Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0084
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0084, 872 aa
1>>>pF1KE0084 872 - 872 aa - 872 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5705+/-0.000971; mu= 11.7394+/- 0.058
mean_var=170.5335+/-34.448, 0's: 0 Z-trim(110.7): 61 B-trim: 60 in 1/53
Lambda= 0.098213
statistics sampled from 11751 (11807) to 11751 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.363), width: 16
Scan time: 3.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34943.1 KCNQ3 gene_id:3786|Hs108|chr8 ( 872) 5842 840.7 0
CCDS56554.1 KCNQ3 gene_id:3786|Hs108|chr8 ( 752) 4998 721.0 1.9e-207
CCDS7736.1 KCNQ1 gene_id:3784|Hs108|chr11 ( 676) 1254 190.5 8.7e-48
CCDS4976.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 932) 1057 162.7 2.8e-39
CCDS55035.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 822) 976 151.2 7.2e-36
CCDS55037.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 923) 976 151.2 7.9e-36
CCDS55034.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 951) 976 151.2 8.1e-36
CCDS46629.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 841) 704 112.6 2.9e-24
CCDS13520.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 872) 654 105.6 4.1e-22
CCDS13521.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 393) 645 104.0 5.5e-22
CCDS13519.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 854) 641 103.7 1.4e-21
CCDS13518.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 844) 635 102.9 2.6e-21
CCDS456.1 KCNQ4 gene_id:9132|Hs108|chr1 ( 695) 618 100.4 1.2e-20
>>CCDS34943.1 KCNQ3 gene_id:3786|Hs108|chr8 (872 aa)
initn: 5842 init1: 5842 opt: 5842 Z-score: 4483.3 bits: 840.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5842; 100.0% identity (100.0% similar) in 872 aa overlap (1-872:1-872)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGLKARRAAGAAGGGGDGGGGGGGAANPAGGDAAAAGDEERKVGLAPGDVEQVTLALGAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MGLKARRAAGAAGGGGDGGGGGGGAANPAGGDAAAAGDEERKVGLAPGDVEQVTLALGAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ADKDGTLLLEGGGRDEGQRRTPQGIGLLAKTPLSRPVKRNNAKYRRIQTLIYDALERPRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ADKDGTLLLEGGGRDEGQRRTPQGIGLLAKTPLSRPVKRNNAKYRRIQTLIYDALERPRG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WALLYHALVFLIVLGCLILAVLTTFKEYETVSGDWLLLLETFAIFIFGAEFALRIWAAGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 WALLYHALVFLIVLGCLILAVLTTFKEYETVSGDWLLLLETFAIFIFGAEFALRIWAAGC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 CCRYKGWRGRLKFARKPLCMLDIFVLIASVPVVAVGNQGNVLATSLRSLRFLQILRMLRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CCRYKGWRGRLKFARKPLCMLDIFVLIASVPVVAVGNQGNVLATSLRSLRFLQILRMLRM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 DRRGGTWKLLGSAICAHSKELITAWYIGFLTLILSSFLVYLVEKDVPEVDAQGEEMKEEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DRRGGTWKLLGSAICAHSKELITAWYIGFLTLILSSFLVYLVEKDVPEVDAQGEEMKEEF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ETYADALWWGLITLATIGYGDKTPKTWEGRLIAATFSLIGVSFFALPAGILGSGLALKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ETYADALWWGLITLATIGYGDKTPKTWEGRLIAATFSLIGVSFFALPAGILGSGLALKVQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 EQHRQKHFEKRRKPAAELIQAAWRYYATNPNRIDLVATWRFYESVVSFPFFRKEQLEAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EQHRQKHFEKRRKPAAELIQAAWRYYATNPNRIDLVATWRFYESVVSFPFFRKEQLEAAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 SQKLGLLDRVRLSNPRGSNTKGKLFTPLNVDAIEESPSKEPKPVGLNNKERFRTAFRMKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SQKLGLLDRVRLSNPRGSNTKGKLFTPLNVDAIEESPSKEPKPVGLNNKERFRTAFRMKA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 YAFWQSSEDAGTGDPMAEDRGYGNDFPIEDMIPTLKAAIRAVRILQFRLYKKKFKETLRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YAFWQSSEDAGTGDPMAEDRGYGNDFPIEDMIPTLKAAIRAVRILQFRLYKKKFKETLRP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 YDVKDVIEQYSAGHLDMLSRIKYLQTRIDMIFTPGPPSTPKHKKSQKGSAFTFPSQQSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YDVKDVIEQYSAGHLDMLSRIKYLQTRIDMIFTPGPPSTPKHKKSQKGSAFTFPSQQSPR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 NEPYVARPSTSEIEDQSMMGKFVKVERQVQDMGKKLDFLVDMHMQHMERLQVQVTEYYPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NEPYVARPSTSEIEDQSMMGKFVKVERQVQDMGKKLDFLVDMHMQHMERLQVQVTEYYPT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 KGTSSPAEAEKKEDNRYSDLKTIICNYSETGPPEPPYSFHQVTIDKVSPYGFFAHDPVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KGTSSPAEAEKKEDNRYSDLKTIICNYSETGPPEPPYSFHQVTIDKVSPYGFFAHDPVNL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 PRGGPSSGKVQATPPSSATTYVERPTVLPILTLLDSRVSCHSQADLQGPYSDRISPRQRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PRGGPSSGKVQATPPSSATTYVERPTVLPILTLLDSRVSCHSQADLQGPYSDRISPRQRR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 SITRDSDTPLSLMSVNHEELERSPSGFSISQDRDDYVFGPNGGSSWMREKRYLAEGETDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SITRDSDTPLSLMSVNHEELERSPSGFSISQDRDDYVFGPNGGSSWMREKRYLAEGETDT
790 800 810 820 830 840
850 860 870
pF1KE0 DTDPFTPSGSMPLSSTGDGISDSVWTPSNKPI
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DTDPFTPSGSMPLSSTGDGISDSVWTPSNKPI
850 860 870
>>CCDS56554.1 KCNQ3 gene_id:3786|Hs108|chr8 (752 aa)
initn: 4998 init1: 4998 opt: 4998 Z-score: 3837.8 bits: 721.0 E(32554): 1.9e-207
Smith-Waterman score: 4998; 99.7% identity (99.9% similar) in 747 aa overlap (126-872:6-752)
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 PVKRNNAKYRRIQTLIYDALERPRGWALLYHALVFLIVLGCLILAVLTTFKEYETVSGDW
:: .::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MKPAEHATMFLIVLGCLILAVLTTFKEYETVSGDW
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 LLLLETFAIFIFGAEFALRIWAAGCCCRYKGWRGRLKFARKPLCMLDIFVLIASVPVVAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LLLLETFAIFIFGAEFALRIWAAGCCCRYKGWRGRLKFARKPLCMLDIFVLIASVPVVAV
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 GNQGNVLATSLRSLRFLQILRMLRMDRRGGTWKLLGSAICAHSKELITAWYIGFLTLILS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GNQGNVLATSLRSLRFLQILRMLRMDRRGGTWKLLGSAICAHSKELITAWYIGFLTLILS
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 SFLVYLVEKDVPEVDAQGEEMKEEFETYADALWWGLITLATIGYGDKTPKTWEGRLIAAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SFLVYLVEKDVPEVDAQGEEMKEEFETYADALWWGLITLATIGYGDKTPKTWEGRLIAAT
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 FSLIGVSFFALPAGILGSGLALKVQEQHRQKHFEKRRKPAAELIQAAWRYYATNPNRIDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FSLIGVSFFALPAGILGSGLALKVQEQHRQKHFEKRRKPAAELIQAAWRYYATNPNRIDL
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 VATWRFYESVVSFPFFRKEQLEAASSQKLGLLDRVRLSNPRGSNTKGKLFTPLNVDAIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VATWRFYESVVSFPFFRKEQLEAASSQKLGLLDRVRLSNPRGSNTKGKLFTPLNVDAIEE
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 SPSKEPKPVGLNNKERFRTAFRMKAYAFWQSSEDAGTGDPMAEDRGYGNDFPIEDMIPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SPSKEPKPVGLNNKERFRTAFRMKAYAFWQSSEDAGTGDPMAEDRGYGNDFPIEDMIPTL
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 KAAIRAVRILQFRLYKKKFKETLRPYDVKDVIEQYSAGHLDMLSRIKYLQTRIDMIFTPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KAAIRAVRILQFRLYKKKFKETLRPYDVKDVIEQYSAGHLDMLSRIKYLQTRIDMIFTPG
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KE0 PPSTPKHKKSQKGSAFTFPSQQSPRNEPYVARPSTSEIEDQSMMGKFVKVERQVQDMGKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PPSTPKHKKSQKGSAFTFPSQQSPRNEPYVARPSTSEIEDQSMMGKFVKVERQVQDMGKK
460 470 480 490 500 510
640 650 660 670 680 690
pF1KE0 LDFLVDMHMQHMERLQVQVTEYYPTKGTSSPAEAEKKEDNRYSDLKTIICNYSETGPPEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LDFLVDMHMQHMERLQVQVTEYYPTKGTSSPAEAEKKEDNRYSDLKTIICNYSETGPPEP
520 530 540 550 560 570
700 710 720 730 740 750
pF1KE0 PYSFHQVTIDKVSPYGFFAHDPVNLPRGGPSSGKVQATPPSSATTYVERPTVLPILTLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PYSFHQVTIDKVSPYGFFAHDPVNLPRGGPSSGKVQATPPSSATTYVERPTVLPILTLLD
580 590 600 610 620 630
760 770 780 790 800 810
pF1KE0 SRVSCHSQADLQGPYSDRISPRQRRSITRDSDTPLSLMSVNHEELERSPSGFSISQDRDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SRVSCHSQADLQGPYSDRISPRQRRSITRDSDTPLSLMSVNHEELERSPSGFSISQDRDD
640 650 660 670 680 690
820 830 840 850 860 870
pF1KE0 YVFGPNGGSSWMREKRYLAEGETDTDTDPFTPSGSMPLSSTGDGISDSVWTPSNKPI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 YVFGPNGGSSWMREKRYLAEGETDTDTDPFTPSGSMPLSSTGDGISDSVWTPSNKPI
700 710 720 730 740 750
>>CCDS7736.1 KCNQ1 gene_id:3784|Hs108|chr11 (676 aa)
initn: 985 init1: 441 opt: 1254 Z-score: 971.4 bits: 190.5 E(32554): 8.7e-48
Smith-Waterman score: 1254; 43.8% identity (71.8% similar) in 500 aa overlap (107-589:106-585)
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 GQRRTPQGIGLLAKTPLSRPVKRNNAKYRRIQTLIYDALERPRGWA-LLYHALVFLIVLG
.: .:. :::: :: ..:: ::::::
CCDS77 ASDLGPRPPVSLDPRVSIYSTRRPVLARTHVQGRVYNFLERPTGWKCFVYHFAVFLIVLV
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 CLILAVLTTFKEYETVSGDWLLLLETFAIFIFGAEFALRIWAAGCCCRYKGWRGRLKFAR
:::..::.:...: ... :. .: . .::.:...:.:.::: .: : :::.:::
CCDS77 CLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGCRSKYVGLWGRLRFAR
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 KPLCMLDIFVLIASVPVVAVGNQGNVLATS-LRSLRFLQILRMLRMDRRGGTWKLLGSAI
::. ..:..:..::. :. ::..:.:.::: .:..:::::::::..::.::::.::::..
CCDS77 KPISIIDLIVVVASMVVLCVGSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLHVDRQGGTWRLLGSVV
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 CAHSKELITAWYIGFLTLILSSFLVYLVEKDVPEVDAQGEEMKEEFETYADALWWGLITL
: .::::. ::::: ::.::..:::.:::. :. .: . :: .::::::::..:.
CCDS77 FIHRQELITTLYIGFLGLIFSSYFVYLAEKDA--VNESG---RVEFGSYADALWWGVVTV
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 ATIGYGDKTPKTWEGRLIAATFSLIGVSFFALPAGILGSGLALKVQEQHRQKHFEKRRKP
.:::::::.:.:: :. ::. ::....:::::::::::::.:::::...:::::...
CCDS77 TTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQRQKHFNRQIPA
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420
pF1KE0 AAELIQAAWRYYAT-NPNRIDLVATWRFYESVVSFPFFRKEQLEAASSQ-KLGLL---DR
:: :::.::: ::. ::. .::..: . . : :.. : . : . : ... .
CCDS77 AASLIQTAWRCYAAENPDS----STWKIY--IRKAP--RSHTLLSPSPKPKKSVVVKKKK
380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 VRLSNPRGSNTKGKLFTPLNVDAIEESPSKEPKPVGLNNKERFRTAFRMKAYAFWQSSED
.:.. : . :..: : : .: .: . . . . . .. : . . :
CCDS77 FKLDKDNGVTPGEKMLT---VPHITCDPPEERR-LDHFSVDGYDSSVRKSPTLLEVSMPH
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 AGTGDPMAED---RGYGNDFPIEDMIPTLK----AAIRAVRILQFRLYKKKFKETLRPYD
. .::: .: :: : :. :.:...: .:. . ::::... .:::
CCDS77 FMRTNSFAEDLDLEGETLLTPITH-ISQLREHHRATIKVIRRMQYFVAKKKFQQARKPYD
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KE0 VKDVIEQYSAGHLDMLSRIKYLQTRIDMIFTPGPPS---TPKHKKSQKGSAFTFPSQQSP
:.::::::: :::... ::: :: :.:. . : :: . ..:....::
CCDS77 VRDVIEQYSQGHLNLMVRIKELQRRLDQ--SIGKPSLFISVSEKSKDRGSNTIGARLNRV
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 RNEPYVARPSTSEIEDQSMMGKFVKVERQVQDMGKKLDFLVDMHMQHMERLQVQVTEYYP
CCDS77 EDKVTQLDQRLALITDMLHQLLSLHGGSTPGSGGPPREGGAHITQPCGSGGSVDPELFLP
600 610 620 630 640 650
>>CCDS4976.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 (932 aa)
initn: 1637 init1: 614 opt: 1057 Z-score: 818.7 bits: 162.7 E(32554): 2.8e-39
Smith-Waterman score: 2060; 43.5% identity (66.6% similar) in 921 aa overlap (15-845:7-886)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MGLKARRAAGAAGGGGDGGGGGGGAANPAGGDAAAAGDEERKVGLAPGDVEQ---VTLAL
::. ::..: .. .:. ::::: ..: . :::. .:
CCDS49 MPRHHAGGEEGGAAGLWVK-SGAAAAAAGGG--RLGSGMKDVESGRGRVLLN
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KE0 GAGADKDGTLLLE--------GGGRDEGQRRTPQG--IGLLAKTPLSRPVK---RNNAKY
.:.: :: ::: ::: . .:: :: ..::.: ::: . : :.::
CCDS49 SAAARGDGLLLLGTRAATLGGGGGGLRESRRGKQGARMSLLGK-PLSYTSSQSCRRNVKY
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 RRIQTLIYDALERPRGWALLYHALVFLIVLGCLILAVLTTFKEYETVSGDWLLLLETFAI
::.:. .:..::::::::..:::.:::.:.:::::.:..:. :. .... ::.:: :
CCDS49 RRVQNYLYNVLERPRGWAFIYHAFVFLLVFGCLILSVFSTIPEHTKLASSCLLILEFVMI
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 FIFGAEFALRIWAAGCCCRYKGWRGRLKFARKPLCMLDIFVLIASVPVVAVGNQGNVLAT
.:: :: .:::.:::::::.::.:::.:::::.:..: .:::::. ::.. .:::..::
CCDS49 VVFGLEFIIRIWSAGCCCRYRGWQGRLRFARKPFCVIDTIVLIASIAVVSAKTQGNIFAT
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 S-LRSLRFLQILRMLRMDRRGGTWKLLGSAICAHSKELITAWYIGFLTLILSSFLVYLVE
: ::::::::::::.::::::::::::::.. :::::::::::::::.::.:::::::::
CCDS49 SALRSLRFLQILRMVRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELITAWYIGFLVLIFSSFLVYLVE
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 KDVPEVDAQGEEMKEEFETYADALWWGLITLATIGYGDKTPKTWEGRLIAATFSLIGVSF
::. ..:: ::::::::: :::.::::::::: :: :::..: :.:.:.::
CCDS49 KDA----------NKEFSTYADALWWGTITLTTIGYGDKTPLTWLGRLLSAGFALLGISF
290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 FALPAGILGSGLALKVQEQHRQKHFEKRRKPAAELIQAAWRYYATNPNRIDLVATWRFY-
:::::::::::.:::::::::::::::::.:::.::: .:: ::.. . .. .:::. .
CCDS49 FALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAANLIQCVWRSYAADEKSVS-IATWKPHL
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450
pF1KE0 ESVVSFPFFRKEQLEAASSQKLGLLDRVRLSNPRGSNTK------GKLFTPLNVDAIEES
... . .::: ::.:::::.. .:::...:::.. : : .: . . : :
CCDS49 KALHTCSPTKKEQGEASSSQKLSFKERVRMASPRGQSIKSRQASVGDRRSPSTDITAEGS
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 PSKEPKPVGLNNKERFRTAFRMKAYAFWQSSEDAGTG---DPMAEDRGYGNDFPIEDMIP
:.: : ..:.. ::: ..:.:. . . :: :. : . ...: : .::. :
CCDS49 PTKVQKSWSFNDRTRFRPSLRLKS-SQPKPVIDADTALGTDDVYDEKGCQCDVSVEDLTP
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 TLKAAIRAVRILQFRLYKKKFKETLRPYDVKDVIEQYSAGHLDMLSRIKYLQTRIDMIFT
::..:::.::..:.. :.:::::::::::::::::::::::::: ::: ::::.:.:.
CCDS49 PLKTVIRAIRIMKFHVAKRKFKETLRPYDVKDVIEQYSAGHLDMLCRIKSLQTRVDQILG
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580 590 600 610 620 630
pF1KE0 PGPPSTPKHKKSQKGSAFTFPSQQSPRNEPYVARPSTSEIEDQSMMGKFVKVERQVQDMG
: .. :... : .:. :.. : ::.:. ::::.:::..
CCDS49 KGQITSDKKSR-----------------EKITAEHETTD--DLSMLGRVVKVEKQVQSIE
580 590 600 610
640 650 660 670 680
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.::: :.:...: ... .:. : :. .::.... . .:
CCDS49 SKLDCLLDIYQQVLRKGSASALALASFQIPPFECEQTSDYQSPVDSKDLSGSAQNSGCLS
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690 700 710
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.. : :. : : .:. :: :.. :. . .:..
CCDS49 RSTSANISRGLQFILTPNEFSAQTFYALSPTMHSQATQVPISQSDGSAVAATNTIANQIN
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720 730 740 750 760 770
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. :. ..:.. .: :: : .. :: .: : . :. .: : :. ..:
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780 790 800 810
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:. . :. :.:. ..: ::. .::.. :::. . :: : .:
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820 830 840 850 860 870
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. : :. : . : .... : .:.:: :
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::. ::..: .. .:. ::::: ..: . :::. .:
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.:.: :: ::: ::: . .:: :: ..::.: ::: . : :.::
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::.:. .:..::::::::..:::.:::.:.:::::.:..:. :. .... ::.:: :
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.:: :: .:::.:::::::.::.:::.:::::.:..: .:::::. ::.. .:::..::
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::. ..:: ::::::::: :::.::::::::: :: :::..: :.:.:.::
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:::::::::::.:::::::::::::::::.:::.::: .:: ::.. . .. .:::
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::
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..:: : .: ...: ... :
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:..:.. :.:::::::::::::::::::::::::: ::: ::::.:.:. : .. :..
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. : .:. :.. : ::.:. ::::.:::.. .::: :.:..
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.: ... .:. : :. .::.... . .: .. : :.
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: : .:. :: :.. :. . .:.. . :. ..:..
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.: :: : .. :: .: : . :. .: : :. ..: :. . :. :
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.:. ..: ::. .::.. :::. . :: : .: . : :.
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::. ..:: ::::::::: :::.::::::::: :: :::..: :.:.:.::
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:::::::::::.:::::::::::::::::.:::.::: .:: ::.. . .. .:::.
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CCDS55 LKTVIRAIRIMKFHVAKRKFKETLRPYDVKDVIEQYSAGHLDMLCRIKSLQTRVDQILGK
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: .. :... : .:. :.. : ::.:. ::::.:::.. .
CCDS55 GQITSDKKSR-----------------EKITAEHETTD--DLSMLGRVVKVEKQVQSIES
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::: :.:...: ... .:. : :. .::.... . .: .
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. : :. : : .:. :: :.. :. . .:.. .
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. . :. :.:. ..: ::. .::.. :::. . :: : .:
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. : :. : . : .... : .:.:: :
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pF1KE0 I
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CCDS55 VVFGLEFIIRIWSAGCCCRYRGWQGRLRFARKPFCVIDTIVLIASIAVVSAKTQGNIFAT
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CCDS55 SALRSLRFLQILRMVRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELITAWYIGFLVLIFSSFLVYLVE
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CCDS55 FALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAANLIQCVWRSYAADEKSVS-IATWKPHL
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... . .::: ::.:: :::.. .:::...:::.. :
CCDS55 KALHTCSPTKKEQGEASSSKFCSNKQKLFRMYTSRKQSQKLSFKERVRMASPRGQSIKSR
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: .: . . : ::.: : ..:.. ::: ..:.:. . . :: :. :
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. ...: : .::. : ::..:::.::..:.. :.::::::::::::::::::::::
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:::: ::: ::::.:.:. : .. :... : .:. :..
CCDS55 LDMLCRIKSLQTRVDQILGKGQITSDKKSR-----------------EKITAEHETTD--
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: ::.:. ::::.:::.. .::: :.:...: ... .:. : :. .
CCDS55 DLSMLGRVVKVEKQVQSIESKLDCLLDIYQQVLRKGSASALALASFQIPPFECEQTSDYQ
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pF1KE0 SPAEAEK---KEDNRYSDLKTIICNYSE-----TGPPE-PPYSFH-----------QVTI
::.... . .: .. : :. : : .:. :: :
CCDS55 SPVDSKDLSGSAQNSGCLSRSTSANISRGLQFILTPNEFSAQTFYALSPTMHSQATQVPI
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pF1KE0 DK-----VSPYGFFAHDPVNLPR-GGPSSGKVQATPPSSATTYVERPTVL-PILTLLDSR
.. :. . .:.. . :. ..:.. .: :: : .. :: .: : . :.
CCDS55 SQSDGSAVAATNTIANQINTAPKPAAPTT--LQIPPPLPAIKHLPRPETLHPNPAGLQES
740 750 760 770 780 790
760 770 780 790
pF1KE0 VS----C--HSQADLQGPYSDRISPRQ-RRSITRDSDTPLSL-----------MSVNH--
.: : :. ..: :. . :. :.:. ..: ::. .::..
CCDS55 ISDVTTCLVASKENVQVAQSNLTKDRSMRKSFDMGGETLLSVCPMVPKDLGKSLSVQNLI
800 810 820 830 840 850
800 810 820 830 840 850
pF1KE0 ---EELERSPSGFSISQDRDDYVFGPNGGSSWMREKRYLAE---GETDTDTDPFTPSGSM
:::. . :: : .: . : :. : . : .... : .:.:: :
CCDS55 RSTEELNIQLSGSESSGSRGSQDFYPK----WRESKLFITDEEVGPEETETDTFDAAPQP
860 870 880 890 900 910
860 870
pF1KE0 PLSSTGDGISDSVWTPSNKPI
CCDS55 AREAAFASDSLRTGRSRSSQSICKAGESTDALSLPHVKLK
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20 30 40 50 60
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:. :. :: . : .: .: :
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70 80 90 100 110
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.::.::. : .:. .: :.. : : ..: ::: : ::..:...:..:::
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pF1KE0 PRGWALLYHALVFLIVLGCLILAVLTTFKEYETVSGDWLLLLETFAIFIFGAEFALRIWA
:::::..::: :::.:..::.:.:..:.:::: : : .:: .: .::.:. .::::
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:::::::.::::::::::::.:..::.:::::. :.:.:.::::.::: :::::::::::
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:.::::::::::::::.. ::::::.:::::::: :::.::::::.:: ::
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...:.:::::::::::::.::::::: :.::.:::.::::.:::::::::::::::::.:
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::::::::::::::::.::: :::.:::.:::: .: :: .::..:: .:. :.. ..
CCDS46 LKVQEQHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTWQYYERTVTVPMYSSQTQ
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..:. . :....: .::: .::: .:
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...:.:::: :: ..... : : :::.:. : :.:: . :. ...:.. .:
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::. : ::..:::: ...: . :.::::.:::::: :::::::::::::::::: ::.:
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.:.: :: : : . :: :. .:. :: ::::.. :::
CCDS46 VDQIVGRGPAITDKDRT--KG-------------------PAEAELPEDPSMMGRLGKVE
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.:: .: :::::::...::.: ... :. :. :: ..... : :.. .
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:. . : :: :: :: . : . .: . :: : .. .
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: .. . :. : : : . ..:... . : . : .. ::::: .:.
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::.::::::: :::::::.... .. . . .: :.::::.:::.: ::
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: : :.::.: ..: :. :
CCDS46 CGPPPRSATGEGPFGDVGWAGPRK
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20 30 40 50 60
pF1KE0 AAGGGGDGGGGGGGAANPAGGDAAAAGDEERKVGLAPGDVEQVTLALG-AGAD-------
:. :. :: . : .: .: :
CCDS13 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGFVGLDPGAPDST
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KE0 KDGTLLLEGGGRDEGQRR-----TPQGIGLLAKTPLSRPVKRNNAKYRRIQTLIYDALER
.::.::. : .:. .: :.. : : ..: ::: : ::..:...:..:::
CCDS13 RDGALLIAG---SEAPKRGSILSKPRAGGAGA----GKPPKRN-AFYRKLQNFLYNVLER
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120 130 140 150 160 170
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:.::::::::::::::.. ::::::.:::::::: :::.::::::.:: ::.
CCDS13 MIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGFLCLILASFLVYLAEK--------GEN-
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..:.:::::::::::::.::::::: :.::.:::.::::.:::::::::::::::::.:
CCDS13 -DHFDTYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLIGVSFFALPAGILGSGFA
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::::::::::::::::.::: :::.:::.:::: .: :: .::..:: .:. :.. ..
CCDS13 LKVQEQHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTWQYYERTVTVPMYSSQTQ
320 330 340 350 360 370
420
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::: . ::::.
CCDS13 TYGASRLIPPLNQLELLRNLKSKSGLAFRKDPPPEPSPSKGSPCRGPLCGCCPGRSSQKV
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.: ::: .:.::: .::: .: ...:.:::: :: ..... : : ::
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:.:. : :.::.:. :. ...:.. .: ::. : ::..:::: ...: . :.:::
CCDS13 RIKGAASRQNSEEASLPGEDIVDDKSCPCEFVTEDLTPGLKVSIRAVCVMRFLVSKRKFK
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pF1KE0 ETLRPYDVKDVIEQYSAGHLDMLSRIKYLQTRIDMIFTPGPPSTPKHKKSQKGSAFTFPS
:.:::::: :::::::::::::::::: ::.:.:.: :: : : . ::
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:. .:. :: ::::.. :::.:: .: :::::::...::.: ...
CCDS13 ------------PAEAELPEDPSMMGRLGKVEKQVLSMEKKLDFLVNIYMQRMGIPPTET
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CCDS13 EAYFGAKEPEPAPPYHSPEDSREHVD-RHGCIVKIVRSSSSTGQKNFSAPPAAPPVQCPP
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CCDS13 ST----------SWQPQSHPRQGHGT-----SPVGDHGSLVRIPPP-PAHERSLSAYGGG
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CCDS13 NRASMEFLRQEDTPGCRPPEGNLRDSDTSISIPSVDHEELERSFSGFSISQSKENLDALN
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CCDS13 SCYAAVAPCAKVRP--YIAEGESDTDSDLCTPCGPPPRSATGEGPFGDVGWAGPRK
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CCDS13 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGFVGLDPGAPDST
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70 80 90 100 110
pF1KE0 KDGTLLLEGGGRDEGQRR-----TPQGIGLLAKTPLSRPVKRNNAKYRRIQTLIYDALER
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CCDS13 RDGALLIAGS---EAPKRGSILSKPRAGGAGA----GKPPKRN-AFYRKLQNFLYNVLER
40 50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 PRGWALLYHALVFLIVLGCLILAVLTTFKEYETVSGDWLLLLETFAIFIFGAEFALRIWA
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CCDS13 PRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEKSSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWA
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pF1KE0 AGCCCRYKGWRGRLKFARKPLCMLDIFVLIASVPVVAVGNQGNVLATS-LRSLRFLQILR
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CCDS13 AGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASIAVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILR
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pF1KE0 MLRMDRRGGTWKLLGSAICAHSKELITAWYIGFLTLILSSFLVYLVEKDVPEVDAQGEEM
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CCDS13 MIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGFLCLILASFLVYLAEK--------GE--
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pF1KE0 KEEFETYADALWWGLITLATIGYGDKTPKTWEGRLIAATFSLIGVSFFALPAGILGSGLA
...:.:::::::::::::.::::::: :.::.:::.::::.:::::::::::::::::.:
CCDS13 NDHFDTYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLIGVSFFALPAGILGSGFA
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CCDS13 LKVQEQHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTWQYYERTVTVPMYRYRRR
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CCDS13 APATKQLFHFLFSICS
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872 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 03:48:30 2016 done: Fri Nov 4 03:48:31 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]