FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0323, 844 aa 1>>>pF1KE0323 844 - 844 aa - 844 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6095+/-0.000969; mu= 10.3872+/- 0.058 mean_var=143.9215+/-29.944, 0's: 0 Z-trim(109.3): 114 B-trim: 106 in 1/51 Lambda= 0.106908 statistics sampled from 10652 (10768) to 10652 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.331), width: 16 Scan time: 4.270 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2902.1 PRICKLE2 gene_id:166336|Hs108|chr3 ( 844) 5886 920.2 0 CCDS8742.1 PRICKLE1 gene_id:144165|Hs108|chr12 ( 831) 2477 394.4 4.3e-109 CCDS14320.1 PRICKLE3 gene_id:4007|Hs108|chrX ( 615) 1874 301.3 3.3e-81 CCDS78481.1 PRICKLE3 gene_id:4007|Hs108|chrX ( 547) 1846 297.0 6.1e-80 CCDS34449.1 PRICKLE4 gene_id:29964|Hs108|chr6 ( 384) 746 127.2 5.4e-29 CCDS5764.1 TES gene_id:26136|Hs108|chr7 ( 412) 710 121.7 2.7e-27 CCDS5763.1 TES gene_id:26136|Hs108|chr7 ( 421) 710 121.7 2.7e-27 CCDS63533.1 LMCD1 gene_id:29995|Hs108|chr3 ( 253) 445 80.7 3.6e-15 CCDS63534.1 LMCD1 gene_id:29995|Hs108|chr3 ( 292) 445 80.7 4.1e-15 CCDS33688.1 LMCD1 gene_id:29995|Hs108|chr3 ( 365) 445 80.8 4.9e-15 CCDS30678.1 FHL3 gene_id:2275|Hs108|chr1 ( 280) 398 73.4 6e-13 CCDS14655.1 FHL1 gene_id:2273|Hs108|chrX ( 280) 355 66.8 5.9e-11 CCDS55506.1 FHL1 gene_id:2273|Hs108|chrX ( 296) 355 66.8 6.2e-11 CCDS55505.1 FHL1 gene_id:2273|Hs108|chrX ( 309) 355 66.8 6.4e-11 >>CCDS2902.1 PRICKLE2 gene_id:166336|Hs108|chr3 (844 aa) initn: 5886 init1: 5886 opt: 5886 Z-score: 4913.6 bits: 920.2 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5886; 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CCDS87 SSMLHRSAESLKSLSSELCPEKILPEEKPVHLPVLRRS-KSQSR-PQQVKFSDDVIDNGN 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KE0 PGQEGVRIQPMSERTRRRATSRDD-NRRFRPHRSRRSRRSRSDNALHLASEREAISRLKD : .: :::::::::. . .. . : . :: ::::.:::::::.:..::. :: CCDS87 YDIE-IRQPPMSERTRRRVYNFEERGSRSHHHRRRRSRKSRSDNALNLVTERKYSP--KD 650 660 670 680 690 720 730 740 750 760 770 pF1KE0 RPPLRAREDYDQFMRQRSFQESMGHGSRRDLYGQCPRTVSDLALQNAFGDRWGPYFAEYD : : . ..:..:....: .: ... . ::::: ...:: .::: .:. ..: : CCDS87 RLRLYTPDNYEKFIQNKSAREIQAYIQNADLYGQYAHATSDYGLQNPGMNRFLGLYGEDD 700 710 720 730 740 750 780 790 800 810 820 830 pF1KE0 --WCSTCSSSSESDNEGYFLGEPIPQPARLRYVT-SDELLHKYSSYGLPKSSTLGGRGQL :::. ::::.:..::::::.::::: :.. .:.: :. :. .: : CCDS87 DSWCSSSSSSSDSEEEGYFLGQPIPQPRPQRFAYYTDDLSSPPSALPTPQ---FGQRTTK 760 770 780 790 800 810 840 pF1KE0 HSRKR-QKSKNCIIS ..:. .:.:::::: CCDS87 SKKKKGHKGKNCIIS 820 830 >>CCDS14320.1 PRICKLE3 gene_id:4007|Hs108|chrX (615 aa) initn: 1914 init1: 1841 opt: 1874 Z-score: 1571.3 bits: 301.3 E(32554): 3.3e-81 Smith-Waterman score: 1874; 50.6% identity (71.2% similar) in 559 aa overlap (2-543:58-599) 10 20 30 pF1KE0 MVTVMPLEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSG : ..:...:. . .:. ::::.: :::::: CCDS14 NSCREQCPGFLLHGWRKICQHCKCPREEHAVHAVPVDLERIMCRLISDFQRHSISDDDSG 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 90 pF1KE0 CALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEKVPYVNSPGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCN :: :::::::::::::::.:..:::::.::::::::::: :::::::::::::.:..::. CCDS14 CASEEYAWVPPGLKPEQVYQFFSCLPEDKVPYVNSPGEKYRIKQLLHQLPPHDSEAQYCT 90 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 150 pF1KE0 SLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNVRPFPVTMTGAICEQCGGQINGGDIAVFASRAGH .:.::::.::. ::.:::::::::: :: ::::.::::::.:: ::.:::::::::::: CCDS14 ALEEEEKKELRAFSQQRKRENLGRGIVRIFPVTITGAICEECGKQIGGGDIAVFASRAGL 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 pF1KE0 GVCWHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAE :.:::: ::: :.:.::::::::::. ::.::::::::::.::: :::::::. :::::: CCDS14 GACWHPQCFVCTTCQELLVDLIYFYHVGKVYCGRHHAECLRPRCQACDEIIFSPECTEAE 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 pF1KE0 GRHWHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTY :::::: ::::::::. ::::::.:...::.:: :.:. .::::: :..:::.:::::.: CCDS14 GRHWHMDHFCCFECEASLGGQRYVMRQSRPHCCACYEARHAEYCDGCGEHIGLDQGQMAY 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 pF1KE0 DGQHWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPKQGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNA-- .::::::.. ::::..: ..::::::::..: :::::::: : .:.. : ... . CCDS14 EGQHWHASDRCFCCSRCGRALLGRPFLPRRGLIFCSRACSLGSEPTAPGPSRRSWSAGPV 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 pF1KE0 RAKESRRSAKIGKNKGKTEEPMLNQHSQLQVSS-----NRLSADVDPLSLQMDMLSLSSQ : . .:... :: .: . ..: .. .:. . : .: :.: : CCDS14 TAPLAASTASFSAVKGASETTTKGTSTELAPATGPEEPSRFLRGA-PHRHSMPELGLRS- 390 400 410 420 430 440 390 400 410 420 430 440 pF1KE0 TPSLNRDPIWRSREEPYHYGNKMEQNQTQSPLQLLSQCNIRTSY-SPGG--QGAGAQPEM .: .: .: .: ... ... : . ..: : :: . .: : . CCDS14 VP----EPPPESPGQP-----NLRPDDSAFGRQSTPRVSFRDPLVSEGGPRRTLSAPPAQ 450 460 470 480 490 450 460 470 480 490 500 pF1KE0 WGKHFSNPKRSSSLAMTGHAGSFIKECREDYYPGRLRSQESYSDMSSQSFSETRGSIQVP . : : :. : : . .. : .:.: : . : .: : ::. .: CCDS14 RRRPRSPPPRAPSRRRHHHHNHHHHHNR---HPSRRRHYQ--CDAGSGSDSESCSSSPSS 500 510 520 530 540 550 510 520 530 540 550 pF1KE0 KYEEEEEEEG---G----LSTQQCRTRHPISSLKYTEDMTPTEQTPRGSMESLALSNATG . : :..: : : . :: : .. . .:. . :: : CCDS14 SSSESSEDDGFFLGERIPLPPHLCRP-MPAQDTAMETFNSPSLSLPRDSRAGMPRQARDK 560 570 580 590 600 610 560 570 580 590 600 610 pF1KE0 LSADGGAKRQEHLSRFSMPDLSKDSGMNVSEKLSNMGTLNSSMQFRSAESVRSLLSAQQY CCDS14 NCIVA >>CCDS78481.1 PRICKLE3 gene_id:4007|Hs108|chrX (547 aa) initn: 1886 init1: 1813 opt: 1846 Z-score: 1548.7 bits: 297.0 E(32554): 6.1e-80 Smith-Waterman score: 1846; 51.1% identity (71.0% similar) in 548 aa overlap (13-543:1-531) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MVTVMPLEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEK . .:. ::::.: :::::::: :::::::::::::::.:..:::::.: CCDS78 MCRLISDFQRHSISDDDSGCASEEYAWVPPGLKPEQVYQFFSCLPEDK 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 VPYVNSPGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNVRP :::::::::: :::::::::::::.:..::..:.::::.::. ::.:::::::::: :: CCDS78 VPYVNSPGEKYRIKQLLHQLPPHDSEAQYCTALEEEEKKELRAFSQQRKRENLGRGIVRI 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 FPVTMTGAICEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVCWHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGK ::::.::::::.:: ::.:::::::::::: :.:::: ::: :.:.::::::::::. :: CCDS78 FPVTITGAICEECGKQIGGGDIAVFASRAGLGACWHPQCFVCTTCQELLVDLIYFYHVGK 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 IYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGRHWHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGR .::::::::::.::: :::::::. :::::::::::: ::::::::. ::::::.:...: CCDS78 VYCGRHHAECLRPRCQACDEIIFSPECTEAEGRHWHMDHFCCFECEASLGGQRYVMRQSR 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 PYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDGQHWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPK :.:: :.:. .::::: :..:::.:::::.:.::::::.. ::::..: ..::::::::. CCDS78 PHCCACYEARHAEYCDGCGEHIGLDQGQMAYEGQHWHASDRCFCCSRCGRALLGRPFLPR 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 pF1KE0 QGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNA--RAKESRRSAKIGKNKGKTEEPMLNQHSQL .: :::::::: : .:.. : ... . : . .:... :: .: . ..: CCDS78 RGLIFCSRACSLGSEPTAPGPSRRSWSAGPVTAPLAASTASFSAVKGASETTTKGTSTEL 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 QVSS-----NRLSADVDPLSLQMDMLSLSSQTPSLNRDPIWRSREEPYHYGNKMEQNQTQ .. .:. . : .: :.: : .: .: .: .: ... ... CCDS78 APATGPEEPSRFLRGA-PHRHSMPELGLRS-VP----EPPPESPGQP-----NLRPDDSA 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KE0 SPLQLLSQCNIRTSY-SPGG--QGAGAQPEMWGKHFSNPKRSSSLAMTGHAGSFIKECRE : . ..: : :: . .: : . . : : :. : : . .. : CCDS78 FGRQSTPRVSFRDPLVSEGGPRRTLSAPPAQRRRPRSPPPRAPSRRRHHHHNHHHHHNR- 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 pF1KE0 DYYPGRLRSQESYSDMSSQSFSETRGSIQVPKYEEEEEEEG---G----LSTQQCRTRHP .:.: : . : .: : ::. .: . : :..: : : . :: : CCDS78 --HPSRRRHYQC--DAGSGSDSESCSSSPSSSSSESSEDDGFFLGERIPLPPHLCRP-MP 460 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 580 pF1KE0 ISSLKYTEDMTPTEQTPRGSMESLALSNATGLSADGGAKRQEHLSRFSMPDLSKDSGMNV .. . .:. . :: : CCDS78 AQDTAMETFNSPSLSLPRDSRAGMPRQARDKNCIVA 520 530 540 >>CCDS34449.1 PRICKLE4 gene_id:29964|Hs108|chr6 (384 aa) initn: 820 init1: 723 opt: 746 Z-score: 634.1 bits: 127.2 E(32554): 5.4e-29 Smith-Waterman score: 746; 44.3% identity (65.6% similar) in 253 aa overlap (24-268:24-259) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MVTVMPLEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYS------ ..::.::: :: ::..: CCDS34 MSVQNSGWPHQEDSPKPQDPGPPANSDSDSGHL--------PGEDPEDTHAQGPAVLSLG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 --CLPEEKVPYVNSPGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKREN :: ...: : : .. ::.::::.: . ::: .: :::. ::.:: ..::.: CCDS34 SLCLDTNQAP--NWTG----LQTLLQQLPPQDIDERYCLALGEEERAELQLFCARRKQEA 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 LGRGNVRPFPVTMTGAICEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVCWHPPCFVRTVCNELLVDL ::.: .: . : ::.: .. :. .:::.:::. ::: :::. .:.. :..: CCDS34 LGQGVARLVLPKLEGHTCEKCRELLKPGEYGVFAARAGEQRCWHQPCFACQACGQALINL 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 IYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGRHWHMKHFCCFECETVLGGQ ::::.::..:::::::: :.::: :::..::. .::::::..:: .:::: .: ::: CCDS34 IYFYHDGQLYCGRHHAELLRPRCPACDQLIFSWRCTEAEGQRWHENHFCCQDCAGPLGGG 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 RYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDGQHWHATETCFCCAHCKKSL :: . : : : :::. .: :. .. : .:: CCDS34 RYALPGGSPCCPSCFEN---RYSDAGSSWAGALEGQAFLGETGLDRTEGRDQTSVNSATL 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 LGRPFLPKQGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNARAKESRRSAKIGKNKGKTEEPML CCDS34 SRTLLAAAGGSSLQTQRGLPGSSPQQENRPGDKAEAPKGQEQCRLETIRDPKDTPFSTCS 290 300 310 320 330 340 >>CCDS5764.1 TES gene_id:26136|Hs108|chr7 (412 aa) initn: 950 init1: 694 opt: 710 Z-score: 603.6 bits: 121.7 E(32554): 2.7e-27 Smith-Waterman score: 863; 39.1% identity (64.8% similar) in 307 aa overlap (37-310:102-407) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 LEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEKVPYVNS : :.:: . ..::.. ::.:: : ..: CCDS57 SDGIPMYKRNVMILTNPVAAKKNVSINTVTYEWAPPVQNQALARQYMQMLPKEKQPVAGS 80 90 100 110 120 130 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 PGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNVRPFPVTM- : . : ::: .::: ::.. :. :. .: .:.. : .. : : :: :.:. .: : CCDS57 EGAQYRKKQLAKQLPAHDQDPSKCHELSPREVKEMEQFVKKYKSEALGVGDVK-LPCEMD 140 150 160 170 180 190 130 140 150 pF1KE0 -------------------TGAI-------------CEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGV .::. : : ... :: :..: :::. CCDS57 AQGPKQMNIPGGDRSTPAAVGAMEDKSAEHKRTQYSCYCCKLSMKEGDPAIYAERAGYDK 200 210 220 230 240 250 160 170 180 190 200 210 pF1KE0 CWHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGR ::: ::: ..:.:::::.:::... :.:::::. . :::::.:::.::..: :.::.. CCDS57 LWHPACFVCSTCHELLVDMIYFWKNEKLYCGRHYCDSEKPRCAGCDELIFSNEYTQAENQ 260 270 280 290 300 310 220 230 240 250 260 270 pF1KE0 HWHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDG .::.::::::.:...:.:. :.: . .: : :. . .: :. : . : . ..::.. CCDS57 NWHLKHFCCFDCDSILAGEIYVMVNDKPVCKPCYVKNHAVVCQGCHNAIDPEVQRVTYNN 320 330 340 350 360 370 280 290 300 310 320 330 pF1KE0 QHWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPKQGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNARAKE :::. :: :. :.: :.:. :.: .:..::: : CCDS57 FSWHASTECFLCSCCSKCLIGQKFMPVEGMVFCSVECKKRMS 380 390 400 410 340 350 360 370 380 390 pF1KE0 SRRSAKIGKNKGKTEEPMLNQHSQLQVSSNRLSADVDPLSLQMDMLSLSSQTPSLNRDPI >>CCDS5763.1 TES gene_id:26136|Hs108|chr7 (421 aa) initn: 950 init1: 694 opt: 710 Z-score: 603.5 bits: 121.7 E(32554): 2.7e-27 Smith-Waterman score: 863; 39.1% identity (64.8% similar) in 307 aa overlap (37-310:111-416) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 LEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEKVPYVNS : :.:: . ..::.. ::.:: : ..: CCDS57 SDGIPMYKRNVMILTNPVAAKKNVSINTVTYEWAPPVQNQALARQYMQMLPKEKQPVAGS 90 100 110 120 130 140 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 PGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNVRPFPVTM- : . : ::: .::: ::.. :. :. .: .:.. : .. : : :: :.:. .: : CCDS57 EGAQYRKKQLAKQLPAHDQDPSKCHELSPREVKEMEQFVKKYKSEALGVGDVK-LPCEMD 150 160 170 180 190 130 140 150 pF1KE0 -------------------TGAI-------------CEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGV .::. : : ... :: :..: :::. CCDS57 AQGPKQMNIPGGDRSTPAAVGAMEDKSAEHKRTQYSCYCCKLSMKEGDPAIYAERAGYDK 200 210 220 230 240 250 160 170 180 190 200 210 pF1KE0 CWHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGR ::: ::: ..:.:::::.:::... :.:::::. . :::::.:::.::..: :.::.. CCDS57 LWHPACFVCSTCHELLVDMIYFWKNEKLYCGRHYCDSEKPRCAGCDELIFSNEYTQAENQ 260 270 280 290 300 310 220 230 240 250 260 270 pF1KE0 HWHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDG .::.::::::.:...:.:. :.: . .: : :. . .: :. : . : . ..::.. CCDS57 NWHLKHFCCFDCDSILAGEIYVMVNDKPVCKPCYVKNHAVVCQGCHNAIDPEVQRVTYNN 320 330 340 350 360 370 280 290 300 310 320 330 pF1KE0 QHWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPKQGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNARAKE :::. :: :. :.: :.:. :.: .:..::: : CCDS57 FSWHASTECFLCSCCSKCLIGQKFMPVEGMVFCSVECKKRMS 380 390 400 410 420 340 350 360 370 380 390 pF1KE0 SRRSAKIGKNKGKTEEPMLNQHSQLQVSSNRLSADVDPLSLQMDMLSLSSQTPSLNRDPI >>CCDS63533.1 LMCD1 gene_id:29995|Hs108|chr3 (253 aa) initn: 613 init1: 423 opt: 445 Z-score: 385.8 bits: 80.7 E(32554): 3.6e-15 Smith-Waterman score: 548; 38.1% identity (59.3% similar) in 231 aa overlap (51-249:20-250) 30 40 50 60 70 80 pF1KE0 QRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEKVPYVNSPGEKLRIKQLLHQL ::. .:.:: : ... : : .::.::: CCDS63 MFGMQGDVFGLRATFMEGLQYMELIPKEKQPVTGTEGAFYRRRQLMHQL 10 20 30 40 90 100 110 120 pF1KE0 PPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNV-----------------RPFPV : .:.. : .: :.: . .. : .: : : :: :.: .: . CCDS63 PIYDQDPSRCRGLLENELKLMEEFVKQYKSEALGVGEVALPGQGGLPKEEGKQQEKPEGA 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 pF1KE0 TMTGA---------------ICEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVCWHPPCFVRTVCNEL :.: .:: : : . .:...:::.. ::: ::: . :.: CCDS63 ETTAATTNGSLSDPSKEVEYVCELCKGAAPPDSPVVYSDRAGYNKQWHPTCFVCAKCSEP 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE0 LVDLIYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGRHWHMKHFCCFECETV :::::::..:: .::::. : :.:::..:::::::.. ..: :: ::: : :: . CCDS63 LVDLIYFWKDGAPWCGRHYCESLRPRCSGCDEIIFAEDYQRVEDLAWHRKHFVCEGCEQL 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE0 LGGQRYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDGQHWHATETCFCCAHC :.:. ::. .:. : : .: CCDS63 LSGRAYIVTKGQLLCPTCSKSKRS 230 240 250 >>CCDS63534.1 LMCD1 gene_id:29995|Hs108|chr3 (292 aa) initn: 632 init1: 423 opt: 445 Z-score: 384.9 bits: 80.7 E(32554): 4.1e-15 Smith-Waterman score: 589; 38.0% identity (59.2% similar) in 245 aa overlap (37-249:45-289) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 LEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEKVPYVNS : :.:::. . ::. .:.:: : ... CCDS63 GDGIRIYKRNRMIMTNPIATGKDPTFDTITYEWAPPGVTQKLGLQYMELIPKEKQPVTGT 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 pF1KE0 PGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNV-------- : : .::.:::: .:.. : .: :.: . .. : .: : : :: :.: CCDS63 EGAFYRRRQLMHQLPIYDQDPSRCRGLLENELKLMEEFVKQYKSEALGVGEVALPGQGGL 80 90 100 110 120 130 120 130 140 150 pF1KE0 ---------RPFPVTMTGA---------------ICEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVC .: . :.: .:: : : . .:...:::.. CCDS63 PKEEGKQQEKPEGAETTAATTNGSLSDPSKEVEYVCELCKGAAPPDSPVVYSDRAGYNKQ 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 pF1KE0 WHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGRH ::: ::: . :.: :::::::..:: .::::. : :.:::..:::::::.. ..: CCDS63 WHPTCFVCAKCSEPLVDLIYFWKDGAPWCGRHYCESLRPRCSGCDEIIFAEDYQRVEDLA 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 pF1KE0 WHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDGQ :: ::: : :: .:.:. ::. .:. : : .: CCDS63 WHRKHFVCEGCEQLLSGRAYIVTKGQLLCPTCSKSKRS 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE0 HWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPKQGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNARAKES >>CCDS33688.1 LMCD1 gene_id:29995|Hs108|chr3 (365 aa) initn: 632 init1: 423 opt: 445 Z-score: 383.5 bits: 80.8 E(32554): 4.9e-15 Smith-Waterman score: 589; 38.0% identity (59.2% similar) in 245 aa overlap (37-249:118-362) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 LEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEKVPYVNS : :.:::. . ::. .:.:: : ... CCDS33 GDGIRIYKRNRMIMTNPIATGKDPTFDTITYEWAPPGVTQKLGLQYMELIPKEKQPVTGT 90 100 110 120 130 140 70 80 90 100 110 pF1KE0 PGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNV-------- : : .::.:::: .:.. : .: :.: . .. : .: : : :: :.: CCDS33 EGAFYRRRQLMHQLPIYDQDPSRCRGLLENELKLMEEFVKQYKSEALGVGEVALPGQGGL 150 160 170 180 190 200 120 130 140 150 pF1KE0 ---------RPFPVTMTGA---------------ICEQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVC .: . :.: .:: : : . .:...:::.. CCDS33 PKEEGKQQEKPEGAETTAATTNGSLSDPSKEVEYVCELCKGAAPPDSPVVYSDRAGYNKQ 210 220 230 240 250 260 160 170 180 190 200 210 pF1KE0 WHPPCFVRTVCNELLVDLIYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRCAACDEIIFADECTEAEGRH ::: ::: . :.: :::::::..:: .::::. : :.:::..:::::::.. ..: CCDS33 WHPTCFVCAKCSEPLVDLIYFWKDGAPWCGRHYCESLRPRCSGCDEIIFAEDYQRVEDLA 270 280 290 300 310 320 220 230 240 250 260 270 pF1KE0 WHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQHIGIDQGQMTYDGQ :: ::: : :: .:.:. ::. .:. : : .: CCDS33 WHRKHFVCEGCEQLLSGRAYIVTKGQLLCPTCSKSKRS 330 340 350 360 280 290 300 310 320 330 pF1KE0 HWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPKQGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSAFQNARAKES 844 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 16:00:43 2016 done: Thu Nov 3 16:00:44 2016 Total Scan time: 4.270 Total Display time: 0.140 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]