Result of FASTA (omim) for
pF1KE0356
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0356, 505 aa
1>>>pF1KE0356 505 - 505 aa - 505 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8371+/-0.000422; mu= 21.2974+/- 0.026
mean_var=80.7735+/-16.584, 0's: 0 Z-trim(112.3): 178 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.142705
statistics sampled from 20971 (21163) to 20971 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.248), width: 16
Scan time: 9.410
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_828847 (OMIM: 614999) cytochrome P450 4X1 isofo ( 509) 1936 408.8 1.9e-113
XP_016856462 (OMIM: 614999) PREDICTED: cytochrome ( 470) 1827 386.3 1e-106
NP_000769 (OMIM: 601310) cytochrome P450 4A11 isof ( 519) 1787 378.1 3.3e-104
NP_001010969 (OMIM: 615341) cytochrome P450 4A22 i ( 519) 1712 362.7 1.5e-99
NP_001307218 (OMIM: 614999) cytochrome P450 4X1 is ( 508) 1709 362.1 2.2e-99
NP_001307219 (OMIM: 614999) cytochrome P450 4X1 is ( 444) 1708 361.8 2.3e-99
NP_000770 (OMIM: 124075) cytochrome P450 4B1 isofo ( 511) 1578 335.1 2.9e-91
NP_001093242 (OMIM: 124075) cytochrome P450 4B1 is ( 512) 1578 335.1 2.9e-91
XP_016855954 (OMIM: 601310) PREDICTED: cytochrome ( 415) 1547 328.6 2.1e-89
XP_016855955 (OMIM: 124075) PREDICTED: cytochrome ( 496) 1322 282.4 2.1e-75
NP_001306090 (OMIM: 124075) cytochrome P450 4B1 is ( 497) 1322 282.4 2.1e-75
NP_001073 (OMIM: 604426) phylloquinone omega-hydro ( 520) 1260 269.6 1.5e-71
NP_009184 (OMIM: 611545) cytochrome P450 4F8 precu ( 520) 1255 268.6 3.1e-71
NP_076433 (OMIM: 611485) cytochrome P450 4F12 [Hom ( 524) 1243 266.1 1.7e-70
NP_067010 (OMIM: 611517) phylloquinone omega-hydro ( 524) 1241 265.7 2.3e-70
NP_001122404 (OMIM: 611517) phylloquinone omega-hy ( 524) 1241 265.7 2.3e-70
XP_016882303 (OMIM: 601270) PREDICTED: docosahexae ( 520) 1236 264.7 4.6e-70
NP_001186137 (OMIM: 601270) docosahexaenoic acid o ( 520) 1236 264.7 4.6e-70
NP_001186138 (OMIM: 601270) docosahexaenoic acid o ( 520) 1236 264.7 4.6e-70
NP_000887 (OMIM: 601270) docosahexaenoic acid omeg ( 520) 1235 264.5 5.4e-70
XP_011525995 (OMIM: 611495) PREDICTED: cytochrome ( 531) 1230 263.5 1.1e-69
XP_011525994 (OMIM: 611495) PREDICTED: cytochrome ( 531) 1230 263.5 1.1e-69
NP_775754 (OMIM: 611495) cytochrome P450 4F22 [Hom ( 531) 1230 263.5 1.1e-69
NP_001306092 (OMIM: 124075) cytochrome P450 4B1 is ( 348) 1167 250.3 6.7e-66
NP_001306091 (OMIM: 124075) cytochrome P450 4B1 is ( 349) 1167 250.3 6.7e-66
XP_006722913 (OMIM: 611485) PREDICTED: cytochrome ( 375) 1113 239.2 1.6e-62
XP_011526504 (OMIM: 611485) PREDICTED: cytochrome ( 375) 1113 239.2 1.6e-62
XP_011526510 (OMIM: 611485) PREDICTED: cytochrome ( 375) 1113 239.2 1.6e-62
XP_005259968 (OMIM: 601270) PREDICTED: docosahexae ( 371) 1096 235.7 1.7e-61
XP_011526316 (OMIM: 601270) PREDICTED: docosahexae ( 371) 1096 235.7 1.7e-61
NP_001306084 (OMIM: 601310) cytochrome P450 4A11 i ( 487) 1052 226.8 1.1e-58
XP_011526507 (OMIM: 611485) PREDICTED: cytochrome ( 352) 1046 225.4 2.1e-58
XP_011526505 (OMIM: 611485) PREDICTED: cytochrome ( 352) 1046 225.4 2.1e-58
XP_011526506 (OMIM: 611485) PREDICTED: cytochrome ( 352) 1046 225.4 2.1e-58
XP_011526509 (OMIM: 611485) PREDICTED: cytochrome ( 334) 1006 217.2 6.2e-56
XP_016881721 (OMIM: 611545) PREDICTED: cytochrome ( 418) 909 197.3 7.4e-50
XP_011539135 (OMIM: 124075) PREDICTED: cytochrome ( 278) 862 187.4 4.6e-47
NP_997235 (OMIM: 210370,608614) cytochrome P450 4V ( 525) 823 179.7 1.8e-44
XP_005262992 (OMIM: 210370,608614) PREDICTED: cyto ( 524) 819 178.9 3.3e-44
XP_016882304 (OMIM: 601270) PREDICTED: docosahexae ( 391) 771 168.8 2.5e-41
XP_016882661 (OMIM: 611485) PREDICTED: cytochrome ( 411) 768 168.2 4e-41
XP_011539134 (OMIM: 124075) PREDICTED: cytochrome ( 296) 716 157.4 5.3e-38
XP_016863526 (OMIM: 210370,608614) PREDICTED: cyto ( 393) 714 157.1 8.6e-38
XP_005270596 (OMIM: 601310) PREDICTED: cytochrome ( 357) 691 152.3 2.1e-36
XP_016855953 (OMIM: 601310) PREDICTED: cytochrome ( 421) 691 152.4 2.4e-36
XP_005270827 (OMIM: 615341) PREDICTED: cytochrome ( 261) 655 144.8 2.9e-34
NP_001295031 (OMIM: 615341) cytochrome P450 4A22 i ( 357) 655 144.9 3.7e-34
XP_005270824 (OMIM: 615341) PREDICTED: cytochrome ( 421) 655 145.0 4.1e-34
NP_476436 (OMIM: 606534) cytochrome P450 3A43 isof ( 503) 647 143.4 1.4e-33
NP_073731 (OMIM: 606534) cytochrome P450 3A43 isof ( 504) 635 141.0 8e-33
>>NP_828847 (OMIM: 614999) cytochrome P450 4X1 isoform 1 (509 aa)
initn: 1892 init1: 974 opt: 1936 Z-score: 2157.8 bits: 408.8 E(85289): 1.9e-113
Smith-Waterman score: 1936; 53.6% identity (81.6% similar) in 506 aa overlap (1-504:1-506)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEPSWLQELMAHPFLLLILLCMSLLLFQVIRLYQRRRWMIRALHLFPAPPAHWFYGHKEF
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NP_828 MEFSWLETRWARPFYLAFVFCLALGLLQAIKLYLRRQRLLRDLRPFPAPPTHWFLGHQKF
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 YPVKEFEVYHKLMEKYPCAVPLWVGPFTMFFSVHDPDYAKILLKRQDPKSAVSHKILESW
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NP_828 IQDDNMEKLEEIIEKYPRAFPFWIGPFQAFFCIYDPDYAKTLLSRTDPKSQYLQKFSPPL
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pF1KE0 VGRGLVTLDGSKWKKHRQIVKPGFNISILKIFITMMSESVRMMLNKWEEHIA-QNSRLEL
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NP_828 LGKGLAALDGPKWFQHRRLLTPGFHFNILKAYIEVMAHSVKMMLDKWEKICSTQDTSVEV
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pF1KE0 FQHVSLMTLDSIMKCAFSHQGSIQLDSTLDSYLKAVFNLSKISNQRMNNFLHHNDLVFKF
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NP_828 YEHINSMSLDIIMKCAFSKETNCQTNSTHDPYAKAIFELSKIIFHRLYSLLYHSDIIFKL
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SSQGQIFSKFNQELHQFTEKVIQDRKESLKDKLKQDTTQKRRW-DFLDILLSAKSENTKD
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NP_828 SPQGYRFQKLSRVLNQYTDTIIQERKKSLQAGVKQDNTPKRKYQDFLDIVLSAKDESGSS
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360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LSQMPYTTMCIKECLRLYAPVVNISRLLDKPITFPDGRSLPAGITVFINIWALHHNPYFW
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NP_828 LGEMSYTTMCIKETCRLIPAVPSISRDLSKPLTFPDGCTLPAGITVVLSIWGLHHNPAVW
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pF1KE0 EDPQVFNPLRFSRENSEKIHPYAFIPFSAGLRNCIGQHFAIIECKVAVALTLLRFKLAPD
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NP_828 KNPKVFDPLRFSQENSDQRHPYAYLPFSAGSRNCIGQEFAMIELKVTIALILLHFRVTPD
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pF1KE0 HSRPPQPVRQVVLKSKNGIHVFAKKVC
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NP_828 PTRPLTFPNHFILKPKNGMYLHLKKLSEC
490 500
>>XP_016856462 (OMIM: 614999) PREDICTED: cytochrome P450 (470 aa)
initn: 1783 init1: 865 opt: 1827 Z-score: 2036.9 bits: 386.3 E(85289): 1e-106
Smith-Waterman score: 1827; 54.2% identity (82.3% similar) in 469 aa overlap (1-467:1-469)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEPSWLQELMAHPFLLLILLCMSLLLFQVIRLYQRRRWMIRALHLFPAPPAHWFYGHKEF
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XP_016 MEFSWLETRWARPFYLAFVFCLALGLLQAIKLYLRRQRLLRDLRPFPAPPTHWFLGHQKF
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pF1KE0 YPVKEFEVYHKLMEKYPCAVPLWVGPFTMFFSVHDPDYAKILLKRQDPKSAVSHKILESW
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XP_016 IQDDNMEKLEEIIEKYPRAFPFWIGPFQAFFCIYDPDYAKTLLSRTDPKSQYLQKFSPPL
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pF1KE0 VGRGLVTLDGSKWKKHRQIVKPGFNISILKIFITMMSESVRMMLNKWEEHIA-QNSRLEL
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XP_016 LGKGLAALDGPKWFQHRRLLTPGFHFNILKAYIEVMAHSVKMMLDKWEKICSTQDTSVEV
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pF1KE0 FQHVSLMTLDSIMKCAFSHQGSIQLDSTLDSYLKAVFNLSKISNQRMNNFLHHNDLVFKF
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XP_016 YEHINSMSLDIIMKCAFSKETNCQTNSTHDPYAKAIFELSKIIFHRLYSLLYHSDIIFKL
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pF1KE0 SSQGQIFSKFNQELHQFTEKVIQDRKESLKDKLKQDTTQKRRW-DFLDILLSAKSENTKD
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pF1KE0 FSEADLQAEVKTFMFAGHDTTSSAISWILYCLAKYPEHQQRCRDEIRELLGDGSSITWEH
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pF1KE0 LSQMPYTTMCIKECLRLYAPVVNISRLLDKPITFPDGRSLPAGITVFINIWALHHNPYFW
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XP_016 LGEMSYTTMCIKETCRLIPAVPSISRDLSKPLTFPDGCTLPAGITVVLSIWGLHHNPAVW
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pF1KE0 EDPQVFNPLRFSRENSEKIHPYAFIPFSAGLRNCIGQHFAIIECKVAVALTLLRFKLAPD
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XP_016 KNPKVFDPLRFSQENSDQRHPYAYLPFSAGSRNCIGQEFAMIELKALISG
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pF1KE0 HSRPPQPVRQVVLKSKNGIHVFAKKVC
>>NP_000769 (OMIM: 601310) cytochrome P450 4A11 isoform (519 aa)
initn: 1761 init1: 718 opt: 1787 Z-score: 1991.9 bits: 378.1 E(85289): 3.3e-104
Smith-Waterman score: 1787; 52.7% identity (79.4% similar) in 491 aa overlap (16-504:24-509)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEPSWLQELMAHPFLLLILLCMSLLLFQVIRLYQRRRWMIRALHLFPAPPAH
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pF1KE0 WFYGH-KEFYPVKEFEVYHKLMEKYPCAVPLWVGPFTMFFSVHDPDYAKILLKRQDPKSA
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NP_000 WLFGHIQELQQDQELQRIQKWVETFPSACPHWLWGGKVRVQLYDPDYMKVILGRSDPKSH
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pF1KE0 AQNSRLELFQHVSLMTLDSIMKCAFSHQGSIQLDSTLDSYLKAVFNLSKISNQRMNNFLH
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NP_000 GQDSPLEVFQHVSLMTLDTIMKCAFSHQGSIQVDRNSQSYIQAISDLNNLVFSRVRNAFH
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pF1KE0 HNDLVFKFSSQGQIFSKFNQELHQFTEKVIQDRKESL-KDKLKQDTTQKRRWDFLDILLS
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NP_000 QNDTIYSLTSAGRWTHRACQLAHQHTDQVIQLRKAQLQKEGELEKIKRKRHLDFLDILLL
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pF1KE0 AKSENTKDFSEADLQAEVKTFMFAGHDTTSSAISWILYCLAKYPEHQQRCRDEIRELLGD
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NP_000 AKMENGSILSDKDLRAEVDTFMFEGHDTTASGISWILYALATHPKHQERCREEIHSLLGD
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pF1KE0 GSSITWEHLSQMPYTTMCIKECLRLYAPVVNISRLLDKPITFPDGRSLPAGITVFINIWA
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NP_000 GASITWNHLDQMPYTTMCIKEALRLYPPVPGIGRELSTPVTFPDGRSLPKGIMVLLSIYG
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pF1KE0 LHHNPYFWEDPQVFNPLRFSRENSEKIHPYAFIPFSAGLRNCIGQHFAIIECKVAVALTL
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NP_000 LHHNPKVWPNPEVFDPFRFAPGSAQ--HSHAFLPFSGGSRNCIGKQFAMNELKVATALTL
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pF1KE0 LRFKLAPDHSRPPQPVRQVVLKSKNGIHVFAKKVC
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NP_000 LRFELLPDPTRIPIPIARLVLKSKNGIHLRLRRLPNPCEDKDQL
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>>NP_001010969 (OMIM: 615341) cytochrome P450 4A22 isofo (519 aa)
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Smith-Waterman score: 1712; 51.9% identity (77.8% similar) in 491 aa overlap (16-504:24-509)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEPSWLQELMAHPFLLLILLCMSLLLFQVIRLYQRRRWMIRALHLFPAPPAH
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pF1KE0 WFYGH-KEFYPVKEFEVYHKLMEKYPCAVPLWVGPFTMFFSVHDPDYAKILLKRQDPKSA
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NP_001 WLFGHIQEFQHDQELQRIQERVKTFPSACPYWIWGGKVRVQLYDPDYMKVILGRSDPKSH
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pF1KE0 VSHKILESWVGRGLVTLDGSKWKKHRQIVKPGFNISILKIFITMMSESVRMMLNKWEEHI
:.:.: .: ::. :.:. : .::... :.:. .::: .. .:..:::.::.:::: .
NP_001 GSYKFLAPRIGYGLLLLNGQTWFQHRRMLTPAFHNDILKPYVGLMADSVRVMLDKWEELL
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180 190 200 210 220 230
pF1KE0 AQNSRLELFQHVSLMTLDSIMKCAFSHQGSIQLDSTLDSYLKAVFNLSKISNQRMNNFLH
.:.: ::.::::::::::.::: :::::::::.: . .::..:. .:... : : .:
NP_001 GQDSPLEVFQHVSLMTLDTIMKSAFSHQGSIQVDRNSQSYIQAISDLNSLVFCCMRNAFH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 HNDLVFKFSSQGQIFSKFNQELHQFTEKVIQDRKESL-KDKLKQDTTQKRRWDFLDILLS
.:: .....: :. . : :: :..::: :: .: :. . .::. :::::::
NP_001 ENDTIYSLTSAGRWTHRACQLAHQHTDQVIQLRKAQLQKEGELEKIKRKRHLDFLDILLL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 AKSENTKDFSEADLQAEVKTFMFAGHDTTSSAISWILYCLAKYPEHQQRCRDEIRELLGD
:: :: . .:. ::.::: :::: :::::.:.:::::: :: .:.::.:::.::. ::::
NP_001 AKMENGSILSDKDLRAEVDTFMFEGHDTTASGISWILYALATHPKHQERCREEIHGLLGD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 GSSITWEHLSQMPYTTMCIKECLRLYAPVVNISRLLDKPITFPDGRSLPAGITVFINIWA
:.::::.::.::::::::::: :::: :: .:.: :. :.::::::::: :: :...:..
NP_001 GASITWNHLDQMPYTTMCIKEALRLYPPVPGIGRELSTPVTFPDGRSLPKGIMVLLSIYG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 LHHNPYFWEDPQVFNPLRFSRENSEKIHPYAFIPFSAGLRNCIGQHFAIIECKVAVALTL
::::: : . .::.: ::. ... : .::.:::.: :::::..::. . ::: ::::
NP_001 LHHNPKVWPNLEVFDPSRFAPGSAQ--HSHAFLPFSGGSRNCIGKQFAMNQLKVARALTL
420 430 440 450 460 470
480 490 500
pF1KE0 LRFKLAPDHSRPPQPVRQVVLKSKNGIHVFAKKVC
:::.: :: .: : :. ..:::::::::. ...
NP_001 LRFELLPDPTRIPIPMARLVLKSKNGIHLRLRRLPNPCEDKDQL
480 490 500 510
>>NP_001307218 (OMIM: 614999) cytochrome P450 4X1 isofor (508 aa)
initn: 1657 init1: 974 opt: 1709 Z-score: 1905.2 bits: 362.1 E(85289): 2.2e-99
Smith-Waterman score: 1709; 53.9% identity (81.9% similar) in 447 aa overlap (60-504:59-505)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 IRLYQRRRWMIRALHLFPAPPAHWFYGHKEFYPVKEFEVYHKLMEKYPCAVPLWVGPFTM
: ..: ....:::: : :.:.:::
NP_001 EPPSLYLTQPTSSLAEPQALICMTSSSSGLFIQDDNMEKLEEIIEKYPRAFPFWIGPFQA
30 40 50 60 70 80
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 FFSVHDPDYAKILLKRQDPKSAVSHKILESWVGRGLVTLDGSKWKKHRQIVKPGFNISIL
:: ..:::::: ::.: :::: .:. .:.::..::: :: .::... :::...::
NP_001 FFCIYDPDYAKTLLSRTDPKSQYLQKFSPPLLGKGLAALDGPKWFQHRRLLTPGFHFNIL
90 100 110 120 130 140
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 KIFITMMSESVRMMLNKWEEHIA-QNSRLELFQHVSLMTLDSIMKCAFSHQGSIQLDSTL
: .: .:..::.:::.:::. . :.. .:...:.. :.:: :::::::.. . : .::
NP_001 KAYIEVMAHSVKMMLDKWEKICSTQDTSVEVYEHINSMSLDIIMKCAFSKETNCQTNSTH
150 160 170 180 190 200
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 DSYLKAVFNLSKISNQRMNNFLHHNDLVFKFSSQGQIFSKFNQELHQFTEKVIQDRKESL
: : ::.:.:::: .:. ..:.:.:..::.: :: :.:... :.:.:. .::.::.::
NP_001 DPYAKAIFELSKIIFHRLYSLLYHSDIIFKLSPQGYRFQKLSRVLNQYTDTIIQERKKSL
210 220 230 240 250 260
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 KDKLKQDTTQKRRW-DFLDILLSAKSENTKDFSEADLQAEVKTFMFAGHDTTSSAISWIL
. .:::.: ::.. :::::.::::.:. ..::. :...::.::..::::: ...:::::
NP_001 QAGVKQDNTPKRKYQDFLDIVLSAKDESGSSFSDIDVHSEVSTFLLAGHDTLAASISWIL
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 YCLAKYPEHQQRCRDEIRELLGDGSSITWEHLSQMPYTTMCIKECLRLYAPVVNISRLLD
:::: ::::.:::.:.: .:::::::::..:..: :::::::: :: : .::: :.
NP_001 YCLALNPEHQERCREEVRGILGDGSSITWDQLGEMSYTTMCIKETCRLIPAVPSISRDLS
330 340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 KPITFPDGRSLPAGITVFINIWALHHNPYFWEDPQVFNPLRFSRENSEKIHPYAFIPFSA
::.::::: .::::::: ..::.::::: :..:.::.:::::.:::.. ::::..::::
NP_001 KPLTFPDGCTLPAGITVVLSIWGLHHNPAVWKNPKVFDPLRFSQENSDQRHPYAYLPFSA
390 400 410 420 430 440
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 GLRNCIGQHFAIIECKVAVALTLLRFKLAPDHSRPPQPVRQVVLKSKNGIHVFAKKVC
: ::::::.::.:: ::..:: ::.:...:: .:: . .:: :::... ::.
NP_001 GSRNCIGQEFAMIELKVTIALILLHFRVTPDPTRPLTFPNHFILKPKNGMYLHLKKLSEC
450 460 470 480 490 500
>>NP_001307219 (OMIM: 614999) cytochrome P450 4X1 isofor (444 aa)
initn: 1657 init1: 974 opt: 1708 Z-score: 1904.8 bits: 361.8 E(85289): 2.3e-99
Smith-Waterman score: 1708; 54.5% identity (82.5% similar) in 440 aa overlap (67-504:2-441)
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 RWMIRALHLFPAPPAHWFYGHKEFYPVKEFEVYHKLMEKYPCAVPLWVGPFTMFFSVHDP
: ....:::: : :.:.::: :: ..::
NP_001 MEKLEEIIEKYPRAFPFWIGPFQAFFCIYDP
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 DYAKILLKRQDPKSAVSHKILESWVGRGLVTLDGSKWKKHRQIVKPGFNISILKIFITMM
:::: ::.: :::: .:. .:.::..::: :: .::... :::...::: .: .:
NP_001 DYAKTLLSRTDPKSQYLQKFSPPLLGKGLAALDGPKWFQHRRLLTPGFHFNILKAYIEVM
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 SESVRMMLNKWEEHIA-QNSRLELFQHVSLMTLDSIMKCAFSHQGSIQLDSTLDSYLKAV
..::.:::.:::. . :.. .:...:.. :.:: :::::::.. . : .:: : : ::.
NP_001 AHSVKMMLDKWEKICSTQDTSVEVYEHINSMSLDIIMKCAFSKETNCQTNSTHDPYAKAI
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 FNLSKISNQRMNNFLHHNDLVFKFSSQGQIFSKFNQELHQFTEKVIQDRKESLKDKLKQD
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NP_001 FELSKIIFHRLYSLLYHSDIIFKLSPQGYRFQKLSRVLNQYTDTIIQERKKSLQAGVKQD
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 TTQKRRW-DFLDILLSAKSENTKDFSEADLQAEVKTFMFAGHDTTSSAISWILYCLAKYP
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NP_001 NTPKRKYQDFLDIVLSAKDESGSSFSDIDVHSEVSTFLLAGHDTLAASISWILYCLALNP
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 EHQQRCRDEIRELLGDGSSITWEHLSQMPYTTMCIKECLRLYAPVVNISRLLDKPITFPD
:::.:::.:.: .:::::::::..:..: :::::::: :: : .::: :.::.::::
NP_001 EHQERCREEVRGILGDGSSITWDQLGEMSYTTMCIKETCRLIPAVPSISRDLSKPLTFPD
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 GRSLPAGITVFINIWALHHNPYFWEDPQVFNPLRFSRENSEKIHPYAFIPFSAGLRNCIG
: .::::::: ..::.::::: :..:.::.:::::.:::.. ::::..::::: :::::
NP_001 GCTLPAGITVVLSIWGLHHNPAVWKNPKVFDPLRFSQENSDQRHPYAYLPFSAGSRNCIG
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500
pF1KE0 QHFAIIECKVAVALTLLRFKLAPDHSRPPQPVRQVVLKSKNGIHVFAKKVC
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NP_001 QEFAMIELKVTIALILLHFRVTPDPTRPLTFPNHFILKPKNGMYLHLKKLSEC
400 410 420 430 440
>>NP_000770 (OMIM: 124075) cytochrome P450 4B1 isoform b (511 aa)
initn: 1455 init1: 1277 opt: 1578 Z-score: 1759.4 bits: 335.1 E(85289): 2.9e-91
Smith-Waterman score: 1578; 45.2% identity (75.2% similar) in 504 aa overlap (1-502:1-503)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEPSWLQELMAHPFLLLILLCMSLLLFQVIRLYQRRRWMIRALHLFPAPPAHWFYGHK-E
: ::.:. .. : : . : ....:.: ::. . .:. ::.::.::..:: :
NP_000 MVPSFLSLSFSSLGLWASGLILVLGFLKLIHLLLRRQTLAKAMDKFPGPPTHWLFGHALE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 FYPVKEFEVYHKLMEKYPCAVPLWVGPFTMFFSVHDPDYAKILLKRQDPKSAVSHKILES
. . .. . ...: : ::: : : :.....::::: . .: :::. . .. .
NP_000 IQETGSLDKVVSWAHQFPYAHPLWFGQFIGFLNIYEPDYAKAVYSRGDPKAPDVYDFFLQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 WVGRGLVTLDGSKWKKHRQIVKPGFNISILKIFITMMSESVRMMLNKWEEHIAQNSRLEL
:.::::..:.: :: .::... :::. ..:: ......::.:.::.::::. ... ...
NP_000 WIGRGLLVLEGPKWLQHRKLLTPGFHYDVLKPYVAVFTESTRIMLDKWEEKAREGKSFDI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 FQHVSLMTLDSIMKCAFSHQGSIQLDSTLDSYLKAVFNLSKISNQRMNNFLHHNDLVFKF
: :. :.:...:::.:. .:. : .:: :: .:. . .::. .: .:::... .
NP_000 FCDVGHMALNTLMKCTFG-RGDTGLGHRDSSYYLAVSDLTLLMQQRLVSFQYHNDFIYWL
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SSQGQIFSKFNQELHQFTEKVIQDRKESLKD-KLKQDTTQKRRWDFLDILLSAKSENTKD
. .:. : . : :. :..::..:: .:.: :... ..:. :::::::.:..:.
NP_000 TPHGRRFLRACQVAHDHTDQVIRERKAALQDEKVRKKIQNRRHLDFLDILLGARDEDDIK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 FSEADLQAEVKTFMFAGHDTTSSAISWILYCLAKYPEHQQRCRDEIRELLGDGSSITWEH
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NP_000 LSDADLRAEVDTFMFEGHDTTTSGISWFLYCMALYPEHQHRCREEVREILGDQDFFQWDD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LSQMPYTTMCIKECLRLYAPVVNISRLLDKPITFPDGRSLPAGITVFINIWALHHNPYFW
:..: : :::::: .::: :: .. : :.::.:: :::::::: . ..:.:::.: :
NP_000 LGKMTYLTMCIKESFRLYPPVPQVYRQLSKPVTFVDGRSLPAGSLISMHIYALHRNSAVW
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 EDPQVFNPLRFSRENSEKIHPYAFIPFSAGLRNCIGQHFAIIECKVAVALTLLRFKLAPD
::.::. :::: ::. : ::.::.::::: ::::::.::. : ::..:. ::::... :
NP_000 PDPEVFDSLRFSTENASKRHPFAFMPFSAGPRNCIGQQFAMSEMKVVTAMCLLRFEFSLD
420 430 440 450 460 470
480 490 500
pF1KE0 HSRPPQPVRQVVLKSKNGIHVFAKKVC
:: : . :.::.::::.:. :
NP_000 PSRLPIKMPQLVLRSKNGFHLHLKPLGPGSGK
480 490 500 510
>>NP_001093242 (OMIM: 124075) cytochrome P450 4B1 isofor (512 aa)
initn: 1575 init1: 914 opt: 1578 Z-score: 1759.4 bits: 335.1 E(85289): 2.9e-91
Smith-Waterman score: 1578; 45.3% identity (75.2% similar) in 505 aa overlap (1-502:1-504)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEPSWLQELMAHPFLLLILLCMSLLLFQVIRLYQRRRWMIRALHLFPAPPAHWFYGHK-E
: ::.:. .. : : . : ....:.: ::. . .:. ::.::.::..:: :
NP_001 MVPSFLSLSFSSLGLWASGLILVLGFLKLIHLLLRRQTLAKAMDKFPGPPTHWLFGHALE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 FYPVKEFEVYHKLMEKYPCAVPLWVGPFTMFFSVHDPDYAKILLKRQDPKSAVSHKILES
. . .. . ...: : ::: : : :.....::::: . .: :::. . .. .
NP_001 IQETGSLDKVVSWAHQFPYAHPLWFGQFIGFLNIYEPDYAKAVYSRGDPKAPDVYDFFLQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 WVGRGLVTLDGSKWKKHRQIVKPGFNISILKIFITMMSESVRMMLNKWEEHIAQNSRLEL
:.::::..:.: :: .::... :::. ..:: ......::.:.::.::::. ... ...
NP_001 WIGRGLLVLEGPKWLQHRKLLTPGFHYDVLKPYVAVFTESTRIMLDKWEEKAREGKSFDI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 FQHVSLMTLDSIMKCAFSHQGSIQLDSTLDS-YLKAVFNLSKISNQRMNNFLHHNDLVFK
: :. :.:...:::.:. .:. : . :: : :: .:. . .::. .: .:::...
NP_001 FCDVGHMALNTLMKCTFG-RGDTGLGHSRDSSYYLAVSDLTLLMQQRLVSFQYHNDFIYW
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 FSSQGQIFSKFNQELHQFTEKVIQDRKESLKD-KLKQDTTQKRRWDFLDILLSAKSENTK
.. .:. : . : :. :..::..:: .:.: :... ..:. :::::::.:..:.
NP_001 LTPHGRRFLRACQVAHDHTDQVIRERKAALQDEKVRKKIQNRRHLDFLDILLGARDEDDI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 DFSEADLQAEVKTFMFAGHDTTSSAISWILYCLAKYPEHQQRCRDEIRELLGDGSSITWE
.:.:::.::: :::: :::::.:.:::.:::.: :::::.:::.:.::.::: . . :.
NP_001 KLSDADLRAEVDTFMFEGHDTTTSGISWFLYCMALYPEHQHRCREEVREILGDQDFFQWD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 HLSQMPYTTMCIKECLRLYAPVVNISRLLDKPITFPDGRSLPAGITVFINIWALHHNPYF
:..: : :::::: .::: :: .. : :.::.:: :::::::: . ..:.:::.:
NP_001 DLGKMTYLTMCIKESFRLYPPVPQVYRQLSKPVTFVDGRSLPAGSLISMHIYALHRNSAV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 WEDPQVFNPLRFSRENSEKIHPYAFIPFSAGLRNCIGQHFAIIECKVAVALTLLRFKLAP
: ::.::. :::: ::. : ::.::.::::: ::::::.::. : ::..:. ::::...
NP_001 WPDPEVFDSLRFSTENASKRHPFAFMPFSAGPRNCIGQQFAMSEMKVVTAMCLLRFEFSL
420 430 440 450 460 470
480 490 500
pF1KE0 DHSRPPQPVRQVVLKSKNGIHVFAKKVC
: :: : . :.::.::::.:. :
NP_001 DPSRLPIKMPQLVLRSKNGFHLHLKPLGPGSGK
480 490 500 510
>>XP_016855954 (OMIM: 601310) PREDICTED: cytochrome P450 (415 aa)
initn: 1514 init1: 718 opt: 1547 Z-score: 1726.0 bits: 328.6 E(85289): 2.1e-89
Smith-Waterman score: 1547; 55.4% identity (81.0% similar) in 406 aa overlap (100-504:2-405)
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 HKLMEKYPCAVPLWVGPFTMFFSVHDPDYAKILLKRQDPKSAVSHKILESWVGRGLVTLD
:..: :.:::: :...: :.: ::. :.
XP_016 MKVILGRSDPKSHGSYRFLAPWIGYGLLLLN
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 GSKWKKHRQIVKPGFNISILKIFITMMSESVRMMLNKWEEHIAQNSRLELFQHVSLMTLD
:. : .::... :.:. .::: .. .:..:::.::.:::: ..:.: ::.::::::::::
XP_016 GQTWFQHRRMLTPAFHYDILKPYVGLMADSVRVMLDKWEELLGQDSPLEVFQHVSLMTLD
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SIMKCAFSHQGSIQLDSTLDSYLKAVFNLSKISNQRMNNFLHHNDLVFKFSSQGQIFSKF
.:::::::::::::.: . .::..:. .:... .:. : .:.:: .....: :. .
XP_016 TIMKCAFSHQGSIQVDRNSQSYIQAISDLNNLVFSRVRNAFHQNDTIYSLTSAGRWTHRA
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NQELHQFTEKVIQDRKESL-KDKLKQDTTQKRRWDFLDILLSAKSENTKDFSEADLQAEV
: :: :..::: :: .: :. . .::. ::::::: :: :: . .:. ::.:::
XP_016 CQLAHQHTDQVIQLRKAQLQKEGELEKIKRKRHLDFLDILLLAKMENGSILSDKDLRAEV
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 KTFMFAGHDTTSSAISWILYCLAKYPEHQQRCRDEIRELLGDGSSITWEHLSQMPYTTMC
:::: :::::.:.:::::: :: .:.::.:::.::. :::::.::::.::.::::::::
XP_016 DTFMFEGHDTTASGISWILYALATHPKHQERCREEIHSLLGDGASITWNHLDQMPYTTMC
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 IKECLRLYAPVVNISRLLDKPITFPDGRSLPAGITVFINIWALHHNPYFWEDPQVFNPLR
::: :::: :: .:.: :. :.::::::::: :: :...:..::::: : .:.::.:.:
XP_016 IKEALRLYPPVPGIGRELSTPVTFPDGRSLPKGIMVLLSIYGLHHNPKVWPNPEVFDPFR
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 FSRENSEKIHPYAFIPFSAGLRNCIGQHFAIIECKVAVALTLLRFKLAPDHSRPPQPVRQ
:. ... : .::.:::.: :::::..::. : :::.:::::::.: :: .: : :. .
XP_016 FAPGSAQ--HSHAFLPFSGGSRNCIGKQFAMNELKVATALTLLRFELLPDPTRIPIPIAR
340 350 360 370 380
490 500
pF1KE0 VVLKSKNGIHVFAKKVC
.:::::::::. ...
XP_016 LVLKSKNGIHLRLRRLPNPCEDKDQL
390 400 410
>>XP_016855955 (OMIM: 124075) PREDICTED: cytochrome P450 (496 aa)
initn: 1492 init1: 1142 opt: 1322 Z-score: 1474.7 bits: 282.4 E(85289): 2.1e-75
Smith-Waterman score: 1502; 44.4% identity (73.2% similar) in 504 aa overlap (1-502:1-488)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEPSWLQELMAHPFLLLILLCMSLLLFQVIRLYQRRRWMIRALHLFPAPPAHWFYGHK-E
: ::.:. .. : : . : ....:.: ::. . .:. ::.::.::..:: :
XP_016 MVPSFLSLSFSSLGLWASGLILVLGFLKLIHLLLRRQTLAKAMDKFPGPPTHWLFGHALE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 FYPVKEFEVYHKLMEKYPCAVPLWVGPFTMFFSVHDPDYAKILLKRQDPKSAVSHKILES
. . .. . ...: : ::: : : :.....::::: . .:
XP_016 IQETGSLDKVVSWAHQFPYAHPLWFGQFIGFLNIYEPDYAKAVYSRG-------------
70 80 90 100
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