Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0298
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0298, 2718 aa
1>>>pF1KE0298 2718 - 2718 aa - 2718 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.1988+/-0.0017; mu= -19.9777+/- 0.099
mean_var=784.8906+/-206.708, 0's: 0 Z-trim(110.0): 9 B-trim: 614 in 1/51
Lambda= 0.045779
statistics sampled from 11298 (11303) to 11298 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.663), E-opt: 0.2 (0.347), width: 16
Scan time: 8.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43426.1 HIVEP1 gene_id:3096|Hs108|chr6 (2718) 17896 1200.5 0
CCDS44124.1 HIVEP3 gene_id:59269|Hs108|chr1 (2405) 1059 88.4 5e-16
CCDS463.1 HIVEP3 gene_id:59269|Hs108|chr1 (2406) 1059 88.4 5e-16
CCDS43510.1 HIVEP2 gene_id:3097|Hs108|chr6 (2446) 934 80.2 1.6e-13
>>CCDS43426.1 HIVEP1 gene_id:3096|Hs108|chr6 (2718 aa)
initn: 17896 init1: 17896 opt: 17896 Z-score: 6410.3 bits: 1200.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 17896; 99.9% identity (100.0% similar) in 2718 aa overlap (1-2718:1-2718)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPRTKQIHPRNLRDKIEEAQKELNGAEVSKKEILQAGVKGTSESLKGVKRKKIVAENHLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MPRTKQIHPRNLRDKIEEAQKELNGAEVSKKEILQAGVKGTSESLKGVKRKKIVAENHLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KIPKSPLRNPLQAKHKQNTEESSFAVLHSASESHKKQNYIPVKNGKQFTKQNGETPGIIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KIPKSPLRNPLQAKHKQNTEESSFAVLHSASESHKKQNYIPVKNGKQFTKQNGETPGIIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 EASKSEESVSPKKPLFLQQPSELRRWRSEGADPAKFSDLDEQCDSSSLSSKTRTDNSECI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EASKSEESVSPKKPLFLQQPSELRRWRSEGADPAKFSDLDEQCDSSSLSSKTRTDNSECI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SSHCGTMSPSYTNTAFDVLLKAMEPELSTLSQKGSPCAIKTEKLRPNKTARSPPKLKNSS
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSHCGTTSPSYTNTAFDVLLKAMEPELSTLSQKGSPCAIKTEKLRPNKTARSPPKLKNSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 MDAPNQTSQELVAESQSSCTSYTVHMSAAQKNEQGAMQSASHLYHQHEHFVPKSNQHNQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MDAPNQTSQELVAESQSSCTSYTVHMSAAQKNEQGAMQSASHLYHQHEHFVPKSNQHNQQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 LPGCSGFTGSLTNLQNQENAKLEQVYNIAVTSSVGLTSPSSRSQVTPQNQQMDSASPLSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LPGCSGFTGSLTNLQNQENAKLEQVYNIAVTSSVGLTSPSSRSQVTPQNQQMDSASPLSI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 SPANSTQSPPMPIYNSTHVASVVNQSVEQMCNLLLKDQKPKKQGKYICEYCNRACAKPSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SPANSTQSPPMPIYNSTHVASVVNQSVEQMCNLLLKDQKPKKQGKYICEYCNRACAKPSV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 LLKHIRSHTGERPYPCVTCGFSFKTKSNLYKHKKSHAHTIKLGLVLQPDAGGLFLSHESP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LLKHIRSHTGERPYPCVTCGFSFKTKSNLYKHKKSHAHTIKLGLVLQPDAGGLFLSHESP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 KALSIHSDVEDSGESEEEGATDERQHDLGAMELQPVHIIKRMSNAETLLKSSFTPSSPEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KALSIHSDVEDSGESEEEGATDERQHDLGAMELQPVHIIKRMSNAETLLKSSFTPSSPEN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 VIGDFLLQDRSAESQAVTELPKVVVHHVTVSPLRTDSPKAMDPKPELSSAQKQKDLQVTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VIGDFLLQDRSAESQAVTELPKVVVHHVTVSPLRTDSPKAMDPKPELSSAQKQKDLQVTN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 VQPLSANMSQGGVSRLETNENSHQKGDMNPLEGKQDSHVGTVHAQLQRQQATDYSQEQQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VQPLSANMSQGGVSRLETNENSHQKGDMNPLEGKQDSHVGTVHAQLQRQQATDYSQEQQG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 KLLSPRSLGSTDSGYFSRSESADQTVSPPTPFARRLPSTEQDSGRSNGPSAALVTASTPS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS43 KLLSPRSLGSTDSGYFSRSESADQTVSPPTPFARRLPSTEQDSGRSNGPSAALVTTSTPS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 ALPTGEKALLLPGQMRPPLATKTLEERISKLISDNEALVDDKQLDSVKPRRTSLSRRGSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ALPTGEKALLLPGQMRPPLATKTLEERISKLISDNEALVDDKQLDSVKPRRTSLSRRGSI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 DSPKSYIFKDSFQFDLKPVGRRTSSSSDIPKSPFTPTEKSKQVFLLSVPSLDCLPITRSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DSPKSYIFKDSFQFDLKPVGRRTSSSSDIPKSPFTPTEKSKQVFLLSVPSLDCLPITRSN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 SMPTTGYSAVPANIIPPPHPLRGSQSFDDKIGAFYDDVFVSGPNAPVPQSGHPRTLVRQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SMPTTGYSAVPANIIPPPHPLRGSQSFDDKIGAFYDDVFVSGPNAPVPQSGHPRTLVRQA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE0 AIEDSSANESHVLGTGQSLDESHQGCHAAGEAMSVRSKALAQGPHIEKKKSHQGRGTMFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AIEDSSANESHVLGTGQSLDESHQGCHAAGEAMSVRSKALAQGPHIEKKKSHQGRGTMFE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE0 CETCRNRYRKLENFENHKKFYCSELHGPKTKVAMREPEHSPVPGGLQPQILHYRVAGSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CETCRNRYRKLENFENHKKFYCSELHGPKTKVAMREPEHSPVPGGLQPQILHYRVAGSSG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE0 IWEQTPQIRKRRKMKSVGDDEELQQNESGTSPKSSEGLQFQNALGCNPSLPKHNVTIRSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IWEQTPQIRKRRKMKSVGDDEELQQNESGTSPKSSEGLQFQNALGCNPSLPKHNVTIRSD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE0 QQHKNIQLQNSHIHLVARGPEQTMDPKLSTIMEQQISSAAQDKIELQRHGTGISVIQHTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QQHKNIQLQNSHIHLVARGPEQTMDPKLSTIMEQQISSAAQDKIELQRHGTGISVIQHTN
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE0 SLSRPNSFDKPEPFERASPVSFQELNRTGKSGSLKVIGISQEESHPSRDGSHPHQLALSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLSRPNSFDKPEPFERASPVSFQELNRTGKSGSLKVIGISQEESHPSRDGSHPHQLALSD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE0 ALRGELQESSRKSPSERHVLGQPSRLVRQHNIQVPEILVTEEPDRDLEAQCHDQEKSEKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ALRGELQESSRKSPSERHVLGQPSRLVRQHNIQVPEILVTEEPDRDLEAQCHDQEKSEKF
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE0 SWPQRSETLSKLPTEKLPPKKKRLRLAEIEHSSTESSFDSTLSRSLSRESSLSHTSSFSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SWPQRSETLSKLPTEKLPPKKKRLRLAEIEHSSTESSFDSTLSRSLSRESSLSHTSSFSA
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE0 SLDIEDVSKTEASPKIDFLNKAEFLMIPAGLNTLNVPGCHREMRRTASEQINCTQTSMEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLDIEDVSKTEASPKIDFLNKAEFLMIPAGLNTLNVPGCHREMRRTASEQINCTQTSMEV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE0 SDLRSKSFDCGSITPPQTTPLTELQPPSSPSRVGVTGHVPLLERRRGPLVRQISLNIAPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SDLRSKSFDCGSITPPQTTPLTELQPPSSPSRVGVTGHVPLLERRRGPLVRQISLNIAPD
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE0 SHLSPVHPTSFQNTALPSVNAVPYQGPQLTSTSLAEFSANTLHSQTQVKDLQAETSNSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SHLSPVHPTSFQNTALPSVNAVPYQGPQLTSTSLAEFSANTLHSQTQVKDLQAETSNSSS
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE0 TNVFPVQQLCDINLLNQIHAPPSHQSTQLSLQVSTQGSKPDKNSVLSGSSKSEDCFAPKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TNVFPVQQLCDINLLNQIHAPPSHQSTQLSLQVSTQGSKPDKNSVLSGSSKSEDCFAPKY
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE0 QLHCQVFTSGPSCSSNPVHSLPNQVISDPVGTDHCVTSATLPTKLIDSISNSHPLLPPEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS43 QLHCQVFTSGPSCSSNPVHSLPNQVISDPVGTDHCVTSATLPTKLIDSMSNSHPLLPPEL
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE0 RPLGSQVQKVPSSFMLPIRLQSSVPAYCFATLTSLPQILVTQDLPNQPICQTNHSVVPIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RPLGSQVQKVPSSFMLPIRLQSSVPAYCFATLTSLPQILVTQDLPNQPICQTNHSVVPIS
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE0 EEQNSVPTLQKGHQNALPNPEKEFLCENVFSEMSQNSSLSESLPITQKISVGRLSPQQES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EEQNSVPTLQKGHQNALPNPEKEFLCENVFSEMSQNSSLSESLPITQKISVGRLSPQQES
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE0 SASSKRMLSPANSLDIAMEKHQKRAKDENGAVCATDVRPLEALSSRVNEASKQKKPILVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SASSKRMLSPANSLDIAMEKHQKRAKDENGAVCATDVRPLEALSSRVNEASKQKKPILVR
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE0 QVCTTEPLDGVMLEKDVFSQPEISNEAVNLTNVLPADNSSTGCSKFVVIEPISELQEFEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QVCTTEPLDGVMLEKDVFSQPEISNEAVNLTNVLPADNSSTGCSKFVVIEPISELQEFEN
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE0 IKSSTSLTLTVRSSPAPSENTHISPLKCTDNNQERKSPGVKNQGDKVNIQEQSQQPVTSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IKSSTSLTLTVRSSPAPSENTHISPLKCTDNNQERKSPGVKNQGDKVNIQEQSQQPVTSL
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE0 SLFNIKDTQQLAFPSLKTTTNFTWCYLLRQKSLHLPQKDQKTSAYTDWTVSASNPNPLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLFNIKDTQQLAFPSLKTTTNFTWCYLLRQKSLHLPQKDQKTSAYTDWTVSASNPNPLGL
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE0 PTKVALALLNSKQNTGKSLYCQAITTHSKSDLLVYSSKWKSSLSKRALGNQKSTVVEFSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PTKVALALLNSKQNTGKSLYCQAITTHSKSDLLVYSSKWKSSLSKRALGNQKSTVVEFSN
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KE0 KDASEINSEQDKENSLIKSEPRRIKIFDGGYKSNEEYVYVRGRGRGKYICEECGIRCKKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KDASEINSEQDKENSLIKSEPRRIKIFDGGYKSNEEYVYVRGRGRGKYICEECGIRCKKP
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KE0 SMLKKHIRTHTDVRPYHCTYCNFSFKTKGNLTKHMKSKAHSKKCVDLGVSVGLIDEQDTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SMLKKHIRTHTDVRPYHCTYCNFSFKTKGNLTKHMKSKAHSKKCVDLGVSVGLIDEQDTE
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KE0 ESDEKQRFSYERSGYDLEESDGPDEDDNENEDDDEDSQAESVLSATPSVTASPQHLPSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ESDEKQRFSYERSGYDLEESDGPDEDDNENEDDDEDSQAESVLSATPSVTASPQHLPSRS
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KE0 SLQDPVSTDEDVRITDCFSGVHTDPMDVLPRALLTRMTVLSTAQSDYNRKTLSPGKARQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLQDPVSTDEDVRITDCFSGVHTDPMDVLPRALLTRMTVLSTAQSDYNRKTLSPGKARQR
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KE0 AARDENDTIPSVDTSRSPCHQMSVDYPESEEILRSSMAGKAVAITQSPSSVRLPPAAAEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AARDENDTIPSVDTSRSPCHQMSVDYPESEEILRSSMAGKAVAITQSPSSVRLPPAAAEH
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KE0 SPQTAAGMPSVASPHPDPQEQKQQITLQPTPGLPSPHTHLFSHLPLHSQQQSRTPYNMVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SPQTAAGMPSVASPHPDPQEQKQQITLQPTPGLPSPHTHLFSHLPLHSQQQSRTPYNMVP
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KE0 VGGIHVVPAGLTYSTFVPLQAGPVQLTIPAVSVVHRTLGTHRNTVTEVSGTTNPAGVAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VGGIHVVPAGLTYSTFVPLQAGPVQLTIPAVSVVHRTLGTHRNTVTEVSGTTNPAGVAEL
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KE0 SSVVPCIPIGQIRVPGLQNLSTPGLQSLPSLSMETVNIVGLANTNMAPQVHPPGLALNAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSVVPCIPIGQIRVPGLQNLSTPGLQSLPSLSMETVNIVGLANTNMAPQVHPPGLALNAV
2470 2480 2490 2500 2510 2520
2530 2540 2550 2560 2570 2580
pF1KE0 GLQVLTANPSSQSSPAPQAHIPGLQILNIALPTLIPSVSQVAVDAQGAPEMPASQSKACE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GLQVLTANPSSQSSPAPQAHIPGLQILNIALPTLIPSVSQVAVDAQGAPEMPASQSKACE
2530 2540 2550 2560 2570 2580
2590 2600 2610 2620 2630 2640
pF1KE0 TQPKQTSVASANQVSRTESPQGLPTVQRENAKKVLNPPAPAGDHARLDGLSKMDTEKAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TQPKQTSVASANQVSRTESPQGLPTVQRENAKKVLNPPAPAGDHARLDGLSKMDTEKAAS
2590 2600 2610 2620 2630 2640
2650 2660 2670 2680 2690 2700
pF1KE0 ANHVKPKPELTSIQGQPASTSQPLLKAHSEVFTKPSGQQTLSPDRQVPRPTALPRRQPTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ANHVKPKPELTSIQGQPASTSQPLLKAHSEVFTKPSGQQTLSPDRQVPRPTALPRRQPTV
2650 2660 2670 2680 2690 2700
2710
pF1KE0 HFSDVSSDDDEDRLVIAT
::::::::::::::::::
CCDS43 HFSDVSSDDDEDRLVIAT
2710
>>CCDS44124.1 HIVEP3 gene_id:59269|Hs108|chr1 (2405 aa)
initn: 1987 init1: 601 opt: 1059 Z-score: 401.1 bits: 88.4 E(32554): 5e-16
Smith-Waterman score: 2640; 31.0% identity (53.5% similar) in 2676 aa overlap (203-2707:1-2353)
180 190 200 210 220
pF1KE0 RTDNSECISSHCGTMSPSYTNTAFDVLLKAMEPELSTLSQK---GSPCA--IKTEKLRPN
:.:: :. . : ::: : : .. .
CCDS44 MDPEQSVKGTKKAEGSPRKRLTKGEAIQ-T
10 20
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 KTARSPPKLKNSSMDAPNQTSQELVAESQSSCTSYTVHMSAAQKNEQGAMQSASHLYHQH
... : : ... . .. .:::.: . : ... .. .:. : .
CCDS44 SVSSSVPYPGSGTAATQESPAQELLAPQPFPGPSSVLREGSQEKTGQQQKPPKRPPIEAS
30 40 50 60 70 80
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 EHFVPKSNQHNQQLPGCSGFTGSLTNLQNQENAKLEQVYNIAVTSSVGLTSPSSRSQVTP
: . . :: : .: . . :.. . : . : ....:. . :
CCDS44 VH-ISQLPQH----PLTPAFMSPGKPEHLLEGSTWQLVDPMRPGPSGSFVAPG----LHP
90 100 110 120 130 140
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 QNQQMDSASPLSISPANSTQSPPMPIYNSTHVASVVNQSVEQMCNLLLKDQKPKKQGKYI
:.: . : . . : : . : . . ..:. .. ... :..::.: ::::
CCDS44 QSQLLPSHASI-IPPEDLPGVPKVFVPRPSQVSLKPTEEAHK------KERKPQKPGKYI
150 160 170 180 190
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 CEYCNRACAKPSVLLKHIRSHTGERPYPCVTCGFSFKTKSNLYKHKKSHAHTIKLGLVLQ
:.::.: ::::::: :::::::::::::: ::::::::::::::.::::: :: ::.
CCDS44 CQYCSRPCAKPSVLQKHIRSHTGERPYPCGPCGFSFKTKSNLYKHRKSHAHRIKAGLA--
200 210 220 230 240 250
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 PDAGGLFLSHESPKALSIHSDVEDSGESEEEGATDERQHDLGAMELQPVHIIKRMSNAET
:: . :..: .. . : :: . . ... .: .:... : .
CCDS44 SGMGGEMY----PHGLEMERIPGEEFEEPTEGESTDSEEETSATSGHPAELSPR--PKQP
260 270 280 290 300
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 LLKSSFTPSSPENVIGDFLLQDRSAESQAVTELPKVVVHHVTVSPLRTDSPKAMDPKPEL
::.:.. :. .. . ..:. .:.. . : : . .: . .. :::
CCDS44 LLSSGLYSSGSHSSSHERCSLSQSSTAQSLEDPPPFV---------EPSSEHPLSHKPED
310 320 330 340 350
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pF1KE0 SSAQKQKDLQVTNVQPLSANMSQGGVSRLETNENSHQKGDMNPLEGKQDSHVGTVHAQLQ
. . ::: :. .:.
CCDS44 THTIKQK---------LALRLSE-------------------------------------
360 370
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pF1KE0 RQQATDYSQEQQGKLLSPRSLGSTDSGYFSRSESADQTVSPPTPFARRLPST-EQDSGRS
:... : :: .::: : :::.::::::::::.: ::::. :. ::
CCDS44 RKKVID---EQA--FLSPGSKGSTESGYFSRSESAEQQVSPPNTNAKSYAEIIFGKCGRI
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pF1KE0 NGPSAALVTASTPSALP--TGEKALLLPGQMRPPLATKTLEERISKLISDNEALVDDKQL
. .: :...:: :: : .: :.: . : :...:. :.:::. :::.:: ...
CCDS44 GQRTAMLTATSTQPLLPLSTEDKPSLVP--LSVP-RTQVIEH-ITKLITINEAVVDTSEI
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:::::::.:::::.:..:::: .... :. :: :. : : :.: .
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: :: .:. ::.:::... . : : ::.::: ::::.: : . .
CCDS44 LQHPPSTAPPVPLLRSHSMPSAACT-----ISTPHHPFRGSYSFDDHI----TDSEALSH
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.. : : ::: : :: ::: ..: : : :.. .. . . . :..
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. ::. . .:...::. : ::.: .:.: :::.:::::. : : : :.
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: . :..::.. :.. : :: .::::: ::.::.:: :: : .: :
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:: .:. ..: .. . . . . .:: ..:. . .:.
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... : . . :::::::.:. . .:...: .: :.. :
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.: : : :: .:.. : : :: .:::: :::::::::
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:::::: : : . .. ::.:.:.:::::.::..::.::::::::::::::. .:: ::
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::.:. :::: :.::..: . :: :::.. .: .:.:: ::. :. : : : .
CCDS44 SFESSVPLSRSPSQESNVSLSGSSRSASFERDDHGKAEAPSPSSDMRPK------PLGTH
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:.::. : :::::.:::: .. : .... :::::: ::.. : ::.
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:. :. ..: :::. :::: ::. :.:.: : : . :.. :. : ..
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...::...: : : :. . .: : . . . .:: :: : : ..
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. :: .:. : :::. . .: : . : :: :. :
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. : :. .:.. : . . : :. ..:. :: . . . .::
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... . ... : :: . : ..:: : :.... :.. .. . ..: :..:.
CCDS44 GTAPGSEALKEYPQPSGKPHRRGLTPLSVKKEDSKEQPDLPSLAPPSS-LPLSETSSRPA
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CCDS44 PCPLIPIGGIQMVQARPGAHPTLLPGPTAAWVSGFSGGGSDLTGAR-EAQERGRWSPTES
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.. ::
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...::...: : : :. . .: : . . . .:: :: : : ..
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. :: .:. : :::. . .: : . : :: :. :
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