Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0334
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0334, 875 aa
1>>>pF1KE0334 875 - 875 aa - 875 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6713+/-0.00116; mu= 13.9048+/- 0.069
mean_var=92.4714+/-17.868, 0's: 0 Z-trim(103.7): 79 B-trim: 52 in 1/48
Lambda= 0.133374
statistics sampled from 7446 (7525) to 7446 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.58), E-opt: 0.2 (0.231), width: 16
Scan time: 3.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3713.1 PDE5A gene_id:8654|Hs108|chr4 ( 875) 5812 1129.5 0
CCDS34055.1 PDE5A gene_id:8654|Hs108|chr4 ( 833) 5465 1062.7 0
CCDS33334.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 ( 933) 1920 380.6 7.3e-105
CCDS42785.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 ( 683) 1643 327.2 6.1e-89
CCDS46459.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 ( 575) 1431 286.4 1e-76
CCDS42786.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 ( 489) 1296 260.4 5.7e-69
CCDS5289.1 PDE10A gene_id:10846|Hs108|chr6 ( 779) 818 168.5 4.2e-41
CCDS47513.1 PDE10A gene_id:10846|Hs108|chr6 ( 789) 818 168.5 4.2e-41
CCDS42947.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 433) 483 103.9 6.3e-22
CCDS42944.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 459) 483 104.0 6.6e-22
CCDS33571.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 465) 483 104.0 6.7e-22
CCDS42946.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 466) 483 104.0 6.7e-22
CCDS33570.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 491) 483 104.0 7.1e-22
CCDS42943.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 492) 483 104.0 7.1e-22
CCDS42941.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 507) 483 104.0 7.3e-22
CCDS42945.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 526) 483 104.0 7.5e-22
CCDS33568.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 533) 483 104.0 7.6e-22
CCDS33567.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 540) 483 104.0 7.7e-22
CCDS42942.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 552) 483 104.0 7.8e-22
CCDS33569.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 567) 483 104.0 8e-22
CCDS13690.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 593) 483 104.0 8.3e-22
CCDS5175.1 PDE7B gene_id:27115|Hs108|chr6 ( 450) 481 103.6 8.5e-22
CCDS46016.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 606) 467 100.9 7.2e-21
CCDS42523.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 680) 467 100.9 8e-21
CCDS12373.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 712) 467 100.9 8.3e-21
CCDS34901.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8 ( 456) 463 100.1 9.5e-21
CCDS56538.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8 ( 482) 463 100.1 1e-20
CCDS12238.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 647) 454 98.4 4.3e-20
CCDS45963.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 825) 454 98.5 5.4e-20
CCDS45962.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 860) 454 98.5 5.6e-20
CCDS58649.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 864) 454 98.5 5.6e-20
CCDS45961.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 886) 454 98.5 5.7e-20
CCDS72802.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 503) 439 95.5 2.6e-19
CCDS56370.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 507) 439 95.5 2.6e-19
CCDS56369.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 518) 439 95.5 2.6e-19
CCDS30743.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 564) 439 95.5 2.8e-19
CCDS54858.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 673) 439 95.6 3.3e-19
CCDS56371.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 679) 439 95.6 3.3e-19
CCDS56372.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 687) 439 95.6 3.4e-19
CCDS30742.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 721) 439 95.6 3.5e-19
CCDS632.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 736) 439 95.6 3.6e-19
CCDS56373.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 745) 439 95.6 3.6e-19
CCDS54859.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 748) 439 95.6 3.6e-19
CCDS47213.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 809) 439 95.6 3.9e-19
CCDS4299.1 PDE6A gene_id:5145|Hs108|chr5 ( 860) 426 93.1 2.3e-18
CCDS7429.1 PDE6C gene_id:5146|Hs108|chr10 ( 858) 411 90.2 1.7e-17
CCDS46993.1 PDE6B gene_id:5158|Hs108|chr4 ( 575) 402 88.4 4e-17
CCDS5437.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 634) 401 88.2 5e-17
CCDS55099.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 709) 401 88.2 5.5e-17
CCDS54703.1 PDE6B gene_id:5158|Hs108|chr4 ( 853) 402 88.5 5.7e-17
>>CCDS3713.1 PDE5A gene_id:8654|Hs108|chr4 (875 aa)
initn: 5812 init1: 5812 opt: 5812 Z-score: 6043.9 bits: 1129.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5812; 99.7% identity (99.9% similar) in 875 aa overlap (1-875:1-875)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MERAGPSFGQQRQQQQPQQQKQQQRDQDSVEAWLDGHWDFTFSYFVRKATREMVNAWFAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MERAGPSFGQQRQQQQPQQQKQQQRDQDSVEAWLDDHWDFTFSYFVRKATREMVNAWFAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 RVHTIPVCKEGIRGHTESCSCPLQQSPRADNSVPGTPTRKISASEFDRPLRPIVVKDSEG
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 RVHTIPVCKEGIRGHTESCSCPLQQSPRADNSAPGTPTRKISASEFDRPLRPIVVKDSEG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 TVSFLSDSEKKEQMPLTPPRFDHDEGDQCSRLLELVKDISSHLDVTALCHKIFLHIHGLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 TVSFLSDSEKKEQMPLTPPRFDHDEGDQCSRLLELVKDISSHLDVTALCHKIFLHIHGLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SADRYSLFLVCEDSSNDKFLISRLFDVAEGSTLEEVSNNCIRLEWNKGIVGHVAALGEPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SADRYSLFLVCEDSSNDKFLISRLFDVAEGSTLEEVSNNCIRLEWNKGIVGHVAALGEPL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NIKDAYEDPRFNAEVDQITGYKTQSILCMPIKNHREEVVGVAQAINKKSGNGGTFTEKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 NIKDAYEDPRFNAEVDQITGYKTQSILCMPIKNHREEVVGVAQAINKKSGNGGTFTEKDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 KDFAAYLAFCGIVLHNAQLYETSLLENKRNQVLLDLASLIFEEQQSLEVILKKIAATIIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 KDFAAYLAFCGIVLHNAQLYETSLLENKRNQVLLDLASLIFEEQQSLEVILKKIAATIIS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 FMQVQKCTIFIVDEDCSDSFSSVFHMECEELEKSSDTLTREHDANKINYMYAQYVKNTME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 FMQVQKCTIFIVDEDCSDSFSSVFHMECEELEKSSDTLTREHDANKINYMYAQYVKNTME
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 PLNIPDVSKDKRFPWTTENTGNVNQQCIRSLLCTPIKNGKKNKVIGVCQLVNKMEENTGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 PLNIPDVSKDKRFPWTTENTGNVNQQCIRSLLCTPIKNGKKNKVIGVCQLVNKMEENTGK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 VKPFNRNDEQFLEAFVIFCGLGIQNTQMYEAVERAMAKQMVTLEVLSYHASAAEEETREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VKPFNRNDEQFLEAFVIFCGLGIQNTQMYEAVERAMAKQMVTLEVLSYHASAAEEETREL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 QSLAAAVVPSAQTLKITDFSFSDFELSDLETALCTIRMFTDLNLVQNFRMKHEVLCRWIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS37 QSLAAAVVPSAQTLKITDFSFSDFELSDLETALCTIRMFTDLNLVQNFQMKHEVLCRWIL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 SVKKNYRKNVAYHNWRHAFNTAQCMFAALKAGKIQNKLTDLEILALLIAALSHDLDHRGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SVKKNYRKNVAYHNWRHAFNTAQCMFAALKAGKIQNKLTDLEILALLIAALSHDLDHRGV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 NNSYIQRSEHPLAQLYCHSIMEHHHFDQCLMILNSPGNQILSGLSIEEYKTTLKIIKQAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 NNSYIQRSEHPLAQLYCHSIMEHHHFDQCLMILNSPGNQILSGLSIEEYKTTLKIIKQAI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 LATDLALYIKRRGEFFELIRKNQFNLEDPHQKELFLAMLMTACDLSAITKPWPIQQRIAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LATDLALYIKRRGEFFELIRKNQFNLEDPHQKELFLAMLMTACDLSAITKPWPIQQRIAE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 LVATEFFDQGDRERKELNIEPTDLMNREKKNKIPSMQVGFIDAICLQLYEALTHVSEDCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LVATEFFDQGDRERKELNIEPTDLMNREKKNKIPSMQVGFIDAICLQLYEALTHVSEDCF
790 800 810 820 830 840
850 860 870
pF1KE0 PLLDGCRKNRQKWQALAEQQEKMLINGESGQAKRN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 PLLDGCRKNRQKWQALAEQQEKMLINGESGQAKRN
850 860 870
>>CCDS34055.1 PDE5A gene_id:8654|Hs108|chr4 (833 aa)
initn: 5465 init1: 5465 opt: 5465 Z-score: 5683.4 bits: 1062.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5465; 99.8% identity (100.0% similar) in 826 aa overlap (50-875:8-833)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 QKQQQRDQDSVEAWLDGHWDFTFSYFVRKATREMVNAWFAERVHTIPVCKEGIRGHTESC
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MLPFGDKTREMVNAWFAERVHTIPVCKEGIRGHTESC
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 SCPLQQSPRADNSVPGTPTRKISASEFDRPLRPIVVKDSEGTVSFLSDSEKKEQMPLTPP
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SCPLQQSPRADNSAPGTPTRKISASEFDRPLRPIVVKDSEGTVSFLSDSEKKEQMPLTPP
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 RFDHDEGDQCSRLLELVKDISSHLDVTALCHKIFLHIHGLISADRYSLFLVCEDSSNDKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RFDHDEGDQCSRLLELVKDISSHLDVTALCHKIFLHIHGLISADRYSLFLVCEDSSNDKF
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 LISRLFDVAEGSTLEEVSNNCIRLEWNKGIVGHVAALGEPLNIKDAYEDPRFNAEVDQIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LISRLFDVAEGSTLEEVSNNCIRLEWNKGIVGHVAALGEPLNIKDAYEDPRFNAEVDQIT
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 GYKTQSILCMPIKNHREEVVGVAQAINKKSGNGGTFTEKDEKDFAAYLAFCGIVLHNAQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GYKTQSILCMPIKNHREEVVGVAQAINKKSGNGGTFTEKDEKDFAAYLAFCGIVLHNAQL
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 YETSLLENKRNQVLLDLASLIFEEQQSLEVILKKIAATIISFMQVQKCTIFIVDEDCSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YETSLLENKRNQVLLDLASLIFEEQQSLEVILKKIAATIISFMQVQKCTIFIVDEDCSDS
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 FSSVFHMECEELEKSSDTLTREHDANKINYMYAQYVKNTMEPLNIPDVSKDKRFPWTTEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FSSVFHMECEELEKSSDTLTREHDANKINYMYAQYVKNTMEPLNIPDVSKDKRFPWTTEN
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KE0 TGNVNQQCIRSLLCTPIKNGKKNKVIGVCQLVNKMEENTGKVKPFNRNDEQFLEAFVIFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TGNVNQQCIRSLLCTPIKNGKKNKVIGVCQLVNKMEENTGKVKPFNRNDEQFLEAFVIFC
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KE0 GLGIQNTQMYEAVERAMAKQMVTLEVLSYHASAAEEETRELQSLAAAVVPSAQTLKITDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GLGIQNTQMYEAVERAMAKQMVTLEVLSYHASAAEEETRELQSLAAAVVPSAQTLKITDF
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KE0 SFSDFELSDLETALCTIRMFTDLNLVQNFRMKHEVLCRWILSVKKNYRKNVAYHNWRHAF
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SFSDFELSDLETALCTIRMFTDLNLVQNFQMKHEVLCRWILSVKKNYRKNVAYHNWRHAF
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650 660 670
pF1KE0 NTAQCMFAALKAGKIQNKLTDLEILALLIAALSHDLDHRGVNNSYIQRSEHPLAQLYCHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NTAQCMFAALKAGKIQNKLTDLEILALLIAALSHDLDHRGVNNSYIQRSEHPLAQLYCHS
580 590 600 610 620 630
680 690 700 710 720 730
pF1KE0 IMEHHHFDQCLMILNSPGNQILSGLSIEEYKTTLKIIKQAILATDLALYIKRRGEFFELI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IMEHHHFDQCLMILNSPGNQILSGLSIEEYKTTLKIIKQAILATDLALYIKRRGEFFELI
640 650 660 670 680 690
740 750 760 770 780 790
pF1KE0 RKNQFNLEDPHQKELFLAMLMTACDLSAITKPWPIQQRIAELVATEFFDQGDRERKELNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RKNQFNLEDPHQKELFLAMLMTACDLSAITKPWPIQQRIAELVATEFFDQGDRERKELNI
700 710 720 730 740 750
800 810 820 830 840 850
pF1KE0 EPTDLMNREKKNKIPSMQVGFIDAICLQLYEALTHVSEDCFPLLDGCRKNRQKWQALAEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EPTDLMNREKKNKIPSMQVGFIDAICLQLYEALTHVSEDCFPLLDGCRKNRQKWQALAEQ
760 770 780 790 800 810
860 870
pF1KE0 QEKMLINGESGQAKRN
::::::::::::::::
CCDS34 QEKMLINGESGQAKRN
820 830
>>CCDS33334.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 (933 aa)
initn: 1713 init1: 737 opt: 1920 Z-score: 1996.1 bits: 380.6 E(32554): 7.3e-105
Smith-Waterman score: 2044; 43.3% identity (74.9% similar) in 760 aa overlap (129-869:177-919)
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 RKISASEFDRPLRPIVVKDSEGTVSFLSDSEKKEQMPLTPPR-FDHD----EGDQCSRLL
:.. ..: :: .:. . .. . .:
CCDS33 EPLSSVRRRALLRKASSLPPTTAHILSALLESRVNLPRYPPTAIDYKCHLKKHNERQFFL
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 ELVKDISSHLDVTALCHKIFLHIHGLISADRYSLFLVCEDSSNDKFLISRLFDVAEGSTL
:::::::. ::.:.: .::.. . ...::: ::::: ... : :.:..::: :. :
CCDS33 ELVKDISNDLDLTSLSYKILIFVCLMVDADRCSLFLVEGAAAGKKTLVSKFFDVHAGTPL
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260
pF1KE0 EEVSN----NCIRLEWNKGIVGHVAALGEPLNIKDAYEDPRFNAEVDQITGYKTQSILCM
:. : ... :.:::.:.:. :: .:: :::.: ::: :.:..:::::.:.:::
CCDS33 LPCSSTENSNEVQVPWGKGIIGYVGEHGETVNIPDAYQDRRFNDEIDKLTGYKTKSLLCM
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 PIKNHREEVVGVAQAINKKSGNGGTFTEKDEKDFAAYLAFCGIVLHNAQLYETSLLENKR
::.. :..:::::::: .:. ::: ::: . :: ::::.. ::::. .: : .:
CCDS33 PIRSSDGEIIGVAQAINKIP-EGAPFTEDDEKVMQMYLPFCGIAISNAQLFAASRKEYER
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 NQVLLDLASLIFEEQQSLEVILKKIAATIISFMQVQKCTIFIVDEDCSD--SFSSVFHM-
...::.... .:::: .:: :.::: .... ..:....... : .:.. :..
CCDS33 SRALLEVVNDLFEEQTDLEKIVKKIMHRAQTLLKCERCSVLLLEDIESPVVKFTKSFELM
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 --ECEELEKSSDTLTREHDANK---INYMYAQYVKNTMEPLNIPDVSKDKRFPWTTENTG
.: ..: . :... . :: :. : .: :.:: :. .: :: ... .
CCDS33 SPKCSADAENSFKESMEKSSYSDWLINNSIAELVASTGLPVNISDAYQDPRFDAEADQIS
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450 460 470 480 490 500
pF1KE0 NVNQQCIRSLLCTPIKNGKKNKVIGVCQLVNKMEENTGKVKPFNRNDEQFLEAFVIFCGL
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510 520 530 540 550 560
pF1KE0 GIQNTQMYEAVERAMAKQMVTLEVLSYHASAAEEETRELQSLAAAVVPSAQTLKITDFSF
::.:: ::. :... ::: :.:.::::::. .. :. ... :: .: .. : : :. :
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570 580 590 600 610 620
pF1KE0 SDFELSDLETALCT-IRMFTDLNLVQNFRMKHEVLCRWILSVKKNYRKNVAYHNWRHAFN
.:: : :... . . .::: .:..::.:.. .:.::::.:.:.:::: : :::::::::
CCDS33 DDFSL-DVDAMITAALRMFMELGMVQKFKIDYETLCRWLLTVRKNYRM-VLYHNWRHAFN
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. : ::: : .. .:. ::..::::.... : :::::::.::.. .: ::::: :
CCDS33 VCQLMFAMLTTAGFQDILTEVEILAVIVGCLCHDLDHRGTNNAFQAKSGSALAQLYGTSA
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690 700 710 720 730
pF1KE0 -MEHHHFDQCLMILNSPGNQILSGLSIEEYKTTLKIIKQAILATDLALYIKRRGEFFELI
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CCDS33 TLEHHHFNHAVMILQSEGHNIFANLSSKEYSDLMQLLKQSILATDLTLYFERRTEFFELV
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740 750 760 770 780 790
pF1KE0 RKNQFNLEDPHQKELFLAMLMTACDLSAITKPWPIQQRIAELVATEFFDQGDRERKELNI
:.... . .....: .::::::::.:.:::: :....::::..:::.:::::: ::..
CCDS33 SKGEYDWNIKNHRDIFRSMLMTACDLGAVTKPWEISRQVAELVTSEFFEQGDRERLELKL
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800 810 820 830 840 850
pF1KE0 EPTDLMNREKKNKIPSMQVGFIDAICLQLYEALTHVSEDCFPLLDGCRKNRQKWQALAEQ
:. ...:..:...: .:. .::.::. ::.::..:. :.::. ::.::. : .
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860 870
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:...: . :
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.. .:::: .:: :.::: .... ..:....... : .:.. :.. .:
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... . . .::: .:..::.:.. .:.::::.:.:.:::: : :::::::::. : :::
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:
CCDS42 TASSSPASVMVAKEDRN
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. .....: .::::::::.:.:::: :....::::..:::.:::::: ::.. :. ..
CCDS46 WNIKNHRDIFRSMLMTACDLGAVTKPWEISRQVAELVTSEFFEQGDRERLELKLTPSAIF
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. :
CCDS46 STASSSPASVMVAKEDRN
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CCDS42 LSSKEYSDLMQLLKQSILATDLTLYFERRTEFFELVSKGEYDWNIKNHRDIFRSMLMTAC
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CCDS42 DLGAVTKPWEISRQVAELVTSEFFEQGDRERLELKLTPSAIFDRNRKDELPRLQLEWIDS
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CCDS52 NSYIEQRLDTGGDNQLLLYELSSIIKIATKADGFALYFLGE--CNNSLCIFTPPGIKEGK
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. . . : . . ..:: . : ..: : :: . .: . ::.::.::
CCDS52 P-RLIPAGPIT--QGTTVSAYVAKSRKTLLVEDILGDERFPRGTGLESGTRIQSVLCLPI
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CCDS52 VTAIGDLIGILE-LYRHWGKEA-FCLSHQEVATANLAWASVAIHQVQVCRGLAKQTELND
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CCDS52 FLLDVSKTYFDNIVAIDSLLEHIMIYAKNLVNADRCALFQVDHKNKELYSDLFDIGEEKE
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.... ::.: ::::. . :: :.: ..: .: : :. . ..
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.. . : .. :.. : :::.:.:::::::. : ::::.:: ..:.::.: :.
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. .. .:::: .:::: : ::::::: .:::.:. .:::: :: : ::.:::.: .
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CCDS52 SILQLEGHNIFSTLSSSEYEQVLEIIRKAIIATDLALYFGNRKQLEEMYQTGSLNLNNQS
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CCDS52 HRDRVIGLMMTACDLCSVTKLWPVTKLTANDIYAEFWAEGD-EMKKLGIQPIPMMDRDKK
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CCDS52 DEVPQGQLGFYNAVAIPCYTTLTQILPPTEPLLKACRDNLSQWEKVIRGEETATWISSPS
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CCDS52 VAQKAAASED
770
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. : ..::. . . .. .. ..:. :: ..:... : :... : . ::.
CCDS47 NSYIEQRLDTGGDNQLLLYELSSIIKIATKADGFALYFLGE--CNNSLCIFTPPGIKEGK
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. . . : . . ..:: . : ..: : :: . .: . ::.::.::
CCDS47 P-RLIPAGPIT--QGTTVSAYVAKSRKTLLVEDILGDERFPRGTGLESGTRIQSVLCLPI
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. ...:. . . .. :. . : . .. .: ::. ....:..:. . ... :.
CCDS47 VTAIGDLIGILE-LYRHWGKEA-FCLSHQEVATANLAWASVAIHQVQVCRGLAKQTELND
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CCDS47 FLLDVSKTYFDNIVAIDSLLEHIMIYAKNLVNADRCALFQVDHKNKELYSDLFDIGEEKE
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CCDS47 GKPVFKKTKEIRFS-IEKGIAGQVARTGEVLNIPDAYADPRFNREVDLYTGYTT----RN
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CCDS47 ILCMPIVS--RGSVIGVVQMVNKI---SGSA--FSKTDENNFKMFAVFCALALHCANMYH
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CCDS47 RIRHSECIYRVTMEKLSYHSICTSEE---WQGLMQFTLPVRLCKEIELFHFDIGPFENMW
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CCDS47 PGIF-VYMVHRSCGTSCFEL--EKLCRFIMSVKKNYRR-VPYHNWKHAVTVAHCMYAILQ
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... ....:::::: ..:: ::. . :. . .::. .:: : :.:.:.: .:.:.::
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CCDS47 VAQKAAASED
780
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CCDS42 DNYRNN-PFHNFRHCFCVAQMMYSMVWLCSLQEKFSQTDILILMTAAICHDLDHPGYNNT
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: .. :: : : .:.:: ..:: : .:.:.. . .: . . :::
CCDS42 YQINARTELAVRYNDISPLENHHCAVAFQILAEPECNIFSNIPPDGFKQIRQGMITLILA
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::.: . . : : . ..:. . .. :. .:. ::.: ..: . . .. .
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...
CCDS42 MVEEIMLQPLWESRDRYEELKRIDDAMKELQKKTDSLTSGATEKSRERSRDVKNSEGDCA
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CCDS42 DNYRNN-PFHNFRHCFCVAQMMYSMVWLCSLQEKFSQTDILILMTAAICHDLDHPGYNNT
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670 680 690 700 710 720
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230 240 250 260 270 280
730 740 750 760 770 780
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CCDS42 TDMARHAEIMDSFKE--KMENFDYSNEEHMTLLKMILIKCCDISNEVRPMEVAEPWVDCL
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]