 770 780 790 800 810 pF1KE0 LGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDIVPRETREYDFIAAQFKYFSFYNMYIVTQKADYPNIQH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 LGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDIVPRETREYDFIAAQFKYFSFYNMYIVTQKADYPNIQH 700 710 720 730 740 750 820 830 840 850 860 870 pF1KE0 LLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQLPKMWLHYFRDWLQGLQDAFDSDWETGKIMPNNYKNGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 LLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQLPKMWLHYFRDWLQGLQDAFDSDWETGKIMPNNYKNGS 760 770 780 790 800 810 880 890 900 910 920 930 pF1KE0 DDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDISQLTKQRLVDADGIINPSAFYIYLTAWVSNDPVAYAAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 DDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDISQLTKQRLVDADGIINPSAFYIYLTAWVSNDPVAYAAS 820 830 840 850 860 870 940 950 960 970 980 990 pF1KE0 QANIRPHRPEWVHDKADYMPETRLRIPAAEPIEYAQFPFYLNGLRDTSDFVEAIEKVRTI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 QANIRPHRPEWVHDKADYMPETRLRIPAAEPIEYAQFPFYLNGLRDTSDFVEAIEKVRTI 880 890 900 910 920 930 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE0 CSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQYIGLRHWLLLFISVVLACTFLVCAVFLLNPWTAGIIV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 CSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQYIGLRHWLLLFISVVLACTFLVCAVFLLNPWTAGIIV 940 950 960 970 980 990 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE0 MVLALMTVELFGMMGLIGIKLSAVPVVILIASVGIGVEFTVHVALAFLTAIGDKNRRAVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 MVLALMTVELFGMMGLIGIKLSAVPVVILIASVGIGVEFTVHVALAFLTAIGDKNRRAVL 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KE0 ALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLMLAGSEFDFIVRYFFAVLAILTILGVLNGLVLLPVLLSF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 ALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLMLAGSEFDFIVRYFFAVLAILTILGVLNGLVLLPVLLSF 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KE0 FGPYPEVSPANGLNRLPTPSPEPPPSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 FGPYPEVSPANGLNRLPTPSPEPPPSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSEE 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KE0 LRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATENPVFAHSTVVHPESRHHPPSNPRQQPHLDSGSLPPGR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 LRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATENPVFAHSTVVHPESRHHPPSNPRQQPHLDSGSLPPGR 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KE0 QGQQPRRDPPREGLWPPPYRPRRDAFEISTEGHSGPSNRARWGPRGARSHNPRNPASTAM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 QGQQPRRDPPREGLWPPPYRPRRDAFEISTEGHSGPSNRARWGPRGARSHNPRNPASTAM 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KE0 GSSVPGYCQPITTVTASASVTVAVHPPPVPGPGRNPRGGLCPGYPETDHGLFEDPHVPFH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 GSSVPGYCQPITTVTASASVTVAVHPPPVPGPGRNPRGGLCPGYPETDHGLFEDPHVPFH 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1420 1430 1440 pF1KE0 VRCERRDSKVEVIELQDVECEERPRGSSSN :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 VRCERRDSKVEVIELQDVECEERPRGSSSN 1360 1370 1380 >>CCDS43851.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9 (1296 aa) initn: 8768 init1: 8768 opt: 8768 Z-score: 5746.5 bits: 1075.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 8768; 100.0% identity (100.0% similar) in 1296 aa overlap (152-1447:1-1296) 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 ETNVEELWVEVGGRVSRELNYTRQKIGEEAMFNPQLMIQTPKEEGANVLTTEALLQHLDS :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 MFNPQLMIQTPKEEGANVLTTEALLQHLDS 10 20 30 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 ALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYMDQIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 ALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYMDQIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAKL 40 50 60 70 80 90 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 QSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVDSWEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPAD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 QSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVDSWEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPAD 100 110 120 130 140 150 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 PDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMHWQEELIVGGTVKNSTGKLVSAHALQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 PDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMHWQEELIVGGTVKNSTGKLVSAHALQ 160 170 180 190 200 210 370 380 390 400 410 420 pF1KE0 TMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAILEAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 TMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAILEAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVLS 220 230 240 250 260 270 430 440 450 460 470 480 pF1KE0 FTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLTMLRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALSV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 FTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLTMLRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALSV 280 290 300 310 320 330 490 500 510 520 530 540 pF1KE0 AAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVFLLAHAFSETGQNKRIPFEDRTGECL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 AAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVFLLAHAFSETGQNKRIPFEDRTGECL 340 350 360 370 380 390 550 560 570 580 590 600 pF1KE0 KRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQAAVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDLY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 KRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQAAVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDLY 400 410 420 430 440 450 610 620 630 640 650 660 pF1KE0 RREDRRLDIFCCFTSPCVSRVIQVEPQAYTDTHDNTRYSPPPPYSSHSFAHETQITMQST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 RREDRRLDIFCCFTSPCVSRVIQVEPQAYTDTHDNTRYSPPPPYSSHSFAHETQITMQST 460 470 480 490 500 510 670 680 690 700 710 720 pF1KE0 VQLRTEYDPHTHVYYTTAEPRSEISVQPVTVTQDTLSCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSLH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 VQLRTEYDPHTHVYYTTAEPRSEISVQPVTVTQDTLSCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSLH 520 530 540 550 560 570 730 740 750 760 770 780 pF1KE0 CLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFLFLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDIV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 CLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFLFLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDIV 580 590 600 610 620 630 790 800 810 820 830 840 pF1KE0 PRETREYDFIAAQFKYFSFYNMYIVTQKADYPNIQHLLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 PRETREYDFIAAQFKYFSFYNMYIVTQKADYPNIQHLLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQLP 640 650 660 670 680 690 850 860 870 880 890 900 pF1KE0 KMWLHYFRDWLQGLQDAFDSDWETGKIMPNNYKNGSDDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDISQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 KMWLHYFRDWLQGLQDAFDSDWETGKIMPNNYKNGSDDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDISQ 700 710 720 730 740 750 910 920 930 940 950 960 pF1KE0 LTKQRLVDADGIINPSAFYIYLTAWVSNDPVAYAASQANIRPHRPEWVHDKADYMPETRL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 LTKQRLVDADGIINPSAFYIYLTAWVSNDPVAYAASQANIRPHRPEWVHDKADYMPETRL 760 770 780 790 800 810 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE0 RIPAAEPIEYAQFPFYLNGLRDTSDFVEAIEKVRTICSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 RIPAAEPIEYAQFPFYLNGLRDTSDFVEAIEKVRTICSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQY 820 830 840 850 860 870 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE0 IGLRHWLLLFISVVLACTFLVCAVFLLNPWTAGIIVMVLALMTVELFGMMGLIGIKLSAV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 IGLRHWLLLFISVVLACTFLVCAVFLLNPWTAGIIVMVLALMTVELFGMMGLIGIKLSAV 880 890 900 910 920 930 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE0 PVVILIASVGIGVEFTVHVALAFLTAIGDKNRRAVLALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLMLA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 PVVILIASVGIGVEFTVHVALAFLTAIGDKNRRAVLALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLMLA 940 950 960 970 980 990 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE0 GSEFDFIVRYFFAVLAILTILGVLNGLVLLPVLLSFFGPYPEVSPANGLNRLPTPSPEPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 GSEFDFIVRYFFAVLAILTILGVLNGLVLLPVLLSFFGPYPEVSPANGLNRLPTPSPEPP 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KE0 PSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSEELRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATEN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 PSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSEELRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATEN 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KE0 PVFAHSTVVHPESRHHPPSNPRQQPHLDSGSLPPGRQGQQPRRDPPREGLWPPPYRPRRD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 PVFAHSTVVHPESRHHPPSNPRQQPHLDSGSLPPGRQGQQPRRDPPREGLWPPPYRPRRD 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KE0 AFEISTEGHSGPSNRARWGPRGARSHNPRNPASTAMGSSVPGYCQPITTVTASASVTVAV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 AFEISTEGHSGPSNRARWGPRGARSHNPRNPASTAMGSSVPGYCQPITTVTASASVTVAV 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KE0 HPPPVPGPGRNPRGGLCPGYPETDHGLFEDPHVPFHVRCERRDSKVEVIELQDVECEERP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 HPPPVPGPGRNPRGGLCPGYPETDHGLFEDPHVPFHVRCERRDSKVEVIELQDVECEERP 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KE0 RGSSSN :::::: CCDS43 RGSSSN >>CCDS53312.1 PTCH2 gene_id:8643|Hs108|chr1 (1146 aa) initn: 3584 init1: 1216 opt: 2010 Z-score: 1325.6 bits: 257.5 E(32554): 1.6e-67 Smith-Waterman score: 4355; 56.3% identity (81.9% similar) in 1158 aa overlap (53-1203:12-1135) 30 40 50 60 70 80 pF1KE0 APGRPAGGGRRRRTGGLRRAAAPDRDYLHRPSYCDAA-FALEQISKGKATGRKAPLWLRA ::: : : :: :. :::::::: CCDS53 MTRSPPLRELPPSYTPPARTAAPQILAGSL---KAPLWLRA 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE0 KFQRLLFKLGCYIQKNCGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAANLETNVEELWVEVGGRVSRELN :: :::.::: ::..::: : .::: :::.:.::. : .:::.:.::::::.:::.::. CCDS53 YFQGLLFSLGCGIQRHCGKVLFLGLLAFGALALGLRMAIIETNLEQLWVEVGSRVSQELH 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE0 YTRQKIGEEAMFNPQLMIQTPKEEGANVLTTEALLQHLDSALQASRVHVYMYNRQWKLEH ::..:.:::: .. :..::: ..:: :.:: ::: ::..:: ::.:.: .:...: :.. CCDS53 YTKEKLGEEAAYTSQMLIQTARQEGENILTPEALGLHLQAALTASKVQVSLYGKSWDLNK 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE0 LCYKSGELITETGYMDQIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAKLQSGTAYLLGKPPLRWTNFDP .::::: . :.:.....:: :.::.:.:::::::::::::.:.::: :.: ..:::.:: CCDS53 ICYKSGVPLIENGMIERMIEKLFPCVILTPLDCFWEGAKLQGGSAYLPGRPDIQWTNLDP 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 pF1KE0 LEFLEELKKINYQVDSWEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPADPDCPATAPNKNSTKPLDMAL ..:::: . ......:.:.::.::..:. ::::.: : :: .:::..: . ..: CCDS53 EQLLEELGPFA-SLEGFRELLDKAQVGQAYVGRPCLHPDDLHCPPSAPNHHSRQAPNVAH 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 pF1KE0 VLNGGCHGLSRKYMHWQEELIVGGTVKNSTGKLVSAHALQTMFQLMTPKQMYEHFKGYEY :.:::::.:.:.:::::::..:: ... :.:. :.:::. : ::.:.:.::::.: .: CCDS53 ELSGGCHGFSHKFMHWQEELLLGGMARDPQGELLRAEALQSTFLLMSPRQLYEHFRG-DY 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 pF1KE0 VSH-INWNEDKAAAILEAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVLSFTTTTLDDILKSFSDVSVI .: :.:.:..:...:.:::: .:....... .:..:.. .:..:::::::..::.::. CCDS53 QTHDIGWSEEQASTVLQAWQRRFVQLAQEALPENASQQIHAFSSTTLDDILHAFSEVSAA 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 500 pF1KE0 RVASGYLLMLAYACLTMLRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALSVAAGLGLCSLIGISFNAATT ::..::::::::::.:::::::..:::.:::::::::::.::.:::::.:.::.:::::: CCDS53 RVVGGYLLMLAYACVTMLRWDCAQSQGSVGLAGVLLVALAVASGLGLCALLGITFNAATT 400 410 420 430 440 450 510 520 530 540 550 560 pF1KE0 QVLPFLALGVGVDDVFLLAHAFSETGQNKRIPFEDRTGECLKRTGASVALTSISNVTAFF :::::::::.::::::::::::.:. . :...: ::::.:::.::.::::.:..::. CCDS53 QVLPFLALGIGVDDVFLLAHAFTEALPG--TPLQERMGECLQRTGTSVVLTSINNMAAFL 460 470 480 490 500 510 570 580 590 600 610 620 pF1KE0 MAALIPIPALRAFSLQAAVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDLYRREDRRLDIFCCFTSPCVS ::::.:::::::::::::.:: .:. :.:.::::::.:: ::. .:::..:::.::: . CCDS53 MAALVPIPALRAFSLQAAIVVGCTFVAVMLVFPAILSLDLRRRHCQRLDVLCCFSSPCSA 520 530 540 550 560 570 630 640 650 660 670 680 pF1KE0 RVIQVEPQAYTDTHDNTRYSPPPPYSSHSFAHETQITMQSTVQLRTEYDPHTHVYYTTAE .:::. :: . :.: : . .:: : .::: :. . .. : CCDS53 QVIQILPQ---ELGDGTV-----PVG---IAHLT-----ATVQAFTHCEASSQHVVTILP 580 590 600 610 690 700 710 720 730 pF1KE0 PRSEISVQPVTVTQDTLSCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSLH--CLEPPCTKWTLSSFAEK :.... : .: :. . .::::::.: .. . : ::..:.:. ::. CCDS53 PQAHLVPPP----SDPLGSELFSPGGSTRDLLGQEEETRQKAACKSLPCARWNLAHFARY 620 630 640 650 660 670 740 750 760 770 780 790 pF1KE0 HYAPFLLKPKAKVVVIFLFLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDIVPRETREYDFIAAQFKYF ..::.::. .::..:. :: .:::.::::.: :.::: :::.::: :.:. :..::..:: CCDS53 QFAPLLLQSHAKAIVLVLFGALLGLSLYGATLVQDGLALTDVVPRGTKEHAFLSAQLRYF 680 690 700 710 720 730 800 810 820 830 840 850 pF1KE0 SFYNMYIVTQKA-DYPNIQHLLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQLPKMWLHYFRDWLQGLQD :.:.. .::: . :: . :. :.:::. ::..: :. : :. ::::.:.::::.: CCDS53 SLYEVALVTQGGFDYAHSQRALFDLHQRFSSLKAVLPPPATQAPRTWLHYYRNWLQGIQA 740 750 760 770 780 790 860 870 880 890 900 910 pF1KE0 AFDSDWETGKIMPNNYKNGSDDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDISQLTKQRLVDADGIINPS :::.:: .:.: ..:.:::.::.::::::.:::. ..:.:.:::: ..::: .:.: : CCDS53 AFDQDWASGRITRHSYRNGSEDGALAYKLLIQTGDAQEPLDFSQLTTRKLVDREGLIPPE 800 810 820 830 840 850 920 930 940 950 960 970 pF1KE0 AFYIYLTAWVSNDPVAYAASQANIRPHRPEWVHDKADYMPETRLRIPAAEPIEYAQFPFY ::. ::.:::.::.. ::::::. : :::.::: : :. :::: :.:.:.::::: CCDS53 LFYMGLTVWVSSDPLGLAASQANFYPPPPEWLHDKYDTTGEN-LRIPPAQPLEFAQFPFL 860 870 880 890 900 910 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE0 LNGLRDTSDFVEAIEKVRTICSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQYIGLRHWLLLFISVVLA : ::. :.::::::: .:. :.. . :. .::.: ::::::::.:::. .:: . ..:. CCDS53 LRGLQKTADFVEAIEGARAACAEAGQAGVHAYPSGSPFLFWEQYLGLRRCFLLAVCILLV 920 930 940 950 960 970 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE0 CTFLVCAVFLLNPWTAGIIVMVLALMTVELFGMMGLIGIKLSAVPVVILIASVGIGVEFT :::::::..::::::::.::.:::.:::::::.::..::::::.:::::.:::::::::: CCDS53 CTFLVCALLLLNPWTAGLIVLVLAMMTVELFGIMGFLGIKLSAIPVVILVASVGIGVEFT 980 990 1000 1010 1020 1030 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE0 VHVALAFLTAIGDKNRRAVLALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLMLAGSEFDFIVRYFFAVLA :::::.:::. :..: ::. :::: :::: :::.:::::.::::::.::::::::::.:. CCDS53 VHVALGFLTTQGSRNLRAAHALEHTFAPVTDGAISTLLGLLMLAGSHFDFIVRYFFAALT 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE0 ILTILGVLNGLVLLPVLLSFFGPYPEVSPANGLNRLPTPSPE--PPPSVVRFAMPPGHTH .::.::.:.::::::::::..:: ::: .. ::: ::. CCDS53 VLTLLGLLHGLVLLPVLLSILGPPPEVI------QMYKESPEILSPPAPQGGGLRPEEI 1100 1110 1120 1130 1140 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE0 SGSDSSDSEYSSQTTVSGLSEELRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATENPVFAHSTVVHPESR >>CCDS516.1 PTCH2 gene_id:8643|Hs108|chr1 (1203 aa) initn: 3662 init1: 1216 opt: 2010 Z-score: 1325.3 bits: 257.5 E(32554): 1.7e-67 Smith-Waterman score: 4357; 55.5% identity (81.0% similar) in 1187 aa overlap (53-1232:12-1159) 30 40 50 60 70 80 pF1KE0 APGRPAGGGRRRRTGGLRRAAAPDRDYLHRPSYCDAA-FALEQISKGKATGRKAPLWLRA ::: : : :: :. :::::::: CCDS51 MTRSPPLRELPPSYTPPARTAAPQILAGSL---KAPLWLRA 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE0 KFQRLLFKLGCYIQKNCGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAANLETNVEELWVEVGGRVSRELN :: :::.::: ::..::: : .::: :::.:.::. : .:::.:.::::::.:::.::. CCDS51 YFQGLLFSLGCGIQRHCGKVLFLGLLAFGALALGLRMAIIETNLEQLWVEVGSRVSQELH 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE0 YTRQKIGEEAMFNPQLMIQTPKEEGANVLTTEALLQHLDSALQASRVHVYMYNRQWKLEH ::..:.:::: .. :..::: ..:: :.:: ::: ::..:: ::.:.: .:...: :.. CCDS51 YTKEKLGEEAAYTSQMLIQTARQEGENILTPEALGLHLQAALTASKVQVSLYGKSWDLNK 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE0 LCYKSGELITETGYMDQIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAKLQSGTAYLLGKPPLRWTNFDP .::::: . :.:.....:: :.::.:.:::::::::::::.:.::: :.: ..:::.:: CCDS51 ICYKSGVPLIENGMIERMIEKLFPCVILTPLDCFWEGAKLQGGSAYLPGRPDIQWTNLDP 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 pF1KE0 LEFLEELKKINYQVDSWEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPADPDCPATAPNKNSTKPLDMAL ..:::: . ......:.:.::.::..:. ::::.: : :: .:::..: . ..: CCDS51 EQLLEELGPFA-SLEGFRELLDKAQVGQAYVGRPCLHPDDLHCPPSAPNHHSRQAPNVAH 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 pF1KE0 VLNGGCHGLSRKYMHWQEELIVGGTVKNSTGKLVSAHALQTMFQLMTPKQMYEHFKGYEY :.:::::.:.:.:::::::..:: ... :.:. :.:::. : ::.:.:.::::.: .: CCDS51 ELSGGCHGFSHKFMHWQEELLLGGMARDPQGELLRAEALQSTFLLMSPRQLYEHFRG-DY 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 pF1KE0 VSH-INWNEDKAAAILEAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVLSFTTTTLDDILKSFSDVSVI .: :.:.:..:...:.:::: .:....... .:..:.. .:..:::::::..::.::. CCDS51 QTHDIGWSEEQASTVLQAWQRRFVQLAQEALPENASQQIHAFSSTTLDDILHAFSEVSAA 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 500 pF1KE0 RVASGYLLMLAYACLTMLRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALSVAAGLGLCSLIGISFNAATT ::..::::::::::.:::::::..:::.:::::::::::.::.:::::.:.::.:::::: CCDS51 RVVGGYLLMLAYACVTMLRWDCAQSQGSVGLAGVLLVALAVASGLGLCALLGITFNAATT 400 410 420 430 440 450 510 520 530 540 550 560 pF1KE0 QVLPFLALGVGVDDVFLLAHAFSETGQNKRIPFEDRTGECLKRTGASVALTSISNVTAFF :::::::::.::::::::::::.:. . :...: ::::.:::.::.::::.:..::. CCDS51 QVLPFLALGIGVDDVFLLAHAFTEALPGT--PLQERMGECLQRTGTSVVLTSINNMAAFL 460 470 480 490 500 510 570 580 590 600 610 620 pF1KE0 MAALIPIPALRAFSLQAAVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDLYRREDRRLDIFCCFTSPCVS ::::.:::::::::::::.:: .:. :.:.::::::.:: ::. .:::..:::.::: . CCDS51 MAALVPIPALRAFSLQAAIVVGCTFVAVMLVFPAILSLDLRRRHCQRLDVLCCFSSPCSA 520 530 540 550 560 570 630 640 650 660 670 680 pF1KE0 RVIQVEPQAYTDTHDNTRYSPPPPYSSHSFAHETQITMQSTVQLRTEYDPHTHVYYTTAE .:::. :: . :.: : . .:: : .::: :. . .. : CCDS51 QVIQILPQ---ELGDGT-----VPVG---IAHLT-----ATVQAFTHCEASSQHVVTILP 580 590 600 610 690 700 710 720 730 pF1KE0 PRSEISVQPVTVTQDTLSCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSLH--CLEPPCTKWTLSSFAEK :.... : .: :. . .::::::.: .. . : ::..:.:. ::. CCDS51 PQAHLVPPP----SDPLGSELFSPGGSTRDLLGQEEETRQKAACKSLPCARWNLAHFARY 620 630 640 650 660 670 740 750 760 770 780 790 pF1KE0 HYAPFLLKPKAKVVVIFLFLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDIVPRETREYDFIAAQFKYF ..::.::. .::..:. :: .:::.::::.: :.::: :::.::: :.:. :..::..:: CCDS51 QFAPLLLQSHAKAIVLVLFGALLGLSLYGATLVQDGLALTDVVPRGTKEHAFLSAQLRYF 680 690 700 710 720 730 800 810 820 830 840 850 pF1KE0 SFYNMYIVTQKA-DYPNIQHLLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQLPKMWLHYFRDWLQGLQD :.:.. .::: . :: . :. :.:::. ::..: :. : :. ::::.:.::::.: CCDS51 SLYEVALVTQGGFDYAHSQRALFDLHQRFSSLKAVLPPPATQAPRTWLHYYRNWLQGIQA 740 750 760 770 780 790 860 870 880 890 900 910 pF1KE0 AFDSDWETGKIMPNNYKNGSDDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDISQLTKQRLVDADGIINPS :::.:: .:.: ..:.:::.::.::::::.:::. ..:.:.:::: ..::: .:.: : CCDS51 AFDQDWASGRITRHSYRNGSEDGALAYKLLIQTGDAQEPLDFSQLTTRKLVDREGLIPPE 800 810 820 830 840 850 920 930 940 950 960 970 pF1KE0 AFYIYLTAWVSNDPVAYAASQANIRPHRPEWVHDKADYMPETRLRIPAAEPIEYAQFPFY ::. ::.:::.::.. ::::::. : :::.::: : :. :::: :.:.:.::::: CCDS51 LFYMGLTVWVSSDPLGLAASQANFYPPPPEWLHDKYDTTGEN-LRIPPAQPLEFAQFPFL 860 870 880 890 900 910 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE0 LNGLRDTSDFVEAIEKVRTICSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQYIGLRHWLLLFISVVLA : ::. :.::::::: .:. :.. . :. .::.: ::::::::.:::. .:: . ..:. CCDS51 LRGLQKTADFVEAIEGARAACAEAGQAGVHAYPSGSPFLFWEQYLGLRRCFLLAVCILLV 920 930 940 950 960 970 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE0 CTFLVCAVFLLNPWTAGIIVMVLALMTVELFGMMGLIGIKLSAVPVVILIASVGIGVEFT :::::::..::::::::.::.:::.:::::::.::..::::::.:::::.:::::::::: CCDS51 CTFLVCALLLLNPWTAGLIVLVLAMMTVELFGIMGFLGIKLSAIPVVILVASVGIGVEFT 980 990 1000 1010 1020 1030 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE0 VHVALAFLTAIGDKNRRAVLALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLMLAGSEFDFIVRYFFAVLA :::::.:::. :..: ::. :::: :::: :::.:::::.::::::.::::::::::.:. CCDS51 VHVALGFLTTQGSRNLRAAHALEHTFAPVTDGAISTLLGLLMLAGSHFDFIVRYFFAALT 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE0 ILTILGVLNGLVLLPVLLSFFGPYPEVSPANGLNRLPTPSPE--PPPSVVRFAMPPGHTH .::.::.:.::::::::::..:: ::: .. ::: :: : : . CCDS51 VLTLLGLLHGLVLLPVLLSILGPPPEVI------QMYKESPEILSPP-----APQGGGLR 1100 1110 1120 1130 1140 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE0 SGSDSSDSEYSSQTTVSGLSEELRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATENPVFAHSTVVHPESR :..:: . ...:.: CCDS51 WGASSSLPQSFARVTTSMTVAIHPPPLPGAYIHPAPDEPPWSPAATSSGNLSSRGPGPAT 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1447 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 04:12:24 2016 done: Fri Nov 4 04:12:25 2016 Total Scan time: 4.270 Total Display time: 0.380 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]