Result of FASTA (ccds) for pF1KE0199
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0199, 1106 aa
  1>>>pF1KE0199 1106 - 1106 aa - 1106 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.4204+/-0.00111; mu= -9.0356+/- 0.066
 mean_var=542.6293+/-116.184, 0's: 0 Z-trim(115.9): 635  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.055058
 statistics sampled from 15754 (16489) to 15754 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.79), E-opt: 0.2 (0.507), width:  16
 Scan time:  4.770

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8940.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12           (1106) 7851 639.5 1.3e-182
CCDS53806.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12          (1065) 7320 597.3 6.1e-170
CCDS53807.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12          ( 978) 6974 569.7 1.1e-161
CCDS5465.1 GLI3 gene_id:2737|Hs108|chr7            (1580) 1285 118.1 1.6e-25
CCDS33283.1 GLI2 gene_id:2736|Hs108|chr2           (1586) 1207 111.9 1.2e-23
CCDS6451.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9         ( 775)  783 77.9   1e-13
CCDS43784.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9        ( 930)  783 78.0 1.1e-13
CCDS582.1 GLIS1 gene_id:148979|Hs108|chr1          ( 620)  767 76.5 2.1e-13
CCDS10511.1 GLIS2 gene_id:84662|Hs108|chr16        ( 524)  696 70.8 9.3e-12


>>CCDS8940.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12                (1106 aa)
 initn: 7851 init1: 7851 opt: 7851  Z-score: 3392.2  bits: 639.5 E(32554): 1.3e-182
Smith-Waterman score: 7851; 100.0% identity (100.0% similar) in 1106 aa overlap (1-1106:1-1106)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MFNSMTPPPISSYGEPCCLRPLPSQGAPSVGTEGLSGPPFCHQANLMSGPHSYGPARETN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 MFNSMTPPPISSYGEPCCLRPLPSQGAPSVGTEGLSGPPFCHQANLMSGPHSYGPARETN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 SCTEGPLFSSPRSAVKLTKKRALSISPLSDASLDLQTVIRTSPSSLVAFINSRCTSPGGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 SCTEGPLFSSPRSAVKLTKKRALSISPLSDASLDLQTVIRTSPSSLVAFINSRCTSPGGS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 YGHLSIGTMSPSLGFPAQMNHQKGPSPSFGVQPCGPHDSARGGMIPHPQSRGPFPTCQLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 YGHLSIGTMSPSLGFPAQMNHQKGPSPSFGVQPCGPHDSARGGMIPHPQSRGPFPTCQLK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 SELDMLVGKCREEPLEGDMSSPNSTGIQDPLLGMLDGREDLEREEKREPESVYETDCRWD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 SELDMLVGKCREEPLEGDMSSPNSTGIQDPLLGMLDGREDLEREEKREPESVYETDCRWD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 GCSQEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKEFVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GCSQEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKEFVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 HKCTFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 HKCTFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 PYVCKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGDGPLPRAPSISTVEPKREREG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 PYVCKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGDGPLPRAPSISTVEPKREREG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 GPIREESRLTVPEGAMKPQPSPGAQSSCSSDHSPAGSAANTDSGVEMTGNAGGSTEDLSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GPIREESRLTVPEGAMKPQPSPGAQSSCSSDHSPAGSAANTDSGVEMTGNAGGSTEDLSS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 LDEGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRPIGTRGLKLPSLSHTGTTVSRRVGPPVSLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LDEGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRPIGTRGLKLPSLSHTGTTVSRRVGPPVSLE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 RRSSSSSSISSAYTVSRRSSLASPFPPGSPPENGASSLPGLMPAQHYLLRARYASARGGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 RRSSSSSSISSAYTVSRRSSLASPFPPGSPPENGASSLPGLMPAQHYLLRARYASARGGG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE0 TSPTAASSLDRIGGLPMPPWRSRAEYPGYNPNAGVTRRASDPAQAADRPAPARVQRFKSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 TSPTAASSLDRIGGLPMPPWRSRAEYPGYNPNAGVTRRASDPAQAADRPAPARVQRFKSL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE0 GCVHTPPTVAGGGQNFDPYLPTSVYSPQPPSITENAAMDARGLQEEPEVGTSMVGSGLNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GCVHTPPTVAGGGQNFDPYLPTSVYSPQPPSITENAAMDARGLQEEPEVGTSMVGSGLNP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE0 YMDFPPTDTLGYGGPEGAAAEPYGARGPGSLPLGPGPPTNYGPNPCPQQASYPDPTQETW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 YMDFPPTDTLGYGGPEGAAAEPYGARGPGSLPLGPGPPTNYGPNPCPQQASYPDPTQETW
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE0 GEFPSHSGLYPGPKALGGTYSQCPRLEHYGQVQVKPEQGCPVGSDSTGLAPCLNAHPSEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GEFPSHSGLYPGPKALGGTYSQCPRLEHYGQVQVKPEQGCPVGSDSTGLAPCLNAHPSEG
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE0 PPHPQPLFSHYPQPSPPQYLQSGPYTQPPPDYLPSEPRPCLDFDSPTHSTGQLKAQLVCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 PPHPQPLFSHYPQPSPPQYLQSGPYTQPPPDYLPSEPRPCLDFDSPTHSTGQLKAQLVCN
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE0 YVQSQQELLWEGGGREDAPAQEPSYQSPKFLGGSQVSPSRAKAPVNTYGPGFGPNLPNHK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 YVQSQQELLWEGGGREDAPAQEPSYQSPKFLGGSQVSPSRAKAPVNTYGPGFGPNLPNHK
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE0 SGSYPTPSPCHENFVVGANRASHRAAAPPRLLPPLPTCYGPLKVGGTNPSCGHPEVGRLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 SGSYPTPSPCHENFVVGANRASHRAAAPPRLLPPLPTCYGPLKVGGTNPSCGHPEVGRLG
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE0 GGPALYPPPEGQVCNPLDSLDLDNTQLDFVAILDEPQGLSPPPSHDQRGSSGHTPPPSGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GGPALYPPPEGQVCNPLDSLDLDNTQLDFVAILDEPQGLSPPPSHDQRGSSGHTPPPSGP
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      
pF1KE0 PNMAVGNMSVLLRSLPGETEFLNSSA
       ::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 PNMAVGNMSVLLRSLPGETEFLNSSA
             1090      1100      

>>CCDS53806.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12               (1065 aa)
 initn: 7310 init1: 7310 opt: 7320  Z-score: 3164.4  bits: 597.3 E(32554): 6.1e-170
Smith-Waterman score: 7460; 96.3% identity (96.3% similar) in 1106 aa overlap (1-1106:1-1065)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MFNSMTPPPISSYGEPCCLRPLPSQGAPSVGTEGLSGPPFCHQANLMSGPHSYGPARETN
       :::::::::::::::::::::::::::::::::                           
CCDS53 MFNSMTPPPISSYGEPCCLRPLPSQGAPSVGTE---------------------------
               10        20        30                              

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 SCTEGPLFSSPRSAVKLTKKRALSISPLSDASLDLQTVIRTSPSSLVAFINSRCTSPGGS
                     ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 --------------VKLTKKRALSISPLSDASLDLQTVIRTSPSSLVAFINSRCTSPGGS
                          40        50        60        70         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 YGHLSIGTMSPSLGFPAQMNHQKGPSPSFGVQPCGPHDSARGGMIPHPQSRGPFPTCQLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YGHLSIGTMSPSLGFPAQMNHQKGPSPSFGVQPCGPHDSARGGMIPHPQSRGPFPTCQLK
      80        90       100       110       120       130         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 SELDMLVGKCREEPLEGDMSSPNSTGIQDPLLGMLDGREDLEREEKREPESVYETDCRWD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SELDMLVGKCREEPLEGDMSSPNSTGIQDPLLGMLDGREDLEREEKREPESVYETDCRWD
     140       150       160       170       180       190         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 GCSQEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKEFVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GCSQEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKEFVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKP
     200       210       220       230       240       250         

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 HKCTFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 HKCTFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEK
     260       270       280       290       300       310         

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 PYVCKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGDGPLPRAPSISTVEPKREREG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PYVCKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGDGPLPRAPSISTVEPKREREG
     320       330       340       350       360       370         

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 GPIREESRLTVPEGAMKPQPSPGAQSSCSSDHSPAGSAANTDSGVEMTGNAGGSTEDLSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GPIREESRLTVPEGAMKPQPSPGAQSSCSSDHSPAGSAANTDSGVEMTGNAGGSTEDLSS
     380       390       400       410       420       430         

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 LDEGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRPIGTRGLKLPSLSHTGTTVSRRVGPPVSLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LDEGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRPIGTRGLKLPSLSHTGTTVSRRVGPPVSLE
     440       450       460       470       480       490         

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 RRSSSSSSISSAYTVSRRSSLASPFPPGSPPENGASSLPGLMPAQHYLLRARYASARGGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RRSSSSSSISSAYTVSRRSSLASPFPPGSPPENGASSLPGLMPAQHYLLRARYASARGGG
     500       510       520       530       540       550         

              610       620       630       640       650       660
pF1KE0 TSPTAASSLDRIGGLPMPPWRSRAEYPGYNPNAGVTRRASDPAQAADRPAPARVQRFKSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TSPTAASSLDRIGGLPMPPWRSRAEYPGYNPNAGVTRRASDPAQAADRPAPARVQRFKSL
     560       570       580       590       600       610         

              670       680       690       700       710       720
pF1KE0 GCVHTPPTVAGGGQNFDPYLPTSVYSPQPPSITENAAMDARGLQEEPEVGTSMVGSGLNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GCVHTPPTVAGGGQNFDPYLPTSVYSPQPPSITENAAMDARGLQEEPEVGTSMVGSGLNP
     620       630       640       650       660       670         

              730       740       750       760       770       780
pF1KE0 YMDFPPTDTLGYGGPEGAAAEPYGARGPGSLPLGPGPPTNYGPNPCPQQASYPDPTQETW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YMDFPPTDTLGYGGPEGAAAEPYGARGPGSLPLGPGPPTNYGPNPCPQQASYPDPTQETW
     680       690       700       710       720       730         

              790       800       810       820       830       840
pF1KE0 GEFPSHSGLYPGPKALGGTYSQCPRLEHYGQVQVKPEQGCPVGSDSTGLAPCLNAHPSEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GEFPSHSGLYPGPKALGGTYSQCPRLEHYGQVQVKPEQGCPVGSDSTGLAPCLNAHPSEG
     740       750       760       770       780       790         

              850       860       870       880       890       900
pF1KE0 PPHPQPLFSHYPQPSPPQYLQSGPYTQPPPDYLPSEPRPCLDFDSPTHSTGQLKAQLVCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PPHPQPLFSHYPQPSPPQYLQSGPYTQPPPDYLPSEPRPCLDFDSPTHSTGQLKAQLVCN
     800       810       820       830       840       850         

              910       920       930       940       950       960
pF1KE0 YVQSQQELLWEGGGREDAPAQEPSYQSPKFLGGSQVSPSRAKAPVNTYGPGFGPNLPNHK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YVQSQQELLWEGGGREDAPAQEPSYQSPKFLGGSQVSPSRAKAPVNTYGPGFGPNLPNHK
     860       870       880       890       900       910         

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE0 SGSYPTPSPCHENFVVGANRASHRAAAPPRLLPPLPTCYGPLKVGGTNPSCGHPEVGRLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SGSYPTPSPCHENFVVGANRASHRAAAPPRLLPPLPTCYGPLKVGGTNPSCGHPEVGRLG
     920       930       940       950       960       970         

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE0 GGPALYPPPEGQVCNPLDSLDLDNTQLDFVAILDEPQGLSPPPSHDQRGSSGHTPPPSGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GGPALYPPPEGQVCNPLDSLDLDNTQLDFVAILDEPQGLSPPPSHDQRGSSGHTPPPSGP
     980       990      1000      1010      1020      1030         

             1090      1100      
pF1KE0 PNMAVGNMSVLLRSLPGETEFLNSSA
       ::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PNMAVGNMSVLLRSLPGETEFLNSSA
    1040      1050      1060     

>>CCDS53807.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12               (978 aa)
 initn: 6974 init1: 6974 opt: 6974  Z-score: 3016.3  bits: 569.7 E(32554): 1.1e-161
Smith-Waterman score: 6974; 100.0% identity (100.0% similar) in 978 aa overlap (129-1106:1-978)

      100       110       120       130       140       150        
pF1KE0 IRTSPSSLVAFINSRCTSPGGSYGHLSIGTMSPSLGFPAQMNHQKGPSPSFGVQPCGPHD
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53                               MSPSLGFPAQMNHQKGPSPSFGVQPCGPHD
                                             10        20        30

      160       170       180       190       200       210        
pF1KE0 SARGGMIPHPQSRGPFPTCQLKSELDMLVGKCREEPLEGDMSSPNSTGIQDPLLGMLDGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SARGGMIPHPQSRGPFPTCQLKSELDMLVGKCREEPLEGDMSSPNSTGIQDPLLGMLDGR
               40        50        60        70        80        90

      220       230       240       250       260       270        
pF1KE0 EDLEREEKREPESVYETDCRWDGCSQEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKEFVCHWGGCSRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EDLEREEKREPESVYETDCRWDGCSQEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKEFVCHWGGCSRE
              100       110       120       130       140       150

      280       290       300       310       320       330        
pF1KE0 LRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGC
              160       170       180       190       200       210

      340       350       360       370       380       390        
pF1KE0 SKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVCKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVCKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHR
              220       230       240       250       260       270

      400       410       420       430       440       450        
pF1KE0 GDGPLPRAPSISTVEPKREREGGPIREESRLTVPEGAMKPQPSPGAQSSCSSDHSPAGSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GDGPLPRAPSISTVEPKREREGGPIREESRLTVPEGAMKPQPSPGAQSSCSSDHSPAGSA
              280       290       300       310       320       330

      460       470       480       490       500       510        
pF1KE0 ANTDSGVEMTGNAGGSTEDLSSLDEGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRPIGTRGLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ANTDSGVEMTGNAGGSTEDLSSLDEGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRPIGTRGLK
              340       350       360       370       380       390

      520       530       540       550       560       570        
pF1KE0 LPSLSHTGTTVSRRVGPPVSLERRSSSSSSISSAYTVSRRSSLASPFPPGSPPENGASSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LPSLSHTGTTVSRRVGPPVSLERRSSSSSSISSAYTVSRRSSLASPFPPGSPPENGASSL
              400       410       420       430       440       450

      580       590       600       610       620       630        
pF1KE0 PGLMPAQHYLLRARYASARGGGTSPTAASSLDRIGGLPMPPWRSRAEYPGYNPNAGVTRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PGLMPAQHYLLRARYASARGGGTSPTAASSLDRIGGLPMPPWRSRAEYPGYNPNAGVTRR
              460       470       480       490       500       510

      640       650       660       670       680       690        
pF1KE0 ASDPAQAADRPAPARVQRFKSLGCVHTPPTVAGGGQNFDPYLPTSVYSPQPPSITENAAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ASDPAQAADRPAPARVQRFKSLGCVHTPPTVAGGGQNFDPYLPTSVYSPQPPSITENAAM
              520       530       540       550       560       570

      700       710       720       730       740       750        
pF1KE0 DARGLQEEPEVGTSMVGSGLNPYMDFPPTDTLGYGGPEGAAAEPYGARGPGSLPLGPGPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DARGLQEEPEVGTSMVGSGLNPYMDFPPTDTLGYGGPEGAAAEPYGARGPGSLPLGPGPP
              580       590       600       610       620       630

      760       770       780       790       800       810        
pF1KE0 TNYGPNPCPQQASYPDPTQETWGEFPSHSGLYPGPKALGGTYSQCPRLEHYGQVQVKPEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TNYGPNPCPQQASYPDPTQETWGEFPSHSGLYPGPKALGGTYSQCPRLEHYGQVQVKPEQ
              640       650       660       670       680       690

      820       830       840       850       860       870        
pF1KE0 GCPVGSDSTGLAPCLNAHPSEGPPHPQPLFSHYPQPSPPQYLQSGPYTQPPPDYLPSEPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GCPVGSDSTGLAPCLNAHPSEGPPHPQPLFSHYPQPSPPQYLQSGPYTQPPPDYLPSEPR
              700       710       720       730       740       750

      880       890       900       910       920       930        
pF1KE0 PCLDFDSPTHSTGQLKAQLVCNYVQSQQELLWEGGGREDAPAQEPSYQSPKFLGGSQVSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PCLDFDSPTHSTGQLKAQLVCNYVQSQQELLWEGGGREDAPAQEPSYQSPKFLGGSQVSP
              760       770       780       790       800       810

      940       950       960       970       980       990        
pF1KE0 SRAKAPVNTYGPGFGPNLPNHKSGSYPTPSPCHENFVVGANRASHRAAAPPRLLPPLPTC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SRAKAPVNTYGPGFGPNLPNHKSGSYPTPSPCHENFVVGANRASHRAAAPPRLLPPLPTC
              820       830       840       850       860       870

     1000      1010      1020      1030      1040      1050        
pF1KE0 YGPLKVGGTNPSCGHPEVGRLGGGPALYPPPEGQVCNPLDSLDLDNTQLDFVAILDEPQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YGPLKVGGTNPSCGHPEVGRLGGGPALYPPPEGQVCNPLDSLDLDNTQLDFVAILDEPQG
              880       890       900       910       920       930

     1060      1070      1080      1090      1100      
pF1KE0 LSPPPSHDQRGSSGHTPPPSGPPNMAVGNMSVLLRSLPGETEFLNSSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LSPPPSHDQRGSSGHTPPPSGPPNMAVGNMSVLLRSLPGETEFLNSSA
              940       950       960       970        

>>CCDS5465.1 GLI3 gene_id:2737|Hs108|chr7                 (1580 aa)
 initn: 1493 init1: 1138 opt: 1285  Z-score: 571.5  bits: 118.1 E(32554): 1.6e-25
Smith-Waterman score: 1805; 37.5% identity (55.5% similar) in 1145 aa overlap (20-952:220-1322)

                          10        20        30        40         
pF1KE0            MFNSMTPPPISSYGEPCCLRPLPSQGAPSVGTEGLSGPPFCHQANLMSG
                                     : :    :: .   :.:   . ::  :..:
CCDS54 FSPPHPYINPYMDYIRSLHSSPSLSMISATRGLSPTDAPHA---GVSPAEYYHQMALLTG
     190       200       210       220       230          240      

      50            60                  70        80        90     
pF1KE0 PHS-YG---PARETNSC----------TEGPLFSSPRSAVKLTKKRALSISPLSDASLDL
        .: :.   :.  : .            ..  ::::: ... ..::.:::::::: :.::
CCDS54 QRSPYADIIPSAATAGTGAIHMEYLHAMDSTRFSSPRLSARPSRKRTLSISPLSDHSFDL
        250       260       270       280       290       300      

         100       110         120       130            140        
pF1KE0 QTVIRTSPSSLVAFIN-SRCTSPG-GSYGHLSIGTMSPSLGF-----PAQMN-HQK----
       ::.:::::.:::...: :: .: . ::::::: ...::.:.:     :.... ::.    
CCDS54 QTMIRTSPNSLVTILNNSRSSSSASGSYGHLSASAISPALSFTYSSAPVSLHMHQQILSR
        310       320       330       340       350       360      

                   150       160             170       180         
pF1KE0 --------GPSPSFGVQPCGPHDSARG--G----MIPHPQSRGPFPTCQLKSELDMLVG-
               : :: . ..:     . :   :    . :   : ::  . : :   .  :. 
CCDS54 QQSLGSAFGHSPPL-IHPAPTFPTQRPIPGIPTVLNPVQVSSGPSESSQNKPTSESAVSS
        370       380        390       400       410       420     

              190       200       210       220        230         
pF1KE0 --------KCREEPLEGDMSSPNSTGIQDPLLGMLDGREDLEREE-KREPESVYETDCRW
               . . .: : :. ::.. : :.   :    .:. ...: :.::: .:::.:.:
CCDS54 TGDPMHNKRSKIKPDE-DLPSPGARGQQEQPEGTTLVKEEGDKDESKQEPEVIYETNCHW
         430       440        450       460       470       480    

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE0 DGCSQEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKEFVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEK
       .::..:::.:::::::::..:::::.:::::.:  :::: .:::::::::::::::::::
CCDS54 EGCAREFDTQEQLVHHINNDHIHGEKKEFVCRWLDCSREQKPFKAQYMLVVHMRRHTGEK
          490       500       510       520       530       540    

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE0 PHKCTFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNE
       ::::::::: :.::::::::::::::::::::.::::::.::::::::::::::::::::
CCDS54 PHKCTFEGCTKAYSRLENLKTHLRSHTGEKPYVCEHEGCNKAFSNASDRAKHQNRTHSNE
          550       560       570       580       590       600    

     360       370       380       390       400        410        
pF1KE0 KPYVCKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGD-GPLPRAPSISTVEPKRER
       ::::::.:::::::::::::::::::::::.:::::..:::  : :  :  :  . . . 
CCDS54 KPYVCKIPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPEAHVTKKQRGDIHPRPPPPRDSGSHSQSRS
          610       620       630       640       650       660    

      420                          430       440       450         
pF1KE0 EGGPI----------------REES---RLTVPEGAMKPQPSPGAQSSCSSDHSPAGSAA
        : :                 :::    . .  :  :  :::::.::::::..:: .. .
CCDS54 PGRPTQGALGEQQDLSNTTSKREECLQVKTVKAEKPMTSQPSPGGQSSCSSQQSPISNYS
          670       680       690       700       710       720    

     460       470       480             490               500     
pF1KE0 NTDSGVEMTGNAGGSTEDLSSLDEGPCI------AGTGLSTLRR--------LENLRLDQ
       :  ::.:.  . :::  :::..:: : .      : :.:.   :        .:...:..
CCDS54 N--SGLELPLTDGGSIGDLSAIDETPIMDSTISTATTALALQARRNPAGTKWMEHVKLER
            730       740       750       760       770       780  

                510                     520       530              
pF1KE0 LHQ-------LRPI--------------GTRGLKLPSLSHTGTTVSRRV---GPPVS---
       :.:       : ::              ::.. .  ::.   : .  :    :  :.   
CCDS54 LKQVNGMFPRLNPILPPKAPAVSPLIGNGTQSNNTCSLGGPMTLLPGRSDLSGVDVTMLN
            790       800       810       820       830       840  

       540       550       560                                570  
pF1KE0 -LERRSSSSSSISSAYTVSRRSSLASP-------------------------FPPGSPPE
        :.::.::.:.:::::  :::::  ::                         . : :   
CCDS54 MLNRRDSSASTISSAYLSSRRSSGISPCFSSRRSSEASQAEGRPQNVSVADSYDPISTDA
            850       860       870       880       890       900  

                   580          590       600       610            
pF1KE0 NGASS-------LPGLM---PAQHYLLRARYASARGGGTSPTAASSLDRIG---------
       .  ::       ::.:.   :::.: :.:.::.: ::   ::   ...:..         
CCDS54 SRRSSEASQSDGLPSLLSLTPAQQYRLKAKYAAATGG-PPPTPLPNMERMSLKTRLALLG
            910       920       930        940       950       960 

                620                     630       640        650   
pF1KE0 -----GLPMPPWRS--------------RAEYPGYNPNAGVTRRASDPAQAADRP-APAR
            :. .:: ..              :   :   :. :: ::::::......  :  :
CCDS54 DALEPGVALPPVHAPRRCSDGGAHGYGRRHLQPHDAPGHGV-RRASDPVRTGSEGLALPR
             970       980       990      1000       1010      1020

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pF1KE0 VQRFKSLG-CVHTPPTVAGGG-------QNFD-PYLPTSVY---SPQPPSITENAAMDAR
       : ::.::. :  .::..: ..       ::.  :    :     :: :::::::..... 
CCDS54 VPRFSSLSSC--NPPAMATSAEKRSLVLQNYTRPEGGQSRNFHSSPCPPSITENVTLESL
             1030        1040      1050      1060      1070        

             710       720       730       740           750       
pF1KE0 GLQEEPEVGTSMVGSGLNPYMDFPPTDTLGYGGPEGAAAE----PYGARGPGSLPLGPG-
        .. .         ..::   :: : :.. : . .. :.     : .    ...: ::: 
CCDS54 TMDAD---------ANLNDE-DFLPDDVVQYLNSQNQAGYEQHFPSALPDDSKVPHGPGD
     1080                1090      1100      1110      1120        

              760             770       780       790       800    
pF1KE0 ------PPTNYGPN------PCPQQASYPDPTQETWGEFPSHSGLYPGPKALGGTYSQCP
             : .. : .      :::. ..   : :  :.:  : :.   . :   :     :
CCDS54 FDAPGLPDSHAGQQFHALEQPCPEGSKTDLPIQ--WNEVSSGSADLSSSKLKCGPRPAVP
     1130      1140      1150      1160        1170      1180      

          810          820       830         840       850         
pF1KE0 RLEHYG---QVQVKPEQGCPVGSDSTGLAPCL--NAHPSEGPPHPQPLFSHYPQPSPPQY
       . . .:    . :.:..  :. :  .:    :  :..:  :: :   :. :    . :  
CCDS54 QTRAFGFCNGMVVHPQN--PLRSGPAGGYQTLGENSNPYGGPEH---LMLH----NSPGS
       1190      1200        1210      1220         1230           

     860       870       880         890       900       910       
pF1KE0 LQSGPYTQPPPDYLPSEPRPCLDFD--SPTHSTGQLKAQLVCNYVQSQQELLWEGGGRED
         ::   .  :   :.    ::. .  .:    :   : .  . ..:    .  .::. .
CCDS54 GTSGNAFHEQPCKAPQYGN-CLNRQPVAPGALDGACGAGIQASKLKSTP--MQGSGGQLN
      1240      1250       1260      1270      1280        1290    

       920       930       940       950       960       970       
pF1KE0 APAQEPSYQSPKFLGGSQVSPSRAKAPVNTYGPGFGPNLPNHKSGSYPTPSPCHENFVVG
            :   .:.  .::.:.  . . ::   : :.                         
CCDS54 FGL--PV--APNESAGSMVNGMQNQDPV---GQGYLAHQLLGDSMQHPGAGRPGQQMLGQ
             1300      1310         1320      1330      1340       

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pF1KE0 ANRASHRAAAPPRLLPPLPTCYGPLKVGGTNPSCGHPEVGRLGGGPALYPPPEGQVCNPL
                                                                   
CCDS54 ISATSHINIYQGPESCLPGAHGMGSQPSSLAVVRGYQPCASFGGSRRQAMPRDSLALQSG
      1350      1360      1370      1380      1390      1400       

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                                     . :: .:..: :  ::    .... . .: 
CCDS33 RGLSPADVAQEHLKERGLFGLPAPGTTPSDYYHQMTLVAGHPAPYGDLLMQSGGAASAPH
         150       160       170       180       190       200     

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pF1KE0 ------------FSSPRSAVKLTKKRALSISPLSDASLDLQTVIRTSPSSLVAFIN-SRC
                   ::::: . .:..::::::::::::::::: .:::::.::::.:: :: 
CCDS33 LHDYLNPVDVSRFSSPRVTPRLSRKRALSISPLSDASLDLQRMIRTSPNSLVAYINNSRS
         210       220       230       240       250       260     

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pF1KE0 TSPG-GSYGHLSIGTMSPSLGFPAQMN---------HQKGPSPSFG-----VQPC----G
       .: . ::::::: :..::.. ::  .:         .:.: . .::     .::     .
CCDS33 SSAASGSYGHLSAGALSPAFTFPHPINPVAYQQILSQQRGLGSAFGHTPPLIQPSPTFLA
         270       280       290       300       310       320     

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pF1KE0 PHDSARGGMIPHPQSRGPFPTC-----QLKSELDMLVG------------KCREEP----
        .  :  ..   : . .   .:     : :.  .  :.            : . ::    
CCDS33 QQPMALTSINATPTQLSSSSNCLSDTNQNKQSSESAVSSTVNPVAIHKRSKVKTEPEGLR
         330       340       350       360       370       380     

                 200       210         220        230        240   
pF1KE0 -------LEGDMSSPNSTGIQDPLLG--MLDGREDLEREE-KREPESV-YETDCRWDGCS
               .:..:. .: :   ::    . : .:::.:.. :.: : : :::.:.:. :.
CCDS33 PASPLALTQGQVSGHGSCGCALPLSQEQLADLKEDLDRDDCKQEAEVVIYETNCHWEDCT
         390       400       410       420       430       440     

           250       260       270       280       290       300   
pF1KE0 QEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKEFVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKC
       .:.:.:::::::::.::::::.:::::.: .:.:: .:::::::::::::::::::::::
CCDS33 KEYDTQEQLVHHINNEHIHGEKKEFVCRWQACTREQKPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKC
         450       460       470       480       490       500     

           310       320       330       340       350       360   
pF1KE0 TFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYV
       ::::: :.::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::::::::.
CCDS33 TFEGCSKAYSRLENLKTHLRSHTGEKPYVCEHEGCNKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYI
         510       520       530       540       550       560     

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pF1KE0 CKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGDGPLPRAPSISTVEPKRE--REGG
       ::.:::::::::::::::::::::::::::::..:.:  : :.: ..    ..   . ::
CCDS33 CKIPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKKQRNDVHL-RTPLLKENGDSEAGTEPGG
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pF1KE0 PIREES-------------RLTVPEGAMKPQPSPGAQSSCSSDHSPAGSAANTDSGVEMT
       :   :.             :    :..   : ::::::::::. :: ::: :.:::::: 
CCDS33 PESTEASSTSQAVEDCLHVRAIKTESSGLCQSSPGAQSSCSSEPSPLGSAPNNDSGVEMP
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pF1KE0 GNAGGSTEDLSSLDEGPCIAGT---------GL------STLRRLENLRLDQLHQLR---
       :.. ::  ::..::. :  : :         ::      .:..:.:.:. ..:..:.   
CCDS33 GTGPGSLGDLTALDDTPPGADTSALAAPSAGGLQLRKHMTTMHRFEQLKKEKLKSLKDSC
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pF1KE0 ----PIG-TRGLKLPSLSHTGTTVSRRVGP----PVSL---------------------E
           :   ::. ::: :  .:. .    :     :..:                     :
CCDS33 SWAGPTPHTRNTKLPPLPGSGSILENFSGSGGGGPAGLLPNPRLSELSASEVTMLSQLQE
          750       760       770       780       790       800    

              550       560             570                        
pF1KE0 RRSSSSSSISSAYTVSRRSSLASPF------PPGSP-----PEN----------------
       ::.::.:..:::::::::::  ::.        .::     :.:                
CCDS33 RRDSSTSTVSSAYTVSRRSSGISPYFSSRRSSEASPLGAGRPHNASSADSYDPISTDASR
          810       820       830       840       850       860    

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pF1KE0 ---------GASSLPGLMPAQHYLLRARYASARGGGTSPTAASSLDRIG-----------
                :.:.: .: :::.: :::.::.: ::   ::   .:.:..           
CCDS33 RSSEASQCSGGSGLLNLTPAQQYSLRAKYAAATGG-PPPTPLPGLERMSLRTRLALLDAP
          870       880       890        900       910       920   

                   620                    630       640       650  
pF1KE0 ------GLPMP--PWRSR-------------AEYPGYNPNAGVTRRASDPAQAADRPAPA
             : : :  : :.                .:   :..:. ::::::..  :  .  
CCDS33 ERTLPAGCPRPLGPRRGSDGPTYGHGHAGAAPAFPHEAPGGGA-RRASDPVRRPDALSLP
           930       940       950       960        970       980  

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pF1KE0 RVQRFKSLGCVHT---PPTVAGGGQNF------DPYLPTSVYSPQPPSITENAAMDARGL
       :::::.:   :.    :: .   :  .      :  :  ..:::.::::.::.::.:   
CCDS33 RVQRFHSTHNVNPGPLPPCADRRGLRLQSHPSTDGGLARGAYSPRPPSISENVAMEA---
            990      1000      1010      1020      1030            

           710       720        730       740       750       760  
pF1KE0 QEEPEVGTSMVGSGLNPYMDFPPTD-TLGYGGPEGAAAEPYGARGPGSLPLGPGPPTNYG
            :.... :.: .  . .:  : .:     .   :.  ::   :.  . :   :...
CCDS33 -----VAAGVDGAGPEADLGLPEDDLVLPDDVVQYIKAHASGALDEGTGQVYPTESTGFS
         1040      1050      1060      1070      1080      1090    

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pF1KE0 PNPCPQQASYPDPTQETWGEF-PSHSGLYPGPKALGGTYSQCPRLEHYGQVQVKPEQGCP
        ::       :.:  .   ..  . :.. :.   :::    :     .:  .   ... :
CCDS33 DNP-----RLPSPGLHGQRRMVAADSNVGPSAPMLGG----CQL--GFGAPSSLNKNNMP
              1100      1110      1120            1130      1140   

               830       840                850       860          
pF1KE0 VGSD--STGLAPCLNAHPSEGPPHPQ---------PLFSHYPQPSPPQYLQSGP----YT
       :  .  :.: .  : :   . :: ::         : :..::  :: : ::..:     :
CCDS33 VQWNEVSSGTVDAL-ASQVKPPPFPQGNLAVVQQKPAFGQYPGYSP-QGLQASPGGLDST
          1150       1160      1170      1180       1190      1200 

        870       880       890       900       910       920      
pF1KE0 QPPPDYLPSEPRPCLDFDSPTHSTGQLKAQLVCNYVQSQQELLWEGGGREDAPAQEPSYQ
       ::   .:  .::      .:...  ..      ::.:   .:    .: .  :..  .. 
CCDS33 QP---HL--QPRS----GAPSQGIPRV------NYMQ---QLRQPVAGSQ-CPGMTTTM-
                     1210            1220         1230       1240  

        930          940       950       960         970       980 
pF1KE0 SPKFLGGS---QVSPSRAKAPVNTYGPGFGPNLPNHKSG--SYPTPSPCHENFVVGANRA
       ::.   :.   :.:::  .. .: . :    :.:  : :  ..:  .    . .. .:: 
CCDS33 SPHACYGQVHPQLSPSTISGALNQF-PQSCSNMPA-KPGHLGHPQQTEVAPDPTTMGNR-
            1250      1260       1270       1280      1290         

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pF1KE0 SHRA-AAPPRLL----PPLPTCYGPLKVGGTNPSCGHPEVGRLGGGPALYPPPEGQVCNP
        ::  ..:   :    :: :.   :                                   
CCDS33 -HRELGVPDSALAGVPPPHPVQSYPQQSHHLAASMSQEGYHQVPSLLPARQPGFMEPQTG
      1300      1310      1320      1330      1340      1350       

>>CCDS6451.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9              (775 aa)
 initn: 843 init1: 489 opt: 783  Z-score: 359.8  bits: 77.9 E(32554): 1e-13
Smith-Waterman score: 942; 34.8% identity (58.1% similar) in 621 aa overlap (24-587:87-683)

                      10        20        30         40          50
pF1KE0        MFNSMTPPPISSYGEPCCLRPLPSQGAPSVGTEGLSGPP-FCHQANLMSG--P
                                     ::.. ..: . :: ::    ..: .:.  :
CCDS64 LSLTESQSASSMKQEWSQGYRALPSLSNHGSQNGLDLG-DLLSLPPGTSMSSNSVSNSLP
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               60        70        80        90        100         
pF1KE0 HSYGPARETNSCTEGPLFSSPRSAVKLTKKRALSISPLSDA-SLDLQTVIRTSPSSLVAF
            .. ..:   .:  :: ::    .::::::.:::::. ..:..:.:::::.::::.
CCDS64 SYLFGTESSHSPYPSPRHSSTRSHSARSKKRALSLSPLSDGIGIDFNTIIRTSPTSLVAY
         120       130       140       150       160       170     

     110             120       130        140               150    
pF1KE0 INSRCTSPGG------SYGHLSIGTMSPSLGFPAQM-NHQKG----PS----PSFGVQPC
       ::.  .::..       :::. .:. .  .  :  . . :::    :.    :..: .  
CCDS64 INGSRASPANLSPQPEVYGHF-LGVRGSCIPQPRPVPGSQKGVLVAPGGLALPAYGEDGA
         180       190        200       210       220       230    

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pF1KE0 GPHDSAR----GGMIP----HP--QSRGPFPTCQ----LKSE-LDMLVGKCREEPLEGDM
         :.  .    ::. :    :   :   : :  :    .:.: :. . :.  . :    .
CCDS64 LEHERMQQLEHGGLQPGLVNHMVVQHGLPGPDSQSAGLFKTERLEEFPGSTVDLPPAPPL
          240       250       260       270       280       290    

     200        210        220         230                  240    
pF1KE0 SS-PNSTGIQDPLLGMLD-GREDL--EREEKREPESVYETD-----------CRWDGCSQ
          :   :   :  .     . .:  . ..   :... . :           :::  :: 
CCDS64 PPLPPPPGPPPPYHAHAHLHHPELGPHAQQLALPQATLDDDGEMDGIGGKHCCRWIDCSA
          300       310       320       330       340       350    

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pF1KE0 EFDSQEQLVHHINSEHIHGERKE-FVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKC
        .:.::.::.::.. ::  .. : :.: :.:: :. .::.:.: :..::: :.::::.::
CCDS64 LYDQQEELVRHIEKVHIDQRKGEDFTCFWAGCPRRYKPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKC
          360       370       380       390       400       410    

           310       320       330       340       350       360   
pF1KE0 TFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYV
       :::::.:..::::::: :::::::::::.:.: ::.:::::.::::::: ::: . :::.
CCDS64 TFEGCEKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKHQ-RTHLDTKPYA
          420       430       440       450       460        470   

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pF1KE0 CKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGDGPLPRAPSISTVEPKREREGGPI
       :..::::::::::::::::::.  . . .. :. :..  :   :.. : .    .   : 
CCDS64 CQIPGCTKRYTDPSSLRKHVKAHSSKEQQARKKLRSSTEL--HPDLLT-DCLTVQSLQPA
           480       490       500       510          520       530

           430       440       450       460       470          480
pF1KE0 REESRLTVPEGAMKPQPSPGAQSSCSSDHSPAGSAANTDSGVEMTGNAGGST---EDLSS
           : .. ::..  .:.:: .      .:    ..: .:    .:.:.:..   . .: 
CCDS64 TSP-RDAAAEGTVGRSPGPGPDL-----YSAPIFSSNYSS---RSGTAAGAVPPPHPVSH
               540       550            560          570       580 

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pF1KE0 LDEGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRPIGTRGLKL-PSLSHTGTTVSRRVGPPVSL
        . :  . :.  .          .::  :  . . . .. ::         :::  : :.
CCDS64 PSPGHNVQGSPHNPS--------SQLPPLTAVDAGAERFAPSAPSPHHISPRRVPAPSSI
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pF1KE0 ERRSSS--SSSISSAYTVSRRSSLASPFPPGSPPENG-ASSLPGLMPAQHYLLRARYASA
        .:..   ... :...  : .    : : :..   .:  ..:  . :  ::         
CCDS64 LQRTQPPYTQQPSGSHLKSYQPETNSSFQPNGIHVHGFYGQLQKFCPP-HYPDSQRIVPP
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pF1KE0 RGGGTSPTAASSLDRIGGLPMPPWRSRAEYPGYNPNAGVTRRASDPAQAADRPAPARVQR
                                                                   
CCDS64 VSSCSVVPSFEDCLVPTSMGQASFDVFHRAFSTHSGITVYDLPSSSSSLFGESLRSGAED
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>>CCDS43784.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9             (930 aa)
 initn: 843 init1: 489 opt: 783  Z-score: 358.9  bits: 78.0 E(32554): 1.1e-13
Smith-Waterman score: 942; 34.8% identity (58.1% similar) in 621 aa overlap (24-587:242-838)

                      10        20        30         40          50
pF1KE0        MFNSMTPPPISSYGEPCCLRPLPSQGAPSVGTEGLSGPP-FCHQANLMSG--P
                                     ::.. ..: . :: ::    ..: .:.  :
CCDS43 LSLTESQSASSMKQEWSQGYRALPSLSNHGSQNGLDLG-DLLSLPPGTSMSSNSVSNSLP
             220       230       240        250       260       270

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pF1KE0 HSYGPARETNSCTEGPLFSSPRSAVKLTKKRALSISPLSDA-SLDLQTVIRTSPSSLVAF
            .. ..:   .:  :: ::    .::::::.:::::. ..:..:.:::::.::::.
CCDS43 SYLFGTESSHSPYPSPRHSSTRSHSARSKKRALSLSPLSDGIGIDFNTIIRTSPTSLVAY
              280       290       300       310       320       330

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pF1KE0 INSRCTSPGG------SYGHLSIGTMSPSLGFPAQM-NHQKG----PS----PSFGVQPC
       ::.  .::..       :::. .:. .  .  :  . . :::    :.    :..: .  
CCDS43 INGSRASPANLSPQPEVYGHF-LGVRGSCIPQPRPVPGSQKGVLVAPGGLALPAYGEDGA
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pF1KE0 GPHDSAR----GGMIP----HP--QSRGPFPTCQ----LKSE-LDMLVGKCREEPLEGDM
         :.  .    ::. :    :   :   : :  :    .:.: :. . :.  . :    .
CCDS43 LEHERMQQLEHGGLQPGLVNHMVVQHGLPGPDSQSAGLFKTERLEEFPGSTVDLPPAPPL
     390       400       410       420       430       440         

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pF1KE0 SS-PNSTGIQDPLLGMLD-GREDL--EREEKREPESVYETD-----------CRWDGCSQ
          :   :   :  .     . .:  . ..   :... . :           :::  :: 
CCDS43 PPLPPPPGPPPPYHAHAHLHHPELGPHAQQLALPQATLDDDGEMDGIGGKHCCRWIDCSA
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pF1KE0 EFDSQEQLVHHINSEHIHGERKE-FVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKC
        .:.::.::.::.. ::  .. : :.: :.:: :. .::.:.: :..::: :.::::.::
CCDS43 LYDQQEELVRHIEKVHIDQRKGEDFTCFWAGCPRRYKPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKC
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pF1KE0 TFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYV
       :::::.:..::::::: :::::::::::.:.: ::.:::::.::::::: ::: . :::.
CCDS43 TFEGCEKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKHQ-RTHLDTKPYA
     570       580       590       600       610        620        

           370       380       390       400       410       420   
pF1KE0 CKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGDGPLPRAPSISTVEPKREREGGPI
       :..::::::::::::::::::.  . . .. :. :..  :   :.. : .    .   : 
CCDS43 CQIPGCTKRYTDPSSLRKHVKAHSSKEQQARKKLRSSTEL--HPDLLT-DCLTVQSLQPA
      630       640       650       660         670        680     

           430       440       450       460       470          480
pF1KE0 REESRLTVPEGAMKPQPSPGAQSSCSSDHSPAGSAANTDSGVEMTGNAGGST---EDLSS
           : .. ::..  .:.:: .      .:    ..: .:    .:.:.:..   . .: 
CCDS43 TSP-RDAAAEGTVGRSPGPGPDL-----YSAPIFSSNYSS---RSGTAAGAVPPPHPVSH
          690       700            710          720       730      

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pF1KE0 LDEGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRPIGTRGLKL-PSLSHTGTTVSRRVGPPVSL
        . :  . :.  .          .::  :  . . . .. ::         :::  : :.
CCDS43 PSPGHNVQGSPHNPS--------SQLPPLTAVDAGAERFAPSAPSPHHISPRRVPAPSSI
        740       750               760       770       780        

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pF1KE0 ERRSSS--SSSISSAYTVSRRSSLASPFPPGSPPENG-ASSLPGLMPAQHYLLRARYASA
        .:..   ... :...  : .    : : :..   .:  ..:  . :  ::         
CCDS43 LQRTQPPYTQQPSGSHLKSYQPETNSSFQPNGIHVHGFYGQLQKFCPP-HYPDSQRIVPP
      790       800       810       820       830        840       

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pF1KE0 RGGGTSPTAASSLDRIGGLPMPPWRSRAEYPGYNPNAGVTRRASDPAQAADRPAPARVQR
                                                                   
CCDS43 VSSCSVVPSFEDCLVPTSMGQASFDVFHRAFSTHSGITVYDLPSSSSSLFGESLRSGAED
       850       860       870       880       890       900       

>>CCDS582.1 GLIS1 gene_id:148979|Hs108|chr1               (620 aa)
 initn: 572 init1: 481 opt: 767  Z-score: 354.2  bits: 76.5 E(32554): 2.1e-13
Smith-Waterman score: 821; 32.9% identity (52.0% similar) in 611 aa overlap (18-587:12-570)

               10        20        30           40        50       
pF1KE0 MFNSMTPPPISSYGEPCCLRPLPSQGAPSVGTEG--LSGP-PFCHQANLMSGPHSYGPAR
                        :  :: .   :..   :  :. : : :.   : : : :    .
CCDS58       MAEARTSLSAHCRGPLATGLHPDLDLPGRSLATPAPSCYL--LGSEPSSGLGLQ
                     10        20        30        40          50  

        60        70         80        90       100       110      
pF1KE0 ETNSCTEGPLFSSPRSAV-KLTKKRALSISPLSDASLDLQTVIRTSPSSLVAFINSRCTS
         .   :: :    :  :  :      : ::   :: :. ..::.: .:::. .:.  . 
CCDS58 PETHLPEGSL---KRCCVLGLPPTSPASSSPC--ASSDVTSIIRSSQTSLVTCVNGLRSP
             60           70        80          90       100       

        120       130       140       150       160       170      
pF1KE0 PGGSYGHLSIGTMSPSLGFPAQMNHQKGPSPSFGVQPCGPHDSARGGMIPHPQSRGPFPT
       :           .. .:: :..   . ::. .         :: .:..  .   .. :  
CCDS58 P-----------LTGDLGGPSK-RARPGPAST---------DSHEGSLQLEACRKASFLK
                  110        120                130       140      

        180       190        200        210       220       230    
pF1KE0 CQLKSELDMLVGKCREE-PLEGDMSS-PNSTGIQDPLLGMLDGREDLEREEKREPESVYE
        .  .:.. : :  ..  :    .:. : . ..    :: : ::    :.          
CCDS58 QEPADEFSELFGPHQQGLPPPYPLSQLPPGPSLGGLGLG-LAGRVVAGRQA---------
        150       160       170       180        190               

          240       250       260        270       280       290   
pF1KE0 TDCRWDGCSQEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKE-FVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMR
         :::  :   ...::.::.::.. ::  .. : :.: :.:: :. .::.:.: :..:::
CCDS58 --CRWVDCCAAYEQQEELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRYKPFNARYKLLIHMR
          200       210       220       230       240       250    

           300       310       320       330       340       350   
pF1KE0 RHTGEKPHKCTFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQN
        :.::::.:: :::: :..::::::: :::::::::::.:.: ::.:::::.::::::: 
CCDS58 VHSGEKPNKCMFEGCSKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKHQ-
          260       270       280       290       300       310    

           360       370       380       390       400             
pF1KE0 RTHSNEKPYVCKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGDGPLPRAPSI----
       ::: . :::.:..:::.::::::::::::::.  . . .: :. .. ::  .:  .    
CCDS58 RTHLDTKPYACQIPGCSKRYTDPSSLRKHVKAHSAKEQQVRKKLHA-GPDTEADVLTECL
           320       330       340       350        360       370  

            410       420        430       440             450     
pF1KE0 -------STVEPKREREGG-PIREESRLTVPEGAMKPQPS------PGAQSSCSSDHSPA
              ::     . .::  . .:    :  :.. :. .      : :..   : : : 
CCDS58 VLQQLHTSTQLAASDGKGGCGLGQELLPGVYPGSITPHNGLASGLLPPAHD-VPSRHHPL
            380       390       400       410       420        430 

         460       470       480       490       500       510     
pF1KE0 GSAANTDSGVEMTGNAGGSTEDLSSLDEGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRPIGTR
        .....   .     : .. . :     :: . .  .: :. :    :    : .  :  
CCDS58 DATTSSHHHLSPLPMAESTRDGL-----GPGLLSPIVSPLKGLGPPPLPPSSQSHSPG--
             440       450            460       470       480      

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pF1KE0 GLKLPSLSHTGTTVSRRVGPPVSL---ERRSSSSSSISSAYTVSRRSSLASP--------
       :  .:.:    .    .  ::  :   .  ..:  ::.: .  .    .: :        
CCDS58 GQPFPTLPSKPSYPPFQSPPPPPLPSPQGYQGSFHSIQSCFPYGDCYRMAEPAAGGDGLV
          490       500       510       520       530       540    

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pF1KE0 -----FPPGSPPENGASSLPGLMPAQHYLLRARYASARGGGTSPTAASSLDRIGGLPMPP
            : :  :  ::  ::   .::  :                                
CCDS58 GETHGFNPLRP--NGYHSLSTPLPATGYEALAEASCPTALPQQPSEDVVSSGPEDCGFFP
          550         560       570       580       590       600  

>>CCDS10511.1 GLIS2 gene_id:84662|Hs108|chr16             (524 aa)
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                                     ::  :: :    : .  :  :: ... . .
CCDS10 KLRAAREKRERTLGVVRPRALHRELGLVDDSPTPGSPGSPPSGFLLNS-KFPEKVEGRFS
          20        30        40        50        60         70    

            150       160         170       180       190       200
pF1KE0 PSP--SFGVQPCGPHDSARGG--MIPHPQSRGPFPTCQLKSELDMLVGKCREEPLEGDMS
        .:  .....: .  ::  :.  . :. :. : .:     :... :      . :.:  :
CCDS10 AAPLVDLSLSPPSGLDSPNGSSSLSPERQGNGDLPPVPSASDFQPL------RYLDGVPS
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pF1KE0 S-----PNSTG--IQDPLLGMLDGRED-LEREEKREPESVYETDCRWDGCSQEFDSQEQL
       :     : ..:  .. :  ..:   .:     .   :...    :::  :.: :.  ..:
CCDS10 SFQFFLPLGSGGALHLPASSFLTPPKDKCLSPDLPLPKQLV---CRWAKCNQLFELLQDL
      130       140       150       160          170       180     

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pF1KE0 VHHINSEHIHGERKE-FVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCRKS
       : :.:. :.. :.   . ::: ::.:. : :.:.: ...:.: ::.::::.:    : ::
CCDS10 VDHVNDYHVKPEKDAGYCCHWEGCARHGRGFNARYKMLIHIRTHTNEKPHRCPT--CSKS
         190       200       210       220       230         240   

             320       330       340       350       360       370 
pF1KE0 YSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVCKLPGCTK
       .::::::: : :::::::::.: .:::.: .::.::: :: .:::  .::: ::.::: :
CCDS10 FSRLENLKIHNRSHTGEKPYVCPYEGCNKRYSNSSDRFKH-TRTHYVDKPYYCKMPGCHK
           250       260       270       280        290       300  

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pF1KE0 RYTDPSSLRKHVKTVHGP-DAHVTKRHRGDGPLPRAPSISTVEPKREREGGPIREESRLT
       :::::::::::.:. ::   .:  ..     : :. :  .   :    .:::    ... 
CCDS10 RYTDPSSLRKHIKA-HGHFVSHEQQELLQLRPPPKPPLPA---P----DGGPYVSGAQII
            310        320       330       340              350    

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pF1KE0 VPE-GAMKPQPS-PGAQSSCSSDHSPAGSAANTDSGVEMTGNAGGSTEDLSSLDEGPCIA
       .:. .:.   :. ::     .   .:       : ..   ::.:::    ..   :: . 
CCDS10 IPNPAALFGGPGLPGLPLPLAP--GP------LDLSALACGNGGGSG---GGGGMGPGLP
          360       370               380       390          400   

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pF1KE0 GTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRPIGTRGLKLPSLSH-TGTTVSRRVG-------PPVSLE
       :  :       ::  . :    :.:. :: :: .:  .:.. ..  :       :  .: 
CCDS10 GPVLPL-----NLAKNPLLP-SPFGAGGLGLPVVSLLAGAAGGKAEGEKGRGSVPTRALG
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        .. ..    .  . :: :  . :. ::     :   :.:.: : .: :           
CCDS10 MEGHKTPLERTESSCSRPSPDGLPLLPGTVLDLSTGVNSAASSPEALAPGWVVIPPGSVL
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       520                                                         




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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