Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0354
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0354, 719 aa
1>>>pF1KE0354 719 - 719 aa - 719 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4607+/-0.000818; mu= 19.8476+/- 0.049
mean_var=79.0256+/-15.599, 0's: 0 Z-trim(108.7): 38 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.144275
statistics sampled from 10368 (10405) to 10368 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.682), E-opt: 0.2 (0.32), width: 16
Scan time: 4.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12519.1 CAPN12 gene_id:147968|Hs108|chr19 ( 719) 5003 1051.2 0
CCDS73038.1 CAPN8 gene_id:388743|Hs108|chr1 ( 703) 1386 298.3 2.6e-80
CCDS44644.1 CAPN1 gene_id:823|Hs108|chr11 ( 714) 1375 296.0 1.3e-79
CCDS31035.1 CAPN2 gene_id:824|Hs108|chr1 ( 700) 1374 295.8 1.4e-79
CCDS47436.1 CAPN11 gene_id:11131|Hs108|chr6 ( 739) 1322 285.0 2.7e-76
CCDS1586.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1 ( 690) 1217 263.1 9.8e-70
CCDS10085.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15 ( 729) 1214 262.5 1.6e-69
CCDS53478.1 CAPN2 gene_id:824|Hs108|chr1 ( 622) 1143 247.7 3.9e-65
CCDS46254.1 CAPN14 gene_id:440854|Hs108|chr2 ( 684) 1063 231.1 4.4e-60
CCDS31053.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1 ( 664) 908 198.8 2.2e-50
CCDS81431.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1 ( 627) 846 185.9 1.6e-46
CCDS46252.1 CAPN13 gene_id:92291|Hs108|chr2 ( 669) 839 184.5 4.6e-46
CCDS32207.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15 ( 815) 733 162.5 2.4e-39
CCDS45245.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15 ( 821) 733 162.5 2.4e-39
CCDS8248.1 CAPN5 gene_id:726|Hs108|chr11 ( 640) 601 134.9 3.7e-31
CCDS42838.1 CAPN10 gene_id:11132|Hs108|chr2 ( 672) 569 128.3 3.8e-29
CCDS33420.1 CAPN10 gene_id:11132|Hs108|chr2 ( 517) 543 122.8 1.3e-27
CCDS14555.1 CAPN6 gene_id:827|Hs108|chrX ( 641) 478 109.3 1.9e-23
CCDS10410.1 CAPN15 gene_id:6650|Hs108|chr16 (1086) 469 107.6 1e-22
CCDS45246.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15 ( 309) 371 86.8 5.3e-17
CCDS10086.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15 ( 156) 339 79.9 3.1e-15
CCDS12489.1 CAPNS1 gene_id:826|Hs108|chr19 ( 268) 332 78.7 1.3e-14
CCDS54010.1 CAPNS2 gene_id:84290|Hs108|chr16 ( 248) 318 75.7 9.4e-14
CCDS2624.1 CAPN7 gene_id:23473|Hs108|chr3 ( 813) 295 71.3 6.6e-12
>>CCDS12519.1 CAPN12 gene_id:147968|Hs108|chr19 (719 aa)
initn: 5003 init1: 5003 opt: 5003 Z-score: 5624.1 bits: 1051.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5003; 100.0% identity (100.0% similar) in 719 aa overlap (1-719:1-719)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MASSSGRVTIQLVDEEAGVGAGRLQLFRGQSYEAIRAACLDSGILFRDPYFPAGPDALGY
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CCDS12 MASSSGRVTIQLVDEEAGVGAGRLQLFRGQSYEAIRAACLDSGILFRDPYFPAGPDALGY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 DQLGPDSEKAKGVKWMRPHEFCAEPKFICEDMSRTDVCQGSLGNCWFLAAAASLTLYPRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DQLGPDSEKAKGVKWMRPHEFCAEPKFICEDMSRTDVCQGSLGNCWFLAAAASLTLYPRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LRRVVPPGQDFQHGYAGVFHFQLWQFGRWMDVVVDDRLPVREGKLMFVRSEQRNEFWAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LRRVVPPGQDFQHGYAGVFHFQLWQFGRWMDVVVDDRLPVREGKLMFVRSEQRNEFWAPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LEKAYAKLHGSYEVMRGGHMNEAFVDFTGGVGEVLYLRQNSMGLFSALRHALAKESLVGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LEKAYAKLHGSYEVMRGGHMNEAFVDFTGGVGEVLYLRQNSMGLFSALRHALAKESLVGA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TALSDRGEYRTEEGLVKGHAYSITGTHKVFLGFTKVRLLRLRNPWGCVEWTGAWSDSCPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TALSDRGEYRTEEGLVKGHAYSITGTHKVFLGFTKVRLLRLRNPWGCVEWTGAWSDSCPR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 WDTLPTECRDALLVKKEDGEFWMELRDFLLHFDTVQICSLSPEVLGPSPEGGGWHVHTFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 WDTLPTECRDALLVKKEDGEFWMELRDFLLHFDTVQICSLSPEVLGPSPEGGGWHVHTFQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 GRWVRGFNSGGSQPNAETFWTNPQFRLTLLEPDEEDDEDEEGPWGGWGAAGARGPARGGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GRWVRGFNSGGSQPNAETFWTNPQFRLTLLEPDEEDDEDEEGPWGGWGAAGARGPARGGR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 TPKCTVLLSLIQRNRRRLRAKGLTYLTVGFHVFQIPEELLGLWDSPRSHALLPRLLRADR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TPKCTVLLSLIQRNRRRLRAKGLTYLTVGFHVFQIPEELLGLWDSPRSHALLPRLLRADR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 SPLSARRDVTRRCCLRPGHYLVVPSTAHAGDEADFTLRVFSERRHTAVEIDDVISADLQS
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CCDS12 SPLSARRDVTRRCCLRPGHYLVVPSTAHAGDEADFTLRVFSERRHTAVEIDDVISADLQS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 LQGPYLPLELGLEQLFQELAGEEEELNASQLQALLSIALEPARAHTSTPREIGLRTCEQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LQGPYLPLELGLEQLFQELAGEEEELNASQLQALLSIALEPARAHTSTPREIGLRTCEQL
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610 620 630 640 650 660
pF1KE0 LQCFGHGQSLALHHFQQLWGYLLEWQAIFNKFDEDTSGTMNSYELRLALNAAGFHLNNQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LQCFGHGQSLALHHFQQLWGYLLEWQAIFNKFDEDTSGTMNSYELRLALNAAGFHLNNQL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KE0 TQTLTSRYRDSRLRVDFERFVSCVAHLTCIFCHCSQHLDGGEGVICLTHRQWMEVATFS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TQTLTSRYRDSRLRVDFERFVSCVAHLTCIFCHCSQHLDGGEGVICLTHRQWMEVATFS
670 680 690 700 710
>>CCDS73038.1 CAPN8 gene_id:388743|Hs108|chr1 (703 aa)
initn: 1793 init1: 887 opt: 1386 Z-score: 1555.4 bits: 298.3 E(32554): 2.6e-80
Smith-Waterman score: 1867; 42.2% identity (68.3% similar) in 729 aa overlap (1-713:1-698)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MASSSGRVTIQLVDEEAGVGAGRLQL-FRGQSYEAIRAACLDSGILFRDPYFPAGPDALG
::.... :. : . . :.:... : . ::.....: :::::.::.:: ::: :.:::
CCDS73 MAAQAAGVSRQRAATQ-GLGSNQNALKYLGQDFKTLRQQCLDSGVLFKDPEFPACPSALG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YDQLGPDSEKAKGVKWMRPHEFCAEPKFICEDMSRTDVCQGSLGNCWFLAAAASLTLYPR
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CCDS73 YKDLGPGSPQTQGIIWKRPTELCPSPQFIVGGATRTDICQGGLGDCWLLAAIASLTLNEE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LLRRVVPPGQDFQHGYAGVFHFQLWQFGRWMDVVVDDRLPVREGKLMFVRSEQRNEFWAP
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CCDS73 LLYRVVPRDQDFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVIDDRLPTKNGQLLFLHSEQGNEFWSA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LLEKAYAKLHGSYEVMRGGHMNEAFVDFTGGVGEVLYLRQNSMGLFSALRHALAKESLVG
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CCDS73 LLEKAYAKLNGCYEALAGGSTVEGFEDFTGGISEFYDLKKPPANLYQIIRKALCAGSLLG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 ATA-LSDRGEYR--TEEGLVKGHAYSITGTHKV-FLGFTKVRLLRLRNPWGCVEWTGAWS
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CCDS73 CSIDVSSAAEAEAITSQKLVKSHAYSVTGVEEVNFQGHPE-KLIRLRNPWGEVEWSGAWS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 DSCPRWDTLPTECRDALLVKKEDGEFWMELRDFLLHFDTVQICSLSPEVLGPSPEGGGWH
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CCDS73 DDAPEWNHIDPRRKEELDKKVEDGEFWMSLSDFVRQFSRLEICNLSPDSLS-SEEVHKWN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 VHTFQGRWVRGFNSGGSQPNAETFWTNPQFRLTLLEPDEEDDEDEEGPWGGWGAAGARGP
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CCDS73 LVLFNGHWTRGSTAGGCQNYPATYWTNPQFKIRL----DEVDEDQEESIG----------
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 ARGGRTPKCTVLLSLIQRNRRRLRAKGLTYLTVGFHVFQIPEELLGLWDSPRSHAL-LPR
: :::::.:.:.::: . : .:..:. :.:.:.:: . :. .. . :
CCDS73 -----EPCCTVLLGLMQKNRRWRKRIGQGMLSIGYAVYQVPKELESHTDAHLGRDFFLAY
410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 LLRADRSPLSARRDVTRRCCLRPGHYLVVPSTAHAGDEADFTLRVFSERRHTAVEIDDVI
: : :.:. : : ::.::::::: . ...: ::::::.. :.:: ::.
CCDS73 QPSARTSTYVNLREVSGRARLPPGEYLVVPSTFEPFKDGEFCLRVFSEKKAQALEIGDVV
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580
pF1KE0 SADLQSLQGPYLPLELGLEQ-------LFQELAGEEEELNASQLQALLSIALEPARAHTS
... :: : ..: ::..:::.. :..:. :. ::. :. :. .
CCDS73 AGN------PYEPHPSEVDQEDDQFRRLFEKLAGKDSEITANALKILLNEAFSK-RTDIK
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KE0 TPREIGLRTCEQ---LLQCFGHGQSLALHHFQQLWGYLLEWQAIFNKFDEDTSGTMNSYE
... ::.. ::. : : .:. .:. :: . .. :. . : . :::....:
CCDS73 FDG-FNINTCREMISLLDSNGTG-TLGAVEFKTLWLKIQKYLEIYWETDYNHSGTIDAHE
580 590 600 610 620
650 660 670 680 690 700
pF1KE0 LRLALNAAGFHLNNQLTQTLTSRYRDSRLRVDFERFVSCVAHLTCIFCHCSQHLDGGEGV
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CCDS73 MRTALRKAGFTLNSQVQQTIALRYACSKLGINFDSFVACMIRLETLFKLFSLLDEDKDGM
630 640 650 660 670 680
710
pF1KE0 ICLTHRQWMEVATFS
. :. .:.
CCDS73 VQLSLAEWLCCVLV
690 700
>>CCDS44644.1 CAPN1 gene_id:823|Hs108|chr11 (714 aa)
initn: 1920 init1: 889 opt: 1375 Z-score: 1542.9 bits: 296.0 E(32554): 1.3e-79
Smith-Waterman score: 1914; 42.6% identity (69.0% similar) in 728 aa overlap (8-719:14-714)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MASSSGRVTIQLVDEEAG-VGAGRLQ---LFRGQSYEAIRAACLDSGILFRDPY
:. :. ..: .: :: . . ::.:: .:. ::.:: ::::
CCDS44 MSEEIITPVYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEA
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pF1KE0 FPAGPDALGYDQLGPDSEKAKGVKWMRPHEFCAEPKFICEDMSRTDVCQGSLGNCWFLAA
:: :..::: .:::.: :. :.:: :: :. ..:.:: . .:::.:::.::.::.:::
CCDS44 FPPVPQSLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 AASLTLYPRLLRRVVPPGQDFQHGYAGVFHFQLWQFGRWMDVVVDDRLPVREGKLMFVRS
::::: ::.:::: ::.::.::::.:::::::::.:.:::::: ::...:::.::.:
CCDS44 IASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHS
130 140 150 160 170 180
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pF1KE0 EQRNEFWAPLLEKAYAKLHGSYEVMRGGHMNEAFVDFTGGVGEVLYLRQNSMGLFSALRH
. ::::. ::::::::..::::.. :: .:.: :::::: : ::. :.. . .
CCDS44 AEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQIILK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KE0 ALAKESLVGATA-LSDRGEYR--TEEGLVKGHAYSITGTHKVFLGFTKVRLLRLRNPWGC
:: . ::.: . .:. ... : . ::::::::.::...: : :.:.:::::
CCDS44 ALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWGE
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 VEWTGAWSDSCPRWDTLPTECRDALLVKKEDGEFWMELRDFLLHFDTVQICSLSPEVLGP
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CCDS44 VEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDAL-K
310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 SPEGGGWHVHTFQGRWVRGFNSGGSQPNAETFWTNPQFRLTLLEPDEEDDEDEEGPWGGW
: :.. ..: : :: ..:: . :::.::::.. : :: :: :.
CCDS44 SRTIRKWNTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRL---DETDDPDD-------
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 GAAGARGPARGGRTPKCTVLLSLIQRNRRRLRAKGLTYLTVGFHVFQIPEELLGLWDSPR
: : :. .:.:.:..::: : : . :.:: :...: ::.: .:
CCDS44 ---------YGDRESGCSFVLALMQKHRRRERRFGRDMETIGFAVYEVPPELVG---QPA
410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 SHA----LLPRLLRADRSPLSARRDVTRRCCLRPGHYLVVPSTAHAGDEADFTLRVFSER
: .: :: . :.:. : : ::.:.::::: . . :.::.:: :::.
CCDS44 VHLKRDFFLANASRARSEQFINLREVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEK
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 RHTAVEIDDVISADLQSLQG-PYLPLELGLEQLFQELAGEEEELNASQLQALLSIALEPA
.::.:: :.:.: . : .. ... ::..::::. :.....:...:. . .
CCDS44 SAGTVELDDQIQANLPDEQVLSEEEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRII--S
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630
pF1KE0 RAHTSTPREIGLRTCEQLLQCF---GHGQSLALHHFQQLWGYLLEWQAIFNKFDEDTSGT
. . . ..:..:..... . :.:. :.: .:. ::. . .. .:: ::: : ::.
CCDS44 KHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDRDGNGK-LGLVEFNILWNRIRNYLSIFRKFDLDKSGS
580 590 600 610 620 630
640 650 660 670 680 690
pF1KE0 MNSYELRLALNAAGFHLNNQLTQTLTSRYRDSRLRVDFERFVSCVAHLTCIFCHCSQHLD
:..::.:.:...:::.::..: . . .:: . : :::. :: :...: .: . . ::
CCDS44 MSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELIITRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMF-RFFKTLD
640 650 660 670 680 690
700 710
pF1KE0 GG-EGVICLTHRQWMEVATFS
.::. . .:.... :.
CCDS44 TDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
700 710
>>CCDS31035.1 CAPN2 gene_id:824|Hs108|chr1 (700 aa)
initn: 1888 init1: 867 opt: 1374 Z-score: 1541.9 bits: 295.8 E(32554): 1.4e-79
Smith-Waterman score: 1909; 42.8% identity (69.2% similar) in 711 aa overlap (14-713:11-695)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MASSSGRVTIQLVDEEAGVGAG---RLQLFRGQSYEAIRAACLDSGILFRDPYFPAGPDA
:.::. : : : . .:.:::.: ::..: ::.:: ::: :.:
CCDS31 MAGIAAKLAKDREAAEGLGSHDRAIKYLNQDYEALRNECLEAGTLFQDPSFPAIPSA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LGYDQLGPDSEKAKGVKWMRPHEFCAEPKFICEDMSRTDVCQGSLGNCWFLAAAASLTLY
::. .::: : :..:..: :: :.::.:.:: .:::.:::.::.::.::: :::::
CCDS31 LGFKELGPYSSKTRGIEWKRPTEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 PRLLRRVVPPGQDFQHGYAGVFHFQLWQFGRWMDVVVDDRLPVREGKLMFVRSEQRNEFW
..: :::: .:.::..:::.::::.::.:.:..::::::::...:.:.::.: . .:::
CCDS31 EEILARVVPLNQSFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVHSAEGSEFW
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 APLLEKAYAKLHGSYEVMRGGHMNEAFVDFTGGVGEVLYLRQNSMGLFSALRHALAKESL
. ::::::::..: ::.. :: .:.: :::::..: :.. .::. ...:: : ::
CCDS31 SALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYELKKPPPNLFKIIQKALQKGSL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 VGA----TALSDRGEYRTEEGLVKGHAYSITGTHKVFLGFTKVRLLRLRNPWGCVEWTGA
.: :. .: .: : . ::::::::.::...: . . .:.:.::::: :::::
CCDS31 LGCSIDITSAAD-SEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWGEVEWTGR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 WSDSCPRWDTLPTECRDALLVKKEDGEFWMELRDFLLHFDTVQICSLSPEVLGPSPEGGG
:.:.:: :.:. : :. : ..::::::: . ::: :.. ..::.:.:..: :
CCDS31 WNDNCPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRHYSRLEICNLTPDTL-TSDTYKK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 WHVHTFQGRWVRGFNSGGSQPNAETFWTNPQFRLTLLEPDEEDDEDEEGPWGGWGAAGAR
:.. ..: : :: ..:: . .::: :::. . : ::.::::: : .:
CCDS31 WKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKL----EEEDEDEED-----GESG--
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 GPARGGRTPKCTVLLSLIQRNRRRLRAKGLTYLTVGFHVFQIPEELLGLWDSPRSHAL-L
:: :..:::..::: : : . :.:: ....:::: : . :. . :
CCDS31 ----------CTFLVGLIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLSKNFFL
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480 490 500 510 520 530
pF1KE0 PRLLRADRSPLSARRDVTRRCCLRPGHYLVVPSTAHAGDEADFTLRVFSERRHTAVEIDD
: . . :.: : : ::.:..:::: . . ..:: .:::::.. .::
CCDS31 TNRARERSDTFINLREVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADYQAVDD
460 470 480 490 500 510
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pF1KE0 VISADLQSLQGPYLPLELGLEQLFQELAGEEEELNASQLQALLSIALEPARAHTSTPREI
: :.:. .. .. :...:: .::::. :..: .::..: .: :. . .
CCDS31 EIEANLEEFDISEDDIDDGFRRLFAQLAGEDAEISAFELQTILRRVL--AKRQDIKSDGF
520 530 540 550 560 570
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pF1KE0 GLRTCE---QLLQCFGHGQSLALHHFQQLWGYLLEWQAIFNKFDEDTSGTMNSYELRLAL
...::. ..:. : :. :.:..: :: . ..: :. ..: : ::::::::.: ::
CCDS31 SIETCKIMVDMLDSDGSGK-LGLKEFYILWTKIQKYQKIYREIDVDRSGTMNSYEMRKAL
580 590 600 610 620 630
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pF1KE0 NAAGFHLNNQLTQTLTSRYRDSRLRVDFERFVSCVAHLTCIFCHCSQHLDGGEGVICLTH
. :::.. :: :....:. :..: .::. :: :...: .: .: . :.: :
CCDS31 EEAGFKMPCQLHQVIVARFADDQLIIDFDNFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIELDL
640 650 660 670 680 690
710
pF1KE0 RQWMEVATFS
.:.
CCDS31 ISWLCFSVL
700
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10 20 30 40
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50 60 70 80 90 100
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.:: ::: :..::. .:::.:.......:.::... .: :: . .: ::.::: ::.::
CCDS47 EDPLFPAEPSSLGFKDLGPNSKNVQNISWQRPKDIINNPLFIMDGISPTDICQGILGDCW
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pF1KE0 FLAAAASLTLYPRLLRRVVPPGQDFQHGYAGVFHFQLWQFGRWMDVVVDDRLPVREGKLM
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CCDS47 LLAAIGSLTTCPKLLYRVVPRGQSFKKNYAGIFHFQIWQFGQWVNVVVDDRLPTKNDKLV
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pF1KE0 FVRSEQRNEFWAPLLEKAYAKLHGSYEVMRGGHMNEAFVDFTGGVGEVLYLRQNSMGLFS
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CCDS47 FVHSTERSEFWSALLEKAYAKLSGSYEALSGGSTMEGLEDFTGGVAQSFQLQRPPQNLLR
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230 240 250 260 270 280
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::.:. . ::.: . . :: : :.. ::.:::::.:: . : :.:.::
CCDS47 LLRKAVERSSLMGCSIEVTSDSELESMTDKMLVRGHAYSVTGLQDVHYRGKMETLIRVRN
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::: .::.:::::: .:. . .. . :: : ::::::: .::: .: ..::.:.:.
CCDS47 PWGRIEWNGAWSDSAREWEEVASDIQMQLLHKTEDGEFWMSYQDFLNNFTLLEICNLTPD
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.:. . .. ::. ..: : :: ..:: . . ::::::::...: : :. .:. :
CCDS47 TLSGDYKSY-WHTTFYEGSWRRGSSAGGCRNHPGTFWTNPQFKISLPEGDDPEDDAE---
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410 420 430 440 450 460
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: . :: :..:.:.: :. : .: :.:: .. .:.:. ..
CCDS47 ---------------GNVVVCTCLVALMQKNWRHARQQGAQLQTIGFVLYAVPKEFQNIQ
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: .. .. . : . . :.:. . : ::.:...::: . .::: ::::.:
CCDS47 DVHLKKEFFTKYQDHGFSEIFTNSREVSSQLRLPPGEYIIIPSTFEPHRDADFLLRVFTE
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.. . :.:.: :. :: . .. . .::. .::: .:... .:: ::. .:.
CCDS47 KHSESWELDEVNYAEQLQEEKVSEDDMDQDFLHLFKIVAGEGKEIGVYELQRLLNRMAI-
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pF1KE0 PARAHTSTPREIGLRTCEQLLQCF---GHGQSLALHHFQQLWGYLLEWQAIFNKFDEDTS
. .. . .:: .:. ... . : :. :.: .:. :: : .:. :: . :.: :
CCDS47 --KFKSFKTKGFGLDACRCMINLMDKDGSGK-LGLLEFKILWKKLKKWMDIFRECDQDHS
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640 650 660 670 680 690
pF1KE0 GTMNSYELRLALNAAGFHLNNQLTQTLTSRYRDSRLRVDFERFVSCVAHLTCIFCHCSQH
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CCDS47 GTLNSYEMRLVIEKAGIKLNNKVMQVLVARYADDDLIIDFDSFISCFLRLKTMFTFFLTM
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700 710
pF1KE0 LDGGEGVICLTHRQWMEVATFS
. : :::. .::...
CCDS47 DPKNTGHICLSLEQWLQMTMWG
720 730
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: :.: .. :.: . . .:::::: ..:: ::: :.::.:.:..: :.
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: . :: :::: ..:: . .:::::::..:.: : :: ..:
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:. :..:.:..::.:. : . ::.:. ... :.. : : : ::
CCDS15 --------CSFLVALMQKDRRKLKRFGANVLTIGYAIYECPDKDEHLNKDFFRYHAS---
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:: . . :.:. : : ::.:...::: . .:::: ::.:::.. . ..: .
CCDS15 --RARSKTFINLREVSDRFKLPPGEYILIPSTFEPHQEADFCLRIFSEKKAITRDMDGNV
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. :: : : : :: ::...:::. :..: .:. .:. .:. . .
CCDS15 DIDLPEPPKPTPPDQETEEEQRFRALFEQVAGEDMEVTAEELEYVLNAVLQ--KKKDIKF
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pF1KE0 REIGLRTCEQ---LLQCFGHGQSLALHHFQQLWGYLLEWQAIFNKFDEDTSGTMNSYELR
....: .:.. :.. :.:. : . .:. .: : .: .: .:: : ::::..::::
CCDS15 KKLSLISCKNIISLMDTSGNGK-LEFDEFKVFWDKLKQWINLFLRFDADKSGTMSTYELR
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CCDS15 TALKAAGFQLSSHLLQLIVLRYADEELQLDFDDFLNCLVRLENASRVFQALSTKNKEFIH
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710
pF1KE0 LTHRQWMEVATFS
CCDS15 LNINEFIHLTMNI
680 690
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CCDS10 SKATEAGGGNPSGIYSAIISRNFPIIGVKEKTFEQLHKKCLEKKVLYVDPEFPPDETSLF
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:.: : . : :: :.: .:.:: . .:::.::: ::.:::::: : ::: .
CCDS10 YSQKFPIQ-----FVWKRPPEICENPRFIIDGANRTDICQGELGDCWFLAAIACLTLNQH
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:: ::.: :.: ..:::.::::.:..:.:.:::.:: ::. ...:.:..:..:::::.
CCDS10 LLFRVIPHDQSFIENYAGIFHFQFWRYGEWVDVVIDDCLPTYNNQLVFTKSNHRNEFWSA
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::::::::::::::...::. .::. ::::::.: . .:. ... ...:. . ::.:
CCDS10 LLEKAYAKLHGSYEALKGGNTTEAMEDFTGGVAEFFEIRDAPSDMYKIMKKAIERGSLMG
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 A---TALSDRGEYRTEEGLVKGHAYSITGTHKVFLGFTKVRLLRLRNPWGCVEWTGAWSD
: . . : : :::.:::::.:: .: . ::.:.::::::: :::.:.:::
CCDS10 CSIDTIIPVQYETRMACGLVRGHAYSVTGLDEVPFKGEKVKLVRLRNPWGQVEWNGSWSD
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CCDS10 RWKDWSFVDKDEKARLQHQVTEDGEFWMSYEDFIYHFTKLEICNLTADAL-QSDKLQTWT
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CCDS10 VSVNEGRWVRGCSAGGCRNFPDTFWTNPQYRLKLLEEDDDPDDSEV--------------
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CCDS10 -------ICSFLVALMQKNRRKDRKLGASLFTIGFAIYEVPKEMHGNKQHLQKDFFLYNA
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CCDS10 SKARSKTYINMREVSQRFRLPPSEYVIVPSTYEPHQEGEFILRVFSEKRNLSEEVENTIS
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pF1KE0 ADLQSLQGPYLPLELGLEQ-----LFQELAGEEEELNASQLQALLSIALEPARAHTSTPR
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CCDS10 VD-RPVPQPGSSDQESEEQQQFRNIFKQIAGDDMEICADELKKVLNTVVNKHKDLKT--H
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CCDS10 GFTLESCRSMIALMDTDGSGK-LNLQEFHHLWNKIKAWQKIFKHYDTDQSGTINSYEMRN
600 610 620 630 640 650
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pF1KE0 ALNAAGFHLNNQLTQTLTSRYRDSRLRVDFERFVSCVAHLTCIFCHCSQHLDGGEGVICL
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CCDS10 AVNDAGFHLNNQLYDIITMRYADKHMNIDFDSFICCFVRLEGMFRAFHAFDKDGDGIIKL
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710
pF1KE0 THRQWMEVATFS
. .:.... ..
CCDS10 NVLEWLQLTMYA
720
>>CCDS53478.1 CAPN2 gene_id:824|Hs108|chr1 (622 aa)
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pF1KE0 YFPAGPDALGYDQLGPDSEKAKGVKWMRPHEFCAEPKFICEDMSRTDVCQGSLGNCWFLA
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CCDS53 MEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLA
10 20 30
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pF1KE0 AAASLTLYPRLLRRVVPPGQDFQHGYAGVFHFQLWQFGRWMDVVVDDRLPVREGKLMFVR
: ::::: ..: :::: .:.::..:::.::::.::.:.:..::::::::...:.:.::.
CCDS53 AIASLTLNEEILARVVPLNQSFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVH
40 50 60 70 80 90
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pF1KE0 SEQRNEFWAPLLEKAYAKLHGSYEVMRGGHMNEAFVDFTGGVGEVLYLRQNSMGLFSALR
: . .:::. ::::::::..: ::.. :: .:.: :::::..: :.. .::. ..
CCDS53 SAEGSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYELKKPPPNLFKIIQ
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.:: : ::.: :. .: .: : . ::::::::.::...: . . .:.:.::::
CCDS53 KALQKGSLLGCSIDITSAAD-SEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPW
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CCDS53 GEVEWTGRWNDNCPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRHYSRLEICNLTPDTL
220 230 240 250 260 270
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pF1KE0 GPSPEGGGWHVHTFQGRWVRGFNSGGSQPNAETFWTNPQFRLTLLEPDEEDDEDEEGPWG
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CCDS53 -TSDTYKKWKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKL----EEEDEDEED---
280 290 300 310 320
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pF1KE0 GWGAAGARGPARGGRTPKCTVLLSLIQRNRRRLRAKGLTYLTVGFHVFQIPEELLGLWDS
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CCDS53 --GESG------------CTFLVGLIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNI
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CCDS46 GIY-LQKPEWMMMALYS
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