Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0358
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0358, 754 aa
1>>>pF1KE0358 754 - 754 aa - 754 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9831+/-0.00153; mu= 18.8572+/- 0.091
mean_var=169.6486+/-31.683, 0's: 0 Z-trim(104.4): 127 B-trim: 8 in 1/51
Lambda= 0.098469
statistics sampled from 7768 (7885) to 7768 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.242), width: 16
Scan time: 3.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6045.1 ADAM7 gene_id:8756|Hs108|chr8 ( 754) 5309 767.9 0
CCDS34865.1 ADAM28 gene_id:10863|Hs108|chr8 ( 775) 1663 249.9 1.1e-65
CCDS47830.1 ADAM28 gene_id:10863|Hs108|chr8 ( 540) 1513 228.4 2.3e-59
CCDS4338.1 ADAM19 gene_id:8728|Hs108|chr5 ( 918) 1379 209.7 1.7e-53
CCDS6112.1 ADAM9 gene_id:8754|Hs108|chr8 ( 819) 1326 202.1 2.9e-51
CCDS63219.1 ADAM33 gene_id:80332|Hs108|chr20 ( 812) 1257 192.3 2.6e-48
CCDS13058.1 ADAM33 gene_id:80332|Hs108|chr20 ( 813) 1257 192.3 2.6e-48
CCDS7654.1 ADAM12 gene_id:8038|Hs108|chr10 ( 738) 1224 187.6 6.3e-47
CCDS7653.1 ADAM12 gene_id:8038|Hs108|chr10 ( 909) 1224 187.7 7.1e-47
CCDS3823.1 ADAM29 gene_id:11086|Hs108|chr4 ( 820) 1205 184.9 4.3e-46
CCDS58103.1 ADAM8 gene_id:101|Hs108|chr10 ( 742) 1179 181.2 5.3e-45
CCDS31319.2 ADAM8 gene_id:101|Hs108|chr10 ( 824) 1177 180.9 6.9e-45
CCDS9804.1 ADAM21 gene_id:8747|Hs108|chr14 ( 722) 1174 180.4 8.5e-45
CCDS32111.1 ADAM20 gene_id:8748|Hs108|chr14 ( 776) 1163 178.9 2.6e-44
CCDS907.1 ADAM30 gene_id:11085|Hs108|chr1 ( 790) 1132 174.5 5.6e-43
CCDS6113.1 ADAM18 gene_id:8749|Hs108|chr8 ( 739) 1087 168.1 4.5e-41
CCDS47846.1 ADAM32 gene_id:203102|Hs108|chr8 ( 787) 1051 163.0 1.6e-39
CCDS34884.1 ADAM2 gene_id:2515|Hs108|chr8 ( 735) 1016 158.0 4.9e-38
CCDS6044.1 ADAMDEC1 gene_id:27299|Hs108|chr8 ( 470) 999 155.3 2e-37
CCDS1088.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 772) 974 152.1 3.2e-36
CCDS58032.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 796) 974 152.1 3.2e-36
CCDS1084.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 814) 974 152.1 3.3e-36
CCDS58031.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 824) 974 152.1 3.3e-36
CCDS1086.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 838) 974 152.1 3.3e-36
CCDS1085.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 839) 974 152.1 3.3e-36
CCDS44236.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 862) 974 152.1 3.4e-36
CCDS1087.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 863) 974 152.1 3.4e-36
CCDS2369.1 ADAM23 gene_id:8745|Hs108|chr2 ( 832) 972 151.8 4e-36
CCDS55212.1 ADAMDEC1 gene_id:27299|Hs108|chr8 ( 391) 938 146.5 7.4e-35
CCDS60282.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 633) 924 144.8 3.9e-34
CCDS82139.1 ADAM11 gene_id:4185|Hs108|chr17 ( 569) 917 143.8 7.3e-34
CCDS11486.1 ADAM11 gene_id:4185|Hs108|chr17 ( 769) 913 143.4 1.3e-33
CCDS43610.1 ADAM22 gene_id:53616|Hs108|chr7 ( 859) 902 141.9 4.1e-33
CCDS47637.1 ADAM22 gene_id:53616|Hs108|chr7 ( 906) 902 141.9 4.2e-33
CCDS43609.1 ADAM22 gene_id:53616|Hs108|chr7 ( 870) 893 140.6 9.9e-33
CCDS43608.1 ADAM22 gene_id:53616|Hs108|chr7 ( 899) 893 140.6 1e-32
CCDS58102.1 ADAM8 gene_id:101|Hs108|chr10 ( 733) 891 140.2 1.1e-32
CCDS64883.1 ADAM2 gene_id:2515|Hs108|chr8 ( 672) 885 139.3 1.9e-32
CCDS64882.1 ADAM2 gene_id:2515|Hs108|chr8 ( 716) 843 133.4 1.2e-30
CCDS83287.1 ADAM18 gene_id:8749|Hs108|chr8 ( 715) 821 130.3 1.1e-29
CCDS83286.1 ADAM32 gene_id:203102|Hs108|chr8 ( 688) 549 91.6 4.4e-18
>>CCDS6045.1 ADAM7 gene_id:8756|Hs108|chr8 (754 aa)
initn: 5309 init1: 5309 opt: 5309 Z-score: 4092.2 bits: 767.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5309; 100.0% identity (100.0% similar) in 754 aa overlap (1-754:1-754)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLPGCIFLMILLIPQVKEKFILGVEGQQLVRPKKLPLIQKRDTGHTHDDDILKTYEEELL
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CCDS60 MLPGCIFLMILLIPQVKEKFILGVEGQQLVRPKKLPLIQKRDTGHTHDDDILKTYEEELL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YEIKLNRKTLVLHLLRSREFLGSNYSETFYSMKGEAFTRHPQIMDHCFYQGSIVHEYDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 YEIKLNRKTLVLHLLRSREFLGSNYSETFYSMKGEAFTRHPQIMDHCFYQGSIVHEYDSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ASISTCNGLRGFFRINDQRYLIEPVKYSDEGEHLVFKYNLRVPYGANYSCTELNFTRKTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ASISTCNGLRGFFRINDQRYLIEPVKYSDEGEHLVFKYNLRVPYGANYSCTELNFTRKTV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PGDNESEEDSKIKGIHDEKYVELFIVADDTVYRRNGHPHNKLRNRIWGMVNFVNMIYKTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PGDNESEEDSKIKGIHDEKYVELFIVADDTVYRRNGHPHNKLRNRIWGMVNFVNMIYKTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NIHVTLVGIEIWTHEDKIELYSNIETTLLRFSFWQEKILKTRKDFDHVVLLSGKWLYSHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 NIHVTLVGIEIWTHEDKIELYSNIETTLLRFSFWQEKILKTRKDFDHVVLLSGKWLYSHV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 QGISYPGGMCLPYYSTSIIKDLLPDTNIIANRMAHQLGHNLGMQHDEFPCTCPSGKCVMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 QGISYPGGMCLPYYSTSIIKDLLPDTNIIANRMAHQLGHNLGMQHDEFPCTCPSGKCVMD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 SDGSIPALKFSKCSQNQYHQYLKDYKPTCMLNIPFPYNFHDFQFCGNKKLDEGEECDCGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SDGSIPALKFSKCSQNQYHQYLKDYKPTCMLNIPFPYNFHDFQFCGNKKLDEGEECDCGP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 AQECTNPCCDAHTCVLKPGFTCAEGECCESCQIKKAGSICRPAKDECDFPEMCTGHSPAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AQECTNPCCDAHTCVLKPGFTCAEGECCESCQIKKAGSICRPAKDECDFPEMCTGHSPAC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 PKDQFRVNGFPCKNSEGYCFMGKCPTREDQCSELFDDEAIESHDICYKMNTKGNKFGYCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PKDQFRVNGFPCKNSEGYCFMGKCPTREDQCSELFDDEAIESHDICYKMNTKGNKFGYCK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 NKENRFLPCEEKDVRCGKIYCTGGELSSLLGEDKTYHLKDPQKNATVKCKTIFLYHDSTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 NKENRFLPCEEKDVRCGKIYCTGGELSSLLGEDKTYHLKDPQKNATVKCKTIFLYHDSTD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 IGLVASGTKCGEGMVCNNGECLNMEKVYISTNCPSQCNENPVDGHGLQCHCEEGQAPVAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 IGLVASGTKCGEGMVCNNGECLNMEKVYISTNCPSQCNENPVDGHGLQCHCEEGQAPVAC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 EETLHVTNITILVVVLVLVIVGIGVLILLVRYRKCIKLKQVQSPPTETLGVENKGYFGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EETLHVTNITILVVVLVLVIVGIGVLILLVRYRKCIKLKQVQSPPTETLGVENKGYFGDE
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KE0 QQIRTEPILPEIHFLNKPASKDSRGIADPNQSAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 QQIRTEPILPEIHFLNKPASKDSRGIADPNQSAK
730 740 750
>>CCDS34865.1 ADAM28 gene_id:10863|Hs108|chr8 (775 aa)
initn: 1699 init1: 1085 opt: 1663 Z-score: 1292.8 bits: 249.9 E(32554): 1.1e-65
Smith-Waterman score: 1954; 39.7% identity (67.0% similar) in 758 aa overlap (1-742:1-736)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLPGCIFLMILLIPQVKE-KFILGVEGQQLVRPKKLPLIQKRDTGHTHDDDILKTYEEEL
:: : . . .:: :. : . ::. ..: : .: ..::.. .. . . .: ::
CCDS34 MLQGLLPVSLLLSVAVSAIKELPGVKKYEVVYPIRLHPLHKREA---KEPEQQEQFETEL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LYEIKLNRKTLVLHLLRSREFLGSNYSETFYSMKGEAFTRHPQIMDHCFYQGSIVHEYDS
:.. .: : ::.: .....:. .:.::.:. :. .: ::::: :.::: :..: :
CCDS34 KYKMTINGKIAVLYLKKNKNLLAPGYTETYYNSTGKEITTSPQIMDDCYYQGHILNEKVS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 AASISTCNGLRGFFRINDQRYLIEPVK--YSDEGEHLVFKYNLRVPYGANY--SCTELNF
:::::: ::::.: .::::.:::.. . : :: .:::: : :: .: .
CCDS34 DASISTCRGLRGYFSQGDQRYFIEPLSPIHRDGQEHALFKYN---PDEKNYDSTCGMDGV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE0 TRKTVPGDNESEEDSKIKGIHD------EKYVELFIVADDTVYRRNGHPHNKLRNRIWGM
.: . .:. ..: :::.: ..: :. ..: .. ....:.:.. :
CCDS34 LWAHDLQQNIALPATKLVKLKDRKVQEHEKYIEYYLVLDNGEFKRYNENQDEIRKRVFEM
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 VNFVNMIYKTLNIHVTLVGIEIWTHEDKIELYSNIETTLLRFSFWQEKILKTRKDFDHVV
.:.:::.:: :: ::.:::.:::: .:::.. : :: :: :. ..:. :: : .
CCDS34 ANYVNMLYKKLNTHVALVGMEIWTDKDKIKITPNASFTLENFSKWRGSVLSRRKRHDIAQ
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290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LLSGKWLYSHVQGISYPGGMCLPYYSTSIIKDLLPDTNIIANRMAHQLGHNLGMQHDEFP
:... : . . :... . :: :: :.....: . .:. :::..:::.:: ::..
CCDS34 LITATELAGTTVGLAFMSTMCSPY-SVGVVQDHSDNLLRVAGTMAHEMGHNFGMFHDDYS
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350 360 370 380 390 400
pF1KE0 CTCPSGKCVMDSDGS--IPALKFSKCSQNQYHQYLKDYKPTCMLNIPFPYNFHDFQFCGN
: ::: ::::. : ::. ::.::. .: ....: .:..: :.: .. . .:::
CCDS34 CKCPSTICVMDKALSFYIPT-DFSSCSRLSYDKFFEDKLSNCLFNAPLPTDIISTPICGN
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410 420 430 440 450 460
pF1KE0 KKLDEGEECDCGPAQECTNPCCDAHTCVLKPGFTCAEGECCESCQIKKAGSICRPAKDEC
. .. ::.:::: ..:::: ::::.:: .: : :: :::::.::.:::: .::::::::
CCDS34 QLVEMGEDCDCGTSEECTNICCDAKTCKIKATFQCALGECCEKCQFKKAGMVCRPAKDEC
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470 480 490 500 510 520
pF1KE0 DFPEMCTGHSPACPKDQFRVNGFPCKNSEGYCFMGKCPTREDQCSELFDDEAIESHDICY
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CCDS34 DLPEMCNGKSGNCPDDRFQVNGFPCHHGKGHCLMGTCPTLQEQCTELWGPGTEVADKSCY
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530 540 550 560 570 580
pF1KE0 KMNTKGNKFGYCKNKENRFLPCEEKDVRCGKIYCTGGELSSLLGEDKTYHLKDPQKNATV
. : :.:.:::. .. ..::. .:. :::..: :: :. : : :. :
CCDS34 NRNEGGSKYGYCRRVDDTLIPCKANDTMCGKLFCQGG--SDNL----------PWKGRIV
540 550 560 570 580
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pF1KE0 K---CKTIFLYHDSTDIGLVASGTKCGEGMVCNNGECLNMEKVYISTNCPSQCNENPVDG
:::. : .::.::.:::::.. :: :.::...::.: :::: :.:. . :
CCDS34 TFLTCKTFDPEDTSQEIGMVANGTKCGDNKVCINAECVDIEKAYKSTNCSSKCKGHAVCD
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KE0 HGLQCHCEEGQAPVACEETLHVTNITILVVVLVLVIVGIGVLILLVRYRKCIKLKQVQSP
: :::.:::: : :... : ...:.: :: . : . :. ...:... . .. ..
CCDS34 HELQCQCEEGWIPPDCDDSSVVFHFSIVVGVLFPMAVIFVVVAMVIRHQSSREKQKKDQR
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740 750
pF1KE0 PTETLGVENKGYFGDEQQIRTEPILPEIHFLNKPASKDSRGIADPNQSAK
: : :.. . :.... . :. :: :
CCDS34 PLSTTGTRPHKQKRKPQMVKA--VQPQEMSQMKPHVYDLPVEGNEPPASFHKDTNALPPT
710 720 730 740 750
CCDS34 VFKDNPVSTPKDSNPKA
760 770
>>CCDS47830.1 ADAM28 gene_id:10863|Hs108|chr8 (540 aa)
initn: 1492 init1: 935 opt: 1513 Z-score: 1179.3 bits: 228.4 E(32554): 2.3e-59
Smith-Waterman score: 1513; 42.6% identity (70.1% similar) in 528 aa overlap (1-515:1-520)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLPGCIFLMILLIPQVKE-KFILGVEGQQLVRPKKLPLIQKRDTGHTHDDDILKTYEEEL
:: : . . .:: :. : . ::. ..: : .: ..::.. .. . . .: ::
CCDS47 MLQGLLPVSLLLSVAVSAIKELPGVKKYEVVYPIRLHPLHKREA---KEPEQQEQFETEL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LYEIKLNRKTLVLHLLRSREFLGSNYSETFYSMKGEAFTRHPQIMDHCFYQGSIVHEYDS
:.. .: : ::.: .....:. .:.::.:. :. .: ::::: :.::: :..: :
CCDS47 KYKMTINGKIAVLYLKKNKNLLAPGYTETYYNSTGKEITTSPQIMDDCYYQGHILNEKVS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 AASISTCNGLRGFFRINDQRYLIEPVK--YSDEGEHLVFKYNLRVPYGANY--SCTELNF
:::::: ::::.: .::::.:::.. . : :: .:::: : :: .: .
CCDS47 DASISTCRGLRGYFSQGDQRYFIEPLSPIHRDGQEHALFKYN---PDEKNYDSTCGMDGV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE0 TRKTVPGDNESEEDSKIKGIHD------EKYVELFIVADDTVYRRNGHPHNKLRNRIWGM
.: . .:. ..: :::.: ..: :. ..: .. ....:.:.. :
CCDS47 LWAHDLQQNIALPATKLVKLKDRKVQEHEKYIEYYLVLDNGEFKRYNENQDEIRKRVFEM
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 VNFVNMIYKTLNIHVTLVGIEIWTHEDKIELYSNIETTLLRFSFWQEKILKTRKDFDHVV
.:.:::.:: :: ::.:::.:::: .:::.. : :: :: :. ..:. :: : .
CCDS47 ANYVNMLYKKLNTHVALVGMEIWTDKDKIKITPNASFTLENFSKWRGSVLSRRKRHDIAQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LLSGKWLYSHVQGISYPGGMCLPYYSTSIIKDLLPDTNIIANRMAHQLGHNLGMQHDEFP
:... : . . :... . :: :: :.....: . .:. :::..:::.:: ::..
CCDS47 LITATELAGTTVGLAFMSTMCSPY-SVGVVQDHSDNLLRVAGTMAHEMGHNFGMFHDDYS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 CTCPSGKCVMDSDGS--IPALKFSKCSQNQYHQYLKDYKPTCMLNIPFPYNFHDFQFCGN
: ::: ::::. : ::. ::.::. .: ....: .:..: :.: .. . .:::
CCDS47 CKCPSTICVMDKALSFYIPT-DFSSCSRLSYDKFFEDKLSNCLFNAPLPTDIISTPICGN
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 KKLDEGEECDCGPAQECTNPCCDAHTCVLKPGFTCAEGECCESCQIKKAGSICRPAKDEC
. .. ::.:::: ..:::: ::::.:: .: : :: :::::.::.:::: .::::::::
CCDS47 QLVEMGEDCDCGTSEECTNICCDAKTCKIKATFQCALGECCEKCQFKKAGMVCRPAKDEC
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 DFPEMCTGHSPACPKDQFRVNGFPCKNSEGYCFMGKCPTREDQCSELFDDEAIESHDICY
:.::::.:.: :: :.:.::::::....:.:.:: ::: ..::.::.
CCDS47 DLPEMCNGKSGNCPDDRFQVNGFPCHHGKGHCLMGTCPTLQEQCTELWGPGRRTNPFPCA
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 KMNTKGNKFGYCKNKENRFLPCEEKDVRCGKIYCTGGELSSLLGEDKTYHLKDPQKNATV
CCDS47 CAKENHFR
540
>>CCDS4338.1 ADAM19 gene_id:8728|Hs108|chr5 (918 aa)
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: .. :::::.:.. . :....::: :.::.. .... :.:::. : .:.::..
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160 170 180 190 200
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. .:. : : .. .. :.::..: .. . : . ... :::::..::
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: ...: . .. .... ..:.:. .:..:::...:::.:.::: . :. : .:
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: : :..:.: ..: :.. :..: ... . :.. .:: : : .. : ..
CCDS43 LWSFLSWRRKLL-AQKYHDNAQLITGMSFHGTTIGLAPLMAMCSVYQSGGVNMDHSENAI
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: : ..::..:. : . :.:. :.:. :. :: : :. ... :. .:..:::: :
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..: : .. ... ..:. .:. : : ::: .::::: . .
CCDS43 QSSEARPLESNAVPIDTTIIMNGRQIQCRGTHVYRGPEEEGDMLDPGLVMTGTKCGYNHI
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: .:.: : . . . .: ..:: . : ... .::: : :: :. : .:
CCDS43 CFEGQCRNT-SFFETEGCGKKCNGHGVCNNNQNCHCLPGWAPPFCNTPGHGGSIDSGPMP
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::. ::: . . ....:. : :. :: :..
CCDS43 PESVGPVVAGVLVAILVLAVLMLMYYCCRQNNKLGQLKPSALPSKLRQQFSCPFRVSQNS
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730 740 750
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CCDS43 GTGHANPTFKLQTPQGKRKVINTPEILRKPSQPPPRPPPDYLRGGSPPAPLPAHLSRAAR
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CCDS61 EPLQNSSHFEHIIYRMDDVYKEPLKCGVSNKDIE---KETAKDEEEEPPSMTQLLRRRRA
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CCDS61 VDSGPTYNEMNTALRDGLLVFFFLIVPLIVCAIFIFIKRDQLWRSYFRKKRSQTYESDGK
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CCDS13 YGPDGQPVVLAPNHTDHCHYQGRVRGFPDSWVVLCTCSGMSGLITLSRNASYYLRPWPPR
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CCDS13 GSKDFSTHEIFRMEQLLTWKG--TCGHRDPGNKAGMTSLPGGPQSRGRREAR--RTRKYL
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CCDS13 ELYIVADHTLFLTRHRNLNHTKQRLLEVANYVDQLLRTLDIQVALTGLEVWTERDRSRVT
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CCDS13 QDANATLWAFLQWR-RGLWAQRPHDSAQLLTGRAFQGATVGLAPVEGMCRAESSGGVSTD
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pF1KE0 LLPDTNIIANRMAHQLGHNLGMQHDEFPCTC-----PSGKCVMDSDGSIPALK-FSKCSQ
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CCDS13 HSELPIGAAATMAHEIGHSLGLSHDPDGC-CVEAAAESGGCVMAAATGHPFPRVFSACSR
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CCDS13 RQLRAFFRKGGGACLSNAPDPGLPVPPALCGNGFVEAGEECDCGPGQECRDLCCFAHNCS
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CCDS13 LRPGAQCAHGDCCVRCLLKPAGALCRQAMGDCDLPEFCTGTSSHCPPDVYLLDGSPCARG
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CCDS13 SGYCWDGACPTLEQQCQQLWGPGSHPAPEACFQVVNSAGDAHGNCGQDSEGHFLPCAGRD
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CCDS13 ALCGKLQCQGGK-PSLLAPHMVPVDSTVHL-DGQE---VTCRGALALPSAQLDLLGLGLV
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CCDS13 EPGTQCGPRMVCQSRRCRKNAFQELQR-CLTACHSHGVCNSNHNCHCAPGWAPPFCDKPG
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CCDS76 SLWNQGRADEVVSASVGSGDLWIPVKSFDSKNHPEVLNIRLQRESKELIINLERNEGLIA
40 50 60 70 80 90
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CCDS76 SSFTETHYLQDGTDVSLARNYTVILGHCYYHGHVRGYSDSAVSLSTCSGLRGLIVFENES
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]