Result of FASTA (omim) for
pF1KE0333
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0333, 633 aa
1>>>pF1KE0333 633 - 633 aa - 633 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0632+/-0.000603; mu= -8.7062+/- 0.037
mean_var=273.9472+/-55.935, 0's: 0 Z-trim(114.4): 26 B-trim: 308 in 1/52
Lambda= 0.077489
statistics sampled from 24184 (24203) to 24184 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.617), E-opt: 0.2 (0.284), width: 16
Scan time: 11.160
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011539137 (OMIM: 612467) PREDICTED: guanylate-b ( 633) 4113 474.1 6.7e-133
NP_940862 (OMIM: 612467) guanylate-binding protein ( 633) 4113 474.1 6.7e-133
NP_001307186 (OMIM: 612467) guanylate-binding prot ( 503) 3240 376.4 1.3e-103
NP_443173 (OMIM: 612466) guanylate-binding protein ( 640) 2873 335.4 3.6e-91
NP_997281 (OMIM: 612468) guanylate-binding protein ( 638) 2859 333.9 1.1e-90
NP_002044 (OMIM: 600411) guanylate-binding protein ( 592) 2080 246.8 1.7e-64
NP_004111 (OMIM: 600412) guanylate-binding protein ( 591) 2073 246.0 2.8e-64
NP_060754 (OMIM: 600413) guanylate-binding protein ( 595) 2037 242.0 4.6e-63
NP_001127958 (OMIM: 611467) guanylate-binding prot ( 586) 1937 230.8 1.1e-59
NP_443174 (OMIM: 611467) guanylate-binding protein ( 586) 1937 230.8 1.1e-59
NP_001306108 (OMIM: 600413) guanylate-binding prot ( 516) 1701 204.4 8.4e-52
XP_011539535 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 516) 1701 204.4 8.4e-52
XP_005270800 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 516) 1701 204.4 8.4e-52
XP_006710637 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 568) 1603 193.4 1.8e-48
NP_001306110 (OMIM: 600413) guanylate-binding prot ( 544) 1577 190.5 1.3e-47
NP_001306109 (OMIM: 600413) guanylate-binding prot ( 461) 1340 164.0 1.1e-39
XP_016856502 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 461) 1340 164.0 1.1e-39
XP_011539536 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 514) 984 124.2 1.1e-27
XP_016856503 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 380) 763 99.5 2.4e-20
>>XP_011539137 (OMIM: 612467) PREDICTED: guanylate-bindi (633 aa)
initn: 4113 init1: 4113 opt: 4113 Z-score: 2507.0 bits: 474.1 E(85289): 6.7e-133
Smith-Waterman score: 4113; 99.1% identity (99.7% similar) in 633 aa overlap (1-633:1-633)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MESGPKMLAPVCQVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNHLAG
:::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MESGPKMLAPVCLVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNHLAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 QNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDSWIFALAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDSWIFALAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRPDGVEDSTEFVSFFPDFLWTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRPDGVEDSTEFVSFFPDFLWTV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 RDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIRRFFPKRKCFVFDRPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIRRFFPKRKCFVFDRPT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGITVTGNRLGTLAVTYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGITVTGNRLGTLAVTYV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 EAINSGAVPCLEDAVITLAQRENSAAVQRASDYYSQQMAQRVKFPTDTLQELLDVHAACE
::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::.::::::::::.:::::
XP_011 EAINSGAVPCLENAVITLAQRENSAAVQRAADYYSQQMAQRVKLPTDTLQELLDMHAACE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 REAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEESSVQYCQAKLNELSKGLMES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 REAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEESSVQYCQAKLNELSKGLMES
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 ISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLESQMVIEESILQSDKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLESQMVIEESILQSDKA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 LTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQVKSRKENIAQLKEKLQMEREH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
XP_011 LTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQDKSRKENIAQLKEKLQMEREH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 LLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTTKNDDTPWIARTLDNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTTKNDDTPWIARTLDNL
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE0 ADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
:::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
610 620 630
>>NP_940862 (OMIM: 612467) guanylate-binding protein 6 i (633 aa)
initn: 4113 init1: 4113 opt: 4113 Z-score: 2507.0 bits: 474.1 E(85289): 6.7e-133
Smith-Waterman score: 4113; 99.1% identity (99.7% similar) in 633 aa overlap (1-633:1-633)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MESGPKMLAPVCQVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNHLAG
:::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 MESGPKMLAPVCLVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNHLAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 QNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDSWIFALAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 QNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDSWIFALAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRPDGVEDSTEFVSFFPDFLWTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 LLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRPDGVEDSTEFVSFFPDFLWTV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 RDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIRRFFPKRKCFVFDRPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 RDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIRRFFPKRKCFVFDRPT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGITVTGNRLGTLAVTYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 NDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGITVTGNRLGTLAVTYV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 EAINSGAVPCLEDAVITLAQRENSAAVQRASDYYSQQMAQRVKFPTDTLQELLDVHAACE
::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::.::::::::::.:::::
NP_940 EAINSGAVPCLENAVITLAQRENSAAVQRAADYYSQQMAQRVKLPTDTLQELLDMHAACE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 REAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEESSVQYCQAKLNELSKGLMES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 REAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEESSVQYCQAKLNELSKGLMES
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 ISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLESQMVIEESILQSDKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 ISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLESQMVIEESILQSDKA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 LTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQVKSRKENIAQLKEKLQMEREH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_940 LTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQDKSRKENIAQLKEKLQMEREH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 LLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTTKNDDTPWIARTLDNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 LLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTTKNDDTPWIARTLDNL
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE0 ADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 ADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
610 620 630
>>NP_001307186 (OMIM: 612467) guanylate-binding protein (503 aa)
initn: 3240 init1: 3240 opt: 3240 Z-score: 1981.0 bits: 376.4 E(85289): 1.3e-103
Smith-Waterman score: 3240; 99.0% identity (99.8% similar) in 503 aa overlap (131-633:1-503)
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 LGDVEKGDPKNDSWIFALAVLLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRP
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRP
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 DGVEDSTEFVSFFPDFLWTVRDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGVEDSTEFVSFFPDFLWTVRDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFP
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 RECIRRFFPKRKCFVFDRPTNDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RECIRRFFPKRKCFVFDRPTNDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKT
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LREGITVTGNRLGTLAVTYVEAINSGAVPCLEDAVITLAQRENSAAVQRASDYYSQQMAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::
NP_001 LREGITVTGNRLGTLAVTYVEAINSGAVPCLENAVITLAQRENSAAVQRAADYYSQQMAQ
160 170 180 190 200 210
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 RVKFPTDTLQELLDVHAACEREAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEE
:::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RVKLPTDTLQELLDMHAACEREAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEE
220 230 240 250 260 270
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 SSVQYCQAKLNELSKGLMESISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSVQYCQAKLNELSKGLMESISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVF
280 290 300 310 320 330
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 QRFLESQMVIEESILQSDKALTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRFLESQMVIEESILQSDKALTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQD
340 350 360 370 380 390
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 KSRKENIAQLKEKLQMEREHLLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KSRKENIAQLKEKLQMEREHLLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKR
400 410 420 430 440 450
590 600 610 620 630
pF1KE0 MIDTTKNDDTPWIARTLDNLADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MIDTTKNDDTPWIARTLDNLADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
460 470 480 490 500
>>NP_443173 (OMIM: 612466) guanylate-binding protein 4 [ (640 aa)
initn: 2943 init1: 2840 opt: 2873 Z-score: 1757.7 bits: 335.4 E(85289): 3.6e-91
Smith-Waterman score: 2873; 70.1% identity (89.4% similar) in 623 aa overlap (2-624:17-638)
10 20 30 40
pF1KE0 MESGPKMLAPVCQVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVG
:: :.::.: :::..::: ::..:..::.:::::::::::::
NP_443 MGERTLHAAVPTPGYPESESIMMAPICLVENQEEQLTVNSKALEILDKISQPVVVVAIVG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 LYRTGKSYLMNHLAGQNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
:::::::::::.:::. .:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
NP_443 LYRTGKSYLMNRLAGKRNGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHLSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 KGDPKNDSWIFALAVLLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRPDGVED
:..:::::::::::::: :.:::::.:::::::::::::::::.:::.::: :::: .::
NP_443 KSNPKNDSWIFALAVLLSSSFVYNSVSTINHQALEQLHYVTELAELIRAKSCPRPDEAED
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 STEFVSFFPDFLWTVRDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIR
:.::.::::::.::::::::::::.:.::::::::::::::: :.::..:.::.::::::
NP_443 SSEFASFFPDFIWTVRDFTLELKLDGNPITEDEYLENALKLIPGKNPKIQNSNMPRECIR
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 RFFPKRKCFVFDRPTNDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGI
.:: ::::::::::::::. : ....: :..:. .: :.. :::::::::.::::::::
NP_443 HFFRKRKCFVFDRPTNDKQYLNHMDEVPEENLERHFLMQSDNFCSYIFTHAKTKTLREGI
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 TVTGNRLGTLAVTYVEAINSGAVPCLEDAVITLAQRENSAAVQRASDYYSQQMAQRVKFP
:::.:::::.::::.:::::::::::.:: .::: :: ::::::.:.:::::::....:
NP_443 IVTGKRLGTLVVTYVDAINSGAVPCLENAVTALAQLENPAAVQRAADHYSQQMAQQLRLP
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 TDTLQELLDVHAACEREAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEESSVQY
::::::::::::::::::::.::::::::::.:::::...: .:::::.:::::.:..:
NP_443 TDTLQELLDVHAACEREAIAVFMEHSFKDENHEFQKKLVDTIEKKKGDFVLQNEEASAKY
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 CQAKLNELSKGLMESISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLE
:::.:..::. : ::: : :::::::.::.: :...: :: ::::::::.::.: ::.
NP_443 CQAELKRLSEHLTESILRGIFSVPGGHNLYLEEKKQVEWDYKLVPRKGVKANEVLQNFLQ
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 SQMVIEESILQSDKALTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQVKSRKE
::.:.:::::::::::: :::.:..:: :::::::::::..: .::::.:::: .: .:
NP_443 SQVVVEESILQSDKALTAGEKAIAAERAMKEAAEKEQELLREKQKEQQQMMEAQERSFQE
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 NIAQLKEKLQMEREHLLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTT
.::...::. :::.::::. .:.: :::.. :.: :.:: :..: ::.:.:. :..:
NP_443 YMAQMEKKLEEERENLLREHERLLKHKLKVQEEMLKEEFQKKSEQLNKEINQLKEKIEST
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630
pF1KE0 KNDDTPWIARTLDNLADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
::.. . . :: .. . . : . .::.: :.: ..:
NP_443 KNEQLR-LLKILDMASNIMIVTLPGASKLLGVGTKYLGSRI
610 620 630 640
>>NP_997281 (OMIM: 612468) guanylate-binding protein 7 [ (638 aa)
initn: 2884 init1: 2851 opt: 2859 Z-score: 1749.3 bits: 333.9 E(85289): 1.1e-90
Smith-Waterman score: 2859; 69.0% identity (88.3% similar) in 632 aa overlap (1-632:1-632)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MESGPKMLAPVCQVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNHLAG
: : .: .::: .::.. .:.::..:..:: :.:::::::::::::::::::::.:::
NP_997 MASEIHMPGPVCLTENTKGHLVVNSEALEILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 QNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDSWIFALAV
.:.::::: ::.:::::::::::::::::::::.:::::::::.::.:::.:::::::::
NP_997 KNKGFPLGCTVKSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLILLDTEGLGDMEKSDPKSDSWIFALAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRPDGVEDSTEFVSFFPDFLWTV
:: :.::::::.::::::::::::::::::::.::: :::: ::::.:::::::::.:::
NP_997 LLSSSFVYNSMGTINHQALEQLHYVTELTELIRAKSCPRPDEVEDSSEFVSFFPDFIWTV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 RDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIRRFFPKRKCFVFDRPT
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NP_997 RDFTLELKLDGHPITEDEYLENALKLISGKNPQIQNSNKPREWIRHFFPKQKCFVFDRPI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGITVTGNRLGTLAVTYV
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NP_997 NDKKLLLHVEEVREDQLDSNFQMQSENFCSYIFTHAKTKTLREGILVTGNRLGMLVETYL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 EAINSGAVPCLEDAVITLAQRENSAAVQRASDYYSQQMAQRVKFPTDTLQELLDVHAACE
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NP_997 DAINSGATPCLENAMAVLAQCENSAAVQRAANHYSQQMAQQVRFPTDTLQELLDVHAVCE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 REAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEESSVQYCQAKLNELSKGLMES
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NP_997 REAIAVFMEYSFKDKSQEFQKKLVDTMEKKKEDFVLQNEEASAKYCQAELKRLSELLTES
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 ISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLESQMVIEESILQSDKA
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NP_997 ISRGTFFVPGGHNIYLEAKKKIEQDYTLVPRKGVKADEVLQSFLQSQVVIEESILQSDKA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 LTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQVKSRKENIAQLKEKLQMEREH
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NP_997 LTAGEKAIAAKQAKKEAAEKEQELLRQKQKEQQQMMEAQERSFQENIAQLKKKMEREREN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 LLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTTKNDDTPWIARTLDNL
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NP_997 YMRELRKMLSHKMKVLEELLTEGFKEIFESLNEEINRLKEQIEAAENEEPSVFSQILDVA
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE0 ADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
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NP_997 GSIFIAALPGAAKLVDLGMKILSSLCNRLRNPGKKIIS
610 620 630
>>NP_002044 (OMIM: 600411) guanylate-binding protein 1 [ (592 aa)
initn: 2107 init1: 966 opt: 2080 Z-score: 1279.1 bits: 246.8 E(85289): 1.7e-64
Smith-Waterman score: 2080; 52.6% identity (81.3% similar) in 588 aa overlap (1-586:1-587)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MESGPKMLAPVCQVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNHLAG
: : .: .:.: .::.: .:..: .:..:: :.::.::::::::::::::::::.:::
NP_002 MASEIHMTGPMCLIENTNGRLMANPEALKILSAITQPMVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 QNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDSWIFALAV
...:: :::::::.::::::::::::.::.: :::::::::::::::: .::::::::::
NP_002 KKKGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPKKPGHILVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE0 LLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSP--RPDGVEDSTEFVSFFPDFLW
:: :::::::..:::.::..::.::::::. :..:::: . ::::..::::::::.:
NP_002 LLSSTFVYNSIGTINQQAMDQLYYVTELTHRIRSKSSPDENENEVEDSADFVSFFPDFVW
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 TVRDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIRRFFPKRKCFVFDR
:.:::.:.:. .:.:.: :::: .::: .:.. . .: :.:: :::.::::.:::::::
NP_002 TLRDFSLDLEADGQPLTPDEYLTYSLKLKKGTSQKDETFNLPRLCIRKFFPKKKCFVFDR
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pF1KE0 PTNDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGITVTGNRLGTLAVT
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NP_002 PVHRRKL-AQLEKLQDEELDPEFVQQVADFCSYIFSNSKTKTLSGGIQVNGPRLESLVLT
250 260 270 280 290
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pF1KE0 YVEAINSGAVPCLEDAVITLAQRENSAAVQRASDYYSQQMAQRVKFPTDTLQELLDVHAA
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NP_002 YVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVQKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQELLDLHRD
300 310 320 330 340 350
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pF1KE0 CEREAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEESSVQYCQAKLNELSKGLM
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NP_002 SEREAIEVFIRSSFKDVDHLFQKELAAQLEKKRDDFCKQNQEASSDRCSALLQVIFSPLE
360 370 380 390 400 410
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pF1KE0 ESISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLESQMVIEESILQSD
: ..:: .: :::..:... . ... :.. ::::..:.:..: .:.:. . ..:::.:
NP_002 EEVKAGIYSKPGGYRLFVQKLQDLKKKYYEEPRKGIQAEEILQTYLKSKESMTDAILQTD
420 430 440 450 460 470
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pF1KE0 KALTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQVKSRKENIAQLKEKLQMER
..::..:: . :.:.: :.:. ..:.. ....:.:: . .: .:.. :: ::.. .:
NP_002 QTLTEKEKEIEVERVKAESAQASAKMLQEMQRKNEQMMEQKERSYQEHLKQLTEKMENDR
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pF1KE0 EHLLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTTKNDDTPWIARTLD
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NP_002 VQLLKEQERTLALKLQEQEQLLKEGFQKESRIMKNEIQDLQTKMRRRKACTIS
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630
pF1KE0 NLADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
>>NP_004111 (OMIM: 600412) guanylate-binding protein 2 [ (591 aa)
initn: 2100 init1: 1121 opt: 2073 Z-score: 1274.9 bits: 246.0 E(85289): 2.8e-64
Smith-Waterman score: 2073; 53.9% identity (82.3% similar) in 566 aa overlap (10-575:10-574)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MESGPKMLAPVCQVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNHLAG
:. ..:.. ::.:: .:..:: :.:::::::::::::::::::::.:::
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10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 QNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDSWIFALAV
...:: :::::.:.::::::::::::.::.:::::::::::::.:::: .:::::::::.
NP_004 KKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDIEKGDNENDSWIFALAI
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 LLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRPDGVEDSTEFVSFFPDFLWTV
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NP_004 LLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIKANSSPGNNSVDDSADFVSFFPAFVWTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 RDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIRRFFPKRKCFVFDRPT
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NP_004 RDFTLELEVDGEPITADDYLELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIRKFFPKRKCFVFDWPA
190 200 210 220 230 240
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pF1KE0 NDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGITVTGNRLGTLAVTYV
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NP_004 -PKKYLAHLEQLKEEELNPDFIEQVAEFCSYILSHSNVKTLSGGIPVNGPRLESLVLTYV
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pF1KE0 EAINSGAVPCLEDAVITLAQRENSAAVQRASDYYSQQMAQRVKFPTDTLQELLDVHAACE
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NP_004 NAISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVEKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQELLDLHRDSE
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pF1KE0 REAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEESSVQYCQAKLNELSKGLMES
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NP_004 REAIEVFMKNSFKDVDQMFQRKLGAQLEARRDDFCKQNSKASSDCCMALLQDIFGPLEED
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pF1KE0 ISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLESQMVIEESILQSDKA
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NP_004 VKQGTFSKPGGYRLFTQKLQELKNKYYQVPRKGIQAKEVLKKYLESKEDVADALLQTDQS
420 430 440 450 460 470
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pF1KE0 LTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQVKSRKENIAQLKEKLQMEREH
:...:::. :.: : :.:: ...:.. ......:: . :: .:.. :: ::.. .: .
NP_004 LSEKEKAIEVERIKAESAEAAKKMLEEIQKKNEEMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMERDRAQ
480 490 500 510 520 530
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pF1KE0 LLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTTKNDDTPWIARTLDNL
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NP_004 LMAEQEKTLALKLQEQERLLKEGFENESKRLQKDIWDIQMRSKSLEPICNIL
540 550 560 570 580 590
610 620 630
pF1KE0 ADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
>>NP_060754 (OMIM: 600413) guanylate-binding protein 3 i (595 aa)
initn: 2097 init1: 1127 opt: 2037 Z-score: 1253.1 bits: 242.0 E(85289): 4.6e-63
Smith-Waterman score: 2037; 52.1% identity (80.7% similar) in 576 aa overlap (7-582:7-581)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MESGPKMLAPVCQVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNHLAG
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NP_060 MAPEIHMTGPMCLIENTNGELVANPEALKILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 QNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDSWIFALAV
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NP_060 KNKGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDVKKGDNQNDSWIFTLAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRPDGVEDSTEFVSFFPDFLWTV
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NP_060 LLSSTLVYNSMGTINQQAMDQLYYVTELTHRIRSKSSPDENENEDSADFVSFFPDFVWTL
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pF1KE0 RDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIRRFFPKRKCFVFDRPT
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NP_060 RDFSLDLEADGQPLTPDEYLEYSLKLTQGTSQKDKNFNLPRLCIRKFFPKKKCFVFDLPI
190 200 210 220 230 240
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pF1KE0 NDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGITVTGNRLGTLAVTYV
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NP_060 HRRKL-AQLEKLQDEELDPEFVQQVADFCSYIFSNSKTKTLSGGIKVNGPRLESLVLTYI
250 260 270 280 290
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pF1KE0 EAINSGAVPCLEDAVITLAQRENSAAVQRASDYYSQQMAQRVKFPTDTLQELLDVHAACE
.::. : .::.:.::..::: :::::::.: .:.:::.:.:..:..:::::::.: . :
NP_060 NAISRGDLPCMENAVLALAQIENSAAVQKAIAHYDQQMGQKVQLPAETLQELLDLHRVSE
300 310 320 330 340 350
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pF1KE0 REAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEESSVQYCQAKLNELSKGLMES
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NP_060 REATEVYMKNSFKDVDHLFQKKLAAQLDKKRDDFCKQNQEASSDRCSALLQVIFSPLEEE
360 370 380 390 400 410
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pF1KE0 ISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLESQMVIEESILQSDKA
..:: .: :::. :... . .:. :.. ::::..:.:..: .:.:. . ..:::.:.
NP_060 VKAGIYSKPGGYCLFIQKLQDLEKKYYEEPRKGIQAEEILQTYLKSKESVTDAILQTDQI
420 430 440 450 460 470
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pF1KE0 LTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQVKSRKENIAQLKEKLQMEREH
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NP_060 LTEKEKEIEVECVKAESAQASAKMVEEMQIKYQQMMEEKEKSYQEHVKQLTEKMERERAQ
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 LLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTTKNDDTPWIARTLDNL
::.:: : . : :.: . . ... ::..... .
NP_060 LLEEQEKTLTSKLQEQARVLKERCQGESTQLQNEIQKLQKTLKKKTKRYMSHKLKI
540 550 560 570 580 590
610 620 630
pF1KE0 ADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
>>NP_001127958 (OMIM: 611467) guanylate-binding protein (586 aa)
initn: 1934 init1: 1059 opt: 1937 Z-score: 1192.8 bits: 230.8 E(85289): 1.1e-59
Smith-Waterman score: 1937; 50.9% identity (79.3% similar) in 584 aa overlap (7-589:7-581)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MESGPKMLAPVCQVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNHLAG
: :.: .:: :::: :::.:..:: :.:::::::::::::::::::::.:::
NP_001 MALEIHMSDPMCLIENFNEQLKVNQEALEILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 QNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDSWIFALAV
.:.:: ..:::::.:::::.::::::. ::::::::::::::::::.: ::: :::::.
NP_001 KNKGFSVASTVQSHTKGIWIWCVPHPNWPNHTLVLLDTEGLGDVEKADNKNDIQIFALAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRPDGVEDSTEFVSFFPDFLWTV
:: ::::::... :.. :.. :: :::::.:.::..:: : ::: .. .:::::..::.
NP_001 LLSSTFVYNTVNKIDQGAIDLLHNVTELTDLLKARNSPDLDRVEDPADSASFFPDLVWTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 RDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIRRFFPKRKCFVFDRPT
::: : :...:. .: ::::::.:. ::.. :::. :.:: ::..::::.:::.:: :.
NP_001 RDFCLGLEIDGQLVTPDEYLENSLRPKQGSDQRVQNFNLPRLCIQKFFPKKKCFIFDLPA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGITVTGNRLGTLAVTYV
..: : :..: . . .:.:.: .:.. ::::::.:. :::: :: :.:.:: .:..:::
NP_001 HQKKL-AQLETLPDDELEPEFVQQVTEFCSYIFSHSMTKTLPGGIMVNGSRLKNLVLTYV
250 260 270 280 290
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pF1KE0 EAINSGAVPCLEDAVITLAQRENSAAVQRASDYYSQQMAQRVKFPTDTLQELLDVHAACE
.::.:: .::.:.::..:::::::::::.: .:.:::.:.:..: .:::::::.: . :
NP_001 NAISSGDLPCIENAVLALAQRENSAAVQKAIAHYDQQMGQKVQLPMETLQELLDLHRTSE
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KE0 REAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMN-KKGDFLLQNEESSVQYCQAKLNELSKGLME
:::: .::..:::: .: :::. .:: .. :..:. .: :.: .::.: :... : :
NP_001 REAIEVFMKNSFKDVDQSFQKE-LETLLDAKQNDICKRNLEASSDYCSALLKDIFGPLEE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 SISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLESQMVIEESILQSDK
... : .: ::::.:... :... :.. ::::..:.::.:..:.:. . ..:::.:.
NP_001 AVKQGIYSKPGGHNLFIQKTEELKAKYYREPRKGIQAEEVLQKYLKSKESVSHAILQTDQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 ALTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQVKSRKENIAQLKEKLQMERE
:::. :: ..: :: . : . : ....:.:. . . ..:.. :. .. ..
NP_001 ALTETEKKKKEAQVKAEAEKAEAQRLAAIQRQNEQMMQERERLHQEQVRQM----EIAKQ
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 HLLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTTKNDDTPWIARTLDN
. : :: : :. .. : : :. . . . .:... .: :..:::
NP_001 NWLAEQQKMQEQQMQEQAAQLSTTFQAQNRSLLSELQHAQR---TVNNDDPCVLL
540 550 560 570 580
600 610 620 630
pF1KE0 LADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
>>NP_443174 (OMIM: 611467) guanylate-binding protein 5 [ (586 aa)
initn: 1934 init1: 1059 opt: 1937 Z-score: 1192.8 bits: 230.8 E(85289): 1.1e-59
Smith-Waterman score: 1937; 50.9% identity (79.3% similar) in 584 aa overlap (7-589:7-581)
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