Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0232
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0232, 312 aa
1>>>pF1KE0232 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2157+/-0.00137; mu= 16.5832+/- 0.080
mean_var=209.2737+/-77.167, 0's: 0 Z-trim(101.4): 417 B-trim: 364 in 1/46
Lambda= 0.088658
statistics sampled from 5997 (6498) to 5997 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.536), E-opt: 0.2 (0.2), width: 16
Scan time: 2.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 ( 312) 2032 273.7 1.3e-73
CCDS31826.2 OR6C68 gene_id:403284|Hs108|chr12 ( 312) 1599 218.3 6.1e-57
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 ( 312) 1507 206.5 2.1e-53
CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 ( 312) 1469 201.7 6.2e-52
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 1442 198.2 6.8e-51
CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 ( 312) 1418 195.1 5.7e-50
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 ( 309) 1414 194.6 8.1e-50
CCDS31821.1 OR6C65 gene_id:403282|Hs108|chr12 ( 312) 1409 194.0 1.3e-49
CCDS31817.1 OR6C6 gene_id:283365|Hs108|chr12 ( 314) 1386 191.1 9.8e-49
CCDS31818.1 OR6C1 gene_id:390321|Hs108|chr12 ( 312) 1383 190.7 1.3e-48
CCDS31825.1 OR6C70 gene_id:390327|Hs108|chr12 ( 312) 1348 186.2 2.8e-47
CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12 ( 309) 1347 186.1 3.1e-47
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 968 137.6 1.2e-32
CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 ( 323) 939 133.9 1.6e-31
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 937 133.6 1.9e-31
CCDS43661.1 OR9A4 gene_id:130075|Hs108|chr7 ( 314) 920 131.5 8.5e-31
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 916 130.9 1.2e-30
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 914 130.7 1.5e-30
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 913 130.5 1.6e-30
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 900 128.9 5e-30
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 893 128.0 9.3e-30
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 889 127.5 1.3e-29
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 887 127.2 1.6e-29
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 884 126.9 2.1e-29
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 882 126.6 2.5e-29
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 879 126.2 3.2e-29
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 875 125.7 4.6e-29
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 872 125.3 6e-29
CCDS34767.1 OR9A2 gene_id:135924|Hs108|chr7 ( 310) 870 125.0 7.2e-29
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 870 125.1 7.2e-29
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 865 124.4 1.1e-28
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 864 124.3 1.2e-28
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 864 124.4 1.3e-28
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 860 123.8 1.8e-28
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 857 123.4 2.3e-28
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 856 123.3 2.5e-28
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 855 123.1 2.7e-28
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 855 123.1 2.7e-28
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 854 123.0 3e-28
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 ( 317) 854 123.0 3e-28
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 854 123.0 3e-28
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 853 122.9 3.2e-28
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 853 122.9 3.2e-28
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 853 122.9 3.3e-28
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 851 122.6 3.9e-28
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 851 122.6 3.9e-28
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 847 122.1 5.6e-28
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 844 121.7 7.2e-28
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 844 121.7 7.2e-28
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 843 121.6 7.9e-28
>>CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 2032 init1: 2032 opt: 2032 Z-score: 1435.0 bits: 273.7 E(32554): 1.3e-73
Smith-Waterman score: 2032; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKNHTVIRTFILLGLTGDPHLQVLLFIFLFLTYMLSVTGNLTIITLTLVDHHLKTPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MKNHTVIRTFILLGLTGDPHLQVLLFIFLFLTYMLSVTGNLTIITLTLVDHHLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LRNFSFLEVSFTTVCIPRFLYNISMGDNTITYNACASQIFFVILFGATEFFLLAAMSYDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LRNFSFLEVSFTTVCIPRFLYNISMGDNTITYNACASQIFFVILFGATEFFLLAAMSYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YVAICKPLHYVVIMNNRVCTLLVLCCWVAGLMIIVPPLSLGLQLEFCDSNAIDHFSCDAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YVAICKPLHYVVIMNNRVCTLLVLCCWVAGLMIIVPPLSLGLQLEFCDSNAIDHFSCDAG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PLLKISCSDTWVIEQMVILMAVFALIITLVCVILSYLYIVRTILKFPSVQQRKKAFSTCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PLLKISCSDTWVIEQMVILMAVFALIITLVCVILSYLYIVRTILKFPSVQQRKKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SHMIVVSIAYGSCIFIYIKPSAKDEVAINKGVSVLTTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHMIVVSIAYGSCIFIYIKPSAKDEVAINKGVSVLTTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 DSIKRIAFLSKK
::::::::::::
CCDS31 DSIKRIAFLSKK
310
>>CCDS31826.2 OR6C68 gene_id:403284|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1599 init1: 1599 opt: 1599 Z-score: 1135.7 bits: 218.3 E(32554): 6.1e-57
Smith-Waterman score: 1599; 74.7% identity (92.9% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKNHTVIRTFILLGLTGDPHLQVLLFIFLFLTYMLSVTGNLTIITLTLVDHHLKTPMYFF
:..::.: :::::::: ::.::::::.:::.::::::::.::::.::..: :::::::::
CCDS31 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LRNFSFLEVSFTTVCIPRFLYNISMGDNTITYNACASQIFFVILFGATEFFLLAAMSYDR
:.:.::::.:::..:.:::::.:: :.. ::::::. :.::. :::.:::::::.:::::
CCDS31 LQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMSYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YVAICKPLHYVVIMNNRVCTLLVLCCWVAGLMIIVPPLSLGLQLEFCDSNAIDHFSCDAG
::::::::::..::.:.:: .:.:::.:.::::.::::::..:::::::.:.::.:::
CCDS31 YVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFGCDAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PLLKISCSDTWVIEQMVILMAVFALIITLVCVILSYLYIVRTILKFPSVQQRKKAFSTCS
:.::: :::: .:::::. ::...:::::::.::: ::.:::::::::::.::::::::
CCDS31 PILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SHMIVVSIAYGSCIFIYIKPSAKDEVAINKGVSVLTTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFS
::. ::::.::::::::::::::.:: :::::::: .:..:.:: :::::::.::::::
CCDS31 SHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVKQAFH
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 DSIKRIAFLSKK
::.:.::: ::
CCDS31 DSLKKIAFRLKK
310
>>CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1570 init1: 1497 opt: 1507 Z-score: 1072.1 bits: 206.5 E(32554): 2.1e-53
Smith-Waterman score: 1507; 68.9% identity (92.6% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKNHTVIRTFILLGLTGDPHLQVLLFIFLFLTYMLSVTGNLTIITLTLVDHHLKTPMYFF
:.:::.. .::::::: ::.:::..:..::.:::::.:::::::::::.: :::::::::
CCDS31 MRNHTTVANFILLGLTDDPQLQVIIFLLLFFTYMLSITGNLTIITLTLLDLHLKTPMYFF
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pF1KE0 LRNFSFLEVSFTTVCIPRFLYNISMGDNTITYNACASQIFFVILFGATEFFLLAAMSYDR
:::::::::::::: ::.:: ... ::.::.:: ::.:.::.::.:::::::::::::.:
CCDS31 LRNFSFLEVSFTTVYIPKFLVSMATGDKTISYNDCAAQLFFTILLGATEFFLLAAMSYER
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130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YVAICKPLHYVVIMNNRVCTLLVLCCWVAGLMIIVPPLSLGLQLEFCDSNAIDHFSCDAG
::::::::::..::..:::.:::. :.::..:: ::: .::::.:: .:..::: ::..
CCDS31 YVAICKPLHYTTIMSSRVCSLLVFASWMAGFLIIFPPLLMGLQLDFCAANTVDHFFCDVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PLLKISCSDTWVIEQMVILMAVFALIITLVCVILSYLYIVRTILKFPSVQQRKKAFSTCS
:.:..::.:: .:: :..: :...:..::: ::::: :.:::::.:: :::::::::::
CCDS31 PILQLSCTDTDIIELMMLLSAILTLLVTLVLVILSYTNIIRTILKIPSSQQRKKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SHMIVVSIAYGSCIFIYIKPSAKDEVAINKGVSVLTTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFS
:::.::::.::::::.:.:::::..:..:::...:.:::::.::::::::::::::..:.
CCDS31 SHMVVVSISYGSCIFMYVKPSAKERVSLNKGIALLSTSVAPMLNPFIYTLRNKQVKDVFK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 DSIKRIAFLSKK
..:.: ..: :
CCDS31 HTVKKIELFSMK
310
>>CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1159 init1: 1159 opt: 1469 Z-score: 1045.9 bits: 201.7 E(32554): 6.2e-52
Smith-Waterman score: 1469; 67.9% identity (90.7% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKNHTVIRTFILLGLTGDPHLQVLLFIFLFLTYMLSVTGNLTIITLTLVDHHLKTPMYFF
:::.: . ::::::: .:.:::..: ::::::.::::::::::.:::.: :::::::::
CCDS31 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LRNFSFLEVSFTTVCIPRFLYNISMGDNTITYNACASQIFFVILFGATEFFLLAAMSYDR
::::: ::.:::.:: :::: .: ::..:.:::::.:.:: :..:.:::::::.::::
CCDS31 LRNFS-LEISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMSYDC
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YVAICKPLHYVVIMNNRVCTLLVLCCWVAGLMIIVPPLSLGLQLEFCDSNAIDHFSCDAG
::::::::::..::..:.: :.. :.::...: :::..::::.:::::.::::.::..
CCDS31 YVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVIDHFTCDSA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PLLKISCSDTWVIEQMVILMAVFALIITLVCVILSYLYIVRTILKFPSVQQRKKAFSTCS
:::.:::.:: ..: : ...:.:.:: ::. ::::: ::.::::..::.:::::::::::
CCDS31 PLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKAFSTCS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SHMIVVSIAYGSCIFIYIKPSAKDEVAINKGVSVLTTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFS
::.:::::.::::::.:.: :::. ::..:::..:.:::::.::::::::::.::::::.
CCDS31 SHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 DSIKRIAFLSKK
: ...:. .::
CCDS31 DVLRKISHKKKKH
300 310
>>CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 (311 aa)
initn: 1517 init1: 1442 opt: 1442 Z-score: 1027.2 bits: 198.2 E(32554): 6.8e-51
Smith-Waterman score: 1442; 64.8% identity (90.3% similar) in 310 aa overlap (3-312:2-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKNHTVIRTFILLGLTGDPHLQVLLFIFLFLTYMLSVTGNLTIITLTLVDHHLKTPMYFF
:::.. :.::::. :: ::...:.:::.::.:::::::::::::.:: ::.::::::
CCDS31 MNHTMVTEFVLLGLSDDPDLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTFVDSHLQTPMYFF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LRNFSFLEVSFTTVCIPRFLYNISMGDNTITYNACASQIFFVILFGATEFFLLAAMSYDR
::::::::.::::::::::: : ..::.:: ::.:.:: :..:.:::..:.::::::
CCDS31 LRNFSFLEISFTTVCIPRFLGAIITRNKTISYNNCAAQLFFFIFMGVTEFYILTAMSYDR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YVAICKPLHYVVIMNNRVCTLLVLCCWVAGLMIIVPPLSLGLQLEFCDSNAIDHFSCDAG
::::::::::. ::: ..::::::: :..:.. : ::: : :::..: ::.::::.::
CCDS31 YVAICKPLHYTSIMNRKLCTLLVLCAWLSGFLTIFPPLMLLLQLDYCASNVIDHFACDYF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PLLKISCSDTWVIEQMVILMAVFALIITLVCVILSYLYIVRTILKFPSVQQRKKAFSTCS
:::..::::::..: . . .:. .:..::. :::::.::.::::..::..::::::::::
CCDS31 PLLQLSCSDTWLLEVIGFYFALVTLLFTLALVILSYMYIIRTILRIPSASQRKKAFSTCS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SHMIVVSIAYGSCIFIYIKPSAKDEVAINKGVSVLTTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFS
:::::.::.::::::.: .::::......::...:.:::::.::::::::::.::::::.
CCDS31 SHMIVISISYGSCIFMYANPSAKEKASLTKGIAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 DSIKRIAFLSKK
. .....: ...
CCDS31 NVVHKVVFYANQ
300 310
>>CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1484 init1: 1395 opt: 1418 Z-score: 1010.6 bits: 195.1 E(32554): 5.7e-50
Smith-Waterman score: 1418; 66.9% identity (90.3% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKNHTVIRTFILLGLTGDPHLQVLLFIFLFLTYMLSVTGNLTIITLTLVDHHLKTPMYFF
:.: :.. :::::::.::. ::.:::::..:::::::::: :::::: : ::.::::::
CCDS31 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPMYFF
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CCDS31 EFTKKILSLNKQ
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CCDS31 PILQISCTDTHVLELMSFTLAVVTLVVTLVLVILSYTCIIKTILKFSSAQQRNKAFSTCT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]