Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0356
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0356, 505 aa
1>>>pF1KE0356 505 - 505 aa - 505 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5460+/-0.000951; mu= 16.9291+/- 0.057
mean_var=74.8704+/-15.271, 0's: 0 Z-trim(105.8): 75 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.148224
statistics sampled from 8563 (8639) to 8563 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.633), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16
Scan time: 3.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS545.1 CYP4Z1 gene_id:199974|Hs108|chr1 ( 505) 3462 750.0 1.4e-216
CCDS544.1 CYP4X1 gene_id:260293|Hs108|chr1 ( 509) 1936 423.7 2.4e-118
CCDS543.1 CYP4A11 gene_id:1579|Hs108|chr1 ( 519) 1787 391.8 9.4e-109
CCDS30707.1 CYP4A22 gene_id:284541|Hs108|chr1 ( 519) 1712 375.8 6.3e-104
CCDS542.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 511) 1578 347.2 2.6e-95
CCDS41328.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 512) 1578 347.2 2.6e-95
CCDS81318.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 497) 1322 292.4 7.8e-79
CCDS12336.1 CYP4F2 gene_id:8529|Hs108|chr19 ( 520) 1260 279.2 7.9e-75
CCDS74303.1 CYP4F8 gene_id:11283|Hs108|chr19 ( 520) 1255 278.1 1.7e-74
CCDS42517.1 CYP4F12 gene_id:66002|Hs108|chr19 ( 524) 1243 275.5 9.9e-74
CCDS12337.1 CYP4F11 gene_id:57834|Hs108|chr19 ( 524) 1241 275.1 1.3e-73
CCDS59362.1 CYP4F3 gene_id:4051|Hs108|chr19 ( 520) 1236 274.0 2.8e-73
CCDS12332.1 CYP4F3 gene_id:4051|Hs108|chr19 ( 520) 1235 273.8 3.2e-73
CCDS12331.1 CYP4F22 gene_id:126410|Hs108|chr19 ( 531) 1230 272.7 6.9e-73
CCDS34119.1 CYP4V2 gene_id:285440|Hs108|chr4 ( 525) 823 185.7 1.1e-46
CCDS76160.1 CYP4A22 gene_id:284541|Hs108|chr1 ( 357) 655 149.7 5.1e-36
CCDS5676.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 503) 647 148.1 2.2e-35
CCDS5675.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 504) 635 145.5 1.3e-34
CCDS5673.1 CYP3A7 gene_id:1551|Hs108|chr7 ( 503) 608 139.7 7.2e-33
CCDS75639.1 CYP3A51P gene_id:100861540|Hs108|chr7 ( 535) 608 139.7 7.6e-33
CCDS5674.1 CYP3A4 gene_id:1576|Hs108|chr7 ( 503) 592 136.3 7.7e-32
CCDS5672.1 CYP3A5 gene_id:1577|Hs108|chr7 ( 502) 569 131.4 2.3e-30
CCDS64723.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 393) 529 122.8 7.2e-28
CCDS5677.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 420) 494 115.3 1.4e-25
CCDS613.1 CYP2J2 gene_id:1573|Hs108|chr1 ( 502) 461 108.3 2.1e-23
CCDS7818.1 CYP2R1 gene_id:120227|Hs108|chr11 ( 501) 405 96.3 8.4e-20
CCDS34047.1 CYP2U1 gene_id:113612|Hs108|chr4 ( 544) 391 93.3 7.2e-19
CCDS12568.1 CYP2A6 gene_id:1548|Hs108|chr19 ( 494) 372 89.2 1.1e-17
CCDS55175.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 466) 369 88.6 1.6e-17
CCDS5855.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 534) 369 88.6 1.8e-17
CCDS55174.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 580) 369 88.6 2e-17
CCDS2423.1 CYP27A1 gene_id:1593|Hs108|chr2 ( 531) 368 88.4 2.1e-17
CCDS9954.1 CYP46A1 gene_id:10858|Hs108|chr14 ( 500) 367 88.2 2.3e-17
CCDS12569.1 CYP2A7 gene_id:1549|Hs108|chr19 ( 494) 365 87.8 3.1e-17
CCDS12573.1 CYP2S1 gene_id:29785|Hs108|chr19 ( 504) 358 86.3 8.9e-17
CCDS7541.1 CYP17A1 gene_id:1586|Hs108|chr10 ( 508) 354 85.4 1.6e-16
CCDS33491.1 CYP24A1 gene_id:1591|Hs108|chr20 ( 514) 353 85.2 1.9e-16
CCDS12571.1 CYP2A13 gene_id:1553|Hs108|chr19 ( 494) 352 85.0 2.1e-16
CCDS8954.1 CYP27B1 gene_id:1594|Hs108|chr12 ( 508) 350 84.6 2.9e-16
CCDS12570.1 CYP2B6 gene_id:1555|Hs108|chr19 ( 491) 348 84.1 3.9e-16
CCDS4735.1 CYP21A2 gene_id:1589|Hs108|chr6 ( 495) 341 82.6 1.1e-15
CCDS7438.1 CYP2C8 gene_id:1558|Hs108|chr10 ( 490) 338 82.0 1.7e-15
CCDS62934.1 CYP26B1 gene_id:56603|Hs108|chr2 ( 437) 330 80.2 5e-15
CCDS1919.1 CYP26B1 gene_id:56603|Hs108|chr2 ( 512) 330 80.3 5.7e-15
CCDS32293.1 CYP1A2 gene_id:1544|Hs108|chr15 ( 516) 328 79.9 7.8e-15
CCDS55123.1 CYP51A1 gene_id:1595|Hs108|chr7 ( 404) 326 79.4 8.6e-15
CCDS5623.1 CYP51A1 gene_id:1595|Hs108|chr7 ( 509) 326 79.4 1e-14
CCDS47406.1 CYP21A2 gene_id:1589|Hs108|chr6 ( 465) 324 79.0 1.3e-14
CCDS12572.1 CYP2F1 gene_id:1572|Hs108|chr19 ( 491) 323 78.8 1.6e-14
CCDS33657.1 CYP2D6 gene_id:1565|Hs108|chr22 ( 446) 311 76.2 8.6e-14
>>CCDS545.1 CYP4Z1 gene_id:199974|Hs108|chr1 (505 aa)
initn: 3462 init1: 3462 opt: 3462 Z-score: 4001.9 bits: 750.0 E(32554): 1.4e-216
Smith-Waterman score: 3462; 100.0% identity (100.0% similar) in 505 aa overlap (1-505:1-505)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEPSWLQELMAHPFLLLILLCMSLLLFQVIRLYQRRRWMIRALHLFPAPPAHWFYGHKEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MEPSWLQELMAHPFLLLILLCMSLLLFQVIRLYQRRRWMIRALHLFPAPPAHWFYGHKEF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YPVKEFEVYHKLMEKYPCAVPLWVGPFTMFFSVHDPDYAKILLKRQDPKSAVSHKILESW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YPVKEFEVYHKLMEKYPCAVPLWVGPFTMFFSVHDPDYAKILLKRQDPKSAVSHKILESW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VGRGLVTLDGSKWKKHRQIVKPGFNISILKIFITMMSESVRMMLNKWEEHIAQNSRLELF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VGRGLVTLDGSKWKKHRQIVKPGFNISILKIFITMMSESVRMMLNKWEEHIAQNSRLELF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 QHVSLMTLDSIMKCAFSHQGSIQLDSTLDSYLKAVFNLSKISNQRMNNFLHHNDLVFKFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QHVSLMTLDSIMKCAFSHQGSIQLDSTLDSYLKAVFNLSKISNQRMNNFLHHNDLVFKFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SQGQIFSKFNQELHQFTEKVIQDRKESLKDKLKQDTTQKRRWDFLDILLSAKSENTKDFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SQGQIFSKFNQELHQFTEKVIQDRKESLKDKLKQDTTQKRRWDFLDILLSAKSENTKDFS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 EADLQAEVKTFMFAGHDTTSSAISWILYCLAKYPEHQQRCRDEIRELLGDGSSITWEHLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EADLQAEVKTFMFAGHDTTSSAISWILYCLAKYPEHQQRCRDEIRELLGDGSSITWEHLS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 QMPYTTMCIKECLRLYAPVVNISRLLDKPITFPDGRSLPAGITVFINIWALHHNPYFWED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QMPYTTMCIKECLRLYAPVVNISRLLDKPITFPDGRSLPAGITVFINIWALHHNPYFWED
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 PQVFNPLRFSRENSEKIHPYAFIPFSAGLRNCIGQHFAIIECKVAVALTLLRFKLAPDHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PQVFNPLRFSRENSEKIHPYAFIPFSAGLRNCIGQHFAIIECKVAVALTLLRFKLAPDHS
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE0 RPPQPVRQVVLKSKNGIHVFAKKVC
:::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RPPQPVRQVVLKSKNGIHVFAKKVC
490 500
>>CCDS544.1 CYP4X1 gene_id:260293|Hs108|chr1 (509 aa)
initn: 1892 init1: 974 opt: 1936 Z-score: 2238.3 bits: 423.7 E(32554): 2.4e-118
Smith-Waterman score: 1936; 53.6% identity (81.6% similar) in 506 aa overlap (1-504:1-506)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEPSWLQELMAHPFLLLILLCMSLLLFQVIRLYQRRRWMIRALHLFPAPPAHWFYGHKEF
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CCDS54 MEFSWLETRWARPFYLAFVFCLALGLLQAIKLYLRRQRLLRDLRPFPAPPTHWFLGHQKF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YPVKEFEVYHKLMEKYPCAVPLWVGPFTMFFSVHDPDYAKILLKRQDPKSAVSHKILESW
..: ....:::: : :.:.::: :: ..:::::: ::.: :::: .:.
CCDS54 IQDDNMEKLEEIIEKYPRAFPFWIGPFQAFFCIYDPDYAKTLLSRTDPKSQYLQKFSPPL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE0 VGRGLVTLDGSKWKKHRQIVKPGFNISILKIFITMMSESVRMMLNKWEEHIA-QNSRLEL
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CCDS54 LGKGLAALDGPKWFQHRRLLTPGFHFNILKAYIEVMAHSVKMMLDKWEKICSTQDTSVEV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 FQHVSLMTLDSIMKCAFSHQGSIQLDSTLDSYLKAVFNLSKISNQRMNNFLHHNDLVFKF
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CCDS54 YEHINSMSLDIIMKCAFSKETNCQTNSTHDPYAKAIFELSKIIFHRLYSLLYHSDIIFKL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SSQGQIFSKFNQELHQFTEKVIQDRKESLKDKLKQDTTQKRRW-DFLDILLSAKSENTKD
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CCDS54 SPQGYRFQKLSRVLNQYTDTIIQERKKSLQAGVKQDNTPKRKYQDFLDIVLSAKDESGSS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 FSEADLQAEVKTFMFAGHDTTSSAISWILYCLAKYPEHQQRCRDEIRELLGDGSSITWEH
::. :...::.::..::::: ...::::::::: ::::.:::.:.: .:::::::::..
CCDS54 FSDIDVHSEVSTFLLAGHDTLAASISWILYCLALNPEHQERCREEVRGILGDGSSITWDQ
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LSQMPYTTMCIKECLRLYAPVVNISRLLDKPITFPDGRSLPAGITVFINIWALHHNPYFW
:..: :::::::: :: : .::: :.::.::::: .::::::: ..::.::::: :
CCDS54 LGEMSYTTMCIKETCRLIPAVPSISRDLSKPLTFPDGCTLPAGITVVLSIWGLHHNPAVW
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 EDPQVFNPLRFSRENSEKIHPYAFIPFSAGLRNCIGQHFAIIECKVAVALTLLRFKLAPD
..:.::.:::::.:::.. ::::..::::: ::::::.::.:: ::..:: ::.:...::
CCDS54 KNPKVFDPLRFSQENSDQRHPYAYLPFSAGSRNCIGQEFAMIELKVTIALILLHFRVTPD
430 440 450 460 470 480
480 490 500
pF1KE0 HSRPPQPVRQVVLKSKNGIHVFAKKVC
.:: . .:: :::... ::.
CCDS54 PTRPLTFPNHFILKPKNGMYLHLKKLSEC
490 500
>>CCDS543.1 CYP4A11 gene_id:1579|Hs108|chr1 (519 aa)
initn: 1761 init1: 718 opt: 1787 Z-score: 2065.9 bits: 391.8 E(32554): 9.4e-109
Smith-Waterman score: 1787; 52.7% identity (79.4% similar) in 491 aa overlap (16-504:24-509)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEPSWLQELMAHPFLLLILLCMSLLLFQVIRLYQRRRWMIRALHLFPAPPAH
::::: :::.....:: .:.:...::. :: ::.:
CCDS54 MSVSVLSPSRLLGDVSGILQAASLLILL---LLLIKAVQLYLHRQWLLKALQQFPCPPSH
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 WFYGH-KEFYPVKEFEVYHKLMEKYPCAVPLWVGPFTMFFSVHDPDYAKILLKRQDPKSA
:..:: .:. .:.. .: .: .: : : :. . ...:::: :..: :.::::
CCDS54 WLFGHIQELQQDQELQRIQKWVETFPSACPHWLWGGKVRVQLYDPDYMKVILGRSDPKSH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 VSHKILESWVGRGLVTLDGSKWKKHRQIVKPGFNISILKIFITMMSESVRMMLNKWEEHI
:...: :.: ::. :.:. : .::... :.:. .::: .. .:..:::.::.:::: .
CCDS54 GSYRFLAPWIGYGLLLLNGQTWFQHRRMLTPAFHYDILKPYVGLMADSVRVMLDKWEELL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 AQNSRLELFQHVSLMTLDSIMKCAFSHQGSIQLDSTLDSYLKAVFNLSKISNQRMNNFLH
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CCDS54 GQDSPLEVFQHVSLMTLDTIMKCAFSHQGSIQVDRNSQSYIQAISDLNNLVFSRVRNAFH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 HNDLVFKFSSQGQIFSKFNQELHQFTEKVIQDRKESL-KDKLKQDTTQKRRWDFLDILLS
.:: .....: :. . : :: :..::: :: .: :. . .::. :::::::
CCDS54 QNDTIYSLTSAGRWTHRACQLAHQHTDQVIQLRKAQLQKEGELEKIKRKRHLDFLDILLL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 AKSENTKDFSEADLQAEVKTFMFAGHDTTSSAISWILYCLAKYPEHQQRCRDEIRELLGD
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CCDS54 AKMENGSILSDKDLRAEVDTFMFEGHDTTASGISWILYALATHPKHQERCREEIHSLLGD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 GSSITWEHLSQMPYTTMCIKECLRLYAPVVNISRLLDKPITFPDGRSLPAGITVFINIWA
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CCDS54 GASITWNHLDQMPYTTMCIKEALRLYPPVPGIGRELSTPVTFPDGRSLPKGIMVLLSIYG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 LHHNPYFWEDPQVFNPLRFSRENSEKIHPYAFIPFSAGLRNCIGQHFAIIECKVAVALTL
::::: : .:.::.:.::. ... : .::.:::.: :::::..::. : :::.::::
CCDS54 LHHNPKVWPNPEVFDPFRFAPGSAQ--HSHAFLPFSGGSRNCIGKQFAMNELKVATALTL
420 430 440 450 460 470
480 490 500
pF1KE0 LRFKLAPDHSRPPQPVRQVVLKSKNGIHVFAKKVC
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CCDS54 LRFELLPDPTRIPIPIARLVLKSKNGIHLRLRRLPNPCEDKDQL
480 490 500 510
>>CCDS30707.1 CYP4A22 gene_id:284541|Hs108|chr1 (519 aa)
initn: 1647 init1: 698 opt: 1712 Z-score: 1979.3 bits: 375.8 E(32554): 6.3e-104
Smith-Waterman score: 1712; 51.9% identity (77.8% similar) in 491 aa overlap (16-504:24-509)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEPSWLQELMAHPFLLLILLCMSLLLFQVIRLYQRRRWMIRALHLFPAPPAH
::::: :::... .:: .:.:...::. :: ::.:
CCDS30 MSVSVLSPSRRLGGVSGILQVTSLLILL---LLLIKAAQLYLHRQWLLKALQQFPCPPSH
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 WFYGH-KEFYPVKEFEVYHKLMEKYPCAVPLWVGPFTMFFSVHDPDYAKILLKRQDPKSA
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CCDS30 WLFGHIQEFQHDQELQRIQERVKTFPSACPYWIWGGKVRVQLYDPDYMKVILGRSDPKSH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 VSHKILESWVGRGLVTLDGSKWKKHRQIVKPGFNISILKIFITMMSESVRMMLNKWEEHI
:.:.: .: ::. :.:. : .::... :.:. .::: .. .:..:::.::.:::: .
CCDS30 GSYKFLAPRIGYGLLLLNGQTWFQHRRMLTPAFHNDILKPYVGLMADSVRVMLDKWEELL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 AQNSRLELFQHVSLMTLDSIMKCAFSHQGSIQLDSTLDSYLKAVFNLSKISNQRMNNFLH
.:.: ::.::::::::::.::: :::::::::.: . .::..:. .:... : : .:
CCDS30 GQDSPLEVFQHVSLMTLDTIMKSAFSHQGSIQVDRNSQSYIQAISDLNSLVFCCMRNAFH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 HNDLVFKFSSQGQIFSKFNQELHQFTEKVIQDRKESL-KDKLKQDTTQKRRWDFLDILLS
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: :: : . :.::.::::.:. :
CCDS81 DPSRLPIKMPQLVLRSKNGFHLHLKPLGPGSGK
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CCDS12 IDVLLLSKDEDGKKLSDEDIRAEADTFMFEGHDTTASGLSWVLYHLAKHPEYQERCRQEV
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CCDS74 DIVFYKTLKPWLGDGLLLSVGDKWRHHRRLLTPAFHFNILKPYIKIFSKSANIMHAKWQR
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CCDS74 LAMEGSTCLDVFEHISLMTLDSLQKCIFSFDSNCQEKPS--EYITAIMELSALVVKRNNQ
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CCDS74 FFRYKDFLYFLTPCGRRFHRACRLVHDFTDAVIQERRRTLTSQGVDDFLQAKAKSKTLDF
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CCDS74 IDVLLLSEDKNGKELSDEDIRAEADTFMFGGHDTTASGLSWVLYNLARHPEYQERCRQEV
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CCDS74 QELLKDREPKEIEWDDLAQLPFLTMCLKESLRLHPPIPTFARGCTQDVVLPDSRVIPKGN
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CCDS74 VCNINIFAIHHNPSVWPDPEVYDPFRFDPENAQKRSPMAFIPFSAGPRNCIGQKFAMAEM
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pF1KE0 KVAVALTLLRFKLAPDHSRPPQPVRQVVLKSKNGIHVFAKKVC
::..:::::::.. ::: : :. . ..::....:.
CCDS74 KVVLALTLLRFRILPDH-REPRRTPEIVLRAEDGLWLRVEPLG
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initn: 1136 init1: 468 opt: 1243 Z-score: 1437.2 bits: 275.5 E(32554): 9.9e-74
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CCDS42 MSLLSLPWLGLRPVATSPWLLLLLVVGSWLLARILAWTYAFYNNCRRLQCFPQPPKRNWF
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