Result of FASTA (omim) for
pF1KE0288
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0288, 313 aa
1>>>pF1KE0288 313 - 313 aa - 313 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0316+/-0.00046; mu= 17.0078+/- 0.029
mean_var=78.4425+/-20.671, 0's: 0 Z-trim(109.3): 318 B-trim: 2114 in 2/47
Lambda= 0.144810
statistics sampled from 16872 (17418) to 16872 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.557), E-opt: 0.2 (0.204), width: 16
Scan time: 6.470
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 888 195.6 1.1e-49
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 856 188.9 1.1e-47
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 845 186.7 5.5e-47
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 835 184.6 2.3e-46
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 816 180.6 3.7e-45
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 816 180.6 3.7e-45
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 816 180.6 3.7e-45
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 800 177.2 3.7e-44
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 796 176.4 6.8e-44
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 785 174.1 3.2e-43
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 785 174.1 3.2e-43
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 783 173.7 4.3e-43
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 783 173.7 4.3e-43
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 783 173.7 4.4e-43
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 776 172.2 1.2e-42
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 767 170.3 4.3e-42
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 763 169.5 7.6e-42
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 718 160.1 5.3e-39
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 709 158.2 1.9e-38
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 708 158.0 2.2e-38
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 523 119.4 9.8e-27
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 512 117.1 4.8e-26
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 204 52.8 1.3e-06
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 204 52.8 1.3e-06
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 204 52.8 1.3e-06
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 204 52.8 1.3e-06
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 204 52.8 1.3e-06
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 204 52.8 1.3e-06
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 204 52.8 1.3e-06
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 204 52.8 1.3e-06
NP_000698 (OMIM: 600264) vasopressin V1b receptor ( 424) 192 50.3 7.9e-06
XP_016883344 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 365) 190 49.9 9.5e-06
NP_001305783 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 365) 190 49.9 9.5e-06
NP_001154888 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 187 49.2 1.4e-05
NP_001154889 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 187 49.2 1.4e-05
NP_001154887 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 367) 187 49.2 1.5e-05
XP_016859322 (OMIM: 603071) PREDICTED: uracil nucl ( 367) 187 49.2 1.5e-05
NP_005282 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cystein ( 367) 187 49.2 1.5e-05
NP_005152 (OMIM: 600052) apelin receptor [Homo sap ( 380) 187 49.3 1.5e-05
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 184 48.6 2.2e-05
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297) 183 48.3 2.3e-05
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297) 183 48.3 2.3e-05
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 183 48.3 2.3e-05
NP_001006628 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 185 48.9 2.3e-05
XP_011514071 (OMIM: 118493) PREDICTED: muscarinic ( 466) 185 48.9 2.3e-05
NP_001006627 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 185 48.9 2.3e-05
NP_001006633 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 185 48.9 2.3e-05
NP_000730 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholine ( 466) 185 48.9 2.3e-05
NP_001006629 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 185 48.9 2.3e-05
NP_001006631 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 185 48.9 2.3e-05
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 857 init1: 492 opt: 888 Z-score: 1013.2 bits: 195.6 E(85289): 1.1e-49
Smith-Waterman score: 888; 42.8% identity (74.9% similar) in 299 aa overlap (5-303:3-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARPM
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSL-GSPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLMA
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NP_001 YLSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFFC
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NP_001 YDHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMC
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190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRAFS
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NP_001 DLNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYV-VILCSLRTHSLEARHKALS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPLDGAAALVPTAITPFLNPLIYTLRNQEVKLAL
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NP_001 TCVSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAI
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 KRMLRSPRTPSEV
...
NP_001 RKLCSRKDISGDK
300
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 850 init1: 654 opt: 856 Z-score: 977.1 bits: 188.9 E(85289): 1.1e-47
Smith-Waterman score: 856; 41.8% identity (74.7% similar) in 304 aa overlap (3-304:6-308)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHA
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 RPMYIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYT
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NP_001 -PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLV
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pF1KE0 LMAYDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDY
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NP_001 VMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 FFCDIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRR
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NP_001 FFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQK
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 AFSTCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPLDGAA--ALVPTAITPFLNPLIYTLRNQE
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NP_001 VFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 VKLALKRMLRSPRTPSEV
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NP_001 VRGAVKRLMGWE
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 821 init1: 641 opt: 845 Z-score: 964.5 bits: 186.7 E(85289): 5.5e-47
Smith-Waterman score: 845; 43.7% identity (74.8% similar) in 302 aa overlap (5-302:5-304)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIP-YPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARP
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHS-P
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pF1KE0 MYIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLM
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NP_835 MYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATM
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pF1KE0 AYDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFF
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NP_835 AYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFF
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pF1KE0 CDIPAVLRLACADTTVNELVTFVD-IGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRA
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NP_835 CDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCL-LILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKA
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pF1KE0 FSTCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETN-SPLDGAA-ALVPTAITPFLNPLIYTLRNQEV
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NP_835 FSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEV
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300 310
pF1KE0 KLALKRMLRSPRTPSEV
: ::.:
NP_835 KNALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 831 init1: 589 opt: 835 Z-score: 953.3 bits: 184.6 E(85289): 2.3e-46
Smith-Waterman score: 835; 39.9% identity (70.9% similar) in 313 aa overlap (1-311:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARPM
: : : : :: :.: :. :.:. ..:.::..:: :: :::: ... . : .::. ::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHT-PM
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pF1KE0 YIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLMA
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NP_003 YFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMA
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pF1KE0 YDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFFC
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NP_003 YDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFC
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pF1KE0 DIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRAFS
: : ...:.:.:: ..: .. . :: ... . .:: :: .. .:. .:...::.::::
NP_003 DSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFS
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pF1KE0 TCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPL--DGAAALVPTAITPFLNPLIYTLRNQEVKL
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NP_003 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 ALKRMLRSPRTPSEV
:: .. :: :
NP_003 ALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 798 init1: 587 opt: 816 Z-score: 931.8 bits: 180.6 E(85289): 3.7e-45
Smith-Waterman score: 816; 43.4% identity (73.8% similar) in 302 aa overlap (5-304:5-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARPM
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHT-PM
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pF1KE0 YIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLMA
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NP_036 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 YDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFFC
::::.:.:. ::: ..: . : : :. .:..: : . .:. .::.::.: . .:.. :
NP_036 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
120 130 140 150 160 170
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pF1KE0 DIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRAFS
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NP_036 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 TCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETN-SPLDGAAALVPTAI-TPFLNPLIYTLRNQEVKL
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NP_036 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 ALKRMLRSPRTPSEV
: ...:
NP_036 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 798 init1: 587 opt: 816 Z-score: 931.8 bits: 180.6 E(85289): 3.7e-45
Smith-Waterman score: 816; 43.4% identity (73.8% similar) in 302 aa overlap (5-304:5-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARPM
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHT-PM
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pF1KE0 YIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLMA
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XP_011 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFFC
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XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRAFS
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XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE0 TCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETN-SPLDGAAALVPTAI-TPFLNPLIYTLRNQEVKL
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XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 ALKRMLRSPRTPSEV
: ...:
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 798 init1: 587 opt: 816 Z-score: 931.8 bits: 180.6 E(85289): 3.7e-45
Smith-Waterman score: 816; 43.4% identity (73.8% similar) in 302 aa overlap (5-304:5-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARPM
:.: .. ::: :. :. .::.:...:..: ::: ::.. . : :::. ::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHT-PM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLMA
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XP_011 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFFC
::::.:.:. ::: ..: . : : :. .:..: : . .:. .::.::.: . .:.. :
XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRAFS
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XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE0 TCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETN-SPLDGAAALVPTAI-TPFLNPLIYTLRNQEVKL
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XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 ALKRMLRSPRTPSEV
: ...:
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 790 init1: 561 opt: 800 Z-score: 913.8 bits: 177.2 E(85289): 3.7e-44
Smith-Waterman score: 800; 41.5% identity (74.9% similar) in 311 aa overlap (1-308:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARPM
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHT-PM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLMA
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NP_001 YFFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFFC
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NP_001 YDRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLR
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE0 DIPAVLRLACADTTVNELVTFV-DIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRAF
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NP_001 EMPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVL-SPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 STCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPLDGAAALV--PTAITPFLNPLIYTLRNQEVK
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NP_001 GTCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 LALKRMLRSPRTPSEV
:: :.: . :
NP_001 GALGRLLLGKRELGKE
300 310
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 693 init1: 540 opt: 796 Z-score: 909.0 bits: 176.4 E(85289): 6.8e-44
Smith-Waterman score: 796; 39.6% identity (70.8% similar) in 308 aa overlap (1-300:1-306)
10 20 30 40 50
pF1KE0 ME-RINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARP
:: : .: .. :.: :.: : :..:.:....: :.:. : ::.... :: .:
NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLH-KP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 MYIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKP-----IPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCF
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NP_003 MYFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGF-VGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECV
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 LYTLMAYDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQ
: ..::::::.::: ::.:::.....: . ..::.: .: . ....: : :::::
NP_003 LLAVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNI
120 130 140 150 160 170
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pF1KE0 VDYFFCDIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADG
...::::. .: :.:.: .. ::. :. .. . .:. ::. : :...: .: :
NP_003 INHFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAG
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 RRRAFSTCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPLDGA--AALVPTAITPFLNPLIYTLR
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NP_003 RYKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLR
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 NQEVKLALKRMLRSPRTPSEV
::::: ::
NP_003 NQEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
300 310 320
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 792 init1: 605 opt: 785 Z-score: 896.9 bits: 174.1 E(85289): 3.2e-43
Smith-Waterman score: 785; 41.3% identity (72.1% similar) in 305 aa overlap (4-304:2-303)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIP-YPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARP
.:.. .:.: :. .: :::: : . :.:: .:: ::.. ::.::. :
NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVL-TSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHS-P
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 MYIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLM
::.::. :: .:. ... ::....:. : : : : .:.... ::.:.:.: :.:
NP_009 MYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVM
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 AYDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFF
:.:::.:.::::.: ... .: :.. ::. : .....:. :..::.: ::: :
NP_009 AFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFV
120 130 140 150 160 170
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pF1KE0 CDIPAVLRLACADTTVNEL-VTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRA
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NP_009 CEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVP-LSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKA
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 FSTCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPLDGAA--ALVPTAITPFLNPLIYTLRNQEV
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300 310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]