FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0351, 818 aa
1>>>pF1KE0351 818 - 818 aa - 818 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1010+/-0.000937; mu= 16.1507+/- 0.056
mean_var=81.1391+/-16.134, 0's: 0 Z-trim(107.0): 76 B-trim: 50 in 1/50
Lambda= 0.142383
statistics sampled from 9259 (9337) to 9259 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.661), E-opt: 0.2 (0.287), width: 16
Scan time: 4.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32203.1 PLA2G4D gene_id:283748|Hs108|chr15 ( 818) 5484 1136.8 0
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CCDS55961.1 PLA2G4B gene_id:8681|Hs108|chr15 ( 893) 1605 340.0 1.1e-92
CCDS1372.1 PLA2G4A gene_id:5321|Hs108|chr1 ( 749) 643 142.3 2.8e-33
>>CCDS32203.1 PLA2G4D gene_id:283748|Hs108|chr15 (818 aa)
initn: 5484 init1: 5484 opt: 5484 Z-score: 6084.5 bits: 1136.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5484; 100.0% identity (100.0% similar) in 818 aa overlap (1-818:1-818)
10 20 30 40 50 60
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CCDS32 MESLSPGGPPGHPYQGEASTCWQLTVRVLEARNLRWADLLSEADPYVILQLSTAPGMKFK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TKTLTDTSHPVWNEAFRFLIQSQVKNVLELSIYDEDSVTEDDICFKVLYDISEVLPGKLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RKTFSQSPQGEEELDVEFLMEETSDRPENLITNKVIVARELSCLDVHLDSTGSTAVVADQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DKLELELVLKGSYEDTQTSFLGTASAFRFHYMAALETELSGRLRSSRSNGWNGDNSAGYL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TVPLRPLTIGKEVTMDVPAPNAPGVRLQLKAEGCPEELAVHLGFNLCAEEQAFLSRRKQV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 VAKALKQALQLDRDLQEDEVPVVGIMATGGGARAMTSLYGHLLALQKLGLLDCVTYFSGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VAKALKQALQLDRDLQEDEVPVVGIMATGGGARAMTSLYGHLLALQKLGLLDCVTYFSGI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SGSTWTMAHLYGDPEWSQRDLEGPIRYAREHLAKSKLEVFSPERLASYRRELELRAEQGH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 PTTFVDLWALVLESMLHGQVMDQKLSGQRAALERGQNPLPLYLSLNVKENNLETLDFKEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PTTFVDLWALVLESMLHGQVMDQKLSGQRAALERGQNPLPLYLSLNVKENNLETLDFKEW
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 VEFSPYEVGFLKYGAFVPPELFGSEFFMGRLMRRIPEPRICFLEAIWSNIFSLNLLDAWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VEFSPYEVGFLKYGAFVPPELFGSEFFMGRLMRRIPEPRICFLEAIWSNIFSLNLLDAWY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 DLTSSGESWKQHIKDKTRSLEKEPLTTSGTSSRLEASWLQPGTALAQAFKGFLTGRPLHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DLTSSGESWKQHIKDKTRSLEKEPLTTSGTSSRLEASWLQPGTALAQAFKGFLTGRPLHQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 RSPNFLQGLQLHQDYCSHKDFSTWADYQLDSMPSQLTPKEPRLCLVDAAYFINTSSPSMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RSPNFLQGLQLHQDYCSHKDFSTWADYQLDSMPSQLTPKEPRLCLVDAAYFINTSSPSMF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 RPGRRLDLILSFDYSLSAPFEALQQTELYCRARGLPFPRVEPSPQDQHQPRECHLFSDPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RPGRRLDLILSFDYSLSAPFEALQQTELYCRARGLPFPRVEPSPQDQHQPRECHLFSDPA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 CPEAPILLHFPLVNASFKDHSAPGVQRSPAELQGGQVDLTGATCPYTLSNMTYKEEDFER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CPEAPILLHFPLVNASFKDHSAPGVQRSPAELQGGQVDLTGATCPYTLSNMTYKEEDFER
730 740 750 760 770 780
790 800 810
pF1KE0 LLRLSDYNVQTSQGAILQALRTALKHRTLEARPPRAQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLRLSDYNVQTSQGAILQALRTALKHRTLEARPPRAQT
790 800 810
>>CCDS55962.1 PLA2G4E gene_id:123745|Hs108|chr15 (868 aa)
initn: 2337 init1: 797 opt: 2374 Z-score: 2631.5 bits: 497.9 E(32554): 3e-140
Smith-Waterman score: 2385; 45.4% identity (73.9% similar) in 832 aa overlap (5-814:46-867)
10 20
pF1KE0 MESLSPGGPP---GHPYQGEA--STCWQLTVRVL
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CCDS55 VFVPQSPQTDEEGSRSGRSFSEFEDTQDLDTPGLPPFCPMAPWGSEEGLSPCHLLTVRVI
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 EARNLRWADLLSEADPYVILQLSTAPGMKFKTKTLTDTSHPVWNEAFRFLIQSQVKNVLE
. .:.: ::.::..: .: : : :: :..:.:... .: :::.: : :::.::::::
CCDS55 RMKNVRQADMLSQTDCFVSLWLPTASQKKLRTRTISNCPNPEWNESFNFQIQSRVKNVLE
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 LSIYDEDSVTEDDICFKVLYDISEVLPGKLLRKTFSQSPQGEEELDVEFLMEETSDRPEN
::. :::.:: :: . ::::.... : . : .::: :::.::::.::. . ::.
CCDS55 LSVCDEDTVTPDDHLLTVLYDLTKLCFRKKTHVKFPLNPQGMEELEVEFLLEESPSPPET
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 LITNKVIVARELSCLDVHLDSTGSTAVVADQDKLELELVLKG-SYEDTQT------SFLG
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CCDS55 LVTNGVLVSRQVSCLEVHAQSRRRRK----REKMKDLLVMVNESFENTQRVRPCLEPCCP
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250
pF1KE0 TASAFR----FHYMAALETELSGRL-RSSRSNGWNGDN-SAGYLTVPLRPLTIGKEVTMD
:.. :. ::: ..... .. .: : : . . : .. :: :. :. .:.
CCDS55 TSACFQTAACFHYPKYFQSQVHVEVPKSHWSCGLCCRSRKKGPISQPLDCLSDGQVMTL-
260 270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 VPAPNAPGVRLQLKAEGCPEELAVHLGFNLCAEEQAFLSRRKQVVAKALKQALQLDRDLQ
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CCDS55 ---PVGESYELHMKSTPCPETLDVRLGFSLCPAELEFLQKRKVVVAKALKQVLQLEEDLQ
320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 EDEVPVVGIMATGGGARAMTSLYGHLLALQKLGLLDCVTYFSGISGSTWTMAHLYGDPEW
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CCDS55 EDEVPLIAIMATGGGTRSMTSMYGHLLGLQKLNLLDCASYITGLSGATWTMATLYRDPDW
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 SQRDLEGPIRYAREHLAKSKLEVFSPERLASYRRELELRAEQGHPTTFVDLWALVLESML
:...:: : ::.:..:.:: . :..: ....::. :...:. .::.:.:.:..:. :
CCDS55 SSKNLEPAIFEARRHVVKDKLPSLFPDQLRKFQEELRQRSQEGYRVTFTDFWGLLIETCL
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KE0 HGQVMDQKLSGQRAALERGQNPLPLYLSLNVKENNLETLDFKEWVEFSPYEVGFLKYGAF
. . ::: ::::: ::::::.::..:::.. . . ::.:: ::::::::. :::::
CCDS55 GDERNECKLSDQRAALSCGQNPLPIYLTINVKDD-VSNQDFREWFEFSPYEVGLQKYGAF
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KE0 VPPELFGSEFFMGRLMRRIPEPRICFLEAIWSNIFSLNLLDAWYDLTSSGESWKQHIKDK
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CCDS55 IPSELFGSEFFMGRLVKRIPESRICYMLGLWSSIFSLNLLDAWNLSHTSEEFFHRWTREK
550 560 570 580 590 600
560 570 580 590 600 610
pF1KE0 TRSLEKEPLTT---SGTSSRLEASWLQPGTALAQAFKGFLTGRPLHQRSPNFLQGLQLHQ
....: ::. . .. ::.. . ::. :...:. .:: : . .. :::.:::::
CCDS55 VQDIEDEPILPEIPKCDANILETTVVIPGSWLSNSFREILTHRSFVSEFHNFLSGLQLHT
610 620 630 640 650 660
620 630 640 650 660 670
pF1KE0 DYCSHKDFSTWADYQLDSMPSQLTPKEPRLCLVDAAYFINTSSPSMFRPGRRLDLILSFD
.: .. .:: : : ::..:.::: . .:::.:.:.:.:.: : ..:: :. :::. ..
CCDS55 NYLQNGQFSRWKDTVLDGFPNQLTESANHLCLLDTAFFVNSSYPPLLRPERKADLIIHLN
670 680 690 700 710 720
680 690 700 710 720 730
pF1KE0 YSLSAPFEALQQTELYCRARGLPFPRVEPSPQDQHQPRECHLFSDPACPEAPILLHFPLV
: .. . :.:: :: ....:::. : :..... .::.:. .: :.:::. :::.
CCDS55 YCAGSQTKPLKQTCEYCTVQNIPFPKYE-LPDENENLKECYLMENPQEPDAPIVTFFPLI
730 740 750 760 770 780
740 750 760 770 780 790
pF1KE0 NASFKDHSAPGVQRSPAELQGGQVDLTGATCPYTLSNMTYKEEDFERLLRLSDYNVQTSQ
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CCDS55 NDTFRKYKAPGVERSPEELEQGQVDIYGPKTPYATKELTYTEATFDKLVKLSEYNILNNK
790 800 810 820 830 840
800 810
pF1KE0 GAILQALRTAL-KHRTLEARPPRAQT
..::::: :. :.. :... :
CCDS55 DTLLQALRLAVEKKKRLKGQCPS
850 860
>>CCDS45241.1 PLA2G4B gene_id:100137049|Hs108|chr15 (781 aa)
initn: 2567 init1: 1272 opt: 2086 Z-score: 2312.5 bits: 438.8 E(32554): 1.7e-122
Smith-Waterman score: 2603; 51.0% identity (75.0% similar) in 800 aa overlap (20-813:9-780)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MESLSPGGPPGHPYQGEASTCWQLTVRVLEARNLRWADLLSEADPYVILQLSTAPGMKFK
:: ::::::.:. : ::.. .: :: : : :: . ...
CCDS45 MAVAEVSRTCL-LTVRVLQAHRLPSKDLVTPSDCYVTLWLPTACSHRLQ
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 TKTLTDTSHPVWNEAFRFLIQSQVKNVLELSIYDEDSVTEDDICFKVLYDISEVLPGKLL
:.:. ..: ::::..:.: :. :.:::.::...:.: :: :: ..::.: . . :..
CCDS45 TRTVKNSSSPVWNQSFHFRIHRQLKNVMELKVFDQDLVTGDDPVLSVLFDAGTLRAGEFR
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 RKTFSQSPQGEEELDVEFLMEETSDRPENLITNKVIVARELSCLDVHLDSTGSTAVVADQ
:..:: ::::: .:.::: .. .:: : :..: :.:::::::: :.:. :: ::
CCDS45 RESFSLSPQGEGRLEVEFRLQSLADRGEWLVSNGVLVARELSCLHVQLEETG------DQ
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE0 DKLE--LELVLKGSYEDTQTSFLGTASAFRFHYMAALETELSGRLRSSRSNGWNGDNSAG
. : ..::. :: : : . .::.. :::: : : ::: ::. :
CCDS45 KSSEHRVQLVVPGSCEGPQEASVGTGT-FRFHCPACWEQELSIRLQ---------DAPEE
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 YLTVPLRPLTIGKEVTMDVPAPNAPGVRLQLKAEGCPEELAVHLGFNLCAEEQAFLSRRK
: .:: : :. : . :. . : .:..:: :. .::::.:::. ::::::::::::
CCDS45 QLKAPLSALPSGQVVRLVFPTSQEPLMRVELKKEAGLRELAVRLGFGPCAEEQAFLSRRK
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 QVVAKALKQALQLDRDLQEDEVPVVGIMATGGGARAMTSLYGHLLALQKLGLLDCVTYFS
:::: ::.:::::: ::::::.:::.::::::: ::::::::.: .:..:::::::.:..
CCDS45 QVVAAALRQALQLDGDLQEDEIPVVAIMATGGGIRAMTSLYGQLAGLKELGLLDCVSYIT
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 GISGSTWTMAHLYGDPEWSQRDLEGPIRYAREHLAKSKLEVFSPERLASYRRELELRAEQ
: :::::..:.:: ::::::.:: :: . . ...:.:: :..: .: ::.:: ::.
CCDS45 GASGSTWALANLYEDPEWSQKDLAGPTELLKTQVTKNKLGVLAPSQLQRYRQELAERARL
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 GHPTTFVDLWALVLESMLHGQVMDQKLSGQRAALERGQNPLPLYLSLNVKENNLETLDFK
:.:. :..::::. :..:: . :.::: :: :: .::::::.: .::.: ..: :..:
CCDS45 GYPSCFTNLWALINEALLHDEPHDHKLSDQREALSHGQNPLPIYCALNTKGQSLTTFEFG
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 EWVEFSPYEVGFLKYGAFVPPELFGSEFFMGRLMRRIPEPRICFLEAIWSNIFSLNLLDA
:: ::::::::: :::::.: ::::::::::.::.:.:: ::::::.::::... :: :.
CCDS45 EWCEFSPYEVGFPKYGAFIPSELFGSEFFMGQLMKRLPESRICFLEGIWSNLYAANLQDS
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 WYDLTSSGESWKQHIKDKTRSLEKE--PLTTSGTSSRLEASWLQPGTA--LAQAFKGFLT
: . .. : . ..... .:.:: :: ..: :.:: .:. : .::
CCDS45 LYWASEPSQFWDRWVRNQA-NLDKEQVPLL------KIEE---PPSTAGRIAEFFTDLLT
520 530 540 550 560
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 GRPLHQRSPNFLQGLQLHQDYCSHKDFSTWADYQLDSMPSQLTPKEPRLCLVDAAYFINT
::: : . :::.::..:.:: .: :::: ::..:.::::.::.:::.:..:.:::
CCDS45 WRPLAQATHNFLRGLHFHKDYFQHPHFSTWKATTLDGLPNQLTPSEPHLCLLDVGYLINT
570 580 590 600 610 620
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 SSPSMFRPGRRLDLILSFDYSLSAPFEALQQTELYCRARGLPFPRVEPSPQDQHQPRECH
: ...: : .:::::.::.: . :. :: .:. .:.::: . :::..: ::::::
CCDS45 SCLPLLQPTRDVDLILSLDYNLHGAFQQLQLLGRFCQEQGIPFPPISPSPEEQLQPRECH
630 640 650 660 670 680
720 730 740 750 760 770
pF1KE0 LFSDPACPEAPILLHFPLVNASFKDHSAPGVQRSPAELQGGQVDLTGATCPYTLSNMTYK
::::.:: :: .::::::. ::...:::::.:.: : .:.:.:... :: ...::.
CCDS45 TFSDPTCPGAPAVLHFPLVSDSFREYSAPGVRRTPEEAAAGEVNLSSSDSPYHYTKVTYS
690 700 710 720 730 740
780 790 800 810
pF1KE0 EEDFERLLRLSDYNVQTSQGAILQALRTALKHRTLEARPPRAQT
.:: ..::.:. ::: ..: .:.::: :...: . ::
CCDS45 QEDVDKLLHLTHYNVCNNQEQLLEALRQAVQRRR-QRRPH
750 760 770 780
>>CCDS32202.1 PLA2G4B gene_id:8681|Hs108|chr15 (1012 aa)
initn: 2567 init1: 1272 opt: 2086 Z-score: 2310.7 bits: 438.8 E(32554): 2.2e-122
Smith-Waterman score: 2604; 50.9% identity (75.1% similar) in 806 aa overlap (15-813:234-1011)
10 20 30 40
pF1KE0 MESLSPGGPPGHPYQGEAS-TCWQLTVRVLEARNLRWADLLSEA
..:.: :: ::::::.:. : ::.. .
CCDS32 PFIPYELYTPATYQLTEEGTFKVVDEEAMEKAEVSRTCL-LTVRVLQAHRLPSKDLVTPS
210 220 230 240 250 260
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 DPYVILQLSTAPGMKFKTKTLTDTSHPVWNEAFRFLIQSQVKNVLELSIYDEDSVTEDDI
: :: : : :: . ...:.:. ..: ::::..:.: :. :.:::.::...:.: :: ::
CCDS32 DCYVTLWLPTACSHRLQTRTVKNSSSPVWNQSFHFRIHRQLKNVMELKVFDQDLVTGDDP
270 280 290 300 310 320
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 CFKVLYDISEVLPGKLLRKTFSQSPQGEEELDVEFLMEETSDRPENLITNKVIVARELSC
..::.: . . :.. :..:: ::::: .:.::: .. .:: : :..: :.:::::::
CCDS32 VLSVLFDAGTLRAGEFRRESFSLSPQGEGRLEVEFRLQSLADRGEWLVSNGVLVARELSC
330 340 350 360 370 380
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LDVHLDSTGSTAVVADQDKLE--LELVLKGSYEDTQTSFLGTASAFRFHYMAALETELSG
: :.:. :: :: . : ..::. :: : : . .::.. :::: : : :::
CCDS32 LHVQLEETG------DQKSSEHRVQLVVPGSCEGPQEASVGTGT-FRFHCPACWEQELSI
390 400 410 420 430
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 RLRSSRSNGWNGDNSAGYLTVPLRPLTIGKEVTMDVPAPNAPGVRLQLKAEGCPEELAVH
::. : : .:: : :. : . :. . : .:..:: :. .::::.
CCDS32 RLQ---------DAPEEQLKAPLSALPSGQVVRLVFPTSQEPLMRVELKKEAGLRELAVR
440 450 460 470 480
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LGFNLCAEEQAFLSRRKQVVAKALKQALQLDRDLQEDEVPVVGIMATGGGARAMTSLYGH
:::. :::::::::::::::: ::.:::::: ::::::.:::.::::::: ::::::::.
CCDS32 LGFGPCAEEQAFLSRRKQVVAAALRQALQLDGDLQEDEIPVVAIMATGGGIRAMTSLYGQ
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CCDS32 SELFMGRLLQLQPEPRICYLQGMWGSAFATSLDEIFLKTAGSGLSFLEWYRGSVNITDDC
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CCDS32 EVLKMTEKYCLDRGIPFPSIEVGPEDMEEARECYLFAKAEDPRSPIVLHFPLVNRTFRTH
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CCDS32 LQLALDRHQARERAGA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]