Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0302
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0302, 476 aa
1>>>pF1KE0302 476 - 476 aa - 476 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6336+/-0.00105; mu= 16.1465+/- 0.062
mean_var=70.4426+/-14.438, 0's: 0 Z-trim(103.7): 38 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.152812
statistics sampled from 7498 (7523) to 7498 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.6), E-opt: 0.2 (0.231), width: 16
Scan time: 3.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4316.1 SLC36A1 gene_id:206358|Hs108|chr5 ( 476) 3147 703.3 1.4e-202
CCDS83035.1 SLC36A1 gene_id:206358|Hs108|chr5 ( 386) 2588 580.0 1.5e-165
CCDS4315.1 SLC36A2 gene_id:153201|Hs108|chr5 ( 483) 2199 494.3 1.2e-139
CCDS4314.1 SLC36A3 gene_id:285641|Hs108|chr5 ( 470) 1921 433.0 3.2e-121
CCDS78073.1 SLC36A1 gene_id:206358|Hs108|chr5 ( 243) 1605 363.2 1.7e-100
CCDS8291.1 SLC36A4 gene_id:120103|Hs108|chr11 ( 504) 1603 362.9 4.4e-100
CCDS47316.1 SLC36A3 gene_id:285641|Hs108|chr5 ( 511) 1451 329.4 5.4e-90
CCDS66202.1 SLC36A4 gene_id:120103|Hs108|chr11 ( 369) 1240 282.8 4.1e-76
>>CCDS4316.1 SLC36A1 gene_id:206358|Hs108|chr5 (476 aa)
initn: 3147 init1: 3147 opt: 3147 Z-score: 3750.3 bits: 703.3 E(32554): 1.4e-202
Smith-Waterman score: 3147; 99.8% identity (100.0% similar) in 476 aa overlap (1-476:1-476)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSTQRLRNEDYHDYSSTDVSPEESPSEGLNNLSSPGSYQRFGQSNSTTWFQTLIHLLKGN
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CCDS43 MSTQRLRNEDYHDYSSTDVSPEESPSEGLNNLSSPGSYQRFGQSNSTTWFQTLIHLLKGN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 IGTGLLGLPLAVKNAGIVMGPISLLIIGIVAVHCMGILVKCAHHFCRRLNKSFVDYGDTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IGTGLLGLPLAVKNAGIVMGPISLLIIGIVAVHCMGILVKCAHHFCRRLNKSFVDYGDTV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 MYGLESSPCSWLRNHAHWGRRVVDFFLIVTQLGFCCVYFVFLADNFKQVIEAANGTTNNC
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CCDS43 MYGLESSPCSWLRNHAHWGRRVVDFFLIVTQLGFCCVYFVFLADNFKQVIEAANGTTNNC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 HNNETVILTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVFIRNLRALSIFSLLANITMLASLVMIYQFIV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS43 HNNETVILTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVFIRNLRALSIFSLLANITMLVSLVMIYQFIV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 QRIPDPSHLPLVAPWKTYPLFFGTAIFSFEGIGMVLPLENKMKDPRKFPLILYLGMVIVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QRIPDPSHLPLVAPWKTYPLFFGTAIFSFEGIGMVLPLENKMKDPRKFPLILYLGMVIVT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ILYISLGCLGYLQFGANIQGSITLNLPNCWLYQSVKLLYSIGIFFTYALQFYVPAEIIIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ILYISLGCLGYLQFGANIQGSITLNLPNCWLYQSVKLLYSIGIFFTYALQFYVPAEIIIP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 FFVSRAPEHCELVVDLFVRTVLVCLTCILAILIPRLDLVISLVGSVSSSALALIIPPLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FFVSRAPEHCELVVDLFVRTVLVCLTCILAILIPRLDLVISLVGSVSSSALALIIPPLLE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE0 VTTFYSEGMSPLTIFKDALISILGFVGFVVGTYEALYELIQPSNAPIFINSTCAFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VTTFYSEGMSPLTIFKDALISILGFVGFVVGTYEALYELIQPSNAPIFINSTCAFI
430 440 450 460 470
>>CCDS83035.1 SLC36A1 gene_id:206358|Hs108|chr5 (386 aa)
initn: 2588 init1: 2588 opt: 2588 Z-score: 3085.7 bits: 580.0 E(32554): 1.5e-165
Smith-Waterman score: 2588; 99.7% identity (100.0% similar) in 386 aa overlap (1-386:1-386)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSTQRLRNEDYHDYSSTDVSPEESPSEGLNNLSSPGSYQRFGQSNSTTWFQTLIHLLKGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MSTQRLRNEDYHDYSSTDVSPEESPSEGLNNLSSPGSYQRFGQSNSTTWFQTLIHLLKGN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 IGTGLLGLPLAVKNAGIVMGPISLLIIGIVAVHCMGILVKCAHHFCRRLNKSFVDYGDTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 IGTGLLGLPLAVKNAGIVMGPISLLIIGIVAVHCMGILVKCAHHFCRRLNKSFVDYGDTV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 MYGLESSPCSWLRNHAHWGRRVVDFFLIVTQLGFCCVYFVFLADNFKQVIEAANGTTNNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MYGLESSPCSWLRNHAHWGRRVVDFFLIVTQLGFCCVYFVFLADNFKQVIEAANGTTNNC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 HNNETVILTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVFIRNLRALSIFSLLANITMLASLVMIYQFIV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS83 HNNETVILTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVFIRNLRALSIFSLLANITMLVSLVMIYQFIV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 QRIPDPSHLPLVAPWKTYPLFFGTAIFSFEGIGMVLPLENKMKDPRKFPLILYLGMVIVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QRIPDPSHLPLVAPWKTYPLFFGTAIFSFEGIGMVLPLENKMKDPRKFPLILYLGMVIVT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ILYISLGCLGYLQFGANIQGSITLNLPNCWLYQSVKLLYSIGIFFTYALQFYVPAEIIIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ILYISLGCLGYLQFGANIQGSITLNLPNCWLYQSVKLLYSIGIFFTYALQFYVPAEIIIP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 FFVSRAPEHCELVVDLFVRTVLVCLTCILAILIPRLDLVISLVGSVSSSALALIIPPLLE
::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 FFVSRAPEHCELVVDLFVRTVLVCLT
370 380
>>CCDS4315.1 SLC36A2 gene_id:153201|Hs108|chr5 (483 aa)
initn: 2192 init1: 2192 opt: 2199 Z-score: 2620.7 bits: 494.3 E(32554): 1.2e-139
Smith-Waterman score: 2199; 72.8% identity (89.5% similar) in 459 aa overlap (19-472:21-479)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MSTQRLRNEDYHDYSSTDVSPEESPSEGLNNLS-----SPGSYQRFGQSNSTTWFQTL
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CCDS43 MSVTKSTEGPQGAVAIKLDLMSPPESAKKLENKDSTFLDESPSESAGLKKTKGITVFQAL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 IHLLKGNIGTGLLGLPLAVKNAGIVMGPISLLIIGIVAVHCMGILVKCAHHFCRRLNKSF
:::.:::.:::.::::::::::::.:::.:::..:..: ::: ::::::..::.:::: :
CCDS43 IHLVKGNMGTGILGLPLAVKNAGILMGPLSLLVMGFIACHCMHILVKCAQRFCKRLNKPF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 VDYGDTVMYGLESSPCSWLRNHAHWGRRVVDFFLIVTQLGFCCVYFVFLADNFKQVIEAA
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CCDS43 MDYGDTVMHGLEANPNAWLQNHAHWGRHIVSFFLIITQLGFCCVYIVFLADNLKQVVEAV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 NGTTNNCHNNETVILTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVFIRNLRALSIFSLLANITMLASLV
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CCDS43 NSTTNNCYSNETVILTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVLIRNLRILTIFSMLANISMLVSLV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 MIYQFIVQRIPDPSHLPLVAPWKTYPLFFGTAIFSFEGIGMVLPLENKMKDPRKFPLILY
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CCDS43 IIIQYITQEIPDPSRLPLVASWKTYPLFFGTAIFSFESIGVVLPLENKMKNARHFPAILS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 LGMVIVTILYISLGCLGYLQFGANIQGSITLNLPNCWLYQSVKLLYSIGIFFTYALQFYV
::: ::: :::... ::::.:: .:..::.:::::::::::::::: ::. ::::::::
CCDS43 LGMSIVTSLYIGMAALGYLRFGDDIKASISLNLPNCWLYQSVKLLYIAGILCTYALQFYV
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 PAEIIIPFFVSRAPEHCELVVDLFVRTVLVCLTCILAILIPRLDLVISLVGSVSSSALAL
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CCDS43 PAEIIIPFAISRVSTRWALPLDLSIRLVMVCLTCLLAILIPRLDLVISLVGSVSGTALAL
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 IIPPLLEVTTFYSEGMSPLTIFKDALISILGFVGFVVGTYEALYELIQPSNAPIFINSTC
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CCDS43 IIPPLLEVTTFYSEGMSPLTIFKDALISILGFVGFVVGTYQALDELLKSEDSHPFSNSTT
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 AFI
CCDS43 FVR
>>CCDS4314.1 SLC36A3 gene_id:285641|Hs108|chr5 (470 aa)
initn: 1913 init1: 1886 opt: 1921 Z-score: 2289.7 bits: 433.0 E(32554): 3.2e-121
Smith-Waterman score: 1921; 62.2% identity (85.0% similar) in 468 aa overlap (6-472:3-466)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MSTQRLRNEDYH-DYSSTDVSPEESPSEGLNNLSSPGSYQRFGQSNSTTWFQTLIHLLKG
: ..::. . .: : .:. ::::. ....: . . :... . .::::::::
CCDS43 MSLLGRDYNSELNSLDNGPQ-SPSESSSSITSENVHPA-GEAG-LSMMQTLIHLLKC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 NIGTGLLGLPLAVKNAGIVMGPISLLIIGIVAVHCMGILVKCAHHFCRRLNKSFVDYGDT
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CCDS43 NIGTGLLGLPLAIKNAGLLVGPVSLLAIGVLTVHCMVILLNCAQHLSQRLQKTFVNYGEA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 VMYGLESSPCSWLRNHAHWGRRVVDFFLIVTQLGFCCVYFVFLADNFKQVIEAANGTTNN
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CCDS43 TMYGLETCPNTWLRAHAVWGRYTVSFLLVITQLGFCSVYFMFMADNLQQMVEKAHVTSNI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 CHNNETVILTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVFIRNLRALSIFSLLANITMLASLVMIYQFI
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CCDS43 CQPREILTLTPILDIRFYMLIILPFLILLVFIQNLKVLSVFSTLANITTLGSMALIFEYI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 VQRIPDPSHLPLVAPWKTYPLFFGTAIFSFEGIGMVLPLENKMKDPRKFPLILYLGMVIV
.. :: ::.:::.: :::. ::::::::.:::.::::::.:.:: :..: ..::::: ::
CCDS43 MEGIPYPSNLPLMANWKTFLLFFGTAIFTFEGVGMVLPLKNQMKHPQQFSFVLYLGMSIV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 TILYISLGCLGYLQFGANIQGSITLNLPNCWLYQSVKLLYSIGIFFTYALQFYVPAEIII
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CCDS43 IILYILLGTLGYMKFGSDTQASITLNLPNCWLYQSVKLMYSIGIFFTYALQFHVPAEIII
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 PFFVSRAPEHCELVVDLFVRTVLVCLTCILAILIPRLDLVISLVGSVSSSALALIIPPLL
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CCDS43 PFAISQVSESWALFVDLSVRSALVCLTCVSAILIPRLDLVISLVGSVSSSALALIIPALL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 EVTTFYSEGMSPLTIFKDALISILGFVGFVVGTYEALYELIQPSNAPIFINSTCAFI
:.. :::: :: .:: :: .:::.:..: . :::.::::: :: . . :::
CCDS43 EIVIFYSEDMSCVTIAKDIMISIVGLLGCIFGTYQALYELPQPISHSM-ANSTGVHA
420 430 440 450 460 470
>>CCDS78073.1 SLC36A1 gene_id:206358|Hs108|chr5 (243 aa)
initn: 1605 init1: 1605 opt: 1605 Z-score: 1917.6 bits: 363.2 E(32554): 1.7e-100
Smith-Waterman score: 1605; 99.6% identity (100.0% similar) in 241 aa overlap (1-241:1-241)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSTQRLRNEDYHDYSSTDVSPEESPSEGLNNLSSPGSYQRFGQSNSTTWFQTLIHLLKGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MSTQRLRNEDYHDYSSTDVSPEESPSEGLNNLSSPGSYQRFGQSNSTTWFQTLIHLLKGN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 IGTGLLGLPLAVKNAGIVMGPISLLIIGIVAVHCMGILVKCAHHFCRRLNKSFVDYGDTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 IGTGLLGLPLAVKNAGIVMGPISLLIIGIVAVHCMGILVKCAHHFCRRLNKSFVDYGDTV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 MYGLESSPCSWLRNHAHWGRRVVDFFLIVTQLGFCCVYFVFLADNFKQVIEAANGTTNNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MYGLESSPCSWLRNHAHWGRRVVDFFLIVTQLGFCCVYFVFLADNFKQVIEAANGTTNNC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 HNNETVILTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVFIRNLRALSIFSLLANITMLASLVMIYQFIV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS78 HNNETVILTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVFIRNLRALSIFSLLANITMLVSLVMIYQFIV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 QRIPDPSHLPLVAPWKTYPLFFGTAIFSFEGIGMVLPLENKMKDPRKFPLILYLGMVIVT
:
CCDS78 QIL
>>CCDS8291.1 SLC36A4 gene_id:120103|Hs108|chr11 (504 aa)
initn: 1589 init1: 597 opt: 1603 Z-score: 1910.3 bits: 362.9 E(32554): 4.4e-100
Smith-Waterman score: 1609; 55.2% identity (80.4% similar) in 449 aa overlap (38-473:51-498)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 NEDYHDYSSTDVSPEESPSEGLNNLSSPGSYQRFGQSNSTTWFQTLIHLLKGNIGTGLLG
:: . .... .. :::.:::::::::::::
CCDS82 DVMRPLINEQNFDGTSDEEHEQELLPVQKHYQ-LDDQEGISFVQTLMHLLKGNIGTGLLG
30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LPLAVKNAGIVMGPISLLIIGIVAVHCMGILVKCAHHFCRRLNKSFVDYGDTVMYGLESS
::::.::::::.:::::..:::..:::: :::.:.: .: :..:: . :.::: ...: :
CCDS82 LPLAIKNAGIVLGPISLVFIGIISVHCMHILVRCSHFLCLRFKKSTLGYSDTVSFAMEVS
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 PCSWLRNHAHWGRRVVDFFLIVTQLGFCCVYFVFLADNFKQVIEA---ANGTTNNCHNNE
: : :...: ::: ::::::..:::::: ::.::::.: ::: :. .. .: :.
CCDS82 PWSCLQKQAAWGRSVVDFFLVITQLGFCSVYIVFLAENVKQVHEGFLESKVFISNSTNSS
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TVILTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVFIRNLRALSIFSLLANITMLASLVMIYQFIVQRIP
. ..: :.::: ::::..::::::.:. : ..:.:::..: .:::.:::..:. .:
CCDS82 NPCERRSVDLRIYMLCFLPFIILLVFIRELKNLFVLSFLANVSMAVSLVIIYQYVVRNMP
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 DPSHLPLVAPWKTYPLFFGTAIFSFEGIGMVLPLENKMKDPRKFPLILYLGMVIVTILYI
:: .::.:: :: ::::::::.:.:::::.::::::.::. ..:: : .:: ::: ::.
CCDS82 DPHNLPIVAGWKKYPLFFGTAVFAFEGIGVVLPLENQMKESKRFPQALNIGMGIVTTLYV
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 SLGCLGYLQFGANIQGSITLNLP-NCWLYQSVKLLYSIGIFFTYALQFYVPAEIIIPFFV
.:. :::. : .:.:::::::: . :::::::.:::.::: ::..::::::::::: ..
CCDS82 TLATLGYMCFHDEIKGSITLNLPQDVWLYQSVKILYSFGIFVTYSIQFYVPAEIIIPGIT
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 SRAPEHCELVVDLFVRTVLVCLTCILAILIPRLDLVISLVGSVSSSALALIIPPLLEVTT
:. . . . .. .:. :: .:: ::::::::.:::.::.::::.::::.:::.:. :
CCDS82 SKFHTKWKQICEFGIRSFLVSITCAGAILIPRLDIVISFVGAVSSSTLALILPPLVEILT
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470
pF1KE0 FYSEGMSPLTIFKDALISILGFVGFVVGTYEALYELIQPS--------NAPIF-INSTCA
: .: .. ..:. :.. : :::..::: .. :.: :. ..:.. .::::
CCDS82 FSKEHYNIWMVLKNISIAFTGVVGFLLGTYITVEEIIYPTPKVVAGTPQSPFLNLNSTCL
440 450 460 470 480 490
pF1KE0 FI
CCDS82 TSGLK
500
>>CCDS47316.1 SLC36A3 gene_id:285641|Hs108|chr5 (511 aa)
initn: 1473 init1: 1446 opt: 1451 Z-score: 1729.1 bits: 329.4 E(32554): 5.4e-90
Smith-Waterman score: 1830; 57.8% identity (78.4% similar) in 505 aa overlap (10-472:7-507)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MSTQRLRNEDYH-DYSSTDVSPEESPSEGLNNLSSPGSYQRFGQSNSTTWFQTLIHLLKG
::. . .: : .:. ::::. ....: . . :... . .::::::::
CCDS47 MSLLGRDYNSELNSLDNGPQ-SPSESSSSITSENVHPA-GEAG-LSMMQTLIHLLKC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 NIGTGLLGLPLAVKNAGIVMGPISLLIIGIVAVHCMGILVKCAHHFCRRLNKSFVDYGDT
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