Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0086
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0086, 525 aa
1>>>pF1KE0086 525 - 525 aa - 525 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4939+/- 0.001; mu= 3.6508+/- 0.061
mean_var=341.1246+/-69.586, 0's: 0 Z-trim(114.2): 73 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.069441
statistics sampled from 14756 (14825) to 14756 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.455), width: 16
Scan time: 3.630
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12078.1 BTBD2 gene_id:55643|Hs108|chr19 ( 525) 3492 363.6 3.3e-100
CCDS10322.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 ( 482) 2496 263.7 3.3e-70
CCDS32313.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 ( 385) 1801 194.0 2.6e-49
CCDS10002.2 BTBD6 gene_id:90135|Hs108|chr14 ( 485) 1357 149.6 7.5e-36
CCDS13114.1 BTBD3 gene_id:22903|Hs108|chr20 ( 461) 1303 144.2 3.1e-34
CCDS13113.1 BTBD3 gene_id:22903|Hs108|chr20 ( 522) 1303 144.3 3.4e-34
>>CCDS12078.1 BTBD2 gene_id:55643|Hs108|chr19 (525 aa)
initn: 3492 init1: 3492 opt: 3492 Z-score: 1912.6 bits: 363.6 E(32554): 3.3e-100
Smith-Waterman score: 3492; 100.0% identity (100.0% similar) in 525 aa overlap (1-525:1-525)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAAGGSGGRASCPPGVGVGPGTGGSPGPSANAAATPAPGNAAAAAAAAAAAAAAPGPTPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAAGGSGGRASCPPGVGVGPGTGGSPGPSANAAATPAPGNAAAAAAAAAAAAAAPGPTPP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 APPGPGTDAQAAGAERAEEAAGPGAAALQREAAYNWQASKPTVQERFAFLFNNEVLCDVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 APPGPGTDAQAAGAERAEEAAGPGAAALQREAAYNWQASKPTVQERFAFLFNNEVLCDVH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FLVGKGLSSQRIPAHRFVLAVGSAVFDAMFNGGMATTSTEIELPDVEPAAFLALLKFLYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FLVGKGLSSQRIPAHRFVLAVGSAVFDAMFNGGMATTSTEIELPDVEPAAFLALLKFLYS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLKKNLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLKKNLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CLENIDKNTADAITAEGFTDIDLDTLVAVLERDTLGIREVRLFNAVVRWSEAECQRQQLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CLENIDKNTADAITAEGFTDIDLDTLVAVLERDTLGIREVRLFNAVVRWSEAECQRQQLQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 VTPENRRKVLGKALGLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILVDREVVSLFLHFTVNPKPRVEFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VTPENRRKVLGKALGLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILVDREVVSLFLHFTVNPKPRVEFI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 DRPRCCLRGKECSINRFQQVESRWGYSGTSDRIRFSVNKRIFVVGFGLYGSIHGPTDYQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DRPRCCLRGKECSINRFQQVESRWGYSGTSDRIRFSVNKRIFVVGFGLYGSIHGPTDYQV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 NIQIIHTDSNTVLGQNDTGFSCDGSASTFRVMFKEPVEVLPNVNYTACATLKGPDSHYGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NIQIIHTDSNTVLGQNDTGFSCDGSASTFRVMFKEPVEVLPNVNYTACATLKGPDSHYGT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE0 KGLRKVTHESPTTGAKTCFTFCYAAGNNNGTSVEDGQIPEVIFYT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KGLRKVTHESPTTGAKTCFTFCYAAGNNNGTSVEDGQIPEVIFYT
490 500 510 520
>>CCDS10322.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 (482 aa)
initn: 2397 init1: 2156 opt: 2496 Z-score: 1373.8 bits: 263.7 E(32554): 3.3e-70
Smith-Waterman score: 2496; 77.6% identity (89.0% similar) in 491 aa overlap (42-525:7-482)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 CPPGVGVGPGTGGSPGPSANAAATPAPGNAAAAAAAAAAAAAAPGPT-PPAPPGPGTDAQ
:::. :..: : :::. :: ::.:..
CCDS10 MASLGPAAAGEQASGAEAEPGPAGPPPPPSPSS---
10 20 30
80 90 100 110 120
pF1KE0 AAGAERAEEAAGPGAAALQREAAYNWQASKPTVQERFAFLFNNEVLCDVHFLVGKGLSS-
:: :::: :::::.: ...::::::::.:.: ::.:..::: ..
CCDS10 ----------LGP-LLPLQREPLYNWQATKASLKERFAFLFNSELLSDVRFVLGKGRGAA
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 -----QRIPAHRFVLAVGSAVFDAMFNGGMATTSTEIELPDVEPAAFLALLKFLYSDEVQ
:::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::.::::::::
CCDS10 AAGGPQRIPAHRFVLAAGSAVFDAMFNGGMATTSAEIELPDVEPAAFLALLRFLYSDEVQ
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLKKNLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASLCLEN
::::::::::::::::::::::::::::: :.::::::::::::::::::::::::::..
CCDS10 IGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLTKHLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASLCLDT
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 IDKNTADAITAEGFTDIDLDTLVAVLERDTLGIREVRLFNAVVRWSEAECQRQQLQVTPE
:::.: :::.::::::::.::: ::::::::.::: :::.:::::.::::::::: ::
CCDS10 IDKSTMDAISAEGFTDIDIDTLCAVLERDTLSIRESRLFGAVVRWAEAECQRQQLPVTFG
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 NRRKVLGKALGLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILVDREVVSLFLHFTVNPKPRVEFIDRPR
:..:::::::.:::::::::::::::::::::: :::::.::::::::::::::.:::::
CCDS10 NKQKVLGKALSLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILSDREVVNLFLHFTVNPKPRVEYIDRPR
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 CCLRGKECSINRFQQVESRWGYSGTSDRIRFSVNKRIFVVGFGLYGSIHGPTDYQVNIQI
:::::::: ::::::::::::::::::::::.::.:: .:::::::::::::::::::::
CCDS10 CCLRGKECCINRFQQVESRWGYSGTSDRIRFTVNRRISIVGFGLYGSIHGPTDYQVNIQI
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 IHTDSNTVLGQNDTGFSCDGSASTFRVMFKEPVEVLPNVNYTACATLKGPDSHYGTKGLR
:. ... .::::::::::::.:.:::::::::.:.:::: :::::::::::::::::::.
CCDS10 IEYEKKQTLGQNDTGFSCDGTANTFRVMFKEPIEILPNVCYTACATLKGPDSHYGTKGLK
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520
pF1KE0 KVTHESPTTGAKTCFTFCYAAGNNNGTSVEDGQIPEVIFYT
::.::.:.. .:: : : . :::::::.:::::::.::::
CCDS10 KVVHETPAA-SKTVFFFFSSPGNNNGTSIEDGQIPEIIFYT
450 460 470 480
>>CCDS32313.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 (385 aa)
initn: 1816 init1: 1575 opt: 1801 Z-score: 998.7 bits: 194.0 E(32554): 2.6e-49
Smith-Waterman score: 1801; 77.6% identity (87.4% similar) in 366 aa overlap (42-400:7-357)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 CPPGVGVGPGTGGSPGPSANAAATPAPGNAAAAAAAAAAAAAAPGPT-PPAPPGPGTDAQ
:::. :..: : :::. :: ::.:..
CCDS32 MASLGPAAAGEQASGAEAEPGPAGPPPPPSPSS---
10 20 30
80 90 100 110 120
pF1KE0 AAGAERAEEAAGPGAAALQREAAYNWQASKPTVQERFAFLFNNEVLCDVHFLVGKGLSS-
:: :::: :::::.: ...::::::::.:.: ::.:..::: ..
CCDS32 ----------LGP-LLPLQREPLYNWQATKASLKERFAFLFNSELLSDVRFVLGKGRGAA
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 -----QRIPAHRFVLAVGSAVFDAMFNGGMATTSTEIELPDVEPAAFLALLKFLYSDEVQ
:::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::.::::::::
CCDS32 AAGGPQRIPAHRFVLAAGSAVFDAMFNGGMATTSAEIELPDVEPAAFLALLRFLYSDEVQ
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLKKNLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASLCLEN
::::::::::::::::::::::::::::: :.::::::::::::::::::::::::::..
CCDS32 IGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLTKHLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASLCLDT
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 IDKNTADAITAEGFTDIDLDTLVAVLERDTLGIREVRLFNAVVRWSEAECQRQQLQVTPE
:::.: :::.::::::::.::: ::::::::.::: :::.:::::.::::::::: ::
CCDS32 IDKSTMDAISAEGFTDIDIDTLCAVLERDTLSIRESRLFGAVVRWAEAECQRQQLPVTFG
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 NRRKVLGKALGLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILVDREVVSLFLHFTVNPKPRVEFIDRPR
:..:::::::.:::::::::::::::::::::: :::::.::::::::::::::.:::::
CCDS32 NKQKVLGKALSLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILSDREVVNLFLHFTVNPKPRVEYIDRPR
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 CCLRGKECSINRFQQVESRWGYSGTSDRIRFSVNKRIFVVGFGLYGSIHGPTDYQVNIQI
:::::::: ::::::::::::::::::::: :.: :
CCDS32 CCLRGKECCINRFQQVESRWGYSGTSDRIR-SLNMRKSKPWDRMIPALVVMGQLTHSGSC
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 IHTDSNTVLGQNDTGFSCDGSASTFRVMFKEPVEVLPNVNYTACATLKGPDSHYGTKGLR
CCDS32 SRNP
>>CCDS10002.2 BTBD6 gene_id:90135|Hs108|chr14 (485 aa)
initn: 1251 init1: 978 opt: 1357 Z-score: 757.1 bits: 149.6 E(32554): 7.5e-36
Smith-Waterman score: 1372; 45.1% identity (72.3% similar) in 501 aa overlap (28-524:8-484)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAAGGSGGRASCPPGVGVGPGTGGSPGPSANAAATPAPGNAAAAAAAAAAAAAAPGPTPP
:.. ::: : .::.::.. :. . :. :
CCDS10 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAP
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 APPGPGTDAQAAGAERAEEAAGPGAAALQREAAYNWQASKPTVQERFAFLFNNEVLCDVH
::: :. . : .. : .:: :. .::..:: :..::::.. :::
CCDS10 APPPPAPAPPTLGNNHQE---SPG-----------WRCCRPTLRERNALMFNNELMADVH
50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FLVGKGLSSQRIPAHRFVLAVGSAVFDAMFNGGMATTSTEIELPDVEPAAFLALLKFLYS
:.:: ... .:::..::::::.:: ::: : .: ...::..::::::::: :::..::
CCDS10 FVVGPPGATRTVPAHKYVLAVGSSVFYAMFYGDLAEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYS
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLKKNLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASL
::... .::..:::.:::: :::: ::.::. .:.: :: .::.:.:::.::.:..
CCDS10 DEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLETSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQR
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CLENIDKNTADAITAEGFTDIDLDTLVAVLERDTLGIREVRLFNAVVRWSEAECQRQQLQ
: : :: .. :. .::: .:: .:: .. :..:. .:. .:.::. :.::::.:: :
CCDS10 CWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQTLEIIVTREALNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLP
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 VTPENRRKVLGKALGLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILVDREVVSLFLHFTVNPKPRVEFI
.::.:.:.:::.:: :.:.: ::.:::: : ::: ::. .:. :.:: .:.. :::..:
CCDS10 ITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTLEEFANGAAQSDILTLEETHSIFLWYTATNKPRLDFP
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410
pF1KE0 DRPRCCLRGKECSINRFQQVESR---WGYSGTSDRIRFSVNKRIFVVGFGLYGSIHGPTD
: : ..: .:::. : : : : : :.:.:..:.:..:.::::: : ..
CCDS10 LTKRKGLAPQRC--HRFQSSAYRSNQWRYRGRCDSIQFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAE
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 YQVNIQIIHTDSNTVLGQNDTGFSCDGSASTFRVMFKEPVEVLPNVNYTACATLKGPD-S
:.:.:.. . ..::.:: : : :::..:: : :..::.: .. ::: :.: : . :
CCDS10 YSVKIELKRL--GVVLAQNLTKFMSDGSSNTFPVWFEHPVQVEQDTFYTASAVLDGSELS
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520
pF1KE0 HYGTKGLRKVTHESPTTGAKTCFTFCYAAGNNNGTSVEDGQIPEVIFYT
..: .:. .: .:. : : .. ..:::.:. :::::.:::
CCDS10 YFGQEGMTEV------QCGKVAFQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA
450 460 470 480
>>CCDS13114.1 BTBD3 gene_id:22903|Hs108|chr20 (461 aa)
initn: 1266 init1: 957 opt: 1303 Z-score: 728.1 bits: 144.2 E(32554): 3.1e-34
Smith-Waterman score: 1303; 46.6% identity (75.9% similar) in 436 aa overlap (93-524:35-460)
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 PGPGTDAQAAGAERAEEAAGPGAAALQREAAYNWQASKPTVQERFAFLFNNEVLCDVHFL
: :::. ::..:: :..:::... ::::.
CCDS13 IFPRKKPANSSSTSVQQYHQQNLSNNNLIPAPNWQGLYPTIRERNAMMFNNDLMADVHFV
10 20 30 40 50 60
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VGKGLSSQRIPAHRFVLAVGSAVFDAMFNGGMATTSTEIELPDVEPAAFLALLKFLYSDE
:: ..::.:.:..::::::.:: ::: : .: . ::..::::::::::.::..: ::
CCDS13 VGPPGGTQRLPGHKYVLAVGSSVFHAMFYGELAEDKDEIRIPDVEPAAFLAMLKYIYCDE
70 80 90 100 110 120
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLKKNLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASLCL
.... .::..:::.:::: :: : ::.::. .: : :: .::.:. ::.::.:.. :
CCDS13 IDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARACVNFLETSLSAKNACVLLSQSCLFEEPDLTQRCW
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ENIDKNTADAITAEGFTDIDLDTLVAVLERDTLGIREVRLFNAVVRWSEAECQRQQLQVT
: :: .. :. .::: :::..:: ..:.:.::. .:. .:.:.. :.:.:::::.: ..
CCDS13 EVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLESILRRETLNAKEIVVFEAALNWAEVECQRQDLALS
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 PENRRKVLGKALGLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILVDREVVSLFLHFTVNPKPRVEFIDR
::.:::::::: :::.: :....:: : ::::.:. :. ..:: .:. ::...:...
CCDS13 IENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFANGAAQSGVLTLNETNDIFLWYTAAKKPELQFVSK
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410
pF1KE0 PRCCLRGKECSINRFQQVESR---WGYSGTSDRIRFSVNKRIFVVGFGLYGSIHGPTDYQ
: : ..: .:::. : : : : : :.:.:.::.:..::::::: : ..:.
CCDS13 ARKGLVPQRC--HRFQSCAYRSNQWRYRGRCDSIQFAVDKRVFIAGFGLYGSSCGSAEYS
310 320 330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 VNIQIIHTDSNTVLGQNDTGFSCDGSASTFRVMFKEPVEVLPNVNYTACATLKGPD-SHY
..:.. . ...::::: . . :::..:: : :. ::.. :.. ::: . : : . :..
CCDS13 AKIELKR--QGVVLGQNLSKYFSDGSSNTFPVWFEYPVQIEPDTFYTASVILDGNELSYF
370 380 390 400 410 420
480 490 500 510 520
pF1KE0 GTKGLRKVTHESPTTGAKTCFTFCYAAGNNNGTSVEDGQIPEVIFYT
: .:. .: .:. : .. ..:::.:. :::::.:::
CCDS13 GQEGMTEVQC------GKVTVQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA
430 440 450 460
>>CCDS13113.1 BTBD3 gene_id:22903|Hs108|chr20 (522 aa)
initn: 1266 init1: 957 opt: 1303 Z-score: 727.5 bits: 144.3 E(32554): 3.4e-34
Smith-Waterman score: 1303; 46.6% identity (75.9% similar) in 436 aa overlap (93-524:96-521)
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 PGPGTDAQAAGAERAEEAAGPGAAALQREAAYNWQASKPTVQERFAFLFNNEVLCDVHFL
: :::. ::..:: :..:::... ::::.
CCDS13 IFPRKKPANSSSTSVQQYHQQNLSNNNLIPAPNWQGLYPTIRERNAMMFNNDLMADVHFV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VGKGLSSQRIPAHRFVLAVGSAVFDAMFNGGMATTSTEIELPDVEPAAFLALLKFLYSDE
:: ..::.:.:..::::::.:: ::: : .: . ::..::::::::::.::..: ::
CCDS13 VGPPGGTQRLPGHKYVLAVGSSVFHAMFYGELAEDKDEIRIPDVEPAAFLAMLKYIYCDE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLKKNLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASLCL
.... .::..:::.:::: :: : ::.::. .: : :: .::.:. ::.::.:.. :
CCDS13 IDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARACVNFLETSLSAKNACVLLSQSCLFEEPDLTQRCW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ENIDKNTADAITAEGFTDIDLDTLVAVLERDTLGIREVRLFNAVVRWSEAECQRQQLQVT
: :: .. :. .::: :::..:: ..:.:.::. .:. .:.:.. :.:.:::::.: ..
CCDS13 EVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLESILRRETLNAKEIVVFEAALNWAEVECQRQDLALS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 PENRRKVLGKALGLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILVDREVVSLFLHFTVNPKPRVEFIDR
::.:::::::: :::.: :....:: : ::::.:. :. ..:: .:. ::...:...
CCDS13 IENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFANGAAQSGVLTLNETNDIFLWYTAAKKPELQFVSK
310 320 330 340 350 360
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