Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0083
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0083, 525 aa
1>>>pF1KE0083 525 - 525 aa - 525 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9276+/-0.00108; mu= 15.0615+/- 0.065
mean_var=81.7333+/-16.099, 0's: 0 Z-trim(104.8): 108 B-trim: 7 in 1/48
Lambda= 0.141865
statistics sampled from 7975 (8091) to 7975 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.249), width: 16
Scan time: 2.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10727.1 NETO2 gene_id:81831|Hs108|chr16 ( 525) 3586 744.2 8.6e-215
CCDS58460.1 NETO2 gene_id:81831|Hs108|chr16 ( 518) 3512 729.0 3.1e-210
CCDS12000.1 NETO1 gene_id:81832|Hs108|chr18 ( 533) 2107 441.5 1.2e-123
CCDS42444.1 NETO1 gene_id:81832|Hs108|chr18 ( 156) 627 138.3 6.3e-33
CCDS7113.1 CUBN gene_id:8029|Hs108|chr10 (3623) 338 79.9 5.7e-14
CCDS46499.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 555) 321 75.9 1.3e-13
CCDS46498.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 901) 321 76.1 2e-13
CCDS2365.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 906) 321 76.1 2e-13
CCDS46497.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 909) 321 76.1 2e-13
CCDS46496.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 926) 321 76.1 2e-13
CCDS2364.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 931) 321 76.1 2e-13
CCDS3811.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 (1013) 319 75.7 2.9e-13
CCDS31179.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 609) 305 72.7 1.4e-12
CCDS31180.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 644) 305 72.7 1.4e-12
CCDS7449.1 TLL2 gene_id:7093|Hs108|chr10 (1015) 306 73.0 1.8e-12
CCDS81448.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 906) 305 72.8 1.9e-12
CCDS7177.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 923) 305 72.8 1.9e-12
CCDS34856.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 730) 293 70.3 8.7e-12
CCDS6026.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 986) 293 70.3 1.1e-11
CCDS8421.1 MFRP gene_id:83552|Hs108|chr11 ( 579) 285 68.6 2.2e-11
>>CCDS10727.1 NETO2 gene_id:81831|Hs108|chr16 (525 aa)
initn: 3586 init1: 3586 opt: 3586 Z-score: 3969.7 bits: 744.2 E(32554): 8.6e-215
Smith-Waterman score: 3586; 100.0% identity (100.0% similar) in 525 aa overlap (1-525:1-525)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MALERLCSVLKVLLITVLVVEGIAVAQKTQDGQNIGIKHIPATQCGIWVRTSNGGHFASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MALERLCSVLKVLLITVLVVEGIAVAQKTQDGQNIGIKHIPATQCGIWVRTSNGGHFASP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 NYPDSYPPNKECIYILEAAPRQRIELTFDEHYYIEPSFECRFDHLEVRDGPFGFSPLIDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NYPDSYPPNKECIYILEAAPRQRIELTFDEHYYIEPSFECRFDHLEVRDGPFGFSPLIDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YCGVKSPPLIRSTGRFMWIKFSSDEELEGLGFRAKYSFIPDPDFTYLGGILNPIPDCQFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YCGVKSPPLIRSTGRFMWIKFSSDEELEGLGFRAKYSFIPDPDFTYLGGILNPIPDCQFE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LSGADGIVRSSQVEQEEKTKPGQAVDCIWTIKATPKAKIYLRFLDYQMEHSNECKRNFVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LSGADGIVRSSQVEQEEKTKPGQAVDCIWTIKATPKAKIYLRFLDYQMEHSNECKRNFVA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VYDGSSSIENLKAKFCSTVANDVMLKTGIGVIRMWADEGSRLSRFRMLFTSFVEPPCTSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VYDGSSSIENLKAKFCSTVANDVMLKTGIGVIRMWADEGSRLSRFRMLFTSFVEPPCTSS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 TFFCHSNMCINNSLVCNGVQNCAYPWDENHCKEKKKAGVFEQITKTHGTIIGITSGIVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TFFCHSNMCINNSLVCNGVQNCAYPWDENHCKEKKKAGVFEQITKTHGTIIGITSGIVLV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 LLIISILVQVKQPRKKVMACKTAFNKTGFQEVFDPPHYELFSLRDKEISADLADLSEELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LLIISILVQVKQPRKKVMACKTAFNKTGFQEVFDPPHYELFSLRDKEISADLADLSEELD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 NYQKMRRSSTASRCIHDHHCGSQASSVKQSRTNLSSMELPFRNDFAQPQPMKTFNSTFKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NYQKMRRSSTASRCIHDHHCGSQASSVKQSRTNLSSMELPFRNDFAQPQPMKTFNSTFKK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE0 SSYTFKQGHECPEQALEDRVMEEIPCEIYVRGREDSAQASISIDF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SSYTFKQGHECPEQALEDRVMEEIPCEIYVRGREDSAQASISIDF
490 500 510 520
>>CCDS58460.1 NETO2 gene_id:81831|Hs108|chr16 (518 aa)
initn: 3522 init1: 2367 opt: 3512 Z-score: 3887.9 bits: 729.0 E(32554): 3.1e-210
Smith-Waterman score: 3512; 98.7% identity (98.7% similar) in 525 aa overlap (1-525:1-518)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MALERLCSVLKVLLITVLVVEGIAVAQKTQDGQNIGIKHIPATQCGIWVRTSNGGHFASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MALERLCSVLKVLLITVLVVEGIAVAQKTQDGQNIGIKHIPATQCGIWVRTSNGGHFASP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 NYPDSYPPNKECIYILEAAPRQRIELTFDEHYYIEPSFECRFDHLEVRDGPFGFSPLIDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NYPDSYPPNKECIYILEAAPRQRIELTFDEHYYIEPSFECRFDHLEVRDGPFGFSPLIDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YCGVKSPPLIRSTGRFMWIKFSSDEELEGLGFRAKYSFIPDPDFTYLGGILNPIPDCQFE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS58 YCGVKSPPLIRSTGRFMWIKFSSDEELEGLGFRAKYSFIPDPDFTYLG-------DCQFE
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LSGADGIVRSSQVEQEEKTKPGQAVDCIWTIKATPKAKIYLRFLDYQMEHSNECKRNFVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LSGADGIVRSSQVEQEEKTKPGQAVDCIWTIKATPKAKIYLRFLDYQMEHSNECKRNFVA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VYDGSSSIENLKAKFCSTVANDVMLKTGIGVIRMWADEGSRLSRFRMLFTSFVEPPCTSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VYDGSSSIENLKAKFCSTVANDVMLKTGIGVIRMWADEGSRLSRFRMLFTSFVEPPCTSS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 TFFCHSNMCINNSLVCNGVQNCAYPWDENHCKEKKKAGVFEQITKTHGTIIGITSGIVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TFFCHSNMCINNSLVCNGVQNCAYPWDENHCKEKKKAGVFEQITKTHGTIIGITSGIVLV
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 LLIISILVQVKQPRKKVMACKTAFNKTGFQEVFDPPHYELFSLRDKEISADLADLSEELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LLIISILVQVKQPRKKVMACKTAFNKTGFQEVFDPPHYELFSLRDKEISADLADLSEELD
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 NYQKMRRSSTASRCIHDHHCGSQASSVKQSRTNLSSMELPFRNDFAQPQPMKTFNSTFKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NYQKMRRSSTASRCIHDHHCGSQASSVKQSRTNLSSMELPFRNDFAQPQPMKTFNSTFKK
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520
pF1KE0 SSYTFKQGHECPEQALEDRVMEEIPCEIYVRGREDSAQASISIDF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SSYTFKQGHECPEQALEDRVMEEIPCEIYVRGREDSAQASISIDF
480 490 500 510
>>CCDS12000.1 NETO1 gene_id:81832|Hs108|chr18 (533 aa)
initn: 2020 init1: 1248 opt: 2107 Z-score: 2333.6 bits: 441.5 E(32554): 1.2e-123
Smith-Waterman score: 2107; 57.9% identity (80.8% similar) in 516 aa overlap (8-517:6-511)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MALERLCSVLKVLLITVLVVEGIAVAQKTQDGQNIGIKHIPATQCGIWVRTSNGGHFASP
:::.. .. :.. .. : : .. . ..::: :.. ..:: :.::
CCDS12 MIHGRSVLHI--VASLIILHLSGATKKGTEKQTTSETQKSVQCGTWTKHAEGGIFTSP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 NYPDSYPPNKECIYILEAAPRQRIELTFDEHYYIEPSFECRFDHLEVRDGPFGFSPLIDR
:::..:::..:::::.:::::: ::: :::.: ::::.::.:::.:::::::::::.: :
CCDS12 NYPSKYPPDRECIYIIEAAPRQCIELYFDEKYSIEPSWECKFDHIEVRDGPFGFSPIIGR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YCGVKSPPLIRSTGRFMWIKFSSDEELEGLGFRAKYSFIPDPDFTYLGGILNPIPDCQFE
.:: ..::.:.:.:::.:::: .: :::..:: :.:.: ::::: ::. :.:.: :.::
CCDS12 FCGQQNPPVIKSSGRFLWIKFFADGELESMGFSARYNFTPDPDFKDLGA-LKPLPACEFE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LSGADGIVRSSQVEQEEKTKPGQAVDCIWTIKATPKAKIYLRFLDYQMEHSNECKRNFVA
..:..:::.: :. .: :. ..:::: : :.: :..:::::::::.:..::::::::::
CCDS12 MGGSEGIVESIQIMKEGKATASEAVDCKWYIRAPPRSKIYLRFLDYEMQNSNECKRNFVA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VYDGSSSIENLKAKFCSTVANDVMLKTGIGVIRMWADEGSRLSRFRMLFTSFVEPPCTSS
:::::::.:.:::::::::::::::.::.:::::::::::: :::.:::::: :::: ..
CCDS12 VYDGSSSVEDLKAKFCSTVANDVMLRTGLGVIRMWADEGSRNSRFQMLFTSFQEPPCEGN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 TFFCHSNMCINNSLVCNGVQNCAYPWDENHCKEKKKAGVFEQITKTHGTIIGITSGIVLV
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CCDS12 TFFCHSNMCINNTLVCNGLQNCVYPWDENHCKEKRKTSLLDQLTNTSGTVIGVTSCIVII
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 LLIISILVQVKQPRKKVMACKTAFNKTGFQEVFDPPHYELFSLRDKEISADLADLSEELD
:.:::..::.:::::: . :. :..: :::::.:::::: .:: .::.::......
CCDS12 LIIISVIVQIKQPRKKYVQRKSDFDQTVFQEVFEPPHYELCTLRGTGATADFADVADDFE
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470
pF1KE0 NYQKMRRSSTASRCIHDHHCGSQASSVKQSRTNLSS------MELPFRNDFAQPQPMKTF
::.:.:::: :.:::::::::: ::.: ::.:::. :.: . ::.
CCDS12 NYHKLRRSS--SKCIHDHHCGSQLSSTKGSRSNLSTRDASILTEMPTQPGKPLIPPMNRR
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KE0 NSTFKKSSYTFKQGHECPEQALEDRVMEEIPCEIYVRGREDSAQASISIDF
: : ::. . : :.. ::.: . .:.:.:
CCDS12 NILVMKHSYSQDAADACDI----DEI-EEVPTTSHRLSRHDKAVQRFCLIGSLSKHESEY
480 490 500 510 520
CCDS12 NTTRV
530
>>CCDS42444.1 NETO1 gene_id:81832|Hs108|chr18 (156 aa)
initn: 622 init1: 622 opt: 627 Z-score: 704.6 bits: 138.3 E(32554): 6.3e-33
Smith-Waterman score: 627; 54.7% identity (81.8% similar) in 148 aa overlap (14-161:9-156)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MALERLCSVLKVLLITVLVVEGIAVAQKTQDGQNIGIKHIPATQCGIWVRTSNGGHFASP
... :.. .. : : .. . ..::: :.. ..:: :.::
CCDS42 MLAEPFPKVVASLIILHLSGATKKGTEKQTTSETQKSVQCGTWTKHAEGGIFTSP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 NYPDSYPPNKECIYILEAAPRQRIELTFDEHYYIEPSFECRFDHLEVRDGPFGFSPLIDR
:::..:::..:::::.:::::: ::: :::.: ::::.::.:::.:::::::::::.: :
CCDS42 NYPSKYPPDRECIYIIEAAPRQCIELYFDEKYSIEPSWECKFDHIEVRDGPFGFSPIIGR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YCGVKSPPLIRSTGRFMWIKFSSDEELEGLGFRAKYSFIPDPDFTYLGGILNPIPDCQFE
.:: ..::.:.:.:::.:::: .: :::..:: :.:.: :.
CCDS42 FCGQQNPPVIKSSGRFLWIKFFADGELESMGFSARYNFTPE
120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LSGADGIVRSSQVEQEEKTKPGQAVDCIWTIKATPKAKIYLRFLDYQMEHSNECKRNFVA
>>CCDS7113.1 CUBN gene_id:8029|Hs108|chr10 (3623 aa)
initn: 530 init1: 312 opt: 338 Z-score: 364.3 bits: 79.9 E(32554): 5.7e-14
Smith-Waterman score: 457; 28.3% identity (64.1% similar) in 276 aa overlap (25-294:2196-2450)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MALERLCSVLKVLLITVLVVEGIAVAQKTQDGQNIGIKH-IPATQCG--IWVRT
.......::.. ::. . :: ....
CCDS71 LGPPGGNGHFCGSHASSTLFTSDNQMFVQFISDHSNEGQGFKIKYEAKSLACGGNVYIHD
2170 2180 2190 2200 2210 2220
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 SNG-GHFASPNYPDSYPPNKECIYILEAAPRQRIELTFDEHYYIEPSFECRFDHLEVRDG
... :. .:::.: .:::. .::.:: : :. ::.: :.... :: . .: ..::.:::
CCDS71 ADSAGYVTSPNHPHNYPPHADCIWILAAPPETRIQLQFEDRFDIEVTPNCTSNYLELRDG
2230 2240 2250 2260 2270 2280
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 PFGFSPLIDRYCGVKSPPLIRSTGRFMWIKFSSDEELEGLGFRAKYSFIPDPDFTYLGGI
. .:.....::.. : :.:. :...: ::. .::.::::
CCDS71 VDSDAPILSKFCGTSLPSSQWSSGEVMYLRFRSDNSPTHVGFKAKYS-------------
2290 2300 2310 2320 2330
180 190 200 210 220
pF1KE0 LNPIPDCQFELSGADGIVRSSQVEQEEKTKPGQ-AVDCIWTIKATPKAKIYLRFLDYQME
: .: .. : .:.:.: . : : . . : : ... . . : :....
CCDS71 ---IAQCGGRVPGQSGVVESIG----HPTLPYRDNLFCEWHLQGLSGHYLTISFEDFNLQ
2340 2350 2360 2370 2380
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 HSNECKRNFVAVYDGSSSIENLKAKFC-STVANDVMLKTGIGVIRMWADEGSRLSRFRML
.:. :...:: ..:. .: :. ...: .:. ... ... .:.:. .: . : ::.
CCDS71 NSSGCEKDFVEIWDNHTS-GNILGRYCGNTIPDSIDTSSNTAVVRFVTDGSVTASGFRLR
2390 2400 2410 2420 2430 2440
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 FTSFVEPPCTSSTFFCHSNMCINNSLVCNGVQNCAYPWDENHCKEKKKAGVFEQITKTHG
: : .:
CCDS71 FESSMEECGGDLQGSIGTFTSPNYPNPNPHGRICEWRITAPEGRRITLMFNNLRLATHPS
2450 2460 2470 2480 2490 2500
>>CCDS46499.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 (555 aa)
initn: 362 init1: 255 opt: 321 Z-score: 357.8 bits: 75.9 E(32554): 1.3e-13
Smith-Waterman score: 445; 27.7% identity (59.5% similar) in 289 aa overlap (37-317:20-290)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 CSVLKVLLITVLVVEGIAVAQKTQDGQNIGIKHIPATQCGIWVRTSNGGHFASPNYPDSY
.. : :: . ....:...::.::..:
CCDS46 MDMFPLTWVFLALYFSRHQVRGQPDPPCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDY
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 PPNKECIYILEAA-PRQRIELTFDEHYYIEPSFECRFDHLEVRDGPFGFSPLIDRYCGVK
: ...: .:. : : :.: :.:. :. :: . .:..: .:.::: . :. ..::
CCDS46 PSHQNCEWIVYAPEPNQKIVLNFNPHFEIE-KHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 SPPLIRSTGRFMWIKFSSDEELEGLGFRAKYSFIPDPDFTYLGGILNPIPDCQFELSGAD
.:: : :.: ...:::.:: .: :: .: .. :. ::. .... .
CCDS46 APPTIISSGSMLYIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKT------GS-----EDCSKNFTSPN
110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KE0 GIVRSSQVEQEEKTKPGQAVDCIWTIKATPKAKIYLRFLDYQMEHS------NECKRNFV
: ..: . : . .:: .:: : :: .: :.:: ...::. ..:: ...
CCDS46 GTIESPGFPE----KYPHNLDCTFTILAKPKMEIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 AVYDGSSSIENLKAKFCST-VANDVMLKTGIGVIRMWADEGSRLSRFRMLFTSFVEPPCT
..:: . : .:.:.: . ... .::: . . .: . . : . . :
CCDS46 DIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELRSSTGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLE
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 SSTFFCHSNMCINNSLVCNGVQNCAYPWDENHCKEKKKAGVFEQITKTHGTIIGITSGIV
. : :. . .... . :
CCDS46 N--FQCNVPLGMESGRIANEQISASSTYSDGRWTPQQSRLHGDDNGWTPNLDSNKEYLQV
280 290 300 310 320 330
>>CCDS46498.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 (901 aa)
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