FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0213, 320 aa 1>>>pF1KE0213 320 - 320 aa - 320 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7289+/-0.000435; mu= 13.6178+/- 0.027 mean_var=68.7472+/-14.510, 0's: 0 Z-trim(108.1): 56 B-trim: 613 in 1/56 Lambda= 0.154685 statistics sampled from 16069 (16125) to 16069 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.537), E-opt: 0.2 (0.189), width: 16 Scan time: 6.350 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001145 (OMIM: 131230,614391) annexin A5 [Homo s ( 320) 2015 459.1 5.3e-129 NP_001144 (OMIM: 106491) annexin A4 isoform a [Hom ( 321) 1202 277.7 2.2e-74 XP_016859432 (OMIM: 106491) PREDICTED: annexin A4 ( 321) 1202 277.7 2.2e-74 NP_001307627 (OMIM: 106491) annexin A4 isoform a [ ( 321) 1202 277.7 2.2e-74 XP_005268489 (OMIM: 114070) PREDICTED: annexin A6 ( 667) 1198 276.9 7.8e-74 NP_001146 (OMIM: 114070) annexin A6 isoform 1 [Hom ( 673) 1198 276.9 7.9e-74 NP_001265338 (OMIM: 602572) annexin A11 isoform 2 ( 472) 1119 259.2 1.2e-68 NP_665876 (OMIM: 602572) annexin A11 isoform 1 [Ho ( 505) 1119 259.3 1.2e-68 XP_011538038 (OMIM: 602572) PREDICTED: annexin A11 ( 505) 1119 259.3 1.2e-68 NP_001265337 (OMIM: 602572) annexin A11 isoform 1 ( 505) 1119 259.3 1.2e-68 NP_665875 (OMIM: 602572) annexin A11 isoform 1 [Ho ( 505) 1119 259.3 1.2e-68 NP_001265336 (OMIM: 602572) annexin A11 isoform 1 ( 505) 1119 259.3 1.2e-68 NP_001148 (OMIM: 602572) annexin A11 isoform 1 [Ho ( 505) 1119 259.3 1.2e-68 XP_005269798 (OMIM: 602572) PREDICTED: annexin A11 ( 605) 1119 259.3 1.5e-68 NP_001180473 (OMIM: 114070) annexin A6 isoform 2 [ ( 641) 1105 256.2 1.3e-67 NP_001035173 (OMIM: 602396) annexin A8 isoform 2 [ ( 327) 1054 244.7 2e-64 XP_006718014 (OMIM: 602396) PREDICTED: annexin A8 ( 351) 1054 244.7 2.1e-64 XP_011538398 (OMIM: 602396) PREDICTED: annexin A8 ( 448) 1054 244.7 2.6e-64 NP_005130 (OMIM: 106490) annexin A3 [Homo sapiens] ( 323) 1048 243.3 4.9e-64 XP_006717876 (OMIM: 602572) PREDICTED: annexin A11 ( 542) 1024 238.1 3.2e-62 XP_006717877 (OMIM: 602572) PREDICTED: annexin A11 ( 542) 1024 238.1 3.2e-62 XP_005269799 (OMIM: 602572) PREDICTED: annexin A11 ( 542) 1024 238.1 3.2e-62 XP_011538037 (OMIM: 602572) PREDICTED: annexin A11 ( 542) 1024 238.1 3.2e-62 NP_001307808 (OMIM: 186360) annexin A7 isoform 4 [ ( 426) 1004 233.6 5.7e-61 NP_001307809 (OMIM: 186360) annexin A7 isoform 3 [ ( 448) 1004 233.6 5.9e-61 NP_001147 (OMIM: 186360) annexin A7 isoform 1 [Hom ( 466) 1004 233.6 6.2e-61 XP_016871652 (OMIM: 186360) PREDICTED: annexin A7 ( 466) 1004 233.6 6.2e-61 XP_016871651 (OMIM: 186360) PREDICTED: annexin A7 ( 488) 1004 233.6 6.4e-61 NP_004025 (OMIM: 186360) annexin A7 isoform 2 [Hom ( 488) 1004 233.6 6.4e-61 NP_001258631 (OMIM: 602396) annexin A8 isoform 1 [ ( 365) 983 228.9 1.3e-59 NP_001129487 (OMIM: 151740) annexin A2 isoform 2 [ ( 339) 927 216.3 6.9e-56 XP_016877579 (OMIM: 151740) PREDICTED: annexin A2 ( 339) 927 216.3 6.9e-56 NP_004030 (OMIM: 151740) annexin A2 isoform 2 [Hom ( 339) 927 216.3 6.9e-56 XP_016877580 (OMIM: 151740) PREDICTED: annexin A2 ( 339) 927 216.3 6.9e-56 NP_001002857 (OMIM: 151740) annexin A2 isoform 2 [ ( 339) 927 216.3 6.9e-56 NP_001002858 (OMIM: 151740) annexin A2 isoform 1 [ ( 357) 927 216.4 7.2e-56 XP_016859433 (OMIM: 106491) PREDICTED: annexin A4 ( 237) 893 208.7 9.7e-54 NP_001307631 (OMIM: 106491) annexin A4 isoform c [ ( 237) 893 208.7 9.7e-54 NP_004297 (OMIM: 602573) annexin A13 isoform a [Ho ( 316) 883 206.5 5.9e-53 NP_001003954 (OMIM: 602573) annexin A13 isoform b ( 357) 883 206.5 6.5e-53 NP_001258632 (OMIM: 602396) annexin A8 isoform 3 [ ( 265) 863 202.0 1.1e-51 NP_000691 (OMIM: 151690) annexin A1 [Homo sapiens] ( 346) 849 198.9 1.2e-50 XP_011516911 (OMIM: 151690) PREDICTED: annexin A1 ( 346) 849 198.9 1.2e-50 XP_016870146 (OMIM: 151690) PREDICTED: annexin A1 ( 357) 849 198.9 1.3e-50 NP_001307629 (OMIM: 106491) annexin A4 isoform b [ ( 299) 829 194.5 2.4e-49 XP_016863630 (OMIM: 131230,614391) PREDICTED: anne ( 148) 808 189.7 3.3e-48 XP_011538401 (OMIM: 602396) PREDICTED: annexin A8 ( 387) 778 183.1 7.9e-46 NP_009124 (OMIM: 608008) annexin A10 [Homo sapiens ( 324) 776 182.6 9.2e-46 NP_003559 (OMIM: 603319) annexin A9 [Homo sapiens] ( 345) 706 167.0 4.9e-41 XP_011519779 (OMIM: 151740) PREDICTED: annexin A2 ( 222) 695 164.5 1.8e-40 >>NP_001145 (OMIM: 131230,614391) annexin A5 [Homo sapie (320 aa) initn: 2015 init1: 2015 opt: 2015 Z-score: 2436.9 bits: 459.1 E(85289): 5.3e-129 Smith-Waterman score: 2015; 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XP_016 IVKCMRNKSAYFAEKLYKSMKGLGTDDNTLIRVMVSRAEIDMLDIRAHFKRLYGKSLYSF 250 260 270 280 290 300 300 310 320 pF1KE0 IKGDTSGDYKKALLLLCGEDD :::::::::.:.::.::: :: XP_016 IKGDTSGDYRKVLLVLCGGDD 310 320 >>NP_001307627 (OMIM: 106491) annexin A4 isoform a [Homo (321 aa) initn: 1200 init1: 1200 opt: 1202 Z-score: 1456.4 bits: 277.7 E(85289): 2.2e-74 Smith-Waterman score: 1202; 57.9% identity (83.5% similar) in 321 aa overlap (1-320:1-321) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MAQVLRG-TVTDFPGFDERADAETLRKAMKGLGTDEESILTLLTSRSNAQRQEISAAFKT ::.. .: :: ::. ::.:::::::::::::..:...:. :..:::::: .:.:. NP_001 MAMATKGGTVKAASGFNAMEDAQTLRKAMKGLGTDEDAIISVLAYRNTAQRQEIRTAYKS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 LFGRDLLDDLKSELTGKFEKLIVALMKPSRLYDAYELKHALKGAGTNEKVLTEIIASRTP .::::.:::::::.:.::..::..: :. :::. ::..:.:::::.: : ::.::::: NP_001 TIGRDLIDDLKSELSGNFEQVIVGMMTPTVLYDVQELRRAMKGAGTDEGCLIEILASRTP 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 EELRAIKQVYEEEYGSSLEDDVVGDTSGYYQRMLVVLLQANRDPDAGIDEAQVEQDAQAL ::.: :.:.:...:: :::::. .::: ..::.:: : ..:: .:.: :.:::: : NP_001 EEIRRISQTYQQQYGRSLEDDIRSDTSFMFQRVLVSLSAGGRDEGNYLDDALVRQDAQDL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 FQAGELKWGTDEEKFITIFGTRSVSHLRKVFDKYMTISGFQIEETIDRETSGNLEQLLLA ..::: :::::: ::.:.. .:. .:: .:::.: :: .::..: ::::..:. ::: NP_001 YEAGEKKWGTDEVKFLTVLCSRNRNHLLHVFDEYKRISQKDIEQSIKSETSGSFEDALLA 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 VVKSIRSIPAYLAETLYYAMKGAGTDDHTLIRVMVSRSEIDLFNIRKEFRKNFATSLYSM .:: .:. ::.:: :: .::: ::::.:::::::::.:::...:: .:.. .. ::::. NP_001 IVKCMRNKSAYFAEKLYKSMKGLGTDDNTLIRVMVSRAEIDMLDIRAHFKRLYGKSLYSF 250 260 270 280 290 300 300 310 320 pF1KE0 IKGDTSGDYKKALLLLCGEDD :::::::::.:.::.::: :: NP_001 IKGDTSGDYRKVLLVLCGGDD 310 320 >>XP_005268489 (OMIM: 114070) PREDICTED: annexin A6 isof (667 aa) initn: 1198 init1: 1198 opt: 1198 Z-score: 1446.5 bits: 276.9 E(85289): 7.8e-74 Smith-Waterman score: 1198; 57.8% identity (80.6% similar) in 315 aa overlap (6-320:11-325) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MAQVLRGTVTDFPGFDERADAETLRKAMKGLGTDEESILTLLTSRSNAQRQEISA ::.. :::::: :::.: ::::.:.:.:.:: ..::::: ::::. 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XP_005 QLKKAMEGAGTDEKALIEILATRTNAEIRAINEAYKEDYHKSLEDALSSDTSGHFRRILI 450 460 470 480 490 500 160 170 180 190 200 210 pF1KE0 VLLQANRDPDAGIDEAQVEQDAQALFQAGELKWGTDEEKFITIFGTRSVSHLRKVFDKYM : ..:. ..: . :...::: . .. . : .:.::. ::: :::.::.... 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NP_001 LSQGNRDESTNVDMSLAQRDAQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEYQR 350 360 370 380 390 400 220 230 240 250 260 270 pF1KE0 ISGFQIEETIDRETSGNLEQLLLAVVKSIRSIPAYLAETLYYAMKGAGTDDHTLIRVMVS ..: .::..: :: ::.::. .::::: ... ::..:: : ::.:::: :.::::.::: NP_001 MTGRDIEKSICREMSGDLEEGMLAVVKCLKNTPAFFAERLNKAMRGAGTKDRTLIRIMVS 410 420 430 440 450 460 280 290 300 310 320 pF1KE0 RSEIDLFNIRKEFRKNFATSLYSMIKGDTSGDYKKALLLLCGEDD ::: ::..::.:... .. ::: :.:::::::.: :: .:: .: NP_001 RSETDLLDIRSEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND 470 480 490 500 320 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 21:03:31 2016 done: Thu Nov 3 21:03:32 2016 Total Scan time: 6.350 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]