Result of FASTA (omim) for
pF1KE0309
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0309, 574 aa
1>>>pF1KE0309 574 - 574 aa - 574 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8489+/-0.000453; mu= 21.9025+/- 0.028
mean_var=87.0045+/-19.064, 0's: 0 Z-trim(110.3): 390 B-trim: 913 in 1/52
Lambda= 0.137500
statistics sampled from 18216 (18669) to 18216 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.576), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16
Scan time: 9.920
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 iso ( 568) 1470 302.5 2.4e-81
NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 606) 1470 302.5 2.5e-81
XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 623) 1470 302.5 2.6e-81
NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568) 1469 302.3 2.8e-81
NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709) 1469 302.4 3.2e-81
NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755) 1469 302.4 3.3e-81
XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 1469 302.5 3.4e-81
XP_005262712 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 789) 1469 302.5 3.4e-81
XP_016876167 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 575) 1456 299.7 1.7e-80
NP_065917 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 isof ( 748) 1456 299.9 2e-80
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 1451 298.8 3.4e-80
NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 1451 298.8 3.4e-80
XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 1450 298.5 3.7e-80
XP_011512002 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 1449 298.5 5.4e-80
XP_016863765 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 1449 298.5 5.4e-80
XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 1449 298.5 5.4e-80
XP_016863763 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 1446 297.9 8.3e-80
XP_016863762 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 1446 297.9 8.3e-80
XP_011512001 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 1446 297.9 8.3e-80
NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 1426 293.8 1e-78
NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 1426 293.8 1e-78
XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 1419 292.4 2.9e-78
NP_950240 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 694) 1391 286.9 1.4e-76
NP_001273654 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 i ( 687) 1381 284.9 5.7e-76
XP_016876168 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 525) 1372 283.0 1.6e-75
NP_061990 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 718) 1367 282.2 4e-75
NP_476503 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 720) 1354 279.6 2.4e-74
NP_065854 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 isof ( 620) 1317 272.2 3.5e-72
NP_001278932 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 i ( 620) 1317 272.2 3.5e-72
NP_001244124 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 505) 1271 263.0 1.7e-69
XP_016863165 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 505) 1266 262.0 3.4e-69
NP_001154994 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 505) 1266 262.0 3.4e-69
NP_001290038 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 467) 1265 261.7 3.7e-69
XP_011508139 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 522) 1265 261.8 4e-69
XP_005260230 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 1225 253.9 1.1e-66
XP_011526754 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 1225 253.9 1.1e-66
NP_987096 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 1225 253.9 1.1e-66
NP_036421 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 1225 253.9 1.1e-66
XP_005260231 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 1225 253.9 1.1e-66
XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 471) 1212 251.2 5.4e-66
XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 526) 1212 251.3 5.9e-66
XP_011529878 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 496) 1204 249.7 1.7e-65
NP_001317953 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 496) 1204 249.7 1.7e-65
XP_016863164 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 415) 1165 241.8 3.2e-63
NP_001278935 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 i ( 544) 1044 218.0 6.4e-56
NP_001026880 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-li ( 586) 1044 218.0 6.8e-56
NP_001317952 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 427) 1036 216.3 1.6e-55
XP_016867928 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 564) 1008 210.8 9.3e-54
XP_016862148 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 990 207.3 1.2e-52
XP_011511240 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 990 207.3 1.2e-52
>>NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 isoform (568 aa)
initn: 1799 init1: 765 opt: 1470 Z-score: 1581.4 bits: 302.5 E(85289): 2.4e-81
Smith-Waterman score: 1470; 41.7% identity (71.4% similar) in 545 aa overlap (28-569:23-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVEDGAEELEDLVHFSVSELPSRGYGVMEEIRRQGKLCDVTLKIGDHKFSAHRIVLAASI
:. .:... ::::::.. .. : ::::::::
NP_067 MGGIMAPKDIMTNTHAKSILNSMNSLRKSNTLCDVTLRVEQKDFPAHRIVLAACS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 PYFHAMFTNDMMECKQDEIVMQGMDPSALEALINFAYNGNLAIDQQNVQSLLMGASFLQL
:: ::::... : . . .::. :..: :..:.:. .. . .::: :: .: .:::
NP_067 DYFCAMFTSELSEKGKPYVDIQGLTASTMEILLDFVYTETVHVTVENVQELLPAACLLQL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QSIKDACCTFLRERLHPKNCLGVRQFAETMMCAVLYDAANSFIHQHFVEVSMSEEFLALP
...:.::: ::. .: :.::::.:.:::: :. :..::. : ..:: :: . :::. :
NP_067 KGVKQACCEFLESQLDPSNCLGIRDFAETHNCVDLMQAAEVFSQKHFPEVVQHEEFILLS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LEDVLELVSRDELNVKSEEQVFEAALAWVRYDREQRGPYLPELLSNIRLPLCRPQFLSDR
.: .:.. ::..: ::: ::::.. ::.. ...: ::.::. .:.:: :....:
NP_067 QGEVEKLIKCDEIQVDSEEPVFEAVINWVKHAKKEREESLPNLLQYVRMPLLTPRYITDV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VQQDDLVRCCHKCRDLVDEAKDYHLMPERRPHLPAFRTRPRCCTSIAGLIYAVGGLNSAG
.. . ..:: .::::::::: .:: :: : .. . ::: : .. . :. :::..:
NP_067 IDAEPFIRCSLQCRDLVDEAKKFHLRPELRSQMQGPRTRARLGANEVLLV--VGGFGSQQ
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE0 DSLNVVEVFDPIANCWERCRPMTTARSRVGVAVVNGLLYAIGGYDGQLRLSTVEA--YNP
. ..::: .:: .. : .: : :. . .. .:.::::::. :::.:: :.
NP_067 SPIDVVEKYDPKTQEWSFLPSITRKRRYVASVSLHDRIYVIGGYDGRSRLSSVECLDYTA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 ETD-TWTRVGSMNSKRSAMGTVVLDGQIYVCGGYDGNSSLSSVETYSPETDKWTVVTSMS
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NP_067 DEDGVWYSVAPMNVRRGLAGATTLGDMIYVSGGFDGSRRHTSMERYDPNIDQWSMLGDMQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 SNRSAAGVTVFEGRIYVSGGHDGLQIFSSVEHYNHHTATWHPAAGMLNKRCRHGAASLGS
. : .::..: : :: ::.:::.:..:::.:. ::. : .. : .:: :.: :..
NP_067 TAREGAGLVVASGVIYCLGGYDGLNILNSVEKYDPHTGHWTNVTPMATKRSGAGVALLND
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 KMFVCGGYDGSGFLSIAEMYSSVADQWCLIVPMHTRRSRVSLVASCGRLYAVGGYDGQSN
...: ::.::.. :: .: :. .:.: .. : : : :. .. :::::..::::.:
NP_067 HIYVVGGFDGTAHLSSVEAYNIRTDSWTTVTSMTTPRCYVGATVLRGRLYAIAGYDGNSL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570
pF1KE0 LSSVEMYDPETDCWTFMAPMACHEGGVGVGCIPLLTI
:::.: ::: : : .. :. .. .:: :.
NP_067 LSSIECYDPIIDSWEVVTSMGTQRCDAGV-CVLREK
540 550 560
>>NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 isof (606 aa)
initn: 1799 init1: 765 opt: 1470 Z-score: 1581.0 bits: 302.5 E(85289): 2.5e-81
Smith-Waterman score: 1470; 41.7% identity (71.4% similar) in 545 aa overlap (28-569:61-602)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MVEDGAEELEDLVHFSVSELPSRGYGVMEEIRRQGKLCDVTLKIGDHKFSAHRIVLA
:. .:... ::::::.. .. : :::::::
NP_001 FVLSPHCFMGGIMAPKDIMTNTHAKSILNSMNSLRKSNTLCDVTLRVEQKDFPAHRIVLA
40 50 60 70 80 90
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 ASIPYFHAMFTNDMMECKQDEIVMQGMDPSALEALINFAYNGNLAIDQQNVQSLLMGASF
: :: ::::... : . . .::. :..: :..:.:. .. . .::: :: .: .
NP_001 ACSDYFCAMFTSELSEKGKPYVDIQGLTASTMEILLDFVYTETVHVTVENVQELLPAACL
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120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LQLQSIKDACCTFLRERLHPKNCLGVRQFAETMMCAVLYDAANSFIHQHFVEVSMSEEFL
:::...:.::: ::. .: :.::::.:.:::: :. :..::. : ..:: :: . :::.
NP_001 LQLKGVKQACCEFLESQLDPSNCLGIRDFAETHNCVDLMQAAEVFSQKHFPEVVQHEEFI
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180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ALPLEDVLELVSRDELNVKSEEQVFEAALAWVRYDREQRGPYLPELLSNIRLPLCRPQFL
: .: .:.. ::..: ::: ::::.. ::.. ...: ::.::. .:.:: :...
NP_001 LLSQGEVEKLIKCDEIQVDSEEPVFEAVINWVKHAKKEREESLPNLLQYVRMPLLTPRYI
220 230 240 250 260 270
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SDRVQQDDLVRCCHKCRDLVDEAKDYHLMPERRPHLPAFRTRPRCCTSIAGLIYAVGGLN
.: .. . ..:: .::::::::: .:: :: : .. . ::: : .. . :. :::..
NP_001 TDVIDAEPFIRCSLQCRDLVDEAKKFHLRPELRSQMQGPRTRARLGANEVLLV--VGGFG
280 290 300 310 320
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pF1KE0 SAGDSLNVVEVFDPIANCWERCRPMTTARSRVGVAVVNGLLYAIGGYDGQLRLSTVEA--
: . ..::: .:: .. : .: : :. . .. .:.::::::. :::.::
NP_001 SQQSPIDVVEKYDPKTQEWSFLPSITRKRRYVASVSLHDRIYVIGGYDGRSRLSSVECLD
330 340 350 360 370 380
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 YNPETD-TWTRVGSMNSKRSAMGTVVLDGQIYVCGGYDGNSSLSSVETYSPETDKWTVVT
:. . : .: :. :: .:. :...: .::: ::.::. .:.: :.:. :.:...
NP_001 YTADEDGVWYSVAPMNVRRGLAGATTLGDMIYVSGGFDGSRRHTSMERYDPNIDQWSMLG
390 400 410 420 430 440
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 SMSSNRSAAGVTVFEGRIYVSGGHDGLQIFSSVEHYNHHTATWHPAAGMLNKRCRHGAAS
.:.. : .::..: : :: ::.:::.:..:::.:. ::. : .. : .:: :.:
NP_001 DMQTAREGAGLVVASGVIYCLGGYDGLNILNSVEKYDPHTGHWTNVTPMATKRSGAGVAL
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pF1KE0 LGSKMFVCGGYDGSGFLSIAEMYSSVADQWCLIVPMHTRRSRVSLVASCGRLYAVGGYDG
:.....: ::.::.. :: .: :. .:.: .. : : : :. .. :::::..::::
NP_001 LNDHIYVVGGFDGTAHLSSVEAYNIRTDSWTTVTSMTTPRCYVGATVLRGRLYAIAGYDG
510 520 530 540 550 560
540 550 560 570
pF1KE0 QSNLSSVEMYDPETDCWTFMAPMACHEGGVGVGCIPLLTI
.: :::.: ::: : : .. :. .. .:: :.
NP_001 NSLLSSIECYDPIIDSWEVVTSMGTQRCDAGV-CVLREK
570 580 590 600
>>XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like prot (623 aa)
initn: 1799 init1: 765 opt: 1470 Z-score: 1580.9 bits: 302.5 E(85289): 2.6e-81
Smith-Waterman score: 1470; 41.7% identity (71.4% similar) in 545 aa overlap (28-569:78-619)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MVEDGAEELEDLVHFSVSELPSRGYGVMEEIRRQGKLCDVTLKIGDHKFSAHRIVLA
:. .:... ::::::.. .. : :::::::
XP_011 FVLSPHCFMGGIMAPKDIMTNTHAKSILNSMNSLRKSNTLCDVTLRVEQKDFPAHRIVLA
50 60 70 80 90 100
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 ASIPYFHAMFTNDMMECKQDEIVMQGMDPSALEALINFAYNGNLAIDQQNVQSLLMGASF
: :: ::::... : . . .::. :..: :..:.:. .. . .::: :: .: .
XP_011 ACSDYFCAMFTSELSEKGKPYVDIQGLTASTMEILLDFVYTETVHVTVENVQELLPAACL
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LQLQSIKDACCTFLRERLHPKNCLGVRQFAETMMCAVLYDAANSFIHQHFVEVSMSEEFL
:::...:.::: ::. .: :.::::.:.:::: :. :..::. : ..:: :: . :::.
XP_011 LQLKGVKQACCEFLESQLDPSNCLGIRDFAETHNCVDLMQAAEVFSQKHFPEVVQHEEFI
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ALPLEDVLELVSRDELNVKSEEQVFEAALAWVRYDREQRGPYLPELLSNIRLPLCRPQFL
: .: .:.. ::..: ::: ::::.. ::.. ...: ::.::. .:.:: :...
XP_011 LLSQGEVEKLIKCDEIQVDSEEPVFEAVINWVKHAKKEREESLPNLLQYVRMPLLTPRYI
230 240 250 260 270 280
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SDRVQQDDLVRCCHKCRDLVDEAKDYHLMPERRPHLPAFRTRPRCCTSIAGLIYAVGGLN
.: .. . ..:: .::::::::: .:: :: : .. . ::: : .. . :. :::..
XP_011 TDVIDAEPFIRCSLQCRDLVDEAKKFHLRPELRSQMQGPRTRARLGANEVLLV--VGGFG
290 300 310 320 330 340
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pF1KE0 SAGDSLNVVEVFDPIANCWERCRPMTTARSRVGVAVVNGLLYAIGGYDGQLRLSTVEA--
: . ..::: .:: .. : .: : :. . .. .:.::::::. :::.::
XP_011 SQQSPIDVVEKYDPKTQEWSFLPSITRKRRYVASVSLHDRIYVIGGYDGRSRLSSVECLD
350 360 370 380 390 400
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 YNPETD-TWTRVGSMNSKRSAMGTVVLDGQIYVCGGYDGNSSLSSVETYSPETDKWTVVT
:. . : .: :. :: .:. :...: .::: ::.::. .:.: :.:. :.:...
XP_011 YTADEDGVWYSVAPMNVRRGLAGATTLGDMIYVSGGFDGSRRHTSMERYDPNIDQWSMLG
410 420 430 440 450 460
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 SMSSNRSAAGVTVFEGRIYVSGGHDGLQIFSSVEHYNHHTATWHPAAGMLNKRCRHGAAS
.:.. : .::..: : :: ::.:::.:..:::.:. ::. : .. : .:: :.:
XP_011 DMQTAREGAGLVVASGVIYCLGGYDGLNILNSVEKYDPHTGHWTNVTPMATKRSGAGVAL
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480 490 500 510 520 530
pF1KE0 LGSKMFVCGGYDGSGFLSIAEMYSSVADQWCLIVPMHTRRSRVSLVASCGRLYAVGGYDG
:.....: ::.::.. :: .: :. .:.: .. : : : :. .. :::::..::::
XP_011 LNDHIYVVGGFDGTAHLSSVEAYNIRTDSWTTVTSMTTPRCYVGATVLRGRLYAIAGYDG
530 540 550 560 570 580
540 550 560 570
pF1KE0 QSNLSSVEMYDPETDCWTFMAPMACHEGGVGVGCIPLLTI
.: :::.: ::: : : .. :. .. .:: :.
XP_011 NSLLSSIECYDPIIDSWEVVTSMGTQRCDAGV-CVLREK
590 600 610 620
>>NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isofo (568 aa)
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10 20 30 40 50 60
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:: ::::::. : .:.:: :.:..:..: .::..::.: : . ..:.. :: : .:::
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... .::: :: ..:::.::::.:.::... :. :. .:... .::.:: ..::. ::
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.. .:.. :..:. .:: ...: :.:::.: ::: : .::. ::::: ::::.:
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.... : : .:. :. :: :::.::::: : . ::.:: : .: ..::::..:.
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. ::.:. :.. : .: :. .:.: .. : :. :.. .:::::::::
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:::... .::: :: ..:::.::::.:.::... :. :. .:... .::.:: ..::.
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:: .. .:.. :..:. .:: ...: :.:::.: ::: : .::. ::::: ::::
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.: .... : : .:. :. :: :::.::::: : . ::.:: : .: ..::::..
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:. . .. : .: .: : :. : . ::::.. ::..:: :: :.::: ::
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:.: ::. . :...: ..:..::.: .:. ::.:: : :..:: ..:.. .:. :..::
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... ::.:. :.. : .: :. .:.: .. : :. :.. .::::::
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>>NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isoform (755 aa)
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:: .. .:.. :..:. .:: ...: :.:::.: ::: : .::. ::::: ::::
NP_057 LLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIRLPLLAPQFL
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NP_057 AD-MENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPRTKPR--KSTVGTLFAVGGMD
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NP_057 STKGATSI-EKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTLNTVECYN
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pF1KE0 PETDTWTRVGSMNSKRSAMGTVVLDGQIYVCGGYDGNSSLSSVETYSPETDKWTVVTSMS
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... ::.:. :.. : .: :. .:.: .. : :. :.. .::::::
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::::. :..:: :::.:. :: .::. ..:. : . :
NP_057 YDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL
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>>XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like prot (788 aa)
initn: 1769 init1: 683 opt: 1469 Z-score: 1578.6 bits: 302.5 E(85289): 3.4e-81
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XP_016 AD-MENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPRTKPR--KSTVGTLFAVGGMD
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XP_016 YDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL
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XP_005 SVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIECLLSTACL
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pF1KE0 LQLQSIKDACCTFLRERLHPKNCLGVRQFAETMMCAVLYDAANSFIHQHFVEVSMSEEFL
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>>XP_016876167 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like prot (575 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE0 MVEDGAEELEDLVHFSVSELPSRGYGVMEEIRRQGKLCDVTLKIGDHKFSAHRI
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10 20 30 40 50
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pF1KE0 VLAASIPYFHAMFTNDMMECKQDEIVMQGMDPSALEALINFAYNGNLAIDQQNVQSLLMG
::.. :: ::::.:. : ::.:: :.:.::.:: :..:::.: : . ......:: .
XP_016 VLSSVSDYFAAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELKEDTIENLLAA
60 70 80 90 100 110
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: .::: .. ..:: :: . :::.::::.: ::... : :. .:.:. ....:: ..
XP_016 ACLLQLPQVVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTMENIMEVIRNQ
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::: :: :.. .:.. :..:: .:: .:.: . ::.:: ..: : ::. ::::: :
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:.:.: ... : . .:. :. :: :::.:::: . . ::.:: : .: .::::
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.::: ::..::....:..: ::.:: . .::.:.:. :: :. : : ..: :.:
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. . ... ::.:. : .:. .: :. .: : ...:. :. :.. :::
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::::::::. :...: :::.:. :: :: . ..:. :
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>>NP_065917 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 isoform (748 aa)
initn: 1777 init1: 650 opt: 1456 Z-score: 1564.9 bits: 299.9 E(85289): 2e-80
Smith-Waterman score: 1456; 40.8% identity (70.1% similar) in 568 aa overlap (6-566:185-742)
10 20 30
pF1KE0 MVEDGAEELEDLVHFSVSELPSRGYGVMEEIRRQG
.::. . :: . . . :: .:
NP_065 SSQATGEGCGHRLSSTGHSMTPQSDLDSSSSEEFYQAVHHA-----EQTFRKMESYLKQQ
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pF1KE0 KLCDVTLKIGDHKFSAHRIVLAASIPYFHAMFTNDMMECKQDEIVMQGMDPSALEALINF
.:::: : .:..:. :::.::.. :: ::::.:. : ::.:: :.:.::.:: :..:
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::.: : . ......:: .: .::: .. ..:: :: . :::.::::.: ::... : :
NP_065 AYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQVVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIEL
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. .:.:. ....:: ..::: :: :.. .:.. :..:: .:: .:.: . ::.:: ..
NP_065 MKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAEELHKLLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQS
330 340 350 360 370 380
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: : ::. ::::: ::.:.: ... : . .:. :. :: :::.:::: . .
NP_065 RCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILAD-LENHALFKNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQS
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pF1KE0 PMHTRRSRVSLVASCGRLYAVGGYDGQSNLSSVEMYDPETDCWTFMAPMACHEGGVGVGC
:. :. :.. :::::::::::. :...: :::.:. :: :: . ..:. :
NP_065 PLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESYDPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVV
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570
pF1KE0 IPLLTI
NP_065 IKQP
574 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 16:21:37 2016 done: Thu Nov 3 16:21:38 2016
Total Scan time: 9.920 Total Display time: 0.170
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]