Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0282
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0282, 432 aa
1>>>pF1KE0282 432 - 432 aa - 432 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2357+/-0.00131; mu= -6.9673+/- 0.079
mean_var=507.7585+/-101.290, 0's: 0 Z-trim(112.3): 137 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.056917
statistics sampled from 12936 (13049) to 12936 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.704), E-opt: 0.2 (0.401), width: 16
Scan time: 3.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11573.1 LUC7L3 gene_id:51747|Hs108|chr17 ( 432) 2810 245.4 8.3e-65
CCDS82158.1 LUC7L3 gene_id:51747|Hs108|chr17 ( 489) 2770 242.2 8.7e-64
CCDS43656.1 LUC7L2 gene_id:51631|Hs108|chr7 ( 392) 849 84.3 2.3e-16
CCDS59085.1 LUC7L2 gene_id:51631|Hs108|chr7 ( 389) 824 82.2 9.6e-16
CCDS59510.1 LUC7L2 gene_id:51631|Hs108|chr7 ( 391) 819 81.8 1.3e-15
CCDS59084.1 LUC7L2 gene_id:100996928|Hs108|chr7 ( 458) 819 81.9 1.4e-15
CCDS32348.1 LUC7L gene_id:55692|Hs108|chr16 ( 371) 736 75.0 1.4e-13
CCDS10401.1 LUC7L gene_id:55692|Hs108|chr16 ( 325) 708 72.6 6.3e-13
>>CCDS11573.1 LUC7L3 gene_id:51747|Hs108|chr17 (432 aa)
initn: 2810 init1: 2810 opt: 2810 Z-score: 1277.0 bits: 245.4 E(32554): 8.3e-65
Smith-Waterman score: 2810; 100.0% identity (100.0% similar) in 432 aa overlap (1-432:1-432)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MISAAQLLDELMGRDRNLAPDEKRSNVRWDHESVCKYYLCGFCPAELFTNTRSDLGPCEK
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CCDS11 MISAAQLLDELMGRDRNLAPDEKRSNVRWDHESVCKYYLCGFCPAELFTNTRSDLGPCEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 IHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 PTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 PDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHS
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CCDS11 PDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 SRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 YKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSGSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSGSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTS
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE0 EDIKSEGDTQSN
::::::::::::
CCDS11 EDIKSEGDTQSN
430
>>CCDS82158.1 LUC7L3 gene_id:51747|Hs108|chr17 (489 aa)
initn: 2770 init1: 2770 opt: 2770 Z-score: 1258.6 bits: 242.2 E(32554): 8.7e-64
Smith-Waterman score: 2770; 100.0% identity (100.0% similar) in 426 aa overlap (1-426:1-426)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MISAAQLLDELMGRDRNLAPDEKRSNVRWDHESVCKYYLCGFCPAELFTNTRSDLGPCEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MISAAQLLDELMGRDRNLAPDEKRSNVRWDHESVCKYYLCGFCPAELFTNTRSDLGPCEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 IHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 PTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 PDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHS
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CCDS82 PDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 SRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 YKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSGSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 YKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSGSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTS
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE0 EDIKSEGDTQSN
::::::
CCDS82 EDIKSEVQRKYAQMKMELSRVRRHTKASSEGKDSVVLQNILRYIVLSQLFCSRLVPPLVC
430 440 450 460 470 480
>>CCDS43656.1 LUC7L2 gene_id:51631|Hs108|chr7 (392 aa)
initn: 809 init1: 361 opt: 849 Z-score: 407.2 bits: 84.3 E(32554): 2.3e-16
Smith-Waterman score: 849; 37.7% identity (71.6% similar) in 387 aa overlap (7-390:10-384)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MISAAQLLDELMGRDRNLAPDEKRSNVRWDHESVCKYYLCGFCPAELFTNTRSDLGP
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CCDS43 MSAQAQMRAMLDQLMGTSRD--GDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSGTRMDLGE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 CEKIHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSG
: :.:: :: .:: .:. . .: : . .:::..:. .:: . .. ::: .:.. :.
CCDS43 CLKVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEEISAE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 AAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLK-EERELLRSTT
.:. . :... :...: :: ..:.::.::.:::.: .: ::. . ..:: .
CCDS43 VAAKA----ERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 STIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRK
... . . :.....:::::.:.: . : . :. ::. :: :.:. .:. .::::. . .
CCDS43 NSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RTEEPDRDERLKK-EKQEREEREK-EREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSR
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CCDS43 KQEKRNQ-ERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSMSRERKRRTR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 SRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSK
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CCDS43 SKSREKRH---RHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSS-KERFRDQDLA-SC
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 SRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSGSREKQSEDTNTESKESDTKN
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CCDS43 DRDRSSRDRSPRDRDRKDKKRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI
350 360 370 380 390
420 430
pF1KE0 EVNGTSEDIKSEGDTQSN
>>CCDS59085.1 LUC7L2 gene_id:51631|Hs108|chr7 (389 aa)
initn: 809 init1: 361 opt: 824 Z-score: 396.2 bits: 82.2 E(32554): 9.6e-16
Smith-Waterman score: 824; 36.6% identity (71.2% similar) in 393 aa overlap (1-390:1-381)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MISAAQLLDELMGRDRNLAPDEKRSNVRWDHESVCKYYLCGFCPAELFTNTRSDLGPCEK
:. .:: ...: .. .. : :. .... . ::: .: . :: .....:: ::: : :
CCDS59 MVIHSQL-KKIQGASERMG-DTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSGTRMDLGECLK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 IHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAG
.:: :: .:: .:. . .: : . .:::..:. .:: . .. ::: .:.. :. .:.
CCDS59 VHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEEISAEVAA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE0 PTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLK-EERELLRSTTSTI
. :... :...: :: ..:.::.::.:::.: .: ::. . ..:: . ...
CCDS59 KA----ERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYRNSM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTE
. . :.....:::::.:.: . : . :. ::. :: :.:. .:. .::::. . .. :
CCDS59 PASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAEKQE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 EPDRDERLKK-EKQEREEREK-EREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRS
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CCDS59 KRNQ-ERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSMSRERKRRTRSKS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 RHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRD
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CCDS59 REKRH---RHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSS-KERFRDQDLA-SCDRD
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 RKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSGSREKQSEDTNTESKESDTKNEVN
:.: . ..:::.. ..: :. . :.:..::
CCDS59 RSSRDRSPRDRDRKDKKRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI
350 360 370 380
420 430
pF1KE0 GTSEDIKSEGDTQSN
>>CCDS59510.1 LUC7L2 gene_id:51631|Hs108|chr7 (391 aa)
initn: 809 init1: 361 opt: 819 Z-score: 393.9 bits: 81.8 E(32554): 1.3e-15
Smith-Waterman score: 819; 37.5% identity (71.6% similar) in 373 aa overlap (21-390:21-383)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MISAAQLLDELMGRDRNLAPDEKRSNVRWDHESVCKYYLCGFCPAELFTNTRSDLGPCEK
: :. .... . ::: .: . :: .....:: ::: : :
CCDS59 MPAYLNLQGSVRKAPHSPSRDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSGTRMDLGECLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 IHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAG
.:: :: .:: .:. . .: : . .:::..:. .:: . .. ::: .:.. :. .:.
CCDS59 VHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEEISAEVAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE0 PTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLK-EERELLRSTTSTI
. :... :...: :: ..:.::.::.:::.: .: ::. . ..:: . ...
CCDS59 KA----ERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYRNSM
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTE
. . :.....:::::.:.: . : . :. ::. :: :.:. .:. .::::. . .. :
CCDS59 PASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAEKQE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 EPDRDERLKK-EKQEREEREK-EREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRS
. .. ::::. :..::::::: .: : . . .. : .:..:.. :. .:::..:.::.:
CCDS59 KRNQ-ERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSMSRERKRRTRSKS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 RHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRD
:.. . :. ::: ...::::..: : :::: : ::. :: :.: :..: : .::
CCDS59 REKRH---RHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSS-KERFRDQDLA-SCDRD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 RKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSGSREKQSEDTNTESKESDTKNEVN
:.: . ..:::.. ..: :. . :.:..::
CCDS59 RSSRDRSPRDRDRKDKKRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI
360 370 380 390
420 430
pF1KE0 GTSEDIKSEGDTQSN
>>CCDS59084.1 LUC7L2 gene_id:100996928|Hs108|chr7 (458 aa)
initn: 809 init1: 361 opt: 819 Z-score: 393.1 bits: 81.9 E(32554): 1.4e-15
Smith-Waterman score: 819; 37.5% identity (71.6% similar) in 373 aa overlap (21-390:88-450)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MISAAQLLDELMGRDRNLAPDEKRSNVRWDHESVCKYYLCGFCPAELFTN
: :. .... . ::: .: . :: .....
CCDS59 ELHFQAATYLCLLRSIRKHVALHQEFHGKGDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSG
60 70 80 90 100 110
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TRSDLGPCEKIHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALS
:: ::: : :.:: :: .:: .:. . .: : . .:::..:. .:: . .. ::: .
CCDS59 TRMDLGECLKVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAET
120 130 140 150 160 170
120 130 140 150 160
pF1KE0 QNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLK-EER
:.. :. .:. . :... :...: :: ..:.::.::.:::.: .: ::. . ..:
CCDS59 QEEISAEVAAKA----ERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKR
180 190 200 210 220 230
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 ELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEE
: . ... . . :.....:::::.:.: . : . :. ::. :: :.:. .:. .::
CCDS59 EAEEVYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEE
240 250 260 270 280 290
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 LKEKLRKRTEEPDRDERLKK-EKQEREEREK-EREREREERERKRRREEEEREKERARDR
::. . .. :. .. ::::. :..::::::: .: : . . .. : .:..:.. :. .:
CCDS59 LKRVVAEKQEKRNQ-ERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSMSR
300 310 320 330 340 350
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 ERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRS
::..:.::.::.. . :. ::: ...::::..: : :::: : ::. :: :.: :.
CCDS59 ERKRRTRSKSREKRH---RHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSS-KERFRD
360 370 380 390 400
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 RDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSGSREKQSEDTNTES
.: : .:::.: . ..:::.. ..: :. . :.:..::
CCDS59 QDLA-SCDRDRSSRDRSPRDRDRKDKKRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI
410 420 430 440 450
410 420 430
pF1KE0 KESDTKNEVNGTSEDIKSEGDTQSN
>>CCDS32348.1 LUC7L gene_id:55692|Hs108|chr16 (371 aa)
initn: 740 init1: 346 opt: 736 Z-score: 357.3 bits: 75.0 E(32554): 1.4e-13
Smith-Waterman score: 748; 36.0% identity (68.3% similar) in 375 aa overlap (7-380:10-367)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MISAAQLLDELMGRDRNLAPDEKRSNVRWDHESVCKYYLCGFCPAELFTNTRSDLGP
:::.::: :. :: :. :.. . ::: .: :: .....:: :::
CCDS32 MSAQAQMRALLDQLMGTARD--GDETRQRVKFTDDRVCKSHLLDCCPHDILAGTRMDLGE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
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