FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0283, 323 aa
1>>>pF1KE0283 323 - 323 aa - 323 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5262+/-0.00122; mu= 14.3660+/- 0.071
mean_var=144.3168+/-50.198, 0's: 0 Z-trim(102.7): 402 B-trim: 823 in 2/46
Lambda= 0.106762
statistics sampled from 6525 (7050) to 6525 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.565), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16
Scan time: 2.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 2119 339.0 3.1e-93
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 2106 337.0 1.3e-92
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 1459 237.3 1.2e-62
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 1425 232.1 5.1e-61
CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 ( 315) 1364 222.7 3.1e-58
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 ( 315) 1363 222.5 3.5e-58
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 ( 308) 1353 220.9 1e-57
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 1333 217.9 8.5e-57
CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 ( 348) 1318 215.6 4.5e-56
CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1 ( 318) 1280 209.7 2.5e-54
CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1 ( 318) 1256 206.0 3.2e-53
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 1168 192.5 4e-49
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 ( 311) 1161 191.4 8e-49
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 1161 191.4 8.1e-49
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 1150 189.7 2.6e-48
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 1149 189.5 2.9e-48
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 1144 188.8 4.9e-48
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 1140 188.1 7.5e-48
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 1136 187.5 1.2e-47
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 1136 187.5 1.2e-47
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 1130 186.6 2.2e-47
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 1082 179.3 3.8e-45
CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19 ( 314) 1079 178.8 5.1e-45
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 1070 177.4 1.3e-44
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 1058 175.5 4.8e-44
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 1056 175.2 6e-44
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 1037 172.3 4.5e-43
CCDS31414.1 OR2AG1 gene_id:144125|Hs108|chr11 ( 316) 1036 172.1 5e-43
CCDS1637.1 OR2L13 gene_id:284521|Hs108|chr1 ( 312) 995 165.8 4e-41
CCDS34696.1 OR2AE1 gene_id:81392|Hs108|chr7 ( 323) 990 165.1 6.9e-41
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 950 158.9 4.9e-39
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 941 157.5 1.3e-38
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 940 157.3 1.4e-38
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 940 157.3 1.4e-38
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 936 156.7 2.2e-38
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 919 154.1 1.3e-37
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 917 153.8 1.7e-37
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 915 153.5 2e-37
CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 913 153.2 2.5e-37
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 913 153.2 2.6e-37
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 911 152.9 3.2e-37
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 909 152.6 3.9e-37
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 908 152.4 4.4e-37
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 906 152.1 5.3e-37
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 906 152.1 5.5e-37
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 903 151.6 7.3e-37
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 902 151.6 8.7e-37
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 901 151.3 9.1e-37
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 900 151.3 1.1e-36
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 897 150.7 1.4e-36
>>CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 (323 aa)
initn: 2119 init1: 2119 opt: 2119 Z-score: 1787.3 bits: 339.0 E(32554): 3.1e-93
Smith-Waterman score: 2119; 100.0% identity (100.0% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAVVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAVVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFYLTLIGGEFFLLGLMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFYLTLIGGEFFLLGLMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFFCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAFAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAFAT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVAAA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE0 LRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
:::::::::::::::::::::::
CCDS31 LRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
310 320
>>CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 (324 aa)
initn: 1463 init1: 1463 opt: 2106 Z-score: 1776.5 bits: 337.0 E(32554): 1.3e-92
Smith-Waterman score: 2106; 99.4% identity (99.7% similar) in 324 aa overlap (1-323:1-324)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAVVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTPM
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAIVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE0 YFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIF-YLTLIGGEFFLLGLMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS31 YFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFLYLTLIGGEFFLLGLMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 EIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAFA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVAA
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE0 ALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
310 320
>>CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 (317 aa)
initn: 1513 init1: 1129 opt: 1459 Z-score: 1238.0 bits: 237.3 E(32554): 1.2e-62
Smith-Waterman score: 1459; 69.1% identity (90.5% similar) in 304 aa overlap (12-314:11-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAVVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTPM
.:.: ::... :: ::::... .:...:..:.: :.:::.::::::::
CCDS31 MEQSNYSVYADFILLGLFSNARFPWLLFALILLVFLTSIASNVVKIILIHIDSRLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 YFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIF-YLTLIGGEFFLLGLMA
::::::::. : .:: ::::: : . ....::: ::..: : :::: :.::::::::.
CCDS31 YFLLSQLSLRDILYISTIVPKMLVDQVMSQRAISFAGCTAQHFLYLTLAGAEFFLLGLMS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFFC
::::::.::::.::.::.:..: ..:...:.:::.:::.::::::.:::: :::::::::
CCDS31 YDRYVAICNPLHYPVLMSRKICWLIVAAAWLGGSIDGFLLTPVTMQFPFCASREINHFFC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 EIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAFA
:.::.::::::::: ::: ::.::..:::::.:::: :::.::.::.::. :::: :: :
CCDS31 EVPALLKLSCTDTSAYETAMYVCCIMMLLIPFSVISGSYTRILITVYRMSEAEGRGKAVA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVAA
:::::..:::.:::::.:: ::::::::::.::.::::::::::::::::::::::::..
CCDS31 TCSSHMVVVSLFYGAAMYTYVLPHSYHTPEQDKAVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVTG
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE0 ALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
::.::.::: :: ..
CCDS31 ALQKVVGRCVSSGKVTTF
300 310
>>CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 (369 aa)
initn: 1114 init1: 1114 opt: 1425 Z-score: 1209.0 bits: 232.1 E(32554): 5.1e-61
Smith-Waterman score: 1425; 66.8% identity (86.9% similar) in 313 aa overlap (3-314:52-364)
10 20 30
pF1KE0 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAVV
:: .::.:.. ::... ::.::..
CCDS31 INSHVVILLPWECYHLIWKILPYIGTTVGSMEEYNTSSTDFTFMGLFNRKETSGLIFAII
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 FSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTPMYFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKT
:: .:. :: :::.::. : :::::::::::.::..: .:: ::::: . : ..:
CCDS31 SIIFFTALMANGVMIFLIQTDLRLHTPMYFLLSHLSLIDMMYISTIVPKMLVNYLLDQRT
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 ISFLGCAVQIF-YLTLIGGEFFLLGLMAYDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVG
:::.::..: : ::::.:.:::::::::::::::.:::::::.::.:::: ....::: :
CCDS31 ISFVGCTAQHFLYLTLVGAEFFLLGLMAYDRYVAICNPLRYPVLMSRRVCWMIIAGSWFG
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 GSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFFCEIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPL
::::::.:::.::::::: :::::::::: ::::::.:.::.::::.::.:::::::::.
CCDS31 GSLDGFLLTPITMSFPFCNSREINHFFCEAPAVLKLACADTALYETVMYVCCVLMLLIPF
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 SVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAFATCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKD
::. .::..:: ::. :.:.:::.:::::::::. :::.:::::.:: .:::::: : .:
CCDS31 SVVLASYARILTTVQCMSSVEGRKKAFATCSSHMTVVSLFYGAAMYTYMLPHSYHKPAQD
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320
pF1KE0 KVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVAAALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
::.:.:::::::::::::::::::::..::...::: . : .
CCDS31 KVLSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVTGALKRALGRFKGPQRVSGGVF
330 340 350 360
>>CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 (315 aa)
initn: 1403 init1: 1077 opt: 1364 Z-score: 1158.9 bits: 222.7 E(32554): 3.1e-58
Smith-Waterman score: 1364; 67.8% identity (85.4% similar) in 295 aa overlap (12-305:15-309)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAVVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLH
.:.: ::. . :.:: .:.: .:. :...: :.::::: :..::
CCDS55 MANITRMANHTGRLDFILMGLFRQSKHPALLSVVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHLH
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TPMYFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIF-YLTLIGGEFFLLG
.::::..::::.:: :: .:::::: : . . .: :..:.: :::: :.:::::.
CCDS55 SPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLLA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LMAYDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINH
::::::::.:.:::::.:::.:::::.. : : ::.:::::::.::::::::: ::.:
CCDS55 TMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLASGCWFLGSVDGFMLTPITMSFPFCRSWEIHH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 FFCEIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRK
::::.::: :::.:::::::::: :::::::::...:: :: ::::::::::::::.:
CCDS55 FFCEVPAVTILSCSDTSLYETLMYLCCVLMLLIPVTIISSSYLLILLTVHRMNSAEGRKK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 AFATCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKD
::::::::. :: .::::: :: .:: :::::::: .::.:::::::.::::::::::::
CCDS55 AFATCSSHLTVVILFYGAAVYTYMLPSSYHTPEKDMMVSVFYTILTPVLNPLIYSLRNKD
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE0 VAAALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
: .::.:.:
CCDS55 VMGALKKMLTVRFVL
310
>>CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 (315 aa)
initn: 1402 init1: 1077 opt: 1363 Z-score: 1158.1 bits: 222.5 E(32554): 3.5e-58
Smith-Waterman score: 1363; 67.8% identity (85.4% similar) in 295 aa overlap (12-305:15-309)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAVVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLH
.:.: ::. . :.:: .:.: .:. :...: :.::::: :..::
CCDS31 MANITRMANHTGKLDFILMGLFRRSKHPALLSVVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHLH
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TPMYFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIF-YLTLIGGEFFLLG
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CCDS31 SPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLLA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LMAYDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINH
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CCDS31 TMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLASGCWFLGSVDGFMLTPITMSFPFCRSWEIHH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 FFCEIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRK
::::.::: :::.:::::::::: :::::::::...:: :: ::::::::::::::.:
CCDS31 FFCEVPAVTILSCSDTSLYETLMYLCCVLMLLIPVTIISSSYLLILLTVHRMNSAEGRKK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 AFATCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKD
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CCDS31 AFATCSSHLTVVILFYGAAVYTYMLPSSYHTPEKDMMVSVFYTILTPVLNPLIYSLRNKD
250 260 270 280 290 300
300 310 320
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: .::.:.:
CCDS31 VMGALKKMLTVRFVL
310
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10 20 30 40 50 60
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CCDS31 MNENNETLTRGFTLMGLFTHNKCSGFFFGVICAVFFMAMIANGVMIFLINIDPHLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 YFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIF-YLTLIGGEFFLLGLMA
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CCDS31 YFLLSHLSVIDTLYISTIVPKMLVDYLMGEGTISFIACTAQCFLYMGFMGAEFFLLGLMA
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CCDS31 YDRYVAICNPLRYPVLISWRVCWMILASSWFGGALDSFLLTPITMSLPFCASHQINHFFC
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: :..:.:.: : . :::.::.::: :::::.::...:::.::.:::.:.:::::.::::
CCDS31 EAPTMLRLACGDKTTYETVMYVCCVAMLLIPFSVVTASYTRILITVHQMTSAEGRKKAFA
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CCDS31 TCSSHMMVVTLFYGAALYTYTLPQSYHTPIKDKVFSAFYTILTPLLNPLIYSLRNRDVMG
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE0 ALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
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CCDS31 ALKRVVARC
300
>>CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 (312 aa)
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10 20 30 40 50 60
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CCDS31 MRLANQTLGGDFFLLGIFSQISHPGRLCLLIFSIFLMAVSWNITLILLIHIDSSLHTPM
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pF1KE0 YFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQI-FYLTLIGGEFFLLGLMA
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CCDS31 YFFINQLSLIDLTYISVTVPKMLVNQLAKDKTISVLGCGTQMYFYLQLGGAECCLLAAMA
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pF1KE0 YDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFFC
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CCDS31 YDRYVAICHPLRYSVLMSHRVCLLLASGCWFVGSVDGFMLTPIAMSFPFCRSHEIQHFFC
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pF1KE0 EIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAFA
:.::::::::.:::::. .:: :::.:::::..:::::: .:.::.:.:::.:::.:::.
CCDS31 EVPAVLKLSCSDTSLYKIFMYLCCVIMLLIPVTVISVSYYYIILTIHKMNSVEGRKKAFT
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pF1KE0 TCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVAA
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CCDS31 TCSSHITVVSLFYGAAIYNYMLPSSYQTPEKDMMSSFFYTILTPVLNPIIYSFRNKDVTR
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE0 ALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
::.:.:
CCDS31 ALKKMLSVQKPPY
300 310
>>CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 (348 aa)
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10 20 30 40
pF1KE0 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAVVFSIFVVAI
..:.: ::. . :.:: .:.: .:..:.
CCDS31 GWSDFILMGLFRQSKHPMANITWMANHTGWSDFILLGLFRQSKHPALLCVVIFVVFLMAL
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 TANLVMILLIHMDSRLHTPMYFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAV
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CCDS31 SGNAVLILLIHCDAHLHTPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKISAPECGM
80 90 100 110 120 130
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pF1KE0 QIF-YLTLIGGEFFLLGLMAYDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFML
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CCDS31 QMFFYVTLAGSEFFLLATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLSSGCWFLGSVDGFTF
140 150 160 170 180 190
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CCDS31 TPITMTFPFRGSREIHHFFCEVPAVLNLSCSDTSLYEIFMYLCCVLMLLIPVVIISSSYL
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CCDS31 LILLTIHGMNSAEGRKKAFATCSSHLTVVILFYGAAIYTYMLPSSYHTPEKDMMVSVFYT
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CCDS31 ILTPVVNPLIYSLRNKDVMGALKKMLTVEPAFQKAME
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CCDS31 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRL
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CCDS31 HTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISPSGCGIQMFFYLTLAGAEVFLL
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pF1KE0 GLMAYDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREIN
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CCDS31 AAMAYDRYAAVCRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWVLGMVDGLLLTPITMSFPFCQSRKIL
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pF1KE0 HFFCEIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRR
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CCDS31 SFFCETPALLKLSCSDVSLYKTLMYLCCILMLLAPIMVISSSYTLILHLIHRMNSAAGHR
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pF1KE0 KAFATCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNK
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CCDS31 DVTRALRSMMQSRMNQEK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]