Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0288
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0288, 313 aa
1>>>pF1KE0288 313 - 313 aa - 313 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7516+/-0.00109; mu= 13.2537+/- 0.063
mean_var=161.6336+/-54.592, 0's: 0 Z-trim(103.7): 404 B-trim: 414 in 1/49
Lambda= 0.100881
statistics sampled from 7056 (7550) to 7056 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.232), width: 16
Scan time: 2.210
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32046.1 OR10G3 gene_id:26533|Hs108|chr14 ( 313) 2061 312.7 2.3e-85
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 1539 236.8 1.7e-62
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 1175 183.8 1.5e-46
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 1153 180.6 1.4e-45
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 1140 178.7 5.1e-45
CCDS31701.1 OR10S1 gene_id:219873|Hs108|chr11 ( 331) 1079 169.9 2.5e-42
CCDS31704.1 OR10G8 gene_id:219869|Hs108|chr11 ( 311) 1067 168.1 8.1e-42
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 993 157.3 1.4e-38
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 976 154.8 7.9e-38
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 962 152.8 3.2e-37
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 948 150.8 1.3e-36
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 929 148.0 9e-36
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 927 147.7 1.1e-35
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 927 147.7 1.1e-35
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 916 146.1 3.3e-35
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 911 145.5 6.1e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 897 143.3 2.3e-34
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 892 142.6 3.7e-34
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 888 142.0 5.6e-34
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 886 141.7 6.9e-34
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 885 141.6 7.5e-34
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 880 140.8 1.2e-33
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 878 140.6 1.6e-33
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 876 140.3 1.9e-33
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 875 140.1 2.1e-33
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 871 139.5 3.1e-33
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 870 139.4 3.4e-33
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 869 139.2 3.8e-33
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 867 138.9 4.6e-33
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 863 138.4 7e-33
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 861 138.1 8.7e-33
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 860 137.9 9.5e-33
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 859 137.8 1e-32
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 858 137.6 1.1e-32
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 858 137.7 1.2e-32
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 858 137.7 1.2e-32
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 856 137.4 1.4e-32
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 856 137.4 1.4e-32
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 854 137.1 1.7e-32
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 854 137.1 1.8e-32
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 853 136.9 1.9e-32
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 851 136.6 2.4e-32
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 850 136.5 2.6e-32
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 849 136.4 3e-32
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 848 136.2 3.2e-32
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 848 136.3 3.5e-32
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 845 135.8 4.3e-32
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 844 135.6 4.7e-32
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 844 135.6 4.8e-32
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 844 135.6 4.8e-32
>>CCDS32046.1 OR10G3 gene_id:26533|Hs108|chr14 (313 aa)
initn: 2061 init1: 2061 opt: 2061 Z-score: 1646.1 bits: 312.7 E(32554): 2.3e-85
Smith-Waterman score: 2061; 100.0% identity (100.0% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPLDGAAALVPTAITPFLNPLIYTLRNQEVKLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPLDGAAALVPTAITPFLNPLIYTLRNQEVKLAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 KRMLRSPRTPSEV
:::::::::::::
CCDS32 KRMLRSPRTPSEV
310
>>CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 (310 aa)
initn: 1557 init1: 1534 opt: 1539 Z-score: 1235.5 bits: 236.8 E(32554): 1.7e-62
Smith-Waterman score: 1539; 75.3% identity (91.9% similar) in 296 aa overlap (8-303:12-307)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLH
..: ::: :. .: ::.:.:. ::.:::::::::::::.:.::::.:
CCDS32 MGKTKNTSLDAVVTDFILLGLSHPPNLRSLLFLVFFIIYILTQLGNLLILLTMWADPKLC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 ARPMYIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLY
::::::.::::: .:: .::. :: :...:: ..: ::::::::::::.:::::::::::
CCDS32 ARPMYILLGVLSFLDMWLSSVTVPLLILDFTPSIKAIPFGGCVAQLYFFHFLGSTQCFLY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 TLMAYDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVD
:::::::::::::::::::::...: ..::::::.:::.::..:: ::::::::::::::
CCDS32 TLMAYDRYLAICQPLRYPVLMNGRLCTVLVAGAWVAGSMHGSIQATLTFRLPYCGPNQVD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 YFFCDIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRR
::.::::::::::::::::::::::::.:::.:::: :::::: .:..:::.:.:.::::
CCDS32 YFICDIPAVLRLACADTTVNELVTFVDVGVVAASCFMLILLSYANIVNAILKIRTTDGRR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RAFSTCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPLDGAAALVPTAITPFLNPLIYTLRNQEV
:::::::.:. ::::::::: ::::: ...:::::::. :..::.:::::::::::::
CCDS32 RAFSTCGSHLIVVTVYYVPCIFIYLRAGSKDPLDGAAAVFYTVVTPLLNPLIYTLRNQEV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 KLALKRMLRSPRTPSEV
: ::::.
CCDS32 KSALKRITAG
310
>>CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1179 init1: 1073 opt: 1175 Z-score: 949.2 bits: 183.8 E(32554): 1.5e-46
Smith-Waterman score: 1175; 55.3% identity (85.0% similar) in 300 aa overlap (5-303:3-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARPM
:..:.:::::::.:. : .:.: .:...:.:: :::::::... .: .::. ::
CCDS31 MSNASLVTAFILTGLPHAPGLDALLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHT-PM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 YIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNF-TLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLM
: :: :: ::: .:.. ::...:.. . . . : : .:::::::.::::::.:::::.:
CCDS31 YYFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRAISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 AYDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFF
.::::::: :::: .:... :::..:.:..::.:.:.:.::::.::::::::....:
CCDS31 SYDRYLAISYPLRYTSMMSGSRCALLATGTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 CDIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRAF
:: : .:.::::::..: .: :::::.:...:: ::.:::..:. .::::.:.:::::::
CCDS31 CDAPPILKLACADTSANVMVIFVDIGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSDGRRRAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 STCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPLDGAAALVPTAITPFLNPLIYTLRNQEVKLA
.::..: :: ..:::. ::::: . . .::..:. :..::.:::..:::::.::: :
CCDS31 QTCASHCIVVLCFFVPCVVIYLRPGSMDAMDGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVKKA
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 LKRMLRSPRTPSEV
. ..
CCDS31 VLKLRDKVAHPQRK
300 310
>>CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1163 init1: 1057 opt: 1153 Z-score: 931.9 bits: 180.6 E(32554): 1.4e-45
Smith-Waterman score: 1153; 54.5% identity (85.3% similar) in 299 aa overlap (6-303:4-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARPM
..:.:::::::.:. : . .: .:...:.:: :::::::... .: .::. ::
CCDS31 MSKTSLVTAFILTGLPHAPGLDAPLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHT-PM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 YIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNF-TLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLM
: :: :: ::: .:.. ::...:.. . . . : : .:::::::.::::::.:::::.:
CCDS31 YYFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRAISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 AYDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFF
.::::::: :::: .:... :::....:..::.:.:.:.::::.::::::::.....
CCDS31 SYDRYLAISYPLRYTSMMSGSRCALLATSTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 CDIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRAF
:: : .:.::::::..::.: :::::.:...:: ::.:::..:. .::::::..::.:::
CCDS31 CDAPPILKLACADTSANEMVIFVDIGLVASGCFLLIVLSYVSIVCSILRIHTSEGRHRAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 STCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPLDGAAALVPTAITPFLNPLIYTLRNQEVKLA
.::..: :: ..:::.:::::: . . .::..:. :..::.:::..:::::.::: :
CCDS31 QTCASHCIVVLCFFVPCVFIYLRPGSRDVVDGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVKKA
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 LKRMLRSPRTPSEV
. ..
CCDS31 VLKLRDKVAHSQGE
300 310
>>CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1152 init1: 1046 opt: 1140 Z-score: 921.7 bits: 178.7 E(32554): 5.1e-45
Smith-Waterman score: 1140; 55.0% identity (84.0% similar) in 300 aa overlap (5-303:3-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARPM
:.::::::::::.:. : . .: .:...:.:: :::::::... .: .::. ::
CCDS31 MSNATLLTAFILTGLPHAPGLDAPLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHT-PM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 YIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNF-TLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLM
: :: :: ::: .:.. ::...:.. . . . : : .:::::::.::::::.:::::.:
CCDS31 YYFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRTISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 AYDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFF
.::::::: :::: .::.. :::..:.:..::.:.:.:.::::.::::::::....:
CCDS31 SYDRYLAISYPLRYTNMMTGRSCALLATGTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 CDIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRAF
:: : .:.::::::..::.: ::.::.:...:: ::.:::..:. .::::.:..::.:::
CCDS31 CDAPPILKLACADTSANEMVIFVNIGLVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSEGRHRAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 STCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPLDGAAALVPTAITPFLNPLIYTLRNQEVKLA
.::..: :: .. : :::::: . . : :..:. :..::..::..:::::.::: :
CCDS31 QTCASHCIVVLCFFGPGLFIYLRPGSRDALHGVVAVFYTTLTPLFNPVVYTLRNKEVKKA
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 LKRMLRSPRTPSEV
: ..
CCDS31 LLKLKNGSVFAQGE
300 310
>>CCDS31701.1 OR10S1 gene_id:219873|Hs108|chr11 (331 aa)
initn: 1024 init1: 933 opt: 1079 Z-score: 873.4 bits: 169.9 E(32554): 2.5e-42
Smith-Waterman score: 1079; 54.2% identity (79.4% similar) in 306 aa overlap (2-306:15-319)
10 20 30 40
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILI
: :.:... :.: :. : . .:::..:.::: .: ::::::.
CCDS31 MTSRSVCEKMTMTTENPNQTVVSHFFLEGLRYTAKHSSLFFLLFLLIYSITVAGNLLILL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 TVWADPRLHARPMYIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNF-TLGVKPIPFGGCVAQLYFYH
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CCDS31 FLASTECFLYTVMAYDRYLAICQPLHYPVAMNRRMCAEMAGITWAIGATHAAIHTSLTFR
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CCDS31 LLYCGPCHIAYFFCDIPPVLKLACTDTTINELVMLASIGIVAAGCLILIVISYIFIVAAV
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CCDS31 LRIRTAQGRQRAFSPCTAQLTGVLLYYVPPVCIYLQPRSSEAGAGAPAVFYTIVTPMLNP
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CCDS31 FIYTLRNKEVKHALQRLLCSSFRESTAGSPPP
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: ..
CCDS31 LLKLKDKVAHSQSK
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:.. : . :
CCDS31 KKLWRRKKDPIGPLEHRPLH
300 310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]