Result of FASTA (omim) for
pF1KE0350
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0350, 747 aa
1>>>pF1KE0350 747 - 747 aa - 747 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3027+/-0.000482; mu= 20.3066+/- 0.030
mean_var=72.8535+/-14.878, 0's: 0 Z-trim(108.2): 38 B-trim: 47 in 1/53
Lambda= 0.150262
statistics sampled from 16232 (16254) to 16232 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.544), E-opt: 0.2 (0.191), width: 16
Scan time: 9.430
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000027 (OMIM: 102770,615511) AMP deaminase 1 is ( 780) 5045 1104.0 0
NP_001166097 (OMIM: 102770,615511) AMP deaminase 1 ( 776) 4999 1094.0 0
NP_001020560 (OMIM: 102772,612874) AMP deaminase 3 ( 767) 2991 658.7 2.5e-188
NP_001165901 (OMIM: 102772,612874) AMP deaminase 3 ( 767) 2991 658.7 2.5e-188
NP_001020561 (OMIM: 102772,612874) AMP deaminase 3 ( 774) 2991 658.7 2.5e-188
NP_000471 (OMIM: 102772,612874) AMP deaminase 3 is ( 776) 2991 658.7 2.5e-188
NP_001165902 (OMIM: 102772,612874) AMP deaminase 3 ( 608) 2855 629.2 1.6e-179
NP_981949 (OMIM: 102771,615686,615809) AMP deamina ( 760) 2331 515.6 2.9e-145
NP_001244290 (OMIM: 102771,615686,615809) AMP deam ( 761) 2331 515.6 2.9e-145
NP_631895 (OMIM: 102771,615686,615809) AMP deamina ( 798) 2331 515.6 3e-145
NP_001295099 (OMIM: 102771,615686,615809) AMP deam ( 804) 2331 515.6 3e-145
NP_004028 (OMIM: 102771,615686,615809) AMP deamina ( 879) 2331 515.7 3.3e-145
NP_001244289 (OMIM: 102771,615686,615809) AMP deam ( 879) 2331 515.7 3.3e-145
>>NP_000027 (OMIM: 102770,615511) AMP deaminase 1 isofor (780 aa)
initn: 5045 init1: 5045 opt: 5045 Z-score: 5908.4 bits: 1104.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5045; 100.0% identity (100.0% similar) in 747 aa overlap (1-747:34-780)
10 20 30
pF1KE0 MPLFKLPAEEKQIDDAMRNFAEKVFASEVK
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RIFYSVSQSPHSLLSLLFYCAILESRISATMPLFKLPAEEKQIDDAMRNFAEKVFASEVK
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 DEGGRQEISPFDVDEICPISHHEMQAHIFHLETLSTSTEARRKKRFQGRKTVNLSIPLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DEGGRQEISPFDVDEICPISHHEMQAHIFHLETLSTSTEARRKKRFQGRKTVNLSIPLSE
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 TSSTKLSHIDEYISSSPTYQTVPDFQRVQITGDYASGVTVEDFEIVCKGLYRALCIREKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TSSTKLSHIDEYISSSPTYQTVPDFQRVQITGDYASGVTVEDFEIVCKGLYRALCIREKY
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 MQKSFQRFPKTPSKYLRNIDGEAWVANESFYPVFTPPVKKGEDPFRTDNLPENLGYHLKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MQKSFQRFPKTPSKYLRNIDGEAWVANESFYPVFTPPVKKGEDPFRTDNLPENLGYHLKM
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 KDGVVYVYPNEAAVSKDEPKPLPYPNLDTFLDDMNFLLALIAQGPVKTYTHRRLKFLSSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KDGVVYVYPNEAAVSKDEPKPLPYPNLDTFLDDMNFLLALIAQGPVKTYTHRRLKFLSSK
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 FQVHQMLNEMDELKELKNNPHRDFYNCRKVDTHIHAAACMNQKHLLRFIKKSYQIDADRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FQVHQMLNEMDELKELKNNPHRDFYNCRKVDTHIHAAACMNQKHLLRFIKKSYQIDADRV
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 VYSTKEKNLTLKELFAKLKMHPYDLTVDSLDVHAGRQTFQRFDKFNDKYNPVGASELRDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VYSTKEKNLTLKELFAKLKMHPYDLTVDSLDVHAGRQTFQRFDKFNDKYNPVGASELRDL
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 YLKTDNYINGEYFATIIKEVGADLVEAKYQHAEPRLSIYGRSPDEWSKLSSWFVCNRIHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YLKTDNYINGEYFATIIKEVGADLVEAKYQHAEPRLSIYGRSPDEWSKLSSWFVCNRIHC
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 PNMTWMIQVPRIYDVFRSKNFLPHFGKMLENIFMPVFEATINPQADPELSVFLKHITGFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PNMTWMIQVPRIYDVFRSKNFLPHFGKMLENIFMPVFEATINPQADPELSVFLKHITGFD
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 SVDDESKHSGHMFSSKSPKPQEWTLEKNPSYTYYAYYMYANIMVLNSLRKERGMNTFLFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SVDDESKHSGHMFSSKSPKPQEWTLEKNPSYTYYAYYMYANIMVLNSLRKERGMNTFLFR
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KE0 PHCGEAGALTHLMTAFMIADDISHGLNLKKSPVLQYLFFLAQIPIAMSPLSNNSLFLEYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PHCGEAGALTHLMTAFMIADDISHGLNLKKSPVLQYLFFLAQIPIAMSPLSNNSLFLEYA
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KE0 KNPFLDFLQKGLMISLSTDDPMQFHFTKEPLMEEYAIAAQVFKLSTCDMCEVARNSVLQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KNPFLDFLQKGLMISLSTDDPMQFHFTKEPLMEEYAIAAQVFKLSTCDMCEVARNSVLQC
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740
pF1KE0 GISHEEKVKFLGDNYLEEGPAGNDIRRTNVAQIRMAYRYETWCYELNLIAEGLKSTE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GISHEEKVKFLGDNYLEEGPAGNDIRRTNVAQIRMAYRYETWCYELNLIAEGLKSTE
730 740 750 760 770 780
>>NP_001166097 (OMIM: 102770,615511) AMP deaminase 1 iso (776 aa)
initn: 5003 init1: 4966 opt: 4999 Z-score: 5854.6 bits: 1094.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4999; 99.3% identity (99.5% similar) in 747 aa overlap (1-747:34-776)
10 20 30
pF1KE0 MPLFKLPAEEKQIDDAMRNFAEKVFASEVK
::::::: .::::::::::::::::::
NP_001 RIFYSVSQSPHSLLSLLFYCAILESRISATMPLFKLP----EIDDAMRNFAEKVFASEVK
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 DEGGRQEISPFDVDEICPISHHEMQAHIFHLETLSTSTEARRKKRFQGRKTVNLSIPLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DEGGRQEISPFDVDEICPISHHEMQAHIFHLETLSTSTEARRKKRFQGRKTVNLSIPLSE
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 TSSTKLSHIDEYISSSPTYQTVPDFQRVQITGDYASGVTVEDFEIVCKGLYRALCIREKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSSTKLSHIDEYISSSPTYQTVPDFQRVQITGDYASGVTVEDFEIVCKGLYRALCIREKY
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 MQKSFQRFPKTPSKYLRNIDGEAWVANESFYPVFTPPVKKGEDPFRTDNLPENLGYHLKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MQKSFQRFPKTPSKYLRNIDGEAWVANESFYPVFTPPVKKGEDPFRTDNLPENLGYHLKM
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 KDGVVYVYPNEAAVSKDEPKPLPYPNLDTFLDDMNFLLALIAQGPVKTYTHRRLKFLSSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDGVVYVYPNEAAVSKDEPKPLPYPNLDTFLDDMNFLLALIAQGPVKTYTHRRLKFLSSK
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 FQVHQMLNEMDELKELKNNPHRDFYNCRKVDTHIHAAACMNQKHLLRFIKKSYQIDADRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FQVHQMLNEMDELKELKNNPHRDFYNCRKVDTHIHAAACMNQKHLLRFIKKSYQIDADRV
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 VYSTKEKNLTLKELFAKLKMHPYDLTVDSLDVHAGRQTFQRFDKFNDKYNPVGASELRDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VYSTKEKNLTLKELFAKLKMHPYDLTVDSLDVHAGRQTFQRFDKFNDKYNPVGASELRDL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 YLKTDNYINGEYFATIIKEVGADLVEAKYQHAEPRLSIYGRSPDEWSKLSSWFVCNRIHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLKTDNYINGEYFATIIKEVGADLVEAKYQHAEPRLSIYGRSPDEWSKLSSWFVCNRIHC
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 PNMTWMIQVPRIYDVFRSKNFLPHFGKMLENIFMPVFEATINPQADPELSVFLKHITGFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNMTWMIQVPRIYDVFRSKNFLPHFGKMLENIFMPVFEATINPQADPELSVFLKHITGFD
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 SVDDESKHSGHMFSSKSPKPQEWTLEKNPSYTYYAYYMYANIMVLNSLRKERGMNTFLFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVDDESKHSGHMFSSKSPKPQEWTLEKNPSYTYYAYYMYANIMVLNSLRKERGMNTFLFR
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KE0 PHCGEAGALTHLMTAFMIADDISHGLNLKKSPVLQYLFFLAQIPIAMSPLSNNSLFLEYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PHCGEAGALTHLMTAFMIADDISHGLNLKKSPVLQYLFFLAQIPIAMSPLSNNSLFLEYA
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KE0 KNPFLDFLQKGLMISLSTDDPMQFHFTKEPLMEEYAIAAQVFKLSTCDMCEVARNSVLQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KNPFLDFLQKGLMISLSTDDPMQFHFTKEPLMEEYAIAAQVFKLSTCDMCEVARNSVLQC
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740
pF1KE0 GISHEEKVKFLGDNYLEEGPAGNDIRRTNVAQIRMAYRYETWCYELNLIAEGLKSTE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GISHEEKVKFLGDNYLEEGPAGNDIRRTNVAQIRMAYRYETWCYELNLIAEGLKSTE
720 730 740 750 760 770
>>NP_001020560 (OMIM: 102772,612874) AMP deaminase 3 iso (767 aa)
initn: 3129 init1: 2779 opt: 2991 Z-score: 3502.1 bits: 658.7 E(85289): 2.5e-188
Smith-Waterman score: 3101; 60.5% identity (83.2% similar) in 751 aa overlap (12-747:12-761)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPLFKLPAEEKQIDDAMRNFAEKVFASEVKDEGGRQEISPFDVDEICPISHHEMQAHIFH
..:. .: .::::::. ...: ... .: : : : :::...: . . ..
NP_001 MPRQFPKLNISEVDEQVRLLAEKVFAKVLREEDSKDALSLFTVPEDCPIGQKEAKERELQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KE0 LETL-STSTE-ARRKKRFQGRKTVNLSIPLSE--------TSSTKLSHIDEYISS-----
: . :.: :.::: :. .. .::. . ..: .: ...
NP_001 KELAEQKSVETAKRKKSFKMIRSQSLSLQMPPQQDWKGPPAASPAMSPTTPVVTGATSLP
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 SPTYQTVPDFQRVQITGDYASGVTVEDFEIVCKGLYRALCIREKYMQKSFQRFPKTPSKY
.:. ..:.:::: :.::: .:.:.::.: . :.: .:: ::::: . ...:::. :.:
NP_001 TPAPYAMPEFQRVTISGDYCAGITLEDYEQAAKSLAKALMIREKYARLAYHRFPRITSQY
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LRNIDGEAWVANESFYPVFTPPVKKGEDPFRTDNLPENLGYHLKMKDGVVYVYPNEAAVS
: . ... .:.. : : :: :::. :. : :: : ..:. :...:: :. .
NP_001 LGHPRADTAPPEEGL-PDFHPPPLPQEDPYCLDDAPPNLDYLVHMQGGILFVYDNKKMLE
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 KDEPKPLPYPNLDTFLDDMNFLLALIAQGPVKTYTHRRLKFLSSKFQVHQMLNEMDELKE
..::. ::::.:.:. ::. .::::..::.::: ::::.:: :::..:.:::::.:.::
NP_001 HQEPHSLPYPDLETYTVDMSHILALITDGPTKTYCHRRLNFLESKFSLHEMLNEMSEFKE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LKNNPHRDFYNCRKVDTHIHAAACMNQKHLLRFIKKSYQIDADRVVYSTKEKNLTLKELF
::.:::::::: :::::::::::::::::::::::..:: . ::.: . ...::...:
NP_001 LKSNPHRDFYNVRKVDTHIHAAACMNQKHLLRFIKHTYQTEPDRTVAEKRGRKITLRQVF
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 AKLKMHPYDLTVDSLDVHAGRQTFQRFDKFNDKYNPVGASELRDLYLKTDNYINGEYFAT
:.: ::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::.::..:::::
NP_001 DGLHMDPYDLTVDSLDVHAGRQTFHRFDKFNSKYNPVGASELRDLYLKTENYLGGEYFAR
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 IIKEVGADLVEAKYQHAEPRLSIYGRSPDEWSKLSSWFVCNRIHCPNMTWMIQVPRIYDV
..:::. .: :.:::..:::::::::::.:: .:. ::. .... ::: :.::::::::.
NP_001 MVKEVARELEESKYQYSEPRLSIYGRSPEEWPNLAYWFIQHKVYSPNMRWIIQVPRIYDI
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 FRSKNFLPHFGKMLENIFMPVFEATINPQADPELSVFLKHITGFDSVDDESKHSGHMFSS
::::..::.:::::::::.:.:.:::::: :: .:::..::::::::::::: ::::.
NP_001 FRSKKLLPNFGKMLENIFLPLFKATINPQDHRELHLFLKYVTGFDSVDDESKHSDHMFSD
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 KSPKPQEWTLEKNPSYTYYAYYMYANIMVLNSLRKERGMNTFLFRPHCGEAGALTHLMTA
:::.:. :: :.:: :.:: :::::::::::.::.:::..::::::::::::..:::..:
NP_001 KSPNPDVWTSEQNPPYSYYLYYMYANIMVLNNLRRERGLSTFLFRPHCGEAGSITHLVSA
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE0 FMIADDISHGLNLKKSPVLQYLFFLAQIPIAMSPLSNNSLFLEYAKNPFLDFLQKGLMIS
:. ::.::::: ::::::::::..::::::::::::::::::::.:::. .::.::: .:
NP_001 FLTADNISHGLLLKKSPVLQYLYYLAQIPIAMSPLSNNSLFLEYSKNPLREFLHKGLHVS
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE0 LSTDDPMQFHFTKEPLMEEYAIAAQVFKLSTCDMCEVARNSVLQCGISHEEKVKFLGDNY
::::::::::.::: :::::::::::.::::::.::.::::::: :.::.:: ::::.::
NP_001 LSTDDPMQFHYTKEALMEEYAIAAQVWKLSTCDLCEIARNSVLQSGLSHQEKQKFLGQNY
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740
pF1KE0 LEEGPAGNDIRRTNVAQIRMAYRYETWCYELNLIAEGLKSTE
.::: :::::.:::::::::.:::: : ::.......:: :
NP_001 YKEGPEGNDIRKTNVAQIRMAFRYETLCNELSFLSDAMKSEEITALTN
720 730 740 750 760
>>NP_001165901 (OMIM: 102772,612874) AMP deaminase 3 iso (767 aa)
initn: 3129 init1: 2779 opt: 2991 Z-score: 3502.1 bits: 658.7 E(85289): 2.5e-188
Smith-Waterman score: 3101; 60.5% identity (83.2% similar) in 751 aa overlap (12-747:12-761)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPLFKLPAEEKQIDDAMRNFAEKVFASEVKDEGGRQEISPFDVDEICPISHHEMQAHIFH
..:. .: .::::::. ...: ... .: : : : :::...: . . ..
NP_001 MPRQFPKLNISEVDEQVRLLAEKVFAKVLREEDSKDALSLFTVPEDCPIGQKEAKERELQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KE0 LETL-STSTE-ARRKKRFQGRKTVNLSIPLSE--------TSSTKLSHIDEYISS-----
: . :.: :.::: :. .. .::. . ..: .: ...
NP_001 KELAEQKSVETAKRKKSFKMIRSQSLSLQMPPQQDWKGPPAASPAMSPTTPVVTGATSLP
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 SPTYQTVPDFQRVQITGDYASGVTVEDFEIVCKGLYRALCIREKYMQKSFQRFPKTPSKY
.:. ..:.:::: :.::: .:.:.::.: . :.: .:: ::::: . ...:::. :.:
NP_001 TPAPYAMPEFQRVTISGDYCAGITLEDYEQAAKSLAKALMIREKYARLAYHRFPRITSQY
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LRNIDGEAWVANESFYPVFTPPVKKGEDPFRTDNLPENLGYHLKMKDGVVYVYPNEAAVS
: . ... .:.. : : :: :::. :. : :: : ..:. :...:: :. .
NP_001 LGHPRADTAPPEEGL-PDFHPPPLPQEDPYCLDDAPPNLDYLVHMQGGILFVYDNKKMLE
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 KDEPKPLPYPNLDTFLDDMNFLLALIAQGPVKTYTHRRLKFLSSKFQVHQMLNEMDELKE
..::. ::::.:.:. ::. .::::..::.::: ::::.:: :::..:.:::::.:.::
NP_001 HQEPHSLPYPDLETYTVDMSHILALITDGPTKTYCHRRLNFLESKFSLHEMLNEMSEFKE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LKNNPHRDFYNCRKVDTHIHAAACMNQKHLLRFIKKSYQIDADRVVYSTKEKNLTLKELF
::.:::::::: :::::::::::::::::::::::..:: . ::.: . ...::...:
NP_001 LKSNPHRDFYNVRKVDTHIHAAACMNQKHLLRFIKHTYQTEPDRTVAEKRGRKITLRQVF
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 AKLKMHPYDLTVDSLDVHAGRQTFQRFDKFNDKYNPVGASELRDLYLKTDNYINGEYFAT
:.: ::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::.::..:::::
NP_001 DGLHMDPYDLTVDSLDVHAGRQTFHRFDKFNSKYNPVGASELRDLYLKTENYLGGEYFAR
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 IIKEVGADLVEAKYQHAEPRLSIYGRSPDEWSKLSSWFVCNRIHCPNMTWMIQVPRIYDV
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..: . ::: .::.:. :::::::::: .:.:. .:: :. :. : :: :.:: :: .:
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