Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0362
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0362, 530 aa
1>>>pF1KE0362 530 - 530 aa - 530 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7196+/-0.0011; mu= 15.4937+/- 0.066
mean_var=61.9765+/-12.311, 0's: 0 Z-trim(102.6): 39 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.162915
statistics sampled from 6966 (7002) to 6966 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.215), width: 16
Scan time: 3.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2506.1 UGT1A7 gene_id:54577|Hs108|chr2 ( 530) 3606 856.6 0
CCDS33402.1 UGT1A8 gene_id:54576|Hs108|chr2 ( 530) 3387 805.1 0
CCDS33403.1 UGT1A10 gene_id:54575|Hs108|chr2 ( 530) 3380 803.5 0
CCDS2505.1 UGT1A9 gene_id:54600|Hs108|chr2 ( 530) 3349 796.2 0
CCDS2507.1 UGT1A6 gene_id:54578|Hs108|chr2 ( 532) 2384 569.4 3.6e-162
CCDS2509.1 UGT1A3 gene_id:54659|Hs108|chr2 ( 534) 2368 565.6 4.9e-161
CCDS33404.1 UGT1A5 gene_id:54579|Hs108|chr2 ( 534) 2363 564.5 1.1e-160
CCDS2510.1 UGT1A1 gene_id:54658|Hs108|chr2 ( 533) 2357 563.1 2.9e-160
CCDS33405.1 UGT1A4 gene_id:54657|Hs108|chr2 ( 534) 2343 559.8 2.9e-159
CCDS2508.1 UGT1A6 gene_id:54578|Hs108|chr2 ( 265) 1736 417.0 1.3e-116
CCDS3523.1 UGT2B17 gene_id:7367|Hs108|chr4 ( 530) 1524 367.3 2.5e-101
CCDS3524.1 UGT2B15 gene_id:7366|Hs108|chr4 ( 530) 1511 364.2 2.1e-100
CCDS75136.1 UGT2B10 gene_id:7365|Hs108|chr4 ( 528) 1472 355.0 1.2e-97
CCDS3526.1 UGT2B7 gene_id:7364|Hs108|chr4 ( 529) 1465 353.4 3.8e-97
CCDS56331.1 UGT2A2 gene_id:574537|Hs108|chr4 ( 536) 1454 350.8 2.3e-96
CCDS43234.1 UGT2B4 gene_id:7363|Hs108|chr4 ( 528) 1448 349.4 6e-96
CCDS3525.1 UGT2A3 gene_id:79799|Hs108|chr4 ( 527) 1446 348.9 8.3e-96
CCDS3527.1 UGT2B11 gene_id:10720|Hs108|chr4 ( 529) 1440 347.5 2.2e-95
CCDS3528.1 UGT2B28 gene_id:54490|Hs108|chr4 ( 529) 1435 346.4 5e-95
CCDS3529.1 UGT2A1 gene_id:10941|Hs108|chr4 ( 527) 1421 343.1 4.9e-94
CCDS75135.1 UGT2B10 gene_id:7365|Hs108|chr4 ( 444) 1175 285.2 1.1e-76
CCDS3705.1 UGT8 gene_id:7368|Hs108|chr4 ( 541) 1131 274.9 1.6e-73
CCDS58901.1 UGT2A1 gene_id:10941|Hs108|chr4 ( 527) 1047 255.2 1.4e-67
CCDS77925.1 UGT2A1 gene_id:10941|Hs108|chr4 ( 483) 858 210.7 3.1e-54
CCDS77924.1 UGT2A2 gene_id:574537|Hs108|chr4 ( 492) 858 210.7 3.1e-54
CCDS58902.1 UGT2A1 gene_id:10941|Hs108|chr4 ( 693) 858 210.8 4.3e-54
CCDS3914.1 UGT3A2 gene_id:167127|Hs108|chr5 ( 523) 838 206.0 8.6e-53
CCDS3913.1 UGT3A1 gene_id:133688|Hs108|chr5 ( 523) 818 201.3 2.2e-51
CCDS54842.1 UGT3A2 gene_id:167127|Hs108|chr5 ( 489) 799 196.9 4.6e-50
CCDS82930.1 UGT2B7 gene_id:7364|Hs108|chr4 ( 369) 757 187.0 3.3e-47
CCDS75137.1 UGT2B4 gene_id:7363|Hs108|chr4 ( 369) 739 182.7 6.3e-46
CCDS56330.1 UGT2B28 gene_id:54490|Hs108|chr4 ( 335) 641 159.7 4.9e-39
CCDS54841.1 UGT3A1 gene_id:133688|Hs108|chr5 ( 252) 272 72.9 4.8e-13
>>CCDS2506.1 UGT1A7 gene_id:54577|Hs108|chr2 (530 aa)
initn: 3606 init1: 3606 opt: 3606 Z-score: 4577.2 bits: 856.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3606; 100.0% identity (100.0% similar) in 530 aa overlap (1-530:1-530)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MARAGWTGLLPLYVCLLLTCGFAKAGKLLVVPMDGSHWFTMQSVVEKLILRGHEVVVVMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 MARAGWTGLLPLYVCLLLTCGFAKAGKLLVVPMDGSHWFTMQSVVEKLILRGHEVVVVMP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 EVSWQLGRSLNCTVKTYSTSYTLEDQDREFMVFADARWTAPLRSAFSLLTSSSNGIFDLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 EVSWQLGRSLNCTVKTYSTSYTLEDQDREFMVFADARWTAPLRSAFSLLTSSSNGIFDLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FSNCRSLFNDRKLVEYLKESCFDAVFLDPFDACGLIVAKYFSLPSVVFARGIFCHYLEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 FSNCRSLFNDRKLVEYLKESCFDAVFLDPFDACGLIVAKYFSLPSVVFARGIFCHYLEEG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 AQCPAPLSYVPRLLLGFSDAMTFKERVWNHIMHLEEHLFCPYFFKNVLEIASEILQTPVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 AQCPAPLSYVPRLLLGFSDAMTFKERVWNHIMHLEEHLFCPYFFKNVLEIASEILQTPVT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AYDLYSHTSIWLLRTDFVLEYPKPVMPNMIFIGGINCHQGKPVPMEFEAYINASGEHGIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 AYDLYSHTSIWLLRTDFVLEYPKPVMPNMIFIGGINCHQGKPVPMEFEAYINASGEHGIV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 VFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQNDLLGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 VFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQNDLLGH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 PMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEMTSEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 PMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEMTSEDL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 ENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAAHDLTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 ENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAAHDLTW
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE0 YQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 YQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
490 500 510 520 530
>>CCDS33402.1 UGT1A8 gene_id:54576|Hs108|chr2 (530 aa)
initn: 3387 init1: 3387 opt: 3387 Z-score: 4299.0 bits: 805.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3387; 94.5% identity (97.4% similar) in 530 aa overlap (1-530:1-530)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MARAGWTGLLPLYVCLLLTCGFAKAGKLLVVPMDGSHWFTMQSVVEKLILRGHEVVVVMP
:::.:::. .:: : ::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MARTGWTSPIPLCVSLLLTCGFAEAGKLLVVPMDGSHWFTMQSVVEKLILRGHEVVVVMP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 EVSWQLGRSLNCTVKTYSTSYTLEDQDREFMVFADARWTAPLRSAFSLLTSSSNGIFDLF
:::::::.::::::::::::::::: ::::: ::::.: : .:: :::. :::::.:.::
CCDS33 EVSWQLGKSLNCTVKTYSTSYTLEDLDREFMDFADAQWKAQVRSLFSLFLSSSNGFFNLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FSNCRSLFNDRKLVEYLKESCFDAVFLDPFDACGLIVAKYFSLPSVVFARGIFCHYLEEG
::.::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS33 FSHCRSLFNDRKLVEYLKESSFDAVFLDPFDACGLIVAKYFSLPSVVFARGIACHYLEEG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 AQCPAPLSYVPRLLLGFSDAMTFKERVWNHIMHLEEHLFCPYFFKNVLEIASEILQTPVT
::::::::::::.:::::::::::::: :::::::::::: :: ::.:::::::::::::
CCDS33 AQCPAPLSYVPRILLGFSDAMTFKERVRNHIMHLEEHLFCQYFSKNALEIASEILQTPVT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AYDLYSHTSIWLLRTDFVLEYPKPVMPNMIFIGGINCHQGKPVPMEFEAYINASGEHGIV
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS33 AYDLYSHTSIWLLRTDFVLDYPKPVMPNMIFIGGINCHQGKPLPMEFEAYINASGEHGIV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 VFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQNDLLGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQNDLLGH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 PMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEMTSEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEMTSEDL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 ENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAAHDLTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAAHDLTW
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE0 YQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
490 500 510 520 530
>>CCDS33403.1 UGT1A10 gene_id:54575|Hs108|chr2 (530 aa)
initn: 3380 init1: 3380 opt: 3380 Z-score: 4290.1 bits: 803.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3380; 93.8% identity (97.5% similar) in 530 aa overlap (1-530:1-530)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MARAGWTGLLPLYVCLLLTCGFAKAGKLLVVPMDGSHWFTMQSVVEKLILRGHEVVVVMP
:::::::. .:: ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MARAGWTSPVPLCVCLLLTCGFAEAGKLLVVPMDGSHWFTMQSVVEKLILRGHEVVVVMP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 EVSWQLGRSLNCTVKTYSTSYTLEDQDREFMVFADARWTAPLRSAFSLLTSSSNGIFDLF
:::::: :::::::::::::::::::.::::::: :.: : .: :::: :::.:..:::
CCDS33 EVSWQLERSLNCTVKTYSTSYTLEDQNREFMVFAHAQWKAQAQSIFSLLMSSSSGFLDLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FSNCRSLFNDRKLVEYLKESCFDAVFLDPFDACGLIVAKYFSLPSVVFARGIFCHYLEEG
::.::::::::::::::::: ::::::::::.::::::::::::::::.::::::.::::
CCDS33 FSHCRSLFNDRKLVEYLKESSFDAVFLDPFDTCGLIVAKYFSLPSVVFTRGIFCHHLEEG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 AQCPAPLSYVPRLLLGFSDAMTFKERVWNHIMHLEEHLFCPYFFKNVLEIASEILQTPVT
::::::::::: ::::::::::::::::::.:::.:::: :.:.:.:::::::::::::
CCDS33 AQCPAPLSYVPNDLLGFSDAMTFKERVWNHIVHLEDHLFCQYLFRNALEIASEILQTPVT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AYDLYSHTSIWLLRTDFVLEYPKPVMPNMIFIGGINCHQGKPVPMEFEAYINASGEHGIV
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS33 AYDLYSHTSIWLLRTDFVLDYPKPVMPNMIFIGGINCHQGKPLPMEFEAYINASGEHGIV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 VFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQNDLLGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQNDLLGH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 PMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEMTSEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEMTSEDL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 ENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAAHDLTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAAHDLTW
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE0 YQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
490 500 510 520 530
>>CCDS2505.1 UGT1A9 gene_id:54600|Hs108|chr2 (530 aa)
initn: 3349 init1: 3349 opt: 3349 Z-score: 4250.8 bits: 796.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3349; 93.4% identity (96.6% similar) in 530 aa overlap (1-530:1-530)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MARAGWTGLLPLYVCLLLTCGFAKAGKLLVVPMDGSHWFTMQSVVEKLILRGHEVVVVMP
:: .:::. ::: ::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS25 MACTGWTSPLPLCVCLLLTCGFAEAGKLLVVPMDGSHWFTMRSVVEKLILRGHEVVVVMP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 EVSWQLGRSLNCTVKTYSTSYTLEDQDREFMVFADARWTAPLRSAFSLLTSSSNGIFDLF
::::::::::::::::::::::::: :::: .:: :.: : .:: .::: .: : :::::
CCDS25 EVSWQLGRSLNCTVKTYSTSYTLEDLDREFKAFAHAQWKAQVRSIYSLLMGSYNDIFDLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FSNCRSLFNDRKLVEYLKESCFDAVFLDPFDACGLIVAKYFSLPSVVFARGIFCHYLEEG
::::::::.:.::::::::: :::::::::: ::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS25 FSNCRSLFKDKKLVEYLKESSFDAVFLDPFDNCGLIVAKYFSLPSVVFARGILCHYLEEG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 AQCPAPLSYVPRLLLGFSDAMTFKERVWNHIMHLEEHLFCPYFFKNVLEIASEILQTPVT
::::::::::::.:::::::::::::: ::::::::::.: ::::.:::::::::::::
CCDS25 AQCPAPLSYVPRILLGFSDAMTFKERVRNHIMHLEEHLLCHRFFKNALEIASEILQTPVT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AYDLYSHTSIWLLRTDFVLEYPKPVMPNMIFIGGINCHQGKPVPMEFEAYINASGEHGIV
::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS25 EYDLYSHTSIWLLRTDFVLDYPKPVMPNMIFIGGINCHQGKPLPMEFEAYINASGEHGIV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 VFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQNDLLGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 VFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQNDLLGH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 PMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEMTSEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 PMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEMTSEDL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 ENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAAHDLTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 ENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAAHDLTW
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE0 YQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 YQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
490 500 510 520 530
>>CCDS2507.1 UGT1A6 gene_id:54578|Hs108|chr2 (532 aa)
initn: 2391 init1: 2194 opt: 2384 Z-score: 3025.0 bits: 569.4 E(32554): 3.6e-162
Smith-Waterman score: 2384; 70.2% identity (84.4% similar) in 520 aa overlap (14-530:15-532)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MARAGWTGLLPLYVCLLLTCGFAKAGKLLVVPMDGSHWFTMQSVVEKLILRGHEVVVVM
: .: :.. . ::::::.:::::..:...:: : ::::.:::.
CCDS25 MACLLRSFQRISAGVFFLALWGMVVGDKLLVVPQDGSHWLSMKDIVEVLSDRGHEIVVVV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 PEVSWQLGRSLNCTVKTYSTSYTLEDQDREFMVFADARWTA-PLRSAFSLLTSSSNGIFD
:::. : .: : : : . : :. ... :.. ... . .: . .. ..
CCDS25 PEVNLLLKESKYYTRKIYPVPYDQEELKNRYQSFGNNHFAERSFLTAPQTEYRNNMIVIG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LFFSNCRSLFNDRKLVEYLKESCFDAVFLDPFDACGLIVAKYFSLPSVVFARGIFCHYLE
:.: ::.::..:: ....::: :::.: :: ::.:.:.:..:::: . ::. : .
CCDS25 LYFINCQSLLQDRDTLNFFKESKFDALFTDPALPCGVILAEYLGLPSVYLFRGFPCSLEH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 EGAQCPAPLSYVPRLLLGFSDAMTFKERVWNHIMHL-EEHLF-CPYFFKNVLEIASEILQ
.. : :.::.:: ::: :::..:: : ...: : .:: : .:.. :.:: .:.
CCDS25 TFSRSPDPVSYIPRCYTKFSDHMTFSQRVANFLVNLLEPYLFYC--LFSKYEELASAVLK
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TPVTAYDLYSHTSIWLLRTDFVLEYPKPVMPNMIFIGGINCHQGKPVPMEFEAYINASGE
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CCDS25 RDVDIITLYQKVSVWLLRYDFVLEYPRPVMPNMVFIGGINCKKRKDLSQEFEAYINASGE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 HGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQND
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEMT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 SEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAAH
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 DLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 DLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
480 490 500 510 520 530
>>CCDS2509.1 UGT1A3 gene_id:54659|Hs108|chr2 (534 aa)
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Smith-Waterman score: 2368; 67.9% identity (83.0% similar) in 529 aa overlap (6-530:11-534)
10 20 30 40 50
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: :::: :::. .:..::.::::.:::::..:. :...: ::
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10 20 30 40 50
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pF1KE0 HEVVVVMPEVSWQLGRSLNCTVKTYSTSYTLEDQDREFMVFADARW-TAPLRSAFSLLTS
:..::. :::. .. . :. ::. :.: .. ::. . .. . : . . : .
CCDS25 HQAVVLTPEVNMHIKEENFFTLTTYAISWTQDEFDRHVLGHTQLYFETEHFLKKFFRSMA
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 SSNGIFDLFFSNCRSLFNDRKLVEYLKESCFDAVFLDPFDACGLIVAKYFSLPSVVFARG
:.. .. .: :.... :...:. . ::.:. :: . :. ..:::.:.:.: : :.
CCDS25 MLNNMSLVYHRSCVELLHNEALIRHLNATSFDVVLTDPVNLCAAVLAKYLSIPTVFFLRN
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pF1KE0 IFCHYLEEGAQCPAPLSYVPRLLLGFSDAMTFKERVWNHIMHLEEHLFCPYFFKNVLEIA
: : .:.::: : ::.:::: :: ::: .:: : .. : .: : .:
CCDS25 IPCDLDFKGTQCPNPSSYIPRLLTTNSDHMTFMQRVKNMLYPLALSYICHAFSAPYASLA
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pF1KE0 SEILQTPVTAYDLYSHTSIWLLRTDFVLEYPKPVMPNMIFIGGINCHQGKPVPMEFEAYI
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CCDS25 SELFQREVSVVDILSHASVWLFRGDFVMDYPRPIMPNMVFIGGINCANRKPLSQEFEAYI
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pF1KE0 NASGEHGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 NASGEHGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKW
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pF1KE0 LPQNDLLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LPQNDLLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLN
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 VLEMTSEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 VLEMTSEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHL
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pF1KE0 RPAAHDLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 RPAAHDLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
480 490 500 510 520 530
>>CCDS33404.1 UGT1A5 gene_id:54579|Hs108|chr2 (534 aa)
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Smith-Waterman score: 2363; 68.6% identity (82.7% similar) in 525 aa overlap (7-530:14-534)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MARAGWTGLLPLYVCLLLTCGFAKAGKLLVVPMDGSHWFTMQSVVEKLILRGH
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pF1KE0 EVVVVMPEVSWQLGRSLNCTVKTYSTSYTLEDQDREFMVFADARW-TAPLRSAFSLLTSS
.:::. ::. . . :. ::. :.: .. :: .. ... . : : :: .
CCDS33 QVVVLTLEVNMYIKEENFFTLTTYAISWTQDEFDRLLLGHTQSFFETEHLLMKFSRRMAI
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pF1KE0 SNGIFDLFFSNCRSLFNDRKLVEYLKESCFDAVFLDPFDACGLIVAKYFSLPSVVFARGI
:.. .. .: :.... :...:. . ::.:. ::: :. ..:::.:.:.: : :.:
CCDS33 MNNMSLIIHRSCVELLHNEALIRHLHATSFDVVLTDPFHLCAAVLAKYLSIPAVFFLRNI
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pF1KE0 FCHYLEEGAQCPAPLSYVPRLLLGFSDAMTFKERVWNHIMHLEEHLFCPYFFKNVLEIAS
: .:.::: : ::.:::: :: ::: .:: : .. : .: .::
CCDS33 PCDLDFKGTQCPNPSSYIPRLLTTNSDHMTFLQRVKNMLYPLALSYLCHAVSAPYASLAS
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 EILQTPVTAYDLYSHTSIWLLRTDFVLEYPKPVMPNMIFIGGINCHQGKPVPMEFEAYIN
:..: :.. :: ::.:.::.: :::..::.:.::::.::::::: .:::. .:::::::
CCDS33 ELFQREVSVVDLVSHASVWLFRGDFVMDYPRPIMPNMVFIGGINCANGKPLSQEFEAYIN
240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 ASGEHGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ASGEHGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWL
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pF1KE0 PQNDLLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PQNDLLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNV
360 370 380 390 400 410
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pF1KE0 LEMTSEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LEMTSEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLR
420 430 440 450 460 470
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pF1KE0 PAAHDLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PAAHDLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
480 490 500 510 520 530
>>CCDS2510.1 UGT1A1 gene_id:54658|Hs108|chr2 (533 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE0 MARAGWTGLLPLYVCLLLTCGFAKAGKLLVVPMDGSHWFTMQSVVEKLILRGHEVVV
...: .: : .:.: ..:::.:..:.:::::..: .....: ::::.::
CCDS25 MAVESQGGRPLVLGLLLCVLGPV-VSHAGKILLIPVDGSHWLSMLGAIQQLQQRGHEIVV
10 20 30 40 50
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pF1KE0 VMPEVSWQLGRSLNCTVKTYSTSYTLEDQDREFM-----VFADARWTAPLRSAFSLLTSS
. :..: . . :.::: . . :: . :. :: . . . .... . ..
CCDS25 LAPDASLYIRDGAFYTLKTYPVPFQREDVKESFVSLGHNVFENDSFLQRVIKTYKKIKKD
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pF1KE0 SNGIFDLFFSNCRSLFNDRKLVEYLKESCFDAVFLDPFDACGLIVAKYFSLPSVVFARGI
: ...:.: :.....:. : :: ::... ::: :. :::.:.:::.: : ...
CCDS25 SA----MLLSGCSHLLHNKELMASLAESSFDVMLTDPFLPCSPIVAQYLSLPTVFFLHAL
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pF1KE0 FCHYLEEGAQCPAPLSYVPRLLLGFSDAMTFKERVWNHIMHLEEHLFCPYFFKNVLEIAS
: :..::: :.::::: : . :: ::: .:: : .. . ....: .. .::
CCDS25 PCSLEFEATQCPNPFSYVPRPLSSHSDHMTFLQRVKNMLIAFSQNFLCDVVYSPYATLAS
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 EILQTPVTAYDLYSHTSIWLLRTDFVLEYPKPVMPNMIFIGGINCHQGKPVPMEFEAYIN
:.:: ::. :: : .:.::.:.::: .::.:.::::.:.::::: . .:. .:::::::
CCDS25 EFLQREVTVQDLLSSASVWLFRSDFVKDYPRPIMPNMVFVGGINCLHQNPLSQEFEAYIN
240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 ASGEHGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 ASGEHGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 PQNDLLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 PQNDLLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNV
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pF1KE0 LEMTSEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LEMTSEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLR
420 430 440 450 460 470
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pF1KE0 PAAHDLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 PAAHDLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
480 490 500 510 520 530
>>CCDS33405.1 UGT1A4 gene_id:54657|Hs108|chr2 (534 aa)
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pF1KE0 MARAGWTGLLPLYVCLLLTCG---FAKAGKLLVVPMDGSHWFTMQSVVEKLILRGHEVVV
:::. . : : . ::: . .:..::.:::: ::: :..:. ....: :::..::
CCDS33 MARGLQVPLPRLATGLLLLLSVQPWAESGKVLVVPTDGSPWLSMREALRELHARGHQAVV
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60 70 80 90 100 110
pF1KE0 VMPEVSWQLGRSLNCTVKTYSTSYTLEDQDREFMVFADARW-TAPLRSAFSLLTSSSNGI
. :::. .. . :. .:.. .: .. :: . .... . : : . .: . :..
CCDS33 LTPEVNMHIKEEKFFTLTAYAVPWTQKEFDRVTLGYTQGFFETEHLLKRYSRSMAIMNNV
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 FDLFFSNCRSLFNDRKLVEYLKESCFDAVFLDPFDACGLIVAKYFSLPSVVFARGIFCHY
. : :.... :...:. . ::.:. :: . :: ..:::.:.:.: : : : :
CCDS33 SLALHRCCVELLHNEALIRHLNATSFDVVLTDPVNLCGAVLAKYLSIPAVFFWRYIPCDL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LEEGAQCPAPLSYVPRLLLGFSDAMTFKERVWNHIMHLEEHLFCPYFFKNVLEIASEILQ
.:.::: : ::.:.:: :: ::: .:: : .. : .: : .:::..:
CCDS33 DFKGTQCPNPSSYIPKLLTTNSDHMTFLQRVKNMLYPLALSYICHTFSAPYASLASELFQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TPVTAYDLYSHTSIWLLRTDFVLEYPKPVMPNMIFIGGINCHQGKPVPMEFEAYINASGE
:.. :: :..:.::.: :::..::.:.::::.::::::: .:::. .:::::::::::
CCDS33 REVSVVDLVSYASVWLFRGDFVMDYPRPIMPNMVFIGGINCANGKPLSQEFEAYINASGE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 HGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQND
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEMT
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 SEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAAH
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 DLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
490 500 510 520 530
>>CCDS2508.1 UGT1A6 gene_id:54578|Hs108|chr2 (265 aa)
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 QTPVTAYDLYSHTSIWLLRTDFVLEYPKPVMPNMIFIGGINCHQGKPVPMEFEAYINASG
::::.:::::::.. : . .::::::::::
CCDS25 MPNMVFIGGINCKKRKDLSQEFEAYINASG
10 20 30
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 EHGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 EHGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQN
40 50 60 70 80 90
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 DLLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 DLLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEM
100 110 120 130 140 150
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 TSEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 TSEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAA
160 170 180 190 200 210
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 HDLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 HDLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
220 230 240 250 260
530 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 14:01:01 2016 done: Thu Nov 3 14:01:01 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]