Result of FASTA (omim) for
pF1KE0255
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0255, 422 aa
1>>>pF1KE0255 422 - 422 aa - 422 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6330+/-0.000348; mu= 16.0186+/- 0.022
mean_var=69.3571+/-14.027, 0's: 0 Z-trim(115.2): 134 B-trim: 913 in 1/54
Lambda= 0.154003
statistics sampled from 25392 (25532) to 25392 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.299), width: 16
Scan time: 7.930
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011535016 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 417) 1157 265.9 1.3e-70
XP_011535017 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 417) 1157 265.9 1.3e-70
NP_783866 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform A [Homo ( 435) 1157 266.0 1.4e-70
NP_001275962 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 2 ( 427) 1154 265.3 2.1e-70
NP_006206 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 2 pre ( 427) 1154 265.3 2.1e-70
NP_001275961 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 1 ( 464) 1154 265.3 2.3e-70
NP_000345 (OMIM: 300932,314200) thyroxine-binding ( 415) 1114 256.4 9.8e-68
NP_001271204 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform C [H ( 399) 1093 251.7 2.4e-66
NP_001121173 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1056 243.5 7.5e-64
NP_001121176 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1056 243.5 7.5e-64
XP_016876859 (OMIM: 107400,606963,613490) PREDICTE ( 418) 1056 243.5 7.5e-64
NP_001121174 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1056 243.5 7.5e-64
NP_000286 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1-ant ( 418) 1056 243.5 7.5e-64
NP_001002236 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1056 243.5 7.5e-64
NP_001002235 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1056 243.5 7.5e-64
NP_001121178 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1056 243.5 7.5e-64
NP_001121177 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1056 243.5 7.5e-64
NP_001121175 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1056 243.5 7.5e-64
NP_001121179 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1056 243.5 7.5e-64
NP_001121172 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1056 243.5 7.5e-64
NP_001076 (OMIM: 107280) alpha-1-antichymotrypsin ( 423) 1052 242.6 1.4e-63
NP_000615 (OMIM: 601841) plasma serine protease in ( 406) 1040 239.9 8.6e-63
XP_011535018 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 337) 1007 232.6 1.2e-60
XP_011535019 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 337) 1007 232.6 1.2e-60
NP_001747 (OMIM: 122500,611489) corticosteroid-bin ( 405) 966 223.5 7.6e-58
XP_005262237 (OMIM: 300932,314200) PREDICTED: thyr ( 371) 941 217.9 3.3e-56
XP_006724746 (OMIM: 300932,314200) PREDICTED: thyr ( 425) 941 218.0 3.7e-56
NP_006211 (OMIM: 107410) putative alpha-1-antitryp ( 421) 858 199.5 1.3e-50
NP_001271205 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform D [H ( 286) 806 187.9 2.8e-47
NP_001035983 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform B [H ( 335) 722 169.3 1.3e-41
NP_008850 (OMIM: 600517) serpin B3 [Homo sapiens] ( 390) 602 142.6 1.6e-33
NP_001284628 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 598 141.7 2.9e-33
NP_004559 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isoform ( 376) 598 141.7 2.9e-33
NP_001284629 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 598 141.7 2.9e-33
XP_011512976 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 376) 598 141.7 2.9e-33
XP_011512975 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 376) 598 141.7 2.9e-33
NP_001258753 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 598 141.7 2.9e-33
NP_001258754 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 598 141.7 2.9e-33
NP_001182220 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 380) 598 141.7 3e-33
XP_016866429 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 380) 598 141.7 3e-33
NP_001258751 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 390) 598 141.7 3e-33
NP_001258752 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 395) 598 141.7 3.1e-33
XP_011512974 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 454) 598 141.8 3.4e-33
XP_011524440 (OMIM: 600518) PREDICTED: serpin B4 i ( 390) 594 140.8 5.6e-33
NP_002965 (OMIM: 600518) serpin B4 isoform 1 [Homo ( 390) 594 140.8 5.6e-33
XP_005249241 (OMIM: 601799) PREDICTED: serpin B9 i ( 376) 583 138.4 2.9e-32
NP_004146 (OMIM: 601799) serpin B9 [Homo sapiens] ( 376) 583 138.4 2.9e-32
XP_005245255 (OMIM: 107300,613118) PREDICTED: anti ( 416) 576 136.9 9.5e-32
NP_000479 (OMIM: 107300,613118) antithrombin-III p ( 464) 576 136.9 1e-31
NP_057270 (OMIM: 605271) protein Z-dependent prote ( 444) 575 136.7 1.2e-31
>>XP_011535016 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 isofo (417 aa)
initn: 1086 init1: 1086 opt: 1157 Z-score: 1388.6 bits: 265.9 E(85289): 1.3e-70
Smith-Waterman score: 1157; 44.6% identity (76.0% similar) in 413 aa overlap (8-419:9-414)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MGPAWLWLLGTGILASVHCQPLLAHGDKSLQGPQPPRHQLSEPAPAYHRITPTITNFAL
:...:. : ..: .. .. :.: . : :: . .. :.::.
XP_011 MASYLYGVLFAVGLCAPIYC---VSPANAPSAYPRPSSTK-STPASQVYSLN---TDFAF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 RLYKELAADAPG-NIFFSPVSISTTLALLSLGAQANTSALILEGLGFNLTETPEADIHQG
:::..:. ..:. ::::::::.::.::.:::::.. :.. ::.:::::::.:::. ::::
XP_011 RLYRRLVLETPSQNIFFSPVSVSTSLAMLSLGAHSVTKTQILQGLGFNLTHTPESAIHQG
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 FRSLLHTLALPSPKLELKVGNSLFLDKRLKPRQHYLDSIKELYGAFAFSANFTDSVTTGR
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XP_011 FQHLVHSLTVPSKDLTLKMGSALFVKKELQLQANFLGNVKRLYEAEVFSTDFSNPSIAQA
120 130 140 150 160 170
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pF1KE0 QINDYLRRQTYGQVVDCLPEFSQDTFMVLANYIFFKAKWKHPFSRYQTQKQESFFVDERT
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XP_011 RINSHVKKKTQGKVVDIIQGLDLLTAMVLVNHIFFKAKWEKPFHPEYTRKNFPFLVGEQV
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SLQVPMMHQKEMHRFLYDQDLACTVLQIEYRGNALALLVLPDPGKMKQVEAALQPQTLRK
...::::::::. : : .: : :::..:.:.:.:..:::. :::.:.: ::. .::::
XP_011 TVHVPMMHQKEQFAFGVDTELNCFVLQMDYKGDAVAFFVLPSKGKMRQLEQALSARTLRK
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pF1KE0 WGQLLLPSLLDLHLPRFSISGTYNLEDILPQIGLTNILNLEADFSGVTGQLNKTISKVSH
:.. : ... .::::::..:::: :::..:. :... .:::::.. . . .::..:
XP_011 WSHSLQKRWIEVFIPRFSISASYNLETILPKMGIQNVFDKNADFSGIAKRDSLQVSKATH
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pF1KE0 KAMVDMSEKGTEAGAASGLLSQPPSLNTMSDPHAHFNRPFLLLLWEVTTQSLLFLGKVVN
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XP_011 KAVLDVSEEGTEATAATTTKFIVRSKDGPSYFTVSFNRTFLMMITNKATDGILFLGKVEN
360 370 380 390 400 410
420
pF1KE0 PVAG
:
XP_011 PTKS
>>XP_011535017 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 isofo (417 aa)
initn: 1086 init1: 1086 opt: 1157 Z-score: 1388.6 bits: 265.9 E(85289): 1.3e-70
Smith-Waterman score: 1157; 44.6% identity (76.0% similar) in 413 aa overlap (8-419:9-414)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MGPAWLWLLGTGILASVHCQPLLAHGDKSLQGPQPPRHQLSEPAPAYHRITPTITNFAL
:...:. : ..: .. .. :.: . : :: . .. :.::.
XP_011 MASYLYGVLFAVGLCAPIYC---VSPANAPSAYPRPSSTK-STPASQVYSLN---TDFAF
10 20 30 40 50
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pF1KE0 RLYKELAADAPG-NIFFSPVSISTTLALLSLGAQANTSALILEGLGFNLTETPEADIHQG
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XP_011 RLYRRLVLETPSQNIFFSPVSVSTSLAMLSLGAHSVTKTQILQGLGFNLTHTPESAIHQG
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 FRSLLHTLALPSPKLELKVGNSLFLDKRLKPRQHYLDSIKELYGAFAFSANFTDSVTTGR
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XP_011 FQHLVHSLTVPSKDLTLKMGSALFVKKELQLQANFLGNVKRLYEAEVFSTDFSNPSIAQA
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pF1KE0 QINDYLRRQTYGQVVDCLPEFSQDTFMVLANYIFFKAKWKHPFSRYQTQKQESFFVDERT
.::......: :.::: . .. : :::.:.:::::::..:: :.:. :.: :..
XP_011 RINSHVKKKTQGKVVDIIQGLDLLTAMVLVNHIFFKAKWEKPFHPEYTRKNFPFLVGEQV
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pF1KE0 SLQVPMMHQKEMHRFLYDQDLACTVLQIEYRGNALALLVLPDPGKMKQVEAALQPQTLRK
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XP_011 TVHVPMMHQKEQFAFGVDTELNCFVLQMDYKGDAVAFFVLPSKGKMRQLEQALSARTLRK
240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 WGQLLLPSLLDLHLPRFSISGTYNLEDILPQIGLTNILNLEADFSGVTGQLNKTISKVSH
:.. : ... .::::::..:::: :::..:. :... .:::::.. . . .::..:
XP_011 WSHSLQKRWIEVFIPRFSISASYNLETILPKMGIQNVFDKNADFSGIAKRDSLQVSKATH
300 310 320 330 340 350
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pF1KE0 KAMVDMSEKGTEAGAASGLLSQPPSLNTMSDPHAHFNRPFLLLLWEVTTQSLLFLGKVVN
::..:.::.:::: ::. : . : . ::: ::... . .:...:::::: :
XP_011 KAVLDVSEEGTEATAATTTKFIVRSKDGPSYFTVSFNRTFLMMITNKATDGILFLGKVEN
360 370 380 390 400 410
420
pF1KE0 PVAG
:
XP_011 PTKS
>>NP_783866 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform A [Homo sap (435 aa)
initn: 1086 init1: 1086 opt: 1157 Z-score: 1388.4 bits: 266.0 E(85289): 1.4e-70
Smith-Waterman score: 1157; 44.6% identity (76.0% similar) in 413 aa overlap (8-419:27-432)
10 20 30 40
pF1KE0 MGPAWLWLLGTGILASVHCQPLLAHGDKSLQGPQPPRHQLS
:...:. : ..: .. .. :.: . :
NP_783 MQGQGRRRGTCKDIFCSKMASYLYGVLFAVGLCAPIYC---VSPANAPSAYPRPSSTK-S
10 20 30 40 50
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pF1KE0 EPAPAYHRITPTITNFALRLYKELAADAPG-NIFFSPVSISTTLALLSLGAQANTSALIL
:: . .. :.::.:::..:. ..:. ::::::::.::.::.:::::.. :.. ::
NP_783 TPASQVYSLN---TDFAFRLYRRLVLETPSQNIFFSPVSVSTSLAMLSLGAHSVTKTQIL
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pF1KE0 EGLGFNLTETPEADIHQGFRSLLHTLALPSPKLELKVGNSLFLDKRLKPRQHYLDSIKEL
.:::::::.:::. :::::. :.:.:..:: : ::.:..::. :.:. . ..: ..:.:
NP_783 QGLGFNLTHTPESAIHQGFQHLVHSLTVPSKDLTLKMGSALFVKKELQLQANFLGNVKRL
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170 180 190 200 210 220
pF1KE0 YGAFAFSANFTDSVTTGRQINDYLRRQTYGQVVDCLPEFSQDTFMVLANYIFFKAKWKHP
: : .::..:.. . .::......: :.::: . .. : :::.:.:::::::..:
NP_783 YEAEVFSTDFSNPSIAQARINSHVKKKTQGKVVDIIQGLDLLTAMVLVNHIFFKAKWEKP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 FSRYQTQKQESFFVDERTSLQVPMMHQKEMHRFLYDQDLACTVLQIEYRGNALALLVLPD
: :.:. :.: :.....::::::::. : : .: : :::..:.:.:.:..:::.
NP_783 FHPEYTRKNFPFLVGEQVTVHVPMMHQKEQFAFGVDTELNCFVLQMDYKGDAVAFFVLPS
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pF1KE0 PGKMKQVEAALQPQTLRKWGQLLLPSLLDLHLPRFSISGTYNLEDILPQIGLTNILNLEA
:::.:.: ::. .:::::.. : ... .::::::..:::: :::..:. :... .:
NP_783 KGKMRQLEQALSARTLRKWSHSLQKRWIEVFIPRFSISASYNLETILPKMGIQNVFDKNA
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350 360 370 380 390 400
pF1KE0 DFSGVTGQLNKTISKVSHKAMVDMSEKGTEAGAASGLLSQPPSLNTMSDPHAHFNRPFLL
::::.. . . .::..:::..:.::.:::: ::. : . : . ::: ::.
NP_783 DFSGIAKRDSLQVSKATHKAVLDVSEEGTEATAATTTKFIVRSKDGPSYFTVSFNRTFLM
360 370 380 390 400 410
410 420
pF1KE0 LLWEVTTQSLLFLGKVVNPVAG
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NP_783 MITNKATDGILFLGKVENPTKS
420 430
>>NP_001275962 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 2 prec (427 aa)
initn: 1023 init1: 701 opt: 1154 Z-score: 1384.9 bits: 265.3 E(85289): 2.1e-70
Smith-Waterman score: 1154; 44.0% identity (76.4% similar) in 423 aa overlap (5-419:6-424)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MGPAWLWLLGTGILASVHCQPLLAH-GDKSLQGPQPPRHQLSEPAPAYHRITPTITNFA
.: :: .:.:: : : . : :.. .. . . .: .:. .:.:. ..::
NP_001 MHLIDYLLLLLVGLLALSHGQLHVEHDGESCSNSSHQQILETGEGSPSL-KIAPANADFA
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pF1KE0 LRLYKELAADAPG-NIFFSPVSISTTLALLSLGAQANTSALILEGLGFNLTETPEADIHQ
.:.: .:...:: ::::::.:::.. :.::::: ... . ::::::::::: :.:.:.
NP_001 FRFYYLIASETPGKNIFFSPLSISAAYAMLSLGACSHSRSQILEGLGFNLTELSESDVHR
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pF1KE0 GFRSLLHTLALPSPKLELKVGNSLFLDKRLKPRQHYLDSIKELYGAFAFSANFTDSVTTG
::. ::::: ::. :: .::..:::.. :: ..:.. .: : : .:: :.: :
NP_001 GFQHLLHTLNLPGHGLETRVGSALFLSHNLKFLAKFLNDTMAVYEAKLFHTNFYDTVGTI
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pF1KE0 RQINDYLRRQTYGQVVDCLPEFSQDTFMVLANYIFFKAKWKHPFSRYQTQKQESFFVDER
. :::.....: :..:: . :...:..:::.:::.::: :..:: .: .. :.:::
NP_001 QLINDHVKKETRGKIVDLVSELKKDVLMVLVNYIYFKALWEKPFISSRTTPKD-FYVDEN
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 TSLQVPMMHQ-KEMHRFLYDQDLACTVLQIEYRGNALALLVLPDPGKMKQVEAALQPQTL
:...:::: : .: : .:.:. : :.::...:.:.: ....::. :::...: .: :. :
NP_001 TTVRVPMMLQDQEHHWYLHDRYLPCSVLRMDYKGDATVFFILPNQGKMREIEEVLTPEML
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 RKWGQLL----LPSLLDLHLPRFSISGTYNLEDILPQIGLTNILNLEADFSGVTGQLNKT
.:..:: . . :.::::.:::::.: :..:::..:.:.... ::.::.: : .
NP_001 MRWNNLLRKRNFYKKLELHLPKFSISGSYVLDQILPRLGFTDLFSKWADLSGITKQQKLE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
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:: ::: .:..: ::::.::... . ...... : .::::::.... ..:::.:
NP_001 ASKSFHKATLDVDEAGTEAAAATSFAIK--FFSAQTNRHILRFNRPFLVVIFSTSTQSVL
360 370 380 390 400 410
420
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::::::.:
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420
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10 20 30 40 50
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.: :: .:.:: : : . : :.. .. . . .: .:. .:.:. ..::
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.:.: .:...:: ::::::.:::.. :.::::: ... . ::::::::::: :.:.:.
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::. ::::: ::. :: .::..:::.. :: ..:.. .: : : .:: :.: :
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. :::.....: :..:: . :...:..:::.:::.::: :..:: .: .. :.:::
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:...:::: : .: : .:.:. : :.::...:.:.: ....::. :::...: .: :. :
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.:..:: . . :.::::.:::::.: :..:::..:.:.... ::.::.: : .
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:: ::: .:..: ::::.::... . ...... : .::::::.... ..:::.:
NP_006 ASKSFHKATLDVDEAGTEAAAATSFAIK--FFSAQTNRHILRFNRPFLVVIFSTSTQSVL
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::::::.:
NP_006 FLGKVVDPTKP
420
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10 20 30
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.: :: .:.:: : : . : :.. ..
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40 50 60 70 80 90
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. . .: .:. .:.:. ..::.:.: .:...:: ::::::.:::.. :.:::::
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... . ::::::::::: :.:.:.::. ::::: ::. :: .::..:::.. :: .
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.:.. .: : : .:: :.: : . :::.....: :..:: . :...:..:::.:::.
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::: :..:: .: .. :.::: :...:::: : .: : .:.:. : :.::...:.:.
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: ....::. :::...: .: :. : .:..:: . . :.::::.:::::.: :..::
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:..:.:.... ::.::.: : . :: ::: .:..: ::::.::... . ....
NP_001 PRLGFTDLFSKWADLSGITKQQKLEASKSFHKATLDVDEAGTEAAAATSFAIK--FFSAQ
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NP_001 TNRHILRFNRPFLVVIFSTSTQSVLFLGKVVDPTKP
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:. :. .: .:. .:::..::.::. :.::: ..:...: :: . .::..:.. .. .
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.::.... :: :.:: . ... .:.:::.::: :::.: .::. .:. . ::..:. :
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..::::::: :.. : :..: :::::..: :::::.::: :.:..::::.. .::.:
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:..:: . .:: .:.::::.::.: : ..:. . . .:::::.: . . .:...:
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::.. ..::::::.:. . ::. : ::. : ...: :.::. : .:.:.:::::::
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::
NP_000 NPTEA
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. ..: ..:.:: : .::..:.. . .::......: :.::: . .. : :::.
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NP_001 NHIFFKAKWEKPFHPEYTRKNFPFLVGEQVTVHVPMMHQKEQFAFGVDTELNCFVLQMDY
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NP_001 KGDAVAFFVLPSKGKMRQLEQALSARTLRKWSHSLQKRWIEVFIPRFSISASYNLETILP
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..:. :... .:::::.. . . .::..:::..:.::.:::: ::. : . :
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pF1KE0 DPHAHFNRPFLLLLWEVTTQSLLFLGKVVNPVAG
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NP_001 YFTVSFNRTFLMMITNKATDGILFLGKVENPTKS
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. ::..:: .. . :::::::::.:..:.::::..:.: :::::.::::: :::.::.
NP_001 FSLYRQLAHQSNSTNIFFSPVSIATAFAMLSLGTKADTHDEILEGLNFNLTEIPEAQIHE
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NP_001 KQINDYVEKGTQGKIVDLVKELDRDTVFALVNYIFFKGKWERPFEVKDTE-EEDFHVDQV
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:...::::.. : . . . :. :: ..: ::: :.. ::: ::....: : . .
NP_001 TTVKVPMMKRLGMFNIQHCKKLSSWVLLMKYLGNATAIFFLPDEGKLQHLENELTHDIIT
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:. . .::::..::.:::.:...: :.:.:.... ::.:::: . .::.
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::
NP_001 NPTQK
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NP_001 FSLYRQLAHQSNSTNIFFSPVSIATAFAMLSLGTKADTHDEILEGLNFNLTEIPEAQIHE
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NP_001 KQINDYVEKGTQGKIVDLVKELDRDTVFALVNYIFFKGKWERPFEVKDTE-EEDFHVDQV
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NP_001 TTVKVPMMKRLGMFNIQHCKKLSSWVLLMKYLGNATAIFFLPDEGKLQHLENELTHDIIT
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:. . .::::..::.:::.:...: :.:.:.... ::.:::: . .::.
NP_001 KFLENEDRRSASLHLPKLSITGTYDLKSVLGQLGITKVFSNGADLSGVTEEAPLKLSKAV
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NP_001 HKAVLTIDEKGTEAAGAMFLEAIPMSI----PPEVKFNKPFVFLMIEQNTKSPLFMGKVV
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::
NP_001 NPTQK
422 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 12:00:18 2016 done: Sat Nov 5 12:00:19 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]