Result of FASTA (omim) for
pF1KE0348
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0348, 503 aa
1>>>pF1KE0348 503 - 503 aa - 503 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2020+/-0.000475; mu= -0.3285+/- 0.029
mean_var=239.2290+/-48.833, 0's: 0 Z-trim(116.5): 78 B-trim: 59 in 2/50
Lambda= 0.082922
statistics sampled from 27732 (27808) to 27732 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.326), width: 16
Scan time: 9.460
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_057069 (OMIM: 603705) angiopoietin-4 isoform 1 ( 503) 3326 411.5 2.9e-114
NP_001309738 (OMIM: 603705) angiopoietin-4 isoform ( 410) 2645 329.9 8.4e-90
XP_011527541 (OMIM: 603705) PREDICTED: angiopoieti ( 451) 2341 293.6 8e-79
NP_001186788 (OMIM: 601667) angiopoietin-1 isoform ( 497) 1575 202.0 3.3e-51
NP_001137 (OMIM: 601667) angiopoietin-1 isoform 1 ( 498) 1571 201.5 4.6e-51
NP_001138 (OMIM: 601922) angiopoietin-2 isoform a ( 496) 1531 196.7 1.3e-49
NP_001112359 (OMIM: 601922) angiopoietin-2 isoform ( 495) 1524 195.9 2.3e-49
NP_001112360 (OMIM: 601922) angiopoietin-2 isoform ( 444) 1180 154.7 5.1e-37
XP_016868807 (OMIM: 601922) PREDICTED: angiopoieti ( 443) 1173 153.9 9.1e-37
NP_001300980 (OMIM: 601667) angiopoietin-1 isoform ( 298) 1087 143.4 8.4e-34
NP_036230 (OMIM: 605001) angiopoietin-related prot ( 493) 696 96.8 1.5e-19
NP_004664 (OMIM: 603874) angiopoietin-related prot ( 491) 694 96.6 1.7e-19
XP_005245634 (OMIM: 603874) PREDICTED: angiopoieti ( 491) 694 96.6 1.7e-19
NP_001308340 (OMIM: 609336) angiopoietin-related p ( 470) 654 91.8 4.7e-18
XP_016882836 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 470) 654 91.8 4.7e-18
NP_114123 (OMIM: 609336) angiopoietin-related prot ( 470) 654 91.8 4.7e-18
XP_011526649 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 470) 654 91.8 4.7e-18
XP_011526652 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 470) 654 91.8 4.7e-18
XP_011526650 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 537) 654 91.9 5.2e-18
XP_011526651 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 537) 654 91.9 5.2e-18
XP_005260148 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 551) 654 91.9 5.3e-18
NP_001138578 (OMIM: 613357) fibrinogen C domain-co ( 461) 632 89.2 2.8e-17
NP_116232 (OMIM: 613357) fibrinogen C domain-conta ( 461) 632 89.2 2.8e-17
NP_001994 (OMIM: 601252) ficolin-1 precursor [Homo ( 326) 594 84.5 5.1e-16
NP_115859 (OMIM: 600985,606408,615963) tenascin-X ( 673) 591 84.4 1.1e-15
NP_647475 (OMIM: 605910,615881) angiopoietin-relat ( 406) 581 83.0 1.8e-15
NP_002395 (OMIM: 600596) microfibril-associated gl ( 255) 572 81.8 2.6e-15
NP_001185624 (OMIM: 600596) microfibril-associated ( 279) 572 81.8 2.8e-15
XP_006717078 (OMIM: 601624) PREDICTED: ficolin-2 i ( 264) 566 81.1 4.4e-15
NP_056652 (OMIM: 601624) ficolin-2 isoform b precu ( 275) 566 81.1 4.6e-15
NP_061978 (OMIM: 600985,606408,615963) tenascin-X (4242) 591 85.0 4.6e-15
XP_011516694 (OMIM: 601624) PREDICTED: ficolin-2 i ( 302) 566 81.1 4.9e-15
NP_004099 (OMIM: 601624) ficolin-2 isoform a precu ( 313) 566 81.1 5e-15
NP_055310 (OMIM: 604774,605019) angiopoietin-relat ( 460) 555 80.0 1.7e-14
NP_775628 (OMIM: 604973,613860) ficolin-3 isoform ( 288) 548 79.0 2.1e-14
NP_003656 (OMIM: 604973,613860) ficolin-3 isoform ( 299) 545 78.6 2.8e-14
NP_001315564 (OMIM: 601995) tenascin-R isoform 2 [ (1025) 554 80.1 3.4e-14
XP_011508251 (OMIM: 601995) PREDICTED: tenascin-R (1199) 554 80.2 3.8e-14
NP_003276 (OMIM: 601995) tenascin-R isoform 1 prec (1358) 554 80.2 4.2e-14
XP_016857707 (OMIM: 601995) PREDICTED: tenascin-R (1358) 554 80.2 4.2e-14
XP_016857708 (OMIM: 601995) PREDICTED: tenascin-R (1358) 554 80.2 4.2e-14
XP_005252032 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1564) 542 78.8 1.3e-13
XP_005252031 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1655) 542 78.8 1.3e-13
XP_006717164 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1655) 542 78.8 1.3e-13
XP_011516931 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1746) 542 78.9 1.4e-13
XP_011516930 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1746) 542 78.9 1.4e-13
NP_006673 (OMIM: 605351) fibroleukin precursor [Ho ( 439) 529 76.8 1.4e-13
XP_005252030 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1837) 542 78.9 1.4e-13
XP_011516928 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1929) 542 78.9 1.5e-13
XP_011516927 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (2019) 542 78.9 1.5e-13
>>NP_057069 (OMIM: 603705) angiopoietin-4 isoform 1 prec (503 aa)
initn: 3326 init1: 3326 opt: 3326 Z-score: 2172.3 bits: 411.5 E(85289): 2.9e-114
Smith-Waterman score: 3326; 100.0% identity (100.0% similar) in 503 aa overlap (1-503:1-503)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLSQLAMLQGSLLLVVATMSVAQQTRQEADRGCETLVVQHGHCSYTFLLPKSEPCPPGPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MLSQLAMLQGSLLLVVATMSVAQQTRQEADRGCETLVVQHGHCSYTFLLPKSEPCPPGPE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VSRDSNTLQRESLANPLHLGKLPTQQVKQLEQALQNNTQWLKKLERAIKTILRSKLEQVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 VSRDSNTLQRESLANPLHLGKLPTQQVKQLEQALQNNTQWLKKLERAIKTILRSKLEQVQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QQMAQNQTAPMLELGTSLLNQTTAQIRKLTDMEAQLLNQTSRMDAQMPETFLSTNKLENQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 QQMAQNQTAPMLELGTSLLNQTTAQIRKLTDMEAQLLNQTSRMDAQMPETFLSTNKLENQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LLLQRQKLQQLQGQNSALEKRLQALETKQQEELASILSKKAKLLNTLSRQSAALTNIERG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 LLLQRQKLQQLQGQNSALEKRLQALETKQQEELASILSKKAKLLNTLSRQSAALTNIERG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LRGVRHNSSLLQDQQHSLRQLLVLLRHLVQERANASAPAFIMAGEQVFQDCAEIQRSGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 LRGVRHNSSLLQDQQHSLRQLLVLLRHLVQERANASAPAFIMAGEQVFQDCAEIQRSGAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ASGVYTIQVSNATKPRKVFCDLQSSGGRWTLIQRRENGTVNFQRNWKDYKQGFGDPAGEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 ASGVYTIQVSNATKPRKVFCDLQSSGGRWTLIQRRENGTVNFQRNWKDYKQGFGDPAGEH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 WLGNEVVHQLTRRAAYSLRVELQDWEGHEAYAQYEHFHLGSENQLYRLSVVGYSGSAGRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 WLGNEVVHQLTRRAAYSLRVELQDWEGHEAYAQYEHFHLGSENQLYRLSVVGYSGSAGRQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 SSLVLQNTSFSTLDSDNDHCLCKCAQVMSGGWWFDACGLSNLNGVYYHAPDNKYKMDGIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 SSLVLQNTSFSTLDSDNDHCLCKCAQVMSGGWWFDACGLSNLNGVYYHAPDNKYKMDGIR
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE0 WHYFKGPSYSLRASRMMIRPLDI
:::::::::::::::::::::::
NP_057 WHYFKGPSYSLRASRMMIRPLDI
490 500
>>NP_001309738 (OMIM: 603705) angiopoietin-4 isoform 2 p (410 aa)
initn: 2645 init1: 2645 opt: 2645 Z-score: 1733.2 bits: 329.9 E(85289): 8.4e-90
Smith-Waterman score: 2645; 99.5% identity (99.8% similar) in 410 aa overlap (1-410:1-410)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLSQLAMLQGSLLLVVATMSVAQQTRQEADRGCETLVVQHGHCSYTFLLPKSEPCPPGPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLSQLAMLQGSLLLVVATMSVAQQTRQEADRGCETLVVQHGHCSYTFLLPKSEPCPPGPE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VSRDSNTLQRESLANPLHLGKLPTQQVKQLEQALQNNTQWLKKLERAIKTILRSKLEQVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSRDSNTLQRESLANPLHLGKLPTQQVKQLEQALQNNTQWLKKLERAIKTILRSKLEQVQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QQMAQNQTAPMLELGTSLLNQTTAQIRKLTDMEAQLLNQTSRMDAQMPETFLSTNKLENQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QQMAQNQTAPMLELGTSLLNQTTAQIRKLTDMEAQLLNQTSRMDAQMPETFLSTNKLENQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LLLQRQKLQQLQGQNSALEKRLQALETKQQEELASILSKKAKLLNTLSRQSAALTNIERG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLLQRQKLQQLQGQNSALEKRLQALETKQQEELASILSKKAKLLNTLSRQSAALTNIERG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LRGVRHNSSLLQDQQHSLRQLLVLLRHLVQERANASAPAFIMAGEQVFQDCAEIQRSGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRGVRHNSSLLQDQQHSLRQLLVLLRHLVQERANASAPAFIMAGEQVFQDCAEIQRSGAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ASGVYTIQVSNATKPRKVFCDLQSSGGRWTLIQRRENGTVNFQRNWKDYKQGFGDPAGEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASGVYTIQVSNATKPRKVFCDLQSSGGRWTLIQRRENGTVNFQRNWKDYKQGFGDPAGEH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 WLGNEVVHQLTRRAAYSLRVELQDWEGHEAYAQYEHFHLGSENQLYRLSVVGYSGSAGRQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :
NP_001 WLGNEVVHQLTRRAAYSLRVELQDWEGHEAYAQYEHFHLGSENQLYRVVV
370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 SSLVLQNTSFSTLDSDNDHCLCKCAQVMSGGWWFDACGLSNLNGVYYHAPDNKYKMDGIR
>>XP_011527541 (OMIM: 603705) PREDICTED: angiopoietin-4 (451 aa)
initn: 2331 init1: 2331 opt: 2341 Z-score: 1536.1 bits: 293.6 E(85289): 8e-79
Smith-Waterman score: 2900; 89.7% identity (89.7% similar) in 503 aa overlap (1-503:1-451)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLSQLAMLQGSLLLVVATMSVAQQTRQEADRGCETLVVQHGHCSYTFLLPKSEPCPPGPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MLSQLAMLQGSLLLVVATMSVAQQTRQEADRGCETLVVQHGHCSYTFLLPKSEPCPPGPE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VSRDSNTLQRESLANPLHLGKLPTQQVKQLEQALQNNTQWLKKLERAIKTILRSKLEQVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSRDSNTLQRESLANPLHLGKLPTQQVKQLEQALQNNTQWLKKL----------------
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QQMAQNQTAPMLELGTSLLNQTTAQIRKLTDMEAQLLNQTSRMDAQMPETFLSTNKLENQ
::::::::::::::::::::::::
XP_011 ------------------------------------LNQTSRMDAQMPETFLSTNKLENQ
110 120
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LLLQRQKLQQLQGQNSALEKRLQALETKQQEELASILSKKAKLLNTLSRQSAALTNIERG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLLQRQKLQQLQGQNSALEKRLQALETKQQEELASILSKKAKLLNTLSRQSAALTNIERG
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LRGVRHNSSLLQDQQHSLRQLLVLLRHLVQERANASAPAFIMAGEQVFQDCAEIQRSGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LRGVRHNSSLLQDQQHSLRQLLVLLRHLVQERANASAPAFIMAGEQVFQDCAEIQRSGAS
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ASGVYTIQVSNATKPRKVFCDLQSSGGRWTLIQRRENGTVNFQRNWKDYKQGFGDPAGEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASGVYTIQVSNATKPRKVFCDLQSSGGRWTLIQRRENGTVNFQRNWKDYKQGFGDPAGEH
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 WLGNEVVHQLTRRAAYSLRVELQDWEGHEAYAQYEHFHLGSENQLYRLSVVGYSGSAGRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WLGNEVVHQLTRRAAYSLRVELQDWEGHEAYAQYEHFHLGSENQLYRLSVVGYSGSAGRQ
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 SSLVLQNTSFSTLDSDNDHCLCKCAQVMSGGWWFDACGLSNLNGVYYHAPDNKYKMDGIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSLVLQNTSFSTLDSDNDHCLCKCAQVMSGGWWFDACGLSNLNGVYYHAPDNKYKMDGIR
370 380 390 400 410 420
490 500
pF1KE0 WHYFKGPSYSLRASRMMIRPLDI
:::::::::::::::::::::::
XP_011 WHYFKGPSYSLRASRMMIRPLDI
430 440 450
>>NP_001186788 (OMIM: 601667) angiopoietin-1 isoform 2 p (497 aa)
initn: 1556 init1: 1016 opt: 1575 Z-score: 1040.3 bits: 202.0 E(85289): 3.3e-51
Smith-Waterman score: 1575; 45.7% identity (76.9% similar) in 497 aa overlap (12-502:10-496)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLSQLAMLQGSLLLVVATMSVAQQTRQEADRGCETLVVQHGHCSYTFLLPKSEP-CPPGP
: ... .. ..: :. . : . .:::.:.:::.::. . : .
NP_001 MTVFLSFAFLAAILTHIGCSNQRRSPENSGRRYNRIQHGQCAYTFILPEHDGNCREST
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 EVSRDSNTLQRESLANPLHLGKLPTQQVKQLEQALQNNTQWLKKLERAIKTILRSKLEQV
. ..:.:::.. : . .:....::....: ::::.::: : ..:.. :.
NP_001 TDQYNTNALQRDA---PHVEPDFSSQKLQHLEHVMENYTQWLQKLENYIVENMKSEMAQI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 QQQMAQNQTAPMLELGTSLLNQTTAQIRKLTDMEAQLLNQTSRMDAQMPETFLSTNKLEN
::. .::.:: :::.:::::.::. : :::::.:.:.::::::.. :. :. ::: :::.
NP_001 QQNAVQNHTATMLEIGTSLLSQTAEQTRKLTDVETQVLNQTSRLEIQLLENSLSTYKLEK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 QLLLQRQKLQQLQGQNSALEKRLQALETKQQEELASILSKKAKLLNTLSRQSAALTNIER
::: : ... ... .:: ::... .: :..::: .. .: .: . ..::. . ..:.
NP_001 QLLQQTNEILKIHEKNSLLEHKILEMEGKHKEELDTLKEEKENLQGLVTRQTYIIQELEK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GLRGVRHNSSLLQDQQHSLRQLLVLLRHLVQERANASAPAFIMAG-----EQVFQDCAEI
: . :.:.:: :: .:. ...:: : . .. : :. :.:::..
NP_001 QLNRATTNNSVLQKQQL---ELMDTVHNLV----NLCTKEVLLKGGKREEEKPFRDCADV
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 QRSGASASGVYTIQVSNATKPRKVFCDLQSSGGRWTLIQRRENGTVNFQRNWKDYKQGFG
..: . ::.::: ..: .:.::::... .:: ::.::.::.:...:::.::.::.:::
NP_001 YQAGFNKSGIYTIYINNMPEPKKVFCNMDVNGGGWTVIQHREDGSLDFQRGWKEYKMGFG
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 DPAGEHWLGNEVVHQLTRRAAYSLRVELQDWEGHEAYAQYEHFHLGSENQLYRLSVVGYS
.:.::.::::: . .: . : ::.::.::::..::.::..::.:.:.: ::: . :..
NP_001 NPSGEYWLGNEFIFAITSQRQYMLRIELMDWEGNRAYSQYDRFHIGNEKQNYRLYLKGHT
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 GSAGRQSSLVLQNTSFSTLDSDNDHCLCKCAQVMSGGWWFDACGLSNLNGVYYHAPDNKY
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NP_001 NGIKWYYWKGSGYSLKATTMMIRPADF
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NP_001 NGIKWYYWKGSGYSLKATTMMIRPADF
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XP_016 SGHTTNGIYTLTFPNSTEEIKAYCDMEAGGGGWTIIQRREDGSVDFQRTWKEYKVGFGNP
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pF1KE0 DGIRWHYFKGPSYSLRASRMMIRPLDI
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XP_016 NGIKWYYWKGSGYSLKATTMMIRPADF
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>>NP_001300980 (OMIM: 601667) angiopoietin-1 isoform 3 [ (298 aa)
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NP_001 MEGKHKEELDTLKEEKENLQGLVTRQTYII
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pF1KE0 TNIERGLRGVRHNSSLLQDQQHSLRQLLVLLRHLVQERANASAPAFIMAG-----EQVFQ
..:. : . :.:.:: :: .:. ...::. . . .. : :. :.
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pF1KE0 DCAEIQRSGASASGVYTIQVSNATKPRKVFCDLQSSGGRWTLIQRRENGTVNFQRNWKDY
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NP_001 DCADVYQAGFNKSGIYTIYINNMPEPKKVFCNMDVNGGGWTVIQHREDGSLDFQRGWKEY
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pF1KE0 VVGYSGSAGRQSSLVLQNTSFSTLDSDNDHCLCKCAQVMSGGWWFDACGLSNLNGVYYHA
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210 220 230 240 250 260
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