FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0199, 1106 aa 1>>>pF1KE0199 1106 - 1106 aa - 1106 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.4204+/-0.00111; mu= -9.0356+/- 0.066 mean_var=542.6293+/-116.184, 0's: 0 Z-trim(115.9): 635 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.055058 statistics sampled from 15754 (16489) to 15754 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.79), E-opt: 0.2 (0.507), width: 16 Scan time: 4.770 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8940.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (1106) 7851 639.5 1.3e-182 CCDS53806.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (1065) 7320 597.3 6.1e-170 CCDS53807.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 ( 978) 6974 569.7 1.1e-161 CCDS5465.1 GLI3 gene_id:2737|Hs108|chr7 (1580) 1285 118.1 1.6e-25 CCDS33283.1 GLI2 gene_id:2736|Hs108|chr2 (1586) 1207 111.9 1.2e-23 CCDS6451.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9 ( 775) 783 77.9 1e-13 CCDS43784.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9 ( 930) 783 78.0 1.1e-13 CCDS582.1 GLIS1 gene_id:148979|Hs108|chr1 ( 620) 767 76.5 2.1e-13 CCDS10511.1 GLIS2 gene_id:84662|Hs108|chr16 ( 524) 696 70.8 9.3e-12 >>CCDS8940.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (1106 aa) initn: 7851 init1: 7851 opt: 7851 Z-score: 3392.2 bits: 639.5 E(32554): 1.3e-182 Smith-Waterman score: 7851; 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100.0% identity (100.0% similar) in 978 aa overlap (129-1106:1-978) 100 110 120 130 140 150 pF1KE0 IRTSPSSLVAFINSRCTSPGGSYGHLSIGTMSPSLGFPAQMNHQKGPSPSFGVQPCGPHD :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 MSPSLGFPAQMNHQKGPSPSFGVQPCGPHD 10 20 30 160 170 180 190 200 210 pF1KE0 SARGGMIPHPQSRGPFPTCQLKSELDMLVGKCREEPLEGDMSSPNSTGIQDPLLGMLDGR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 SARGGMIPHPQSRGPFPTCQLKSELDMLVGKCREEPLEGDMSSPNSTGIQDPLLGMLDGR 40 50 60 70 80 90 220 230 240 250 260 270 pF1KE0 EDLEREEKREPESVYETDCRWDGCSQEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKEFVCHWGGCSRE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 EDLEREEKREPESVYETDCRWDGCSQEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKEFVCHWGGCSRE 100 110 120 130 140 150 280 290 300 310 320 330 pF1KE0 LRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 LRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGC 160 170 180 190 200 210 340 350 360 370 380 390 pF1KE0 SKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVCKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 SKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVCKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHR 220 230 240 250 260 270 400 410 420 430 440 450 pF1KE0 GDGPLPRAPSISTVEPKREREGGPIREESRLTVPEGAMKPQPSPGAQSSCSSDHSPAGSA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 GDGPLPRAPSISTVEPKREREGGPIREESRLTVPEGAMKPQPSPGAQSSCSSDHSPAGSA 280 290 300 310 320 330 460 470 480 490 500 510 pF1KE0 ANTDSGVEMTGNAGGSTEDLSSLDEGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRPIGTRGLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 ANTDSGVEMTGNAGGSTEDLSSLDEGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRPIGTRGLK 340 350 360 370 380 390 520 530 540 550 560 570 pF1KE0 LPSLSHTGTTVSRRVGPPVSLERRSSSSSSISSAYTVSRRSSLASPFPPGSPPENGASSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 LPSLSHTGTTVSRRVGPPVSLERRSSSSSSISSAYTVSRRSSLASPFPPGSPPENGASSL 400 410 420 430 440 450 580 590 600 610 620 630 pF1KE0 PGLMPAQHYLLRARYASARGGGTSPTAASSLDRIGGLPMPPWRSRAEYPGYNPNAGVTRR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 PGLMPAQHYLLRARYASARGGGTSPTAASSLDRIGGLPMPPWRSRAEYPGYNPNAGVTRR 460 470 480 490 500 510 640 650 660 670 680 690 pF1KE0 ASDPAQAADRPAPARVQRFKSLGCVHTPPTVAGGGQNFDPYLPTSVYSPQPPSITENAAM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 ASDPAQAADRPAPARVQRFKSLGCVHTPPTVAGGGQNFDPYLPTSVYSPQPPSITENAAM 520 530 540 550 560 570 700 710 720 730 740 750 pF1KE0 DARGLQEEPEVGTSMVGSGLNPYMDFPPTDTLGYGGPEGAAAEPYGARGPGSLPLGPGPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 DARGLQEEPEVGTSMVGSGLNPYMDFPPTDTLGYGGPEGAAAEPYGARGPGSLPLGPGPP 580 590 600 610 620 630 760 770 780 790 800 810 pF1KE0 TNYGPNPCPQQASYPDPTQETWGEFPSHSGLYPGPKALGGTYSQCPRLEHYGQVQVKPEQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 TNYGPNPCPQQASYPDPTQETWGEFPSHSGLYPGPKALGGTYSQCPRLEHYGQVQVKPEQ 640 650 660 670 680 690 820 830 840 850 860 870 pF1KE0 GCPVGSDSTGLAPCLNAHPSEGPPHPQPLFSHYPQPSPPQYLQSGPYTQPPPDYLPSEPR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 GCPVGSDSTGLAPCLNAHPSEGPPHPQPLFSHYPQPSPPQYLQSGPYTQPPPDYLPSEPR 700 710 720 730 740 750 880 890 900 910 920 930 pF1KE0 PCLDFDSPTHSTGQLKAQLVCNYVQSQQELLWEGGGREDAPAQEPSYQSPKFLGGSQVSP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 PCLDFDSPTHSTGQLKAQLVCNYVQSQQELLWEGGGREDAPAQEPSYQSPKFLGGSQVSP 760 770 780 790 800 810 940 950 960 970 980 990 pF1KE0 SRAKAPVNTYGPGFGPNLPNHKSGSYPTPSPCHENFVVGANRASHRAAAPPRLLPPLPTC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 SRAKAPVNTYGPGFGPNLPNHKSGSYPTPSPCHENFVVGANRASHRAAAPPRLLPPLPTC 820 830 840 850 860 870 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE0 YGPLKVGGTNPSCGHPEVGRLGGGPALYPPPEGQVCNPLDSLDLDNTQLDFVAILDEPQG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 YGPLKVGGTNPSCGHPEVGRLGGGPALYPPPEGQVCNPLDSLDLDNTQLDFVAILDEPQG 880 890 900 910 920 930 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE0 LSPPPSHDQRGSSGHTPPPSGPPNMAVGNMSVLLRSLPGETEFLNSSA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 LSPPPSHDQRGSSGHTPPPSGPPNMAVGNMSVLLRSLPGETEFLNSSA 940 950 960 970 >>CCDS5465.1 GLI3 gene_id:2737|Hs108|chr7 (1580 aa) initn: 1493 init1: 1138 opt: 1285 Z-score: 571.5 bits: 118.1 E(32554): 1.6e-25 Smith-Waterman score: 1805; 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CCDS54 QTMIRTSPNSLVTILNNSRSSSSASGSYGHLSASAISPALSFTYSSAPVSLHMHQQILSR 310 320 330 340 350 360 150 160 170 180 pF1KE0 --------GPSPSFGVQPCGPHDSARG--G----MIPHPQSRGPFPTCQLKSELDMLVG- : :: . ..: . : : . : : :: . : : . :. CCDS54 QQSLGSAFGHSPPL-IHPAPTFPTQRPIPGIPTVLNPVQVSSGPSESSQNKPTSESAVSS 370 380 390 400 410 420 190 200 210 220 230 pF1KE0 --------KCREEPLEGDMSSPNSTGIQDPLLGMLDGREDLEREE-KREPESVYETDCRW . . .: : :. ::.. : :. : .:. ...: :.::: .:::.:.: CCDS54 TGDPMHNKRSKIKPDE-DLPSPGARGQQEQPEGTTLVKEEGDKDESKQEPEVIYETNCHW 430 440 450 460 470 480 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 DGCSQEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKEFVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEK .::..:::.:::::::::..:::::.:::::.: :::: .::::::::::::::::::: CCDS54 EGCAREFDTQEQLVHHINNDHIHGEKKEFVCRWLDCSREQKPFKAQYMLVVHMRRHTGEK 490 500 510 520 530 540 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 PHKCTFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNE ::::::::: :.::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::::: CCDS54 PHKCTFEGCTKAYSRLENLKTHLRSHTGEKPYVCEHEGCNKAFSNASDRAKHQNRTHSNE 550 560 570 580 590 600 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 KPYVCKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGD-GPLPRAPSISTVEPKRER ::::::.:::::::::::::::::::::::.:::::..::: : : : : . . . CCDS54 KPYVCKIPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPEAHVTKKQRGDIHPRPPPPRDSGSHSQSRS 610 620 630 640 650 660 420 430 440 450 pF1KE0 EGGPI----------------REES---RLTVPEGAMKPQPSPGAQSSCSSDHSPAGSAA : : ::: . . : : :::::.::::::..:: .. . CCDS54 PGRPTQGALGEQQDLSNTTSKREECLQVKTVKAEKPMTSQPSPGGQSSCSSQQSPISNYS 670 680 690 700 710 720 460 470 480 490 500 pF1KE0 NTDSGVEMTGNAGGSTEDLSSLDEGPCI------AGTGLSTLRR--------LENLRLDQ : ::.:. . ::: :::..:: : . : :.:. : .:...:.. CCDS54 N--SGLELPLTDGGSIGDLSAIDETPIMDSTISTATTALALQARRNPAGTKWMEHVKLER 730 740 750 760 770 780 510 520 530 pF1KE0 LHQ-------LRPI--------------GTRGLKLPSLSHTGTTVSRRV---GPPVS--- :.: : :: ::.. . ::. : . : : :. CCDS54 LKQVNGMFPRLNPILPPKAPAVSPLIGNGTQSNNTCSLGGPMTLLPGRSDLSGVDVTMLN 790 800 810 820 830 840 540 550 560 570 pF1KE0 -LERRSSSSSSISSAYTVSRRSSLASP-------------------------FPPGSPPE :.::.::.:.::::: ::::: :: . : : CCDS54 MLNRRDSSASTISSAYLSSRRSSGISPCFSSRRSSEASQAEGRPQNVSVADSYDPISTDA 850 860 870 880 890 900 580 590 600 610 pF1KE0 NGASS-------LPGLM---PAQHYLLRARYASARGGGTSPTAASSLDRIG--------- . :: ::.:. :::.: :.:.::.: :: :: ...:.. CCDS54 SRRSSEASQSDGLPSLLSLTPAQQYRLKAKYAAATGG-PPPTPLPNMERMSLKTRLALLG 910 920 930 940 950 960 620 630 640 650 pF1KE0 -----GLPMPPWRS--------------RAEYPGYNPNAGVTRRASDPAQAADRP-APAR :. .:: .. : : :. :: ::::::...... : : CCDS54 DALEPGVALPPVHAPRRCSDGGAHGYGRRHLQPHDAPGHGV-RRASDPVRTGSEGLALPR 970 980 990 1000 1010 1020 660 670 680 690 700 pF1KE0 VQRFKSLG-CVHTPPTVAGGG-------QNFD-PYLPTSVY---SPQPPSITENAAMDAR : ::.::. : .::..: .. ::. : : :: :::::::..... CCDS54 VPRFSSLSSC--NPPAMATSAEKRSLVLQNYTRPEGGQSRNFHSSPCPPSITENVTLESL 1030 1040 1050 1060 1070 710 720 730 740 750 pF1KE0 GLQEEPEVGTSMVGSGLNPYMDFPPTDTLGYGGPEGAAAE----PYGARGPGSLPLGPG- .. . ..:: :: : :.. : . .. :. : . ...: ::: CCDS54 TMDAD---------ANLNDE-DFLPDDVVQYLNSQNQAGYEQHFPSALPDDSKVPHGPGD 1080 1090 1100 1110 1120 760 770 780 790 800 pF1KE0 ------PPTNYGPN------PCPQQASYPDPTQETWGEFPSHSGLYPGPKALGGTYSQCP : .. : . :::. .. : : :.: : :. . : : : CCDS54 FDAPGLPDSHAGQQFHALEQPCPEGSKTDLPIQ--WNEVSSGSADLSSSKLKCGPRPAVP 1130 1140 1150 1160 1170 1180 810 820 830 840 850 pF1KE0 RLEHYG---QVQVKPEQGCPVGSDSTGLAPCL--NAHPSEGPPHPQPLFSHYPQPSPPQY . . .: . :.:.. :. : .: : :..: :: : :. : . : CCDS54 QTRAFGFCNGMVVHPQN--PLRSGPAGGYQTLGENSNPYGGPEH---LMLH----NSPGS 1190 1200 1210 1220 1230 860 870 880 890 900 910 pF1KE0 LQSGPYTQPPPDYLPSEPRPCLDFD--SPTHSTGQLKAQLVCNYVQSQQELLWEGGGRED :: . : :. ::. . .: : : . . ..: . .::. . CCDS54 GTSGNAFHEQPCKAPQYGN-CLNRQPVAPGALDGACGAGIQASKLKSTP--MQGSGGQLN 1240 1250 1260 1270 1280 1290 920 930 940 950 960 970 pF1KE0 APAQEPSYQSPKFLGGSQVSPSRAKAPVNTYGPGFGPNLPNHKSGSYPTPSPCHENFVVG : .:. .::.:. . . :: : :. CCDS54 FGL--PV--APNESAGSMVNGMQNQDPV---GQGYLAHQLLGDSMQHPGAGRPGQQMLGQ 1300 1310 1320 1330 1340 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE0 ANRASHRAAAPPRLLPPLPTCYGPLKVGGTNPSCGHPEVGRLGGGPALYPPPEGQVCNPL CCDS54 ISATSHINIYQGPESCLPGAHGMGSQPSSLAVVRGYQPCASFGGSRRQAMPRDSLALQSG 1350 1360 1370 1380 1390 1400 >>CCDS33283.1 GLI2 gene_id:2736|Hs108|chr2 (1586 aa) initn: 1817 init1: 1096 opt: 1207 Z-score: 538.0 bits: 111.9 E(32554): 1.2e-23 Smith-Waterman score: 1894; 38.0% identity (55.6% similar) in 1195 aa overlap (40-1001:176-1322) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 ISSYGEPCCLRPLPSQGAPSVGTEGLSGPPFCHQANLMSG-PHSYGPA-RETNSCTEGPL . :: .:..: : :: .... . .: CCDS33 RGLSPADVAQEHLKERGLFGLPAPGTTPSDYYHQMTLVAGHPAPYGDLLMQSGGAASAPH 150 160 170 180 190 200 70 80 90 100 110 pF1KE0 ------------FSSPRSAVKLTKKRALSISPLSDASLDLQTVIRTSPSSLVAFIN-SRC ::::: . .:..::::::::::::::::: .:::::.::::.:: :: CCDS33 LHDYLNPVDVSRFSSPRVTPRLSRKRALSISPLSDASLDLQRMIRTSPNSLVAYINNSRS 210 220 230 240 250 260 120 130 140 150 pF1KE0 TSPG-GSYGHLSIGTMSPSLGFPAQMN---------HQKGPSPSFG-----VQPC----G .: . ::::::: :..::.. :: .: .:.: . .:: .:: . CCDS33 SSAASGSYGHLSAGALSPAFTFPHPINPVAYQQILSQQRGLGSAFGHTPPLIQPSPTFLA 270 280 290 300 310 320 160 170 180 190 pF1KE0 PHDSARGGMIPHPQSRGPFPTC-----QLKSELDMLVG------------KCREEP---- . : .. : . . .: : :. . :. : . :: CCDS33 QQPMALTSINATPTQLSSSSNCLSDTNQNKQSSESAVSSTVNPVAIHKRSKVKTEPEGLR 330 340 350 360 370 380 200 210 220 230 240 pF1KE0 -------LEGDMSSPNSTGIQDPLLG--MLDGREDLEREE-KREPESV-YETDCRWDGCS .:..:. .: : :: . : .:::.:.. :.: : : :::.:.:. :. CCDS33 PASPLALTQGQVSGHGSCGCALPLSQEQLADLKEDLDRDDCKQEAEVVIYETNCHWEDCT 390 400 410 420 430 440 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 QEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKEFVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKC .:.:.:::::::::.::::::.:::::.: .:.:: .::::::::::::::::::::::: CCDS33 KEYDTQEQLVHHINNEHIHGEKKEFVCRWQACTREQKPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKC 450 460 470 480 490 500 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 TFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYV ::::: :.::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::::::::. 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CCDS33 GTGPGSLGDLTALDDTPPGADTSALAAPSAGGLQLRKHMTTMHRFEQLKKEKLKSLKDSC 690 700 710 720 730 740 520 530 540 pF1KE0 ----PIG-TRGLKLPSLSHTGTTVSRRVGP----PVSL---------------------E : ::. ::: : .:. . : :..: : CCDS33 SWAGPTPHTRNTKLPPLPGSGSILENFSGSGGGGPAGLLPNPRLSELSASEVTMLSQLQE 750 760 770 780 790 800 550 560 570 pF1KE0 RRSSSSSSISSAYTVSRRSSLASPF------PPGSP-----PEN---------------- ::.::.:..::::::::::: ::. .:: :.: CCDS33 RRDSSTSTVSSAYTVSRRSSGISPYFSSRRSSEASPLGAGRPHNASSADSYDPISTDASR 810 820 830 840 850 860 580 590 600 610 pF1KE0 ---------GASSLPGLMPAQHYLLRARYASARGGGTSPTAASSLDRIG----------- :.:.: .: :::.: :::.::.: :: :: .:.:.. CCDS33 RSSEASQCSGGSGLLNLTPAQQYSLRAKYAAATGG-PPPTPLPGLERMSLRTRLALLDAP 870 880 890 900 910 920 620 630 640 650 pF1KE0 ------GLPMP--PWRSR-------------AEYPGYNPNAGVTRRASDPAQAADRPAPA : : : : :. .: :..:. ::::::.. : . CCDS33 ERTLPAGCPRPLGPRRGSDGPTYGHGHAGAAPAFPHEAPGGGA-RRASDPVRRPDALSLP 930 940 950 960 970 980 660 670 680 690 700 pF1KE0 RVQRFKSLGCVHT---PPTVAGGGQNF------DPYLPTSVYSPQPPSITENAAMDARGL :::::.: :. :: . : . : : ..:::.::::.::.::.: CCDS33 RVQRFHSTHNVNPGPLPPCADRRGLRLQSHPSTDGGLARGAYSPRPPSISENVAMEA--- 990 1000 1010 1020 1030 710 720 730 740 750 760 pF1KE0 QEEPEVGTSMVGSGLNPYMDFPPTD-TLGYGGPEGAAAEPYGARGPGSLPLGPGPPTNYG :.... :.: . . .: : .: . :. :: :. . : :... CCDS33 -----VAAGVDGAGPEADLGLPEDDLVLPDDVVQYIKAHASGALDEGTGQVYPTESTGFS 1040 1050 1060 1070 1080 1090 770 780 790 800 810 820 pF1KE0 PNPCPQQASYPDPTQETWGEF-PSHSGLYPGPKALGGTYSQCPRLEHYGQVQVKPEQGCP :: :.: . .. . :.. :. ::: : .: . ... : CCDS33 DNP-----RLPSPGLHGQRRMVAADSNVGPSAPMLGG----CQL--GFGAPSSLNKNNMP 1100 1110 1120 1130 1140 830 840 850 860 pF1KE0 VGSD--STGLAPCLNAHPSEGPPHPQ---------PLFSHYPQPSPPQYLQSGP----YT : . :.: . : : . :: :: : :..:: :: : ::..: : CCDS33 VQWNEVSSGTVDAL-ASQVKPPPFPQGNLAVVQQKPAFGQYPGYSP-QGLQASPGGLDST 1150 1160 1170 1180 1190 1200 870 880 890 900 910 920 pF1KE0 QPPPDYLPSEPRPCLDFDSPTHSTGQLKAQLVCNYVQSQQELLWEGGGREDAPAQEPSYQ :: .: .:: .:... .. ::.: .: .: . :.. .. 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CCDS64 LEHERMQQLEHGGLQPGLVNHMVVQHGLPGPDSQSAGLFKTERLEEFPGSTVDLPPAPPL 240 250 260 270 280 290 200 210 220 230 240 pF1KE0 SS-PNSTGIQDPLLGMLD-GREDL--EREEKREPESVYETD-----------CRWDGCSQ : : : . . .: . .. :... . : ::: :: CCDS64 PPLPPPPGPPPPYHAHAHLHHPELGPHAQQLALPQATLDDDGEMDGIGGKHCCRWIDCSA 300 310 320 330 340 350 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 EFDSQEQLVHHINSEHIHGERKE-FVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKC .:.::.::.::.. :: .. : :.: :.:: :. .::.:.: :..::: :.::::.:: CCDS64 LYDQQEELVRHIEKVHIDQRKGEDFTCFWAGCPRRYKPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKC 360 370 380 390 400 410 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 TFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYV :::::.:..::::::: :::::::::::.:.: ::.:::::.::::::: ::: . :::. CCDS64 TFEGCEKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKHQ-RTHLDTKPYA 420 430 440 450 460 470 370 380 390 400 410 420 pF1KE0 CKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGDGPLPRAPSISTVEPKREREGGPI :..::::::::::::::::::. . . .. :. :.. : :.. : . . : CCDS64 CQIPGCTKRYTDPSSLRKHVKAHSSKEQQARKKLRSSTEL--HPDLLT-DCLTVQSLQPA 480 490 500 510 520 530 430 440 450 460 470 480 pF1KE0 REESRLTVPEGAMKPQPSPGAQSSCSSDHSPAGSAANTDSGVEMTGNAGGST---EDLSS : .. ::.. .:.:: . .: ..: .: .:.:.:.. . .: CCDS64 TSP-RDAAAEGTVGRSPGPGPDL-----YSAPIFSSNYSS---RSGTAAGAVPPPHPVSH 540 550 560 570 580 490 500 510 520 530 pF1KE0 LDEGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRPIGTRGLKL-PSLSHTGTTVSRRVGPPVSL . : . :. . .:: : . . . .. :: ::: : :. CCDS64 PSPGHNVQGSPHNPS--------SQLPPLTAVDAGAERFAPSAPSPHHISPRRVPAPSSI 590 600 610 620 630 540 550 560 570 580 590 pF1KE0 ERRSSS--SSSISSAYTVSRRSSLASPFPPGSPPENG-ASSLPGLMPAQHYLLRARYASA .:.. ... :... : . : : :.. .: ..: . : :: CCDS64 LQRTQPPYTQQPSGSHLKSYQPETNSSFQPNGIHVHGFYGQLQKFCPP-HYPDSQRIVPP 640 650 660 670 680 690 600 610 620 630 640 650 pF1KE0 RGGGTSPTAASSLDRIGGLPMPPWRSRAEYPGYNPNAGVTRRASDPAQAADRPAPARVQR CCDS64 VSSCSVVPSFEDCLVPTSMGQASFDVFHRAFSTHSGITVYDLPSSSSSLFGESLRSGAED 700 710 720 730 740 750 >>CCDS43784.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9 (930 aa) initn: 843 init1: 489 opt: 783 Z-score: 358.9 bits: 78.0 E(32554): 1.1e-13 Smith-Waterman score: 942; 34.8% identity (58.1% similar) in 621 aa overlap (24-587:242-838) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MFNSMTPPPISSYGEPCCLRPLPSQGAPSVGTEGLSGPP-FCHQANLMSG--P ::.. ..: . :: :: ..: .:. : CCDS43 LSLTESQSASSMKQEWSQGYRALPSLSNHGSQNGLDLG-DLLSLPPGTSMSSNSVSNSLP 220 230 240 250 260 270 60 70 80 90 100 pF1KE0 HSYGPARETNSCTEGPLFSSPRSAVKLTKKRALSISPLSDA-SLDLQTVIRTSPSSLVAF .. ..: .: :: :: .::::::.:::::. ..:..:.:::::.::::. CCDS43 SYLFGTESSHSPYPSPRHSSTRSHSARSKKRALSLSPLSDGIGIDFNTIIRTSPTSLVAY 280 290 300 310 320 330 110 120 130 140 150 pF1KE0 INSRCTSPGG------SYGHLSIGTMSPSLGFPAQM-NHQKG----PS----PSFGVQPC ::. .::.. :::. .:. . . : . . ::: :. :..: . CCDS43 INGSRASPANLSPQPEVYGHF-LGVRGSCIPQPRPVPGSQKGVLVAPGGLALPAYGEDGA 340 350 360 370 380 160 170 180 190 pF1KE0 GPHDSAR----GGMIP----HP--QSRGPFPTCQ----LKSE-LDMLVGKCREEPLEGDM :. . ::. : : : : : : .:.: :. . :. . : . CCDS43 LEHERMQQLEHGGLQPGLVNHMVVQHGLPGPDSQSAGLFKTERLEEFPGSTVDLPPAPPL 390 400 410 420 430 440 200 210 220 230 240 pF1KE0 SS-PNSTGIQDPLLGMLD-GREDL--EREEKREPESVYETD-----------CRWDGCSQ : : : . . .: . .. :... . : ::: :: CCDS43 PPLPPPPGPPPPYHAHAHLHHPELGPHAQQLALPQATLDDDGEMDGIGGKHCCRWIDCSA 450 460 470 480 490 500 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 EFDSQEQLVHHINSEHIHGERKE-FVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKC .:.::.::.::.. :: .. : :.: :.:: :. .::.:.: :..::: :.::::.:: CCDS43 LYDQQEELVRHIEKVHIDQRKGEDFTCFWAGCPRRYKPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKC 510 520 530 540 550 560 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 TFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYV :::::.:..::::::: :::::::::::.:.: ::.:::::.::::::: ::: . :::. CCDS43 TFEGCEKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKHQ-RTHLDTKPYA 570 580 590 600 610 620 370 380 390 400 410 420 pF1KE0 CKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGDGPLPRAPSISTVEPKREREGGPI :..::::::::::::::::::. . . .. :. :.. : :.. : . . : CCDS43 CQIPGCTKRYTDPSSLRKHVKAHSSKEQQARKKLRSSTEL--HPDLLT-DCLTVQSLQPA 630 640 650 660 670 680 430 440 450 460 470 480 pF1KE0 REESRLTVPEGAMKPQPSPGAQSSCSSDHSPAGSAANTDSGVEMTGNAGGST---EDLSS : .. ::.. .:.:: . .: ..: .: .:.:.:.. . .: CCDS43 TSP-RDAAAEGTVGRSPGPGPDL-----YSAPIFSSNYSS---RSGTAAGAVPPPHPVSH 690 700 710 720 730 490 500 510 520 530 pF1KE0 LDEGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRPIGTRGLKL-PSLSHTGTTVSRRVGPPVSL . : . :. . .:: : . . . .. :: ::: : :. CCDS43 PSPGHNVQGSPHNPS--------SQLPPLTAVDAGAERFAPSAPSPHHISPRRVPAPSSI 740 750 760 770 780 540 550 560 570 580 590 pF1KE0 ERRSSS--SSSISSAYTVSRRSSLASPFPPGSPPENG-ASSLPGLMPAQHYLLRARYASA .:.. ... :... : . : : :.. .: ..: . : :: CCDS43 LQRTQPPYTQQPSGSHLKSYQPETNSSFQPNGIHVHGFYGQLQKFCPP-HYPDSQRIVPP 790 800 810 820 830 840 600 610 620 630 640 650 pF1KE0 RGGGTSPTAASSLDRIGGLPMPPWRSRAEYPGYNPNAGVTRRASDPAQAADRPAPARVQR CCDS43 VSSCSVVPSFEDCLVPTSMGQASFDVFHRAFSTHSGITVYDLPSSSSSLFGESLRSGAED 850 860 870 880 890 900 >>CCDS582.1 GLIS1 gene_id:148979|Hs108|chr1 (620 aa) initn: 572 init1: 481 opt: 767 Z-score: 354.2 bits: 76.5 E(32554): 2.1e-13 Smith-Waterman score: 821; 32.9% identity (52.0% similar) in 611 aa overlap (18-587:12-570) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MFNSMTPPPISSYGEPCCLRPLPSQGAPSVGTEG--LSGP-PFCHQANLMSGPHSYGPAR : :: . :.. : :. : : :. : : : : . 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CCDS58 QEPADEFSELFGPHQQGLPPPYPLSQLPPGPSLGGLGLG-LAGRVVAGRQA--------- 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 TDCRWDGCSQEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKE-FVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMR ::: : ...::.::.::.. :: .. : :.: :.:: :. .::.:.: :..::: CCDS58 --CRWVDCCAAYEQQEELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRYKPFNARYKLLIHMR 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 RHTGEKPHKCTFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQN :.::::.:: :::: :..::::::: :::::::::::.:.: ::.:::::.::::::: CCDS58 VHSGEKPNKCMFEGCSKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKHQ- 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 pF1KE0 RTHSNEKPYVCKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGDGPLPRAPSI---- ::: . :::.:..:::.::::::::::::::. . . .: :. .. :: .: . 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